FacMed.

3emeAnnéemed
4eme anneephar
2016/17
MicrobiologiE
ALLAG H.

Structures bactériennes et classification simplifiée.

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 Historique (I)
• 1676 : Van Leeuwenhoek : microscope

• « Génération spontanée »

• Début XIXè siècle : Pasteur, (1) notion de micro-

organisme, (2) ces micro-organismes peuvent
provoquer des maladies

• Milieu XIXè : Lister, stérilisation

• 1876 : Koch, notion de maladie bactérienne,

4 postulats de Koch
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 Historique (II)
• « age d’or de la microbiologie » :
– Koch : charbon (Bacillus anthracis), tuberculose
(Mycobacterium tuberculosis), choléra (Vibrio
cholerae)
– Klebs/Loeffler : diphtérie (Corynebacterium
diphtheriae)
– Shiga : dysenterie (Shigella dysenteriae)
– Kitasato/Yersin : peste (Yersinia pestis)
• Vaccins :
– Jenner : variole/vaccine
– Pasteur : choléra des poules, rage
– Von Behring/Kitasato : antitoxine (diphtérie)
– Anatoxines
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Microscope de van Leeuwenhoek

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 MORPHOLOGIE ET STRUCTURE DES
BACTERIES
• Définition
• Moyens d’étude
– microscopie optique
– microscopie électronique
• Anatomie bactérienne
– microscopie optique
• taille
• morphologie ; classification
– microscopie électronique
• schéma général
• enveloppes : paroi • peptidoglycane
• ≠ Gram + / Gram -
membrane cytoplasmique
• constituants internes : cytoplasme
appareil nucléaire
• éléments inconstants 5
 Définition

BACTERIE : être vivant unicellulaire, de petite taille

(1 à qq µm de longueur)
= cellule procaryote (sans véritable noyau)
≠ cellule eucaryote
paroi rigide, contient un constituant spécifique :
le peptidoglycane

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• Agents des maladies infectieuses
• Prions : maladies dégénératives du système nerveux
• (maladie de Creutzfeldt Jakob)
• Virus : 20 – 200 nm
• Bactéries
• Champignons
• Parasites

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 Moyens d’étude
• microscope optique
– état frais : entre lame et lamelle
forme
mobilité (X 200 à X 400)
– frottis fixé et coloré
meilleure appréciation de
la morphologie (X 1000)
nombreuses méthodes : GRAM +++
Giemsa
P.A.S., etc.
• microscope électronique
– plusieurs technique : transmission, balayage...
– étude des structures superficielles, de
l’architecture interne
– travaux de recherche uniquement

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• Qu’est ce qu’une bactérie ?
• Bactérie = être vivant, unicellulaire
• Poids d’une cellule = 10 puissance-12 g (poids sec =
3x10-13 g)
• • Découverte du monde bactérien : début du 18ème
siècle grâce au microscope
• • Étude des bactéries : Louis Pasteur (1822-1895)
• découverte du rôle des bactéries dans
• -les fermentations
• - les maladies
• • Classement :
• Eucaryotes : membrane nucléaire
• (algues, champignons, protozoaires)
• Procaryotes : un seul chromosome, pas de membrane
nucléaire
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• toujours unicellulaire
• Domaines de la bactériologie
• Science médicale : pathologie infectieuse
• Science fondamentale :
• bactéries et virus = outils en génétique et biologie
moléculaire
• Science extra-médicale concernant :
• - L’agriculture :
• bactéries interviennent dans cycles naturels de C, N, S
• - L’industrie alimentaire :
• . rôle dans les fermentations
• . contamination des aliments (Salmonelles, Listéria)
• - L’industrie chimique et pharmaceutique :
• . production d’antibiotiques
• . armes de guerre

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• Moyens d’étude de la structure
bactérienne
• A) microscopie optique (x 1000 à 1500)
• morphologie, groupement
• Coloration de Gram inventée en 1884
• ®violet : Gram +
• ®rose : Gram –
• B) microscopie électronique (x > 10 000)
• structure fine des bactéries
• C) fractionnement des bactéries
• Constituants libérés, séparés, analysés

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 Anatomie bactérienne

• microscopie optique
– taille
de 1 à quelques µm
ex. staphylocoque 1 µm

Escherichia coli 3 µm

hématie 7 µm

– morphologie : 3 formes principales chez les

bactéries d’intérêt médical

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• Morphologie bactérienne
• 1)• forme : - coques = sphères
- bacilles = bâtonnets
- spirilles
• 2)• taille : ~1 μ de large x quelques μ de long
• 3)• groupement des bactéries caractéristique de
l’espèce :isolées, par 2, amas, chaînettes, en
palissades…
4)Combinaison entre - forme, caractérise les bactéries
- coloration
- et groupement

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1 - sphérique : coques ou cocci
– isolées

– en paire = diplocoques
pneumocoques
méningocoques

– en amas staphylocoques

– en tétrades microcoques

– en chaînettes streptocoques

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 Taille, forme, et arrangement
 Coques: sphères
diplocoques:
paires de coques
 Streptocoques: chaînes de coques

 Staphylocoques: organisation en grapes

Tétrades:
4 coques en un groupe carré
 Genre Sarcina:

aglomérat cubique de 8 coques

Exemple de streptocoques
2 - bâtonnets : bacilles

– Bacillus

– Listeria

– corynébactéries palissades ou
lettres de l’alphabet

– Actinomyces

– Clostridium

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– entérobactéries coloration
bipolaire

– Haemophilus
Pseudomonas

– Acinetobacter

– vibrions

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3 - spirales = spirilles ou spirochètes

tréponème (Treponema pallidum) syphilis

Borrelia burgdorferi maladie de Lyme

Leptospira spp. leptospirose

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Streptocoques corynébactéries

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Bacillus
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Méningocoque (LCR)

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Gonocoque (prélèvement urétral)

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Bactérie spiralée en microscopie à fond
noir (Borrelia) 27
Bacille à gram négatif à coloration
bipolaire (Yersinia)
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• Anatomie bactérienne (cellule procaryote)
• Eléments obligatoires : Eléments inconstamment
présents :
• - chromosome - plasmides
• - cytoplasme - vacuoles, substances de réserve
• - ribososomes - capsule
• - membrane cytoplasmique - flagelles
• - paroi - pili (pilus commun et
pilus sexuel)
- spore
• Eléments absents :
• * véritable noyau
• * mitochondrie
• * réticulum endoplasmique
• * appareil de Golgi

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• Constituants de la cellule bactérienne
• • Rôle pour la bactérie
• • Implications médicales dans
• - pouvoir pathogène
• - diagnostic biologique (direct et indirect)
• - études épidémiologiques (comparaison de souches)
• - sensibilité aux antibiotiques
• - vaccins

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• Structures constantes
• Paroi
• Membrane cytoplasmique
• Appareil nucléaire
• Cytoplasme
• Structures inconstantes
• Capsule
• Couche S
• Flagelles
• Fimbriae, Pili
• Spore
• Eléments génétiques mobiles

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A)Chromosome
- absence de membrane nucléaire
- filament unique d’ADN . bicaténaire
. circulaire
. surenroulé
- 1000 fois plus long que la bactérie (masse ~
2000MDa)
- protéines fixées dessus:
- ADN et ARN polymérases
- topoisomérases : réalisent les torsades

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• A’)Chromosome : intérêt médical
• Identification bactérienne : mise en évidence de gènes
• Épidémiologie : comparaison des génomes des
souches bactériennes
• Cible d’antibiotiques :
- quinolones : inhibition des topoisomérases
- rifamycine : inhibition de l’ARN polymérase (=> de la
transcription)
- nitro-imidazolés : fragmentation de l’ADN

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• B)Plasmides
• structures génétiques non essentielles (inconstantes)
• ADN double brin, surenroulé
• de 1 à 1000 kb (en moyenne 0,5 à 5% de la taille du
chromosome) cytoplasmique, de réplication autonome
• transférable à d’autres bactéries par conjugaison
• exemples :
- plasmides porteurs de gènes intervenant dans le
pouvoir pathogène(gènes de virulence, de toxines…)
- plasmides de résistance aux antibiotiques
- Facteur F transfert de fragments de chromosome par
conjugaison.

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• C)Cytoplasme
• composés solubles
• composés de réserve
• ARN
• ribosomes

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• D)Ribosomes
• Nombreux : ~ 20 000 / bactérie
• Constitution :
-comportent 2 sous unités (50S et 30S)
constituées de protéines + ARN (23S et 16S)
• Rôle dans la synthèse protéique
• Cible d’antibiotiques qui agissent en perturbant la
synthèse protéique
- aminosides
- cyclines
- phénicolés
- macrolides
- acide fusidique.
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• E)Membrane cytoplasmique
• interface entre cytoplasme et structures externes
• sous la paroi
• Constitution
- protéines dispersées dans
- double couche de phospholipides
absence de cholestérol
-micro. électronique : aspect trilamellaire
• Lieu de fixation des flagelles et d’initiation de leur
mouvement

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• E’)Membrane cytoplasmique :
-nombreuses fonctions
• Responsable des échanges
- transferts passifs : barrière osmotique
- pénétration active et sélective : perméases
- sortie des protéines : systèmes de sécrétion
• Transmission des informations de l’environnement :
protéine signal
• Enzymes de la chaîne respiratoire (même rôle que la
mitochondrie dans la cellule eucaryote)
• Cible de substances antibactériennes :
- phénols, antiseptiques cationiques
- antibiotiques polypeptidiques : fixation sur les
phospholipides
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• F)Paroi
• enveloppe rigide
• forme (exosquelette)
• protection
• contient la pression osmotique interne
• différente chez les Gram positif et les Gram négatif
• mais comporte un polymère commun, partie la plus
interne :
• PEPTIDOGLYCANE = MUREINE = MUCOPEPTIDE
• macromolécule (= sac entourant la bactérie) de
structure réticulée :
• - chaines polysaccharidiques reliées par des
• - chainons peptidiques

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43
 La paroi et les groupes bactériens
Paroi d’une cellule Gram-positive Paroi d’une cellule
Gram-négative
Paroi
Peptidoglycane cellulaire
Membrane externe
Membrane
plasmique Peptidoglycane
Membrane
plasmique

Paroi cellulaire
Espace
périplasmique
• F’)Paroi : peptidoglycane ou muréine
• · constitution :
• - chaines polysaccharidiques .
acide N-acétyl muramique = NAM
. N-acétyl glucosamine = NAG
- chainons peptidiques . branchés sur l’acide
muramique (NAM)
. et reliés entre eux par une chaîne peptidique
• · biosynthèse :
• - enzymes (transpeptidase, carboxypeptidase) sur
lesquelles se fixent les AB béta-lactamines = protéines
se liant à la pénicilline ou PLP

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• F’a)Paroi chez les GRAM POSITIF :
• épaisse (30 à 50 nm)
peptidoglycane = constituant majeur (30% du
poids sec),
-nombreuses couches
- autres constituants fixés dans le
peptidoglycane :
• - acides teichoïques
• - polysaccharides
• - protéines
• - la mb. Cytoplasmique.
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• F’b)Paroi chez les GRAM NEGATIF :
• plus complexe
• peptidoglycane : couche mince (3-5 nm) (<
15% du poids sec)
• espace périplasmique
• membrane externe : - double couche de
phospholipides
• - couche externe de lipopolysaccharide (LPS)
• - protéines : - de structure (OmpA)
• - de transport
• - porines : perméabilité
• - d’adhérence

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• F’c)Paroi des GRAM NEGATIF :
• structure du LPS
• couche externe de lipopolysaccharide (LPS) =
endotoxine, avec 3 régions :
• • lipides (lipide A)
• • rattachés au core ou noyau polysaccharidique
de base
• • sur lequel est fixé un polysaccharide complexe
immunogène (antigène O)
• se développant à l’extérieur de la paroi

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• Mb externe des Gr-: le LPS
• LPS = endotoxine = Ag O
- Composé de 3 parties:
-Lipide A
-Polysaccharide central
-Chaîne O

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• F’d)Intérêt médical de la paroi bactérienne
• Des fragments des divers constituants ont un rôle dans :
• • activation des macrophages (muréine, ac lipoteichoïque, LPS)
• plus forte production de cytokines
• endotoxine en grande quantité choc toxique
• • activation de la voie alterne du complément,
• attraction des phagocytes sur les sites infectieux
• • activité antiphagocytaire
• • adhérence (protéines associées, ac lipoteichoïques)
• • immunogènicité
• • variantes antigéniques sérotypage des bactéries (épidémiologie)
• Site d’action
• • d’antiseptiques
• • d’antibiotiques agissant sur :
• - la synthèse de la paroi : - béta-lactamines (liaison avec les PLP)
• - fosfomycine
• - glycopeptides
• - la partie phospholipidique : polymyxines (colistine)

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• G)Capsule
• élément le plus superficiel
• inconstante
• polysaccharidique (polymère de 1-2 sucres)
• mise en évidence à l’encre de chine halo clair
• Implications médicales :
• • Pouvoir pathogène : la résistance à la phagocytose
(pneumocoque)
• • Diagnostic : antigènes solubles dans les liquides de
l’organisme
• • Épidémiologie : typage sérologique (pneumocoque,
hémophile)
• • Vaccins : à base de polymères capsulaires purifiés
• (pneumocoque, Haemophilus influenzae)

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• H)Flagelles
• · assurent la mobilité de certaines bactéries
• · colorations spéciales en microscopie optique
• - longueur : 6 à 15 μm
• - nombre variable suivant les espèces : 1 ou plus
• - disposition variable
• - péritriche (autour de la bactérie)
• - polaire (à 1 ou aux 2 extrémités)
• · assemblage de protéines : flagellines
• · attachés à la membrane cytoplasmique par une
structure protéique mobile
• par rotation
• · flagellines sont antigéniques
• - sérotypage
• - sérodiagnostic (fièvre typhoïde)

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• I)Pili sexuels
• peu nombreux (1 à 4)
• longs - creux - extrémité distale renflée
• codés par des gènes plasmidiques
(facteur F)
• rôle dans la conjugaison bactérienne :
rapprochement des 2 bactéries male et
femelle
• échange de matériel génétique

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• J)Pili communs ou Fimbriae
• • structure fibrillaire protéique, fine, 4 à 8 μm de
long
• • visibles uniquement en microscopie électronique
• rigides, régulièrement disposés à la surface
• ancrés dans membrane externe de la paroi
• • facteurs de pathogénicité :
• . adhésion aux cellules eucaryotes, favorise la
colonisation des muqueuses :
• - épithélium urinaire : colibacilles uropathogènes
• - entérocytes : colibacilles entéropathogènes
• - épithélium urogénital : gonocoque
• . protection contre la phagocytose

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• K)Glycocalyx Biofilm
• Exopolymère : feutrage de fibres polysaccharidiques = structure
réticulée lâche
• Propriétés d’adhésion responsable de l’attachement :
• ⇒ des bactéries entre elles
• ⇒ entre bactéries et corps étrangers (biomatériaux, cathéters,
prothèses)
• ⇒ entre bactéries et surfaces cellulaires (respiratoires) : facteur
de colonisation
• ⇒ entre bactéries et valves cardiaques : végétations et
endocardite
• ⇒ entre bactéries et émail dentaire : plaque dentaire puis carie
• Biofilm = ensemble structuré de bactéries, enveloppées dans
une matrice de
• polymère autoproduit, qui s’amarre sur des surfaces inertes ou
vivantes

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• L)SPORE
• FORME DE RESISTANCE de certaines bactéries
• quand les conditions deviennent défavorables
• - ronde ou ovale
• - paroi très épaisse
• - résiste . au froid. à la chaleur. à la dessication. aux antibiotiques
• . à certains antiseptiques
• - conservation de toutes les aptitudes génétiquement
déterminées
• - peut persister très longtemps dans l’environnement et redonner
une forme végétative quand les conditions redeviennent
favorables
• exemples de bactéries sporulées : Bacillus anthracis
• Clostridium perfringens
• Clostridium botulinum
• Clostridium tetani
• Clostridium difficile.

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 L’endospore bactérienne
 Formée par certaines
bactéries Gram-
positives.
 Dormance
 Résistante aux
conditions sévères de
l’environnement:
 Chaleur
 Radiations
ultraviolettes
 Désinfectants a) Spore centrale
b) Spore subterminale
chimiques c) Spore terminale
 Dessiccation d) Spore terminale
avec sporange
gonflé 65
spore :
forme de résistance de certaines espèces
permet la survie dans des conditions défavorables
(froid, dessication...)
redonne des formes végétatives quand des
conditions favorables se manifestent à nouveau
propriétés :
• thermorésistance : 100°C, 20 min
• résistance aux radiations (U.V.)
• résistance aux antibiotiques, à certains
antiseptiques
différentes formes :
centrale non déformante subterminale déformante
terminale déformante
(Bacillus cereus) (Clostridium perfringens)
(Clostridium tetani) 66
• M)Cibles d’action des principales famille d’antibiotiques
• ► Paroi : - Bêta-lactamines (PLP)
• - Glycopeptides
• - Fosfomycine
• ►Membrane cytoplasmique : -Polymyxines

• ►Ribosomes : - Aminosides
• - Phénicols
• - Cyclines
• - Macrolides
• - Acide Fusidique
• ►ADN : - Rifamycines (ARN polymérase)
• - Quinolones (topo-isomérases)
• - Sulfamides et apparentés (synthèse des acides nucléiques)
• - Nitroimidazolés( Flagyl*)
FIN 2016/17. ALLAG H.
FacMed3/4emeanMED/PHAR.Microbiologie.

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• MERCI POUR VOTRE ATTENTION.
• fin

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