Guía para Imprimir en PDF Desde R

6/11/2019 Guía para imprimir en pdf desde R
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APRENDIZAJE AUTOMÁTICO (1)
ÍNDICE
BLOGDOWN (4)
Herramientas para empezar
BOOKDOWN (2)
Cómo se crea un pdf con R
COLUMNA (1) CRS (3)
Parámetros YAML
CSS (2) CURIOSIDADES (2)
Una o dos caras
DATA MINNING (3)
Márgenes
Tipo de letra DIBUJO (8) DIVERTIDO (7)
Personalizar encabezados y pies de página FORMATO (4) GGPLOT (1)
Ejemplo GRAFICAS (6) GRÁFICOS (7)
LaTeX puro
INSTALACIÓN (2) LOGO (1)
He hecho una recopilación de indicaciones, trucos y preguntas para MAPAS (8) MARKDOWN (5)
aprender a imprimir informes de calidad desde R con RSTUDIO, knitr y
MATEMÁTICAS (4)
LaTeX . Creo que es un tema imprescindible para los cientí cos o
ingenieros pues al nal, nuestro trabajo debe ser plasmado en MATHJAX (1) MODELOS (4)
documentos y las posibilidades que ofrece R con rmarkdown y LaTeX
son realmente sorprendentes. NUBE (2)
LaTeX es el procesador de textos por excelencia, pero hemos de NUBE PROGRAMAS

INSTALACIÓN (2)
reconocer que no es fácil iniciarse, es un lenguaje de marcado
poderoso, pero muy complejo, por eso es tan importante la aprición PDF (2) PLOT (5)
de otros lenguajes intermedios como rmarkdown, que simpli can las
reglas de marcado y hacen de traductores. PROCESSING (1)
Con markdown solo es necesario aprender unas pocas reglas de PROGRAMAS (2) R (17)
marcado o etiquetas sencillas y eso nos permite dar formato

RED (3)
complejo a cualquier documento. Rmarkdown fue, para mi, un gran
descubrimiento, pues ponía al alcance del público generalista una REDES BAYESIANAS (2) SF (7)
manera fácil de dar formatos y calidad a los documentos
aprovechando toda la fortaleza de editores poderosos como LaTeX. SIG (8) SINTAXIS (4)
TIPOGRAFÍA (3)
Acostumbrado a los problemas de los procesadores de texto tipo
windows como word, que eran una verdadera pesadilla para VISIÓN ARTIFICIAL (1)
documentos grandes y complejos como un Proyecto de
Construcción, el uso de markdown es una luz en el camino, lo que me
sorprende es que no tenga mayor difusión y uso. SOCIAL
Tengo que confesar que hacer proyectos, pliegos, contratos o libros

GitHub
en el entorno de RSTUDIO con herramientas como blogdown o
fervilber@gmail.com
bookdown , o simplemente con Rmarkdown clásico es mucho más
sencillo y tiene salidas grá cas e impresas de mucha mayor calidad
que las obtenidas con microsoft word, y son ¡herramientas
gratuitas!.
Comenzar es difícil, por eso voy a mostrar cómo hago yo los

documentos, los trucos que uso para obtener pdf impresos de
calidad excepcional.
Herramientas para empezar

Es necesario que tengas instalado R, RSTUDIO y además alguna
versión de LaTeX en tu PC. La recomendada por Yihui Xie es TinyTeX
pues se puede realizar desde el propio entorno de RSTUDIO de la
siguiente manera:
install.packages("tinytex")
tinytex::install_tinytex() # install TinyTeX
En mi caso, como ya usaba LaTeX hace años con el editor LyX, tengo
instalada MiKTeX con la que me apaño bien de momento.
Puede que tengas un lío de nombres en la cabeza (R, rmarkdown,

Knitr, pandoc, latex..), pero es que hay un montón de lenguajes que se
relacionan mutuamente y hace posible el ujo de documentación y
su integración, la siguiente imagen lo describe muy bien:
Como ves una de las ventajas de todo esto, es que puedes mezclar
código y programación con texto en un documento, y que además la
salida nal de ese documento puede ser en múltiples formatos, con
un mismo chero base. Es decir, que podrías sacar un chero pdf
hecho con LaTeX o un chero de word con el mismo chero inicial de
Rmarkdown.
Cómo se crea un pdf con R

Mirando el diagrama anterior nos vamos a centrar en la salida de
documento pdf, y vemos que desde el chero de rmarkdown al pdf
hay 3 pasos que transforman internamente el chero origen: knitr –>
pandoc –> LaTeX.
El ujo es el siguiente:
knitr transforma el código R en formato markdown, es decir

inserta las imágenes generadas o las salidas de R en texto
formateado etiquetado como markdown.
pandoc es el gran desconocido, pero es el corazón de la bestia,
pues transforma el texto markdown en otro texto formateado
según la salida nal elegida (pdf LaTeX, word, html…). Para
especi car el formato de salida metemos unos encabezados en
el chero rmarkdown que se llaman YAML.
LaTeX toma el código salida de pandoc y lo convierte en por
ejemplo un chero pdf completamente acabado. LaTeX se
ocupa de cosas como insertar un índice de capítulos o de
guras, meter el encabezado o pie de página, ordenar los
párrafos con el borde, usar tipografía adecuada, ordenar las
imagenes para que quepan en el documento, insertar un pie
de imagen….
Vamos a centrarnos en la parte práctica de crear un pdf desde R y

todo se reduce al encabezado YAML que cada chero de rmarkdown
lleva.
Se trata de unas palabras-etiquetas que de nen caracteristicas del

documento y el tipo de salida, formatos etc..
El código YAML va delimitado por 3 marcas de signo menos seguidas:

--- . Un ejemplo de encabezado YAML es el siguiente:
---
title: "Informe estado Obras"
author:
- name: F.VilBer
- affiliation: Universidad de la vida
- name: M. López
affiliation: Escuela terrenal
date: "`r format(Sys.time(), '%B %d, %Y')`"
abstract: "Este documento explica los principios de
rmarkdown..."
keywords: "Informe de estado de las obras de .."
lang: es
documentclass: article
papersize: a4
output:
pdf_document:
latex_engine: xelatex
lof: yes
lot: yes
number_sections: yes
toc: yes
toc_depth: 2
html_document:
fig_caption: yes
theme: journal
toc: yes
toc_depth: 2
---
Parámetros YAML
En este encabezado que ponemos al principio de cada documento
rmarkdown en RSTUDIO de nimos las características de formato,
mediante etiquetas. Un listado completo de las etiquetas disponibles
lo vemos en la web o cial de pandoc.
La mayoría de los parámetros se de nen con su nombre: título,

autor, fecha. Como vemos en el ejemplo anterior la fecha la
escribimos directamente con código R, aunque se podría poner
directamente con texto entrecomillado.
Si usamos nuestro amado idioma castellano, debemos especi car

lang: es para que los capítulos e índices automáticos generados
no sean en inglés.
papersize: a4 especi ca el tamaño de la página nal en este

caso A4, el por defecto de LaTeX suele ser el americano
letter . Cambiando a a5 por ejemplo y ejecutando preview
nos transformaría el documento completo a una página más
pequeña.
documentclass: especi ca el tipo de documento. LaTeX tiene
múltiples plantillas de documento, y normalmente se instalan
desde el gestor de paquetes,(el Package Manager de MiKTeX por
ejemplo). Los tipos de documento habituales son artículo, libro,
carta. Son cambios importantes, por ejemplo el tipo libro
book hace que cada capítulo vaya en una pagina nueva,
mientras que con article va todo el texto seguido. También
hay formatos de más versátiles prede nidos como el koma-
script muy completo y utilizado por la comunidad, pero que

requiere su instalación en LaTeX previa.
output: este parámetro indica el tipo de documento de salida, si
va a ser una web, un chero word o un pdf. Para cada caso hay
varias opciones de con guración, por ejemplo los parámetros
lof: yes y lot: yes y toc=yes que están indentados, nos
dicen que se generarán indices automáticos de guras, tablas y
de títulos en el documento pdf nal. number_sections: yes
indica que se numerarán los títulos automáticamente, y
después decimos hasta qué profundidad de título saldrá en el
índice toc_depth: 2 .
latex_engine: xelatex esto si es importante, aquí
indicamos el motor de LaTeX que vamos a usar para
transformar el markdown simple en código LaTeX. El que viene
por defecto con RSTUDIO es pd atex y xelatex. Recomendamos
encarecidamente usar este ultimo, pues pd atex se ha
quedado un poco desfasado y puede implicar algunos cambios
respecto a lo que vamos a indicar en los siguientes aparatados.
Vamos a exponer más parámetros interesantes con los que de nir al

detalle nuestro documento en base al siguiente ejemplo:
---
title: "Loren Ipsum"
author: "FVB"
date: "`r format(Sys.time(), '%B %d, %Y')`"
classoption: oneside
keywords: "pandoc, r markdown, knitr"
geometry:
- top=1in
- bottom=1in
- right=0.5in
- left=1in
graphics: yes
lang: es
link-citations: yes
linkcolor: red
documentclass: scrartcl
papersize: a5
citecolor: blue
urlcolor: blue
fontsize: 11pt
o ts e: pt
fontfamily: bookman
header-includes:
- \usepackage{graphicx}
- \usepackage{fancyhdr}
- \pagestyle{fancy}
- \fancyhead[L]{\slshape \rightmark}
- \fancyhead[R]{\includegraphics[height=1cm]
{logo1.jpg}}
- \fancyfoot[R]{\textit{\scriptsize
www.enrdados.net }}
- \fancyfoot[C]{\thepage}
- \renewcommand{\headrulewidth}{0.2pt}
- \usepackage{floatpag}
- \floatpagestyle{empty}
output:
pdf_document:
latex_engine: xelatex
lof: yes
lot: yes
number_sections: yes
toc: yes
toc_depth: 2
---
Una o dos caras

Con el parámetro classoption: indicamos si el documento nal
será a una cara oneside o a dos twoside .
Lo importante de poner a dos caras es que los márgenes, así como

los encabezados pueden cambiar en este caso si la página es par
(Even) o impar (Odd).
Márgenes
Se especi can con el parámetro geometry , y los valores se pueden
dar en cm o en pulgadas (in). Si el documento es a dos caras, y los
márgenes no son simétricos, el pdf se verá claramente como
cambian estos de una pagina par a impar.
Si todos los márgenes son iguales podemos escribir todo así en una
sola línea: geometry: "margin=2cm"
so a ea: geo et y: a g c
geometry:
- top=1in
- bottom=1in
- right=0.5in
- left=1in
Tipo de letra
Esto del tipo de letra que usa LaTeX es un poco quebradero de
cabeza, pues no valen los mismos tipos de letra del sistema en
windows. Solo se pueden especi car aquellos que estén en LaTeX
instalados. Normalmente son archivos *.sty que se instalan con el
desarrollo de LaTeX.
Otra opción es meterlo directamente en el encabezado

header-includes: con código latex directo, pero siempre es más
fácil así. Debes revisar tus opciones de letras en LaTeX, normalmente
los nombres siguientes son válidos: palatino, helvet, utopia, times,
pifont, courier, bookman, newcent, newcent, avant.
fontsize: 11pt
fontfamily: bookman
También se puede especi car el tipo de letra según el uso:
mainfont: letra del texto y párrafos normales

sansfont: es la letra usada para textos del tipo sans serif sin
terminaciones do de palo seco.
monofont: es el tipo de letra usado en los chunk de código
mainfont: LiberationSerif
sansfont: LiberationSans
monofont: LiberationMono
Personalizar encabezados y pies de

página
Mucha gente que usa RSTUDIO y ha probado las salidas en formato
pdf me decía que quedaban documentos de gran calidad, pero que
no podían insertar pies de página o encabezados personalizados.
Es cierto que markdown es un lenguaje de marcado simple y no llega

a hacer cosas complejas, pero para eso está LaTeX, para las cosas
complejas. Por lo que si queremos meter encabezados y pies de
página debemos recurrir a insertar código latex directamente, en el
apartado YAML tras el parámetro header-includes: .
Lo que pongamos a continuación será código latex puro y por

ejemplo con las siguientes líneas de niremos un encabezado y pie de
pagina bastante complejo.
header-includes:
- \usepackage{graphicx}
- \usepackage{fancyhdr}
- \pagestyle{fancy}
- \fancyhead[L]{\slshape \rightmark}
- \fancyhead[R]{\includegraphics[height=1cm]
{logo1.jpg}}
- \fancyfoot[R]{\textit{\scriptsize
www.enRdados.net }}
- \fancyfoot[C]{\thepage}
- \renewcommand{\headrulewidth}{0.2pt}
- \usepackage{floatpag}
- \floatpagestyle{empty}
Lo primero que hace es cargar las librerías de latex graphicx, para

insertar una imagen y fancyhdr para la gestión de encabezados y
pies.
Después de ne el estilo de pagina fancy, que es el que permite

personalizar todo. A parir de aquí es cuando de nimos el contenido,
primero del encabezado con
\fancyhead[L]{\slshape \rightmark} que nos dice que en el
encabezado izquierdo [L] va la numeración y el nombre del capítulo
en el que esté la página
en el que esté la página.
Con esto
\fancyhead[R]{\includegraphics[height=1cm]{logo1.jpg}}
indicamos que en el lado derecha [R] de right del encabezado vamos
a insertar una imagen correspondiente al chero logo1.jpg que
está en el mismo directorio que el chero rmarkdown . Además la
altura de la imagen en la pagina será de 1 cm.
Con \fancyfoot[R] de nimos el pie de página derecho, en el que

se pone un link a nuestra web y en otra linea decimos que en el
centro del pie de pagina ponga la numeración de la página
\thepage .
La separación entre el texto de página y el encabezado se de ne

como una linea na 0,4 de grueso mediante el comando:
\renewcommand{\headrulewidth}{0.2pt} . En este caso no hay
linea en el pie de página, pero si quisiéramos poner una de
separación lo haríamos con:
\renewcommand{\footrulewidth}{0.4pt} .
En documentos a doble cara, podemos especi car incluso diferentes

encabezados para las páginas par o impares simplemente
indicándolo en la de nición. Recordemos que en inglés par es even e
impar odd, por lo que izquierda de pagina par es [LE] , centro de
pagina impar [CO] . Ejemplo:
\fancyhead[LE,RO]{\slshape \rightmark}
\fancyhead[LO,RE]{\slshape \leftmark}
\fancyfoot[C]{\thepage}
Ejemplo
Os dejo en imagen algunas paginas del documento pdf generado de
ejemplo con un encabezado YAML como el descrito en apartados
anteriores e impreso en A5, el indice se crea automáticamente y
como vemos los encabezados y pies van acordes con los capítulos:
LaTeX puro
Los documentos rmarkdown admiten código LaTeX directo. El código
LaTeX va precedido de la barra inclinada \ y a continuación la
etiqueta correspondiente.
Este código se puede introducir en cualquier parte del documento, y

complementa al que metemos en el encabezado YAML que va dentro
de header-includes como vimos antes.
Por ejemplo si después del encabezado YAML y antes de comenzar

con el texto escribimos lo siguiente, crearemos una página inicial solo
con el título y meteremos manualmente un índice de guras y de
títulos:


\begin{titlepage}
\begin{center}
\begin{LARGE}
\textsc{INFORME DE LUCES NOCTURNAS \\
JUNIO 2017 \\ }
\textsc{--- \\
DATOS DEL INSTUTO DE LUZ MURCIANO}
\end{LARGE}
\textsc{ \\}
\textsc{ \\}
\includegraphics[width=0.8\linewidth]
{imag/luces.jpg}
\end{center}
\begin{large}
\textit{-Informe análisis de luces
nocturnas-}
\end{large}
\begin{flushright}
\textit{F.Villalba \\
desde Cieza, Murcia, España \\
}
\end{flushright}
\end{titlepage}


\begin{titlepage}
\tableofcontents
\end{titlepage}


\begin{titlepage}
\begin{scriptsize}
\listoffigures
\end{scriptsize}
\end{titlepage}
\pagebreak
Veamos algunas expresiones de LaTeX:
\pagebreak incluye un salto de página.

\newpage y \clearpage meten una nueva pagina en blanco
\\* inserta un salto de línea y rohibe el salto de pagina

posterior.
\hfill\break inserta un salto de línea.
\includegraphics[width=3cm, height=4cm]{imag/universe.jpg}
inserta una imagen, para ello antes debe cargarse el paquete
\usepackage{graphicx}
insertar referencias cruzadas. \label{fig:imagen_1} y
después si queremos hacer referencia a esta imagen hacemos:
\ref{fig:imagen_1} .
Las medidas pueden darse en unidades o usar referencias como:
\columnsep distancia entre las columnas
\columnwidth anchura de una columna
\linewidth amplitud de línea en el ambiente actual

\paperwidth anchura del papel
\paperheight altura del papel
\textwidth anchura del texto

\textheight altura del texto
\unitleght unidades de longitud en el ambiente picture
Quizás nos interese también conocer el paquete fancy que es el que

permite en LaTeX hacer los encabezados y pies de página de los
documentos, la información completa está aquí ( fancyhdr ) en
resumen:
\thepage el número de la página

\chaptermark el título del capítulo
\chaptername el nombre “Capítulo”, (chapter en ingles) el

literal no el titulo
\thechapter el número del capítulo
\leftmark y \rightmark contienen las referencias últimas
al capítulo, que van cambiando a medida que avanza el
documento.
R TIPOGRAFÍA SINTAXIS FORMATO
Sobre el autor F.VilBer

Hola soy Fernando VilBer, ingeniero de caminos y
entusiasta usuario de R.
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1 comentario • hace 9 meses 1 comentario • hace 9 meses
fervilber — Ayer haciendo fervilber — El generador de
pruebas actualicé la plantilla mapas está
de Hugo mainroad sin genial:https://nolugar.shinyap
Instalar R en la nube con Manual de sf para SIG

amazon 3 comentarios • hace 8 meses
1 comentario • hace 6 meses Juan Carlos Lopez — Un
fervilber — he descubierto tutorial magnífico.
este Muchisimas gracias, y
enlace:http://www.louisaslett.
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Con \fancyfoot[R] de nimos el pie de página derecho, en el que

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Por ejemplo si después del encabezado YAML y antes de comenzar

Veamos algunas expresiones de LaTeX:

\pagebreak incluye un salto de página.

\\* inserta un salto de línea y rohibe el salto de pagina

Las medidas pueden darse en unidades o usar referencias como:

\columnsep distancia entre las columnas

\columnwidth anchura de una columna

\linewidth amplitud de línea en el ambiente actual

\paperheight altura del papel

\textwidth anchura del texto

\unitleght unidades de longitud en el ambiente picture

Quizás nos interese también conocer el paquete fancy que es el que

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