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secundarios
Contenido
Aminoglucósidos y componentes de azúcar en otros metabolitos secundarios ................................ 1
1. Introducción .................................................................................................................................... 2
2 Aislamiento, distribución, ecología y fermentación......................................................................... 3
3 Biogénesis y vías básicas de cicitoles y componentes de azúcar ..................................................... 7
3.1 Ciclitoles .................................................................................................................................... 8
3.2 Componentes de azúcar .......................................................................................................... 12
3.2.1 6-desoxi y otras desoxihexosas ........................................................................................ 14
3.2.2 Otros componentes del azúcar ........................................................................................ 15
4 Genética y bioquímica de la biosíntesis y funciones de los aminoglucósidos............................... 16
4.1 Streptomycins y Ca Aminogl ycosides relacionados ............................................................... 24
4.1.1 Estreptomicinas ................................................................................................................ 24
4.1.2 Estreptomicina relacionada con los Aminogl ycósidos de Ca .......................................... 40
4.2 Fortimicinas, Istamicinas ......................................................................................................... 43
4.3 Aminooglucósidos que contienen 2-desoxstreptamina.......................................................... 46
1
1. Introducción
No existe una definición química o bioquímica clara del término "aminoglucósido",
que tradicionalmente se reserva para el azúcar mono o oligosacárido y / o los
derivados del ciclitol que contienen nitrógeno amino. Por lo tanto, en este capítulo
se intenta demostrar que, en términos biológicos y especialmente genéticos,
existen muchos paralelos entre los orígenes y los usos de los componentes de
azúcar fuertemente derivados en los metabolitos secundarios en general y con
respecto a los aminoglucósidos de aminociclitol en particular. Una lista de los
principales grupos químicos de aminoglucósidos (ver Tab. 1) muestra que algunas
estructuras nuevas se han descrito en la última década.
Sin embargo, esta situación podría cambiar nuevamente debido a los problemas
cada vez mayores con la resistencia a los antibióticos y la aparición de nuevas y
reapariciones de enfermedades infecciosas "antiguas" (ver discusión en DAVIES,
1992; HOTTA et al., 1995). Algunos ejemplos son los estafilococos resistentes a la
meticilina, las infecciones bacterianas en pacientes con VIH y el renacimiento
mundial de la tuberculosis como un importante problema de salud. En línea con
este desarrollo, los autores de este El capítulo se centra principalmente en los
nuevos aspectos de la genética molecular, la bioquímica y la fisiología de la
producción de aminoglucósidos y los componentes de azúcar modificados de
manera similar de otras clases químicas de metabolitos secundarios. Además, se
discuten las futuras aplicaciones biotecnológicas de este conocimiento.
3
Los números entre paréntesis se refieren a las figuras que muestran la
fórmula en la Sec. 10)
4
Ver texto en la sección. 3; solo se da la fórmula básica si se caracteriza un
grupo de compuestos
Figura 1
Géneros bacterianos productores de aminoglucósidos aminociclitol (extendido
según HASEGA AC acarbosa e inhibidores de la glucosidasa relacionados; BM:
bluensomicina; BU: butirosinas; DM: destomicinas; FM: fortimicinas (astromicinas);
GM: gentamicinas; HM-A, B: higromicinas A o B; IM: istamicinas; KG
kasugamycins; KM: kanamicinas; LM: lividomicinas; NM: neomicinas; PM:
paromomicinas; RM: ribostamicinas; SE: seldomicinas; SI: sisomicinas; SM:
estreptomicinas; SP: espectinomicina; TM: toctomicina; TM: toctomicina; TM:
toctomicina; TM: TM VM: validamicinas.
de las plantas también debe ser considerado. En general, se puede suponer que
estos glucósidos comparten una base bioquímica general común con los de las
bacterias y que se utiliza un grupo genético equivalente para su producción
celular. Sin embargo, dado que se sabe poco sobre su biosíntesis, este capítulo se
concentra en los sistemas de producción de procariotas.
5
Se ha demostrado que los aminoglucósidos se producen en suelos
(WELLINGTON et al., 1993). Por lo tanto, uno de los objetivos futuros de la
investigación del aminoglucósido aminociclitol es estudiar su papel ecológico en
los biotopos de organismos. Allí, estas sustancias podrían estar involucradas en la
comunicación entre diferentes organismos y en la diafonía similar a las hormonas
entre las células diferenciadas del propio productor (CHADWICK y WHELAN,
1992; PIEPERSBERG, 1993). Además, las vías de diseminación de los
mecanismos de resistencia a los aminoglucósidos que se encuentran tanto en los
productores como en las bacterias no productoras clínicamente relevantes (véase
la sección 4.5) y las presiones selectivas impulsoras en condiciones naturales
podrían ser accesibles para la investigación experimental directa.
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buena evidencia de que la mayor parte del metabolismo del azúcar más allá de la
glucosa, la fructosa y algunas pentosas básicas y su incorporación en el
almacenamiento y los materiales de la pared celular es específica para el tipo de
célula o cepa, en lugar de para una especie o taxones superiores, y parece estar
basado en el mismo común y altamente variable y conjunto de genes fluidos. Esto
se refleja en las altas variaciones en las reacciones de glicosilación en todos los
organismos y especialmente en los organismos diferenciadores. Esto da lugar a la
alta variación antigénica en las células microbianas y eucariotas superiores.
Ejemplos de esto son los diferentes marcadores de grupos sanguíneos en el
hombre y los materiales capsulares, lipopolisacáridos y diversas formas de
productos glicosilados excretados en bacterias, que se describen en este capítulo.
3.1 Ciclitoles
Según nuestro conocimiento actual, hay dos vías diferentes (amino-) ciclitol (Fig.
4).
apertura del anillo de piranosa y rotación del enlace C-4 / C-5 para
colocar el grupo C-6 en una posición activa,
la oxidación reversible y la reducción de la posición C-5 por NAD +,
la eliminación del átomo pro-R-H de C-6 y su transferencia al carbonilo
C-1, y
el uso del anómero p de ~ -glucosa-6- fosfato como sustrato preferido
(WONG y SHERMAN, 1985; FLOSS y
BEALE, 1989).
(2) La vía del deshidroquinado. La segunda ruta hacia los cicitoles (Cb) sigue un
mecanismo similar a la deshidroquinato-sintasa dependiente de NAD + en hexosa-
6 o heptulosa-7-fosfatos de cadena abierta que producen 1-ceto-2-
desoxicicloritoles no fosforilados. Los productos finales son, por ejemplo, 6-
desoxstreptamina y valienamina / valiolamina (Fig.6; WIDLANSKI et al., 1989;
8
GODA y AKHTAR, 1992; RINEHART et al., 1992; YAMAUCHI y KAKINUMA
1992c, 1993).
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Figura 4 Fig. 4. Rutas hacia la formación de (amino-) ciclitoles a través de
mioinositol- ~ -3-fosfato sintasa (Ca) y un mecanismo de enzima similar a la
deshidroquinato sintasa (Cb; cf. reacciones 8-7). Los sustratos pueden ser D
glucosa6-fosfato (1 y 3), sedoheptulosa-7-fosfato (5, o su 5-epímero), o ácido 3-
desoxiarabinoheptulosónico (7). Los productos de las rutas de Ca o Cb son
ciclofosfatos (2) que tienen que sufrir desfosforilación y oxidación adicional antes
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de la transaminación o 1-ceto-2-desoxicicitoles (4,6 y 8) que se pueden transaminar
directamente, respectivamente. La numeración de los átomos del anillo en (2) y (4)
está de acuerdo con el sistema de conteo utilizado en los derivados de
estreptamina (estreptidina, actinamina, 2-desoxstreptamina); los números en (6) y
(8) se dan de acuerdo con la nomenclatura en valienamina y deshidroquinato,
respectivamente. (C-1 o C-2) y Δ (C-6 o C-7) marcan los átomos de carbohidratos
originales que forman el nuevo enlace C-C en los productos de ciclitol. La vía del
deshidroquinado (7-8) también se puede iniciar con un ácido 5-amino-3,5-
desoxiarabinoheptulosónico o un intermedio se transamina después de la ciclación
para producir una unidad aromática m-C7N como se encuentra en muchos
metabolitos secundarios (para más detalles, ver FLOSS y BEALE, 1989; RINEHART
et al., 1992; YAMAUCHI y KAKINUMA, 1992c, 1993).
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Sin embargo, es dudoso que algunos de los representantes de un grupo químico
común de aminoglucósidos compartan la misma vía del ciclitol. Por ejemplo, el
grupo destomicina contiene dos compuestos con aminociclitoles derivados de la
estreptamina, uno de los cuales es idéntico a la 1-N-amidinostreptamina (ver Fig.
A16 IKEDA et al., 1985b), un intermediario en la vía de estreptomicina (vía Ca; ver
Sección 4.1.1). Los otros miembros de esta familia tienen 2-desoxi-scyllo-
streptamine (2DOS) como restos de ciclitol (vía Cb). De manera similar, las
fortimicinas (Ca) y las istamicinas (Cb) podrían clasificarse en grupos separados
(ver Fig. A10 y Sección 4.2). Esto podría sugerir incluso dos vías iniciales
diferentes para la formación de ciclitol que resulten en productos finales muy
similares o, como alternativa, una modificación posterior por oxidorreductasas
(deshidroxilación de derivados de Ca o hidroxilación de productos Cb) como rutas
opcionales para producir la categoría alternativa de bloques de construcción. , esta
última posibilidad es menos probable ya que en ningún caso se encontraron
ambas vías en el mismo productor.
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construcción de carbohidratos:
(2) la pentosa piranosídica o furanosídica (P), hexosa (H), heptosa (Hep), octosa
(Oct) o la vía de hexosamina (HA);
Por lo tanto, para los propósitos de la discusión aquí y para simplificar, se define
una "fórmula de ruta" para cada compuesto que contiene carbohidratos
considerado. La ruta postulada para la derivación de las estructuras mono y
oligosacáridas se da conectando las abreviaturas anteriores para las rutas
precursoras individuales donde las figuras entre paréntesis indican los puntos de
sustitución glucosídica (u otra). Por ejemplo, estreptomicina (Ca (4) -6DOH (2) -
HA) o
manosilmannosidostreptomic
ina (Ca (4) -6DOH (2) - HA
(4) - (H) J se clasificaría junto
con la espectinomicina (Ca
(4,5) -6DOH) y se separaría
de las neomicinas (HA- (4)
Cb (6) -P (3) -HA),
validamicinas (Cb (1) -Cb) y
amilostatinas ((H) ,, - (4) Cb
(l) -6DOH (l) (H) ,,) (consulte
la Sección 10 y la Tabla 1
para obtener una
compilación).
Los compuestos 4-ceto se pueden usar como un precursor común para ramificar
las vías adicionales en las series D y L de derivados de hexosa (Figs. 8 y 9).
14
2, C-3 y C-4, y (3) los pasos de isomerización y epi- merización. Otros tipos de
modificaciones, como las metilaciones C, N, 0 y S o reacciones de transferencia
para grupos secundarios más complejos también son comunes en las vías 6DOH.
Aquí describimos brevemente solo el primer mecanismo; Las transaminaciones y
otros tipos de reacciones de isomerización (por ejemplo, epimerización) se
analizan a continuación. Un mecanismo para los pasos de desoxigenación fue
aclarado por los estudios recientes de la vía CDP-3,6-desoxihexosa (REEVES,
1993; SHNAITMAN y KLENA, 1993; THORSON et al. 1993; THOR-SON y LIU,
1993a, b ; LIU y THORSON, 1994). Esta es una ruta alternativa que produce
6DOHs que se usa abundantemente en bacterias gramnegativas además de la
ruta dTDP, por ejemplo, en la biosíntesis de cadenas 0 de lipopolisacárido. El
sistema enzimático implicado consiste en dos proteínas de azufre de hierro, una
de las cuales (El) cataliza la deshidratación dependiente de fosfato de
piridoxamina (PMP) de la 4-ceto-6-desoxi hexosa a través de un mecanismo
radical y formando una PMP unida covalentemente -hexosa intermedia (Fig. 10).
Los electrones para este proceso se entregan a través de una segunda enzima
(E2) que contiene FAD además del grupo [2Fe-2S] y usa NADH como donante de
electrones. Este tipo de mecanismo podría fácilmente verse también involucrado
en la 2-desoxigenación de muchos otros 6DOH en metabolitos secundarios, como
los constituyentes del azúcar en el grupo de antraciclinas daunorrubicina
cytorhodin-rodomicina o algunos de los 6DOH que ocurren en las cromomicinas (
cf. Figs. 8 y 9).
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3 y 4 isómeros y que la misma ruta principal también debería producir grupos
amino. - ing pentosas, heptosis y octosas. Una variación adicional puede provenir
de la etapa de transaminación, antes o después de la activación del azúcar por
nucleotidilación o incluso después de la condensación en moléculas complejas.
16
et al., 1978). Investigaciones recientes se han concentrado principalmente en la
biología molecular de la resistencia a aminoglucósidos clínicamente relevante y los
aspectos moleculares de la biosíntesis, resistencia y regulación de aminociclitol
aminoglucósidos en los organismos productores (principalmente con respecto a
estreptomicinas y fortimicinas; ver Sectas 4.1 y 4.2). Durante la última década, la
modificación semisinética, los nuevos métodos de detección y los nuevos campos
de aplicación han dado como resultado el descubrimiento de varios nuevos
estructuras de aminoglucósidos y, al menos en un caso, en la introducción al uso
farmacéutico. Este capítulo se centrará principalmente en los últimos aspectos.
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Figura 8 Variantes estructurales de D-6-desoxihexosas (D-6DOH)
encontradas en metabolitos secundarios. Ejemplos de su ocurrencia en
productos naturales particulares se dan entre paréntesis
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Figura 9 Variantes estructurales de L-6-desoxihexosas (L-6DOH)
encontradas en metabolitos secundarios. Ejemplos de su ocurrencia en
productos naturales particulares se dan entre paréntesis.
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deshidrasa que contiene [2Fe-2S] (tipo AscCIRfbH); E2: NADH-dependiente,
FAD / [2Fe-2S] que contiene la síntesis (para detalles, ver LIU y THORSON,
1994).
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4.1 Streptomycins y Ca Aminogl ycosides relacionados
Las estreptomicinas y la bluensomicina son un grupo relativamente homogéneo de
aminoglucósidos pseudotrisacáridos básicos (Fig. Al) que pueden alargarse con
uno o dos residuos glucosídicos adicionales (manosilo o ashimosilo; IKEDA y
otros, 1985a; TOHMA y otros, 1989). o escindirse en dos derivados de hexosa
como en AC4437 (dihidrostreptosil-estreptidina; AWATA et al., 1986). Los
compuestos de este grupo son producidos por una amplia gama de especies
(KORZYBSKI et al., 1978). Se han encontrado en los géneros Streptomyces,
Streptoverticillium, Amycolatopsis, y pueden estar presentes en otros. Una
encuesta de cepas productoras de estreptomicina de colecciones y un estudio
taxonómico de nuevos aislamientos que se inició recientemente (PHILLIPS et al.,
1992; MARSH y WELLINGTON1, 994) indicaron que pueden agruparse
principalmente en tres grupos dentro de familia de Streptomycetaceae. Estos
grupos están representados por S. griseus, S. hygro- scopicus y Streptoverticillium
mashuense.
4.1.1 Estreptomicinas
La biosíntesis de estreptomicinas, incluida la bluensomicina, se estudió
intensamente mediante la alimentación de precursores metabólicos primarios
etiquetados (DEMAIN e INAMINE1,9 70 MUNROe t al., 1975) y el análisis de las
reacciones biosintéticas de estreptomicina en sistemas libres de células y con
células purificadas. enzimas biosintéticas (WALKER, 1975a, b; GRISEBACH,
1978; RINEHART, 1980). Aunque no se han aclarado todas las reacciones
biosintéticas, se sabe que los compuestos de la familia de la estreptomicina se
sintetizan mediante 25-30 pasos catalizados por enzimas (WALKER, 1975a;
RINEHART y STRO-SHANE, 1976; GRISEBACH, 1978; RINEHART, 1980;
OKUDA e ITO, 1982; PIEPERSBERG, 1995). Las vías de biosíntesis de
estreptomicina y bluensomicina actualmente hipotetizadas se resumen en la Fig.
12. Implican la formación de los precursores activados, estreptidina (bluensidina) -
6-fosfato (cf. Sección 4.1.1.1), dTDP-dihidrostreptosa ( cf. Sect. 4.1.1.2), y NDP-N
(metil) -L-glucosamina (cf. Sect. 4.1.1.3) que están hechos más probablemente de
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~ -glucosa-6-fosfato. Sin embargo, se ha demostrado que la D-glucosamina se
puede incorporar sin romper sus enlaces C-C en la subunidad N-metil-L-
glucosamina de estreptomicina (revisado por OKUDA e ITO, 1982). En una
segunda fase, los precursores se condensan formando fosfato de dihidro
estreptomicind (véase la sección 4.1.1.4) que se secreta y probablemente se oxida
mientras pasa a través de la membrana citoplasmática para dar estreptomicina-6-
fosfato fuera de la célula ( cf. Sección 4.1.1.4). Las estreptomicinas biológicamente
activas se liberan finalmente por una fosfatasa específica (véase la sección
4.1.1.4), y después de la absorción pueden ser fosforiladas por una estreptomicina
6 fosfotransferasa que representa el mecanismo de resistencia que protege a los
productores de sus propios productos. (cf. Sección 4.5).
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aphE, que codifican dos estreptomicina fosfotransferasas diferentes, APH (6) y
APH (3 ”), respectivamente (WALKER, 1975b; WALKER y WALKER, 1975;
DISTLER y PIEPERSBERG, 1985 ; DISTLER et al., 1987a; HEINZEL et al., 1988).
Hasta ahora, solo el gen strA podría estar localizado en los grupos de genes de
producción de S. griseus y S. gfuucescens GLA 0. Sin embargo, el gen aphE solo
se produce en las cepas de S. griseus y no aparece en estar vinculado al grupo de
strlsts. Posteriormente, se identificaron más genes biosintéticos de estreptomicina
mediante el desplazamiento cromosómico y la complementación genética de
mutantes de diferentes cepas de S. griseus deficientes en biosíntesis de
estreptomicina (DISTLER et al., 1985; OHNUKI et al., 1985a, b). Alrededor de 30
genes para la producción de (5 '-hidroxi-) estreptomicina (strlsts) y bluensomicina
(bfu) se han clonado y analizado de varias cepas de S. griseus, de S. gfuucescens
GLA.0 (ETH 22794) y de otros Strepto - myces spp., y se encontró que todos
estaban agrupados en una región de aproximadamente 3040 kb de ADN
genómico (Tab. 2; Fig. 13; MANSOURI et al., 1989; DISTLER et al., 1990, 1992;
RETZLAFF et al. ., 1993; PIEPERSBERG, 1995). La comparación de las
estructuras primarias de los genes strl sts homólogos y sus productos génicos en
S. griseus y S. gfuucescens revelaron valores de identidad que variaban entre
58% y 86%. En contraste, las secciones de ADN intercistrónicas no codificantes
correspondientes tienen una homología significativa mucho menor o nula. El orden
de los genes strlsts identificados hasta ahora dentro de los operones respectivos
es similar, aunque la disposición de los operones difiere considerablemente entre
las especies productoras. Por lo general, los genes que codifican las enzimas para
la síntesis de una subunidad de estreptomicina (por ejemplo, estreptidina) no
están organizados en operones específicos de la vía secundaria. En cambio,
generalmente se encuentran operones mixtos que pueden reflejar la necesidad de
una regulación estrictamente coordinada de la expresión del gen strlsts para
garantizar un suministro coordinado de los precursores activados en la síntesis de
estreptomicina. Los fenómenos implicados en la regulación genética de la
biosíntesis de estreptomicina se analizan a continuación (véase la sección 4.6).
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hecho de SD suministrado externamente en SD-mutantes (OH-NUKI et al., 1985a,
b; DISTLER et al., 1985). El SD-6-fosfato se sintetiza mediante dos conjuntos de
cinco reacciones enzimáticas paralelas, cada una de las cuales se cataliza
presumiblemente por enzimas individuales: dos fosfatos fosfatosas de ciclitol, dos
deshidrogenasas ciclitol, dos aminotransferasas, dos fosfotransferasas y dos
amidinotransferasas en productores de estreptomicina (cf. Tab.2, Fig.14).
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las enzimas SMAT restantes, StrS o StsA, puede estar involucrada como una
enzima biosintética en la síntesis de la subunidad NDP-N-metil-L-glucosamina
(NMLGA) (véase la sección 4.1.1.3). Las enzimas que catalizan el
fosfotransferencia (véanse los Pasos 5 y 10, Fig. 14) parecen ser proteínas StrN o
StsE. Aunque esta función aún no ha sido probada por ensayos in vitro de las
enzimas expresadas individualmente, hay mucha evidencia de esta suposición.
Ambas proteínas contienen en su porción C terminal los motivos característicos
característicos que son típicos para las fosfotransferasas de amiglucósidos y las
proteínas quinasas eucarióticas (véase la sección 4.5; PIEPERS-BERG et al.,
1988; HEINZEL et al. , 1988). Recientemente, se encontró un gen homólogo a
strN en un fragmento de ADN de S. flavopersicus, que confiere resistencia a la
espectinomicina a S. lividans (J. ALTENBUCHNEaRn d D. LYUTZ-KANOVA,
datos no publicados; ver más abajo Sección 4.1.2) . Además, se detectó una
actividad de fosforilación de espectinomicina en esta cepa recombinante de S.
lividans (J. DISTLER, J. ALTEN BUCHNER y D. LYUTZKANOVA, datos no
publicados). Estos hallazgos apoyan la suposición de que sfrN codifica una
fosfotransferasa. Se identificaron dos genes estrechamente relacionados, strBI y
strB2, que codifican la amidinotransferasa que participa en la biosíntesis del resto
de estreptidina (OHNUKeIt al., 1985a, b; DISTLER et al., 1987b; TOHYAMA et al.,
1987; MAYERe t al., 1988
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Figura 13 Agrupaciones de genes para la producción de estreptomicinas
(SM) y los aminoglucósidos de Ca, bluensomicina (BM) y espectinomicina
(SP) relacionados. Los productores de estreptomicetos investigados más
intensamente son las cepas de S. griseus (Sgr) N2-3-11 y DSM40236, S.
glaucescens (Sgl) GLA.0 (ETH 22794), S. bluensis (Sbl) DSM40564 y S. flavo -
persicus (Sfl) NRRL 2820. Se proporcionan mapas de restricción para
algunas enzimas para orientación; los grupos se alinean de acuerdo con sus
genes de amidinotransferasa [strB (l)] homólogos.
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Figura 15 La vía dTDP-dihidrostreptosa. Para el sistema de numeración y
etiquetado, vea la leyenda de la Fig. 14; los intermedios son (12) D glucosa-1-
fosfato, (13) dTDP-D-glucosa, (14) dTDP-4-ceto-6 desoxi- ~ -glucosa, (15)
dTDP-4-ceto- ~ -ramnosa
4.1.1.2 La vía de la L-dihidrostreptosa
GRISEBACH (1978) postuló una ruta para dTDP-L dihidrostreptosa similar a la
que conduce a L-ramnosa activada en bacterias gramnegativas: activación de D-
glucosa en forma de dTDP D-glucosa (paso 12, Fig. 15), deshidratación a dTDP-4-
ceto-6 desoxiglucosa (paso 13), epimerización a dTDP-4-ceto- ~ ramnosa (paso
14), y reducción acoplada a un reordenamiento de la cadena de carbono hexosa
que produce dTDP-L-dihidrostreptosa (paso 15). Las 4 enzimas que catalizan la
síntesis de dTDP-L-dihidrostreptosa están codificadas por los genes strD, strE,
strM y strL (ver Tab. 2 y Fig. 14; DISTLER et al., 1987b).
La evidencia que lo respalda es el alto nivel de homología que comparten con los
genes respectivos que codifican las enzimas de biosíntesis de L-ramnosa en
salmonellae, rfbA, B, C, D y su actividad en Escherichiu coli (REEVES, 1993;
PIEPERSBERG , 1994; S. VERSECK y W. PIEPERSBERG, datos no publicados).
StrD está relacionado con NDP-hexosa sintasas (pirofosforilasas) (DISTLER et al.,
1987b). Los genes similares a todo o parte del grupo strDELM están presentes en
muchos otros grupos de genes que codifican enzimas para la producción de
metabolitos secundarios de estreptomicetos que contienen un resto de azúcar
6DOH (PIEPERSBERG, 1994; LIU y THORSON, 1994; VINING y STUT-TARD ,
1994). En un examen de las cepas de estreptomicetos, más de 50 de las cuales
produjeron 6 metabolitos secundarios que contenían desoxihexosa, la mayoría
parecía poseer genes que se hibridan con strD, E (L, M (STOCKMANaNn d
PIEPERSBERG, 1992). Por lo tanto, esta parte de la El grupo de genes str parece
estar muy extendido entre los estreptomicetos productores de antibióticos y otros
grupos bacterianos (ver Secciones 5.3 y 6). WOTZKI et al., 1991; PIEPERSBERG,
1994).
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4.1.1.3 Vía de hexosamina
La síntesis del tercer resto de estreptomicina, N-metil-L-glucosamina (NMLGA)
(activada por NDP), se ha estudiado intensamente. Se han postulado varias vías
especulativas, incluida la nucleotidilación, la desacetilación de uno de los
intermedios (si se forman UDP-N-acetil-hexosaminas) y al menos tres pasos de
epimerización, uno de los cuales podría dividirse en etapas separadas de
oxidación y reducción en C -4 de la hexoseamina, seguido de N-metilación. El
precursor directo aún se desconoce, pero podría ser D-glucosa-1-fosfato, D
glucosam-he-1-fosfato, N-acetilm-glucosamina-1-fosfato o N-metil-D-glucosamina
(S. BEYER y W. PIEPERSBERG, datos no publicados). Además, las estructuras
publicadas, hexosaminas activadas por UDP y fosforiladas (HIROSE-KUMAGAI et
al., 1982; KUMADA et al., 1986), de intermedios putativos de la vía V-metil-L
glucosamina (NMLGA) que se acumularon en el el tipo salvaje y en un mutante
bloqueado en la ruta NMLGA no puede explicarse por la ruta actualmente
postulada. Otro problema no resuelto es la formación del grupo N-metilo en N
metil-L-glucosamina que podría introducirse al nivel de D glucosamina o más tarde
en la vía, quizás incluso después de la condensación de los tres restos de
estreptomicina (OKUDA e ITO, 1982, op. Lit.).
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Figura 16 La vía NDP-N-metil-L-glucosamina (NMLGA). Para el sistema de
numeración y etiquetado, consulte la leyenda de la Fig. 14. La ruta exacta de
formación de NMLGA es desconocida y podría proceder a través de CDP-
glucosa (A) o un derivado desconocido de NDP-D glucosamina (B) como
precursores (para detalles, ver texto). Los posibles intermedios en (A) son
(16) D-glucosa-1-fosfato, (17) CDP-D glucosa, (18) CDP-4-ceto-D-glucosa, (19)
CDP-4-ceto- ~ - manosa, (20) CDP-L-manosa, (21) CDP-2-ceto- ~ -glucosa,
(22) CDP-L glucosamina; posibles intermedios en (B) son (16a) NDP-D
glucosamina, (17a) NDP-N-metil-D-glucosamina, (18a) NDP-N metil-D-
manosamina, (19a) NDP-4-ceto -N-metil- ~ manosamina, (20a) NDP- 4-ceto-N-
metil- ~ -glucosam
Los genes strFG se mapearon en una región que complementaba un mutante
bloqueado en la ruta de N-metil-L-glucosamina. Las comparaciones de proteínas
sugieren que tanto StrF como StrG podrían ser miembros del grupo de las
isomerasas (o epimerasas) de azúcar independientes de dinucleótidos (no
oxidorreductasa) e incluso podrían formar una enzima heterodimérica
(MANSOURI y PIEPERSBERG, 1991). Un candidato para una 35-epimerasa (Fig.
16, pasos 18 y 19a) en la ruta de la N-metil-L-glucosamina es StrX debido a su
similitud significativa con otras 35-epimerasas como StrM (ver sección 4.1. 1.2; S.
35
BEYER y W. PIEPERSBERG, datos no publicados). La proteína StsG tiene tres
motivos conservados que generalmente se encuentran en metiltransferasas.
37
ruta biosintética, ya que en las mismas cepas se forma un manosidohidrolizado
bajo el agotamiento del catabolito de carbono (INAMINE y DEMAIN, 1975). Más
tarde, también se detectó un producto dimannosilado en cepas de S. griseus
(IKEDA et al., 1985a), además de las modificaciones del grupo amino N-metil-L-
glucosamina como en las ashimicinas producidas por S. griseus FT3-4 ( TOHMA
et al., 1989). Además, los productos finales pseudodisacáridos de la familia de
estreptomicina que carecen del resto N-metil-L-glucosamina tienen actividad
antibiótica y se presentan como productos naturales en las fermentaciones de
Streptomyces sp. cepa AC4437 (AWATA et al., 1986).
38
Figura 17
39
4.1.2 Estreptomicina relacionada con los Aminogl ycósidos de Ca
Espectinomicinas (actinospectacina). La molécula de espectinomicina (ver Fig. A2)
está compuesta de dos derivados de hexosa condensados dobles, un mioinositol y
un derivado 6DOH (actinospectosa, una 4,6-didesoxihexosa; cf. Fig. 8), y, por lo
tanto, es un compuesto de Ca (4,5) -6DOH como lo es la
dihidroestreptosilstreptidina (AC4437) producida por algunos estreptomicetos
(AWATA et al., 1986). La incorporación de glucosa marcada con isótopos
radiactivos y estables en ambos restos claramente apoya esta interpretación
(OTSUKA et al., 1980). Sin embargo, no se han informado más estudios
bioquímicos sobre la vía, a excepción de la reciente demostración en un productor
de espectomicina de una L-g1utamina: escifosinosa aminotransferasa similar a la
encontrada en los productores de estreptomicina (cf. Sect. 4.1.1.1; WALKER,
1995). Recientemente, se clonó un segmento de ADN que confiere resistencia a la
espectinomicina (3,65 kb) del productor de espectinomicina S. flawpersicus NRRL
2820 (J. AL-TENBUCHNER y D. LYUTZKANOVA, comunicación personal). La
secuencia de ADN sugirió que se derivaba de un grupo de genes de
estreptomicina reordenado y degenerado ya que mostraba una sorprendente
similitud con tres genes, strBl, strR y strN en los respectivos grupos de S. griseus y
S. gfaucescenso (cf. Fig. 14). El gen relacionado con strB2 se elimina y su
producto proteico truncado (80 aa) es ciertamente no funcional. La eliminación
probablemente estuvo acompañada o precedida por una inserción de un elemento
IS similar a IS112, parte del cual se ha retenido. Además, el patrón de similitud
entre los marcos de lectura es desconcertante: el producto del gen relacionado
con strB2 muestra 83.8% y 92.5%, el producto del gen relacionado con strR 45.9%
y 47.5%, y el producto de strN- gen relacionado 29.5% y 29.4% de identidad con
las proteínas StrB1, StrR y StrN, respectivamente, de S. griseus y S. gfaucescens.
Todavía no se sabe si hay otros genes de producción de espectinomicina
adyacentes a este grupo. Sin embargo, este hallazgo respalda firmemente la
hipótesis de que un grupo de genes de producción ancestral para aminoglucósidos
similares a la estreptomicina podría haberse desarrollado en otra variante por
evolución divergente después de la degeneración, modificación y, más tarde,
recombinación frecuente con un grupo de genes strlsts intactos creando así una
nueva vía que produce productos finales más simples pero efectivos. Más
recientemente, se ha descrito un nuevo derivado de la espectinomicina, la
espenolimicina (Fig. A3) (KARWOWSKI et al., 1984). Su resto 6DOH se altera
porque la posición 3 'contiene un grupo oximetilo y el enlace C-3' 14 'es
insaturado, lo que recuerda las modificaciones que ocurren en otros residuos
6DOH, por ejemplo, en antraciclinas (ver Figs. 8 y 9 y sección 5.3).
40
(4) -6DOH (minosaminomicina; Fig. A5). Sin embargo, es razonable postular vías
similares a la estreptomicina también para estos aminoglucósidos. Los ciclitoles se
derivan claramente de mioinositol. Sin embargo, el postulado de UMEZA-WA et al.
(1986) que el resto 6DOH kasugamina podría derivarse de UDP-N-acetil-D-
glucosamina parece poco probable en vista de lo que se ha aprendido de la vía de
estreptomicina y de otras vías 6DOH o hexosamina en el pasado reciente. Más
bien, parece probable que se utilice una ruta biosintética dTDP- o CDP-hexosa, ya
que el producto final es un derivado de 2,3,4,6-tetradesoxi-2,4-diaminohexosa (cf.
Sectas. 3.2.1 y 5.3).
41
estructurales tanto con la miomicina (en la unidad pseudodisacárida de ciclicitol (4)
-3-amino hexosa; ver arriba) como con las seldomicinas (en la unidad de ciclitol (6)
-2-amino-pentosa; cf. Sección 4.3) le da un claro papel de puente entre los
aminoglucósidos Ca y los '(2DOS-) Cb, y será interesante ver si esto se refleja en
similitudes a nivel genetidenzymic. La incorporación de una D-manoheptosa lo
hace único entre los aminoglicósidos que contienen ciclitol y podría ser otra
indicación de la hipótesis de que la producción de componentes de la pared
celular de bacterias gramnegativas (p. Ej., Lipopolisacárido) y muchos antibióticos
en estreptomicetos. puede basarse en el mismo grupo de genes (PIEPERSBERG,
1992,1993).
42
(3) Los aminoglucósidos de la serie LL-BM123 (Fig. A6), producidos por Nocardia
sp., Son nuevamente compuestos de origen biosintéticamente mixto ya que
también contienen residuos de aminoácidos como la minosaminomicina. Su
fórmula de ruta única es Ca (4) -H (4) - HA, donde el disacárido D-glucosaminil-
(pl, 4) - ~ -nannanosa está unido glucosídicamente a la posición 4 de la 2-amino-2-
desoxi- resto mioinositol. El último aminociclitol debería derivarse del mioinositol,
que de nuevo solo se puede formar a través de una aminotransferasa con
diferente selectividad de sustrato en relación con la proteína StsC implicada en la
biosíntesis de estreptidina (véase la sección 4.1.1.1).
Lyspora hirsuta ATCC 20501 (Fig. 18 y Tab. 3; ITOH et al., 1984; ODAKURA et
al., 1984; DAIRI y HASEGAWA, 1989; HASEGAWA, 1991, 1992; DAIRI et al.,
1992a, b, c; OHTA et al., 1992a, b, 1993a, b; OHTA y HASEGA-WA, 1993a, b;
HOTTA et al., 1995). De los aproximadamente 20 pasos de la biosíntesis de FTM-
A, 14 han sido identificados por varios métodos, incluida la inducción y el análisis
de mutantes bloqueados, la clonación de genes y la alimentación de intermedios.
La mayoría de los genes de producción (fms) parecen estar agrupados en un
fragmento de ADN de ca. 30 kb o más en M. olivasterospora. El orden de los
genes identificados en M. olivasterospora ATCC 21819 es fmsl0, 13, 3, 4, 5, 12, 8,
7, 14,1,11, (orf2), fmr0, (orf4). Este segmento de ADN en su conjunto solo se
hibrida con el ADN genérico de Micromonospora sp. SF-2089 y D. matsuzakiense
(DAIRI et al., 1992b). Sin embargo, el patrón de restricción de las bandas de
hibridación fue casi idéntico solo en la cepa Micromonospora sp. SF-2089. En el
ADN de los otros tres productores investigados no se observó hibridación con el
43
fragmento de 30 kb, pero cuando los genes individuales para funciones
conservadas se tomaron como sondas, por ejemplo, el fmsl3 (smsl3; codificando
el N-glycyltransferase), se observó una hibridación significativa con el ADN de los
seis productores (OHTA et al., 1992b). Por lo tanto, parece probable que todos los
productores de aminoglucósidos de tipo FTM contengan grupos de genes
altamente relacionados que se originan a partir de una fuente evolutiva común con
algunas modificaciones menores, como el uso de una vía diferente para la
formación del (2-desoxi ) - precursor de la silo-inososa. y HASEGAWA, 1993a, b;
OHTA y col. 1993a, b; ver Sect. 4.5) En cada caso, el gen de resistencia simple
parece residir en el grupo de genes de producción.
44
Figura 18 La vía fortimicina (FTM, astromicina). La misma vía a partir de la 2-
desoxi-scilo-inosamina parece estar establecida en los productores de
istamicina / sannarnicina / esporaricina. Se dan los intermedios conocidos y
los pasos enzimáticos postulados; para más detalles, ver HASEGAWA (1992)
y HO'ITA et al. (1995)
Sin embargo, parecen estar organizados de manera diferente en los grupos de
genes en ambos grupos (OHTA et al., 1993a). Por lo tanto, el conjunto de genes
utilizados en el productor de dactimicina podría ser una mezcla de las dos líneas
evolutivas extremas encontradas en los otros productores del grupo FTMlISM
aminoglucósidos: (1) contiene probablemente una vía Cb como el tipo ISM
(sanamicina) productores; pero (2) tiene el gen y el perfil de resistencia, así como
la mayor similitud de secuencia de ADN con los productores de tipo FTM (SF-
2051).
45
Los dos últimos pasos en la formación de FTM-A (transferencia de glicil) y FTM-C
(N-para-mimidoilación del grupo glicil amino; cf. Fig. 18), catalizados por los
productos génicos Fmsl3 y Fmsl4, respectivamente, en M El olivuterosporu (Tab.
3) representa la fase bioquímicamente mejor investigada de la ruta biosinética
para los aminoglucósidos de tipo FTM. Los genes para estos dos pasos han sido
clonados, analizados en parte, y se ha encontrado que están presentes en todos
los productores de aminoglucósidos de tipo FIM / ISM ya sea por hibridación o por
actividad (DAIRI et al., 1992c; OHTA et al. , 1992b). En un mutante bloqueado del
productor ISM, S. tenjimuriensis FTM-B se convirtió en 1-epi-FIM-B, dactimicina y
l-epi-dactimicina; M. olivasterosporu a su vez convirtió ISM-A. e ISM-Bo en ISM-A3
e ISM-B3, respectivamente (ver Fig. A10 HOTTA et al., 1989; DAIRI y
HASEGAWA, 1989). El mecanismo de la transferencia de glicilo y la posible
activación del residuo de glicilo (p. Ej., Aminoacil-AMP) aún no se ha estudiado.
Se demostró que el grupo N-formimidoilo deriva de la glicina, cuyo grupo C-2 se
convierte mediante un mecanismo de oxidasa inusual en el grupo formimidoilo y
probablemente COa solo en presencia de oxígeno molecular; esto es catalizado
por la enzima Fmsl4 que contiene FAD (DAIRI et al., 1992 ~). Otro producto
génico interesante es la Fms8 fosfotransferasa, que probablemente cataliza la
fosforilación 3 '-OH del resto de purpurosamina en el intermedio FTM-KK1. Esta
enzima es homóloga a las enzimas APH (3 ') codificadas por los genes nmrA y
aph de Micromonosporu sp. Productora de neomicina. y Streptomyces fradiae,
respectivamente, y pueden ser reemplazados por los últimos productos génicos
(DAIRI et al., 1992a). Sin embargo, su implicación en la interesante
deshidroxilación 3 ', 4' no está clara (ver Fig. 18, pasos 8, 9). Para esta fase de la
ruta probablemente se requieren varios pasos: (1) la deshidratación en C-3 'podría
ocurrir a través de un mecanismo similar al que opera en la ruta de 3,6-
didesoxihexosa en bacterias gramnegativas (cf. Sect. 3.2.1 y Fig. 10); (2) una
reacción de 4'5'-deshidratasa como se sugiere por la aparición de 4'3'-
deshidratado-FTM-A; (3) una etapa de reductasa / deshidrogenasa) reduciendo el
doble enlace 4 ', 5'.
46
encontrado muy pocos hallazgos nuevos. publicado. Por lo tanto, aquí solo se
ofrece un breve resumen de lo que se conoce actualmente.
47
unidad NMLGA de estreptomicina (ver sección 4.1) queda por mostrar. Más
adelante, las rutas 2DOS se ramifican en varias rutas alternativas que dan como
resultado la gran variedad de productos finales (ver Figs. All-A17).
Los compuestos que están sustituidos con 4,5 en el aminociclitol, como las
neomicinas, paromomicinas, lividomicinas (Fig. A1 l; básicamente Ha- (4) Cb (S) -
P (3) -HA) o ribostamicinas, y las butirosinas (Fig. A13; básicamente Ha- (4) Cb (5)
- P), probablemente se sintetizan directamente a partir de la romamina o por
medio de un segundo pseudodiscoloide, neamina (Fig. 19), seguido de la unión de
un pentosa furanosídica, xilosa (formando xilostasinas) o ribosa (formando
ribostamicinas) que finalmente pueden ser glucosiladas por una 2,6-diamino-2,6-
didesoxihexosa (neosamina B o C) en las neomicinas y pa- romomicinas Los
pseudodisacáridos son claramente intermedios y pueden convertirse directamente
en los productos finales respectivos en mutantes bloqueados en su formación, por
ejemplo, en la ruta biosintética del aminociclitol. La neamina (neomicina A) tiene
una actividad antibiótica medible. La vía de las neosaminas B y C es tan oscura
como la de la primera unidad de hexosamina, aunque está claro que la D-
glucosamina se incorpora preferentemente en ellas. El tipo de activación, la (s)
glicosiltransferasa (s) y la ruta de incorporación de un segundo amino-N en la
posición C de la 2-aminohexosa aún no se han establecido enzimáticamente.
También podría existir una similitud con la situación en S. griseus productor de
estreptomicina: UDP- (N-acetil-) D-glucosamina podría no ser un precursor
inmediato como en la biosíntesis de la pared celular. Por lo tanto, será necesario
detectar también una enzima nucleotidiladora relacionada con StrQ entre los
productos génicos implicados en la biosíntesis de aminoglucósidos de tipo
neomicina. En este contexto también son importantes los resultados de estudios
de biogénesis más recientes con glucosa etiquetada con 13C y 6-13C, que
sugieren que todos los componentes básicos de la neomicina parecen estar
formados por intermedios del ciclo de la pentosa fosfato (Fig. 20; RINEHART et
al., 1992). Si este "equilibrio" de todas o la mayoría de las moléculas de glucosa a
través del ciclo de la pentosa fosfato ocurre generalmente para todas las hexosa y
otros componentes de carbohidratos en metabolitos secundarios dentro de la fase
de producción, los resultados anteriores de los estudios de etiquetado de isótopos
tendrían que ser reinterpretado Aminoglucósidos 2DOS 4,6-disustituidos.
Las kanamicinas-tobramicina (Fig. A12 HA- (4) Cb (6) -HA), las gentamicinas-
sagamicina (Fig. A14; HA- (4) Cb (6) -PA), y probablemente también las
seldomicinas (Fig. A17; los grupos HA- (4) Cb (6) - PA) de 2DOS que contienen
aminoglucósidos también se sintetizan a partir de paromamina. Sin embargo, su
sustitución adicional en la posición C6 del ciclitol y la naturaleza y modificación del
48
segundo residuo glucosídico distinguen las gentamicinas de las seldomicinas en
las que un resto de azúcar piranoide C-5 se reemplaza por una hexosamina. Este
azúcar en los compuestos relacionados con la gentamicina es D-xilosa (la unidad
de pseudodisacárido formada con el ciclosito 2DOS se llama garamina) y podría
ser D-xilosa o 2-amino-2-desoxi-~ -xi-pérdida en las seldomicinas. Dado que las
gentamicinas solo se producen en Micromonospora spp., Y las seldomicinas solo
se encuentran en Srrepromyces spp. Será de interés estudiar las relaciones
mutuas entre los respectivos conjuntos de genedenzimas biosintéticas en relación
con los involucrados en la producción de los otros grupos de aminoglucósidos que
contienen 2DOS. El estudio más intensivo sobre el diseño de una ruta 2DOS
individual se llevó a cabo en el grupo de gentamicina (GM) -sisomicina-sagamicina
(KASE et al., 1982; cf. UMEZA-WA et al., 1986) que es uno de los más versátiles
con más de 20 productos finales identificados. Se deben mencionar algunos
detalles para la comparación (para las fórmulas, ver la Fig. A 14): (1) un mínimo de
20 enzimas probablemente esté involucrado en la biosíntesis de, por ejemplo, GM-
C; (2) muchos de los pasos, por ejemplo, deshidrogenación y transaminación en
las posiciones 3 y 6 de piranosas, o N-metilación y deshidratación, se parecen a
los de otras rutas de aminoglucósidos; (3) la ruta de ramificación múltiple avanza
desde el primer intermediario trisacárido GM-A2 a GM-X2 y luego se ramifica para
producir los dos intermedios insaturados sisomicina (a través de JI-20A) y
verdamicina (a través de G-418, un compuesto que ahora con frecuencia utilizado
para la selección de vectores de clonación en células vegetales y animales). En
algunas cepas, estos dos intermedios ya pueden ser los principales productos
finales que se liberan. Esta fase biosintética se asemeja mucho a los pasos de
3,4-deshidroxilación en la ruta de fortimicina (cf. Fig. 18; pasos 8, 9); sin embargo,
la aparición de una 2,3,4,6-desoxi-2,6-aminohexosa 3,4-insaturada indica que la
deshidratación (probablemente de un precursor 4-hidroxilado después de 3-
deshidroxilación; cf. LIU y THORSON, 1994) es un paso en este proceso (véase
también la sección 4.2). La última fase de la biosíntesis de GM que produce los
productos finales GM-C ,, GM-C ,,, GM-C2 y sagamicina, que se utilizan
principalmente en terapéutica implica etapas de reducción, epimerización y N-
metilación, probablemente mediante acción de los mismos enzimas en intermedios
diferentes pero estructuralmente relacionados.
49
Figura 19
50
Figura 20 Biogénesis de los componentes derivados de hexosa, pentosa y
ciclotol en neomicina a partir de 6- (CL3) - ~ - glucosa (según RINE-HART et
al., 1992). Los patrones de etiquetado medidos por (C ”) RMN prueban que
todas las unidades se construyen preferentemente a partir de unidades C,
(0), C2 o C3 (líneas gruesas) reorganizadas por reacciones catalizadas por
transcetolasa y transaldolasa en pasajes a través de el ciclo de
penosfosfato. Los patrones de etiquetado anteriores obtenidos con 1- (*) o
1,6-etiquetas (DLA) glucosas también se dan a partir de los cuales no fue
posible una diferenciación entre la incorporación directa o indirecta de
glucosa.
Apramicinas y Destomicinas. La apramicina toma una posición más distante en
relación con los otros aminoglucósidos 2DOS (Fig. A15; CB (4) -OctA (S) -HA) y la
destomicina-higromicina B (Fig. A16 Cb / Ca (S) -H (2,3) -HepA) grupo. En las
apramicinas monosustituidas en la posición 4 del resto 2DOS, la paminamina
podría ser un intermediario. La vía adicional requeriría entonces un alargamiento
en el grupo 6'-hidroximetilo del resto hexosamina por una unidad C-2 que, sin
embargo, parece bastante improbable. Una ruta alternativa sería la condensación
de 2DOS con un derivado de octosa, que recuerda la vía inusual de la octosa en
las lincosamidas (véase la sección 5.1; RINEHART, 1980; véase también la
discusión en OKUDA e ITO, 1982). Además, el resto 4-amino-4-desoxi-~-glucosa
unido glicosídico a la posición 8 'es bastante inusual entre los aminoglucósidos; La
transaminación 4 también se produce en los compuestos relacionados con la
kasugamicina, pero en una unidad 6DOH (véase la sección 4.1). Esta unidad
51
podría sintetizarse mediante la transaminación de un intermedio de NDP-4-
cetoglucosa formado por una enzima relacionada con la UDP-glucosa 4-
epimerasa (véase la sección 3.2). En las destomicinas y la higromicina B, el resto
2DOS está 5-sustituido con una hexosa inusual, D-talosa. Esto a su vez se fusiona
a través de un tipo único de enlace químico, un enlace orto-éster entre los 2'- y 3'-
hidroxilos y la posición 1 "de un ácido de azúcar derivado de una 6-amino-6-
desoxiheptosa , ácido destómico. Estos detalles estructurales sugieren que hay
muy poca semejanza entre las vías de la higromicina B y la producción de
destomicina y las de otros aminoglucósidos, a excepción de la biosíntesis del
aminociclitol. Curiosamente, las cepas de Streptomyces eurocidicus y de
Saccharopolyspora hirsuta producen los derivados de destomicina, SS-56-C y lN-
amidino-1N-demetil-2- hidroxdestomicina A (INOUYE y col., 1973; IKEDA y col.,
1985b; cf. Fig. A16), respectivamente. ly, que son claramente compuestos de Ca y
están relacionados con la estreptidina en sus restos de diaminociclitol. Aquí, un
evento de recombinación de ADN que resulta en la fusión de dos grupos de
genes, aquellos para la producción de estreptomicina y destomicina, podría haber
creado una nueva vía mixta. el gen de estreptomicina agrupa esos ge nes
necesarias para la producción del intermedio 1-N-amidinostreptamina-6-fosfato (cf.
La figura 14) podría ser utilizada. La unidad de estreptamina en SS-56-C podría
formarse directamente a partir de scilo-inosamina o por hidrólisis del grupo l-N-
amidino a partir de l-N-amidino-estreptamina. Esto también podría significar que
los intermedios de 6-fosfato de las destomicinas se forman dentro de las células
como en el caso de los productores de estreptomicina.
53
Figura 21Biogénesis propuesta de nojirimicina y análogos de
monosacáridos relacionados. (D) NJ: (1-desoxi-) nojirimicina; (D) MJ: (1-
desoxi-) manonojirimicina. Los patrones de marcaje obtenidos de D-glucosa
marcada con 1,6 se adoptaron de RINECHART et al. (1992) (cf. Fig. 20).
Trehalosaminas y otros aminodisacáridos. Un grupo más grande de productos de
actinomicetos que contienen nitrógeno y carbohidratos son compuestos con
analogía estructural a los disacáridos trehalosa o sacarosa. La mayoría de estos
tienen alguna actividad biológica, ya sea como antibióticos o como inhibidores de
la glucosidasa. Las trehalosaminas a, glicosídicas y (Fig. A19; HA (1) -H) se
conocen desde hace mucho tiempo y se aislaron debido a su actividad
54
antibacteriana que, sin embargo, es solo débil (cf. UMEZAWA et al. , 1986;
ASANOe t al., 1989). La biosíntesis de 2-trehalosamina y manosil glucosaminida a
partir de una molécula de D-glucosamina y D-glucosa o D-manosa,
respectivamente, por enzimas relacionadas con la trehalosa sintasas puede ser
fácilmente considerada. Por el contrario, la derivación de 3- y 4-trehalosaminas
que también se producen como productos de estreptomicetos podría seguir al
menos dos rutas diferentes:
55
unidad de 4-desoxi-~-glucosa (familia de acarviosina de inhibidores de a-
glucosidasa y trehalasa). Esto sugiere que la reacción de aminotransferencia tiene
lugar en un precursor de la fracción C, ciclitol y que la valienamina podría ser un
intermediario para todos los demás derivados (véanse las figuras 6,21 y A21, A22;
cf. RINEHART et al., 1992) .
Las validamicinas son a-D- o P-D-glucosiladas en varias posiciones (Fig. A21) que
podrían lograrse mediante glucosiltransferasas extracelulares o asociadas a la
pared celular. Además, la familia de inhibidores de la glucosidasa acarviosina, que
comprende acarbosa, amilostatinas, oligostatinas, "amino-oligosacáridos"
(derivados epoxídicos de amilostatinas), adiposinas, trestatinas y AI-5662, todos
están glucosilados de forma variable, principalmente por condensación con
unidades di- u oligosacáridas tales como maltosa, oligomaltodextrinas, trehalosa o
unidades de acarviosina (TRUSCHEITet al., 1981; MULLER, 1989). Nuevamente,
el mecanismo de adición de tales bloques de azúcares oligosacáridos podría ser
un proceso extracelular asociado a la membrana similar a la formación
dependiente de bactoprenol de heteropolisacáridos extracelulares, por ejemplo,
cadenas 0 de lipopolisacárido (GOEKE, 1986; RAETZ, 1996). Alternativamente,
estos compuestos podrían ser excretados como precursores inactivos por
exportadores especiales similares a la estreptomicina (véase la sección 4.1.1.4).
Este punto de vista está respaldado por la reciente identificación de una 7-
fosfotransferasa acarbosa en la producción de Actinoplanes sp. (DREPPER y
PAPE, 1996).
56
al., 1986). Es tentador especular que estos compuestos podrían derivarse de una
ruta similar a la de las fortimicinas, seguida de una división de anillo reductora
entre las posiciones C-1 y C-2 de un aminociclitol similar a la fortamina más
adelante en la ruta (cf Sección 4.2; cf. Figura 18). De hecho, un precursor de
amina no metilado y no metilado podría ser el precursor directo del 1,4-
diaminosorbitol con una epi- merización adicional en la posición c-5 (C-3 de
fortarina) creando la configuración estereoquímica del sorbitol. La presencia de
una 4-amino-4-desoxi-glucosa se puede explicar de dos maneras, en cuanto a la
biogénesis de 4-amino-4-desoxitrelosa (ver la discusión sobre trehalosaminas más
arriba). De acuerdo con la similitud con la vía de fortimicina, un precursor preferido
sería el Camino-glucosa preformado (NDP-).
57
Esto podría sintetizarse a través de reacciones similares a las etapas iniciales
postuladas para la biosíntesis de la fracción NMLGA de estreptomicina (cf.
Sección 4.1; cf. Fig. 16), por lo que se forma un conveniente intermedio 4-
cetohexosa. que podría usarse como sustrato de aminotransferasa.
58
coli y Pseudo-monas aeruginosa (UMEZAWA et al., 1967a, b), por primera vez
condujo a la especulación de que la resistencia a los antibióticos transferible
podría haber evolucionado en general en los productores de estos productos
naturales (BENVENISTE y DAVIES, 1973). Más tarde, la modificación del sitio
diana ribosómico a través de la metilación específica de ARNr 16s también se
identificó como un mecanismo principal de resistencia a aminoglucósidos en los
productores (PIENDL et al., 1984; CUNDLIFFE, 1989, 1992a). Por primera vez, se
demostró que la transferencia de un gen entre bacterias gram positivas y
gramnegativas en la naturaleza ocurre con un gen de resistencia a
aminoglucósidos: el gen aphA-3 (kanamicinomicina 3 '- fosfotransferasa) se
transfirió entre enterococos ( también estreptococos y estafilococos) y
Campylobacter coli (revisado en COURVALIN, 1994). Algunos de los genes de
resistencia a los aminoglucósidos podrían haberse diseminado de los productores
de aminoglucósidos a otras bacterias en períodos evolutivos anteriores, cuyos
mecanismos ahora se están haciendo evidentes (MAZODIER y DAVIES, 1991;
COURVAIJN, 1994). En este contexto, también es interesante que existan
sistemas multifactoriales relacionados para el transporte intracelular de ADN y
moléculas de proteínas que funcionan específicamente entre bacterias y otros
tipos no relacionados, como células de otros géneros bacterianos y células
vegetales y animales (POHLMAN et al., 1994). Se ha avanzado mucho en el
análisis de los mecanismos de resistencia en productores bacterianos de
aminoglucósidos y otros compuestos autóxicos que contienen carbohidratos (Tab.
4, Fig. 23). Nuestro conocimiento actual se puede resumir de la siguiente manera:
(1) Hay dos fenómenos bioquímicos que confieren resistencia básica: primero, la
eliminación específica de la función inhibidora dentro de la célula productora (por
ejemplo, inactivación por modificación, modificación del sitio objetivo o la
producción de un nuevo insensible versión del complejo diana normal) y el
segundo transporte activo del inhibidor fuera de las células a través de
exportadores de energía. El primer tipo podría considerarse como un mero
mecanismo de autoprotección que emplea grupos químicos protectores o
mecanismos de derivación, mientras que el segundo tiene su función principal en
el transporte de los compuestos fuera de las células para permitir que los
productos finales bioactivos alcanzar sus destinos naturales, es decir, otras
células. Solo podemos especular sobre las funciones naturales de estos
compuestos y la naturaleza de las células objetivo. En general, estas células
objetivo podrían ser otras células del mismo organismo (funciones similares a las
hormonas: las células objetivo serían etapas no productivas o de otro modo
diferentes del ciclo de vida) o células de otros organismos, por ejemplo,
competitivos (DAVIES). et al., 1992; PIEPERSBERG, 1993).
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(2) Los exportadores activos se han identificado hasta ahora solo para antibióticos
como macrólidos, antraciclinas, tetraciclinas (véase la Tabla 4), pero no para
aminoglucósidos. Curiosamente, dos genes, strV y strW, se han detectado
recientemente en los grupos de genes de producción de estreptomicina de S.
glaucescens y S. griseus; Estos genes codifican un nuevo tipo de transportadores
ABC (PIEPERSBERG, 1995; BEYER et al., 1996). Como la estreptomicina se
secreta en forma inactiva y fosforilada (WALKER, 1975b; MANSOURI y
PIEPERSBERG, 1991; PIEPERSBERG, 1995), estos exportadores
transmembrana, si son responsables de la secreción, no darían lugar a un fenotipo
de resistencia (RETZLAFF et al., 1993) . Hay evidencia que respalda esta
hipótesis: S. lividans 66 cepas que llevan una combinación de las unidades de
transcripción strA [APH (6)] y strVW en plásmidos convierten la estreptomicina
añadida en un estreptomiccindfosfato acumulado extracelularmente
(desafortunadamente esos clones resultaron ser muy inestable; S. BEYER y W.
PIEPERSBERG, datos no publicados). Por lo tanto, la vista anterior estaría
respaldada además por la posible existencia de un sistema de exportación activo,
también para precursores de aminoglucósidos antibióticos inactivos de las células
productoras. Será de mayor interés investigar la presencia de genes
transportadores similares en otros grupos de genes de producción de
aminoglucósidos. Recientemente se ha identificado un tipo diferente de proteína
unida a la membrana como el producto del gen butB en Bacillus circulans NRRL
B3312 (AUBERT-PIVERT y DAVIES, 1994; HOTTA et al., 1995). La proteína ButB
está relacionada con las proteínas de la capa S asociadas a la pared celular en
bacterias gram positivas de bajo G + C y la interrupción de su gen bloquea la
producción de butirosina, lo que indica eso. También podría estar involucrado en
la exportación de aminoglucósidos.
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1975b; sin embargo, a valores de KM mucho más altos; DISTLER y
PIEPERSBERG, 1985) se sugirió que también era un agente biosintético. - Zyme.
Sin embargo, entre los productos génicos para la producción de estreptomicina
hay dos, StrN y StsE, con motivos peptídicos similares a los de los centros
catalíticos de antibióticos y proteínas quinasas, especialmente HXDX ~ NX, -UD
(U = residuo hidrofóbico, p. Ej. , I, V, L) probablemente involucrados en la
transferencia del grupo fosfato (PISSOWOTZKI et al., 1991; RETZ-LAFF et al.,
1993; KNIGHTON et al., 1991; cf. también la Sección 6). Es más probable que
sean las dos fosfotransferasas involucradas en la vía de la estreptidina (ver
sección 4.1.1.1). Recientemente, un gen de resistencia a la espectinomicina que
codifica una espectinomicina fosfotransferasa, fue clonado de S. flavopersicus
NRRL 2820 que mostró una sorprendente similitud con StrN de S. griseus y S.
glaucescens (J. ALTENBUCH-NER, D. LYUTZKANOVA y J DISTLER,
comunicación personal). Este hallazgo respalda firmemente la hipótesis de que los
genes de resistencia se originan a partir de genes biosintéticos. Aquí, esta
hipótesis también debe extenderse para incluir la posibilidad de que un gen de
producción ancestral pueda convertirse en un gen de resistencia por evolución
divergente o después de la degeneración y modificación de una vía preexistente
para producir productos finales más simples pero aún efectivos ( este podría ser el
caso de la espectinomicina; ver sección 4.1). La kanamicina-6'-acetiltransferasa en
S. kanamyceticus también podría estar involucrada principalmente en la
acetilación de precursores de kanamicina por varias razones (CRA-MERI y
DAVIES, 1986; ver también más abajo).
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Figura 23 Representación esquemática de los mecanismos de resistencia
autoprotectora en productores de carbohidratos secundarios
antibióticamente activos.
(4) La resistencia a los aminoglucósidos también se produce como una propiedad
fenotípica críptica en estreptomicetos, como una segunda enzima de resistencia a
estreptomicina (estreptomicina-3 ”-fosfo-transferasa) y enzima de resistencia a
kanamicina (kanamicina-3- N-acetiltransferasa) en S. griseus (HEINZEL, et al.
1988; HOITA et al., 1988). Se puede usar como base para la detección de nuevos
productores de antibióticos similares a los aminoglucósidos (ETIENNE et al., 1991)
o para estimular la producción de aminoglucósidos, por ejemplo, el gen 6'-
acetiltransferasa de S. kana- myceticus estimula producción de aminoglucósidos
cuando se introducen varias copias en los productores de kanamicina y neomicina
(CRAMERI y DAVIES, 1986).
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actividad enzimática. Principalmente para la S. griseus productora de
estreptomicina como sistema modelo, describiremos aquí algunos de los detalles
más importantes conocidos o postulados (resumidos en la Fig. 24).
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subyacentes al efecto positivo de la asparagina y la prolina (SHAPIRO, 1989) o la
represión de la síntesis de estreptomicina por valina (ENSIGN, 1988; NEUMANN
et al., 1996) en S. griseus actualmente no se comprenden. Estos compuestos
podrían influir en la expresión de enzimas biosintéticas clave a nivel genético. Esta
influencia podría estar mediada por un sistema similar a NtrB / NtrC o por una
modulación de las actividades de las enzimas metabólicas primarias y las enzimas
biosintéticas de estreptomicina a nivel fisiológico a través de la acumulación y
excreción de metabolitos mediante, por ejemplo, la regeneración de
retroalimentación presión o inducción de vías gluconeogenéticas o condiciones
metabólicas que favorecen rutas especiales del metabolismo intermediario, como
el ciclo del pentosefosfato utilizado en la "dirección inversa".
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