Td de biologie animal : vertébrés

Exercice dendrogramme

La première petite valeur dans ce matrice est égale 1

donc on va faire une association entre le (H et Ch)
H+Ch Ba Lo Ca Da Bo Mo P Man
H+Ch 0
Ba 6.5 0
Lo 19.5 18 0
Ca 23.5 25 23 0
Da 25.5 27 27 9 0
Bo 28.5 29 26 31 29 0
Mo 24.5 25 24 28 28 6 0
P 34 36 38 41 40 45 43 0
Man 44 45 42 47 48 47 45 28 0
La méthode de calcule :
Ba(HCh)= BaH+BCh = 6+7 = 6.5
2 2
Lo(HCh) = LoH+ LoCh = 19+20 = 19.5
2 2
Pour la deuxième matrice la petite valeur égale 6 donc
on a association entre (Mo et Bo).
La matrice devient :
Mo+Bo HCh Ba Lo Ca Da P Man
Mo+Bo 0
HCh 26.5 0
Ba 27 6,5 0
Lo 25 19,5 18 0
Ca 29,5 23,5 25 23 0
Da 28,5 25,5 27 27 9 0
P 44 34 36 38 41 40 0
Man 46 44 45 42 47 48 28 0

La méthode de calcule :
(HCh)(MoBo) = H(MoBo)+Ch(MoBo)
=HMo+HMo+ChMo+ChBo
4
=( 25+29+24+28) / 4 = 26.5
Ba(MoBo)=BaMo+BaBo/2
=25+29/2
=27
Lo(MoBo)=LoBo+LoMo/2
=26+24/2
=25
Ca(MoBo)=CaMo+CaBo/2
=28+31/2
=29,5
Da(MoBo)=DaMo+DaBo/2
=28+29/2
=28,5
P(MoBo) =PMo+PBo/2
=43+45/2
=44
Man(MoBo)= ManMo + ManBo/2
=45+47/2
=46
Pour la troisième association la petite valeur dans la
matrice est égale 6.5 entre (HCh et Ba)
La matrice devient :
Ba+HCh MoBo Lo Ca Da P Man
Ba+HCh 0
MoBo 26.5 0
Lo 19 25 0
Ca 24 29.5 23 0
Da 26 28.5 27 9 0
P 34.7 44 38 41 40 0
Man 44.3 46 42 47 48 28 0

La méthode de calcule :
(MoBo)(BaHCh)= Mo(BaHCh)+ Bo(BaHCh)

=MoBa+MoH+MoCh+BoBa+BoH+BoCh/6
= (25+25+24+29+29+28)/6
= 26.7
Lo(BaHCh)= LoBa+LoH+LoCh/3
= 18+19+20/3
=19
Ca(BaHCh)=CaBa+CaH+CaCh/3
=25+24+23/3 = 24
Da(BaHCh)= DaBa+DaH+DaCh/3
=27+26+25/3
=26
P(BaHCh)= Pba+PH+PCh/3
=36+34+34/3
=34.7
Dans ce matrice la petite valeur est 9 entre (Ca et Da)
Donc la matrice devient :
Da+Ca BaHCh MoBo Lo P Man
Da+Ca 0
BaHCh 25 0
MoBo 29 26.7 0
Lo 25 19 25 0
P 40.5 34.7 44 38 0
Man 47.5 44.3 46 42 28 0

La méthode de calcule :
(DaCa) (BaHCh)= Da(BaHCh)+ Ca(BaHCh)
=DaBa+DaH+DaCh+CaBa+CaH+CaCh/6
=27+26+25+25+24+23/6
=25
(DaCa)(MoBo)= DaMo+DaCa+CaMo+CaBo/5
 = 28+28+29+38/4
=29
Lo(DaCa)= LoDa+LoCa/2
=27+23/2
=25
Dans la matrice ci-dessus la petite valeur égale 19 entre
(Lo et BaHCh)
Donc la matrice devient :
Lo+BaHCh DaCa MoBo P Man
Lo+BaHCh 0
DaCa 25 0
MoBo 26.25 40.5 0
P 35.5 40.5 44 0
Man 43.75 47.5 46 28 0

La méthode de calcule :
(DaCa)(LoBaHCh)= Da(LoBaHCh)+ Ca(LoBaHCh)

=DaLo+DaBa+DaH+DaCh+CaLo+CaBa+CaH+CaCh/8
= 27+27+26+25+23+25+24+23/8
=25
Dans la matrice ci-dessus la petite valeur est 25 entre
(DaCa et LoBaHCh)
Donc la matrice devient :
Lo+Ba+H+Ch+Da+ MoB p Man
Ca o .
Lo+Ba+H+Ch+Da+ 0
Ca
MoBo 27.17 0
P 37.17 44 0
Man 45 46 28 0
.

Dans la matrice ci-dessus la petite valeur égale 27.17

donc entre (LoBaHChDaCa et MoBo)
La matrice devient :
Lo+Ba+H+Ch+Da P Man
Ca+Mon+Bo
Lo+Ba+H+Ch+Da+ 0
Ca+Mo+Bo
P 38.87 0
Man 45.25 28 0

Dans la matrice ci-dessus la petite valeur égale 28 entre

(P et Man)
Donc la matrice devient :
 Man+P Lo+Ba+H+Ch+Da+
Ca+Mo+Bo
Man+P 0
Lo+Bo+H+Ch+Da+ 42.06 0
Ca+Mo+Bo

La représentation dendrogramme
 Le groupe de primates étudies est considéré
comme un groupe polyphylétique.