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Glycolyse
« cours 1 »
A.Introduction.
✦ Définition.
• La glycolyse est la voie de catabolisme oxydatif anaérobie du glucose en pyruvate.
- catabolisme : dégradation d’une molécule de glucose (6C) en 2 molécules de pyruvate
(3C).
- oxydatif : enlèvement d’un atome d’hydrogène dont l’accepteur est NAD+ se
transformant en NADH, H+.
- anaérobie : ne nécessite pas d’oxygène, mais a lieu même en présence d’oxygène.
✦ Intérêt de la glycolyse.
• Source d’énergie : d’accompagne de la production de 2 ATP, 2 NADH,H+ et 2 pyruvates.
- en anaérobiose : 2 ATP, faible rendement énergétique.
- en aérobiose : —> oydation du pyruvate en CO2 et H2O —> CK.
—> NADH,H+ —> CRM.
—> rendement énergétique élevé : 38 ATP.
• Précurseur de molécules d’intérêt biologique : Glycérol 3P / 2,3 diphosphoglycérate / AA.
✦ Localisation.
• cytoplasmique.
• Elle se déroule dans le cytoplasme de toutes les cellules à des degrés différents (globules
rouges et cerveau : gluco-dépendant, muscle et myocarde : glucose ou acide gras, foie et
l’adipocyte : utilisent peu le glucose).
✦ Origine du glucose.
—> Le glucose a 2 origines :
• Exogène : alimentaire.
• Endogène :
- glycogénolyse : glucides de réserve glycogène.
- interconversions de certains oses : fructose, galactose, mannose.
- néoglucogénèse : synthèse de glucose à partir de substances non glucidiques
(lactate, pyruvate, glycérol, AA).
• catalysée par :
- glucokinase : au niveau du foie.
- hexokinase : au niveau des autres organes.
• consomme 1 molécule d’ATP.
• réaction irréversible +++ : c’est le point de régulation de la glycolyse.
Aldose Cétose
Cétose Aldose
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D.Régulation de la glycolyse.
—> 3 types de régulations :
- Régulation de l’entrée du glucose dans la cellule.
- allosterique : 2 réactions irréversibles de la glycolyse, et 3 enzymes clés :
✦ l’hexokinase.
✦ la phosphofrucokinase : étape limitante.
✦ la pyruvate kinase.
- hormonale par modification covalente de : glucagon, insuline.
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II.Régulation enzymatique.
• l’Hexokinase :
- a une activité limitée : une
accumulation de G6P l’inhibe).
- rétrocontrôle allostérique exercé
par le G6P.
• la Glucokinase :
- inhibée par le F6P.
- l’activité de la glucokinase dans le
foie est proportionnelle à la
concentration intracellulaire de
glucose (reflet de concentration
plasmatique).
- l’activité glucokinase s’adapte donc
à chaque instant aux variations
d’apport glucosé, sans mécanisme
de rétrocontrôle par le G6P.
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• la PFK-1 (phosphofructokinase-1) :
- Le point de contrôle le plus important+++.
- Inhibition par l’ATP et le citrate.
- Activation par l’ADP et l’AMP.
- Régulation allosterique spéciale dépendante des hormones par le fructose-2,6-
biphosphate au niveau du foie et du muscle.
- F2,6BP activateur puissant de la PFK-1.
- Il intervient dans la régulation réciproque de la glycolyse et de la néoglucogenèse
hépatiques.
• la PFK-2 (phosphofructokinase-2) :
- Le F2,6BiP est produit par la PFK-2.
- N’a qu’une fonction de régulation de la glycolyse.
- PFK-2 = enzyme bifonctionnelle : porte 2 activités :
✦ PFK-2 : phosphorylation du F6P en F2,6BiP.
✦ fructose 2,6 biphosphatase (F2,6 BPase): déphosphorylation du
F2,6BiP en F6P.
- coexiste sous 2 formes interconvertibles : phosphorylée et non phosphorylée.
Explication :
- Pour les besoins de régulation de glycolyse et néoglycogénèse, on a
un intermédiaire métabolique produit par PFK-2 qui est le F2,6BP.
- Quand PFK-2 est déphosphorylé (active) —> on a synthèse du
fructose2,6BP qui va permettre l’activation de PFK-1 et donc
production de F1,6BiP.
- Quand PFK-2 est phosphorylé (inactive) —> transformation du
F2,6BiP en F6P grâce à F2,6BPase.
• la Pyruvate Kinase :
- activée par le F-1,6-BiP.
- inhibée par l’ATP et l’Alanine.
- régulation hormonole par son état de phosphorylation.
III.Régulation hormonale.
• l’insuline:
- hormone hypoglycémiante sécretée après prise alimentaire.
- augmente la captation cellulaire du glucose. (GLUT4: tissu adipeux + c musculaires).
- déphosphorylation de la PFK2 par une protéine phosphatase : PFK-2, PK.
- → activation de la glycolyse.
• le Glucagon :
- hormone hyperglycémiante sécretée en période de jeûne.
- action médiée de l’adénylate cyclase ADc qui hydrolyse l’ATP en AMPc.
- réactions de phosphorylation en cascade permettant l’activation de la protéine kinase A
et la phosphorylation de la PFK-2, PK.
- → inhibition de la glycolyse.
• l’Adrénaline :
- hormone hyperglycémiant ; augmente la glycémie par induction de la glycogénolyse.
- même mécanisme d’action que le glucagon.
- Accélération de la glycolyse en période d’activité musculaire.
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Cycle de Krebs
« cours 2 »
A.Introduction.
• Cycle de krebs = cycle tricarboxylique = cycle citrique.
• Voie métabolique de la mitochondrie qui oxyde l’acide acétique de l’acétyl Coenzyme-A en
bicarbonate en présence de coenzymes qui transportent les hydrogènes vers la chaine
respiratoire mitochondriale.
• Localisation mitochondriale.
• a lieu dans toutes les cellules à l’exception de celles dépourvues de mitochondries (GR).
1. Formation du citrate.
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• Condensation d’une molécule d’oxaloacetate (C4) et d’acétyle Co-A (C2) en acide citrique (qui
est le premier acide tricarboxylique).
• Consommation d’une molécule d’H2O.
• Libèration d’une molécule de CoenzymeA.
• Enzyme = Citrate synthase.
• Irréversible, limitante, centre de régulation.
4. Déshydrogénation de a-cétoglutarate.
• Bilan énergétique :
- 1 ATP ———————————————> 1ATP
- 3NADH+ + 3H+ ——————————> 3 x3 ATP (CRM ) = 9ATP
- FADH2 ———————————————> 1 x 2 ATP (CRM) = 2ATP
12 ATP
—> Donc, 1 molécule d’acétyl CoA produit 12 ATP par tour de cycle ++++.
II.Bilan métabolique.
• Le cycle de Krebs fournit des précurseurs importants pour des voies anaboliques :
- Oxaloacétate et malate : néoglucogènèse.
- Succinyl CoA : Porphyrines.
- Oxaloacétate et cétoglutarate : acides aminés.
- Citrate : acides gras, cholestérol.
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Réaction de
Glutamate + NAD+ + H2O
déshydrogénation
alpha-ceétoglutarate —> NH4+ + alpha-
catalysée par glutamate
Glutamate cétoglutarate + NADH + H+
« hydrogénation » —> déshydrogénase.
—> L’inhibition de la citrate synthase par l’ATP est levée par l’ADP.
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—> Les effecteurs positifs de la PDH kinase sont des effecteurs négatifs de la PDH
phosphatase et vice versa.
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A.Introduction.
• La voie des pentoses phosphates, ou « shunt des pentoses mono-phosphates » permet grâce à
l’oxydation du glucose, la synthèse de :
✦ NADPH : coenzyme réduit nécessaire à :
- des réactions de synthèse réductrices : des acides ras, cholestérol, AA.
- des réactions de réduction particulières : réduction du glutathion.
✦ Ribose-5P : constituant essentiel des coenzymes pyridiniques (NAD, NADP) et
flaviniques (FMN, FAD), du coenzyme A, de l'ATP et des acides nucléiques (ADN, ARN).
• Localisation cytoplasmique.
• S’effectue dans tous les tissus mais surtout:
- foie : synthèses des acides gras, cholestérol, réaction d’hydroxylation.
- tissu adipeux : AG.
- glandes mammaires en période de lactation.
- tissu stéroidogènes : corticosurrénales, testicules, ovaires et placenta.
- globules rouges : réduction du glutathion.
- Transfert :
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• Les étapes de la branche non oxydative sont toutes réversibles, donc la direction des
réactions dans cette branche dépend de la disponibilité des substrats.
La Phosphorylation Oxydative
ou « CRM »
« cours 6 »
A.Introduction.
• La CRM « Chaine Respiratoire Mitochondriale » est un ensemble fonctionnel et physique
localisée au niveau de la membrane mitochondriale qui permet la formation d’ATP à partir de
cofacteurs réduits (NADH,H+ et FADH2) et de l’oxygène de l’air.
• Processus qui couple la réoxydation des NADH,H+ et FADH2 à la synthèse d’ATP par
phosphorylation de l’ADP.
• La CRM comporte 2 sous-ensembles :
- la chaine d’oxydoréduction : Transfert des équivalents réducteurs jusqu’à l’accepteur
final : l’oxygène moléculaire.
- les mécanismes de phosphorylation : de l’ADP en ATP.
• D’où le nom de phosphorylation oxydative ou oxydation phosphorylantes.
• Dans la cellule, il existe 2 modes de production d’énergie :
- directement par transfert de groupement phosphate et d’énergie à partir d’un
phospho-dérivé riche en énergie : 1 glucose ———————> 2ATP.
- production de cofacteurs réduits NADH,H+ et FADH2 qui alimentent le transport d’e-
au niveau de la CRM : 1glucose ———————> 38ATP.
Explication :
- Le glucose entre à l’intérieur de la cellule et se transforme en glucose 6P qui
rejoint la glycolyse, qui produit 2 pyruvates + 2NADH,H+ + 2ATP.
- Ensuite, les 2 pyruvates entrent dans la mitochondrie et vont subir une réaction de
décarboxylation oxydative par la pyruvate déshydrogénase donnant l’Acétyl Co-A.
Ce dernier va intégrer le cycle de Krebs et va subir une oxydation donnant 2ATP +
2FADH2 + NADH,H+ + CO2.
- Finalement, ces cofacteurs réduits vont passer dans la CRM pour produire de l’ATP.
1.Navette Glycérol-Phosphate.
• Dans le cytosol, la dihydroxyacétone phosphate (DHAP) sera résuite en glycérol 3P en
convertissant le NADH,H+ en NAD+.
• Dans la mitochondrie, le glycérol 3P sera réoxydé et les e- seront déchargés sur un FAD pour
donner du FADH2 et régénérer le DHAP permettant de reprendre le cycle à nouveau.
2.Navette Malate-Aspartate.
• Dans le cytosol, l’oxaloacétate sera réduit en malate frâce à la malate déshydrogénase
cytoplasmique.
• La malate possède un transporteur qui permet de l’intégrer à l’intérieur de la mitochondrie.
Une fois dans la mitochondrie, le malate va régénérer l’oxaloacétate grâce à la malate
déshydrogénase mitochondriale.
• L’oxaloacétate réagit avec le glutamate donnant l’aspartate qui sort de la mitochondrie
grâce à l’antiport glutamate-aspartate.
• Puis dans le cytosol, l’aspartate va régénérer l’oxalocétate permettant de démarrer un
nouveau cycle pour cette navette.
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• Chaque complexe de la CRM est un système rédox : forme réduite et forme oxydée, càd,
capable de donner ou recevoir un nombre donné de H+ et d’e-.
• Les systèmes rédox interviennent dans l’ordre croissant de leur potentiel rédox E°’ ; des plus
réducteurs vers les plus oxydants.
Glycolyse :
Glucose + 2NAD+ + 2Pi + 2ADP ———> 2Pyruvate + 2NADH + 2H+ + 2ATP + 2H2O
Cycle de Krebs :
Acétyl-CoA + 4H20 + 6NAD+ + 2FAD + 2GDP + 2Pi ———> 4CO2 + 6NADH + 2FADH2 + 2GTP + 4H+ +
2CoA
✦ Et sachant que :
- Chaque NADH ———> 3ATP.
- Chaque FADH2 —> 2ATP.
✦ Donc 1 glucose ———>
10 x 3 = 30 NADH.
+ 2 x 2 = 4 FADH2.
+ 2 = 2 ATP.
+ 2 = 2 GDP.
—> 38 ATP.
E.Régulation de la CRM.
• Concentration en O2: respiration–circulation.
• Rapport ATP / ADP :
- Faible : CRM stimulée.
- Élevé : CRM ralentie.
• Rapport NAD+/NADH,H+ :
- Faible: CRM stimulée.
- Élevé: CRM ralentie.
F.Anomalies de la CRM.
I. Anomalies primaires :
• Cytopathies mitochondriales : du au déficiti enzymatique en complexes respiratoires.
II.Anomalies secondaires :
• Inhibiteurs de la CRM : il s’agit de substances hautement toxiques.
✦ « QE »:
- Complexe I —> Barbituriques.
- Complexe II —> Malonate.
- Complexe III —> Antimycine A.
- Complexe IV —> Cyanure, CO.
- ATPsynthase —> Oligomycine.
- ATP translocase : Atractylate.
• Pathologies thyroïdiennes :
- l’hyperthyroïdie: augmentation de la dissipation de l’énergie sous forme de chaleur
(découplage)
- l’hypothyroïdie : diminution de la vitesse maximale de la synthèse de l’ATP
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Néoglucogenèse
« cours 3 »
A.Introduction.
• Voie métabolique qui permet la production du glucose à partir de substrats non glucidiques.
- Néo : nouveau.
- Glucogenèse : synthèse de molécule de glucose.
• Le glucose est :
- nécessaire à toutes les cellules.
- indispensable aux cellules glucodependantes (GR, neurones).
- et aux cellules qui dépendent de la glycolyse en anaérobiose (muscle).
- précurseur indispensable à la biosynthèse de molécules d’interêt biologique.
• Les besoins en glucose sont couverts par :
- l’alimentation : intermittente.
- la glycogénolyse hépatique: stock faible 190g.
- et par la néoglucogenèse : indispensable pour le maintien de la glycémie.
• A lieu dans le foie +++ : 90%, le cortex rénal et l’intestin 10%
(le foie fournit 50g/j de glucose =1/3 de la consommation tissulaire quotidienne).
• En période de jeûne la NGG s’intensifie dés les premières heures, à la 36ème c’est la seule
source de glucose (100g/j).
• Au bout de 10j de jeûne : foie 50% et rein 50%.
- Glucose 6 phosphatase.
- Hexokinase/ - Fructose 6
Glucokinase. biphosphatase.
- Phosphofructokinase. - Pyruvate carboxylase +
- Pyruvate kinase. Phosphoénol pyruvate
carboxykinase (PEPCK).
-> Transport du malate de la mitochondrie vers le cytosol grâce à un système navette (la
navette du malate).
II.Phase cytosolique :
2 malate + 2 NAD⁺ ——> 2 oxaloacétate + 2 NADH,H⁺
malate deshydrogénase cytosolique.
• Coenzyme Biotine.
• Strictement mitochondriale.
• Consomme une molécule d’ATP.
• Importante : plus de 2/3 des précurseurs de la NGG passent par cette réaction.
• Réaction anaplérotique du cycle de krebs.
• Décarboxylation phosphorylante.
• Consomme une molécule de GTP , régénérée par une molécule d’ATP.
• Le CO2 perdu dans cette réaction est le même que celui qui a activé le pyruvate.
D.Bilan énergétique.
• La NGG est énergiquement coûteuse. Le bilan des réactions de biosynthèse conduisant du
pyruvate au glucose est :
2pyruvate + 4ATP + 2GTP + 2NADH + 4H2O → Glucose + 4ADP + 2GDP + 6Pi + 2NAD+ + 2H+.
• Ce coût énergétique est nécessaire pour assurer l’irréversibilité de la NGG.
• Bilan énergétique de la NGG : 6 ATP consommés.
Biochimie - Glucides Skikri Oumeima
• Les acides aminés glucoformateurs sont les AA dont le squelette carboné est transformé en
pyruvate ou en un des 4 intermédiaires du cycle citrique (succinyl –CoA, a-cétoglutarate,
fumarate et oxaloacétate).
• Tous le Acides aminés sont glucoformateurs sauf la Leucine.
F.Régulation de la NGG.
• Les régulations de la glycolyse et de la NGG se font de façon opposées.
• Les effecteurs négatifs (inhibiteurs) de la glycolyse sont des effecteurs positifs (activateurs)
de la néoglucogenèse.
• La NGG est régulée au niveau des enzymes clés :
- La pyruvate carboxylase (PC).
- La phospho-énol-pyrvate carboxykinase (PEPCK).
- La fructose 1,6 Bi-Pase (F1,6BiPase).
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I. Régulation allostérique : PC et F1,6BiPase +++.
- N.B : PEPCK n est pas régulée allostériquement.
2. Pyruvate carboxylase.
• Étape limitante de la régulation de la NGG
• L'acétyl-CoA est un activateur allostérique de la pyruvate carboxylase :
- La cellule hépatique ne s’ engage dans la NGG que s’il y’a suffisamment Acétyl-CoA
provenant du catabolisme des AG.
- Si le taux d’ acétyl-CoA augmente dans la mitochondrie, les besoins en OAA augmentent
pour former de l’acide citrique, alors l’acétyl-CoA active la PC et inhibe la pyruvate
déshydrogénase.
Métabolisme du Glycogène
« cours 5 »
A.Introduction.
✦ Glycogène : macromolécule énorme peut contenir jusqu’à 50 000 molécules de glucose.
• Polymères de résidus glycosyl liées en α1-4 avec des branchements en α1-6 toutes les 10
unités de glucose.
• Amorce protéique = Glycogénine.
• Dégradation rapide du glycogène.
• L’alimentation apporte environ 120 g de glucides : Le foie et les muscles en stockent 80%
sous forme de glycogène.
• C’est la forme de mise en réserve du glucose rapidement mobilisable à la différence des
lipides et des protéines.
• Localisation cytoplasmique.
• Ubiquitaire, surtout foie et muscle ; 400 g au niveau de l’organisme :
- foie (il représente 10% de la masse hépatique) : 150g ; A partir du glucose alimentaire
et NGG - Glucose pour tout l’organisme - Assure l’équilibre glycémique.
- muscle : 250g ; A partir du glucose circulant - Pour ses propres besoins énergétiques.
1.Glycogénolyse exogène.
• Dégradation du glycogène alimentaire « les muscles (la viande) et le foie des animaux ».
• Fait intervenir 3 enzymes :
- La α Amylase (salivaire, pancréatique) ou α 1-4 glucosidase : enzyme spécifique du D
Glucose: hydrolyse la liaison α 1-4 à l’intérieur de la chaine.
- α1-6 glucosidase (Dextrinase) : enzyme débranchante hydrolyse la liaison α 1-6.
- Maltase : hydrolyse la liaison α 1-4 entre 2 molécules de glucose.
1.Glycogénolyse endogène.
• Processus de mobilisation rapide en réponse à une demande immédiate
- En l’absence de glucose alimentaire.
- La néoglucogenèse est souvent trop lente pour répondre à une demande immédiate.
• Le glycogène hépatique est mobilisé :
- pour maintenir le taux du glucose sanguin.
- pour alimenter les tissus périphériques.
• Le glycogène musculaire est mobilisé et consommé sur place pour leur fonctionnement.
Etapes de la glycogénolyse :
Régulation de la glycogénolyse.
- Enzyme : P glucomutase.
- Réversible.
Réaction 3 : Activation du glucose 1P en UDP glucose.
- Enzyme : Glucose 1 phosphate uridyl transférase = UDP Glucose phosphorylase.
- Irréversible.
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Régulation de la glycogénogenèse.
• Double : allostérique et covalente.
• Au niveau de la glycogène synthase.
• La GS Existe sous deux formes
- forme b ———> phosphorylée inactive.
- forme a ———> déphosphorylée active.
• Glucagon (foie), Adrénaline (Foie et muscle) via l’AMPc activent une proteine kinase qui
active à son tour phosphoryle la GS et l’inactive.
—> La glycogénogenèse est inhibée.
• L’Insuline active une protéine phosphatase qui dephosphoryle la GS et l’active.
—> La glycogénogenèse est activée.
2. Régulation hormonale
Biochimie - Glucides Skikri Oumeima