ESTRUCTURA MOLECULAR DE ÁCIDOS NUCLEICOS

Una estructura para el ácido desoxirriboso nucleico

Deseamos sugerir una estructura para el DNA, la cual tiene nuevos hallazgos, que son de
considerable interés biológico. Una estructura para el ácido nucleico ya ha sido propuesta
por Pauling y Corey". Ellos amablemente hicieron su manuscrito a nuestra disposición
antes de la publicación. Su modelo consiste en tres cadenas entrelazadas, con los
fosfatos cerca de la fibra y las bases en el exterior. En nuestra opinión, esta estructura es
insatisfactoria por dos razones:
(I) Consideramos que el material que da LO diagramas de rayos X son la sal, no el ácido
libre. Sin los átomos de hidrógeno ácido, no está claro qué fuerzas mantendría la
estructura unida, especialmente cuando los fosfatos cargados negativamente cerca del
eje se repelen entre sí.
(2) Algunos de las distancias de van del' Waals parecen ser demasiado pequeñas.
Otra estructura de tres cadenas también ha sido sugerida por Fraser (en la prensa). En su
modelo, los fosfatos están en el exterior y las bases en el dentro, unidos entre sí por
enlaces de hidrógeno. Esta estructura como la descrita está bastante mal definida, y para
esta razón no vamos a comentar en ella.Deseamos presentar una estructura radicalmente
diferente para la sal de desoxirribosa nucleica ácido. Esta estructura tiene dos cadenas
helicoidales cada una en espiral enrollados alrededor del mismo eje (ver diagrama).
Nosotros hemos hecho suposiciones químicas usuales, es decir, que cada uno de ellos
está formado por grupos diésteres de fosfato que unen los residuos de Beta-D-
deoxirribofuranosa con vínculos 3',5'. Las dos cadenas (pero no sus bases) están
relacionadas por una pareja perpendicular a los ejes de la fibra. Ambas cadenas siguen a
las hélices derechas, pero debido a las secuencias de los átomos en las dos cadenas
corren en direcciones opuestas. Cada cadena se parece al modelo de Furberg No.1; es
decir, las bases están en el interior de la hélice y los fosfatos en el exterior. La
configuración del azúcar y de los átomos cerca está cerca a la configuración estándar de
Furberg’s, siendo el azúcar aproximadamente perpendicular a la base adherida.
Hay un residuo en cada cadena cada 3-4 A. en la z-direción. Hemos asumido un ángulo
de 36° entre residuos adyacentes en la misma cadena, de modo que la estructura se
repite después de 10 residuos en cada cadena, que es, después de 34 A. La distancia de
un átomo de fósforo del eje de la fibra es de 10 A. Como los fosfatos están en el exterior,
los cationes tienen fácil acceso a ellos. La estructura es abierta, y su contenido de agua
es bastante alta. Con un contenido de agua más bajo, podríamos esperar que las bases
se inclinen para que la estructura pueda volverse más compacta.La novedad de la
estructura es la manera en que en la que las dos cadenas se mantienen unidas por las
bases purinas y pirimidinas. Los planos de las bases son perpendiculares al eje de la
fibra. Están unidos juntos en pares, siendo una sola base de una cadena enlazado por
hidrógeno a una sola base desde la otra de modo que los dos se encuentran uno al lado
del otro con idénticas coordenadas Z. Uno de los dos debe ser un purina y la otra una
pirimidina para que se produzca la unión. Los enlaces de hidrógeno se hacen de la
siguiente manera: purina posición 1 para pirimidina posición 1; purina posición 6 para
pirimidina posición 6. Si se asume que las bases sólo se encuentran en la estructura en
las formas tautoméricas más plausibles (es decir, con las configuraciones keto en lugar de
enol) se encuentra que sólo pares específicos de las bases pueden unirse. Estos pares
son: adenina (purina) con timina (pirimidina) y guanina (purina) con citosina (pirimidina).
En otras palabras, si una adenina forma un miembro de un par, en cualquiera de las dos
cadenas, luego en estas suposiciones el otro miembro debe ser timina; del mismo modo
para guanina y citosina. La secuencia de las bases en una sola cadena no parece estar
restringida en ningún caso.Sin embargo, si sólo se pueden utilizar pares de bases
específicos pueden ser formados, se deduce que si la secuencia de bases en una cadena
dada, entonces la secuencia en la otra cadena se determina automáticamente. Se ha
encontrado experimentalmente, que la relación de las cantidades de adenina a timina, y la
proporción de guanina a citosina, están siempre muy cerca de la unidad para el ácido
nucleico desoxirriboso. Probablemente es imposible construir esta estructura con un
azúcar ribosa en lugar de la desoxirribosa, ya que el átomo de oxígeno extra haría un
contacto demasiado cercano con los enlaces de Van der Waals.Los datos radiográficos
publicados anteriormente sobre el ácido nucleico desoxirriboso son insuficientes para
realizar una prueba rigurosa de nuestra estructura. Hasta donde podemos decir, es más o
menos compatible con los datos experimentales, pero se considerarán no probadas hasta
que se hayan verificado con resultados más exactos. Algunos de ellos se dan en las
siguientes comunicaciones. No sabíamos que de los detalles de los resultados
presentados allí cuando nosotros ideamos nuestra estructura, descansan principalmente,
aunque no siempre enteramente en datos experimentales publicados y argumentos
estereoquímicos.
No ha dado forma a nuestro aviso de que la que hemos postulado irrimediosamente
sugiere una posible mecanismo de copia para el material genético. Detalles completos de
la estructura, incluyendo las condiciones asumidas en la construcción de la misma, junto
con un conjunto de coordenadas para los átomos, será publicado en otra parte.
Estamos en deuda con el Dr. Jerry Donohue por consejos y críticas constantes,
especialmente sobre las distancias interatómicas. También hemos sido estimulados por
un conocimiento de la naturaleza general de la información inédita resultados
experimentales e ideas del Dr. M. H. F. Wilkins, Dr. R. E. Franklin y sus compañeros de
trabajo en King's College, Londres.
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