Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
CODIRECCIÓN
1. MARCO TEÓRICO........................................................................................................................................................1
2. ANTECEDENTES..........................................................................................................................................................6
3. OBJETIVOS...................................................................................................................................................................8
3.1. GENERAL........................................................................................................................................................8
3.2. PARTICULARES..............................................................................................................................................8
4. METODOLOGÍA............................................................................................................................................................8
5. CRONOGRAMA DE ACTIVIDADES............................................................................................................................13
1. MARCO TEÓRICO
Página | 1
Condicion Termino Valores Ejemplo
Hipertermofilo 80-113°C Pyrolobus fumarii
Termofilo 70-80°C Thermus acuaticus
Mesofilo 25-40°C Cyanidium caldarium
Psicrófilo > -5°C Pseudomonas
Temperatura Psicrófilo facultativo 15-0°C Heteromita
Alcalófilo 8-9 Spirulina
PH Acidófilo >5 Ferrplasma acidarmanus
Desecación Xerófilo Perdida de agua Metallogenium
Metales Metalófilo altas concentraciones Ralstonia metallidurans
Barófilos extremo 10,000m
Barófilos 5000-6000m Metanococcus
Barótolerante 400m Moritella
Presión Halófilo extremo <20% Nocardiopsis halophila
Halófilo moderado 10-20% Sterptimonspora
Halófilo debil .5-10% Actinopolyspora halophila
Concentracion NaCl Halótolerante <.5% Aspergillus
Tabla I. Clsificación de los organismos extremófilos (Madigan, 2005)
1.1.1. HALÓFILOS
Página | 2
aunque en la actualidad tambien se han descrito algunas especies de algas y hongos.
Particularmente el porcentaje de hongos filamentosos descritos hasta la fecha es muy
pobre y aun se requiere de mas estudios para entender los mecanismos moleculares
que les permiten contender contra las altas concentraciones de NaCl (Gunde-
cimerman, Ramos, Plemenitas, & Gadd, 2009) y la mayoría de las estrategias utilizadas
han sido estudiadas en bacterias
Es interesante mencionar que debido a que los microorganismos halófilos
ofrecen una multitud de aplicaciones en varios campos de la biotecnología, como en la
producción de enzimas industriales, producción de colorantes y aditivos, biotecnología
alimentaria y producción de alimentos fermentados, producción de antibióticos
(actinomicetos halófilos), producción de biopolímeros y biorremediación (Ramírez,
Sandoval, & Serrano, 2004), la caracterización fisiológica y molecular de estos resulta
relevante.
Página | 3
1.2.2. “SALT OUT”
SOLUTOS COMPATIBLES
Página | 4
antitransportadores Na+/H+. Estos antitransportadores juegan un papel importante para
mantener bajas las concentraciones de Na+. Se ha descrito que la actividad del
antitransportador Na+/H+ de la membrana citoplasmática -en bacterias- aumenta
cuando las células crecen en altas concentraciones de NaCl, además se la expresión
de algunos otras transportadores y bombas de eflujo –como la bomba de sodio-potasio-
(González-Hernández & Peña, 2002).
Página | 5
halófilos, podría ser la expresión diferencial de unas proteínas que recubren a las
paredes celulares de estos: las hidrofobinas (Plemenitaš et al., 2014; Gunde-cimerman,
Ramos, Plemenitas, & Gadd, 2009).
1.2. HIDROFOBINAS
En una interfaz agua- aire las HCI tienen mayor contenido de estructuras
proteicas hoja beta plegadas mientras en agua- solido se favorece la aparición de α-
hélices. El estado α-hélice representa un estado intermedio de autoensamblaje mientras
el estado β-plegado, es más estable y favorable el contacto e interacción con la
superficie. Las HCII son estudiadas, por lo cual existe carencia de información de todos
los cambios estructurales (Wessels, 1997, H. a. . Wosten, 2001).
En las HCI y II, los puentes disúlfuro –formados por ocho residuos de cisteína
altamente conservados- son los encargados de mantener los monómeros solubles en
agua y previenen el autoensamblaje prematuro, así se explica la presencia de las ocho
cisteínas altamente conservadas en la secuencia de aminoácidos en ambas clases de
hidrofobinas (H. Wosten, De Vries, & Wessels, 1993).
Página | 7
Tabla II. Expresión diferencial de los genes de HFB de A. sydowii. Tomado de Pérez- Llano et al., 2017 .
Estos resultados también sugieren que las hidrofobinas podrían ser una
respuesta a hipersalinidad. Es de relevancia caracterizar las propiedades biofísicas de
estas proteínas y estudiar si la presencia de sal tiene un efecto en la estructura de la
proteína o en la formación de películas o en la hidrofobicidad-hidrofilicidad de estas. En
estudios futuros sería importante comprobar si efectivamente estas participan en la
resistencia a altas concentraciones de sal del hongo.
3. OBJETIVOS
3.2. GENERAL
Evaluar las propiedades biofísicas de las hidrofobinas HFB1, HFB2 y HFB4 del
hongo halófilo Aspergillus sydowii.
3.3. ESPECIFICOS
Página | 8
Determinar la influencia de la salinidad en el recubrimiento, la modificación de las
propiedades superficiales y en la estructura de las HFBs.
4. METODOLOGÍA
SECUENCIA 5'-3'
Sitio EcoRI C-myc Factor Xa Región HFB
FwHFB1 ATA GAATTC GAGCAGAAACTCATCTCTCTGAAGAGGATCTG ATCGAAGGTCGT CATCCCCAACGGCCCTGGCTA
Tabla III. Construcción especifica de los cebadores Fw y Rv para las HFB. Modificado de Pérez- Llano et
al., 2017.
Página | 9
4.1.2 TRANSFORMACIÓN DE E. COLI
Una vez obtenido el producto de PCR –digerido con EcoRI y XbaI- se ligará con
el vector específico para Pichia Pastoris –PpicZα-, y se procederá a transformar E. coli
(XL1-BLUE), mediante electroporación. Se harán cultivos en medio solido LB bajo en
sales y se utilizara Zeocina (Zeocin ™, 25µg/ml) como antibiótico de selección.
Se verificará que las cepas transformantes contienen el inserto mediante PCR de
colonia. Los plásmidos con el inserto se purificarán a partir de un cultivo líquido de 5 ml
de LB bajo en sales con Zeocina, utilizando el kit GeneJET Plasmid Miniprep
(ThermoFisher Scientific).
Página | 10
cual se teñirá con el kit SilverQuest Silver Staining (Novex, Life Technologies), para
verificar la inducción proteica.
Página | 11
las proteínas de 5 a 10 veces, se prepararán muestras 10µM de las mismas, y se
suspenderán en 10uM tampón fosfato, con 2M de NaCl o sin NaCl.
Las proteínas se incubarán solo 5 minutos en el tampón con 2.0M. La medición
del espectro DS sin NaCl se realizará en el rango 260-190nm, mientras que en
presencia de 2M NaCl será a 203nm (puesto que el tampón con NaCl interfiere con la
medición en el otro rango).
Página | 12
pérdida de moléculas y un mecanismo de retroalimentación entre el sensor de tensión y
el motor de la barraras mantiene constante la presión. Esta técnica en combinación con
microscopia de fluorescencia permite estudiar los cambios en la organización
supramolecular del material tensoactivo – en el proceso de compresión y durante las
distintas faces en las que encuentra la monocapa.
5. CRONOGRAMA DE ACTIVIDADES
Página | 13
Página | 14
BIBLIOGRAFIA
DasSarma, S., & DasSarma, P. (2015). Halophiles and their enzymes: Negativity
put to good use. Current Opinion in Microbiology.
https://doi.org/10.1016/j.mib.2015.05.009
González-Hernández, J. C., & Peña, A. (2002). Estrategias de adaptación de
microorganismos halófilos y Debaryomyces hansenii (levadura halófila). Revista
Latinoamericana de Microbiologia, 44(3–4), 137–156.
Gunde-cimerman, N., Ramos, J., Plemenitas, A., & Gadd, G. M. (2009).
Halotolerant and halophilic fungi, 1–11. https://doi.org/10.1016/j.mycres.2009.09.002
Kogej, T., Stein, M., Volkmann, M., Gorbushina, A. A., Galinski, E. A., & Gunde-
Cimerman, N. (2007). Osmotic adaptation of the halophilic fungus Hortaea werneckii:
Role of osmolytes and melanization. Microbiology, 153(12), 4261–4273.
https://doi.org/10.1099/mic.0.2007/010751-0
Madigan, M. T. (2005). Brock Biology of Microorganisms, 11th edn. International
Microbiology, 8(May), 149–152.
Mosier M, Avi, Mix, L. J., Armstrong, J. C., Mandell, A. C., Raymond, J.,
Raymond, S. N., Stewart, F. J., … Vance, S. (2006). The Astrobiology Primer: An
Outline of General Knowledge—Version 1, 2006. Astrobiology, 6(5), 735–813.
https://doi.org/10.1089/ast.2006.6.735
Plemenitaš, A., Lenassi, M., Konte, T., Kejžar, A., Zajc, J., Gostinčar, C., &
Gunde-Cimerman, N. (2014). Adaptation to high salt concentrations in
halotolerant/halophilic fungi: A molecular perspective. Frontiers in Microbiology.
https://doi.org/10.3389/fmicb.2014.00199
Ramírez, N., Sandoval, A., & Serrano, J. (2004). Las bacterias halófilas y sus
aplicaciones biotecnológicas. Revista de La Sociedad Venezolana de Microbiología,
24(2), 1–10.
Ramirez, N., Serrano, J. A., & Sandoval, H. (2006). Microorganismos
extremofilos. Actinomicetos halófilos en México. Revita Mexicana de Ciencias
Farmaceuticas, 56–71.
Página | 15
Saito, H., & Posas, F. (2012). Response to hyperosmotic stress. Genetics.
https://doi.org/10.1534/genetics.112.140863
Serrano, R. (1996). Salt tolerance in plants and microorganisms: toxicity targets
and defense responses. International Review of Cytology, 165, 1–52.
https://doi.org/10.1016/S0074-7696(08)62219-6
Siglioccolo, A., Paiardini, A., Piscitelli, M., & Pascarella, S. (2011). Structural
adaptation of extreme halophilic proteins through decrease of conserved hydrophobic
contact surface. BMC Structural Biology, 11, 50. https://doi.org/10.1186/1472-6807-11-
50
Wessels, J. G. H. (1997). Hydrophobins: proteins that change the nature of the
fungal surface. Adv.Microb.Physiol (Vol. 38). https://doi.org/10.1016/S0065-
2911(08)60154-X
Woese, C. R., & Fox, G. E. (1977). Phylogenetic structure of the prokaryotic
domain: The primary kingdoms. Proceedings of the National Academy of Sciences,
74(11), 5088–5090. https://doi.org/10.1073/pnas.74.11.5088
Wosten, H. a. . (2001). H YDROPHOBINS : Multipurpose Proteins. Annual
Review of Microbiology, 55, 625–46. https://doi.org/10.1146/annurev.micro.55.1.625
Wosten, H., De Vries, O., & Wessels, J. (1993). Interfacial Self-Assembly of a
Fungal Hydrophobin into a Hydrophobic Rodlet Layer. The Plant Cell, 5(11), 1567–74.
https://doi.org/10.1105/tpc.5.11.1567
Zajc, J., Kogej, T., Galinski, E. A., Ramos, J., & Gunde-cimerman, N. (2014).
Osmoadaptation Strategy of the Most Halophilic Fungus, Wallemia ichthyophaga,
Growing Optimally at Salinities above 15% NaCl. https://doi.org/10.1128/AEM.02702-13
Página | 16