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1 Título

2 • Consideraciones generales
• Propiedades específicas de las enzimas
• Nomenclatura y clasificación
• Mecanismo de la catálisis enzimática
• Teorías propuestas para explicar la interacción enzima-sustrato
• Cinética de las reacciones enzimáticas
• Factores que influyen en la acción catalítica de las enzimas
• Cofactores y coenzimas
• Influencia del ph en las reacciones enzimáticas
• Influencia de la temperatura en las reacciones enzimáticas
• control de la acción enzimática

3 ENZIMAS: CONSIDERACIONES GENERALES (1)


1. Las enzimas son proteínas que actúan como biocatalizadores: aumentan la
velocidad de las reacciones biológicas, haciendo que alcancen el equilibrio en
tiempos compatibles con las funciones vitales.
2. Todas las enzimas son proteínas, generalmente con estructura globular.
Además, en la mayoría de los casos son heteroproteínas cuyo grupo prostético
suele participar en el mecanismo molecular de la catálisis.
3. En toda reacción catalizada por una enzima distinguiremos:
a) Las sustancias reaccionantes: se designan genéricamente como
sustrato(s de la reacción. Se simbolizan con la letra S.
b) El producto(s) de la reacción. Se simboliza(n) con la letra P.
c) Las moléculas de enzima, simbolizadas como E,

4 ENZIMAS: CONSIDERACIONES GENERALES (2)


4. Las enzimas, como todos los catalizadores, ejercen su acción disminuyendo la energía
de activación de las reacciones que catalizan.

5 ENZIMAS: CONSIDERACIONES GENERALES (3)

• Las enzimas no alteran el equilibrio de la reacción que catalizan. Su única


acción consiste en hacer que dicho equilibrio se alcance más rápidamente, sin
afectar a la dirección en que la reacción transcurre.

• Las enzimas participan temporalmente en la reacción que catalizan


combinándose con uno o más de los reactivos o sustratos y a continuación,
este complejo intermedio (complejo enzima-sustrato) se transforma
químicamente, formándose los productos y regenerándose el catalizador.

ENZIMA (E) + SUSTRATO (S)  COMPLEJO ENZIMA -SUSTRATO (ES)

COMPLEJO ENZIMA SUSTRATO (ES)  ENZIMA (E) + PRODUCTO (P)


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6 ENZIMAS: CONSIDERACIONES GENERALES (4)
El mecanismo de actuación descrito permite entender dos características adicionales de
las enzimas:

• Las enzimas no se consumen en el curso de la reacción.

• Pequeñas cantidades de enzima bastan para catalizar la transformación de


cantidades relativamente grandes de sustrato.

7 PROPIEDADES ESPECÍFICAS DE LAS ENZIMAS

• ELEVADO PODER CATALÍTICO: Las reacciones enzimáticas alcanzan el


equilibrio miles e incluso millones de veces más rápidamente que las
reacciones sin catalizar.

• ESPECIFICIDAD EN RELACIÓN CON LA REACCIÓN QUE CATALIZAN: Las


enzimas son moléculas específicas: en general una enzima determinada sólo
cataliza una o unas pocas reacciones metabólicas concretas.

8 CONSIDERACIONES ACERCA DE LA ESPECIFICIDAD DE LAS ENZIMAS


La especificidad de las enzimas puede considerarse
1. En relación con el tipo de reacción que catalizan.
En general, cada enzima cataliza sólo un tipo concreto de reacción (rédox, de
hidrólisis, de adición al doble enlace, etc.).
2. Considerando las moléculas con las que van a reaccionar (sustratos).
Las enzimas poseen un grado de especificidad variable en relación con sus
sustratos: algunas poseen gran especificidad y sólo reconocen a un compuesto
o compuestos muy concretos. Otras, por el contrario, poseen poca
especificidad y pueden reconocer a varios sustratos que sean semejantes
químicamente.

9 ENZIMAS: NOMENCLATURA Y CLASIFICACIÓN (1)

• Históricamente (antes de adoptarse una nomenclatura sistemática) a las


enzimas les asignaron nombres específicos (así pepsina, tripsina, etc.).

• Posteriormente se adoptó el criterio de darles un nombre incluyendo la


terminación asa (catalasa, ureasa, ribonucleasa,...).

• En la actualidad, se ha elaborado una nomenclatura sistemática relacionada


con el sistema de clasificación adoptado para su estudio.

10 ENZIMAS: NOMENCLATURA Y CLASIFICACIÓN (2)


Actualmente las enzimas se clasifican en seis grandes grupos:

1 OXIDO-REDUCTASAS Transferencia de electrones.

2 TRANSFERASAS Transferencia de grupos funcionales.

3 HIDROLASAS Reacciones de hidrólisis.

4 LIASAS Adición de grupos a dobles enlaces o formación de dobles


enlaces por eliminación de grupos.
5 ISOMERASAS Transferencia de grupos en una molécula para obtener
otro isómero.
6 LIGASAS Formación de enlaces C-C, C-S, C-O, C-N, por
reaccionmes de condensación acopladas a gasto de ATP.
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11 Los números EC (Enzyme Commission numbers) son un esquema de clasificación
númérica para las enzimas, basado en las reacciones químicas que catalizan.
Como sistema de nomenclatura de enzimas, cada número EC está asociado a un
nombre recomendado para dicha enzima. En realidad los números EC codifican
reacciones catalizadas por enzimas. Enzimas diferentes (por ejemplo que procedan de
organismos diferentes) que catalicen la misma reacción recibirán el mismo número EC.
Cada código de enzimas consiste en las dos letras EC seguidas por 4 números
separados por puntos. Estos números representan una clasificación progresivamente
más específica.
Por ejemplo, la enzima tripéptido aminopeptidasa tiene el código EC 3.4.11.4, construido
así:
• 3 por hidrolasa (enzima que usa el agua para catalizar algunas reacciones).
• 3.4 por hidrolasa, que actúa sobre los enlace peptídico.
• 3.4.11 por aquellas que actúan sobre el terminal amino de aminoácido de un
polipéptido.
• 3.4.11.4 por aquellas que actúan sobre el terminal amino final de un tripéptido.
(Wikipedia)

12 Cuadro de clasificación con ejemplos e ilustraciones obtenido de la página de Biología de


Lourdes Luengo.

http://www.juntadeandalucia.es/averroes/html/adjuntos/2007/12/11/0010/enzimas.html#GlossClasi

13 MECANISMO DE LA CATÁLISIS ENZIMÁTICA


1ª etapa: interacción de las moléculas de enzima (E) con las moléculas de sustrato (S),
formándose complejos Enzima-Sustrato (ES):
E + S → ES
2ª etapa: transformación química de las moléculas de sustrato y formación de los
productos de la reacción, liberándose las moléculas de enzima:
ES → E + P

14 MECANISMO DE LA CATÁLISIS ENZIMÁTICA:


FORMACIÓN DE LOS COMPLEJOS [ES]

• Las moléculas de sustrato interaccionan con las moléculas de enzima y se


unen a ellas “encajando” en un lugar determinado de su conformación llamado
centro activo.
• Esquema de la estructura de una enzima.
◦ Centro activo: zona de la molécuia a la que se une el sustrato y donde se
realiza la catálisis enzimática.
◦ Centro regulador: zona en la que se unen las sustancias que regulan la
actividad de la enzima.

15 CENTRO ACTIVO
Región de la molécula de enzima que se une al sustrato y contribuye con los residuos
que participan en la formación y rotura de enlaces (grupos catalíticos)
1. Supone una porción relativamente pequeña del volumen total de la enzima.
2. Es una entidad tridimensional.
3. Se unen a los sustratos por fuerzas relativamente débiles.
4. Son hoyos o hendiduras de las que suele quedar excluida el agua, salvo que
sea un componente de la reacción
5. Su “forma” determina el tipo de sustrato que puede “encajar” en él

16 Representaciones de la lisozima y su sustrato (hidrato de carbono) en el centro activo.


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17 TEORÍAS PROPUESTAS PARA EXPLICAR LA INTERACCIÓN ENZIMA-SUSTRATO

1894 Emil Fischer (1852-1919) propuso la hipótesis de la llave-cerradura.

1958 Daniel Edward Koshland, Jr. ( 1920 – 2007 ) propuso la teoría del ajuste inducido.

18 Hipótesis de la llave-cerradura

Este modelo postula que el centro activo de la enzima tiene una configuración fija, y su
“forma” es complementaria a la del sustrato, de modo que éste último “encaja” en el
interior del centro activo de un modo muy preciso.

19 Hipótesis del ajuste autoinducido.

En el modelo llamado de adaptación inducida, la configuración del centro activo es, en


alguna medida, “adaptable” a la forma del sustrato.

20 CINÉTICA DE LAS REACCIONES ENZIMÁTICAS


Conceptos previos:
1. Cinética de una reacción: estudio de la variación de la velocidad de la reacción
en función de factores concretos (generalmente en función de la [S]).
2. Velocidad de reacción :
[S] que “desaparece”/tiempo o
[P] que se forma/tiempo.

21 CINÉTICA DE LAS REACCIONES ENZIMÁTICAS II


Cuando en una reacción enzimática se alcanza la Vmax se dice que la enzima se
encuentra "saturada" por el sustrato: esta "saturación" se produce cuando todas las
moléculas de enzima que participan en la reacción están unidas a moléculas de sustrato,
formando complejos ES. (La imagen enlaza con Wikipedia)

22 CINÉTICA DE LAS REACCIONES ENZIMÁTICAS III


ECUACIÓN DE MICHAELIS-MENTEN
La ecuación que relaciona el valor de la velocidad de una reacción enzimática en función
de la s, propuesta por los matemáticos Michaelis y Menten sobre la idea de un modelo de
catálisis enzimática con formación de un complejo ES, es:

• Vo es la velocidad inicial de la reacción para una cierta [S] inicial.

• Vmax es la veloc. Máxima de la reacción (para una cierta [E] presente en la


reacción.

• Km es la constante de Michaelis, específica para cada reacción enzimática:


cada enzima posee un valor de Km concreto para cada uno de los diferentes
sustratos que puede transformar. Equivale al valor de la [S] que hace que la
velocidad de la reacción (Vo) sea la mitad de su valor máximo.
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23 ¿ QUÉ REPRESENTA EL VALOR DE LA Km DE UNA REACCIÓN ENZIMÁTICA

• Da idea del valor aproximado de la [S] con que se desarrollan muchas


reacciones metabólicas.

• El valor de la Km es indicativo de la mayor o menor afinidad de la enzima por


el(los) sustrato(s) de la reacción enzimática.

24 FACTORES QUE INFLUYEN EN LA ACCIÓN CATALÍTICA (ACTIVIDAD) DE LAS


ENZIMAS

• Algunas enzimas necesitan interaccionar con otras sustancias no protéicas


para ejercer su acción catalítica. A dichas sustancias que colaboran en la
catálisis enzimática se las denomina cofactores enzimáticos.

• Para participar en la catálisis, los cofactores se unen a la molécula de enzima


formando un complejo enzima-cofactor que, a su vez, se unirá a la molécula de
sustrato.

• El complejo enzima-cofactor catalíticamente activo se denomina holoenzima.


Cuando se separa el cofactor, la proteína restante, que por sí misma es
inactiva, se designa como apoenzima.
COFACTORES Y COENZIMAS

• Los cofactores pueden ser, bien iones metálicos (Zn++, Mg++, Mn++, Fe++ ó
Fe+++, Cu++, etc.), bien moléculas orgánicas diversas. Este último grupo de
cofactores recibe el nombre específico de coenzimas.

25 COENZIMAS I
Son moléculas orgánicas, de peso molecular intermedio, que suelen contener en su
estructura química una molécula de vitamina. Entre las más importantes pueden citarse
el Coenzima A, los piridín nucleótidos y los flavín nucleótidos.

26 COENZIMAS II
Coenzima A, los piridín nucleótidos y los flavín nucleótidos.
Las coenzimas pueden estar permanentemente unidas a la molécula enzimática,
haciendo las veces de grupo prostético, o pueden unirse a ella sólo débilmente durante la
catálisis, comportándose como uno de los sustratos específicos de la enzima.

27 Mecanismo de actuación enzimática:

1) Se forma un complejo: enzima-substrato o substratos.

28 2) Se une la coenzima a este complejo.


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29 3) Los restos de los amino 塶 idos que configuran el centro activo catalizan el proceso.
Para ello debilitan los enlaces necesarios para que la reacción química se lleve a cabo a
baja temperatura y no se necesite una elevada energía de activación.

30 4) Los productos de la reacción se separan del centro activo y la enzima se recupera


intacta para nuevas catálisis.

31 5) Las coenzimas cdaboran en el proceso; bien aportando energía (ATP), electrones


(NADH/NADPH) o en otras funciones relacionadas con la catáisis enzim嫢ica

32 1. Se forma un complejo: enzima- substrato o substratos.


2. Se une la coenzima a este complejo.
3. Los restos de los amino 塶 idos que configuran el centro activo catalizan el
proceso. Para ello debilitan los enlaces necesarios para que la reacción
química se lleve a cabo a baja temperatura y no se necesite una elevada
energía de activación.
4. Los productos de la reacción se separan del centro activo y la enzima se
recupera intacta para nuevas catálisis.
5. Las coenzimas cdaboran en el proceso; bien aportando energía (ATP),
electrones (NADH/ NADPH) o en otras funciones relacionadas con la catálisis
enzimática

http://web.educastur.princast.es/proyectos/biogeo_ov/2BCH/B3_METABOLISMO/t31_ME
TABOL/animaciones/mecanismo.pps

33 Principales coenzimas en mamíferos:

• Precursores.
• Ejemplos de la actuación de coenzimas.

34 INFLUENCIA DEL pH EN LAS REACCIONES ENZIMÁTICAS


Las reacciones enzimáticas son sensibles al pH del medio en que se desarrolla
la reacción.

• Las variaciones de pH pueden afectar a la conformación de la enzima


(especialmente a la conformación del centro activo), incidiendo así
directamente en la funcionalidad de la molécula enzimática.

• Asimismo, las variaciones de pH pueden afectar al estado de ionización del


sustrato, lo cual puede influir negativamente en la formación del complejo ES.

• Para cada enzima puede definirse un valor de pH óptimo en el que su


actividad es máxima, de modo que cifras superiores o inferiores a dicho valor
óptimo hacen que la actividad de la enzima disminuya.
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35 INFLUENCIA DE LA TEMPERATURA EN LAS REACCIONES ENZIMÁTICAS
Las reacciones enzimáticas también son muy sensibles a los cambios de
temperatura, por :

• La influencia que tiene en la conformación de la enzima.

• La influencia en la propia reacción.


En general, cada enzima posee una temperatura óptima de funcionamiento, bajo la cual
su actividad es máxima. En los animales superiores, esa temperatura es cercana a los
40ºC.

36 CONTROL DE LA ACCIÓN ENZIMÁTICA


La función de las enzimas está sometida a regulación, para así posibilitar el control de la
velocidad de las reacciones metabólicas, y en consecuencia, las funciones celulares.
Este control de la actividad celular está diseñado para la consecución de un objetivo
básico: Funcionar según el principio general de máxima economía de medios
PROCEDIMIENTOS DE CONTROL DE LA ACCIÓN ENZIMÁTICA
En la célula viva se emplean dos estrategias independientes:
1. Modificar la cantidad de enzima que participa en la reacción, haciendo que en
cada momento el medio celular tenga una concentración de enzima adecuada
a la velocidad de reacción que se desea conseguir (regulación a nivel de
síntesis de moléculas de enzima) .
2. Modificar la funcionalidad (actividad) de cada molécula de enzima que participa
en la reacción, haciendo que cada una de ellas, individualmente, tenga mayor o
menor actividad catalítica (regulación a nivel de actividad).

37 CONTROL DE LA ACCIÓN ENZIMÁTICA A NIVEL DE SÍNTESIS


Existen dos mecanismos de control de la síntesis de moléculas de enzima:
1. INDUCCIÓN ENZIMÁTICA

• La inducción enzimática consiste en comenzar a fabricar


moléculas de una enzima que no se estaba fabricando. El inicio de la
síntesis es promovido por alguna “señal” química (inductor) que suele
ser, generalmente, el sustrato de la reacción catalizada por la enzima en
cuestión: cuando la [S] alcanza un valor determinado, comienza a
fabricarse la enzima que cataliza su transformación química.
2. REPRESIÓN ENZIMÁTICA

• La represión enzimática consiste en dejar de sintetizar moléculas de una


enzima que se estaba fabricando, como respuesta a un incremento en la
concentración de una cierta sustancia (correpresor). Esta sustancia es,
generalmente, el producto de la reacción que cataliza la enzima. La
“acumulación” del producto de la reacción “reprime” la síntesis de nuevas
moléculas de enzima.

38 CONTROL DE LA ACCIÓN ENZIMÁTICA A NIVEL DE ACTIVIDAD


La catálisis enzimática puede regularse modificando la actividad catalítica de las
moléculas de enzima que participan en la reacción.
Esta modificación de la actividad individual de las moléculas de enzima puede realizarse
mediante procedimeintos diversos:
1. Variaciones locales de los valores de pH y/o temperatura del medio
2. Interacción de la enzima con sustancias (ligandos) que modifican su capacidad
catalítica. Muchas enzimas modifican su actividad por la inserción covalente o
no covalente de sustancias (ligandos):
1. Cuando la unión enzima-ligando hace aumentar la actividad enzimática
hablamos de activación enzimática.
2. Cuando la unión enzima-ligando disminuye la actividad catalítica de la
enzima hablamos de inhibición enzimática.
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39 INHIBICIÓN ENZIMÁTICA
Algunos compuestos químicos modifican la actividad de las enzimas, disminuyéndola.
Tales compuestos se denominan inhibidores, y el proceso que realizan, inhibición
enzimática.
Existen dos tipos de inhibición enzimática:
1. INHIBICIÓN COMPETITIVA

• Producida por compuestos que son semejantes químicamente al sustrato


de la enzima, compitiendo con éste por ocupar su centro activo .
2. INHIBICIÓN NO COMPETITIVA

• Producida por compuestos que no tienen por qué parecerse


químicamente al sustrato de la enzima.

• En este caso, el inhibidor puede unirse a una zona de la molécula


enzimática que no es el centro activo.

40 INHIBICIÓN COMPETITIVA
Producida por compuestos que son semejantes químicamente al sustrato de la enzima,
compitiendo con éste por ocupar su centro activo .
Los inhibidores competitivos son sustancias, muchas veces similares químicamente a los
sustratos, que se unen al centro activo impidiendo con ello que se una el sustrato. El
proceso es reversible y depende de la cantidad de sustrato y de inhibidor, pues ambos
compiten por la enzima.

41 INHIBICIÓN COMPETITIVA (2)


Los inhibidores competitivos disminuyen la afinidad de la enzima por su sustrato, pero no
alteran la Vmax de la reacción

42 INHIBICIÓN NO COMPETITIVA
Producida por compuestos que no tienen por qué parecerse químicamente al sustrato de
la enzima.
En este caso, el inhibidor puede unirse a una zona de la molécula enzimática que no es
el centro activo.

Los inhibidores no competitivos son sustancias que se unen a la enzima en lugares


diferentes al centro activo alterando la conformación de la molécula de tal manera que,
aunque se forme un complejo enzima-sustrato, no se produce la catálisis. Este tipo de
inhibición depende solamente de la concentración de inhibidor.

43 A diferencia de los inhibidores competitivos, los inhibidores no competitivos no suelen


modificar la afinidad de la enzima por su sustrato. Sin embargo, llegan a disminuir la
Vmax de la reacción.

Ver inhibidores irreversibles (ampliación)

44 Gráfica comparativa entre inhibición competitiva y ni competitiva.


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45 ENZIMAS ALOSTÉRICAS
Son un ejemplo representativo de enzimas reguladoras: moléculas enzimáticas
biológicamente adaptadas para desempeñar una función reguladora de algún proceso
metabólico además de su función catalítica.
La actividad de este tipo de enzimas está regulada por un compuesto específico: el
efector o modulador alostérico. El efector ejerce su acción reguladora uniéndose a la
enzima, mediante enlace no covalente, en un lugar de esta última distinto al centro activo.

46 Los inhibidores alostéricos se unen a una zona de la enzima y cambian la configuración


del centro activo de tal manera que impiden que el sustrato se pueda unir a él.

47 ENZIMAS ALOSTÉRICAS (2)


Un efector alostérico positivo será aquel que, al unirse a la enzima, provoque su
activación (aumento de su actividad enzimática)
Un efector alostérico negativo será aquel que, al unirse a la enzima, provoque su
inactivación (disminución de su actividad enzimática)

48 CARACTERÍSTICAS DE LAS ENZIMAS ALOSTÉRICAS

Son moléculas compuestas, generalmente, por varias subunidades (tienen estructura


cuaternaria

Poseen una cinética diferente de la clásica de Michaelis-Menten (exhiben una curva


sigmoidal en la representación de v frente a la concentración de sustrato)

49 Comparación entre una enzima con una cinética clásica de Michaelis-Menten y una
enzima alostérica.

50 UN EJEMPLO DE REGULACIÓN POR ENZIMAS ALOSTÉRICAS


Un ejemplo de alosterismo (proceso metabólico controlado por enzimas alostéricas) es la
llamada inhibición por el producto final (o también regulación por retroinhibición o
regulación feed back).
La regulación feed back es usual en vías metabólicas integradas por varias reacciones en
cadena conducentes a la síntesis de un determinado producto (generalmente pequeñas
moléculas como aminoácidos).

A → B → C → D → E → P

E1 E2 E3 E4 E5
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51 INHIBICIÓN POR EL PRODUCTO FINAL
La enzima que cataliza la primera de esas reacciones (E1) es alostérica y su actividad es
regulada por el producto final de la síntesis, (P), que actúa como efector alostérico
negativo: la mayor o menor concentración de dicho producto final determinará una
menor o mayor actividad de la enzima y, por consiguiente, la mayor o menor velocidad de
la secuencia completa de reacciones.

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• Ampliar información
◦ Biología 2º de Bachillerato (Educastur)
◦ Cinética enzimática.
◦ Enzimología (Univ. Cat. de Puerto Rico)
◦ Introducción al metabolismo.
◦ Presentación sobre enzimas.
◦ Presentación sobre las enzimas.
◦ Ribozimas: resabios de un mundo primitivo.

• Vídeos y animaciones
◦ Aproximación a las enzimas.
◦ Enzimas alostéricas.
◦ ¿Qué es una enzima?
◦ Retroinhibición de vías bioquímicas (Mc Graw Hill).
◦ Ruta metabólica.

53 Acción de reguladores alostéricos

La acción de efectores alostéricos positivos y negativos regulan la velocidad del proceso.


Frecuentemente los sustratos actúan como efectores positivos y los productos como
negativos.

54

55 Animación sobre la formación del complejo enzima-sustrato.

56 Animación sobre la catálisis enzimática.


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57 Animación sobre inhibición competitiva

58 Animación sobre inhibición no competitiva Michaelliana

59 Animación sobre inhibición no competitiva alostérica

60 Ampliación <Centro activo>

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