Etude du microbiote intestinal chez les greffés rénaux sous immunosuppresseurs :

Approche moléculaire et métabolomique

Les mots clés : Microbiote intestinal, approche métabolomique, patients greffés rénaux,
immunosuppresseurs, trouble métabolomique, dysbiose, DDGE, HPLC, GC/MS
Résumé : Le tube digestif abrite une communauté complexe de micro-organismes appelée
microbiote qui réside à la surface des muqueuses intestinales tout au long de la vie. En effet,
le microbiote intestinal exerce des actions physiologiques pour maintenir la santé de l’hôte.
Toute rupture de l’équilibre «Dysbiose» entre ces constituants est susceptible de perturber le
fonctionnement de l’écosystème et d’être à l’origine de pathologies digestives et des
désordres métaboliques chez l’Homme et en particulier chez les patients transplantés rénaux
sous un traitement immunosuppresseur.
Cette étude a porté sur 40 patients greffés rénaux colligés au service de greffe d’organe à
l’hôpital militaire et 17 sujets témoins sains.
Notre approche expérimentale s’est basée en premier lieu sur l’étude de la composition
bactérienne du microbiote intestinal par DGGE des patients greffés rénaux par rapport aux
sujets sains. Les résultats ont montré que la richesse spécifique est plus importante pour les
sujets contrôles que certains patients greffés rénaux présentant un profil moins diversifié.
Par ailleurs les échantillons de fèces ont été analysés pour les deux groupes d’étude (patient
vs témoins) par métabolomique moyennant de deux méthodes d’analyses biochimiques et
physicochimiques : la HPLC et la GC/MS. Nous avons ainsi mis en évidence d’une part des
fluctuations métaboliques significatives induites par l’effet des immunosuppresseurs, et
d’autre part identifier quelques métabolites (biomarqueurs) spécifiques des patients (p-crésol
et indole) et spécifiques des sujets témoins (méthyl stéarate).

Molecular and Metabolomic study of the intestinal microbiota in renal transplant

patients under immunosuppressive therapy
Keywords: Gut microbiota, metabolomics approach, renal transplant patients,
immunosuppressive therapy, metabolic disorder, dysbiosis, DGGE, HPLC, GC/MS
Abstract: The digestive tract harbors a complex community of microorganisms called
microbiota that reside on the surface of the intestinal mucosa throughout life. Indeed, the
intestinal microbiota exercises physiological actions to maintain the health of the host. Any
disruption of the "Dysbiosis" equilibrium between these constituents is likely to disrupt the
functioning of the ecosystem and to be the cause of digestive pathologies and metabolic
disorders in humans and in particular in renal transplant patients under an immunosuppressive
treatment.
Our experimental approach was based primarily on the study of the bacterial composition of
the Gut microbiota by DGGE of renal transplant patients compared to healthy subjects. The
results show that the specific wealth is more important for the control subjects than some
renal transplant patients with a less diversified profile.
Further, we focused on studying the metabolomics profile of renal transplant patients under
immunosuppressive treatment using analytical methods HPLC and GC/MS. Metabolomic
research applied to feces samples allowed to define the specific metabolic profile of patients
vs controls and to identify classes and compounds of interest. Characterization of small
molecules produced by intestinal microbes could lead to the development of novel biomarkers
in renal transplantation.