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oxidativa
El piruvato producido a partir de la glucólisis y otras vías metabólicas se
metaboliza de varias maneras según el organismo y las condiciones de
crecimiento. El piruvato se usa como precursor para la biosíntesis o se oxida
completamente a CO2 en condiciones aeróbicas. Este capítulo está dedicado a los
mecanismos de oxidación de piruvato, transporte de electrones y fosforilación
oxidativa.
5.1 Descarboxilación oxidativa de piruvato
El complejo de piruvato deshidrogenasa oxida el piruvato a acetil-CoA y NAD+
reductor de CO2 en condiciones aeróbicas. El complejo de piruvato
deshidrogenasa consta de 24 moléculas de piruvato deshidrogenasa que contiene
pirofosfato de tiamina (TPP), 24 moléculas de dihidrolipoato acetiltransferasa que
contiene dihidrolipoato y 12 moléculas de dihidrolipoato deshidrogenasa que
contiene flavina adenina dinucleótido (FAD). Además, NAD+ y la coenzima A
participan en la reacción (Figura 5.1). Esta reacción es irreversible y tiene lugar en
la mitocondria en las células eucariotas. La reacción puede resumirse como:
Esta enzima necesita biotina. Acetyl-CoA activa esta enzima en muchas bacterias,
como en los animales, pero algunas bacterias como Pseudomonas aeruginosa
tienen una piruvato carboxilasa que no es activada por acetyl-CoA.
Un mutante de carboxilasa PEP de Escherichia coli no puede crecer en un medio
de sales minerales de glucosa, pero puede crecer cuando se complementa con
intermedios del ciclo TCA. Esta bacteria tiene PEP carboxilasa como secuencia
anaplerótica, no piruvato carboxilasa. Esta propiedad es compartida por muchas
otras bacterias, como Bacillus anthracis, Thiobacillus novellus, Acetobacter
xylinum y Azotobacter vinelandii.
Figura 5: 4 ciclo de glioxilato para la reposición de los intermedios del ciclo TCA.
(Gottschalk, G. 1986, Bacterial Metabolism, 2nd edn., Figura 4.5. Springer, Nueva York.)
Las bacterias que crecen en fuentes de carbono que se metabolizan a acetil-CoA pero no
a través de piruvato o PEP no pueden reponer los intermedios del ciclo TCA a través de la
secuencia anaplerótica. Sintetizan malato a partir de dos moléculas de acetil-CoA a través
del ciclo de glioxilato, utilizando isocitrato liasa y malato sintasa junto con enzimas del
ciclo TCA.
5.5.1.3 ΔG de ΔG°’
ΔG° y ΔG°’ expresan energía libre a las concentraciones de reactivo y producto de
una unidad de actividad (=1 M). Sin embargo, las concentraciones dentro de una
célula son mucho más bajas que eso. La ΔG a una concentración dada de
reactivos y productos puede calcularse a partir de ΔG°’ en una reacción de
Cuando se usa una temperatura de 30°C, el E°´ se calcula como 0,42 V. Los
valores de E°´ de algunas medias reacciones de interés biológico se enumeran en
la Tabla 5.1.
Figura 5: 8 Determinación del potencial redox.
Un recipiente se llena con una solución que contiene 1 M de cada una de las formas
reducidas y oxidadas de un compuesto de potencial redox conocido, y el otro recipiente
con 1 M de cada una de las formas reducidas y oxidadas del compuesto de prueba. Se
coloca un electrodo de platino en cada recipiente. Estos dos recipientes están conectados
con un puente de sal de KCl y los electrodos con un potenciómetro. Debido a las
diferencias en la tendencia a transferir electrones al electrodo de platino en cada
recipiente, se desarrolla un potencial. El potenciómetro da la diferencia en el potencial
redox de los compuestos. Una solución de 1 M H+ (forma oxidada) gaseada con 1 atm H 2
(forma reducida) se define arbitrariamente como una reacción que tiene un potencial
redox de 0 V.
ESTEQUIÓMETROS HÞ / ATP.
La ATP sintasa unida a la membrana cataliza la síntesis y la hidrólisis de ATP
consumiendo y desarrollando la fuerza motriz de protones (Figura 5.21b). No se sabe con
certeza cuántos protones se mueven a través del enzima para generar 1 ATP
(estequiometría Hþ / ATP). Hþ / ATP la estequiometría depende del potencial de
fosforilación (DGp, Sección 5.6.3) y el tamaño de la fuerza motriz del protón (Dp, Sección
5.7.1). Varios resultados experimentales han demostrado una estequiometría Hþ / ATP de
2–5 con una estequiometría de 3 generalmente aceptada.
Este número tiene una implicación importante en términos del mínimo Energía libre
conservada en un sistema biológico. La energía se conserva a través de la fermentación
(fosforilación a nivel de sustrato, SLP), respiración y fotosíntesis (ETP) en sistemas
biológicos. En SLP a El cambio de energía libre mayor que DGp se puede conservar para
termodinámica razones. Del mismo modo, los cambios de energía libre se pueden
conservar durante la respiración y la fotosíntesis cuando el cambio es mayor que DGp /
[Hþ / ATP estequiometría]. En el caso de organismos que utilizan Naþ en lugar de Hþ, la
cantidad mínima de energía conservada sería DGp / [Naþ / ATP estequiometría].
DESACOPLADORES
Se sabe que muchos compuestos inhiben la síntesis de ATP con un aumento en el
consumo de O2 durante la respiración. Estos se conocen como desacopladores. Son
ácidos débiles o bases débiles, y son permeables a la membrana ya que son hidrófobos
no solo en formas no disociadas sino también en formas disociadas. En una celda que
respira, el pH interno es más alto que el externo. Desacopladores no disociados a baja. El
pH externo se difunde en la célula, donde se asocian al pH interno más alto. Las formas
disociadas se difunden fuera de la célula. El resultado neto es el transporte de Hþ a la
celda. De esta forma, los desacopladores disipan Dp (Figura 5.24). En presencia de un
desacoplador, el ATP no puede sintetizarse debido a la baja Dp, y la célula consume más
O2 para aumentar la Dp.
Los productos químicos que aumentan la permeabilidad de los iones se denominan
ionóforos. Los desacopladores son, por lo tanto, ionóforos para Hþ. Alternativamente, se
les puede llamar protonóforos. La figura 5.25 muestra algunos ejemplos de
desacopladores.
BOMBAS PRIMARIAS DE HÞ (NAÞ) EN EL METABOLISMO FERMENTATIVO.
Los cambios de energía libre disponibles de las reacciones de oxidación-reducción en la
respiración y la fotosíntesis se conservan en forma de Dp. Además del O2, los procariotas
usan otros aceptores de electrones para su respiración. El término respiración anaeróbica
se usa para describir el proceso de conservación de energía usando aceptores de
electrones que no sean O2. Algunos procesos de transporte activo primario Hþ (Naþ) se
conocen en bacterias fermentativas donde se utilizan aceptores de electrones
suministrados internamente (Sección 8.1).
FUMARATO REDUCTASA.
Las especies de Propionibacterium fermentan lactato a propionato a través de la vía
succinato-propionato (Figura 8.16, Sección 8.7.1). La fumarato reductasa de esta vía
reduce el fumarato a uccinado, extruyendo Hþ. Se conoce un proceso de conservación de
energía similar en Vibrio succinogenes, Desulfovibrio gigas y Clostridium formicoaceticum.
Esta enzima unida a la membrana utiliza H2 y formiato como donantes de electrones y
necesita menaquinona y citocromo b como enzimas (Figura 5.26). Estrictamente
hablando, el último ejemplo es la respiración anaeróbica, ya que el aceptor de electrones,
el fumarato, se suministra externamente.
DESCARBOXILASA DEPENDIENTE DE NAÞ.
Klebsiella pneumoniae (Klebsiella aerogenes) tiene una metilmalonil-CoA descarboxilasa
dependiente de Naþ. Esta enzima está unida a la membrana y exporta Naþ acoplado a la
reacción de descarboxilación. El cambio de energía libre de la descarboxilación (# 30 kJ /
mol de metil-malonil-CoA) se conserva como una fuerza motriz de sodio, que se convierte
en Dp por un Naþ /
Hþ antiportador para sintetizar ATP. La figura 5.27 muestra una reacción de
descarboxilación que conserva la energía como una fuerza motriz de sodio.
La energía se conserva de manera similar por la glutaconil-CoA descarboxilasa en
Acidamicoccus fermentans y Clostridium symbiosum, y por succinato descarboxilasa en
Veillonella parvula. La conservación de energía no se conoce en la descarboxilación de
oxaloacetato en la fermentación de citrato por Pediococcus halophilus y actococcus
lactis (Figuras 8.4, 8.5, Sección 8.4.6).
FORMACIÓN DE DP A TRAVÉS DEL PRODUCTO DE FERMENTACIÓN / SYMPORT
HÞ
Una bacteria de ácido láctico, Lactococcus cremoris, xtrudesHþ por un simportador de
lactato / Hþ, utilizando la energía potencial desarrollada por el gradiente de lactato debido
a la alta concentración interna de lactato en la célula (Figura 5.28). Cuando el lactato se
ha acumulado en el medio ambiente, Hþ no se puede simpatizar con lactato. En el ácido
láctico, la fermentación bacteriana y maloláctica (Sección 8.4.6) un antiportador de
malato2 # / lactato # importa malato a cambio de lactato (Figura 3.6). Esta reacción
genera Dy ya que se importa malate2 # exportando # lactato. Además, Hþ se consume en
la reacción de descarboxilación de malato (Figura 3.6).
OTROS PROCESOS DE TRANSDUCCIÓN DE ENERGÍA BIOLÓGICA.
La figura 5.7 ilustra los procesos de transducción de energía en microbios. Los
quimiotróficos convierten la energía química en energía biológica, y los fotótrofos utilizan
la energía de la luz. La energía biológica en forma de ATP y Dp se invierte en procesos
que requieren energía, incluido el transporte (Capítulo 3), la biosíntesis (Capítulo 6) y la
motilidad. No se incluye en la figura la bioluminiscencia que se encuentra en ciertas
bacterias.
BIOLUMINISCENCIA BACTERIANA
fischerii vive simbióticamente en los órganos ligeros de ciertos peces, mientras que un
nematodo del suelo es el hábitat de Xenorhabdus nematophilus. Algunos miembros del
género Vibrio son bacterias luminosas de vida libre en ecosistemas marinos y de agua
dulce.
La luz se emite cuando la densidad celular alcanza ciertos niveles. Las bacterias
luminiscentes excretan N-acil homoserina lactona como un autoinductor. Los
componentes de la reacción de bioluminiscencia son inducido solo por encima del umbral
de concentración de este autoinductor en el medio ambiente. Esta inducción se conoce
como detección de quórum (Sección 12.2.8) y la reacción depende estrictamente del O2.
La oxidación FMNH2 proporciona energía para la luminiscencia. La luciferasa bacteriana
forma un complejo FMNH2 de unión, O2 y un aldehído alifático de cadena larga para
emitir luz (Figura 5.29). La luciferasa bacteriana es un tipo de monooxigenasa (Sección
7.7) y requiere aldehído para la emisión de luz. El aldehído se oxida a ácido graso por la
luciferasa, y la reducción a aldehído se acopla a la oxidación de NADH.
LA ELECTRICIDAD COMO FUENTE DE ENERGÍA EN MICROBIOS.
Los quimiotróficos usan energía química como fuente de energía, y la energía de la luz es
utilizada por los fotótrofos. La energía química y la luz se convierten en energía biológica
que se utiliza para diversas funciones biológicas. Estos incluyen biosíntesis (energía
química), transporte (energía potencial), motilidad energía mecánica) y luminiscencia
(energía luminosa). En los peces eléctricos, la energía biológica se convierte en
electricidad.
Existe alguna evidencia que muestra que la electricidad se utiliza como fuente de energía
en la desnitrificación. Las cepas de Geobacter reducen el nitrato con un electrodo como
donante de electrones. Se puede hacer un cultivo de enriquecimiento utilizando un
electrodo como donador de electrones y nitrato como aceptor de electrones. Las bacterias
pueden crecer en un dispositivo electroquímico similar con nitrato agregado como aceptor
de electrones.