Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
LP11 ADN Recombinant PDF
LP11 ADN Recombinant PDF
11
TEHNOLOGIA
ADN RECOMBINANT
Descifrând enigmele structurii genelor, savanţii au
început să se preocupe de izolarea şi sinteza lor. În urmă cu 30
de ani cei care credeau în reuşita acestor deziderate erau puţini şi
nimeni nu bănuia explozia actuală a ingineriei genetice şi
consecinţele cu adevărat extraordinare pe care le va avea.
Primii paşi au fost făcuţi de Beckwith şi Shapiro, care în
1969 au izolat şi fotografiat operonul lactozei. Un an mai târziu
G. Khorana reuşeşte sinteza artificială a primelor gene de
procariote. Cu aceeaşi tehnică se sintetizează gena ce codifică
somatostatina – un hormon hipofizar (1977). După descoperirea
transcriptazei inverse se reuşeşte sinteza altor gene de mamifere
(pentru hemoglobină, ovalbumină, insulină etc.). Genele
obţinute nu erau însă active, deoarece nu aveau un sistem
propriu de replicare, nici secvenţele necesare declanşării
transcripţiei şi apoi a sintezei proteinelor pe care le codifică.
Aceste dificultăţi au fost depăşite, introducând genele artificiale
în plasmidele unor bacterii sau virusuri. Pentru inserţia genelor
în plasmide se folosesc enzime speciale care taie ADN în locuri
specifice – enzime de restricţie (Premiul Nobel, 1978).
Realizările ingineriei genetice au un mare interes teoretic
şi practic incontestabil. Izolarea sau sinteza genelor a dus la
obţinerea artificială a unor produşi naturali de mare valoare
(insulina, somatostatina, interferonul), dar speranţele justificate
181
Capitolul 11
pe care savanţii şi le pun în acest domeniu sunt mult mai mari.
Nu este vorba numai de o nouă industrie farmaceutică care să
producă antibiotice, hormoni, vaccinuri antivirale ci şi de
posibilităţile reale de a realiza o terapie cauzală – terapie
genică, corectând genele mutante sau înlocuindu-le şi rezolvând,
astfel, marea problemă a incurabilităţii bolilor genetice.
Actualmente există toate posibilităţile tehnice pentru
studierea directă sau indirectă a acizilor nucleici – purtători ai
mesajului ereditar. Gena de interes poate fi extrasă din
organism, supusă unor modificări structurale, introdusă în alt
organism, poate fi obţinut produsul ei proteic. Toate procedeele
manipulării acizilor nucleici se reunesc în termenul genetic –
tehnica ADN recombinant.
Pentru studiul acizilor nucleici sunt necesare următoarele
procedee:
- extragerea şi purificarea moleculelor de ADN (sau ARN)
din celule;
- izolarea fragmentului de ADN de interes;
- multiplicarea fragmentelor izolate;
- analiza secvenţelor de interes (determinarea succesiunii
bazelor, determinarea expresiei, determinarea poziţiei în
genom).
182
Capitolul 11
Pentru izolarea unei anumite moleculele de ARNm se
utilizează celulele ţesuturilor în care are loc expresia genei
respective (de ex., ARNm pentru insulină poate fi izolat doar din
celulele ale pancreasului; ARNm pentru globine – din celulele
eritroblaştilor etc.).
Restricţia ADN
Clivarea enzimatică a moleculelor de ADN se efectuează
cu ajutorul unor enzime de restricţie (ER) care recunosc
secvenţe specifice dublucatenare, numite situsuri de restricţie.
183
Capitolul 11
ER sunt enzime întâlnite la procariote care, în natură,
sunt responsabile de clivarea ADN-ului exogen (de ex., ADN
virual). SR reprezintă nişte succesiuni specifice formate, de
regulă, din 4-6-8 pb ce formează palindroame (fig. 11.1).
Secvenţele respective în ADN-ul gazdei sunt metilate şi nu pot
fi recunoscute de ER proprii.
Ca rezultat al acţiunii diferitor ER se pot obţine
fragmente de ADN cu capete monocatenare adezive (lipicioase)
sau cu capete neadezive.
ADN-ul din genomul eucariotelor (inclusiv genomul
uman) conţine diferite SR dispersate la întâmplare de-a lungul
macromoleculei. Utilizând ER pot fi obţinute fragmente de
ADN cu lungimi diferite. Comparând fragmentele de restricţie
se poate construi harta de restricţie a moleculei de ADN –
localizarea SR pentru diferite restrictaze.
Sinteza ADNc
184
Capitolul 11
(5) sinteza catenei complementare a ADNc, bucla servind în
calitate de primer pentru ADN-polimerază;
(6) înlăturarea buclei cu ajutorul nucleazei S1.
Clonarea ADN
Procesul de obţinere a unui număr mare de copii a
secvenţei ADN de interes cu utilizarea tehnicilor ADN
recombinant poartă denumirea de clonare. Procesul poate fi
realizat atât in vivo , cât şi in vitro (PCR).
185
Capitolul 11
Clonarea ADN în vivo
Clonarea ADN în vivo constă în izolarea unui fragment
de ADN, introducerea lui prin ligare într-un vector şi
multiplicarea lui într-o celulă gazdă.
Vectorii de clonare sunt molecule de ADN care se
replică independent de cromozomul celular, chiar şi atunci când
sunt introduse artificial în structura lor fragmente de ADN
străin. Pentru replicare vectorul are nevoie de două elemente:
punctul ORI de iniţiere a replicării şi gena pentru proteinele SSB
care pregătesc matriţa pentru replicare. În calitate de vectori se
utilizează plasmidele R, bacteriofagul λ, virusul simian SV-40,
cosmidele, cromozomii artificiali bacterieni (BAC), cromozomii
artificiali ai drojdiilor (YAC), etc. Selectarea vectorului de
clonare se face în funcţie de dimensiunile fragmentului
multiplicat: fragmentele mici de până la 15 kb pot fi clonate în
plasmide, fragmentele cu o lungime de până la 50 kb – în
cosmide şi bacteriofagi, fragmentele mai mari de 300 kb – pot fi
clonate în cromozomii artificiali BAC sau YAC.
În calitate de gazdă de clonare sunt utilizate: celula
bacteriană (pentru plasmide, cosmide, bacteriofagi, BAC),
celulele drojdiilor (pentru plasmide, YAC), celulele vegetale
(plasmide, virusuri), celulele animale (virusuri). Există vectori
care se pot replica în mai multe gazde – vectorii navetă.
Moleculele hibride formate din ADN vector şi ADN
pentru cercetare poartă denumirea ADN recombinant. Obţinerea
ADN recombinant necesită următoarele procese (fig. 11.3):
- izolarea ADN pentru clonare (o secvenţă de ADN sau o
genă) şi selecţia vectorului de clonare;
- clivarea ADN de interes şi a vectorului cu aceeaşi enzimă de
restricţie ce produce capete adezive;
- introducerea secvenţei de ADN în vector prin ligarea
fragmentelor rezultate din digestia cu ER cu ajutorul enzimei
186
Capitolul 11
ADN-ligaza. ADN-ligaza uneşte complementar capetele
adezive ale fragmentelor prin legături fosfodiesterice.
187
Capitolul 11
Amplificarea ADN in vitro
Biblioteci de ADN
Biblioteca genomică
Colecţia de clone ce conţine cel puţin o copie a fiecărei
secvenţe de ADN al genomului se numeşte bibliotecă
188
Capitolul 11
Biblioteci cromozomiale
Biblioteci de ADNc
190
Capitolul 11
digestie cu ER, moleculele de ADNc nu posedă capete adezive,
de aceea pentru introducerea în vector la moleculele de ADNc se
adaugă adaptori care conţin capete adezive.
191
Capitolul 11
2. sondele “reci” – fragmente de acid nucleic, marcate cu un
produs chimic neutru: direct, cu enzime sau fluorocromi sau
indirect, cu biotină. Se vizualizează în funcţie de tipul de
marcaj. Deşi sunt mai puţin sensibile, au avantajul de a fi
inofensive pentru cercetător.
Verificarea cunoştinţelor:
1. Definiţi noţiunile: ADN recombinant, clonare, vector de
clonare, enzimă de restricţie, situs de restricţie, ADNc,
bibliotecă ADN, fragmente de restricţie, sondă moleculară,
hibridare.
2. Care sunt etapele obţinerii genei de interes dintr-o celulă?
3. Ce proprietăţi au enzimele de restricţie?
4. Ce vectori de clonare cunoaşteţi? Prin ce se deosebesc?
5. Care sunt etapele obţinerii ADNc?
6. Ce importanţă are clonarea ADN?
7. Care este destinaţia bibliotecilor ADN?
8. În ce constă hibridarea ADN?
9. În ce scopuri se utilizează sondele moleculare?
192