Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
• Prezentarea schematică a
modului prin care două
substanţe, notate A şi B
sunt separate prin
cromatografie de eluţie pe
o coloană, cu fază mobilă
lichidă. Eluţia implică
spălarea, trecerea speciilor
(substanţelor A şi B, în
speţă) prin coloană, la
adăugarea continuă de
solvent (fază mobilă)
proaspăt (a).
o porţiune unică de probă este
introdusă la capătul superior al coloanei
(timpul to), după care componentele probei
se distribuie independent, între cele două
faze.
(b) Semnalul înregistrat de către un detector în funcţie de
evoluţia eluţiei prin coloana prezentată în (a).
Introducerea unui volum adiţional de fază mobilă (de
eluent) forţează volumul de solvent care conţine o
parte a probei să coboare prin coloană, unde, se
stabileşte o nouă partiţie între faza mobilă şi cea
staţionară (timpul t1). Simultan cu aceasta se
stabileşte un nou echilibru și o nouă partiţie între
solventul proaspăt (faza mobilă nou adăugată) şi faza
staţionară la locul iniţial de adăugare a probei.
Adăugarea unor noi volume de solvent va avea ca
efect coborârea moleculelor de solut spre capătul de
jos al coloanei printr-o serie continuă de transferuri
între faza mobilă şi cea staţionară. Cum mişcarea
solutului se poate realiza numai prin intermediul fazei
mobile, viteza medie cu care zona (banda) solutului
migrează în josul coloanei depinde de fracţia de timp
în care solutul este reţinut de către această fază.
Această fracţie este mică pentru componenta mai
puternic reţinută de către faza staţionară (compusul B,
din figură) şi este mare în cazul în care retenţia în faza
mobilă este mai adecvată (componenta A). În mod
ideal, diferenţele rezultate în vitezele diferite conduc la
separarea componentelor dintr-un amestec în benzi
sau zone localizate de-a lungul coloanei (timpul t3 din
figură). Izolarea şi deci separarea speciilor A şi B este
urmarea trecerii unei cantităţi suficiente de fază mobilă
prin coloană şi care conduce la o separare individuală
de zone clar distribuite ce pot fi colectate ori detectate
(timpii t3 şi t4 din figură).
DILUŢIA ANALITULUI
• Figura ilustrează o caracteristică
importantă a procesului de separare,
denumită diluţia analitului fenomen care
însoţeşte aproape întotdeauna separările
cromatografice. Astfel, mărimea zonei
originale care conţine analiţii din figură
este notabil mai mică decât cele două
zone care conţin componentele A şi B şi
care ajung în zona detectorului. Acest
fenomen semnificativ de diluare se
manifestă odată cu separarea
componentelor şi din această cauză,
detectorii utilizaţi pentru separarea
analiţilor trebuie adesea să prezinte o
sensibilitate mai mare decât cea care
ar fi dorită dacă procesul de separare
nu ar fi necesar.
CROMATOGRAMELE
• Dacă un detector care răspunde la o
modificare de concentraţie a solutului este
plasat la capătul terminal al coloanei iar
semnalul său este reprezentat grafic în
funcţie de timp (sau de volumul de fază
mobilă adăugat) se obţin o serie de peak-uri,
prezentate în figură (b). Asemenea
reprezentări grafice poartă numele de
cromatograme, care sunt utilizate atât în
cromatografia analitică cât şi în cea
preparativă. Poziţia peak-urilor pe axa
timpului poate servi la identificarea
componentelor din probă, aria fiecăruia
conducând la determinarea cantitativă a
fiecărui component.
EFECTELE VITEZELOR DE MIGRARE ŞI A LĂŢIMII ZONEI ASUPRA
REZOLUŢIEI CROMATOGRAFICE
Constanta de echilibru, K, pentru această reacţie este numită constantă de distribuţie, raport
de partiţie sau coeficient de partiţie Comisia de Nomenclatură Analitică a IUPAC pentru
cromatografie recomandă utilizarea termenului de constantă de distribuţie, Kc în loc de vechiul
termen în loc de vechiul termen de coeficient de partiţie sau raport de partiţie, K. Totuși, în literatura
de specialitate ambii termeni sunt încă utilizaţi. Constanta K este definită conform formulei:
CS reprezintă concentraţia molară a solutului din faza staţionară iar CM este
concentraţia molară din faza mobilă; în mod ideal, K este constantă în tot
domeniul de concentraţii a solutului, iar CS este proporţională cu CM.
Tipul de cromatografie în care se aplică ecuaţia poartă denumirea de
cromatografie lineară iar rezultanta ei este caracterizată printr-o simetrie de
tip Gauss a peak-urilor şi a timpilor de retenţie, parametrii care sunt
independenţi de cantitatea de analit supusă analizei. În general, studiile
teoretice se limitează la o astfel de cromatografie lineară.
TIMPUL DE RETENŢIE
Cele două volume pot fi estimate prin metode specifice fiecărui tip de cromatografie.
VITEZA DE MIGRARE A SOLUTULUI: FACTORUL DE RETENŢIE
Factorul de retenţie, sau factorul de capacitate reprezintă un
parametru important care este general utilizat în descrierea vitezelor
de migrare a soluturilor pe coloană. Pentru un solut A, factorul de
retenţie k’A este definit ca:
= L (2 ) u= L (3 )
tR t
M
Factorul de selectivitate
al unei coloane () pentru (9)
două specii, A şi B este
definit prin formula:
unde KB reprezintă constanta de distribuţie
a speciei B, mai puternic reţinută pe
coloană, în timp ce KA reprezintă
constanta de distribuţie a speciei A, mai
puţin reţinută pe coloană, şi mai rapid
eluată de pe aceasta. Prin definiţie, este
întotdeauna mai mare decât unitatea.
• Prin substituirea ecuaţiei 5 şi a
ecuaţiei analoage pentru
solutul B în ecuaţia 9 se
obţine, după la rearanjare,
relaţia de legătură între factorul (10)
de selectivitate pentru cei doi
soluţi şi factorii lor de retenţie:
unde k'B şi k'A reprezintă factorii de retenţie
ai solutului B, respectiv A.
Substituţia în ecuaţia 8 pentru cei doi soluţi din ecuaţia 10 conduce la o expresie ce
permite determinarea experimentală lui dintr-o cromatogramă:
Figura 4
Figura 1
Figura 2
• Examinarea peak-urilor dintr-o cromatogramă sau a benzilor pe
coloană (figurile de mai jos) relevă o similaritate a erorilor normale,
repartiţia realizându-se după un profil Gaussian, care sunt obţinute
în condiţiile reprezentării grafice a valorilor determinate funcţie de
frecvenţa repartiţiei a acestora.
În unele cazuri, peak-urile cromatografice nu sunt lineare, manifestând o
coadă (trenă) sau un front.
În primul caz, trena peak-ului care apare în dreapta cromatogramei
este prelungă, în timp ce frontul acestuia este abrupt.
În cel de-al doilea caz, forma cromatogramei este inversată, adică
frontul este prelung în timp ce trena este extrem de scurtă. Cauza comună a
apariţiei frontului sau a trenei o reprezintă existenţa unei constante de
distribuţie neliniare. Frontul apare de asemenea în cazul eluării unei
cantităţi mari de probă pe coloană. Distorsiunile de acest fel sunt nedorite
deoarece conduc la separări de proastă calitate şi la timpi de eluţie cu
reproductibilitate scăzută. În abordarea teoretică se consideră ca fenomenul
de front sau coadă cromatografică este absent sau minim.
• După cum se cunoaşte, curbele de erori normale pot fi
raţionalizate prin asumarea faptului că incertitudinea
asociată cu orice măsurătoare singulară reprezintă
însumarea unui număr mult mai mare de erori mici,
individuale nedetectabile şi de repartiţii întâmplătoare,
fiecare dintre acesta având o probabilitate egală, pozitivă
sau negativă. Cea mai comună manifestare a acestor
incertitudini este reprezentată de anularea uneia de către
cealaltă, ceea ce conduce la o valoare medie. Cu o mică
probabilitate, însumarea poate conduce la un rezultat mai
mare sau mai mic decât media. Drept consecinţă,
distribuţia valorilor este simetrică, în jurul valorii medii. În
mod similar, forma Gaussiană a unei zone
cromatografice ideale poate fi atribuită combinării aditive
a mişcărilor întâmplătoare a moleculelor de solut în zona
cromatografică.
Să considerăm comportamentul unei molecule de solut, care în timpul
migrării, trece prin mii de transferuri între faza staţionară şi cea mobilă. Timpul
petrecut în fiecare fază de transfer este deosebit de neuniform, depinzând de
câştigul accidental de energie termică din mediul înconjurător pentru a realiza
un transfer reversibil, în cealaltă fază. Astfel, în unele cazuri, timpul de şedere
într-o fază dată, poate fi tranzitoriu, în timp ce în alte faze perioada poate fi
relativ mai lungă. Cum molecula este eluată numai în timpul şederii sale în faza
mobilă, are ca rezultat, migrarea sa total neuniformă în josul coloanei. Din
cauza timpilor variabili de şedere, viteza medie cu care moleculele individuale
se mişcă relativ în faza mobilă variază în mod considerabil. Anumite particule
individuale traversează mai rapid în virtutea includerii lor accidentale în faza
mobilă, majoritatea timpului de eluţie. Altele, din contră, pot prezenta întârzieri
datorită includerii lor în faza staţionară, timp mai îndelungat decât timpul mediu
de eluţie. Consecinţa acestor procese aleatoare este o împrăştiere simetrică a
vitezelor în jurul valorii medii, iar acesta reprezintă comportamentul mediu al
moleculei.
Lăţimea benzii componentului separat creşte odată cu coborârea lui de-
a lungul coloanei, datorită faptului că o creştere a timpului de eluţie permite
manifestarea unei mai mari împrăştieri. Astfel, lăţimea zonei este în relaţie
directă cu timpul de şedere în coloană şi în relaţie inversă cu viteza de curgere
a fazei mobile.
METODE DE DESCRIERE A EFICIENŢEI COLOANEI
În măsurarea cantitativă a
eficienţei unei coloane
N = L/H (1.12)
L, lungimea coloanei împachetate
cromatografice în general
(dată de obicei în centimetrii)
sunt utilizaţi doi termeni
înrudiţi: Eficienţa coloanelor cromatografice creşte
(1) înălţimea talerului cu numărul de talere teoretice: cu cât
numărul de talere teoretice este mai mare
teoretic, H şi şi înălţimea talerului teoretic devine mai
(2) numărul de talere mică. Sunt întâlnite diferenţe enorme în
eficienţa unei coloane, datorită diferenţelor
teoretice, N. Cei doi dintre tipul de coloană şi fazele mobilă,
parametrii sunt asociaţi respectiv staţionară, utilizate. În mod
prin ecuaţia: curent, eficienţa unei coloane în termen de
număr de talere teoretice, poate varia între
câteva sute până la mii, iar domeniul
înălţimii talerelor variind între zecimi până
la miimi de centimetrii sau mai mici.
• Introducerea termenilor de înălţime a talerului şi a numărului de
talere este datorată studiilor teoretice ale lui Martin şi Synge care
au tratat coloana cromatografică similar coloanei de distilare, unde
au loc o multitudine de procese discrete dar continue, în straturi
înguste, denumite talere teoretice. S-a considerat că la nivelul
fiecărui taler, are loc un echilibru între faza mobilă şi cea staţionară.
Mişcarea solutului în josul coloanei a fost apoi tratată ca o treaptă
de transfer între faza mobilă în echilibru şi următorul taler situat mai
jos.
Reprezentarea
grafică a definiţiei
talerului teoretic.
H = 2/ L
N = L/H (1.12)
Figura ilustrează modul simplu de
aproximare al lui şi dintr-o
cromatogramă obţinută experimental.
Tangentele punctelor de inflexiune de pe
cele două părţi ale peak-ului
cromatografic sunt prelungite până la
intersectarea lor şi se formează astfel un
triunghi cu baza pe axa timpului a
cromatogramei. Aria acestui triunghi
reprezintă aproximativ 96% din aria
totală a peak-ului.
În evaluarea statistică, se consideră că aproximativ
96% din aria peak-ului Gaussian este inclusă în interiorul
suprafeţei cu o aproximaţie de plus sau minus două deviaţii
standard (±2) din valoarea sa maximă. Astfel, intercepţiile
arătate în figură se manifestă la aproximativ ±2 din
maximum, iar W = 4, unde W este mărimea bazei
triunghiului. Substituind această relaţie în ecuaţia 1.14 şi
rearanjând termenii, rezultă:
N = L/H (1.12)
În continuare, N
poate fi calculat din
măsurarea, la două
momente de timp, tR şi W;
iar pentru a obţine H,
lungimea coloanei
împachetate trebuie să fie
de asemenea cunoscută.
O altă metodă de aproximare a lui N, şi care este
considerată de către unii practicieni mai sigură,
necesită determinarea a W1/2 (jumătate din lăţimea
bazei peak-ului), Iar numărul de talere este dat de
formula:
Tabelul prezintă parametrii cei mai importanţi care concură la rezoluţia cromatografică.
EFECTUL VITEZEI DE CURGERE A FAZEI
MOBILE
Magnitudinea efectelor cinetice asupra eficienţei coloanei
depinde în mod clar de lungimea timpului în care faza mobilă este
în contact cu faza staţionară, care, la rândul ei, este depinde de
viteza de curgere a fazei mobile. Din această cauză, studiile
referitoare la eficienţa unor coloane sunt în general axate pe
determinarea lui H ca funcţie de viteza fazei mobile, u. Aceste date
sunt exemplificate de cele două curbe din figura următoare, una
caracterizând cromatografia de lichide, în timp ce a doua este
reprezentativă cromatografiei de gaze.
Ambele curbe prezintă un minim al înălţimii talerului teoretic, H
(ceea ce semnifică o eficienţă maximă) la viteze mici de curgere.
Această valoare minimă din cromatografia lichidă se manifestă în
general la viteze de curgere care sunt asemănătoare celei de
cromatografie de gaze şi deseori sunt atât de mici încât nu sunt
sesizabile în condiţiile normale de operare.
Efectul vitezei de curgere a fazei mobile asupra înălţimii
talerului teoretic în cazul
(a) cromatografiei de lichide şi (b) gaz cromatografiei.
Teoria vitezei de împrăştiere a zonei cromatografice
descrie cu acurateţe şi predicţionează forma diagramei H
în funcţie de u, grafic denumit adesea diagrama van
Deemter după numele descoperitorului ei. După cum se
observă în figura alăturată, vitezele de curgere pentru
cromatografia lichidă sunt semnificativ mai mici decât
cele utilizate în cazul celei gazoase.
Din această cauză, separările în gaz cromatografie
sunt mai rapide decât cele de cromatografie lichidă. Mai
mult, după cum arată figura, înălţimea talerului teoretic a
unei coloane de cromatografie lichidă are un alt ordin de
magnitudine fiind mult mai mică faţă de cel întâlnit în
cazul coloanelor utilizate în cromatografia de gaze. Din
această cauză, nu este practic a se utiliza coloane de
cromatografie lichidă care sunt mai lungi de 25-50 cm
(datorată presiunii picăturilor), în timp ce coloanele de
gaz cromatografie pot fi de 50 de metrii sau mai lungi.
În consecinţă, numărul total de talere şi astfel
eficienţa totală a coloanei sunt în general superioare în
cazul coloanelor de gaz cromatografie. În acest fel, o
primă comparaţie între gaz cromatografie şi cea lichidă
arată că prima metodă este capabilă de separări mai
rapide şi de mai mare eficienţă.
RELAŢIA DINTRE ÎNĂLŢIMEA TALERULUI ŞI VARIABILELE
COLOANEI
Necesitatea celor doi coeficienţi de transfer de masă CS şi CM din ecuaţia 1.19 apare
datorită faptului că echilibrul dintre fazele mobilă şi staţionară se stabileşte deosebit de lent
în coloana cromatografică deoarece ea operează întotdeauna în condiţii de neechilibru. În
consecinţă, moleculele de analit aflate în partea frontală a benzii cromatografice sunt
preluate în faţă, înainte de a avea timp pentru a se echilibra în faza staţionară şi astfel să fie
reţinute de această fază. În mod similar echilibrul nu se stabileşte la marginea situată la
trena benzii iar moleculele de analit sunt părăsite îndărătul fazei staţionare, datorită mişcării
rapide a fazei mobile.
Împrăştierea benzii din cauza efectelor de transfer de masa se manifestă din cauza
faptului că o multitudine de curenţi de curgere ai fazei mobile din coloană şi stratul care
înconjoară faza staţionară au dimensiuni finite. În consecinţă, este necesar un timp pentru ca
moleculele de solut aflate la interfaţă să difuzeze dintr-o fază în interiorul celelalte faze.
Acest timp „de lag” rezultă din persistenţa condiţiilor de neechilibru de-a lungul coloanei
cromatografice. De altfel, dacă vitezele de transfer de masă dintre cele două faze ar fi
infinite, fenomenul de împrăştiere a zonelor cromatografice nu s-ar manifesta.
Se poate nota că extensia benzii cromatografice produsă atât de împrăştierea
longitudinală cât şi de transferul de masă depinde de viteza de difuzie a moleculelor de
analitul în timp ce direcţia difuziei în cele două cazuri este diferită. Împrăştierea longitudinală
apare din tendinţa moleculelor de a se îndrepta într-o direcţie paralelă curgerii, în timp ce
împrăştierea datorată transferului de masă se manifestă din tendinţa moleculelor de a difuza
într-un plan perpendicular cu direcţia de curgere. Drept consecinţă, gradul de împrăştiere
longitudinală este în relaţie inversă cu viteza de curgere. Pentru împrăştierea datorată
transferului de masă, din contră, cu cât faza mobilă se mişcă mai repede, cu atât timpul
necesar ajungerii la echilibru este mai redus. Astfel, după cum arată ultimii doi termeni ai
ecuaţiei 1.19, efectul transferului de masă asupra înălţimii talerului este direct proporţional
cu viteza lineară, u, de mişcare a fazei mobile.
•TERMENUL DE TRANSFER DE MASĂ ÎN FAZA STAŢIONARĂ (CSU).
Ecuaţia a treia din tabelul 1.3, arată că în condiţiile în care faza staţionară este un lichid imobilizat,
coeficientul de transfer de masă este proporţional cu o funcţie complexă, fs(k') a factorului de retenţie k', este
direct proporţională cu pătratul grosimii filmului de pe particulele suport df şi este invers proporţională cu
coeficientul de difuzie, DS a solutului în film. Efectele acestei relaţii pot fi înţelese prin imaginarea modului prin
care aceşti factori influenţează frecvenţa medie prin care moleculele de analit care ajung la interfaţă sunt
transferate în faza mobilă. De exemplu, în funcţie de grosimea filmelor, moleculele trebuie să traverseze în medie
o distanţă mai mare sau mai mică pentru a atinge suprafaţa; în cazul coeficienţilor de difuzie mai mici, ele vor
traversa mai încet. Consecinţa ambilor factori este o viteză scăzută de transfer de masă şi o creştere a înălţimii
talerului.
Efectele acestei relaţii pot fi înţelese prin imaginarea modului prin care aceşti
factori influenţează frecvenţa medie prin care moleculele de analit care ajung la
interfaţă sunt transferate în faza mobilă. De exemplu, în funcţie de grosimea
filmelor, moleculele trebuie să traverseze în medie o distanţă mai mare sau mai
mică pentru a atinge suprafaţa; în cazul coeficienţilor de difuzie mai mici, ele vor
traversa mai încet. Consecinţa ambilor factori este o viteză scăzută de transfer de
masă şi o creştere a înălţimii talerului.
Este foarte util a se dezvolta o relaţie matematică între rezoluţia unei coloane şi
factorii de retenţie, k’A şi k’B, a factorului de selectivitate , şi numărul de talere, N,
care alcătuiesc o coloană cromatografică în cazul a doi soluţi.
Considerând că cei doi soluţi, A şi B au timpi de retenţie apropiaţi unul de celălalt,
se poate aproxima că:
WA = WB W
În condiţiile în care atinge unitatea, optimizarea lui k' şi creşterea lui N nu sunt suficiente pentru a produce o separare
satisfăcătoare a doi soluţi, într-un timp rezonabil. Sub aceste circumstanţe, trebuie identificată o posibilitate de creştere a
factorului de selectivitate , cu menţinerea lui k' într-un domeniu optim de 1-10. În acest context sunt posibile o serie de
opţiuni de lucru. Astfel, scăderea oportunităţii în perspectiva şi avantajul (comodităţii) aceste opţiuni includ: (1) schimbarea
compoziţiei fazei mobile, inclusiv schimbarea pH-ului; (2) schimbarea temperaturii coloanei; (3) schimbarea
compoziţiei fazei staţionare; (4) utilizarea unor efecte specifice, chimice.
Un exemplu de utilizare a opţiunii (1) a fost raportat în cazul separării anisolului (C6H5OCH3), de benzen. Cu o fază
mobilă conţinând un amestec metanol:apă 50%, k' pentru cei doi soluţi a fost raportată de 4,5 şi respectiv 4,7, în timp ce a
fost egal cu numai 1,04. Înlocuirea fazei apoase cu una care ca conţinut 37% tetrahidrofuran a condus la k' de 3,9 şi 4,7 şi la o
valoare de 1,20. Dacă suprapunerea celor două peak-uri a fost semnificativă în primul caz, în cel de al doilea caz
suprapunerea a fost neglijabilă.
Pentru separări care implică acizi sau baze ionizabile, modificarea pH-ului fazei mobile conduce deseori la
manipularea valorilor fără a schimbare majoră în k' ceea ce conduce la separări mai eficiente.
O metodă mai puţin convenabilă dar deseori foarte eficientă în creşterea simultan cu o menţinere aproape
constantă a valorilor lui k' în domeniul optim este cea de alterare a compoziţiei chimice a fazei staţionare. Pentru
aceasta, cele mai multe laboratoare care realizează separări cromatografice frecvente posedă mai multe coloane care pot fi
interschimbabile cu un minim de efort.
O creştere a temperaturii generează deseori o creştere în k' dar această operaţiune are un efect mic asupra valorilor
lui în cazul cromatografiei lichid-lichid ori cromatografiei lichid-solid. În opoziţie, în cazul cromatografiei de schimb
ionic, efectul temperaturii poate fi suficientă în cazul explorării acestei opţiuni, înainte de schimbarea împachetării coloanei.
În fine, o altă metodă de creştere a rezoluţiei este încorporarea în faza staţionară a unor specii care complexează sau
interacţionează cu unul sau mai mulţi componenţi aflaţi în proba de separat. Un exemplu de utilizare a acestei opţiuni o
reprezintă impregnarea cu săruri de argint a suportului adsorbent care conduce la o îmbunătăţire a separării olefinelor ca o
consecinţă a formării unor complexe între ionii de argint şi compuşii organici nesaturaţi.
Trena cromatografică
unde “a” si “b” sunt măsurate la 10% din înălţimea peak-ului cromatografic din figura alăturată.
Pentru valori mai mici de 2, As şi USP Tf sunt aproximativ aceleaşi, precum se poate
observa şi in tabelul de mai jos. ce reprezintă măsurătorile factorului de asimetrie şi ale
factorului de trenare USP pentru acelaşi peak, în cazul figurii de mai jos.
Valoarea măsurată
Peak-ul din figura alăturată
As Tf
Practicienii descriu în mod curent suprafaţa ca posedând grupări libere silanolice (a)
dar sunt de altfel prezenţi atomi de siliciu cu două grupări hidroxil în configuraţie geminală
(b). Dacă grupările silanolice sunt poziţionate una, alături de alta, se pot realiza legături de
hidrogen cu o grupare adiacentă (c). Grupările libere de silanol sunt mai acide decât
grupările geminale ori asociate ele interacţionând mai puternic cu soluţi bazici având ca
rezultat formarea unei trene deseori asociată cu separarea unor soluţi bazici. În alte cazuri,
urme de metale (deseori fier ori aluminiu) pot fi prezente in matrixul de silicagel (d). Ionii
metalici pot acţiona ca situsuri schimbătoare de ioni sau, când grupările silanol libere sunt
adiacente, ei pot atrage electroni, care fac ca silanolul sa fie şi mai acid (e).
In trecut, coloanele împachetate cu silice tip A conţineau toate aceste forme de silanol
prezentate în figură, totuşi, în ultimii ani s-a pus la punct tehnologii de obţinere de suporturi de
silice de puritate înaltă (silicea de tip B), ce conţine un număr redus de grupări silanol libere la
suprafaţă şi sunt lipsite de urme de metale, fiind astfel mai puţin acide. Astfel de coloane ce conţin
silice de tip B au o tendinţă mult mai mică de a genera peak-uri cu trenă.
Reducerea formării trenelor în coloane de tip.A, înseamnă de obicei modificarea fazei mobile
pentru a include componente ce concură la suprimarea trenei. Adăugarea de trietilamină în faza
mobilă reprezintă o metodă curentă în reducerea formării trenelor cromatografice. Folosită la o
concentraţie de 20mM sau mai mare în faza mobilă, trietilamina poate reduce semnificativ trenarea
picurilor în coloane de tip A. În cazul utilizării de silice de tip B trenarea peak-urilor reprezintă o
problemă mult mai rară. În condiţiile utilizării exclusiv de coloane de tip B, rareori se adaugă
trietilamină la faza mobilă. Ca regulă generală, pH-ul scăzut al fazei mobile (pH < 3) acţionează de
asemenea ca un supresor al ionizării silanolului, care mai departe conduce la reducerea formării
trenelor cromatografice.
Problema generală a eluţiei
Aceste modificări pot fi realizate într-o manieră în trepte ori continuă. Astfel, pentru
amestecul prezentat în figură, condiţiile de la început pot fi cele care conduc la
cromatograma (a). Imediat după eluţia componentelor 1 şi 2, este necesară schimbarea
condiţiilor astfel încât să se ajungă la cele optime pentru separarea compuşilor 3 şi 4 (după
cum se observă în cromatograma c). Odată cu apariţia peak-urilor acestor compuşi, eluţia
poate fi realizată în condiţiile utilizate în cazul cromatogramei (b). Deseori, astfel de
proceduri conduc la rezolvarea satisfăcătoare a peak-urilor tuturor componenţilor din
amestec într-un interval minim de timp.
În cazul cromatografiei lichide, variaţiile în k' sunt produse prin variaţia în compoziţie a
fazei mobile în timpul eluţiei (eluţie în gradient sau programarea solventului).
Pentru gaz cromatografie, creşterea temperaturii (programarea temperaturii) serveşte
la atingerea condiţiilor optime necesare separării.
relaţii de legătură (1)
relaţii de legătură (2)
APLICAŢIILE CROMATOGRAFIEI
Cea mai sigură metodă de analiză cromatografică cantitativă implică prepararea unei
serii de standarde prin diluţia unei soluţii stoc ce posedă o compoziţie aproximativ
asemănătoare cu cea a probei necunoscute. Cromatogramele pentru standarde obţinute
astfel sunt apoi reprezentate în funcţie de concentraţia lor. Curba rezultată care obligatoriu
trece prin origine este utilizată la determinările de concentraţie a compusului care se
dozează. În mod frecvent se recurge la restandardizare pentru a obţine rezultate cu o mai
mare acurateţe.
Cea mai importantă sursă de erori în analize efectuate prin metoda mai sus
menţionată este dată de incertitudinea legată de volumul probei; uneori, viteza de injecţie,
reprezintă de asemenea un factor de eroare. În mod curent probele sunt mici (de
aproximativ 1 µl), iar incertitudinile legate de injectarea în condiţii reproductive a unui volum
cu o seringă de aceleaşi mărime poate conduce la scăderea cu procente semnificative a
erorilor. Această situaţie este des-întâlnită în cromatografia gaz-lichid, unde proba trebuie
sa fie injectată într-un dispozitiv special încălzit, unde fenomenul de evaporare care apare
la nivelul acului seringii poate fi deosebit de crescut, conducând astfel la variaţii mari ale
volumului injectat. Erorile volumului de probă pot fi reduse, cu probabil 1-2% din medie, prin
utilizarea unei valve rotative.
Metoda cu standard intern
Precizia cea mai mare în cromatografia cantitativă este obţinută prin utilizarea
standardelor interne deoarece incertitudinile introduse prin injectarea probei sunt evitate.
În această procedură, se măsoară cu atenţie o substanţă, denumită standard intern,
care este introdusă în fiecare standard sau probă, raportul dintre ariile (ori înălţimea)
peak-urilor analitului şi a standardului intern servind drept parametru analitic. Pentru ca
această metodă sa aibă succes, este ca peak-ul standardului intern să fie bine separat
de peak-urile celorlalte componente din probă (Rs > 1,25); peak-ul standard trebuie, pe
de altă parte, sa apară în apropierea peak-ului analitului. Cu un standard intern adecvat,
se poate creşte precizia faţă de alte metode, utilizate frecvent.
unde k'2 şi k'1 reprezintă valorile iniţiale şi finale pentru un solut, în timp ce P'1 şi P'2 sunt valorile corespunzătoare ale lui P'.
Abordarea sistematică a separării a şase steroizi. (a) şi (b) utilizarea apei pentru a ajusta
valoarea factorului de retenţie k'. Efectele variaţiei factorul de selectivitate α sunt arătate în
(b), (c), (d), şi (e). Coloană: 0,4 x 150 mm împachetată cu suport C8, particule de fază inversă,
5 μm. Temperatura: 50°C. Viteza de curgere: 3.0 cm3/min. Detector: UV 254 nm. Compuşi: (1)
prednisonă, (2) cortizonă (3) hidrocortizonă, (4) dexametazonă, (5) corticosteronă; (6)
cortoexolonă.
Două aplicaţii ale
cromatografiei de partiţie cu
fază legată. a) Analiza unor
aditivi într-o băutură
nealcoolică. Coloană cu suport
polar legat (nitril). Eluţie
izocratică. b) Analiza unor
insecticide organofosforice.
Coloană cu fază legată C8,
eluţie în gradient. Detecţie UV,
254 nm.
Formarea unor derivaţi ai probei
În unele cazuri este util a se converti componenţii probei în derivaţi înaintea sau
uneori când se întreprinde o separare cromatografică. Acest tratament este de dorit în
condiţiile în care se doreşte (1) reducerea polarităţii speciilor astfel că se poate utiliza mai
degrabă cromatografia de partiţie decât cea de adsorbţie ori de schimb ionic, (2) creşterea
răspunsului detectorului şi astfel creşterea sensibilităţii pentru toate ori pentru o serie de
componente ale probei şi (3) intensificarea selectivă a răspunsului la detector pentru o
serie de componente ale probei.
Faza staţionară este constituită din particule inerte care conţin pori mici cu dimensiuni
controlate. Examinarea microscopică a acestor particule arată un interior spongios. O soluţie care
conţine molecule cu diferite mase moleculare este trecută prin coloană sub influenţa unui solvent în
continuă curgere. Moleculele de solut care sunt mai mari decât porii nu vor putea pătrunde în
interiorul sferelor de gel din cauza împiedicărilor sterice datorate dimensiunii acestora în
comparaţie cu spaţiul din interiorul sferelor. Volumul coloanei care este accesibil moleculelor foarte
mari este astfel semnificativ redus. Ca rezultat, ele nu vor fi încetinite în curgerea lor prin coloană şi
vor fi eluate astfel ca o singură bandă (zonă). Moleculele mici sunt capabile să difuzeze în şi în
afara sferelor de gel, fiind necesare volume mai mari de solvent pentru a fi eluate, astfel ele
staţionând un timp îndelungat în interiorul sferelor, în consecinţă fiind întârziată eluţia lor din
coloană. Moleculele cu dimensiuni intermediare migrează prin coloană cu viteză cuprinsă între cea
a moleculelor mari şi cele mici. Astfel, ordinea de eluţie a diverselor molecule de solut este
oarecum în relaţie directă cu dimensiunile lor moleculare.
Tipul de suport cromatografic Mărimea pariculei, Domeniul de limită al Limita de excluziune a masei
μm porilor, Å moleculare
Dextranul este un polizaharid compus din resturi de glucoză legate prin legături (α-1 -6) şi
legături α-1,3 care conferă legături ramificate. El este biosintetizat de către o enzimă produsă de
către bacteria Leuconostoc mesenteroides, tulpina B-512F. Dextranul este reticulat la multiplele
sale extremităţi printr-o reacţie cu epiclorhidrină, ceea ce conduce la obţinerea unor sfere de gel cu
porozităţi diferite.
Numărul dat fiecărui tip de gel se referă la capacitatea de îmbibare cu soluţie apoasă (water
regain) multiplicată cu 10. Sephadex-ul este oferit în diverse mărimi ale particulelor denumite
coarse, medium, fine şi superfine. Gelurile pe bază de dextran nu pot fi preparate decât pentru
limite de excluziune mai mici de 600000 daltoni, deoarece mica reticulare existentă în structura lor
nu este suficientă pentru a preveni colapsul particulelor. În schimb, prin reticularea dextranului cu
NN'- metilen bisacrilamidă, este posibilă utilizarea acestor geluri la fracţionări cu domenii mai mari.
Aceste geluri sunt denumite Sephacryl.
Gelurile pe bază de poliacrilamidă sunt produse prin copolimerizarea acrilamidei cu NN'-
metilen bisacrilamidă, ultimul fiind şi agent de reticulare. Denumirea comercială a acestor geluri
este Bio-Gel P. Mediile pe bază de Bio-Gel sunt media sunt disponibile în 10 limite de excluziune,
în domeniul 1800 la 400000 daltoni.
Gelurile pe bază de agaroză prezintă avantajul unor deosebit de mari limite de excluziune.
Agaroza, componentul polizaharidic neutru al agarului, este compusă din unităţi alternative de
galactoză şi anhidro-galactoză (Figura următoare).
Agaroza este un material gelificant a căror mărime a porilor este mai mare
decât cei ai dextranului reticulat ori ai poliacrilamidei. Agaroza este un polizaharid
neutru, fracţie de agar.
Ea este compusă din polimer linear de D-galactopiranoză legate β-1→4 la 3,6
anhidro-L-galactopiranoză, care este legată α -1→3. În condiţiile în care
polizaharidul este dizolvat prin fierbere şi apoi este răcit, el formează legături de
hidrogen inter- şi intramoleculare. Mărimea porilor este controlată prin
concentraţia de agaroză. Structura gelului este stabilizată mai mult prin legături de
hidrogen decât prin legături încrucişate covalente.
Gelurile pe bază de agaroză sunt furnizate sub denumirea comercială de Bio-Gel A şi Sepharose
ori Superose. Sepharose CL este o Sepharose reticulată prin reacţia dextranului cu 2,3-
dibromopropanol în condiţii alcaline, ceea ce conduce la obţinerea unui gel de agaroză cu o stabilitate
termică şi chimică crescută.
Un pas înainte în tehnologia de gel filtrare s-a realizat în momentul introducerii gelurilor
compozite, prin grefarea unui polimer secundar pe un suport de gel preformat, precum de
exemplu Sephacryl (figura de mai jos), unde reticularea se realizează între alil dextran şi N,N'-
metilen bisacrilamidă ori mai recent, Superdex.
Selecţia corectă a gelului suport reprezintă o etapă critică în succesul unei separări gel
cromatografice. Cele mai multe experimente de excluziune moleculară pot fi clasificate în separări de grup
şi în fracţionări de înaltă rezoluţie.
Separările de grup pot fi divizate, funcţie de solut, în două grupe: fracţionări se soluţi cu masă
moleculară relativ mică şi fracţionări se soluţi cu masă moleculară relativ mare. Exemplele specifice ale
acestora sunt desalifierea soluţiilor de proteine sau îndepărtarea unor molecule mici de contaminanţi din
extracte de proteine sau acizi nucleici. Pentru separările de grup, gelul trebuie ales astfel încât sî conducă
la o excluziune completă a moleculelor cu masă moleculară mare în void volume. În acest scop sunt
recomandate Sephadex G-25, Bio-Gel P-6, şi Sephacryl S-100HR pentru cele mai multe separări de grup.
Mărimea recomandată a particulelor este de 100 - 200 mesh ori particule cu un diametru de 50 - 150 μm.
Fracţionarea implică separarea gupelor de soluţi cu mase moleculare similare dintr-un amestec
multicomponent. În acest caz, gel trebuie ales astfel ca domeniul de fracţionare să includă masele
moleculare dorite a se separa din solut. Dacă amestecul de solut conţine macromolecule cu mase
moleculare de până la 120000, cele mai potrivite suporturi cromatografice sunt Bio-Gel P- 150, Sephacryl
S-200 HR ori Sephadex G-150. În cazul utilizării Bio-Gel P-100, Sephadex G- 100 sau Sephacryl S- 100
HR o serie de proteine din probă cu masă moleculară mai mare vor elua în void volume. Pe de altă parte,
dacă se utilizează dacă se utilizează Bio-Gel P-200, Bio-Gel P-300 ori Sephadex G-200 acestea vor
scădea atât rezoluţia cât şi viteza de curgere. În cazul în care domeniul de masă moleculară a amestecului
de solut este necunoscut, este necesară o selecţie empirică a suportului cromatografic. În cazul celor mai
multe fracţionări se recomandă utilizarea suporturilor cromatografice de 100-200 ori 200-400 mesh (20-80
μm ori 10-40 μm). În cazul gelurile celor mai fine este recomandabil a se selecta o viteză de curgere
optimă. Pentru separări critice, gradele superfine oferă cea mai bună rezoluţie dar vitezele de curgere sunt
foarte scăzute.
APLICAŢII ALE CROMATOGRAFIEI DE EXCLUZIUNE MOLECULARĂ
Pentru a obţine cele mai corecte valori ale RF, este nevoie de o precizie mare şi o mare
reproductibilitate. Cei mai importanţi factori de care depinde exactitatea (determinare magnitudinii
RF), includ grosimea stratului de suport, deci a fazei staţionare, contaminarea (conţinutul în umiditate)
a fazelor mobilă şi staţionară, temperatura, gradul de saturaţie a camerei de developare cu vapori de
fază mobilă ori mărimea probei. Un control complet al acestor factori variabili nu sunt în general
controlabili în condiţii practice. Ameliorarea parţială a acestor efecte poate fi deseori realizată totuşi
prin substituirea cu un factor relativ de retenţie RX a factorului de retardare, RF care reprezintă
raportul dintre distanţa parcursă de analit şi distanţa parcursă de o substanţă standard.
Mecanismul retenţiei de proteine prin RPC. Proteinele pătrund în coloană şi sunt adsorbite la
suprafaţa hidrofobă. Datorită mărimii lor, numai o porţiune a acestor proteine „braţul
hidrofob” se leagă la adsorbent. La adăugarea unor concentraţii precise de solvent organic
proteinele sunt eliberate şi părăsesc suprafaţa coborând de-a lungul colonei.
În momentul injectării pe coloană, polipeptidele se leagă la suprafaţa
adsorbentului şi se desorb numai când solventul organic atinge o concentraţie
specifică şi unică. Odată desorbite, ele vor interacţiona foarte slab cu suprafaţa
adsorbentului fiind astfel eluate le-a lungul coloanei. Polipeptidele pot fi
imaginate ca o „aluviune” pe faza staţionară, cu cea mai mare parte a moleculei
expusă la faza mobilă şi numai o parte a moleculei, denumită picior hidrofob, în
contact cu suprafaţa de fază inversă.
Diferenţele în „braţul hidrofob” al polipeptidelor rezultă din secvenţa de
amioacizi şi din diferenţele de conformaţie (fenomen discutat în cazul
hidrofobicităţii proteinelor). Desorbţia are loc într-o fereastră îngustă de
concentraţie al unui modificator organic. Astfel, retenţia polipeptidelor este
completă până la atingerea unei concentraţii critice de modificator organic când
acestea sunt rapid desorbite. Sensibilitatea desorbţiei unui polipeptid la o
concentraţie precisă de modificator organic conduce la selectivitatea RPC în
separarea polipeptidelor, în peak-uri în general înguste. Peptidele mici se
desorb mai rapid odată cu schimbarea concentraţiei de modificator organic
decât moleculele mici, totuşi, ele se desorb mai gradual decît proteinele ceea
ce sugerează un mecanism hibrid de separare.
CROMATOGRAFIA CU PERECHI DE IONI
Tipul fazei
Proba Faza mobilă Contraion
staţionare
Amine HClO4, 0,1 M /H2O/acetonitril CIO4- FLa
H2O/CH3OH/H2SO4 C12H25SO3- FL
Acizi carboxilici pH 7,4 (C4H9)4N+ FL
pH 7,4 (C4H9)4N+ Lb
Tehnica cromatografie de adsorbţie este cea mai fezabilă pentru compuşi nepolari
care posedă mase moleculare mai mici de 5000.
Cu toate că există o suprapunere între cromatografia de adsorbţie şi cea de
partiţie, metodele tind a fi complementare.
O aplicaţie caracteristică a
cromatografiei de adsorbţie în
separarea cis- şi trans-pirazolinelor.
Coloană: 100 x 0.3 cm, suport silice
peliculară. Fază mobilă: clorură de
metilen/izooctan 50%. Temperatura:
ambiantă. Viteză de curgere: 0,225
mL/min. Detector: UV, 254 nm.
CROMATOGRAFIA PE HIDROXIAPATITĂ
În general, HAP este realizată prin eluţie în gradient linear (deseori creat în
domeniul 10 până la 400 mM) tampon fosfat, la un de pH 6,8, alcătuit din
amestecuri echimoleculare de fosfaţi sodiu ori potasiu mono şi dibazici.
Deoarece hidroxiapatita este stabilă numai la valori ale pH-ului mai mari de 5,
tampoanele de eluţie cu pH acid nu trebuiesc să fie utilizate.
APLICAŢII ALE CROMATOGRAFIEI PE HIDROXIAPATITĂ
Purificarea ovomucoidului
comercial pe o coloană de
hidroxiapatită. Treapta I conţine
material inactiv cu un maximum de
absorbţie la 260 nm; pe parcursul
treptei a II a se separă ovomucoidul
în formă activă; volumul III conţine
lizozim; ulima treaptă - IV conduce
la separarea unor impurităţi, de
tipul tripsinei şi chimotripsinei.
Ovomucoidul comercial conţine o multitudine de impurităţi precum
lizozim, ovoinhibitor, conalbumină şi ovalbumină. Profilul cromatografic din
figură arată că la aplicarea a două probe de ovomucoid la o coloană de
HAP echilibrată cu 0,001 M NaCl, spălarea coloanei cu NaCl 0,001 M,
urmată de eluţia în trepte cu 0.01 M PO4, pH 6,8 (pentru a elua
ovomucoidul, o glicoproteină cu o structură deschisă), 0;5 M NaCl (pentru a
elua proteinele bazice precum lizozimul şi ovoinhibitororul) şi 0,5 M PO4
(pentru a epuiza coloana de alte proteine acide) conduce la obţinerea
ovomucoidului într-o formă înalt purificată.
(M)atrice-O-CH2-CH2-SO2-CH2-CH2-X-Y
unde M reprezintă matricea de agaroză iar X reprezintă S, N ori O, iar Y este un rest
mic, alifatic, sau un heteroatom
Principiul operaţional care stă la baza cromatografiei de adsorbţie tiofilică se
aseamănă cu cel al cromatografiei de interacţie hidrofobă. Astfel, proteinele sunt legate
la tării ionice mari şi eliberate în urma scăderii tăriei ionice. Faţă de matricele tradiţionale
hidrofobe precum fenil-Sepharose sau octil-Sepharose, matricele tiofilice conduc la
randamente înalte de separare cât şi la separări în zone înguste, având drept
caracteristică o afinitate înaltă faţă de imunoglobulinee şi scăzută faţă de
albumine.
În mod similar, un schimbător bazic puternic interacţionează cu un anion Ax- după reacţia:
+ x-
xRN(CH3)OH + Ax- [RH(CH3) 3]x A + xOH
solid solutie solid solutie
Ca un exemplu de aplicare a legii masei la un echilibru de schimb ionic, se consideră pe
coloană are loc o reacţie între un ion monovalent, B+ cu o grupare acid-sulfonică prezentă pe
suportul cromatografic. Din considerente de neutralizare, retenţia iniţială a ionilor B+ se realizează
la capătul superior al coloanei după reacţia:
unde (s) şi (aq) delimitează faptul că sistemul conţine o fază solidă, respectiv apoasă. Eluţia
cu o soluţie diluată de acid clorhidric, de exemplu, modifică echilibrul din ecuaţia 1 în partea
stângă, ceea ce conduce la transferul parţial a ionilor B+ din faza staţionară în faza mobilă. Aceşti
ioni coboară apoi de-a lungul coloanei printr-o serie de transferuri între fazele staţionară şi mobilă.
Constanta de echilibru Kex, pentru reacţia de schimb prezentată în ecuaţia 1 ia forma:
unde [RSO3B+]s şi [RSO3H+]s
reprezintă concentraţiile (strict sub
formă de activităţi) ale ionilor B+ şi H+
După rearanjare rezultă: în faza solidă.
În timpul eluţiei, concentraţia ionilor de hidrogen din faza apoasă este mult mai mare decât
concentraţia ionilor de compus B, monovalent din faza mobilă. Pe lângă aceasta, schimbătorul
posedă un număr enorm de situsuri de schimb ionic comparativ cu numărul de ioni B+ ce pot fi
reţinuţi. Astfel, concentraţia totală a ionilor, [H+]aq şi [RSO-3H+]s nu este afectată de schimburile din
ecuaţia 1 ce descrie reacţia globală. Pentru acest motiv, în condiţiile în care [RSO-3H+]s >> [B+]aq
termenii din dreapta ecuaţiei 3 sunt în mod substanţial constanţi şi astfel se poate scrie:
unde K reprezintă constanta ce corespunde
constantei de distribuţie descrisă anterior. Astfel,
toate ecuaţiile descrise în tratarea teoretică din
primul capitol pot fi aplicate cu succes.
Se poate nota că Kex din ecuaţia 2 reprezintă afinitatea răşinii pentru ionul B+ comparativ cu un
alt ion (în cazul de faţă, H+). În condiţiile în care Kex este mare, se poate spune că există o
puternică tendinţă a fazei solide de a reţine B+; în cazul în care Kex este mică, efectul este diametral
opus. Prin selecţia unui ion comun de referinţă precum H+, se pot compara experimental rapoartele
de distribuţie pentru diverşi ioni pe un tip dat de răşină schimbătoare de ioni. Experimentele relevă
că ionii polivalenţi sunt mai puternic legaţi decât speciile cu o singură sarcină electrică. Pentru un
număr de sarcini date, totuşi, apar diferenţe care sunt legate de mărimea ionului hidratat precum şi
de alte proprietăţi. Astfel, pentru o răşină schimbătoare de ioni sulfonată, clasică, obişnuită, valorile
Kex scad în ordinea: Tl+ > Ag+ > Cs+ > Rb+ > K+ > NH4+ > Na+ > H+ > Li+. Pentru cationii divalenţi,
ordinea este: Ba2+ > Pb2+ > Sr2+ > Ca2+ > Ni2+ > Cd2+ > Cu2+ > Co2+ > Zn2+ > Mg2+ > UO22+.
În cazul anionilor, Kex pentru o răşină bazică scade în ordinea: SO42-> C2O4- > I- > NO3- > Br- >
Cl- > HCO2- > CH3COO- > OH- > F-. Această serie este oarecum dependentă de tipul de răşină şi
de condiţiile de reacţie, putând fi considerată numai aproximativă.
Prima etapă o reprezintă echilibrarea în care schimbătorul de ioni este adus în starea de start
în termeni de pH şi tărie ionică, stare ce va permite legarea moleculelor de solut. Grupările
schimbătoare de ioni sunt asociate în acest moment cu contraionii de schimb (uzual anioni ori
cationi simplii, precum ionii clorură sau de sodiu).
Cea de a doua etapă o reprezintă aplicarea şi adsorbţia probei, în care moleculele de solut
care posedă sarcini corespunzătoare, ajung şi dislocuie contraionul, legându-se reversibil la suport.
Substanţele nelegate vor fi eluate de pe schimbător utilizând acelaşi tampon de start.
În etapa a treia, substanţele sunt îndepărtate de pe coloană prin schimbarea condiţiilor de
eluţie nefavorabile pentru legarea ionică a moleculelor de solut.
Această eluţie implică în mod normal creşterea tăriei ionice a tamponului de eluţie sau
schimbarea pH-ului acestuia. În figura de mai sus, desorbţia se realizează prin introducerea unui
gradient crescător de sare, ceea ce conduce la eliberarea moleculelor de solut de pe coloană în
ordinea tăriei legării lor, substanţele cele mai slab legate eluând primele.
Etapele a patra şi a cincea sunt cele de îndepărtare de pe coloană a substanţelor care nu au
fost eluate în condiţiile experimentale anterioare şi de reechilibrare a coloanei pentru un nou proces
de purificare.
Separarea este astfel obţinută datorită diferenţelor
de interacții dintre un schimbător de ion cu molecule cu
densităţi diferite de sarcină şi de distribuţie a acestora pe
suprafaţa lor. Figura alăturată prezintă schematic modul
de legare a unor molecule cu sarcini diferite. Aceste
interacţii pot fi controlate prin variaţia condiţiilor precum
tăria ionică ori a pH-ului. Diferenţele în proprietăţilor
electrice ale compuşilor biologici sunt deseori
considerabile, din această cauză cromatografia de
schimb ionic este capabilă să separe specii cu foarte
mici diferenţe în proprietăţi, de exemplu două proteine
care diferă numai printr-un aminoacid ionizabil, motiv
pentru care această tehnică este deosebit de importantă
în analiza biochimică.
Tehnica de adsorbţie precum cea de cromatografie de schimb ionic oferă factori mari de
capacitate după cum condiţiile experimentale pot fi alese astfel încât să conducă la volume de
retenţie a peak-ului mari în exces a Vt, opus tehnicii de gel filtrare unde capacitatea este limitată
deoarece toate peak-urile trebuiesc eluate cu un volum egal cu (Vt - V0).
Capacitatea unui schimbător de ioni este o măsură cantitativă a abilităţii sale de a
îmbunătăţi schimbul de contraioni, din această cauză fiind un parametru deosebit de important.
Capacitatea poate fi exprimată ca şi capacitate ionică totală, capacitate disponibilă sau capacitate
dinamică.
Capacitatea ionică totală reprezintă numărul de grupări încărcate electric substituite per gram
de schimbător uscat ori per gram de schimbător îmbibat. Capacitatea ionică totală poate fi
măsurată prin titrare cu un acid sau o bază puternică.
Cantitatea totală de proteină care poate fi legată la un schimbător de ioni, în condiţii
experimentale definite, determină capacitatea disponibilă pentru gel. Dacă condiţiile definite includ
şi viteza de curgere la care gelul operează, cantitatea legată se referă la capacitatea dinamică
pentru schimbătorul de ioni. Capacitatea disponibilă şi cea dinamică depind de:
proprietăţile proteinei;
proprietăţile schimbătorului de ioni;
condiţiile experimentale alese;
DEAE şi CM Sepharose CL-6B sunt disponibile sub formă preînmuiată, putând fii
utilizate imdeiat pentru încărcare (împachetare) pe coloană. În privinţa capacitatăţii, se
poate spune că deoarece DEAE şi CM Sepharose CL-6B sunt schimbători de ioni slabi,
numărul de grupări ionice legate care sunt schimbate şi deci capacitatea pentru
macromolecule este dependentă de pH. Această dependenţă se ilustrează cu ajutorul
curbelor de titrare. Domeniul de pH la care se lucrează cu DEAE Sepharose CL-6B este de
2-9 în timp ce pentru CM Sepharose CL-6B este de 6-10.
SELECŢIA GRUPĂRII SCHIMBĂTOARE DE IONI
În selecţia suportului cromatografic trebuie avut în vedere că nu există un singur schimbător de ioni perfect
pentru oricare separare. Alegerea matrix-ului şi a grupării ionice substituite depinde de:
• necesităţile specifice aplicaţiei;
• mărimea moleculară a componentelor probei;
• punctul izoelectric al componentelor probei.
Substanţele se leagă la schimbătorul de ioni în momentul în care posedă o sarcină opusă celei prezentate
de suportul cromatografic. Această legare este electrostatică şi reversibilă.
În cazul în care substanţele ce doresc a fi separate posedă numai un tip de sarcini electrice, alegerea
schimbătorului este clară. În condiţiile separării unor substanţe cu încărcătură mixtă, ce prezintă sarcini atât
pozitive cât şi negative, substanţe denumite amfotere, sarcina netă va depinde de pH. În consecinţă la o anumită
valoare a pH-ului, o substanţă amfoteră va avea o sarcină netă egală cu zero. Această valoare este denumită
punct izoelectric (pI) şi în acel punct substanţele nu se vor lega nici de schimbătorul anionic nici de cel cationic,
după cum se observă schematizat în figura de mai jos.
Secvenţa de baze complementară, histone, polimeraza acidului
Acid nucleic
nucleic, proteina de legare a acidului nucleic.
Hormon,
Receptor, proteină transportoare (carrier)
vitamină
Glutation Glutation-S-transferază ori proteine de fuziune GST
Proteine de fuziune poli (His), proteine native cu histidină,
Ioni metalici
cisteină şi/sau resturi de triptofan pe suprafaţa lor.
O reprezentare schematică a unui proces de separare prin cromatografie de afinitate
La mijlocul anilor „70, echipa de cercetători condusă de Porath a introdus un nou tip de
cromatografie ce a fost atunci denumită iniţial “cromatografie cu metal chelat”, după care s-a
redenumit “cromatografie de afinitate (adsorbţie) cu metal (ion) imobilizat” (immobilized metal
affinity chromatography, IMAC). Tehnica se bazează pe diferenţele de afinitate ale proteinelor
faţă de ioni metalici legaţi de substanţe ce au proprietăţi chelatoare, care sunt imobilizate pe
un suport (răşină) cromatografic.
Cu toate că bazele acestei metode nu au fost noi, Porath şi colaboratorii s-au focusat pe
utilizarea acestei noi tehnici în separarea proteinelor. Această caracteristică de “bio-afinitate”
a captat atenţia biochimiştilor, chimiştilor şi biologilor care au utilizat IMAC şi au descoperit
noi valenţe în aplicații particulare a metodei.
Cea mai cunoscută îmbunătăţire o reprezintă aplicaţiile ce utilizează o “coadă” (tag) de
poli-histidină la separarea polipeptidelor recombinante care consistă din inserţia unei
secvenţe terminale de resturi histidinice atât la capătul N- ori la cel C-terminal al proteinei ori
al peptidei. Utilizarea unor astfel de histidine sau a altor secvenţe ce posedă afinitate pentru
metale în IMAC a dovedit a reprezenta o metodă deosebit de utilă în recuperarea proteinelor,
în special în condiţiile în care se urmăreşte o producţie mare şi a unui randament crescut de
proteine. În consecinţă, IMAC a apărut drept o metodă majoră utilizată în purificarea
proteinelor, pornind din faza de laborator până la cea de pilot ori industrială.
Au fost publicate o multitudine de studii referitoare la IMAC, unele dintre ele prezentând
noi aplicaţii ale metodei ori de introducere a unor noi posibile arii de utilizare, în care această
tehnică poate fi exploatată.
Interacţiile dintre
resturile învecinate ale
secvenţei hexa-
histidinice şi matricea
Ni-NitriloTetraAcetat.
Utilizarea diferenţelor de afinitate în interacţia proteină – ion metalic
Reprezentarea schematică a
mecanismelor implicate în
adsorbția şi desorbția
proteinelor în cromatografia
de afinitate cu metal (ion)
imobilizat (IMAC). Se prezintă
interacţiile specifice ce se
stabilesc între ionul de metal
chelator, suportul chelator şi
secvenţa polihistidinică.
În condiţiile în care ionii metalici sunt adăugaţi (încărcaţi), chelatorii multidentaţi şi ionii metalici
formează complexe în care ionii metalici sunt fixaţi pentru interacţia următoare cu compuşii ce
trebuie să fie rezolvaţi. La sfârşitul acestei etape, ionii metalici aflaţi în complexe trebuie să posede
situsuri de coordinaţie libere la care se vor lega solventul ori moleculele de solut după interacţia
dintre proteine şi ionii metalici, proteinele legate pot fi eliberate prin utilizarea unui dezlocuitor
(precum imidazolul).
Diferenţele în afinităţi ale proteinelor pentru un metal pot fi explicate, cel puţin în parte, pe
baza principiului acizilor ori bazelor tari sau slabe, descrise de către Pearson. În această teorie
se statuează că dacă doi atomi formează o legătură, un atom acţionează ca un acid Lewis iar
cel de al doilea atom ca o bază Lewis. Tăria legăturii este guvernată de valorile intrinseci “tari”
ori “slabe” ai atomilor implicaţi. Teoria acizilor tari sau slabi ori a bazelor tari şi slabe dictează că
legăturile dintre atomi cu o poziţie similară, de exemplu un acid tare combinat cu o bază tare
sunt cele mai puternice. Urmând conceptul de mai sus, ionii metalici precum K+, Ca+2, Mg+2 şi
Fe +3 sunt clasificaţi drept acizi Lewis tari, în timp ce ionii monovalenţi ai metalelor precum Ag+ şi
Cu+ sunt categorisiţi drept acizi Lewis slabi. Ionii metalelor tranziţionale de tipul, Co+2, Zn+2, Cu+2
şi Ni+2, sunt consideraţi acizi “de limită”. Aceşti ioni metalici sunt cel mai adesea utilizaţi în
IMAC, în particular Ni(II), care conferă la un număr de coordinaţie egal cu şase, posedă o
stabilitate electrochimică în condiţii cromatografice, o polarizabilitate limită şi o
stabilitate redox. Ionii metalici chelatori manifestă variaţii în afinitate faţă de proteine, care
poate fi precizată prin utilizarea teoriei descrise de Pearson.
Această teorie a acizilor şi bazelor tari şi slabi postulează că există trei tipuri majori de
liganzi. Acei liganzi care conţin oxigen (de exemplu carboxilat), azot alifatic (precum asparagina
şi glutamina) şi fosfor (de exemplu aminoacizi fosforilaţi) sunt clasificaţi drept baze Lewis tari.
Liganzii care conţin sulf (de exemplu cisteina) sunt clasificaţi drept baze slabe, acei care conţin
azot aromatic (de exemplu histidina şi triptofanul) sunt consideraţi baze de limită. Acizii aflaţi la
limită şi care conţin Co+2, Zn+2, Cu+2 şi Ni+2, coordinează în mod favorabil cu atomii de azot
aromatici (baze la limită) şi de asemenea cu atomii de sulf (baze slabe).
În interacţiile dintre ionii de Cu(II), Ni(II), Co(II) ori Zn(II) imobilizaţi şi resturile de
aminoacizi de pe suprafaţa proteinei, grupările funcţionale imidazolil, tiol şi indolil sunt
principalele ţinte pentru ionii metalici. Grupările funcţionale carboxil şi fosfat sunt
principalele ţinte pentru ionii metalici tari precum Fe(III) şi Mg(II). Un concept acceptat
este acela al distribuţiei spaţiale a resturilor de histidină pe întreaga suprafaţă a unei
proteine în timp ce accesibilitatea acestora va influenţa caracteristicile de retenţie ale
moleculei proteice. Au fost descrise în literatura de specialitate o serie de peptide cu
mare afinitate pentru metal după cum s-au prezentat motife din structura proteică de
legare a metalului neînvecinate precum cele găsite în prolactină sau în hormonul de
creştere. Este de remarcat că existenţa unui motif de legare al metalului nu este
întotdeauna garanţia pentru succesul IMAC, după cum există un număr de enzime cu
afinitate pentru metal care se leagă la matrix-ul chelator prin intermediul unui situs care
nu este cel catalitic de legare a metalului. O serie de secţiuni de legare a metalului la
proteină, chiar dacă sunt expuse, pot contribui foarte puţin la tăria netă a retenţiei a
proteinei în IMAC.
Chelatori de metale şi matrix-uri polimerice de chelare
Majoritatea grupărilor chelatoare utilizate în IMAC sunt compuşi chelatori multidentaţi ce
furnizează tăria complexului format de către proteină, ion metalic şi gruparea chelatoare. Aceste
substanţe chelatoare sunt ataşate pe o suprafaţă de sorbent prin intermediul unor grupări de legare
(braţe, spacere) care pot varia în lungime ori în compoziţie. Structura finală formată după ce ionul
metalic este chelatat de către gruparea chelatoare trebuie să permită o oarecare libertate situsurilor
de coordinaţie în ion metalic pentru adsorbţia ori legarea proteinelor și a moleculelor de solvent.
Diferenţele în numărul de situsuri de coordinaţie libere poate explica în parte de ce o serie de
substanţe chelatoare (acidul iminodiacetic, IDA; acidul nitrilotriacetic, NTA, etc.) prezintă
selectivităţi diferite şi activităţi de adsorbţie faţă de proteina ţintă, dată. În tridentatul IDA, metalul se
va lega la atomul de azot şi de doi atomi de oxigen din grupările carboxilat, lăsând trei situsuri
libere pentru molecula de proteină ori solvent (în condiţiile utilizării Ni+2 ca metal chelator, acesta
putând da o tărie metal-chelatoare superioară, dar pe de altă parte, o slăbire a puterii de reţinere a
proteinei. O altă însuşire a chelatorului ar fi reprezentată de o scădere a riscului de scurgere
(pierdere) a metalului chelat. Figura de mai jos arată un model al celor mai comuni şi utilizaţi
chelatori, IDA şi NTA legaţi la atomii de Ni.
O multitudine de studii indică histidina drept aminoacidul care posedă cea mai puternică
afinitate pentru ionii metalici. Este general acceptat că histidina, asemeni resturilor de triptofan şi
cisteină ca rezultat al interacţiilor puternice cu ionii metalici sunt compuşii cheie în legarea
proteinelor în IMAC. Aceşti trei aminoacizi au cele mai mari retenţii, comparativ de exemplu, cu
resturile glutamat şi aspartat, care esenţial nu prezintă nici o retenţie. Studiile efectuate au corelat
retenţiile unui mare număr de peptide sintetice ori biologic active pe Ni(II), Zn(II) şi Cu(II) chelaţi pe
IDA, cu profilurile lor în aminoacizi în scopul de a evalua proprietăţile de adsorbţie ale aminoacizilor
implicaţi în retenţia peptidelor. Alte investigaţii au relevat că proprietatea de retenţie a unor proteine
este în mare parte guvernată de resturile de histidină expuse pe suprafaţa proteinei.
Cisteina prezintă de asemenea o afinitate puternică faţă de metal, deşi oarecum mai scăzută decât
histidina. Afinitatea pentru metal a acestor doi aminoacizi poate fi atribuită în general grupărilor lor
funcţionale, în particular a grupărilor imidazol şi tiol, ale histidinei respectiv cisteinei. În cazul
histidinei, alte grupări funcţionale precum grupările carboxil şi amino, joacă de asemenea un rol în
procesul de legare la metal. Alţi aminoacizi care pot să posede o afinitate substanţială faţă de metal sunt
triptofanul, fenilalanina şi tirozina care acţionează direct prin intermediul catenelor lor aromatice, în timp
ce arginina, lizina, asparagina, glutamina şi metionina, acţionează indirect prin efecte individuale sau
combinate pe accesibilitatea histidinei. Cu toate că retenţia proteinelor ori a peptidelor este în mod primar
(cauzal) dată de afinitatea faţă de metal a aminoacizilor constituenţi, alţi factori pot contribui profund
alături de afinitatea faţă de metal, factori ce includ secvenţa în aminoacizi (poziţia aminoacizilor în
catenă, structura primară), plierea proteinei ori proprietăţile suprafeţei acestora. Se poate spune faptul
că aceste caracteristici de retenţie ale proteinelor în IMAC nu este uşor de precizat.
În interacţiile dintre ionii de Cu(II), Ni(II), Co(II) ori Zn(II) imobilizaţi şi
resturile de aminoacizi de pe suprafaţa proteinei, grupările funcţionale
imidazolil, tiol şi indolil sunt principalele ţinte pentru ionii metalici. Grupările
funcţionale carboxil şi fosfat sunt principalele ţinte pentru ionii metalici tari
precum Fe(III) şi Mg(II).
Un concept acceptat este acela al distribuţiei spaţiale a resturilor de
histidină pe întreaga suprafaţă a unei proteine în timp ce accesibilitatea
acestora va influenţa caracteristicile de retenţie ale moleculei proteice. Au
fost descrise în literatura de specialitate o serie de peptide cu mare afinitate
pentru metal după cum s-au prezentat motife din structura proteică de legare
a metalului neînvecinate precum cele găsite în prolactină sau în hormonul de
creştere. Este de remarcat că existenţa unui motif de legare a metalului nu
este întotdeauna garanţia pentru succesul IMAC, după cum există un număr
de enzime cu afinitate pentru metal care se leagă la matrix-ul chelator prin
intermediul unui situs care nu este cel catalitic de legare a metalului. O serie
de secţiuni de legare a metalului la proteină, chiar dacă sunt expuse, pot
contribui foarte puţin la tăria netă a retenţiei a proteinei în IMAC.
Chelatori de metale şi matrix-uri polimerice de chelare
Interacţii gazdă-macromoleculă în
Ciclodextrine, eteri coroană şi polimeri legaţi.
interiorul unei cavităţi chirale
Se mai poate nota că numărul de proteine care pot fi utilizate drept selectori chirali
imobilizaţi în electroforeza capilară ori în alte tehnici înrudite este mult mai mic decât cel utilizat
în cromatografia lichidă. Au fost descrise separări chirale prin electrocromatografie în tuburi
deschise capilare (open tubular capillary electrochromatography, OTCEC) cu proteine adsorbite
pe perete (lizozim, avidină, albumina serică bovină - BSA, orosomucoid, albumina serică umană
- HSA) ca faze staţionare. În paralel la aceste studii au fost testate reţele de BSA–dextran şi
geluri reticulate de BSA şi celobiohidrolază I în geluri de electroforeză de afinitate.
În concluzie, aceste faze staţionare se realizează din proteine naturale legate la matricea
de silice. Caracteristica de bază o reprezintă faptul că aceste proteine conţin un mare număr de
centrii chirali recunoscuţi a reacţiona puternic cu analiţii mici manifestând o selectivitate chirală
puternică. S-au evidenţiat situsuri interactive specifice care conduc la selectivitatea chirală, dar,
sunt prezente mult mai multe situsuri ce numai contribuie la retenţia generală. Aceste alte
situsuri pot fi dezactivate de către aditivii prezenţi în faza mobilă (de exemplu octilamina) care
reduc astfel retenţia generală dar cresc selectivitatea chirală.
Cel de al doilea tip se bazează pe interacţii chirale între solut şi polimeri naturali şi a fost
dezvoltă de către Okamato şi colaboratorii ce au descris în anul 1987 prima preparare de
suport chiral la care polizaharidele au fost legate de gelul de matricea solidă activată cu γ –
amino-propil-silice. Metoda de fixare constă din utilizarea diizocianatului.
•Forța de frecare Stokes (F2), egală cu produsul dintre coeficientul de vâscozitate a mediului (η), raza
particulei (r) și viteza electroforetică, v după relația:
F2= 6πηrv
•Forța de frânare electroforetică (F3) rezultată ca urmare a atracției exercitate de câmpul electric asupra
ionilor electrolitului (soluția tampon în care se deplasează particula) conform relației:
F3= (Q - ε• ξ•r)•E
reprezintă sarcina electrică a particulei;
unde Q
ε este constanta dielectrică a mediului;
ξ reprezintă potențialul zeta;
r este raza particulei;
E reprezintă intensitatea câmpului electric aplicat.
Forța datorată efectului de frânare (F4), forță care apare din cauza redistribuirii ionilor electrolitului în
apropierea particulei, sub acțiunea unui câmp electric uniform.
Imediat după aplicarea unui câmp electric , suma vectorială a celor patru forțe devine
egală cu zero, iar viteza electroforetică devine constantă:
Pentru electroforeza în medii stabilizate (gel de amidon, poliacrilamidă, etc.) F3 și F4 sunt practic
neglijabile, astfel încât forței de atracție electroforetice (F1) se opune forța de frecare Stokes (F2):
La temperatura camerei,
pentru n=c (în moli/litru)
adică,
atunci,
unde Δd reprezintă distanța dintre centrele zonelor 1 și 2, iar l1 și l2 sunt lățimile celor
două zone formate de două tipuri de particule.
Drumul parcurs (distanța) în procesul
d = µ•E•t separării electroforetice este
egală cu: d = v•t
unde v reprezintă viteza electroforetică iar t
este timpul de migrare
Din relația mobilității, µ=V/E se deduce viteza electroforetică, v=µ•E, iar drumul
parcurs de o particulă în funcție de mobilitatea sa este dat de relația:
unde i = 1,2,....n
µ
În calculul forței ionice a unei soluții tampon se consideră că acizii slabi sunt
nedisociați, în schimb sărurile lor sunt complet disociate. Astfel, pentru o soluție
tampon conținând 8,8 g/l acid dietilbarbituric și 10,3 g/l dietilbarbiturat de sodiu,
forța ionică este dată numai din disocierea sării de sodiu și ionul de dietilbarbiturat.
Cum dietilbarbituratul are masa moleculară de 206,18g, 10,3 grame reprezintă 0,05
moli/l, de aici se trage concluzia că tăria ionică (j) este egală cu 0,05M.
Teoretic, mobilitatea electroforetică este invers proporțională cu rădăcina pătrată a
forței ionice:
Există mai multe dificultăţi implicate în separarea electroforetică de celule sau alte bioparticule.
În primul rând, celulele care urmează a fi separate trebuie să fie prezente ca o suspensie
monocelulară. Agregatele de celule sau ansamblurilor lor nu pot fi separate. Astfel, celule
sanguine, limfatice, sau prezente în alte fluide ale corpului pot fi destul de uşor pregătite, în timp
ce celulele din ţesuturi trebuie să fie mai întâi izolate prin dezintegrare mecanică. Multe proceduri
de izolare a celulelor conduc la o deteriorare a acestora prin disrupere și de eliberare a nucleilor
sau a ADN-ului, oferind preparate care nu pot fi utilizate la separarea electroforetică. Distrugerea
celulelor prin simpla dezintegrare mecanică poate fi redusă prin tratarea țesuturilor cu diferite
enzime combinată apoi cu metode mecanice blânde, cum ar fi amestecare ușoară sau aspiraţie
printr-o pipetă gură largă. Această procedură este singura modalitate de a obţine o suspensie
monocelulară din țesuturi precum cel tumoral. Enzimele care s-au dovedit a fi adecvate pentru
obţinerea de suspensii monocelulare din ţesuturi diferite sunt tripsina, chimotripsina, colagenaza,
hialuronidaza şi dispaza. Cu toate acestea, astfel de enzime, de multe ori au dezavantajul de a
cliva o serie de grupări specifice de suprafaţă, modificând sarcina superficială a acestora, care
reprezintă o condiţie prealabilă pentru separarea electroforetică. Acesta este unul dintre
principalele motive pentru care un număr relativ mic de exemple de succes de separare
electroforetică a celulelor ţesutului pot fi găsite în literatura de specialitate.
O abordare diferită, utilizată la pregătirea prealabilă a celulelor, cum ar fi a nefronilor, care
sunt conectați între ei prin intermediul unor complexe juncționale Ca2+-dependente, este de a
trata țesutul cu complexanți slabi ai Ca2+, precum citratul, EDTA sau EGTA, în combinaţie cu
o agitarea blândă. În general, orice nuclei eliberați în timpul procedurii de izolare pot fi
eliminați prin filtrarea suspensiei pe vată de sticlă introdusă într-o pipetă Pasteur. ADN-ul
liber, care poate apărea în cazul în care nucleii sunt dezintegrați, trebuie să fie de asemenea,
eliminați, deoarece, în câmp electric, conduc la agregarea celulară. Un tratament scurt cu DN-
ază ultrapură (20-30µg/ml) la temperatura camerei timp de 5-10 minute este în general
suficientă.
O altă problemă este alegerea mediului de pregătire şi de separare. Cele mai multe dintre
instrumente de electroforeză în flux continuu prezintă sisteme eficiente de răcire care permit a
se crește tăria ionică a mediului de separare până la 8-10 x 102 µohm/cm. Aceasta este încă o
tărie apropiată condiţiilor fiziologice în care se separă celule în stare viabilă. În scopul de a
atenua pierderea viabilității celulelor acestea trebuie să fie colectate în mai multe soluţii
fiziologice, cum ar fi medii de cultură, după ce acestea au fost separate prin camera
electroforetică. Compoziţia cele mai potrivită a tamponului de separare trebuie să fie
identificată pentru fiecare tip de celule.
ELECTROFOREZA FRONTALĂ
PE COLOANA
Utilizarea hârtiei de filtru sau a altor medii suport solide introduc de asemenea o serie de
factori care implică mobilitatea electroforetică a moleculelor încărcate electric,
electroosmoza, curgerea hidrodinamică a lichidului, adsorbția, efecte cromatografice și
de stivuire. Din acest punct de vedere, electroforeza zonală nu poate fi utilizată pentru
determinarea precisă a mobilității electroforetice, a punctului izoelectric sau a altor
proprietăți de migrare a substanțelor fără o procedură de standardizare adecvată pentru
tehnicile particulare. Suportul ideal ar trebui să fie acela care nu prezintă impurități, este
chimic inactiv în ceea ce privește substanțele separate, nu prezintă activitate adsorbtivă
și prezintă cel mai scăzut efect electroosmotic. Nici o hârtie de filtru nu îndeplinește în
totalitate toate aceste condiții. Totuși, noi medii suport au fost introdusă care posedă
proprietăți mult mai favorabile, precum acetatul de celuloză, gelurile de agaroză și de
poliacrilamidă
În prezent se folosesc o varietate de medii suport stabilizante care se pot împărți în:
•Medii suport cu structură capilară, care
(a) prezintă proprietăți anticonvective - dacă secțiunea capilară este suficient de mică (într-un canal cu
secțiune circulară curgerea descrește cu puterea a 4-a a razei);
(b) sunt stabile fizico-chimic;
(c) prezintă proprietăți mecanice bune;
(d) sunt netoxice;
(e) sunt ieftine și astfel accesibile;
(f) sunt relativ inerte – este cazul hârtiei de filtru, a acetatului de celuloză, a mediilor specifice
cromatografiei pe strat subțire (celuloza microcristalină, silicagelul, alumina, silicagelul);
(g) au proprietăți electroforetice specifice bune – nu interacționează decât foarte slab cu compușii pe care
îi separă (excepție face hârtia de filtru la care se observă o adsorbție nespecifică).
În cazul acestor medii suport, proteinele serice se separă în albumină și patru sau mai multe
componente globulinice dar cu o rezoluție inegală, cu o poziție relativă a fracțiunilor (zonelor)
asemănătoare.
•Medii suport care, datorită structurii poroase caracteristice, participă activ în separare. În acest caz
separarea electroforetică are loc atât densității sarcinilor electrice cât și a efectului de cernere
moleculară. Astfel, două particule cu aceeași sarcină electrică dar cu dimensiuni diferite, vor fi separate
ca zone distincte, particulele mai mici migrând mai ușor. De exemplu, dacă prin electroforeză pe hârtie
proteinele serice se separă în fracțiile albumină, α1-, α2-, β- și γ-globuline, după electroforeza pe gel de
amidon se identifică circa 15 zone proteice. Din categoria acestor medii fac parte gelul de amidon, gelul
de agaroză (unde efectul de sită moleculară apare la concentrații mari de gel) și gelul de poliacrilamidă
(care prezintă avantajul de a putea alege dimensiunea porilor).
•Medii afine, pe care le vom examina într-un capitol special.
ELECTROFOREZA PE HÂRTIE
În acest caz, hârtia de filtru reprezintă mediul stabilizant care posedă următoarele caracteristici:
(a) conține minimum 96% celuloză, insolubilă în NaOH concentrat;
(b) prezintă o capacitate mare de imbibiție (absorbție) - mărimea acestei proprietăți este dată de
firma producătoare și trebuie să fie de două ori mai mare decât greutatea sa;
(c) este lipsită de metale grele (de exemplu Pb), care modifică conductibilitatea sa electrică; (are
o structură uniformă a fibrelor de celuloză, unidirecționate;
(d) prezintă o densitate caracteristică a fibrelor - o hârtie de filtru fină sau medie prezintă o
textură deasă care va conduce la separări în zone bine delimitate, dar într-un timp mai mare, în
timp ce o hârtie de filtru grosieră se îmbibă rapid cu cantități mari de tampon iar separările vor
conduce la zone neclare, într-un timp mai scurt;
(e) la un pH acid și la tării ionice scăzute apar fenomene de adsorbție a proteinelor pe suportul de
hârtie de filtru ceea ce va conduce la formarea benzilor cu coadă.
Tamponul, reprezintă de asemenea o componentă importantă în sistemul electroforetic. În cazul
electroforezei pe hârtie, tamponul se află în compartimentul electrozilor, la un nivel egal și
constantă, evitându-se fenomenul de sifonare. Menținerea evaporării tamponului în limite
rezonabile se realizează prin:
(a) scăderea forței ionice, legată de efectul Joule și de efectul de flux capilar;
(b) saturarea compartimentului de separare cu vapori;
(c) adăugarea de propilenglicol sau glicerină (5-15%) în soluția tampon sau
(d) în cazul electroforezei de înaltă tensiune, prin plasarea hârtiei de filtru în solvenți hidrofobi.
Valoarea pI este specifică unei proteine și ea depinde
de natura solventului și de concentrația electrolitului
(a nu se confunda pI cu punctul izotonic, definit ca
valoarea pH-ului unei soluții apoase de proteină după
îndepărtarea tuturor ionilor necoloidali din soluție).
În separarea electroforetică este necesară o conduce
cu mare atenție pH-ul și tăria ionică a soluției tampon.
De obicei tăria ionică a soluției tampon este cuprinsă
între 0,06-0,1. Soluțiile tampon cu o tărie ionică mai
mică de 0,06 nu tamponează suficient în timp ce
soluțiile cu o tărie ionică mai mare de 0,1 conduc la Dependența dintre pH-ul soluției și
sarcina electrică a două polipeptide,
un efect Joule, marcant, ceea ce conduce la o degajare insulina umană și fragmentul
semnificativă de căldură. polipeptidice des-B23-B30-
Echipamentul utilizat în electroforeza pe hârtie octapeptid insulină (DOI).).
consistă din două componente principale: o cameră
(tanc) electroforetic și o sursă de putere electrică.
Tancurile electroforetice sunt variate în construcție și
depind de aranjamentul pe orizontală sau verticală a
benzii de hârtie electroforetică precum și de
necesitățile caracteristice ale unor experimente
particulare.
Tancul electroforetic comun utilizat
la electroforeza pe hârtie de voltaj
scăzut este de două tipuri, după cum
hârtia de filtru este așezată. În tipul
orizontal, hârtia de filtru este fixată
orizontal la capetele incintei. La tipul
vertical, hârtia de filtru este așezată
vertical pe o baghetă. La extremități,
banda de hârtie este imersată în vasele
de tampon la aceeași adâncime în timp
ce nivelul tamponului în cele două
compartimente trebuie să fie egal.
Unele aparate prezintă un sistem
labirint prin care comunică, în condiții
speciale, cele două rezervoare,
prevenindu-se astfel fenomenul de
sifonare prin banda de hârtie în timpul
separării electroforetice. Aparatul este
de asemenea prevăzut cu un capac,
realizat de obicei din plexiglas.
unde UH+ reprezintă mobilitatea H+, I este intensitatea curentului (Amperi), t este timpul
(secunde) iar K este conductivitatea soluției. Astfel, în cazul unor electroliți diluați și la timpi
mari de separare, tamponul trebuie să circule continuu între compartimentele cu electrozi.
Sursa de curent trebuie să fie capabilă să ofere un curent sau un voltaj constant, preferabil
ambele. Pentru cele mai comune separări sursa de curent adecvată trebuie să aibă capacitatea de a
oferi 50 mA și 500V. Intensitatea maximă a curentului care poate fi utilizată pe unitatea de arie a
benzii de hârtie de filtru supuse separării electroforetice poate fi calculată astfel:
unde I (mA) reprezintă intensitatea curentului, P (cm2) este aria benzii de hârtie
de filtru măsurată între suprafețele de electrolit și compartimentele electrozilor
iar U (V) este potențialul electric.
În general tensiunea maximă de lucru este de 400 V, cu o cădere maximă de
15V/cm (în medie de 2-10V/cm).
Pentru determinări cantitative substanțele separate pe benzile din hârtie de filtru pot fi utilizate
atât metode directe cât și cele indirecte. În cazul metodelor directe, substanța care trebuie să fie
măsurată trebuie să absoarbă radiație UV sau să fie fluorescentă ori radioactivă. În metodele
indirecte zonele separate trebuie să fie mai întâi colorate iar absorbanța măsurată cu ajutorul unui
densitometru racordat. Au fost construite o serie de densitometre semi - sau total automatizate
care trasează grafic intensitatea luminii transmise sau reflectate de pe o electroforegramă colorată
versus distanța de-a lungul benzii electroforetice în formă de curbe electroforetice. Aria din
interiorul acestor curbe este determinată fie automat printr-o scalare integrată, fie cu ajutorul unui
planimetru ori prin tăierea ariilor reprezentate și cântărirea lor. Sunt descrise de asemenea
scannere computerizate care permit analiza cantitativă completă a unei electroferograme în câteva
secunde. Aria din interiorul acestor curbe este determinată fie automat printr-o scalare integrată,
fie cu ajutorul unui planimetru ori prin tăierea ariilor reprezentate și cântărirea lor.
Aplicarea probei se face pe banda de hârtie de filtru îmbibată
cu soluție tampon, fixată în aparat, după crearea unui mediu
saturat și stabilizat în vapori, cu ajutorul unei pipete capilare,
seringi Hamilton (1-5µl), micropipete, fără a zgâria hârtia. Se
folosesc două tipuri de spotări: în picătură sau în linie.
În acest caz tensiunea aplicată este de circa 50-215V/cm, iar la bornele sursei de curent
tensiunea a redresorului este de 10 kV. Se poate afirma că o creștere de la 5V la
100V/cm (adică o creștere de 20 de ori) viteza de migrare crește de asemenea de 20 de
ori dar cantitatea de căldură degajată va crește de 202, adică de 400 de ori, motiv pentru
care este absolut necesară o termostatare uniformă (o termostatare neuniformă conduce
la apariția zonelor de semilună-marginile hârtiei se usucă mai tare. Se mai poate nota că
la concentrații mari de probă rezoluția de separare este scăzută și se vor obține zone cu
coadă.
Electroforeza pe hârtie la tensiune înaltă se utilizează la separarea aminoacizilor (se
produce în tampon acid formic-acetat de sodiu), a peptidelor (separarea se realizează în
tampon piridină-acid acetic (la un pH cuprins între 3,0 și 5,0), glucidelor sau a bazelor
azotate purinice și pirimidinice.
Sub forma bidimensională, electroforeza pe hârtie la tensiune înaltă se poate combina
cu cromatografia pe hârtie.
ELECTROFOREZA PE STRAT SUBȚIRE
În momentul introducerii cromatografiei în strat subțire și a electroforezei în strat
subțire, cu ceva timp în urmă, comoditatea și sensibilitatea crescută (de la 10 la 50 de
ori) în comparație cu tehnicile pe hârtie au fost considerate metode promițătoare
pentru analizele compoziției proteinelor și a acizilor nucleici. Electroforeza în strat
subțire combinată cu cromatografia în strat subțire a reprezentat o metodă de rutină
pentru separarea a unor mici cantități de aminoacizi, nucleotide, ioni anorganici și a
altor substanțe cu masă moleculară mică.
Utilizarea mediilor suport de strat subțire oferă următoarele avantaje față de tehnicile
care utilizează hârtia:
(1) necesită un echipament mult mai simplu pentru preparare;
(2) rezoluția este în general superioară;
(3) separările se pot realiza la potențiale înalte în perioade de timp foarte scurte;
(4) sunt necesare mici cantități de probă, putându-se realiza mai ușor separări atât
cantitative cât și micro-preparative;
(5) probele nu trebuie desalinizate, ele se aplică direct pe strat. Astfel, ureea și
glucidele rămân în start, ionii migrând rapid;
(6) se pot utiliza reactivi agresivi de spray-ere și în acest mod se coboară limita de
detecție.
Din punct de vedere al echipamentului
utilizat, se folosesc aparate convenționale
de tip orizontal, similare celora utilizate
electroforeza pe hârtie, acetat de celuloză
ori pe gel de agar. Pentru separări la
potențiale mai înalte și pentru separări Cameră pentru electroforeză în strat subțire. (a)
bidimensionale, s-au descris diverse placă orizontală prevăzută cu system de răcire; (b)
camere prevăzute cu sisteme de răcire. foițe de izolare; (c) strat subțire pe placă de sticlă;
Aparatul pentru electroforeză pe strat (d) bride de hârtie (Whatman 3 MM); (e) placă de
subțire este prezentat schematic în sticlă, 5 mm grosime; (f) compartimente pentru
tampon și electrozi; (w) sistem de răcire.
alăturată. El posedă un plan orizontal
sub care se află un sistem de răcire cu
apă, pe care se așează placa (cu
dimensiuni de 10 x 10 sau 20 x 20 cm) cu
strat subțire (circa 250-300 µm) care este
pusă în contact cu tamponul prin
intermediul unor bride din hârtie de filtru.
Aparatul este acoperit cu o placă de
sticlă. Mica distanță dintre placa cu strat
subțire și placa care acoperă aparatul Hunter Thin Layer Peptide Mapping
acționează ca o cameră umedă și previne Electrophoresis System, CE. For high
uscarea stratului subțire. resolution two dimensional tryptic peptide
mapping and phosphoamino acid (PAA)
analysis
În cazul separărilor efectuate pe ser sanguin, volumul de probă este în funcție de cantitatea de
creatinină. În general proba spotată trebuie să conțină maximum 5 µg de creatinină. Timpul de
separare este de aproximativ 25-30 minute la o tensiune de 30 V/cm.
Proteinele sau alte substanțe macromoleculare pot fi separate prin utilizarea gel filtrarea pe strat
subțire-electroforeza pe strat subțire. În funcție de masele moleculare ale probei, se poate utiliza
Sephadex Superfine (de la G-25 la G-200). Sephadex-ul, echilibrat cu tamponul adecvat, este
depus pe o placă de sticlă. Placa cu strat subțire este plasată într-un aparat adecvat ca cel
prezentat în figura de mai jos, fiind echilibrată cu un tampon care curge prin stratul de gel.
Stratul trebuie conectat cu un rezervor prin intermediul unei bride din hârtie de filtru Whatman
No. 1 la capătul superior, iar placa se înclină într-un unghi de 15-20o față de orizontală.
Membranele îmbibate se plasează imediat în sistemul reglabil și se aplică probele cu ajutorul unei
micropipete sau unui dispozitiv de aplicare simultană a probelor (10-16 probe).) Volumul aplicat de probă
este în funcție de grosimea membranei și de concentrația proteică. Nigrozina (denumită și Indian ink) este
cel mai bun colorant al proteinelor pe folii de nitroceluloză. Un alt colorant utilizat în colorarea proteinelor
este Ponceau S.
La pH neutru și alcalin, RNA migrează rapid în folie spre anod, în timp ce DNA nativ rămâne pe linia de
start. DNA monocatenar denaturat migrează spre anod. Membranele de nitroceluloză cu dimensiuni variate
a mărimii porilor, impregnate cu detergenți ori soluții de albumină serică, pot fi utilizate la separări de
proteine, polinucleotide și nucleoproteine.
Modelul de bază a tancurilor electroforetice utilizate pentru
membranele de celuloză seamănă cu cele utilizate la tehnica
electroforetică pe hârtie. O serie dintre acestea prezintă
sisteme de răcire și pot fi utilizate concomitent pentru
electroforeză pe membrane și pe strat subțire. Ambele
separări se pot realiza atât la voltaje scăzute cât și la cele
înalte. Pentru a minimaliza procesul de evaporare, se poate
adăuga glicerol la soluția tampon. Controlul evaporării se
poate realiza și prin folosirea de soluții tampon cu tării ionice
mici (o concentrație mică a soluției tampon favorizează
creșterea vitezei de migrare în paralel cu scăderea efectului
Joule.
Electroforeza pe gel de amidon este considerată după unii autori a fi o metodă blândă de
purificare a proteinelor fără șanse de denaturare, putându-se pune alături de metoda salting-out
ori precipitarea cu acizi, alcool sau acetonă. Pe de altă parte, alți autori consideră că din contră, în
timpul electroforezei au loc procese ireversibile de denaturare care conduc la o pierdere
considerabilă de proteină. Chestiunea în cauză se ridică dacă acest proces se manifestă din cauza
dezvoltării de căldură cauzată la intensități de 17-20 mA a curentului electric cu soluții tampon cu
tărie mare. Astfel, procesul de denaturare nu se observă la tării ionice scăzute, rezultatele fiind
satisfăcătoare.
Amidonul este utilizat ca mediu suport
în trei tehnici electroforetice zonale:
Electroforeza clasică pe gel de
amidon, descrisă pentru prima dată de
Smithies;
Electroforeza pe coloană, dezvoltată
de către Carlson și independent de
Flodin și Porath;
Electroforeza pe bloc de amidon,
introdusă de Kunkel și Slater.
Aparatura utilizată în electroforeza pe
gel de amidon este de două tipuri: I)
pentru geluri orizontale; II) aparate cu
gel vertical. Ambele aparate sunt
alcătuite de 2 rezervoare cu soluție
tampon, compartimentate pentru a
împiedica produșii de electroliză să
intre în contact direct cu gelul.
Contactul dintre suport și gel se
realizează prin intermediul unor bride
din hârtie de filtru sau tifon (bumbac)
iar legăturile dintre compartimente se
formează în același mod.
Godeurile se efectuează cu ajutorul unui pieptene din plexiglace care se plasează peste
stratul de amidon înainte de gelificare și se îndepărtează după aceasta. Dimensiunile
godeelor sunt de 15-30 mm lungime, 1 mm lățime și 50 mm adâncime.
În general separări bune sau foarte bune se pot obține la temperatura camerei la o
tensiune de 6V/cm timp de 6 ore sau la o temperatură de 5oC și la o tensiune de
10V/cm, în sistem de tampon continue sau discontinue.
După separarea electroforetică sunt recomandate diverse proceduri de colorare a
gelurilor. Astfel, gelul este extras cu grijă din cuva de electroforeză și tăiate paralel cu
suprafața în două părți egale. Colorarea se realizează prin turnarea colorantului peste
suprafața secționată. O serie de lucrări prezintă colorația cu soluție de Amido black 10B
în metanol:apă:acid acetic glacial (50:50:10) timp de l0-30 min.
Lipoproteinele pot fi colorate prin incubare timp de 16 ore într-o o soluție alcătuită din: 1,2 g
Sudan black 10B, 40 ml de apă distilată, 600 ml etanol și 2 ml NaOH,. Decolorarea completă se
realizează după 6-8 zile după imersare într-o soluție de etanol 60%. De asemenea, pentru a
vizualiza lipoproteinele se poate utiliza o soluție saturată de Oil Red O pregătită într-un amestec
metanol:apă:acid acetic glacial (60:10:30).).
Proteinele care conțin cupru precum hemocianina, sunt detectate prin plasarea gelului secționat
pentru 3-4 ore într-o soluție care conține 50 ml acetat de sodiu l0% și 3 ml de soluție ditio-
oximidă, 0,1% preparată în alcool. Apariția unei colorații verde-închis este un rezultat pozitiv.
Hemoglobinele sunt detectate cu reactiv benzidină sau cea descrisă pentru electroforeza pe gel de
agar. Hem-proteinele pot fi de asemenea colorate cu o-tolidină.
Pentru complexul acestor proteine cu hemoglobina care prezintă o activitate peroxidază-like, o-
dianisidina pare a fi cel mai bun reactiv ea formând o colorație brună.
o serie de aplicații ale electroforezei pe gel de amidon
Tărie ionică
Material biologic Tampon pH V mA Timp (ore)
(Molaritate)
Barbital 0,1 25-60
Lipoproteine serice normale și patologice 8,6 100-500
Fosfat 0,5 24
Proteine lenticulare bovine Barbital 0,1 8,6 400 - 24
Tuberculo-proteine Barbital 0,1 8,6 360 17-20 30
Fosfataza alcalină intestinală Barbital 0,02 8,6 200 7-9 12
Acetat 0,017 4,00 175 30 24
Hormonul de creștere (somatotropină)
Carbonat 0,1 11,2 175 30 72
β-Galactozidză Pirofosfat 0,025 8,5 370 1 16
Chimotripsinogen Cacodilat 0,1 6,6 3,2V/cm - 65
Tirozinază de mamifere Barbital 0,1 8,5 300 11 19
Tripsină Acetat 0.1 4,00 /300 - 10
0,02M borat +
Hemocianină Borat 8,0/3 92V/cm - 12
NaOH 0,008M
Hemoglobină Borat 0,05 M 8,5 6V/cm - 5
Plasmă umană Borat 0,025 - 450 - 18
ELECTROFOREZA PE GEL DE AGAROZĂ
Agaroza este singurul hidrocoloid neadeziv care și-a găsit o multitudine de utilizări în științele
separatologice după prepararea sa de către Araki (1937) ca un component aparent fără grupări sulfat,
din agaropectina, bogată în astfel de grupări, la rândul ei obținută din agar.
Cele două componente se separă prin acetilare și dizolvare în cloroform când agaroza acetilată este
solubilă. Încă din secolul al XVII-lea în Japonia, agarul și o mulți alți hidrocoloizi derivați dintr-o serie
de alge roșii de mare din clasa Rhodophyceae (speciile Gelidium și Gracilaria) au fost utilizați la
prepararea hranei.
Agarul a fost introdus ca mediu pentru imunoelectroforeză de către Grabar și Williams în anul 1953,
tehnica originală descrisă de aceștia fiind ocazional utilizată și astăzi. Electroforeza pe agar tratat este
de altfel principala metodă curentă de identificare a variantelor de hemoglobină.
Agarul a fost aplicat de către Polson în anul 1961 pentru separări cromatografice bazate pe
proprietatea sa de sitare moleculară, după care acesta a fost înlocuit gradat cu agaroza, începutul fiind
făcut de către Hjerten (1961).
Conținutul în sulfat a agarozelor de diferite grade furnizate pentru utilizare în laborator este în
general sub 0,12% comparativ cu 4% conținutul în agaropectină. Din această cauză agaroza poate fi
utilizată în prepararea gelurilor fără nevoia utilizării unor aditivi sau a unor agenți de reticulare iar
inerția sa față de interacția cu proteinele și acizii nucleici reprezintă principalele rațiuni ale ei în larga
utilizare ca mediu de separare. Tot ce este necesar în prepararea gelurilor este de a dizolva agaroza
pulbere prin încălzire controlată la fierbere sau aproape de temperatura de fierbere, după care să se lase
să se răcească. Procesul de gelificare se manifestă spontan și este complet în gelurile reci. În plus față
de simplicitatea pregătirii gelului de agaroză, alături de inerția față de interacții cu proteinele și acizii
nucleici îi oferă acesteia o multitudine de avantaje ca mediu de separare precum recuperarea simplă a
probei, netoxicitatea și simplicitatea pregătirii gelului.
Agaroza este de asemenea unică ca aplicativitate în numeroase proceduri imunoelectroforetice.
În comparație cu gelul de poliacrilamidă, gelul de agaroză este un material foarte poros, ceea ce îi
limitează oportunitatea folosirii sale în formă nemodificată în separări de proteine bazate pe
efectul de sită moleculară la cele cu masă moleculară mai mică de 60 kDa. Pe de altă parte, marea
sa permeabilitate face din ea un mediu superior poliacrilamidei pentru studii imunochimice.
Gelurile de agaroză sunt în mod curent utilizate pentru electroforeză plană, orizontală pe care
gelurile sunt plasate între electrodul anodic și catodic aflați în camere umplute cu tampon și
conectate prin punți umede. Cu excepția unor cerințe uzuale la platforma pe care se așează
gelul se poate adapta ușor un sistem de răcire prin recircularea apei. Gelurile sunt turnate în
casete deschise ori prevăzute cu două spațiatoare. Se are în vedere că utilizarea punților din
hârtie sau bumbac conduce la o pierdere de voltaj prin ele ceea ce conduce la o creșterea a
efectului de încălzire și apariția fenomenului de condensare în camera de separare
electroforetică. Pierderea de voltaj de-a lungul gelului trebuie să fie controlată direct de la
nivelul gelului și nu din sursa de curent. În plus hârtia de filtru nu este totdeauna
recomandată deoarece prin utilizarea sa drept bridă de contact, datorită procesului de
electroosmoză, puntea dinspre anod se poate usca împreună cu extremitatea respectivă a
gelului în timp ce la extremitatea catodică se adună lichid în exces, deoarece hârtia de filtru
nu poate prelua și transfera cantități mari de lichid. Condensarea vaporilor pe gel este ușor
de prevenit printr-o simplă barieră de vapori care se așează pe gel. Pentru electroforeza
acizilor nucleici utilizarea punților (bridelor) de legătură a fost eliminată prin aplicarea tehnici
cunoscute drept „submersă” în care gelul este așezat pe o platformă încărcată cu tampon
conectată la camerele electrozilor. Modul de electroforeză submarin nu este în mod curent
aplicabil în electroforeza proteinelor deoarece acestea au tendința de a difuza în tamponul
înconjurător, în timp ce acizii nucleici posedă constante de difuziune foarte mici, motiv pentru
care migrează aproape în întregime prin gel la aplicare unui câmp electric, cu o doar mică
difuziune. Gelurile de migrare din agaroză în format vertical cu camere de electrozi sunt
rareori utilizați deoarece agaroza are tendința de a se dilata și astfel de a părăsi caseta.
Inițial, aplicarea probei în gelul de agaroză s-a realizat
prin tăierea unei fante în gel. Această tehnică este în
continuare utilizată la electroforeza acizilor nucleici,
care formează benzi înguste când migrează nerestinctiv
din soluția de probă în gelul de migrare restrictiv,
comparativ cu proteinele la care se manifestă foarte
mică îngustare a benzii care permează gelul ușor. În
plus, godeurile induc distorsiuni ale benzilor proteice
datorită: (i) procesului de permeație parțială în
marginile godeului înainte de începerea „de facto” a
separării electroforetice; și (ii) datorită tensiunii
electrice inegale care se manifestă le-a lungul godeului
în momentul aplicării unui câmp electric. Datorită
ușurinței cu care soluțiile pot fi îmbibate în agaroză
urmată de compresia temporară cu hârtie de transfer,
probele pot fi depuse pe gel în benzi demarcate prin
intermediul așa-numitei tehnici „folie de aplicare a
probei”, un plastic subțire întins peste gel care are
prevăzute niște fante prin care probele sunt depuse pe
gel. Acest sistem de aplicare a probei a fost sugerat de
Cawley simplificând procedura comparativ cu cea de
formare de godeuri.
Din punct de vedere electric, în cele mai multe aparate se utilizează un gradient de
potențial de 15-20 V/cm. Acesta corespunde unei puteri totale a câmpului electric de
250-300 V și o intensitate de curent de 100-140 mA, depinzând de mărimea electrozilor.
În cazul gelurilor subțiri de 3 mm grosime, tensiunea aplicată este de 6 V/cm.
Fixarea fracțiilor proteice se realizează: a) fie prin imersarea gelului în soluție de acid
acetic 20% timp de o oră, după care gelul se usucă timp de 16 ore la 37oC; b) fie prin
imersarea sa într-un amestec de acid picric (soluție saturată):acid acetic (20%) într-un
raport 3/1 timp de 15 minute, după care gelul se usucă.
Prealbumina 0,15-0,36
Albumina 39-51
α-Lipoproteine (3-7)
(α-Fetoproteina)a <1-1 -5
(Orosomucoid) 0,40-1,05
α1-Antitripsina 0,8-1,9
Globuline specifice de grup 0,2-0,55
(Inhibitorii inter-α1-tripsină) 0,2-0,7
(Ceruloplasmina) 0,22-0,46
α2-Macroglobulinele 1,2-2,4
Haptoglobinele (1-1, 2-2, 2-1) 0,40-2,9
Globulinele insolubile la rece 0,1-0,3
Transferina 1,7-2,7
β-Lipoproteinele 2,2-7,4
Al treilea component al sistemului complement, C3 0,6-2,2
IgA 1,0-3,0
Fibrinogenul 2,2-4,4
(IgM) 0,6-2,2
IgG 6,5-15,5
(Catenele de imunoglobulină ușoară) <0,001
(Proteina C-reactivă) <0,02
Analiza profilului electroforetic
S-a introdus pentru analiza calitativă a proteinelor urinare electroforeza pe gel de poliacrilamidă în prezența
dodecil sulfat de sodiu (SDS-PAGE). SDS-PAGE separă proteinele în funcţie de mărimea lor moleculară, iar
monomerii catenelor ușoare libere (policlonale sau monoclonale) sunt vizualizate ca o bandă cu masă
moleculară (Mr) de 25.000 Da, care sunt deosebite cu uşurinţă de imunoglobulinele intacte (cu masă
moleculară de 150.000 Da). SDS-PAGE diferenţiază, de asemenea, proteinuriea cu origine glomerulară
(proteine, cu masă moleculară de 66.000 Da), de cea cu origine tubulară (proteine cu masă moleculară de
66.000 Da), sau cu origine mixtă. Această metodă este, aşadar, un potenţial instrument clinic pentru evaluarea
funcţiei renale, un important factor de prognostic în MM. Cu toate acestea SDS-PAGE, nu este utilizată pe
scară largă în laboratoarele clinice, pentru că este exigentă din punct de vedere tehnic, un timp mai
mare, şi este mai costisitoare.
Le Bricon și colaboratorii (1998; 2000) propun pentru prima dată o tehnică de
analiză a proteinelor urinare prin electroforeză pe gel de agaroză în prezență de
dodecil sulfat de sodiu (SDS-AGE) la pacienți suferinzi de Mielom multiplu. Astfel,
urina, fără o concentrare prealabilă, se analizează prin SDS-AGE pe suport
Hydragel®, mediu electroforetic utilizat în mod comun la analiza proteinuriei.
Acizii nucleici sunt polimeri compuși din unităţi nucleotidice individuale, unităţile fiind conectate prin
intermediul legăturilor diester fosfat la scheletul zaharidic. Efectul net al acestor legături este cel de a oferi
polimerilor o sarcină netă negativă.
Încă de la începutul tehnicilor electroforetice s-a axiomat faptul că moleculele care transportă o sarcină
electrică vor migra într-un câmp electric într-un mod previzibil. Atunci când este supusă unui câmp electric, o
moleculă care transportă o sarcină netă negativă va migra spre polul pozitiv, în timp ce o moleculă încărcată
cu o sarcină netă negativă va migra spre polul negativ.
Atunci când macromolecule de acizi nucleici încărcate electric sunt plasate în matricea
semi-solidă a unui gel, ele vor migra spre polul pozitiv într-un mod previzibil şi
reproductibil, procesul putând fi descris ca o funcţie exponenţială negativă a lungimii
acestora. Altfel spus, moleculele mai scurte vor migra mai repede în timp ce moleculele
mai mari (mai lungi) vor migra mai lent. Într-adevăr, în cazul unui acid nucleic, aflat
într-un câmp electric uniform, orice alt element al expresiei migrării sale este o
constantă, iar mobilitatea sa este complet determinată de mărimea moleculei (masa
moleculară a unui acid nucleic se exprimă în daltoni sau în perechi de baze, base pair,
bp, de fapt nucleotide; o pereche de baze este aproximativ egală cu 660 daltoni).
Metoda este deosebit de simplă, rapidă și sensibilă pentru separarea, identificarea și
purificarea fragmentelor de ADN.
Din punct de vedere practic, intr-un gel de
agaroză, este dificil să se rezolve cu
precizie acizi nucleici dubli catenari mai
mici de aproximativ 100 de baze, deoarece
proprietăţile de cernere moleculară a
agarozei nu sunt suficient de pregnante. Pe
de altă parte, macromoleculele mai mari
de aproximativ 25.000 bp dar mai mici de
aproximativ 2.000.000 bp vor migra în gel
cu viteze diferite, datorită limitării de
mobilitate. Macromoleculele de acizi
nucleici mai mari de 2.000.000 bp nu vor
putea penetra un gel convențional de Mobilitatea electroforetică a fragmentelor de
agaroză. Astfel, domeniul efectiv de restricție a ADN într-un gel de agaroză. DNA provine
mărime pentru electroforeza acizilor din bacteriofagul lambda în urma digestiei cu enzima
nucleici dublu catenari pe un gel de restricție Hind III. Graficul arată că distanța de
migrare în centimetri în funcție de mărimea în
convențional de agaroză este între 100 bp
perechi de baze a fragmentului separat
și 25.000 de bp. În acest interval
comportamentul macromoleculei este
precis şi previzibil. Acest comportament
este prezentat în figura alăturată.
În anii „80, a fost prezentată o teorie prin care se consideră că
acizi nucleici migrează prin gel asemănător mișcării
ondulatorii a unui şarpe. Astfel macromolecula se mișcă din
față și trage restul de macromoleculă după ea. În acest model,
cu cât molecula este mai mare, cu atât ea interacționează mai
puternic cu matricea de gel și astfel întâmpină o rezistenţă mai
mare din partea acesteia . în așa fel încât timpul său de
staționare într-o zonă este mai mare. Aşa cum a fost arătat mai
sus, creşterea rezistenţei gelului este neliniară. Acest model,
numit „biased reptation”, este suficient pentru a explica tot
comportamentul unui acid nucleic într-o matrice de semi-
solidă.
În anul 1989 un grup de cercetători de la Universitatea din
Washington, au testat această teorie, filmând macromoleculele
de ADN care se deplasează printr-un gel de agaroză. Filmul a
arătat atât mișcarea ondulatorie, sigmoidală, cât și
interacțiunile dintre acid nucleic și matricea gelului de
agaroză.
Separarea fragmentelor de ADN de dimensiuni
diferite prin electroforeză pe gel vertical. Gelul este
preparat prin turnarea agarozei topite sau a
acrilamidei nepolimerizate între două geamuri de
sticlă aflate la o distanță de câțiva milimetrii. După
solidificarea agarozei ori polimerizarea acrilamidei se
formează o matrice de gel, a cărei pori depinde de
concentrația de gel sau de acrilamidă utilizată.
Deoarece porii sunt mai mari în gelurile de agaroză
decât în cele de poliacrilamidă, cel din înainte este
utilizat la separarea fragmentelor mari de ADN (între
500 și 20 kb) în timp ce al doilea se utilizează la
separarea fragmentelor mici (de la o nucleotidă, până
la 2 kb). Amestecul de fragmente de ADN care
urmează a fi separat este depus într-un godeu din
partea superioară după care se aplică un câmp
electric prin gel. Fragmentele de ADN se mișcă spre
polul pozitiv cu o viteză invers proporțională cu
logaritmul lungimii lor formând benzi care pot fi
vizualizate prin autoradiografie (dacă fragmentele
sunt radiomarcate) ori prin adăugare de colorant
fluorescent de tipul bromurii de etidiu; în acest ultim
caz, agaroza lichefiată este lăsată să se solidifice pe
un suport de sticlă sau plastic orizontal
Cum matricea de gel restricționează difuzia întâmplătoare a moleculelor,
moleculele cu lungimi diferite se separă în zone discrete („benzi”) a
căror lățime este egală cu lățimea godeului unde s-a plasat amestecul
original de ADN
Dacă prin metoda clasică, convențională se pot separa fragmente de ADN de până la 20 kbp cu
rezoluție bună, cele până la 40 kbp cu rezoluție satisfăcătoare, pentru separarea fragmentelor
până la 500 kbp se rezolvă cu rezoluție slabă, într-un gel de agaroză foarte fragil cu o
concentrație de 0,1%. La mijlocul anilor `80 s-au dezvoltat o serie de metode de analiză
electroforetică a moleculelor de acizi nucleici în domeniul de mărime care limitează mobilitatea.
Soluția a implicat introducerea mobilității dependente de mărime a moleculelor de acizi nucleici
prin alterarea câmpului electric. Primul tip de alterare implică simpla schimbare de polaritate a
câmpului electric într-o manieră regulată. S-a arătat că o schimbare periodică a polarității va
induce moleculelor o mișcare de întoarcere în forma literei U, în matricea de gel. Chiar pentru
cele mai mari molecule, această întoarcere permite separarea moleculelor. Dacă lungimea
timpului de reversare a moleculelor este de aproximativ o treime din timpul de mișcare spre
înainte, ele se vor putea separa în câteva ore pe agaroză standard. Prima demonstrație practică a
acestei metode, denumită ”electroforeză în câmp inversat” (Field Inversion Gel Electrophoresis-
FIGE), a rezolvat complet printr-o migrare de o secundă înainte urmată de o secundă înapoi
molecule mari de 2.000.000 bp precum cromozomii intacți din drojdie. De atunci s-au dezvoltat o
varietate de metode, în mod comun denumite ”electroforeză în câmp pulsator”. Prin aceste
tehnici cele mai mari molecule de ADN cu o lungime cuprinsă între 2•104 la 107 bp (20 kb la 10
megabp, Mb), se pot separa în funcție de masa lor moleculară. Separarea prin electroforeză în
câmp pulsator depinde de comportamentul singular al moleculelor mari de DNA într-un câmp
electric care este pornit și oprit (pulsat) la intervale mici de timp.
În condițiile în care se aplică un câmp electric unor
molecule mari de ADN aflate într-un gel, molecule
migrează în direcția câmpului electric și de asemenea se
întind pe toată lungimea lor. Dacă curentul este stopat,
moleculele încep să se “relaxeze” prin înfășurări
întâmplătoare. Timpul necesar pentru relaxare este
direct proporțional cu lungimea moleculei. Câmpul
electric este apoi reaplicat într-un unghi de 90° ori 180°
față de prima direcție. Moleculele mai mari se
relaxează mai puțin decât moleculele mai scurte în
momentul în care curentul este oprit. Cum moleculele
trebuie să se relaxeze prin înfășurări întâmplătoare
înaintea miscării lor într-o nouă direcție, moleculele
mai mari încep ă se miște în direcția nouă impusă mai
lent decât cele mai scurte. Alternarea repetată a
direcției câmpului electric forțează moleculele mari de
ADN de diferite mărimi să se îndepărteze mai mult și
mai multe între ele.
Electroforeza în câmp pulsator este foarte importantă în purificarea moleculelor mari de
ADN, până la ≈107 bp în lungime. Tehnica este necesară pentru analiza cromozomilor
celulari de la 5•105 bp (cel mai mic fiind cromozomul de la drojdie) până la aproximativ 2-
3•108 bp (cromozomii animali și de plante). Cromozomii cei mai mari trebuie în prealabil
să fie digerați în fragmente de 107 bp ori mai mici înainte de analiză. Astfel de fragmente
de restricție pot fi generate cu ajutorul enzimelor de restricție care taie la situsuri de
restricție găsite la situsuri de restricție de 8 bp
Se poate spune că principiul (caracteristica metodei) o reprezintă faptul că
fragmentele de ADN sunt obligate să-și schimbe periodic direcția de deplasare ca
urmare a schimbării direcției câmpului electric. Intervalul de timp pentru migrare
într-o direcție sau alta determină limita superioară a dimensiunii fragmentelor de
ADN care se vor separa distinct. Dependența de timp este aproape liniară: la
frecvențe de timp de 0,1 secunde, se separă fragmente mai mari de 10 Kbp, în timp
ce la intervale de timp de o oră, se vor separa fragmente de circa 1 Mbp. Timpul
necesar separării prin electroforeză în câmp pulsator este cuprins între 20 și 80 de
ore, în condițiile în care gelul de agaroză are o concentrație de 0,5-1%
adică:
•Proteina cu mobilitate mai mare (densitate de sarcină electrică mai mare) este mai mică în
dimensiuni. În acest caz separarea se realizează pe baza mobilității și a masei moleculare.
Se consideră că cele două proteine sunt sinergice iar prin creșterea concentrației de gel
crește și rezoluția de separare (panelul B).
•Una dintre proteine are dimensiuni mai mari și mobilitate electroforetică mai mare. În acest
caz separarea se realizează în funcție de dimensiune și sarcină electrică, cele două proteine
fiind antagoniste. Cazul este caracteristic sistemelor nedisociative (panelul C).
Două proteine au aceleași dimensiuni dar au mobilități electroforetice diferite (este cazul
izoenzimelor, hemoglobinelor, etc.). În acest caz concentrația monomerilor nu are efect
asupra separării relative a celor două proteine. Situația corespunde separărilor prin focusare
izoelectrică sau prin izotacoforeză (panelul D).
Soluțiile de monomeri se prepară uzual ca soluții stoc, concentrate. Pentru gelurile utilizate în
separarea de proteine este preferată o soluție stoc de monomeri cu T%=30% și C%=2,7% care se
prepară prin dizolvarea a 29,2g de acrilamidă și 0,8g de bisacrilamidă în 70 ml de apă complet
deionizată (volumul final fiind de 100 ml iar densitatea specifică de 1,025). Soluția de monomeri
trebuie filtrată și stocată la rece, preferabil într-un vas de sticlă. Pentru gelurile utilizate în
separarea de acizi nucleici se folosește un amestec alcătuit din acrilamidă:bisacrilamidă cu
T%=30% și C%=3,3% preparată din 29g de acrilamidă și 1g de bisacrilamidă.
Concentrațiile de inițiator sunt determinate empiric prin urmărirea polimerizării în timp de 15-
20 minute după adăugare. În aceste condiții, gelificarea se realizează complet în 90 de minute.
Dacă se utilizează geluri de concentrare, este necesar ca acestea să aibă structuri poroase mari.
Pentru o polimerizare rapidă (în circa 8-10 minute) se adaugă persulfat de amoniu, la o
concentrație finală de 0,05% respectiv TEMED, 0,1%.
Soluțiile stoc de monomer și de tampon se combină până la concentrația dorită și apoi se
deaerează sub un vid modest timp de aproximativ 15 minute. Inițiatorul și catalizatorul sunt apoi
adăugate iar amestecul se toarnă în aparatul montat. Dacă se utilizează gel de concentrare, se
prepară și se toarnă mai întâi gelul se rezolvare (separare). El este apoi acoperit cu o soluție de
izobutanol saturat în apă pentru a exclude aerul din vecinătatea superioară a gelului și pentru a
forma o legătură puternică între cele două geluri. După aproximativ o oră, stratul de alcool este
îndepărtat și gelul format în partea superioară se spală cu apă până la dispariția mirosului
caracteristic de butanol, după care se toarnă amestecul de gel de concentrare peste gelul de
separare și se introduce un ”pieptene” formator de godeuri pentru a forma spații în care se aplică
proba. După finalizarea polimerizării și îndepărtarea pieptenului, gelul este gata de utilizare.
Gelurile de poliacrilamidă sunt inerent instabile în afara domeniului de
pH cuprins între 4 și 6. După un stocaj de aproape 4 luni la o temperatură
de 4oC, în tampoanele uzual utilizate în electroforeză, uneori are loc o
scădere notabilă a profilului benzilor separate electroforetic. Astfel,
pentru a obține o rezoluție maximă, este necesar să se utilizeze numai
geluri proaspăt preparate. Alterarea structurii poliacrilamidei este un
proces lent de hidroliză a grupărilor carbox-amididice (-CO-NH2) ale
monomerilor de acrilamidă și care se manifestă în tampoane bazice.
Hidroliza conduce la formarea unor grupări carboxil (-COO-), ionizabile.
Gelurile vechi umflate au o structură a porilor este schimbată ele luând
caracteristici de schimbători de ioni datorită hidrolizei. Îmbătrânirea
gelurilor de poliacrilamidă are o semnificație comercială deoarece
limitează perioada de utilizare a gelurilor preturnate.
Forma gelului
Primele electroforeze care au folosit poliacrilamida drept mediu suport s-au efectuat pe
geluri plate, orizontale și apoi pe geluri cilindrice (unde amestecul de polimerizare se toarnă
în tuburi de sticlă sau plexiglace). În prezent însă, în majoritatea cazurilor se apelează la
separarea pe verticală în geluri plate (geluri placă), cu o grosime a gelului cuprinsă între 50
µm și 3 mm.
Gelurile placă orizontală (sau verticală) sunt simplu de preparat , într-un timp scurt. Pe
un astfel de gel se aplică mai multe probe, inclusiv proteine standard cu masă
moleculară cunoscută, separându-se în condiții identice. Numărul de probe aplicate este
în funcție de necesități iar analiza calitativă și estimările cantitative se efectuează cu mai
multă ușurință și precizie în cazul gelurilor cilindrice. Se elimină astfel artefactele optice,
ceea ce face posibilă fotografierea corectă. În plus, în cazul gelurilor placă, căldura
produsă prin efect Joule este mai repede disipată comparativ cu gelurile cilindrice iar
uscarea gelurilor este relativ simplă.
Gelurile cilindrice sunt
de neînlocuit la separarea proteinelor marcate cu radioizotopi când se urmărește
determinarea cantitativă a radioactivității.
Ele sunt de preferat atunci când trebuie determinată activitatea enzimatică a
fracțiunilor separate deoarece cantitatea aplicată este mult mai mare (fără a afecta
calitatea separării).
Gelurile cilindrice sunt preferate la testarea pH-ului optim de lucru și a concentrației
optime a gelului de poliacrilamidă
CONDIȚII DE SEPARARE
Condițiile de separare trebuie să asigure o solubilizare completă a probelor
proteice, alegerea acestora realizându-se sistematic în funcție de proprietățile
hidrofile/hidrofobe ale proteinelor.
Pentru testarea solubilității numai prin disocierea legăturilor hidrofile, proba este
incubată în soluții tampon alcaline, neutre și acide, în prezența/absența clorurii de
potasiu (0,1-0,5 M), la o temperatură de 4oC, pentru a nu afecta activitatea
biologică.
Urea este deseori utilizată ca agent de disociere în electroforeza pe gel. Urea, care disrupe
legăturile de hidrogen și legăturile hidrofobe poate cauza agregări nedorite ori formarea
unor structuri secundare care afectează mobilitățile proteinelor. Ea este deseori utilizată în
denaturarea acizilor nucleici. Urea este un component esențial al gelurilor la care este
necesară menținerea configurațiilor unicatenare a ADN sau ARN, pentru a se determina cu
acuratețe masele moleculare. Disocierea legăturilor de hidrogen necesită uree în
concentrații mari (7-8 M).
Poliolii (de exempul glicerina, trixidroxipropan, propantriolul) este folosită frecvent pentru
solubilizarea proteinelor în condițiile menținerii activității biologice.
Dacă proba continuă să rămână insolubilă se recurge la detergenți,
compuși care modifică hidrofobicitatea relativă a proteinelor și care astfel
îmbunătățesc separarea electroforetică. Într-o mică măsură același efect
se obține prin folosirea tampoanelor relativ hidrofobe pe bază de N-
etilmorfolină sau hidroxietilmorfolină
A B
Cea mai mare parte a studiilor de electroforeză în gel de poliacrilamidă folosește condiții
denaturante, disociative. În aceste condiții, proteinele oligomere disociază în lanțuri
polipeptidice, componente. Astfel, proteinele își pierd activitatea biologică. Detergenții se
utilizează în electroforeză când este necesară disruperea interacțiilor proteină-lipid și
proteină-proteină. În acest scop au fost utilizați o serie de detergenți. Cel mai cunoscut
agent de disociere este dodecilul sulfat de sodiu (lauril sulfatul de sodiu, SDS). SDS este un
detergent ionic care are formula CH3-(CH2)10-CH2-SO3-Na+.
Structura chimică a
dodecilsulfatului de sodiu, SDS.
Se observă brațul nepolar și
regiunea polară care posedă o
sarcină negativă
Cele mai multe proteine sunt ușor solubile în SDS, făcând electroforeza în prezență
de SDS (SDS-PAGE) o metodă general aplicabilă.
Puritatea (calitatea) detergentului este o condiție importantă în SDS-PAGE.
Efectele impurităților prezente în preparatele de SDS sunt impredictibile.
Dintre contaminanți, cele mai nedorite efecte le au probabil alchil sulfații,
alții decât dodecil sulfatul (C12); în special decil sulfatul (C10), tetradecil
sulfatul (C14) și hexadecil sulfatul (C16) Aceștia se leagă la proteine cu
afinități diferite și în consecință afectează mobilitățile.
Contaminanții lipofilici prezenți în preparatele de SDS, printre care
dodecanolul, pot fi incluși în complexele SDS-proteină și în micelele de
SDS conducând la scăderea rezoluției. Numai SDS purificat (care se
realizează prin recristalizare în n heptan) trebuie utilizată pentru
electroforeză, dar chiar cu SDS pur, diferite glicoproteine, lipoproteine și
nucleoproteine au tendința de a se lega la detergent neregulat, rezultanta
fiind o migrare anormală a complexelor SDS-polipeptide în ceea ce
privește masele lor moleculare. În plus, prezența unor săruri anorganice în
preparatul de SDS conduce la modificarea proprietăților tensioactive ale
acestuia. Dintre proprietățile fizice ale SDS se pot aminti:
SDS are o solubilitate în apă de 3% (masă/volum);
SDS precipită la temperaturi cuprinse între 0-10oC.
Dodecil sulfatul de litiu (lithium dodecyl sulfate, LDS) a fost uneori
substituit SDS în analizele efectuate pe geluri de poliacrilamidă după cum
bromura de cetiltrimetilamoniu (cetyltrimethylammonium bromide, CTAB)
a fost de asemenea utilizată în electroforeza proteinelor.
LDS este mai solubil decât SDS și nu precipită la temperaturi scăzute (la
4oC se leagă afin la poliacrilamidă, deși la 25oC nu prezintă o astfel de
proprietate), ceea ce permite migrarea gelurilor la temperaturi scăzute. S-
a constatat că dacă într-un sistem tampon continuu, SDS este înlocuit cu
LDS, separarea moleculelor cu masă moleculară mică este accelerată
datorită deficitului de LDS în regiunea frontală a gelului. Dacă gelul este
saturat în LDS, rezoluția separării la 4oC pe acest gel este mai bună decât
cea obținută după electroforeză un gel de poliacrilamidă în prezență de
SDS efectuată la 25oC.
CTAB este un denaturant mai slab decât SDS, prezervând anumite
activități biologice care sunt distruse de către SDS.
Majoritatea proteinelor leagă SDS într-un raport constant de 1,4g SDS/gram proteină. În
aceste condiții, sarcinile intrinseci (proprii) ale polipeptidelor sunt nesemnificative
comparativ cu sarcinile electrice negative rezultate după legarea SDS. Densitățile de
sarcină electrică superficială ale complexelor SDS-polipeptide sunt în principiu
identice, ceea ce permite separarea (într-un gel cu porozitate controlată) strict în funcție
de dimensiunile polipeptidelor. În acest fel, pe lângă compoziția (conținutul)
polipeptidelor din probă, se determină și masele moleculare ale polipeptidelor, dacă
sunt separate în același timp cu un set de proteine cu masă moleculară cunoscută, prin
raportare la acestea. Tehnica de lucru este simplă iar cantitatea de probă este de
ordinul a micro sau a nanogramelor.
Cea mai mare parte dintre proteine se solubilizează în SDS, indiferent de sursă, însă
există și excepții: astfel, glicoproteinele și lipoproteinele nu pot fi saturate în SDS,
deoarece, în primul caz, partea neproteică a unităților hidrofile oligozaharidice previn
legarea micelelor de SDS partea proteică numai interacționând cu acesta. Proteinele
puternic bazice (de exemplu, histonele) interacționează prin legare electrostatică a
micelelor de SDS prin intermediul grupărilor sulfat.
În cazul glicoproteinelor, impedimentul poate fi relativ îndepărtat prin
utilizarea tampoanelor Tris-borat în condiții alcaline, astfel crescându-se sarcina netă
negativă a glicoproteinelor ceea ce conduce la viteze de migrare bine corelate cu masa
moleculară.
Migrarea histonelor poate fi îmbunătățită prin utilizarea gelurilor în gradient de
pori care permit catenelor polipeptidice să acceadă la limita lor de pori.
Pe de altă parte, proteinele pure, au tendința ca la temperaturi
ridicate să formeze agregate și să precipite. Este cazul
hemaglutininei bacteriene care disociază complet după 30 de
minute de fierbere la 100oC în prezență de SDS. Competiția
agregare/dezagregare se poate rezolva prin scăderea
concentrației proteinei din probă. Practic, testarea celui mai bun
amestec de disociere se face prin păstrarea constantă a
concentrației proteice, a concentrației de agent reducător (de
obicei β-mercaptoetanol), și a concentrației de detergent cu
varierea timpului de incubare. Dacă rezultatul este
nesatisfăcător, se trece la varierea unui alt parametru dintre cei
arătați mai sus.
S-a studiat interacțiunea diferiților detergenți anionici cu albumina serică bovină
(BSA). În stare nativă, BSA conține 10-11 situsuri cu constante mari de legare a ionilor
de detergent. Legarea ionilor de detergent de proteina nativă nedenaturată se
realizează secvențial (unul după altul), în timp ce legarea detergentului la proteina
denaturată este puternic cooperativă. Existența complexelor discrete proteină-detergent
sugerează că asocierea ionilor de detergent este, de asemenea importantă, atunci când
afinitatea detergentului pentru proteină este mai mică. Un raport de legare mai mare
decât cel normal pentru un singur situs de legare se explică numai prin formarea de
micele de detergent în acel loc, adică ionii de detergent se leagă atât la proteină cât și la
ionii de detergent deja legați. acest fenomen este numit amplificarea legării, iar acest tip
de legare poartă numele legare micelară și s-a demonstrat că este reversibil. La
atingerea concentrației micelare critice acest mecanism încetează.
Saturarea cu SDS a unei proteine depinde de asemenea în punctul izoelectric
al acesteia, indirect influențând comportamentul electroforetic. De asemenea, saturarea
cu SDS este posibilă la temperatura camerei și se aplică la electroforeza
bidimensională, gelurilor folosite la separarea proteinelor prin focusare izoelectrică fiind
pregătite pentru a doua dimensiune, electroforeza pe gel de poliacrilamidă în prezență
de SDS (SDS-PAGE). În acest caz, incubarea la fierbere este înlocuită printr-o incubare
la temperatura camerei într-un amestec format din uree, 9M și Triton X-100, 20%.
Un alt agent de disociere foarte aplicat în disocierea probelor pregătite pentru
electroforeză este ureea.
Denaturarea produsă de uree este dependentă de temperatură, pH și tărie
ionică. Pentru o denaturare completă, se utilizează uree cu o concentrație mai
mare sau egală cu 8M, alături de agenții reducători ai punților disulfurice. Totuși
există proteine care nu se pot denatura.
Avantajul utilizării ureei drept agent de denaturare constă în faptul că în
unele separări electroforetice ea nu afectează sarcina electrică intrinsecă a
proteinei permițând astfel o separare atât în funcție de masa moleculară cât și în
funcție de sarcina electrică. Efectul denaturant al ureei datorat ruperii legăturilor
de hidrogen inter și intramoleculare poate fi reversat prin îndepărtarea ei prin
dializă.
Dezavantajele utilizării sale constau în faptul că nu se poate determina cu
precizie masa moleculară, nu este la fel de eficientă ca SDS în disocierea
proteinelor. De exemplu, ureea disociază în proporție de 50% un lizat celular brut
(la electroforeză, 50% din lizat este agregat nefiind apt să penetrteze gelul) în timp
ce SDS disociază același preparat în proporție de 90%.
Unele proteine, pentru a fi disociate complet necesită prezența simultană
a SDS și a ureei.
Clorura de guanidină (guanidina hidroclorică) este, de asemenea, un
agent de disociere utilizat în disocierea probelor pregătite pentru
electroforeză. În concentrații de 4-6M, ea realizează ruperea legăturilor
necovalente provocând desfacerea structurii cuaternare și distrugerea
structurilor secundare și terțiare datorită capacității superioare de a
participa la stabilirea legăturilor de hidrogen. Majoritatea proteinelor în
guanidină hidroclorică au o conformație total dezordonată și din această
cauză este rareori folosită în separările electroforetice.
Disocierea completă a celor mai multe proteine se realizează prin
incubarea probei diluate în tamponul de migrare la 95-100oC (pe baie de
apă) timp de 2-5 minute în prezența atât a SDS în exces cât și a β-
mercaptoetanolului, ditioeritrolului sau ditiotreitolului (agenți utilizați la
reducerea punților disulfurice)
Mecanismul reducerii
punților disulfurice de
către tiocompuși.
Coloana din stânga:
reducerea cu monotioli
(de tipul β-
mercaptoetanolului).
Coloana din dreapta:
reducerea cu ditioli
ciclizabili (cum ar fi
ditiotreitolul, DTT).
Sferele întunecate
reprezintă suprafața
proteinei.
În procedura Laemmli (1970) probele pregătite pentru electroforeză pe gel de
poliacrilamidă în prezență de SDS (SDS-PAGE) se prepară în tampon Tris-HCl, 0,0625
M, pH 6.8, SDS, 2%, β-mercaptoetanol, 5%, glicerol, 10%, și aproximativ 0,025%
(greutate/volum) colorant de monitorizare a migrării, albastru de bromfenol.
Este de preferat a se prepara un stoc de tampon pentru probă care să conțină toate
componentele cu excepția β-mercaptoetanolului, acesta adăugându-se chiar înainte de
utilizare. Glicerolul oferă probei o densitate care îi permite depunerea sa în godeul
gelului de separare aflat sub tamponul de migrare.
Colorantul de migrare permite atât aplicarea probei cât și monitorizarea migrării
electroforetice (el migrează odată cu ionul frontal, adică odată cu frontul).
Cantitatea de detergent prezentă în tamponul probei este suficientă pentru a asigura
saturarea amestecului de proteine. În cazuri rare, când proba are o tărie ionică foarte
crescută (> 0,2 M), ea poate fi dizolvată în tamponul stoc al probei (tamponul de
încărcare) într-un raport de 1:1 (v/v), fiind totuși, mai indicată o diluție într-un raport de
cel puțin 1:4 (v/v).
Cantitatea de proteină din proba care se încarcă pe un gel depinde de metoda de
detectare utilizată. Proteinele de interes care se încarcă pe gel trebuie să fie într-o
cantitate suficientă pentru a fi ulterior localizate. Detectarea în geluri impune o cantitate
de proteină/bandă de circa 1 µg pentru a avea o vizibilitate uşoară a benzilor proteice
colorate cu coloranţii anionici, de tipul Coomassie Brilliant Blue R-250 sau de 0.1 µg de
proteine/bandă în cazul colorării cu argint.
Electroforeza în condiții nedenaturante
Tampon de electrolit, evident, are un efect profund asupra migrării electroforetice. Tipul de tampon utilizat
conduce la stabilirea condiţiilor intensității câmpului electric aplicat şi afectează separarea şi de aici
rezoluţia. Proteinele diferă foarte mult în sensibilitatea lor la tării ionice, specii ionice, pH, şi necesitățile
lor în cofactori. Astfel, sistemul de tampon utilizat este în funcție de proba care urmează a fi separată
electroforetic. Tamponul ales pentru separarea proteinelor prin electroforeză nativă (nedenaturantă) de
multe ori depinde mai mult de tipul proteinelor luate în studiu decât de cerințele electroforetice.
Sistemele electroforetice în care ionii unei singure soluții tampon sunt
prezenți în probă, gel și compartimentul electrozilor (concentrația lor putând
fi diferită) la un pH constant se numesc sisteme tampon continue. Un sistem
continuu de tampon se poate utiliza pentru separarea acizilor nucleici şi a
proteinelor în concentraţii de aproximativ 1 mg/ml sau mai mare. În acest caz, în
tancul electroforetic se folosește acelaşi tampon, la un pH constant, ca și la
prepararea gelului. De asemenea, proba este încărcată direct pe gelul unde se va
produce separarea electroforetică. După cum moleculele vor migra prin porii de
gel, acestea sunt fracţionate în funcţie de mobilitatea lor. Lățimea benzilor este
determinată în principal de volumul probei aplicate, acest parametru limitând
rezoluția în sistemele continue de electroforeză.
Probe diluate necesită volume mari pentru a furniza cantităţi detectabile de
material, obţinându-se benzi relativ largi. Utilizarea gelurilor de dimensiunea
porilor constantă, limitează sistemele continue la probe cu o concentrație mare de
proteine care conduc astfel la cele mai bune rezultate. De obicei gelul are porii
suficient de mici pentru a permite separarea în funcție de dimensiunile
macromoleculelor proteice.
Unele proteine plasmatice și celulare se pot separa mai bine în geluri de
poliacrilamidă cu gradient de concentrație în sistem continuu, viteza de deplasare
a proteinelor descrescând în timp și ajungând zero, odată cu atingerea limitei lor de
por. În acest fel, crește rezoluția de separare, electroforeza cu limită de pori fiind foarte
valoroasă pentru separări de proteine pe baza masei lor moleculare.
Se poate spune că într-un gel omogen separarea macromoleculelor se
realizează în funcție de sarcină electrică și masă moleculară, în timp ce într-un gel cu
gradient de concentrație, separarea macromoleculelor se realizează în funcție de
masă moleculară.
De exemplu, într-un gel omogen cu T%=7,5 α1-antitripsina are o mobilitate
mai mică decât albumina, migrând după aceasta, într-un gel în gradient de
concentrație, α1-antitripsina (MM=54.000 Da) va migra în fața albuminei
(MM=68.000Da).
Folosind geluri de poliacrilamidă cu gradient liniar de concentrație (gradient
de pori) %T=3-30, %C=3,8, în sistem de tampon continuu, se constată că distanța de
migrare (D) este proporțională cu logaritmul timpului de migrare după relația:
unde a reprezintă panta dreptei iar b este intersecția cu abcisa
Etapele separării unui amestec de proteine în sistem discontinuu tampon Ornstein-Davis. (A) gelul este format din două
secţiuni. Un gel de concentrare cu pori mari aflat în parte superioară este turnat peste un gel restrictiv de rezolvare
(separare). Fiecare secțiune de gel conţine tampon Tris-HCl, dar concentraţiile şi pH-urile celor două tampoane
corespunzătoare celor două secţiuni sunt diferite. Gelul de concentrație este indicat printr-o nuanță de gri deschis în timp
ce gelul de separare este de culoare gri-închis. Proba proteică dizolvată în tamponul gelului de concentrare diluat este
plasată în godeurile gelului de concentrare (linii orizontale întunecate). Tamponul Tris- glicină de electrozi (culoarea
fondului figurii) este în contact cu partea de sus a gelului, partea de sus a probei, precum şi partea de jos a gelului. Anodul
este situat în partea inferioară a gelului iar catodul se află în zona superioară, nefiind prezentate. În acest sistem proteinele
serice de exemplu, au sarcini nete negative şi se mișcă în jos spre anod. Ionii de Tris sunt distribuiți în întregul sistem şi
servesc la menţinerea electroneutralității. Intensitatea câmpului electric, E, la scurt timp după aplicarea unei tensiuni
electrice, este reprezentată în graficul din partea dreaptă a imaginii de gel. Câmpul electric din gel, E este relativ scăzut, ca
o consecinţă a conductivitate relativ ridicată datorată ionilor de clorură, mobili. (B). În momentul aplicării unei tensiuni,
constituenții anionici ai sistemului se vor alinia în ordinea de mobilităţi lor electroforetice. Magnitudinea mobilității ioni
clorură (Cl-), în zona tamponului de gel este mai mare decât mobilitatea ionului glicinat (Gly), provenit din zona tamponului
de electrozi. Proteinele din probă, cu mobilităţi intermediare, sunt introduse într-un sandwich (în ordinea de mobilitatea lor)
între frontul clorură şi frontul de ioni glicinat. Astfel, proteinele din probă devin "stivuite" în regiunea foarte îngustă dintre
cele cele două fronturi de ioni de tampon în mişcare şi formează, spațial, o zonă foarte îngustă de start. Intensitatea
câmpului electric este influenţată de distribuţie locală a purtătorilor de sarcină, care sunt proteinele din zona de probă.
Intensitatea, E, a câmpului în zone diferite care conțin ioni este ajustată, astfel încât toate fronturile ionice migrează cu
aceeaşi viteză. (C). La scurt timp după ce procesul de concentrare este finalizat, proteinele din probă trec în gelul de
rezolvare care este prevăzut cu pori mai mici pori unde mișcarea este încetinită datorită procesului de cernere moleculară.
În gelul de rezolvare, ionii de glicinat depășesc proteinele din probă şi vor migra chiar în spatele ionilor clorură. În timpul
etapei de rezolvare, proteinele vor răspunde la câmpul electric relativ ridicat determinat de ionii glicinat din gel.
Electroforeza continuă cu proteinele din probă în tampon Tris- glicină, până când aparatul este închis.
Stivuirea. Când este aplicată o tensiune de curent, ionii clorură din secţiunile de gel, proteinele
anionice din probă, precum şi ionii de glicinat din zona tamponului de electrod încep să se
deplaseze spre anod (panel B). Tris-ul (o bază), precum şi orice altă proteină cationică din probă
migrează spre catod. Aşa cum ioni de clorură părăsesc proba, în spatele lor se creează o regiune
localizată, de conductivitate scăzută și câmp înalt. Câmpul crescut din spatele frontului de ion
clorură accelerează proteinele din probă şi ionii de glicinat de la tampon electrodului la aceeaşi
viteză ca şi a ionilor clorură (Eµ=constant). Gradul de ionizare a glicinei, la pH-ul tamponului de
electrozi (pH=8,3) este de aşa natură că mobilitatea efectivă a ionilor glicinat este mai mică decât
ca a ionului clorură şi a proteinelor din probă. (Mobilitatea efectivă a unei electrolit slab este
mobilitatea medie a formei ionizate; µef=µx, unde x este fracţiunea de molecule ionizate la un pH
specific iar µ este mobilitatea acestuia. Fiecare moleculă poate fi gândită ca fiind ionizată x% din
timp şi neionizată restul timpului. pKa a glicinei este pH=9,8 iar la pH=8,3, moleculele de glicină
sunt disociate în proporție de 1/30 în ioni glicinat). O regiune a frontului mobil se formează rapid
cu ioni de clorură, frontali și ionii de glicinat în spate, iar proteinele din probă sunt comprimate
între ele. Proteinele formează, zone individuale subțiri, așezate precum fișicul de monede, în
ordinea descrescătoare a mobilităţii, între ionul conducător, clorură şi ionul de sfârşit, glicinat. În
acest timp, pH-ul gelului de concentrare devine 8,3 deoarece ionii de glicină se deplasează prin
acest gel. În stiva creată, fiecare zonă proteică se află într-un câmp electric scăzut care se mișcă
în față și un câmp electric ridicat aflat în spatele ei. Orice moleculă de proteină avansează în zona
din fața sa unde întâlnește un câmp electric cu intensitate scăzută, fiind încetinită până când zona
sa îl va prelua. Invers, o moleculă proteică care provine spatele acestei zone este accelerată de
câmpul electric crescut de acolo. În starea de echilibru, fiecare dintre proteine este concentrată
într-o zona îngustă, de înaltă densitate, determinată exclusiv de mobilitatea sa, în condiţii
electroforetice.
Separarea. În cazul în care regiunile mobile se deplasează în ajung la
interfaţa dintre gelul de concentrare (stivuire) şi gelul de rezolvare, proteinele
vor fi încetinite accentuat datorită existenței porilor restrictivi ai gelului de
separare. În acelaşi timp, pH-ul este brusc crescut la o valoare de 8,8 şi
creşte rapid la un pH de 9,5 deoarece tris-Cl se înlocuieşte cu tris-glicinat.
Mobilitatea efectivă a ionilor de glicinat la pH 9,5 este destul de mare și ca
atare depășește proteinele din probă care sunt încetinite în mișcare de către
porii gelului de rezolvare, migrând chiar în spatele frontului de clorură
(x=1/3) În aceste condiții zonele de proteine devin necomprimate şi începe
să se separe în benzi macroscopice prin cernere moleculară (panel C). In
gelul de rezolvare, proteine se mișcă la pH 9,5. pH-ul de operare a gelului
de separare, egal cu 9,5 a fost introdus în sistemul Ornstein-Davis pentru a
asigura o mobilitate eficientă a glicinatului, mai mare decât cea a celei mai
rapide proteine serice (prealbumina) în geluri cu %T=7,5. După cum are loc
progresul migrării, benzile proteice, inițial foarte subțiri se lățesc într-un ordin
de milimetrii, drept consecință a difuziei și diluției.
Principiul electroforezei pe gel de poliacrilamidă în sistem
discontinuu.
Electroforeza pe geluri de poliacrilamidă în condiții discontinue și denaturante
după protocolul descris de Laemmli.
În cazul unei proteine multimerice, parţial purificate, numărul de subunități şi masa
moleculară a subunităţilor sunt analizate simultan prin electroforeză 2-D cu electroforeza în
gradient de pori pentru prima dimensiune și SDS-PAGE pentru a doua dimensiune. După o
primă electroforeză în gradient de pori în condiții nedenaturante, poziţia proteinelor
multimerice în gel este determinată prin teste specifice acestei proteine pentru estimarea
masei sale moleculare native, după care proteina multimerică este disociată în subunităţile
sale prin tratament cu SDS. Masa moleculară a fiecărei subunități este determinată prin
electroforeză pe gel de poliacrilamidă în prezență de SDS iar numărul de subunități dintr-o
proteină nativă complexă se calculează din aceste valori.
Au fost descrise alte aplicații ale electroforezei în analiza lipoproteinelor, inclusiv lipoproteinelor cu
densitate mare (HDL) precum și a lipoproteinelor cu densitate mică (LDL). În cele mai multe laboratoare de
analiză specializată, metodele uzuale de separare și analiză a lipoproteinelor din ser sunt cele de
ultracentrifugare în gradient de densitate. Un dezavantaj al acestei metode constă din necesarul unui
echipament scump şi personal cu experienţă, în timp ce separarea și analiza acestora prin electroforeză în
gradient de pori este o metodă relativ simplă, necostisitoare, şi sensibilă pentru detectarea subfracțiilor
lipoproteice dintr-un volum mic de ser. În plus, electroforeza în gradient de pori în condiții nedenaturante
separă lipoproteinele, pe baza diferenţelor de dimensiune a particulelor şi astfel poate oferi în mod direct
dimensiunea particulelor, în timp ce separarea ultracentrifugarea în gradient de densitate se bazează pe
diferenţa de densitate, parametru indirect, dependent de dimensiunea particulelor. Dacă, înainte de
electroforeză, în cazul în care lipoproteinele din probă sunt precolorate printr-o tehnică de colorare a lipidelor
(colorare cu negru de Sudan B, de exemplu) migrarea lor poate fi monitorizată în timp real. De exemplu,
HDL poate fi fracţionată în 14 subclase prin electroforeză în gradient de pori în condiții nedenaturante.
În plus faţă de interacţiunea funcţională a proteinelor sau a subunităţilor acestora, reacțiile antigen-anticorp
sunt analizate după separarea prin electroforeză în gradient de pori în condiții nedenaturante. Mobilitatea
unui complex de antigen-anticorp este mai lentă decât cea a unei molecule singulare de antigen. Mai mult
decât atât, un complex al unei molecule de antigen şi doi anticorpi monoclonali care recunosc doi epitopi
distincți migrează mai lent decât un complex format dintr-un antigen şi un anticorp monoclonal. Prin urmare,
prin electroforeză în gradient de pori în condiții nedenaturante se poate determina dacă două anticorpi
monoclonali împotriva acelaşi antigen recunosc epitopi diferiți sau identici, și astfel este posibil realizarea
unui studiu de cartografiere a epitopilor prin electroforeză pe gel.
se poate realiza de asemenea, studiul complexelor ADN-proteine. În analiza de modificare a mobilității
electroforetice (electrophoretic mobility shift assay, EMSA), EMSA cu electroforeza în gradient de pori în
condiții nedenaturante are o capacitate de rezoluţie înaltă şi este utilă pentru analiza complexele ADN-
proteine care conțin proteine diferite ori pentru detectarea unor proteine de legare a de ADN mutanți.
ELECTROFOREZA PE GELURI DE
POLIACRILAMIDĂ ÎN PREZENȚA
BROMURII DE CETIL-TRIMETIL-AMONIU
nu este nimic altceva, decât un sistem de gel folosit în BN-PAGE, fără a utiliza
colorantul CBB
Proteinele, ca molecule amfotere, posedă sarcini nete pozitive, negative, sau neutre în
funcţie de pH-ul de mediului în care se află dizolvate. Sarcina per ansamblu a unei proteine
particulare este determinată de resturile de aminoacizi acizi sau bazici ionizabili de pe
catenele polipeptidice și de grupările protetice. Grupările carboxilice acide (-COOH), din
proteine sunt neionizate în soluţii acide şi disociază în formă anionică (-COO-), la valorile ale
pH-ului mai mari, de mai sus de pH=3,0. Grupările amino (-NH2) şi alți compuși de bază din
proteine, cum ar fi guanidinele, sunt neîncărcate electric la un pH alcalin, dar devin cationi la
un pH mai în jur de 10,0 (de exemplu,-NH3+). pH-ul la care o catenă polipeptidică disociază
este afectat de compoziția totală a proteinei și de proprietățile mediului în care se află
dizolvată. Ca urmare, fiecare grupare individuală ionizabilă dintr-o proteină are un punct
aproape unic de disociere.
Sarcina netă a unei proteine este suma algebrică a tuturor sarcinilor sale, pozitive şi
negative. După cum s-a mai amintit în acest capitol, există un pH specific pentru fiecare
proteină la care sarcina netă care o posedă este egală cu zero. Această valoare este
denumită pH izoelectric (pI) este o proprietate caracteristică fizico-chimică specifică fiecărei
proteine. În cazul în care numărul de grupări acide dintr-o proteină depăşeşte numărul de
grupări bazice, pI-ul proteinei va avea o valoare scăzută a pH-ului. Pe de altă parte, în cazul
în care numărul grupărilor bazice sunt mai numeroase decât cele acide, pl-ul va fi înalt.
Proteinele arată variaţii considerabile ale punctelor izoelectrice, dar valorile pl-urilor se
încadrează de obicei, în intervalul de pH cuprins între 3 și 10.
În general, IEF se efectuează în condiţii nedenaturante, fiind o tehnică de înaltă
rezoluţie. Deseori, rezoluţia a două proteine diferite se realizează la valori ale
pI-ului lor de doar 0,02 unităţi de pH, sau mai puţin. Din cauza acestei înaltei
rezoluţii, probe de proteine care par a fi omogene atunci când sunt testate prin
alte mijloace poate fi adesea separate în mai multe componente prin IEF. Astfel,
microheterogenitatea poate fi un indiciu dat de diferenţe în structura primară,
existența unor izomeri conformaționali, a unor diferenţele de tipuri şi de număr
de grupări prostetice, sau de denaturare a proteinei.
În funcție de proprietățile proteinei (proteinelor) luate în studiu și în funcție de
scopul urmărit, trebuie avut în vedere:
- compoziția chimică, concentrația și structura gelului (de poliacrilamidă ori
agaroză);
- forma gelului (gelul poate fi cilindric sau plat);
- condițiile de separare (IEF, CA-IEF).
REZOLUȚIA DE SEPARARE ÎN FOCALIZAREA IZOELECTRICĂ
Izotacoforeza sau electroforeza de dizlocuire, după cum a fost denumită la un moment dat, este o
dezvoltare mai recentă a principiului descris în 1920, fiind o metodă de separare în funcție de
sarcina electrică. Ea se utilizează pentru separarea particulelor care se deosebesc în special prin
încărcătura electric netă și nu prin dimensiuni fizice, vitezele de separare ale fracțiunilor din
probă, după ce separarea este completă, când s-a atins o stare de echilibru, sunt egale, de unde și
denumirea acestei metode. În această tehnică electrolitul dintre cei doi electrozi nu este o singură
soluție uniformă, ci este formată dintr-o secvență discontinuă de soluții diferite (figura de mai
jos), în care ionii acestora migrează cu aceeași viteză (iso = egal, tachos = viteză, phoresis =
migrare).
Izotacoforeza este similară ”stivuirii”, concentrării în faza staționară sau
electroforezei zonale în sisteme multifazice. În practică, totuși se face distincție
între aceste metode. Concentrarea în faza staționară se realizează în două moduri:
•Concentrarea selectivă (selective stacking) prin care componentul/componentele
de interes sunt incluse în fronul mobil, iar celelalte componente rămân în afara
acestuia (unstacked). Este de altfel cazul izotacoforezei;
•Excluderea selectivă (selective unstacking) prin care componentul/componentele
de interes sunt excluse selectiv din frontal mobil, iar celelalte componente sunt
incluse în acesta.
Separarea componentelor printr-un model de tren ionic
Colorația reversibilă cu cupru este o metodă realizată într-o singură etapă pentru
detectarea rapidă a proteinelor fracţionate prin SDS-PAGE. În această tehnică nu
este necesară o etapă de decolorare. Colorarea se bazează pe interacţiunea ionilor
de cupru cu poliacrilamida şi cu proteinele separate. Tehnica de colorare implică
precipitarea ionului de cupru în gel care astfel devine verde opac, în timp ce SDS
previne legarea ionului de cupru la proteine, rezultând astfel o imagine negativă. În
final se evidențiază benzi clare de proteine pe un fundal semiopac albastru-verzui de
poliacrilamidă. Benzile proteice sunt vizualizate în mai putin de 5 minute.
Sensibilitatea colorației reversibile este cuprinsă între 0,5ng și 12ng/bandă proteică.
Colorarea nu interferă cu tehnicile ulterioare de electroeluție a proteinelor și nu
modifică proprietăţile biologice ale acestora. Gelurile colorate reversibil cu ioni de
cupru pot fi decolorate în 20-25 de minute, înainte de transferul sau electroeluția
proteinelor din gel. Un dezavantaj major totuși, este că această colorațioe nu este
compatibilă cu gelurile native
În cazul BSA sensibilitatea metodei ajunge la 0,5-10 ng proteină/bandă, fracțiile proteice fiind
vizibile după o separare pe un gel de poliacrilamidă cu T=12%. În cazul gelurilor cu o concentraţie
mai mică de 12% sensibilitatea scade din cauza creșterii dimensiunilor porilor, cu consecință în
creșterea procesului de difuziune a benzilor de proteine.
COLORAȚIA NEGATIVĂ IMIDAZOL-SDS-ZINC
Lipoproteinele
Precolorare cu Sudan Black
Glicoproteinele
Colorare cu sulfit de fucsina (reactiv Shiff) in conditii oxidante realizate cu
acid periodic;
Colorare argentica
Colorare cu Alcian blue (glicoproteinele acide)
Colorare cu izocianat de fluoresceina (FTIC)- lectinebenzi fluorescente
COLORAȚIA FLUORESCENTĂ
ce lulozã
O
+
CH2 N N]
Nitrocellulose
PVDF (polyvinylidene difluoride)
Tipuri de membrane utilizate în
transferul de proteine
Protein transfer systems
• Proteins migrate to the membrane
following a current (I) that is generated by
applying a voltage (V) across the
electrodes, following Ohm‟s law:
• V=IxR
• where R is the resistance generated by
the materials placed between the
electrodes (that is, the transfer buffer, gel,
membrane, and filter papers)
METODE DE DETECŢIE A PROTEINELOR PE MEMBRANĂ DUPĂ TRANSFER
ELECTROFORETIC
Înaintea oricărei separări şi localizări este necesar a cunoaşte proprietăţile enzimei luate în studiu,
precum pH-ul optim, necesităţile în cofactori, inclusiv a cationilor şi a cosubstratelor. Detergenţii,
agenţii de oxidare sau alţi factori detrimentali care pot influenţa activitatea enzimatică precum
pH-ul şi mediul ionic trebuie monitorizaţi cu stricteţe, atât în timpul preparării probei cât şi în
timpul procesului electroforetic. Ieste bine de notat că prezenţa coloranţilor de evidenţiere a
migrării pot ei însuşi să denatureze ireversibil o serie de enzime. Înaintea electroforezei este
esenţial a se determina concentraţia proteică şi a se efectua un test convenabil al activităţii
enzimatice. O cantitate de 1 până la 10 g de proteină pură reprezintă optimul în timp ce
amestecurile de proteine pot conţine până la 100 g. Este important a alege o cantitate optimă de
soluţie proteică care să prezinte o activitate bine-decelată în urma procesului de evidenţiere
postelectroforetică, o cantitate prea mică făcând dificilă identificarea enzimei în timp ce o
încărcare mare va conduce la suprapunerea benzilor şi la o distorsiune a lor. Electrofocusarea este
pe departe mult mai sensibilă la supraîncărcare, după cum proteina va distorsiona în gradientul de
pH.
În condiţiile în care toate informaţiile pertinente sunt obţinute, este necesar un
experiment pilot în determinarea activităţii enzimatice. În acest scop, este preparat un
gel care conţine toate componentele necesare în timpul procesului de separare
electroforetică. Proba este plasată într-un godeu şi lăsată să difuzeze în matricea
gelului, fără migrare electroforetică. Metoda de detecţie este astfel testată fără separare
electroforetică, în scopul stabilirii prezenţei sau absenţei agenţilor denaturanţi ori a
inhibitorilor în gel. Dacă testele preliminarii relevă o inactivare a enzimei, trebuie
aleasă şi testată o altă strategie de evidenţiere în scopul menţinerii activităţii
enzimatice în timpul procesului electroforetic.
Cele mai comune şi nedorite componente inhibitorii ale gelului de poliacrilamidă sunt
iniţiatorii reacţiei de polimerizare, persulfatul şi riboflavina, monomerul de acrilamidă
nepolimerizat şi acidul acrilic, deseori prezent în amestecul de polimerizare. Există o
serie de căi în limitarea a efectului acestor componente. De exemplu, pre-electroforeza
gelului de separare, singur, înaintea polimerizării gelului de concentrare va elimina
iniţiatorii reacţiei de polimerizare care au capacitatea de a oxida grupările tiol deseori
implicate în actul catalitic. O altă tehnică este aceea de a adăuga acid cisteic la
tamponul de migrare, care va "curăţa" gelul de peroxizi datorită faptului că acest acid
va migra alături de ionul lider, conducător. Alternativ, gelurile subţiri (de 1 mm sau
mai mici) pot fi imersate şi umectate într-un tampon care conţine ditiotreitol în scopul
îndepărtării oxidanţilor. Eliminarea acidului acrilic poate fi realizată prin
recristalizarea monomerului de acrilamidă chiar înaintea polimerizării.
PRINCIPIILE LOCALIZĂRII “IN SITU”A
ENZIMELOR
– Captura simultană a produsului reacţiei enzimatice. Produsul reacţiei este cuplat cu un
reactiv care conduce la obţinerea unui produs colorat. Această tehnică este utilizată în toate
cazurile în care enzima rămâne activă în prezenţa reactivilor de colorare. Marele ei avantaj este
reprezentat de faptul că procedura este realizată într-o singură treaptă, fără o difuzie
substanţială a enzimei în gel.
– Postincubarea cuplată a substratului. Această tehnică necesită o metodologie în două trepte.
Incubarea enzimei prezente în gel cu substratul este urmată de incubarea cu un reactiv ce
permite formarea unui produs secundar colorat şi insolubil. În cazul acesta, difuziunea se
manifestă în timpul perioadei iniţiale de incubare a gelului cu substratul.
– Metode autocromice. Evoluţia activităţii enzimatice poate fi urmărită în mod direct prin
observarea modificărilor proprietăţilor optice precum absorbţia luminii sau fluorescenţa, produsă
de substrat sau de către produsul de reacţie. O serie de substrate sau coenzime îşi modifică
proprietăţile optice în lumină vizibilă sau ultra violetă în timpul reacţiei enzimatice. Schimbarea
fluorescenţei serveşte de asemenea ca indicator în cazul metodelor autocrome.
– Analiza indicator-matrice. Enzimele de cuplare auxiliare şi substratele cu masă moleculară
mare necesită o incubare a gelului cu un strat care conţine o matrice indicatoare, un gel
suplimentar, indicator. Incubarea de tip sandwich a gelului de separare şi indicator conduce la
localizarea activităţii enzimatice. O variantă a acestei tehnici o reprezintă incubarea după
separare cu o matriţă pe care proteina a fost transferată şi imobilizată. Astfel, după separare,
proteina este transferată din gel pe membrană prin tehnicile descrise ca Western blotting.
– Copolimerizarea substratului în gelul de separare. Substraturile cu masă moleculară mare
precum polimerii carbohidraţi, proteinele sau acizii nucleici pot fi copolimerizaţi în gelul de
separare. Acest procedeu poate totuşi influenţa separarea enzimei. În timpul electroforezei,
activitatea enzimatică poate fi stopată prevenindu-se astfel acţiunea ei asupra substratului, de
exemplu prin utilizarea unor inhibitori reversibili precum SDS. După separare, gelul este spălat în
tampon fără detergent, ceea ce conduce la renaturarea sa. O altă cale de prevenire a activării
enzimei în timpul procesului de electroforeză este reprezentată de incubarea cu diverşi agenţi
chelatori care leagă ionii metalici esenţiali. După finalizarea procesului de separare gelul este
incubat în tampon care conţine cationul esenţial într-o concentraţie mai mare decât cea a
agentului chelator, şi prin aceasta se restabileşte activitatea.
Oxidoreductaze- Detecţia directă a enzimelor
NAD- şi NADP-dependente prin conversia
coloranţilor tetrazolici la formazani
Aplicarea cu succes a acestei metode necesită ca sensul reacţiei enzimatice să
conducă la oxidarea substratului cu reducerea concomitentă a coenzimei
(formarea de NADH ori NADPH) Echivalenţii de reducere sunt apoi transferaţi
spre colorantul tetrazolic, reacţie de cele mai multe ori mediată de fenazin
metosulfat; astfel prin reducerea sării de tetrazoliu rezultă formazan, colorat şi
insolubil. Stoichiometria transferului necesită un echivalent de reducere la o
pereche de electroni transferaţi pentru formarea unui formazan din sărurile
monotetrazolice şi doi echivalenţi pentru sărurile ditetrazolice. Astfel, sărurile
monotetrazolice precum MTT (bromură de 3-(4,5-dimetiltiazol-2-il)-2,5-
difeniltetrazoliu, tiazolil blue) sunt mult mai sensibile decât sărurile de sărurile
de ditetrazoliu. De exemplu, NBT (clorura de 2,2'-di -p-nitrofenil-5,5'-difenil-3,3'-
(3,3'-dimetoxi-4,4'-difenilen) tetrazoliu, în condiţiile reducerii incomplete,
conduce la un formazan de culoare roşie, în timp ce forma total redusă este
albastră.
N
N+
CH3OSO3
CH3
• NAD+, 1 mg/ml,
• PMS, 0,02 mg/ml,
• Nitro blue tetrazoliu,
0.2 mg/ml,
• Etanol, 0.1 M
Detecţia enzimelor NAD- şi NADP-dependente prin iluminare UV
În general, hidrolazele sunt cele mai stabile enzime dintre toate clasele sus
menţionate. Substraturile cromogene pentru multe dintre ele sunt
disponibile comercial, evoluţia reacţieie putând fi monitorizată direct, în
lumină vizibilă, ori în UV. Substraturile sau produşii care-şi schimbă
proprietăţile fluorescente sunt deasemenea larg utilizaţi datorită tehnicilor
de mare sensibilitate. Hidrolazele pot fi deasemenea localizate prim
metode de cuplare cu derivaţi azoici, în care substratul hidrolizat
reacţionează cu săruri de diazoniu, precum Fast Red TR ori Fast Blue
RR.
CENTRIFUGAREA
1 2 1 2 g d 1 2 2
wg d
18 2 18 2
unde:
wg- viteza de sedimentare în câmp gravitaţional;
d – diametrul particulelor care sedimentează;
1- densitatea particulelor;
2- densitatea lichidului;
g – acceleraţia gravitaţională
- vâscozitatea cinematică a lichidului
Viteza de sedimentare în câmpul gravitaţional depinde de mărimea
particulelor care sedimentează şi de constantele fizice (1,2, ) ale sistemului
dispers. Rezultă că viteza de sedimentare nu poate fi schimbată decât prin
schimbarea proprietăţilor sistemului, de exemplu prin mărirea particulelor
(coagulare) sau prin micşorarea vâscozităţii (încălzire). O altă posibilitate de
mărire a vitezei de sedimentare este de a lucra într-un câmp de forţe
caracterizat printr-o acceleraţie mai mare decât cea gravitaţională, ceea ce se
poate realiza prin centrifugare.
Într-o centrifugă viteza de sedimentare nu este constantă din cauza câmpului
neomogen a cărui intensitate creşte cu distanţa de la centru.
Durata de sedimentare, adică timpul necesar ca particula cu diametrul d să
parcurgă un strat de lichid egal cu ( R2-R1) se deduce cu ajutorul vitezei medii:
1 2 1 2 w R 2
w R 2
w0,c d w0, g w0, g z
18 2 g
Efectele sedimentării într-un câmp de forţe centrifuge sunt:
• viteze mari de sedimentare;
• sedimentarea particulelor mai fine, adică o separare mai
înaintată a celor două faze din care este format sistemul dispers;
• separarea sistemelor disperse cu diferenţă mică între densităţile
1 şi 2 ale celor două faze.
Ultracentrifugarea zonala
• Svedberg- separarea particulelor in câmp
centrifugal
• Intensit cp. Centrifugal
a = x•ω2 x=pozitia radiala
ω=viteza unghiulara
ω = 2π•η
a = x• (2π•η)2
a = x•ω2 / g
• F = me•xω2 me= m-ms
• Fef = m•xω2 - ms•xω2
• Vp=volum particula de masa m
• ρp= densitatea particulei
• ρl = densitatea lichidului
• ms=Vp• ρp
• Fef = m•xω2 - m•(ρl / ρp) xω2
• s = v / a = dx/dt/x•ω2
• Unitate svedberd 1s = 10-13sec
• s = so / (1 + kc) so = val. Coef. la conc. = 0
sRT
M= l
D(1- )
p
Factorii care influenteaza
sedimentarea particulelor
• Raza particulei
• Vâscozitatea
• Densitatea mediului