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Inclut tous les éléments du biofilm autre que les microorganismes: eau
(jusqu’à 97 %), polymères polysaccharidiques secrétés par les
microorganismes, produits de dégradation et de substances provenant du
milieu extérieur
Stromatolithes
B. subtilis / racine d’Arabidopsis Shark Bay (Australie)
S. aureus / cathétère
Plaque dentaire
COMMENT EST FORMÉ LE BIOFILM ?
1ère étape: “conditionnement” de la surface
Flagelles
Monotrich
e
Péritrich
Flagelles TTSS e
3ème étape: adhérence à la surface
Attachement
réversible à ce stade
-Contraintes physiques
-Disponibilité de nutriments (la disponibilité de glucose est
un paramètres inducteurs du détachement)
- Signaux intercellulaires (pas liés directement au QS)
AVANTAGES ET CONSÉQUENCES DU MODE DE VIE
BIOFILM
Coopérations métaboliques et échanges d’informations au
sein du biofilm
Cette résistance accrue, multifactorielle, est liée aux conditions de vie dans
le biofilm (hétérogénéité, accès aux nutriments, oxygène etc.)
Les antibiotiques sont en effet très peu efficaces contre les biofilms et les
symptômes peuvent réapparaître une fois le traitement fini
Protection vis-à-vis du système immunitaire
Les cellules phagocytaires libèrent des enzymes qui ont très peu d’effet sur
le biofilm et qui peuvent endommager les tissus
Les biofilms constituent ainsi des réservoirs d’infections: chez les personnes
atteintes de mucoviscidose, par exemple, la bactérie Pseudomonas aeruginosa
infecte les tissus pulmonaires. L’infection s’établit de manière chronique et
conduit à des endommagements mortels du tissu pulmonaire
Planctonisation,circulation
systémique de bactéries
(streptocoques) issues du
biofilm de la plaque dentaire
Végétation
endocarditique
valvulaire = biofilm
Biofilm et inflammation chronique
Une fois un biofilm établi, sa fragmentation brutale peut
causer des emboles métastatiques dramatiques (embole
septique cérébrale)
Processus d’inflammation
chronique/récidivante
Enclume
Marteau Etrier
Oreille
moyenne
Tympan
Trompe d’ Eustache
Otite
Moyenn
Otite moyenne
e
Inflammation
et
épanchement
La formation des biofilms sur les métaux peut également engendrer des
problèmes de corrosion: en effet, associés à des surfaces métalliques, les biofilms
de bactéries anaérobies sont à l’origine de réactions chimiques corrosives,
susceptibles d’endommager, d’obturer et de contaminer durablement les
systèmes de circulation de fluides
Les biofilms sont employés pour traiter les eaux usées et les décharges, pour
dépolluer des sites contaminés et enfin, pour mobiliser les métaux lourds d’un sol
ou d’un déchet par le procédé de biolixiviation
Peut-on élargir le concept de biofilm ?
Fusobacterium nucleatum (rouge),
Streptococcus oralis (bleu),
Actinomyces naeslundii (vert)
(salive)
Biofilms complexes
Biofilms intracellulaires
? Biofilms viraux ?
Autres…?
Biofilms polymicrobiens
Bien que la plupart des travaux expérimentaux soient réalisés
avec une seule espèce microbienne, la réalité est celle de
communautés plurimicrobiennes.
Dynamique des communautés complexes évoluant comme
la résultante de coopérations (symbioses vitales) et de
compétitions (antagonismes mortels).
Plaque dentaire: plus de 500 espèces bactériennes
différentes coexistantes, la moitié incultivables.
Streptococcus gordonii
Fermentation des sucres (production de lactate)
Veillonella atypica
Utilise les produits de fermentation
(lactate)
Pseudomonas aeruginosa
Diminution du niveau
de production de
quinolone et de
pyocyanine
3-oxo-C12HSL
Prédation
Acidification :
L’effet inhibiteur des acides est attribué à une forme non dissociée
La génomique microbienne peut nous aider à comprendre quelle est l’action des
micro-organismes, comment ils agissent et comment ils peuvent être manipulés à
notre avantage
La génomique microbienne dans la production et la
transformation des produits alimentaires
Outils:
D’autres applications
L’étude des pré biotiques et des pro biotiques, la description des réponses au
stress, l’étude de l’écologie microbienne et, ce qui n’est pas négligeable, la mise
au point de procédures d’évaluation des risques
Réponse physiologique des
microorganismes aux fluctuations des
paramètres physico-chimiques de
l'environnement
Adaptations thermiques
Mise en oeuvre de mécanismes permettant la détection du stress, quelle
qu’en soit la nature (thermique, acide…)
Réponse au choc thermique " heat shock response " l’universalité de la "
réponse au choc thermique " l'induction rapide et vigoureuse de l'activité de gènes
spécifiques lors de stress (les " heat shock genes "), accompagnée par la répression
d'autres séquences géniques
Protéases énergie-dépendantes
Stress osmotique
Choc hypertonique Choc hypotonique
H2O
Plasmolyse Turgescence
Osmoprotection
Les bactéries se défendent selon deux voies :
La compartimentation cellulaire
Au niveau génétique