Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
LP
- Analiza citogenetică a etapelor diviziunilor celulare la specii: vegetale, animale şi la om
- Ciclul de viaţă şi identificarea de mutante la Drosophila melanogaster
- Tipuri particulare de cromozomi: cromozomii politeni
- Cultura de sânge periferic
- Cariotipul uman normal şi patologic
- Pedigree
BIBLIOGRAFIE SELECTIVĂ
- Celis J. 2014.Cell Biology. A laboratory handbook. 5th edition. Academic Press, ISBN 0-12-
164715-3 (v.1), 0-12-164716-1 (v.2),0-12-164717-X (v.3)
- Ecovoiu Al., Georgescu M. 2003. Drosophila melanogaster – Model experimental în genetică.
Editura Ars Docendi, Bucureşti
- Rosenberg L.E., Rosenberg D.D. 2012. Human Genes and Genomes: Science, Health, Society
ISBN: 978-0-12-385212-0
CICLUL CELULAR
✓ Ciclu celular = totalitatea evenimentelor care au loc într-o celulă între 2 diviziuni celulare succesive
interfază + diviziune celulară
➢ Interfaza
- 90% din durata ciclului celular
- 3 faze succesive:
G1 - faza presintetică
- G (gap = gol – lipsa sintezei de ADN)
- sinteză de ARN şi proteine
- acumulare ATP
- creştere numărul de organite celulare
- reorganizare nucleoli
-cromozomi – monocromatidici
S – faza de sintezăADN
- replicarea ADN = dublarea cantităţii de material genetic
- cromozomi bicromatidici
- se continuă sinteza de ARN şi de histone
G2 - faza postsintetică
- se continuă sinteza de ARN şi de proteine
- se sintetizează în cantităţi mari: tubuline, actina şi miozina
- cromozomi bicromatidici
- cea mai scurtă, ca timp, din durata interfazei
CONTROLUL CICLULUI CELULAR
- asigurat de complexe proteice alcătuite din 2 subunităţi: cicline + cicline dependente de proteinkinaze
ciclina - componentă reglatoare
CDK - acţiune catalitică
- acţionează ca proteinkinază
p 53 = ‘’gardianul genomului’’- blochează celula în faza G1, dacă ADN prezintă leziuni
ELEMENTE DEFINITORII PENTRU CROMOZOM
Cromatina
- substanţa nucleară din care se formează cromozomii
- acizi nucleici (ADN şi ARN) + proteine histonice şi non-histonice (la eucariote)
Cromatida
- subunitatea longitudinală a cromozomului
- prezintă 2 braţe: braţul scurt (p) - situat deasupra planului ecuatorial
braţul lung (q) – situat dedesubtul planului ecuatorial
Centromerul
- zona din cromozom unde cromatina este cea mai îngustată
- unește cele 2 braţe ale cromatidei
- reper cromozomial care, prin poziţia sa, determină forma cromozomului
Referinţă: B.A.Pierce: Genetics-A Conceptual Approach. Fig. 2.7. p. 20. 4 th ed. Referinţă: B.A.Pierce: Genetics-A Conceptual Approach. Fig.
2.8. p. 20. 4th ed. 2012, W.H.Freeman and Company, New
2012, W.H.Freeman and Company, New York ISBN-13: 978-1-4292-3250-0 ISBN- York ISBN-13: 978-1-4292-3250-0 ISBN-10: 1-4292-3250-1
10: 1-4292-3250-1
DIVIZIUNEA CELULARĂ MITOTICĂ
Rezultatul mitozei
2n
2n
2n
Referinţă: B.A.Pierce: Genetics-A Conceptual Approach. Fig. 2.10. p. 23. 4 th ed. 2012, W.H.Freeman and Company, New York ISBN-13: 978-1-4292-
3250-0 ISBN-10: 1-4292-3250-1
Allium cepa (ceapa)
Metoda Feulgen
Analiză la M.O.
Studiul diviziunii mitotice în meristemul radicular de ceapă (Allium cepa)
Metoda Feulgen
Etape
- Secţionarea în mijlocul unei lame din sticlă a 0,5 – 1 mm din vârful colorat al radicelei, cu un ac spatulat
- Se îndepărtează restul radicelei
- Se adaugă o picătură de colorant (carmin-acetic) peste vârful secţionat al radicelei. Se aşteaptă 2 min.
- Deasupra vârfului colorat se plasează o lamelă
- Se absoarbe cu o hârtie de filtru excesul de colorant
- Se aplică tehnica squash (presare), cu un băţ de chibrit
- Se observă preparatul citogenetic la microscopul optic, cu obiective: 10x – 40 x
- Se identifică etapele ciclului celular, cu accent pe diviziunea celulară, în special pe metafaze
- O metafază ‘’ideală’’ cuprinde toţi cromozomii speciei analizate vizibili într-un singur câmp microscopic,
perfect individualizaţi şi fără suprapuneri
Colecţie preparate microscopice din laboratorul de Genetică, Facultatea de Biologie, Universitatea din Bucureşti; fotografii realizate de Pojoga Daniela
DIVIZIUNEA CELULARĂ MEIOTICĂ
https://www.youtube.com/watch?v=16e
nC385R0w
Referinţă: B.A.Pierce: Genetics-A Conceptual Approach. 2012, 4th ed. fig. 2.13. p. 26
. W.H.Freeman and Company, New York ISBN-13: 978-1-4292-3250-0 ISBN-10: 1-
4292-3250-1
Meioza primară (I) – diviziunea reducţională
- celulă diploidă (2n) → 2 celule haploide (n)
Profaza I
- complex sinaptonemal (CS) = 2 elemente laterale (EL1 + EL2) şi un element central (EC)
elementele laterale = cei 2 cromozomi omologi din bivalent
elementul central – rezultă prin interdigitarea unor fibrile proteinice
fibrilele proteinice - în spaţiul dintre cromatidele surori, apoi emerg prin transpoziţie şi se interdigitează
→EC
CS = EL1 + EC + EL2
- caracteristica meiozei – formarea CS
- funcţiile CS: - menţine conectaţi cromozomii omologi
- facilitează desfăşurarea ULTERIOARĂ a procesului de crossing-over
5. Diakineză (gr. dia - divergent, kinesis – mişcare) - cromozomii ating maximul de condensare
- chiasmele sunt împinse de forţe electrostatice către extremitaţile bivalenţilor → formaţiuni de
tip: ‘’inel” – cei 2 cromozomi bicromatidici din bivalent rămân asociaţi ‘’cap-la-cap” (telomer-la-
telomer) (end to end), fiind uniţi prin chiasme
‘’cruce”- cei 2 cromozomi bicromatidici din bivalent rămân asociaţi ‘’spate-în-spate” (latură-
pe-latură) (side by side), cu chiasma în centru
- începe formarea fusului de diviziune
Meioza I
Metafaza I
– bivalenţi aşezaţi de o parte şi de alta a axei lungi a fusului de diviziune
- prin forţele de respingere dintre cei 2 centromeri ai bivalentului are loc îndepărtarea cromozomilor omologi
unul de celălalt
- la ecuatorul celulei – rămân chiasmele, care ţin uniţi cromozomii omologi din bivalent
Anafaza I
- se rup chiasmele
- cromozomii omologi bicromatidici migrează fiecare către un pol al celulei
- centromerii nu se divid → către fiecare pol migrează doar jumătate din numărul iniţial de cromozomi, în mod
egal
Referinţă: Hartl D.I. & Jones E.W. 1998. Genetics. Principles and Analysis, 4th ed. fig. 3.11, p. 95. Jones and Bartlett Publishers Inc., USA, ISBN 0-7637-0489-X
Meioza
Telofaza I
–cromozomii bicromatidici au ajuns la polii celulei
- începe formarea unei noi membrane nucleare la fiecare pol celular
- rezultă 2 nuclei haploizi (n)→ diada
Citokineza
- formarea a 2 celule fiice
- fiecare celulă fiică are un număr haploid de cromozomi bicromatidici
- cele 2 cromatide ale fiecărui cromozom pot fi diferite între ele ca urmare a crossing-over-ului
Interkineza
- perioadă scurtă între meioza I şi meioza II
- numărul de cromozomi nu se modifică
Profaza II
- filamentele de cromatină ale cromozomilor se condensează
- membrana nucleară se degradează
- începe să se formeze fusul de diviziune
Metafaza II
- se finalizează formarea fusului de diviziune
- cromozomii migrează către planul ecuatorial al celulei → placa metafazică sau ecuatorială
- cromozomii se prind de fus cu ajutorul centromerului
Anafaza II
- are loc divizarea centromerilor cu separarea cromatidelor surori
- fiecare cromatidă soră migrează către un pol al celulei
Telofaza II
- se produce despiralizarea şi decondensarea cromozomilor ajunşi la cei doi poli
- se formează câte o membrană nucleară în jurul fiecarui set haploid de cromozomi
Citokineza
- rezultă 4 celule haploide care au un număr de cromozomi monocromatidici de 2 ori mai mic decât celula
mamă
- cele 4 celule formeaza o tetradă, fiind precursorii gameţilor
Meioza I
Rezultatul meiozei
celula mamă diploidă (2n) → 4 celule fiice haploide (n)
meioză II n
meioză I n
2n meioză II n
meioză I meioză II n
n
meioză II n
Cultură de Triticale
Studiul diviziunii meiotice la Triticale
Etape
- Secţionarea în mijlocul unei lame din sticlă a unei antere din mijlocul spiculeţului, cu
un ac spatulat
- Se îndepărtează restul anterei
- Se adaugă o picătură de colorant (carmin-acetic). Se aşteaptă 3 min.
- Deasupra se plasează o lamelă
- Se absoarbe cu o hârtie de filtru excesul de colorant
- Se aplică tehnica squash (presare), cu un băţ de chibrit
- Se observă preparatul citogenetic la microscopul optic, cu obiective: 10x – 40 x
- Se identifică etapele meiozei
Diviziunea celulară la plante
Zigoten Diploten
Etape ale meiozei I la secară şi la Triticale
Metafază I Anafază I
Metafaze I
Telofază I, cu micronuclei
Etape ale meiozei II la secară
Colecţie preparate microscopice din laboratorul de Genetică, Facultatea de Biologie, Universitatea din Bucureşti; fotografii realizate de Pojoga Daniela
Etape ale meiozei la secară
Fotografie din colecţia de fotografii a laboratorului de Genetică, Facultatea de Biologie, Universitatea din Bucureşti
Etape ale meiozei la Lilium longiflorum (crin)
Profaza I in microsporocitele de Lilium Alte etape ale Meiozei I
longiflorum
Referinţă: Hartl D.I. & Jones E.W. 1998. Genetics. Principles and Analysis, 4th ed.
Referinţă: idem fig. 3.10 p. 94.
fig. 3.8, p. 92. Jones and Bartlett Publishers Inc., USA, ISBN 0-7637-0489-X
Principalele componente ale microscopului optic
Microscop optic
oculare
Buton on/off
Obiective Buton reglare
10x, 20x, 40x, 100 x intensitate lumina
Platforma lama
macroviza
Diafragma si lentile ce
focalizeaza lumina
Sursa de microviza
lumina
Vă mulţumesc pentru atenţie!
https://www.pestcontrol-expert.ro/wordpress/wp-content/uploads/2015/02/Drosophila_melanogaster_Copy_.jpg
Mediu de cultura:
✓ Banana
✓ Zahar
✓ Drojdie
✓ Agar
✓ Malai
✓ Acid propionic
✓ Apa distilata
Larva st 1 Larva st 2 Larva st 3 Pupa Adulti
Bw=brown
Wild type - Ochi cafenii – rosiatici cu inaintarea
(ochi caramizii) in varsta
Ry=Rosy W=White
- ochi de culoare rosu inchis - -ochi de culoare alba-
The genome of Drosophila melanogaster (1992). Edited by Dan L. Lindsley and Georgianna G. Zimm.
Mutatii aripi
Cy = Curly
- Aripile curbate in sus si catre inainte
- Homozogotii – letali/pitici
Wild type
Cy
The genome of Drosophila melanogaster (1992). Edited by Dan L. Lindsley and Georgianna G. Zimm.
Ser=Serrate
- Aripi crestate la vârf
- Homozogotii -letali
Wild type
Ser
The genome of Drosophila melanogaster (1992). Edited by Dan L. Lindsley and Georgianna G. Zimm.
Vg=Vestigiale
- Aripile - extrem de reduse
Wild type
Vg
The genome of Drosophila melanogaster (1992). Edited by Dan L. Lindsley and Georgianna G. Zimm.
Mutatii culoare corp
Eb=Eboni
- Corpul de culoare neagra
Wild type
Eb
The genome of Drosophila melanogaster (1992). Edited by Dan L. Lindsley and Georgianna G. Zimm.
Y=yellow
- Culoare corp galbena
Wild type
Y
The genome of Drosophila melanogaster (1992). Edited by Dan L. Lindsley and Georgianna G. Zimm.
Mutatii la nivel de perisori
Sb=stubble
- Perisorii ingrosati si scurtati la ½ lungimea normala
- Homozigotii-letali
Sb
The genome of Drosophila melanogaster (1992). Edited by Dan L. Lindsley and Georgianna G. Zimm.
Mutatii larvare/pupa
Tb=Tubby
- Larve si pupe scurte si indesate
WT=wild type
Atlas of Drosophila morphology: wild type and classical mutants, Nicolas Gompel, Sylwester Chyb, 2013.
Cromozomii politeni
Introducere in studiul cromozomilor politeni
• 1881- profesorul Balbiani (Universitatea din Paris) - nucleii
celulelor glandelor salivare de la larvele de Chironomus
plumosus.
Se intalnesc la:
❑ plante Phaseolus coccineus, P. vulgaris și Vigna unguiculata.
❑ nevertebrate - insecte.
• stadiile larvare - glandele salivare, epiteliu intestinal, rect, tubi Malpighi, corpi graşi,
celule ganglionare, musculare, traheale.
• adulţi - celulele hrănitoare ovariene, tubi Malpighi şi glande accesorii genitale la
femele.
❑ mamifere
• în celulele gigante ale trofoblastului la şoarece, iepure şi şobolan
Interfază: G1, S și G2
Interfază – doar cu fază G1
Profază
Metafază Faza de politenizare
Mitoză:
Anafază Fază G2 modificată
Telofază
2 celule
celula nu se mai divide
ci moare
Politen - în l. gr. polis – multiplu, tenos – filament
ORGANIZARE STRUCTURALA
Procesul de politenizare este format din 3 sub-procese
1. endoreduplicarea
2. condensarea incompletă a materialului genetic
3. unirea centromerilor
1. Endoreduplicarea
- toți cei 8 centromeri (D.melanogaster - 8 cromozomi) se unesc, cu formarea unui corp unic
= cromocentru
Chironomide – pufe de
dimensiuni foarte mari = inele
Balbiani
ROLUL CROMOZOMILOR POLITENI
❖ Sinteza unor produşi necesari într-o cantitate foarte mare, într-un timp
foarte scurt, condiţionând transformarea larvei în pupă
Lungime brate
politeni =
157 x lungime
c r o m o z o m i
somatici
dreapta (Right)/
stanga (Left)
pozitia braţelor dinspre
cromocentru spre
deschiderea lor
Perechile I si II – metacentrici
Perechea III – submetacentrici
Perechea IV – telocentrici ∈ RON
Cromozomi politeni la
Chironomus sp. (2n = 8)
https://www.youtube.com/watch?v=sm3X6HThJNQ
https://www.youtube.com/watch?v=mh7i3nhzXzk
Protocol
Material biologic- larve stadiul III, bine dezvoltate de D. melanogaster
Etape
Mutatii
❖ Forma ochi: B=Bar - Ochii forma de bara verticala, mici la masculi si la femele
homozigote – Femelele heterozigote – ochi forma rinichi
❖ Culoare ochi: Bw=brown - Ochi cafenii, Ry=Rosy - ochi rosu inchis, W=White -ochi
albi
❖ Aripi: Cy = Curly - Aripile curbate in sus si catre inainte; Ser=Serrate -Aripi crestate la
vârf; Vg=Vestigiale - Aripi extrem de reduse
❖ Culoare corp: Eb=Eboni - Corpul de culoare neagra; Y=yellow - Culoare corp galbena
❖ Perisori: Sb=stubble - Perisorii ingrosati si scurtati la ½ lungimea normala
❖ Larve/pupa: Tb=Tubby- Larve si pupe scurte si indesatea
Cromozomii politeni
1881- profesorul Balbiani- nucleii celulelor glandelor salivare de la larvele de Chironomus plumosus.
1933 - Painter - nucleii celulelor glandelor salivare de la Drosophila melanogaster
Structura
Politenizarea-3 sub-procese:
❖ endoreduplicarea (fiecare rundă de replicare NU este urmată de diviziunea nucleului-sute de cromatide/
cromozom – D. melanogaster 512 cromatide/cromozom)
❖ condensarea incompletă a materialului genetic-fibra de 30mn-
▪ benzi (de culoare închisă)-n cromomere dispuse la acelaşi nivel si asociate intim
▪ interbenzi (de culoare deschisă)- fibra de cromatină extinsă
Structura cromomerică vizibilă permanent - interfază permanent extinsă.
!!!!! Cromozomi politeni nu parcurg mitoza.
❖ unirea centromerilor-cromocentru –cromozom unic - D.melanogaster
Rol
Cromozomii politeni - structuri funcţionale.
Cromozomii politeni NU sunt structuri implicate în transmiterea informaţiei ereditare în descendenţă
Perechile I si II – metacentrici
Perechea III – submetacentrici
Perechea IV – telocentrici ∈ RON
Cromozomii politeni sunt independenti – NU
are loc unirea centromerilor in cromocentru!!!
http://doccdn.simplesite.com/d/ee/
48/281756458863184110/29fb0bc
1-9bc4-4e59-aa50-b097eedfd42d/
BchII_G_LP%2BCromozomi%2B
EVIDENŢIEREA
CROMOZOMILOR ÎN
DIVIZIUNE LA ANIMALE SI OM
▪ MITOZA
https://www.youtube.com/watch?v=DwAFZb8juMQ
https://www.youtube.com/watch?v=L61Gp_d7evo
• MEIOZA
https://www.youtube.com/watch?v=-Lx0oLPnRQg
https://www.youtube.com/watch?v=16enC385R0w
• COMPARATIE
https://www.youtube.com/watch?v=Ba9LXKH2ztU
EVIDENŢIEREA CROMOZOMILOR ÎN DIVIZIUNE LA ANIMALE
Model animal - Mus musculus - BALB/c
MEDII SPECIALE
volumului celular
conc.
concentrație extracelulară scăzută intracelulara
M E T A N O L - D E S H I D R AT E A Z A C E L U L E L E ,
DENATUREAZA SI PRECIPITA PROTEINELE IN SITU
Șoc chimic:
ACID ACETIC GLACIAL – STABILIZEAZA ACIZII
NUCLEICI, PREVINE PIERDEREA DE MATERIAL
GENETIC
Soluţia fixatoare:
p
p p
centromer
q q q q
Mus musculus Balb/c
2n=40 – cromozomi telocentrici !!!
cromozomii telocentrici – nu prezinta la
Mitoza
partea superioara centromerului (maduva osoasa femurala)
structuri detectabile prin metode Metafaza
citogenetice clasice
MEIOZA (testicule)
Profaza I
Leptoten Zigoten
Pachiten
Diploten Diploten-Diakineza
Diakineza
Metafaza 2
Pachiten + Metafaza 1
Om - 2n=46 cromozomi
EVIDENŢIEREA CROMOZOMILOR ÎN DIVIZIUNE LA ANIMALE –etape (rezumat)
❖ Colchicinizare - soluţie de colchicină - blocheaza functionarea fusului de
diviziune - blocheaza celule în metafază
Mus musculus
2n=40 – cromozomi telocentrici !!!
CULTURA DIN SANGE PERIFERIC-etape (rezumat)
1. Recoltare sange periferic (limfocitele) – pe anticoagulant (de ex. heparina sodica)
▪ ser fetal bovin: contine factori de crestere si nutrienti → stimuleaza replicarea si impiedica
evolutia celulelor din mediu spre apoptoza
▪ L-glutamină = aminoacid esential pentru functionarea celulelor (sinteza de proteine, sursa de
energie etc.)
▪ soluţie N16 = amestec de 13 aminoacizi si 6 vitamine
▪ fitohemaglutinină (lectina extrasa din Phaseolus vulgaris) = agent mitogen (induce mitoza!!!!!!)
- activarea si transformarea limfocitelor T .
In vivo – antigene specifice
In vitro – agenti mitogeni (ex. Fitohemaglutinină)
▪ antibiotice → se evita infectarea culturii
3. Colchicinizare cu soluţie de colchicină → blocarea limfocitelor în metafază
https://www.pestcontrol-expert.ro/wordpress/wp-content/uploads/2015/02/Drosophila_melanogaster_Copy_.jpg
Mediu de cultura:
✓ Banana
✓ Zahar
✓ Drojdie
✓ Agar
✓ Malai
✓ Acid propionic
✓ Apa distilata
Larva st 1 Larva st 2 Larva st 3 Pupa Adulti
Bw=brown
Wild type - Ochi cafenii – rosiatici cu inaintarea
(ochi caramizii) in varsta
Ry=Rosy W=White
- ochi de culoare rosu inchis - -ochi de culoare alba-
The genome of Drosophila melanogaster (1992). Edited by Dan L. Lindsley and Georgianna G. Zimm.
Mutatii aripi
Cy = Curly
- Aripile curbate in sus si catre inainte
- Homozogotii – letali/pitici
Wild type
Cy
The genome of Drosophila melanogaster (1992). Edited by Dan L. Lindsley and Georgianna G. Zimm.
Ser=Serrate
- Aripi crestate la vârf
- Homozogotii -letali
Wild type
Ser
The genome of Drosophila melanogaster (1992). Edited by Dan L. Lindsley and Georgianna G. Zimm.
Vg=Vestigiale
- Aripile - extrem de reduse
Wild type
Vg
The genome of Drosophila melanogaster (1992). Edited by Dan L. Lindsley and Georgianna G. Zimm.
Mutatii culoare corp
Eb=Eboni
- Corpul de culoare neagra
Wild type
Eb
The genome of Drosophila melanogaster (1992). Edited by Dan L. Lindsley and Georgianna G. Zimm.
Y=yellow
- Culoare corp galbena
Wild type
Y
The genome of Drosophila melanogaster (1992). Edited by Dan L. Lindsley and Georgianna G. Zimm.
Mutatii la nivel de perisori
Sb=stubble
- Perisorii ingrosati si scurtati la ½ lungimea normala
- Homozigotii-letali
Sb
The genome of Drosophila melanogaster (1992). Edited by Dan L. Lindsley and Georgianna G. Zimm.
Mutatii larvare/pupa
Tb=Tubby
- Larve si pupe scurte si indesate
WT=wild type
Atlas of Drosophila morphology: wild type and classical mutants, Nicolas Gompel, Sylwester Chyb, 2013.
Cromozomii politeni
Introducere in studiul cromozomilor politeni
• 1881- profesorul Balbiani (Universitatea din Paris) - nucleii
celulelor glandelor salivare de la larvele de Chironomus
plumosus.
Se intalnesc la:
❑ plante Phaseolus coccineus, P. vulgaris și Vigna unguiculata.
❑ nevertebrate - insecte.
• stadiile larvare - glandele salivare, epiteliu intestinal, rect, tubi Malpighi, corpi graşi,
celule ganglionare, musculare, traheale.
• adulţi - celulele hrănitoare ovariene, tubi Malpighi şi glande accesorii genitale la
femele.
❑ mamifere
• în celulele gigante ale trofoblastului la şoarece, iepure şi şobolan
Interfază: G1, S și G2
Interfază – doar cu fază G1
Profază
Metafază Faza de politenizare
Mitoză:
Anafază Fază G2 modificată
Telofază
2 celule
celula nu se mai divide
ci moare
Politen - în l. gr. polis – multiplu, tenos – filament
ORGANIZARE STRUCTURALA
Procesul de politenizare este format din 3 sub-procese
1. endoreduplicarea
2. condensarea incompletă a materialului genetic
3. unirea centromerilor
1. Endoreduplicarea
- toți cei 8 centromeri (D.melanogaster - 8 cromozomi) se unesc, cu formarea unui corp unic
= cromocentru
Chironomide – pufe de
dimensiuni foarte mari = inele
Balbiani
ROLUL CROMOZOMILOR POLITENI
❖ Sinteza unor produşi necesari într-o cantitate foarte mare, într-un timp
foarte scurt, condiţionând transformarea larvei în pupă
Lungime brate
politeni =
157 x lungime
c r o m o z o m i
somatici
dreapta (Right)/
stanga (Left)
pozitia braţelor dinspre
cromocentru spre
deschiderea lor
Perechile I si II – metacentrici
Perechea III – submetacentrici
Perechea IV – telocentrici ∈ RON
Cromozomi politeni la
Chironomus sp. (2n = 8)
https://www.youtube.com/watch?v=sm3X6HThJNQ
https://www.youtube.com/watch?v=mh7i3nhzXzk
Protocol
Material biologic- larve stadiul III, bine dezvoltate de D. melanogaster
Etape
Mutatii
❖ Forma ochi: B=Bar - Ochii forma de bara verticala, mici la masculi si la femele
homozigote – Femelele heterozigote – ochi forma rinichi
❖ Culoare ochi: Bw=brown - Ochi cafenii, Ry=Rosy - ochi rosu inchis, W=White -ochi
albi
❖ Aripi: Cy = Curly - Aripile curbate in sus si catre inainte; Ser=Serrate -Aripi crestate la
vârf; Vg=Vestigiale - Aripi extrem de reduse
❖ Culoare corp: Eb=Eboni - Corpul de culoare neagra; Y=yellow - Culoare corp galbena
❖ Perisori: Sb=stubble - Perisorii ingrosati si scurtati la ½ lungimea normala
❖ Larve/pupa: Tb=Tubby- Larve si pupe scurte si indesatea
Cromozomii politeni
1881- profesorul Balbiani- nucleii celulelor glandelor salivare de la larvele de Chironomus plumosus.
1933 - Painter - nucleii celulelor glandelor salivare de la Drosophila melanogaster
Structura
Politenizarea-3 sub-procese:
❖ endoreduplicarea (fiecare rundă de replicare NU este urmată de diviziunea nucleului-sute de cromatide/
cromozom – D. melanogaster 512 cromatide/cromozom)
❖ condensarea incompletă a materialului genetic-fibra de 30mn-
▪ benzi (de culoare închisă)-n cromomere dispuse la acelaşi nivel si asociate intim
▪ interbenzi (de culoare deschisă)- fibra de cromatină extinsă
Structura cromomerică vizibilă permanent - interfază permanent extinsă.
!!!!! Cromozomi politeni nu parcurg mitoza.
❖ unirea centromerilor-cromocentru –cromozom unic - D.melanogaster
Rol
Cromozomii politeni - structuri funcţionale.
Cromozomii politeni NU sunt structuri implicate în transmiterea informaţiei ereditare în descendenţă
CARIOTIPUL
UMAN NORMAL
Cariograma - aranjarea ordonată a tuturor cromozomilor unei celule
in perechi, în funcție de mărimea lor și de poziția centromerului.
Cariotipul
formula (scrisă cu cifre și litere) ce descrie numărul cromozomal de baza (2n)
Istoric
G Levitsky – 1924 – notiunea de cariotip
OM
1921- H. Winwarter – 47 in spermatogonii 48 in ovogonii
1922- Painter – 2n=46/48?
1956 – J. H. Tjio, A. Levan – 2n= 46
❖ Celulele somatice – diploide - 2n
Autozomi
Cromozomii
Heterozomi (cromozomi de sex): X, Y
heterozomii (XX/XY)
Importanta cariotip
Acipenser mikadoi
2n= ±268
Cariotipul de baza - 2n=48+/-2
Zebrafish
2n=50
✓ Poliploidia (prezența în nucleu a mai mult de două seturi de cromozomi),
aneuploidia (2n+/-1) şi anomaliile structurale cromozomale (deletii,
duplicatii, inversii etc.) au stat la baza evoluţiei cariotipului in grupa mare
a peştilor.
2n=22 2n=44
Cariotipul reptilian
✓ Toate reptilele conţin număr mare de microcromozomi greu identificabili.
Dimensiuni
p
p
Cei mai mari – perechea 1 – 10% ADN genomic (9,08 µm)
!!!!! Cei mai mici – perechea 21 !!!! -1,5% din ADN genomic (1,68 µm)
(Perechea 22 – 2% din ADN genomic -1,83 µm )
q q q q
Cariotip la barbat
Cariotip la femeie
http://www.rerf.jp/dept/genetics/giemsa_4_e.html
CARIOTIPUL UMAN PATOLOGIC
NOȚIUNI INTRODUCTIVE
Cimponeriu Dănuț
2020
I. Introducere
Istoric
Referință: 1. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1932263/?page=1
2. https://www.karger.com/Article/Pdf/279442
I. Introducere
Localizarea cromozomală
Cariogramă vs Idiogramă
I. Genomice: - Triploidia
- Tetraploidia
- Trisomii
- Tetrasomii
I. Deleţii
II. Duplicaţii
B. Anomalii structurale III. Izocromozomii
IV. Inversii: - Paracentrică (nu include centromerul)
- Pericentrică (include centromerul)
V. Translocaţii: - intracromozomale
- intercromozomale
C. Mozaicism
I. Anomalii genomice
Poliploidizarea în condiții fiziologice
În condiții fiziologice, celulele poliploide în general:
-au dimensiuni mai mari
- au activitate metabolică mai intensă
- sunt mai rezistente la stress/ agenți mutageni
Ex. -ex. cardiomiocitele (au o rată de regenerare <1%/an) sunt supuse unui strss oxidativ crescut
└poliploidizarea este asociată cu- creșterea normală a inimii,
-exercițiile fizice și antrenamentul (ex. la atleți)
Cardiomiocite adulte
Reeferințe: Edwards MJ, Park JP, Wurster-Hill DH, Graham JM Jr. Mixoploidy in humans: two surviving cases of diploid-tetraploid mixoploidy
and comparison with diploid-triploid mixoploidy. Am J Med Genet. 1994 Sep 1;52(3):324-30.
II. Aberații cromozomale numerice
Nondisjuncțiile
= baza aberațiilor cromozomale numerice
- sunt mai frecvente în prima diviziune meiotică (80%)
mai rare în a doua diviziune meiotică (20%)
>5% dintre toate toate sarcinile detectabile clinic au la bază gameți cu număr anormal de cromozomi
II. Aberații cromozomale numerice
1. Sindromul Down
Istoric
-J.E.D. Esquirol (1838) şi Seguin Edouard (1844) descriu fenotipul clinic John Langdon Haydon
- 1862-1866- John Langdon Down definește tipul mongolian de idioţi Down (1828-1896)
„Observaţii privind clasificarea etnică a idioţilor” .
-1959 -Jérôme Lejeune a afirmat că a descoperit relația dintre trisomia 21 și este Sdr Down; afirmație-disputată.
-2014, the Scientific Council of the French Federation of Human Genetics
└ Marthe Gautier recompensată cu Marele Premiu.
-1965- OMS a renunțat oficial la termenul de „mongolism” după o cerere a unui delegat mongol.
-21 .03. 2006 - Prima zi internațională a sindromului Down (proclamată în timpul congresului Asociaţiei Europene a
Sindromului Down, Palma de Mallorca, februarie 2005).
1. Sindromul Down
Frecvenţa:
-1/600-800 sarcini conștientizate;
-0,9-2/1000 nou-născuți
1. Fenotip clinic
-majoritatea manifestărilor nu sunt prezente la toți indivzii
- hipotonie marcată, hiperflexibilitate articulară (80%) →mers nesusţinut la 2-4 ani;
- brahicefalie, occiput aplatizat, urechi displazice și rotunjite, facies aplatizat, nas aplatizat, anomalii dentare
- retard sexual moderat (baieţii sunt infertile) (>60%)
-fante palpebrale oblice (spre superior și exterior)
-nări mari, macroglosie realtivă şi micrognatism
- pliul simian
-gât scurt cu surplus de tegument
-anomalii cardiace
-hernie ombilicală (~50%)
-retard mental -ușor – moderat; (IQ mediu ~50, un număr mic au un handicap intelectual sever IQ<30)
- diferenţe între înţelegerea şi exprimarea verbală (în general - retard de vorbire).
- platoul de dezvoltare intelectuală ajunge la un platou în adolescență
Alți factori care au fost investigați dar pentru care rezultatele nu sunt clare
b. Vârsta tatălui- mai puțin studiată
c. Vârsta bunicii - foarte puțin studiat
d. Existența unui proband cu sdr Down (risc de recurență)
e. Existența unor anomalii structurale ale cromozomilor 21 la părinți (ex. translocații)
f. Consangvinizarea (?)
g. Mutaţii în genele care participă la metabolismul folaţilor la mamă şi copiii cu sdr Down (?)
3. Speranţa de viaţă
-Mai mare la pacienții cu cariotip mozaicat (~50 ani) sau cu trisomie segmentară
1.Sindromul Down
3. Forme citogenetice - trisomie 21 liber omogenă. (92-94%)
- sindrom Down cu translocaţie (21-14 sau 21-21) (3-4%)
└ trisomie 21 segmentară
- forma mozaicată (2-4%)
Tabel. Genel din DSCR care pot să contribuie la apariția unor Fig. Relaţia dintre trisomia parţială şi fenotipul
particularități fenotipice la pacienții cu sdr Down Down (redefinire DSCR în decursul timpului)
2. Trisomia 18 - Edwards
1. Frecvenţă
1/3400 - 1/11000
2. Fenotip
- aspect fragil, frecvent sunt subponderali
- occiput proeminent
- urechi malformate, ascuţite, inserate jos
- fante palpebrale înguste, orizontale Anomalii faciale
- gura mică
- pumn strâns, degete suprapuse
- retard mental
- afecțiuni - cardiace
- gastrointestin (stenoză pilorică, imperforare anală)
- renale şi ureterale.
3. Formule citogenetice 47,XX,+18 sau 47,XY,+18 Camptodactilie Clinodactilie
~80% sunt fete Poziţia caracteristică a degetelor 2 şi
Procentual trisomie - 95% 5 peste degetele 3 şi 4
translocatie - 2%
mozaicism - 3%
4. Mortalitate
- speranţă de viaţă – redusă
- foarte mare în primul an de viaţă (90-95%)
(durata medie de viaţă – 2 luni)
Segmentarea suplimentară a
plămânului Agenezie anorectală
3. Trisomia 13 (Sindromul Patau/ Bartholin-Patau)
1. Istoric
- 1657 - Erasmus Bartholin a descris fenotipul clinic dar nu a conștientizat etiologia și semnificația sdr.
- 1960 - Klaus Patau
2. Frecvență Erasmus Bartholin
-1 /5000-29000 născuți vii (1616-1680)
5. Factori de risc
- vârsta mamei >35 ani (relaţia nu este aşa de evidentă ca la sdr Down şi Edwards)
- existenţa unui proband
- o anomalie structurală a 13 la părinți (ex. translocţie balansată)
Riscul nu pare să fie influențat de: factorii geografici
etnia
mutaţii genice (ex. MTHFR, MTRR)
6. Forme citogenetice
- trisomie liber omogenă (47, XX,+13) 75%-90%
- translocație Robertsoniană (cu alţi acrocentrici) 5%-10%
46,XY, rob(13;13) sau 46,XX, rob(13;13)
- trisomie segmentară
-mozaicism - 5%
3. Trisomia 13
7. Mecanisme:
-90% dintre trisomiile 13 libere sunt cauzate de nondisjuncţia în meioza maternală (aproape toate în meioza I)
~10% translocație
4. Sindrom Klinefelter
1. Istoric
-1942 Dr. Harry Klinefelter descrie 9 bărbați cu ginecomastie, reducerea pilozității,
testicule mici și infertili
-anii 1950- este identificată cauza sindromului
2. Frecvenţă
-una dintre cele mai frecvente anomalii genetice cunoscute
└(1/ 500- 1.000 băieţi)
3. Variante citogenetice
- 47, XXY
- alte variante 48,XXYY, 48, XXXY, 49,XXXXY
4. Fenotip
Depinde de - numărul cromozomilor suplimentari,
- concentraţia testosteronului,
- vârsta la care debutează simptomatologia
4. Sindrom Klinefelter
- Caracteristici frecvent întâlnite
- copii
- sistemul muscular
└ forţă redusă → învaţă să meargă mai târziu
- statura tinde să fie mai mare (mai evidentă de la vârsta de 4 ani)
- capacitate de coordonare a mișcărilor diminuată
- este afectată capacitatea de comunicare
- mai liniştiţi
- 25-85% - probleme -expimare verbală
- înţelegerea frazelor
- la pubertate –deficitul de testosteron domină modificările fenotipice
└ - aspect longilin,
- dezvoltare psihică moderat redusă,
- dificultăţi de învătare
- la adulţi - eliberarea estrogenilor + deficitul de testosteron
└- caracterelor sexuale masculine subdezvoltate
- dezvoltarea unor caractere specifice femeilor
-ginecomastie
- pierd pilozitatea facială şi toracală
- au risc crescut de -osteoporoză; fragilitate osoasă
- cancer de sân
- pot avea viaţă sexuală
└cantitatea de spermă este însă foarte redusă
└ 95-99% infertili
- dacă sunt instruiţi reuşesc să scrie şi să citească
- comportamentul social
- mai puţin încrezători
5. Sindromul Turner (45, X0)
1. Frecvenţă
- 1/10.000
2. Fenotip
- statură redusă
- facies caracteristic
- gât scurt, palmat, exces de tegument la baza gâtului
- linia părului – joasă pe gât
- torace cu aspect de scut
- sânii -au dimensiuni reduse
-distanţă mare între mameloane
- constricţii ale aortei
- disgeneză gonadală, ovare rudimentare, amenoree
- numeroşi nevi
- abilităţi de învăţare reduse moderat
3. Formule citogenetice
50% sunt 45, XO.
Restul sunt forme mozaicate.
6. Sindromul 47, XYY (Sdr Jacobs)
1. Istoric
- Inițial denumit “criminal chromosome”
2. Fenotip
- tulburări comportamentale, inteligenţă submedie (dificultăţi de învăţare)
- longilini,
- predispoziție la acnee severă
- pot să fie fertili
3. Frecvenţă
- 1/ 1000 bărbaţi
- incidenţa -mai mare la indivizii cu mentalitate subnormală din instituţiile penale
- 99% rămân nediagnosticaţi
4. Mecanism
-nondisjuncţie în meioza II paternală.
└ nu este asociat cu vârsta mamei
7. Polisomia X
1. Istoric Sindromul 47, XXX
- Jacobs et al (1959)
2. Frecvenţă
- 1/ 700-1000 fete
3. Fenotip
- unele sunt asimptomatice
- neonatal - uşoară întârziere a dezvoltării neuromusculare
- până la 2 ani - devin evidente problemele de vorbire şi învăţare
- perioada scolară - probleme de învăţare, retard mintal blând (15-25% ),
- probleme de coordonare
- comportament imatur,
-după pubertate - înalte, microcefalie relativă,
- tendinţă la sterilitate;
└există şi cazuri de paciente care au urmaşi aneuploizi
Cimponeriu Dănuț
I. Genomice: - Triploidia
- Tetraploidia
- Trisomii
- Tetrasomii
I. Deleţii
II. Duplicaţii
B. Anomalii structurale III. Izocromozomii
IV. Inversii: - Paracentrică (nu include centromerul)
- Pericentrică (include centromerul)
V. Translocaţii: - intracromozomale
- intercromozomale
C. Mozaicism
B. Aberaţii cromozomale structurale
1. Deleţii
2. Duplicaţii
Izocromozomii
3. Inversii
Balansate 4.Translocaţii
Translocaţii Robertsoniene
B. Aberaţii cromozomale structurale (ACS)
✓ Cauze
- în general expunere la radiații ionizante, agenți genotoxici
✓ Caracterizare
- reflectă rupturile produse în ADN și consecințele acțiunii mecanismelor de reparare.
- reprezintă doar o mică fracție din nr de modificări care se produc în ADN
- localizare mai frecventă a punctelor de rupere :
- eucromatinei (sensibilitatea diferită a cromatinei/ cromozomilor la rupere)
- telomerelor și secvențelor repetitive intercalare
- regiunile subtelomerice= hot spoturi pentru apariția unor → shimburi simetrice între cromatidele omoloage
- consecințele ACS:
- depind de - etapa din ciclul celular în care are loc expunerea
- tipul de aberație analizată (corelat cu natura agentului inductor)
- asociate cu patologica și evoluția
- frecvența ACS este mai mare la - pacienții cu boli maligne
- subiecții cu anomalii congenitale
- avortoni (avorturi spontane)
B. Aberații cromozomale structurale (nebalansate)
1. Deleții
✓Mecanisme principale:
- acțiunea agenţilor mutageni (ex. radiaţii, agenţi chimici)
- crossing over inegal (meioză)
B. Aberații cromozomale structurale (nebalansate)
1. Deleții
✓Consecințele delețiilor – reflectă
- expresia dezechilibrată a genelor din regiune (haploinsuficiența)
- pseudodominanță (genele din zona deleției sunt hemizigote → alelele recesive se exprimă) → sindroame genetice
- deleții mici → depind de funcțiile genelor - reduc viabilitatea
mari (>5Mb )→ se pierd mai multe gene (nealele)
→multe sunt letale
→ o parte se pot menține în populație în stare hemizigotă
- afectează sinapsarea cromozomilor (în meioza I)→se formează bucle de deleție
└scade posibilitatea de recombinare în regiune
predispune la aberații crz numerice→ scade fertilitatea
Deleții
Ex.1 Sindromul Wolf–Hirschhorn
✓ Istoric: 1961 - U. Wolf și K. Hirschhorn au descris un copil cu anomalii (defecte de fuziune) la nivelul feței
✓ Frecvență -1/20000-1/50000 nou –născuți
✓ Fenotip - afectare multisistemică cu variabilitate crescută
- asimetrie cranio-facială - microcefalie ( aspect de coif grecesc)
- piramida nazală largă →hipertelorism
- spațiul dintre nas și buza superioară este mic
- buză / palat despicat,
- micrognație
-retard de creștere sever (statură redusă)
-hipotonie (abilitățile motorii sunt întârziate)
- retard metal
- abilitățile de comunicare verbală sunt moderat reduse.
✓Speranța de viață:
Decesul în primii 2 ani de viață la >33% dintre pacienți
└→în multe cazuri înainte de stabilirea diagnosticului.
✓ Cauza (mai frecventă): - deleții de diferite dimensiuni care includ - 4p16.3
-80-85% sunt mutații de novo (în gametogeneză sau postzigotic)
└→risc de recurență este redus
Ex.1 Sindromul Wolf –Hirschhorn
Modificarea aspectului
facial și hipertelorism
Ex. 2 Sindrom Cri-du-chat
Evoluția clinică și metode de diagnostic genetic
46,XX,del(5)(p15.3)
Microcefalie, hipertelorism,
Fante palpebrale, microgantia
Referință: 1.https://ojrd.biomedcentral.com/articles/10.1186/1750-1172-1-33
1.1. Cazuri particulare de deleție
Cromozomii inelari
✓Transmitere ereditară
- crz inelari sunt instabili în meioză
└ rar sunt transmiși de la părinţi la urmaşi
Cromozomii care se pot circulariza:
- toți crz umani se pot circulariza (Therman 1986);
- se estimează că cel mai frecvent sunt identificați inelarii - 13 (14%)
- X (12%)
- 22 (10%)
- 15 (9%)
- 14 (7%)
- 18 (7%)
- ~½ dintre inelarii proveniți din autozomi se formează din crz acrocentrici (Kosztolanyi 1987).
✓ Frecvența medie
-1/25000 produșii de concepție conștientizați (Jacob 1981) ;
-1/50.000 nou născuți.
Cromozomii inelari
✓ Fenotipul reflectă:
a) delețiile primare- pierderile de material genetic care preced formarea inelarului
b) instabilitatea crz inelari
└ în timpul diviziunilor nucleare ulterioare → noi aberații crz
└ mozaicism dinamic
(se produc noi aberații crz în celulele fiice→, care sunt tot dezechilibrate din punct de vedere genetic).
→ celule anormale → apoptoză→ deficit de creștere pre și post-natal.
→ supraviețuiesc → fenotip patologic cauza de dezechilibul genetic
Alte aspecte - afectare intelectuală blândă sau severă,
- microcefalie
- particularități faciale
✓ Nomenclatură:
46,XY, dup(7)(q11.q22)
✓ Mecanisme (mai frecvente)
a) crossing over inegal între omologi (meioză) – cel mai frecvent
b) schimb inegal între cromatidele surori (mitoză)
✓ Consecinţele duplicațiilor:
- în general - sunt mai bine tolerate comparativ cu deleţiile
- alterarea dozajului genic poate cauza unele manifestări clinice;
- dezvoltarea embrionară este sensibilă la dozajul genic (supraexprimarea unor gene)
- alterarea meioza I (unul sau ambii omologi formeză bucle de duplicație pentru a permite sinapsarea crz) → creşte riscul
apariţiei gameţilor dezechilibraţi genetic→ fertilitatea este diminuată
- rol în evoluţia eucariotelor
- reprezintă baza pentru apariția unor gene noi → funcții noi
2. Duplicaţii
✓ Fenotipuri patologice
12 and 21
- i(17q) - izocromozom 17q - tumori asociate cu prognostic nefavorabil
- defect de doză (deficit pentru genele din braț p, exces pentru genele din q)
- braț p are numeroase GSCT
✓ Incidenţă
- i(Xq) - cel mai comun izocromozom la specia umană
- izocromozomii autozomali- rezultă cel mai frecvent din braţele lungi ale acrocentricilor.
✓ Clasificare: - paracentrice
- pericentrice
✓ Frecvență
- paracentric 46,XY,inv(1)(p12p31)
✓ Consecinţe
- majoritatea nu produc modificări fenotipice vizibile la purtători (spre deosebire de deleție și duplicație)
- efectul de poziţie
-reglarea expresiei unor gene depinde de poziția acestor gene într-un anumit sector de ADN;
-punctele de rupere- pot să fie localizate în genă (în regiunile reglatoare sau în exoni)
- gena de fuziune
✓ Nomenclatură:
46,XY,t(9;22)(q34;q11)
-"t" = translocație.
-primul set de paranteze identifică cei doi cromozomi implicați în translocare
- al doilea set de paranteze -indică punctele de rupere ale brațelor cromozomilor.
✓Consecinţe
a) fenotip- normal
b) patologic →patologia determinată de - efectul punctului de rupere,
- efectul de poziție (alterarea expresiei genice),
- genele de fuziune (→proteine de fuziune cu funcție nouă)
- în meioză- probleme la formarea sinapselor crz→ probabilitatea apariției gameţilor dezechilibrați genetic
└ infertilitate sau subfertilitate
Rol
evoluția cariotipul
cimpanzeu, gorilă și urangutan 2n=48
om 2n=46
Hsa2 – este de tip mare
- modelul de benzi G
-corespunde cu cel de la 2 crz acrocentrici (brațele lungi) de la primate
-brațele scurte ale acrocentricilor s-au pierdut
Tip particular de translocație
4.2. Cromozomii dicentrici
-reunire nelegitimă
-replicare
-Cromozom dicentric și fragmente
acentrice
Cicluri- rupere-fuziune-rupere
BFB
Orphanet
http://www.orpha.net/consor/cgi-bin/index.php ECARUCA
https://omictools.com/ecaruca-tool
Dănuț Cimponeriu,
2020
I. Definiție
✓ presupune:
- colectarea datelor referitoare la particularitățile fenotipice (fiziologice sau patologice) pentru fiecare individ
- realizarea arborelui familiei
- simboluri și linii care unesc simbolurile
Referință: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/epdf/10.1007/s10897-008-9169-9
Simbolistică
Linii
II.2. Reguli generale pentru trasarea unui pedigree
✓ Generațiile - se notează cu cifre romane, consecutive (I, II, III, IV etc), de la stânga spre dreapta.
- generația I - cea mai îndepărtată
- este prezentată în partea de sus a diagramei.
✓ Indivizii - se notează cu cifre arabe, consecutive (1,2,3), de la stânga spre dreapta.
✓ Pentru a indica un indivd→ precizăm generația apoi poziția pe care o are în generația respectivă
(ex. indivizii II.3 și III.3 sunt afectați)
Adopție
Linia punctată (- - - ) indică părinții adoptivi
solidă ( ) indică părinții biologici
II.2. Reguli generale pentru trasarea unui pedigree