Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
INTRODUCERE ÎN MICROBIOLOGIE
SCOPUL CURSULUI Formarea unui sistem de cunoştințe despre organizarea celulară procariotă şi
eucariotă.
CONȚINUTUL Cursul conține informații privind elementele discriminatorii între organizarea
CURSULUI celulară procariotă şi eucariotă şi un istoric al evoluției sistemelor de clasificare a
lumii vii.
OBIECTIVE După parcurgerea capitolului studentul va putea:
- să definească tipurile de organizare procariot şi eucariot pe baza
caracteristicilor celulare;
- să compare cele două tipuri de organizare celulară;
- să dobândească cunoştințe privind evoluția sistemelor de clasificare a lumii vii.
1. INTRODUCERE ÎN MICROBIOLOGIE
Microbiologia este ştiința biologică fundamentală al cărei obiect de studiu este
reprezentat de un grup eterogen de organisme care diferă din punct de vedere al
morfologiei, activității metabolice şi încadrării sistematice.
Caracterele comune ale acestor organisme sunt dimensiunile foarte mici, de ordinul
micrometrilor (ceea ce le face vizibile doar la microscop), organizarea, în general unicelulară
şi structura internă relativ simplă.
Etimologia denumirii ştiinței provine din limba greacă: micros – mic; bios – viață;
logos – ştiință: ştiința organismelor de dimensiuni mici.
Grupul microorganismelor include domeniile Bacteria, Archaea, iar din domeniul
Eukarya ciupercile microscopice (mucegaiuri şi drojdii), unele alge şi protozoarele.
Virusurile, viroizii şi prionii, entități corpusculare de natură organică alcătuite din
componente chimice definitorii ale organismelor vii dar lipsite de organizare celulară,
constituie de asemenea obiect de studiu al microbiologiei. Sunt considerați agenți infecțioşi
deoarece se manifestă ca paraziți intracelulari obligatorii, incapabili de activități metabolice
în afara unei celule vii.
Celula reprezintă unitatea fundamentală, morfologică şi funcțională a materiei vii.
La viețuitoarele inferioare, unicelulare, celula îndeplineşte toate funcțiile vitale,
caracteristice pentru aceste grupe, în timp ce la plantele şi animalele pluricelulare celulele
sunt specializate în îndeplinirea unor anumite funcții.
1.1. Caracterele diferenţiale ale celulelor procariote şi eucariote
Organismele vii, indiferent de sistemul taxonomic în care sunt încadrate, aparțin la
două tipuri de organizare celulară: procariot şi eucariot, fiecare fiind caracterizat printr-o
anumită structură şi compoziție chimică.
Organizarea procariotă este unitatea de structură caracteristică domeniilor
bacteriilor şi archaea.
Pag. |1
CURSUL 1. CAP. 1. INTRODUCERE ÎN MICROBIOLOGIE
Tabelul 1.1.
Pag. |2
CURSUL 1. CAP. 1. INTRODUCERE ÎN MICROBIOLOGIE
Caracterele diferenţiale ale celulelor procariote şi eucariote (modificat, după Zarnea, 1983)
Caracterul Celula procariotă Celula eucariotă
Pag. |3
CURSUL 1. CAP. 1. INTRODUCERE ÎN MICROBIOLOGIE
Pag. |4
CURSUL 1. CAP. 1. INTRODUCERE ÎN MICROBIOLOGIE
Pag. |5
CURSUL 1. CAP. 1. INTRODUCERE ÎN MICROBIOLOGIE
Pag. |6
CURSUL 1. CAP. 1. INTRODUCERE ÎN MICROBIOLOGIE
Pag. |7
CURSUL 1. CAP. 1. INTRODUCERE ÎN MICROBIOLOGIE
*) Pot perturba ribosomii din mitocondrii şi cloroplaste, dar în celula normală aceştia sunt
inaccesibili.
Pag. |8
CURSUL 1. CAP. 1. INTRODUCERE ÎN MICROBIOLOGIE
Pag. |9
CURSUL 1. CAP. 1. INTRODUCERE ÎN MICROBIOLOGIE
P a g . | 10
CURSUL 1. CAP. 1. INTRODUCERE ÎN MICROBIOLOGIE
4. Escherichia coli 0,05 0,10 0,06 - 0,24 0,25 0,28 0,26 0,21 0,11 0,12 0,07 0,12
5. Chlorobium vibrioforme 0,06 0,05 0,06 0,24 - 0,22 0,22 0,20 0,19 0,06 0,07 0,06 0,09
6. Bacillus firmus 0,08 0,06 0,07 0,25 0,22 - 0,34 0,26 0,20 0,11 0,13 0,06 0,12
7.* C. diphterieae 0,09 0,10 0,07 0,28 0,22 0,34 - 0,23 0,21 0,12 0,12 0,09 0,10
8. Aphanocapsa 6714 0,11 0,09 0,09 0,26 0,20 0,26 0,23 - 0,31 0,11 0,11 0,10 0,10
9. Cloroplast de Lemna 0,08 0,11 0,06 0,21 0,19 0,20 0,21 0,31 - 0,14 0,12 0,10 0,12
10.* M. 0,11 0,10 0,10 0,11 0,06 0,11 0,12 0,11 0,14 - 0,51 0,25 0,30
thermoautotrophicum
11. M. ruminantium M-1 0,11 0,10 0,10 0,12 0,07 0,13 0,12 0,11 0,12 0,51 - 0,25 0,24
12. M. sp. izolat Cariaco JR- 0,08 0,13 0,09 0,07 0,06 0,06 0,09 0,10 0,10 0,25 0,25 - 0,32
1
13. Methanosarcina barkeri 0,08 0,07 0,07 0,12 0,09 0,12 0,10 0,10 0,12 0,30 0,24 0,32 -
1* - Saccharomyces; 7* - Corynebycterium; 10* - Methanobacterium; ** - Celule canceroase de şoarece.
ARN-ul ribozomal 16S (18S) din organismele (organitele) enumerate au fost digerate cu T1 RN-ază;
produşii rezultați au fost supuși la separarea electroforetică bidimensională pentru a produce o
amprentă oligonucleotidică. Oligonucleotidele individuale au fost apoi ordonate pentru a obține
catalogul oligonucleotidic caracteristic organismului dat. Comparațiile pentru toate perechile posibile
ale acestor cataloage definește un set de coeficienți de similaritate (SAB), calculați după formula:
SAB = 2NAB / (NA + NB): NAB – numărul total de nucleotide comune în cele două secvențe comparate;
NA+NB - numărul total de nucleotide în cele două secvențe comparate.
1. Primul dintre ele conține toate bacteriile tipice caracterizate până în 1977, inclusiv
genurile Acetobacterium, Acinetobacter, Acholeplasma, Aeromonas, Alcaligenes, Anacystis,
Aphanocapsa, Bacillus, Bdellovibrio, Chlorobium, Chromatium, Clostridium, Corynebacterium,
Escherichia, Eubacterium, Lactobacillus, Leptospira, Micrococcus, Mycoplasma, Paracoccus,
Photobacterium, Propionibacterium, Pseudomonas, Rhodopseudomonas, Rhodospirillum,
Spirochaeta, Spiroplasma, Streptococcus și Vibrio (Uchida şi colab., 1974; Doolittle şi
colab., 1975; Zablen şi Woese, 1975; Pechman şi colab., 1976; Fox şi colab., 1977).
Grupul are trei subdiviziuni majore, bacterii albastre-verzi și cloroplastele, bacteriile
"Gram-pozitive" și o subdiviziune largă a bacteriilor "Gram-negative". Acest regn primar
este numit Eubacteria.
2. Al doilea grup este definit de ARN-ul ribozomal 18S din citoplasma eucariotă -
animale, plante, fungii și mucegaiuri. Este incert al cărui organism ancestral, care a produs în
simbioză celule eucariote, îl reprezintă acest ARN. Dacă a existat o "specie înghițitoare" în
raport cu care toate celelalte organisme au fost endosimbionți, atunci se pare că ARNr 18S
P a g . | 11
CURSUL 1. CAP. 1. INTRODUCERE ÎN MICROBIOLOGIE
reprezintă acea specie. Acest grup ipotetic de organisme, într-un fel strămoșii celulelor
eucariote, a fost numit în mod corespunzător şi încadrat în regnul primar Urkaryotes.
Eubacteria și Urkaryotes corespund aproximativ categoriilor convenționale
"procariote" și "eucariote", atunci când sunt utilizate într-un sens filogenetic. Cu toate
acestea ele nu epuizează clasa sistemelor vii.
3. Al treilea regn primar a fost reprezentat numai de bacteriile metanogene, care,
până în anul 1977, cuprindea o clasă relativ necunoscută de anaerobe, care posedă un
metabolism unic, bazat pe reducerea dioxidului de carbon la metan (Wolfe, 1972; Zeikus şi
Bowen, 1975; Zeikus, 1977).
Fenotipul metanogenelor, deși aparent "bacterian", nu indică o asemănare
filogenetică specifică eubacteriilor. De exemplu, metanogenele nu au pereți celulari şi nu
conțin peptidoglican (Kandler, şi Hippe, 1977). Biochimia formării metanului pare să
implice coenzime unice (Cheeseman şi colab., 1972; Fox şi colab., 1977; Taylor şi Wolfe,
1974). ARNr al metanogenelor este comparabil ca mărime cu omologii lor eubacterieni, dar
nu seamănă cu aceştia din urmă în nici o secvență și nici în modificarea modelului lor de
bază. ARN-ul de transport din eubacterii și eucariote sunt caracterizate de o secvență
comună modificată, TΨCG; această secvență de ARNt la metanogene este modificată într-un
mod cu totul diferit și unic (Fox şi colab., 1977).
Aceste "bacterii" par a fi legate de bacteriile tipice nu mai mult decât de eucariote.
Nu există nici un motiv, în prezent, pentru a lua în considerare metanogenele ca fiind mai
aproape de eubacterii decât de "componenții citoplasmatici" ai eucariotelor. Aparenta
vechime a fenotipului metanogenelor, faptul că par bine adaptate la tipul de mediu, plus
presupunerea că există pe Pământ de acum 3-4 miliarde de ani a condus la denumirea
acestui regn primar: Archaebacteria.
Atât din punctul de vedere al secvențelor de ARNr măsurate, cât și al diferențelor
fenotipice generale, cele trei grupări par să fie regnuri primare distincte.
Se pune problema dacă este posibil ca să fie descoperite şi alte regnuri primare.
Woese (1977) consideră că nu, chiar dacă sunt necesare cercetări exhaustive, iar numărul
de specii care pot fi clasificate ca eubacterii este relativ mare. La această listă pot fi adăugate
genurile Spirillum şi Desulfovibrio al căror ARNr (în urma măsurătorilor de hibridizare a
acidului nucleic) apare de obicei ca fiind tipic eubacterian (Pace şi Campbell, 1971).
Deşi lista este diversă din punct de vedere fenotipic, pare puțin probabil că multe, dacă este
cazul, dintre grupurile de procariote încă necaracterizate se va dovedi că vor avea statut egal
cu cele trei regnuri primare deja prezentate. Se presupune însă că cele halofile, ale căror
pereți celulari nu conțin peptidoglican, sunt candidate pentru această distincție (Brown şi
Cho, 1970; Reistad, 1972).
În ceea ce privesc organitele eucariote ar putea fi o problemă diferită. Nu poate fi nici
o îndoială, cloroplastele sunt de origine eubacteriană (Bonen şi Doolittle, 1975; Zablen şi
colab., 1975). Întrebările se pun în legătură cu organitele şi structurile rămase. Mitocondriile,
P a g . | 12
CURSUL 1. CAP. 1. INTRODUCERE ÎN MICROBIOLOGIE
P a g . | 13
CURSUL 1. CAP. 1. INTRODUCERE ÎN MICROBIOLOGIE
Figura 1. Arborele filogenetic universal cu cele trei domenii (Woese şi colab., 1990)
Ordinea ramificațiilor şi lungimea ramurilor se bazează pe compararea secvențelor de ARNr.
Poziția rădăcinilor, care a fost determinată prin compararea secvențelor perechilor de gene paraloage, s-au
separat înainte ca cele trei linii principale să iasă din starea lor ancestrală comună (Iwabe şi colab., 1989).
Numerele de pe ramuri corespund următoarelor organisme (Woese, 1987):
Bacteria. 1 – Thermotogales; 2 - Flavobacterii și bacterii înrudite; 3 – Cianobacterii; 4 - Bacteriile
purpurii; 5 - Bacterii Gram-pozitive; 6 - Bacterii nesulfuroase verzi.
Archaea. Regnul Crenarchaeota: 7 - genul Pyrodictium; 8 - genul Thermoproteus. Regnul
Euryarchaeota: 9 – Thermococcales; 10 - Methanococcales; 11 - Methanobacteriales; 12 -
Methanomicrobiales; 13 - Halofile extreme.
Eucarya. 14 – Animale; 15 – Ciliate; 16 - Plante verzi; 17 - Fungi, 18 – Flagelate; 19 - Microsporidia.
P a g . | 14
CURSUL 1. CAP. 1. INTRODUCERE ÎN MICROBIOLOGIE
Tabelul 1.3.
Câteva trăsături diferenţiale între cele trei domenii: Archaea, Bacteria şi Eukarya
(Muntean, 2009)
Caracteristici Bacteria Archaea Eukarya
Structurale
Nucleu delimitat de membrană nu nu da
Plasmide da da rar
Mitocondrii nu nu da
Cloroplaste nu nu da
Reticul endoplasmic nu nu da
Aparat Golgi nu nu da
Lizosomi nu nu da
Peroxisomi nu nu da
Nucleol nu nu da
Ribosomi 70S (30S+50S) 70S (30S+50S) 80S (40S+60S)
Peptidoglican da nu nu
Membrană
Legăturile lipidelor ester eter ester
Steroli nu* nu da
Hopanoide da nu nu
Izopren (4 → fitanol) nu da nu
Genetice
Histone nu da da
Aminoacidul iniţiator formil-metionina metionina metionina
Introni rar rar frecvent
Operoni da da nu
ARNm capped şi poliadenilat nu nu da
Fiziologice
Fotosinteză cu ajutorul clorofilelor da nu da
Fixarea N2 da da nu
Creşterea la >80oC da da nu
Metanogeneză nu da nu
P a g . | 15
CURSUL 1. CAP. 1. INTRODUCERE ÎN MICROBIOLOGIE
Sensibilitatea la streptomicină, da nu nu
kanamicină şi cloramfenicol
* - excepție metilotrofele şi micoplasmele
REZUMAT
Obiectul de studiu al Microbiologiei generale include bacteriile, archaea,
ciupercile microscopice (mucegaiuri şi drojdii), unele alge şi protozoarele. Caracterele comune
ale acestor organisme sunt dimensiunile foarte mici, de ordinul micrometrilor, organizarea, în
general unicelulară şi structura internă relativ simplă. Organismele vii, indiferent de sistemul
taxonomic în care sunt încadrate, aparțin la două tipuri de organizare celulară: procariot şi
eucariot, fiecare fiind caracterizat printr-o anumită structură şi compoziție chimică.
Virusurile, viroizii şi prionii, entități corpusculare de natură organică alcătuite din
componente chimice definitorii ale organismelor vii dar lipsite de organizare celulară,
constituie de asemenea obiectul de studiu al microbiologiei.
Plecând de la clasificarea lumii vii în două regnuri, Vegetabilia şi Animalia (Linnaeus,
1735), sistemele de clasificare au evoluat pe măsura dezvoltării tehnicilor de studiu al
organizării celulare: sistemul celor trei regnuri – Protista (microorganismele unicelulare sau
unicelular-coloniale), Plantae şi Animalia (Haeckel, 1866); sistemul celor patru regnuri –
Monera (bacteriile propriu-zise şi „algele” albastre-verzi), Protoctista (algele cu excepția
celor procariote, fungii, mixomicetele şi protozoarele), Plantae şi Animalia (Copeland,
1938); sistemul celor cinci regnuri – Monera (organisme unicelulare de tip procariot),
Protista (organisme primar unicelulare sau unicelular-coloniale de tip eucariot), Plantae,
Fungi şi Animalia (Whittacher, 1969), agreat, până de curând, de un mare număr de
specialişti.
Sistemul celor trei domenii, structurat pe criteriul filogeniei moleculare, grupează
organismele în trei domenii primare: domeniile Archaea (cu regnurile Euryarchaeota şi
Crenarchaeota) şi Bacteria, cu organizare procariotă şi domeniul Eucarya (protozoare,
plante, ciuperci, animale), cu organizare eucariotă (Woese şi colab., 1977; 1990).
BIBLIOGRAFIE
1. Bonen, L. & Doolittle, W. F. 1975. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 72, 2310–2314.
2. Brown, A. D. & Cho, K. Y. 1970. J. Gen. Microbiol. 62, 267–270.
3. Cheeseman, P., Toms-Wood, A. & Wolfe, R. S. 1972. J. Bacteriol. 112, 527–531.
4. Doolittle, W. F., Woese, C. R., Sogin, M. L., Bonen, L. & Stahl, D. 1975. J. Mol. Evol. 4, 307–315.
5. Fitch, W. M. & Margoliash, E. 1967. Science 155, 279–284.
6. Fitch, W. M. 1976. J. Mol. Evol. 8, 13–40.
7. Fox, G. E., Magrum, L. J., Balch, W. E., Wolfe, R. S. & Woese, C. R. 1977. Proc. Natl. Acad. Sci.
USA, 74, 4537–4541
P a g . | 16
CURSUL 1. CAP. 1. INTRODUCERE ÎN MICROBIOLOGIE
8. Fox, G. E., Pechman, K. R. & Woese, C. R. 1977. Int. J. Syst. Bacteriol. 27, 44–57.
9. Gutell, R. R., Weiser, B., Woese, C. R. & Noller, H. F. 1985. Prog. Nucleic Acid Res. Mol. Biol.
32, 155-216.
10. Haeckel, E. 1866. Generelle Morphologie der Organismen. Reimer, Berlin.
11. Kandler, O. & Hippe, H. 1977. Arch. Microbiol. 113, 57–60.
12. Linnaeus, C. 1735. Systemae Naturae, sive regna tria naturae, systematics proposita per
classes, ordines, genera & species.
13. Muntean, V. 2009. Microbiologie generală. Ed. Presa Universitară Clujeană, Cluj-Napoca.
14. Pace, B. & Campbell, L. L. 1971. J. Bacteriol. 107, 543–547.
15. Pechman, K. J., Lewis, B. J. & Woese, C. R. 1976. Int. J. Syst. Bacteriol. 26, 305–310.
16. Raff, R. A. & Mahler, H. R. 1973. Science 180, 517–521.
17. Reistad, R. 1972. Arch. Mikrobiol. 82, 24–30.
18. Sneath, P. H. A. & Sokal, R. R. 1973. Numerical Taxonomy (W. H. Freeman, San Francisco).
19. Taylor, C. D. & Wolfe, R. S. 1974. J. Biol. Chem. 249, 4879–4885.
20. Uchida, T., Bonen, L., Schaup, H. W., Lewis, B. J., Zablen, L. B. & Woese, C. R. 1974. J. Mol.
Evol. 3, 63–77.
21. Woese, C. R. 1987. Microbiol. Rev. 51, 221-271.
22. Woese, C. R., Gutell, R. R., Gupta, R. and Noller, H. F. 1983. Microbiol. Rev. 47, 621-669.
23. Woese, C.R. and Fox, G.E. 1977. Phylogenetic structure of the prokaryotic domain: The primary
kingdoms. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America.
24. Woese, C.R., Kandler, O., Wheelis, M.L. 1990. Towards a natural system of organisms:
Proposal for the domains Archaea, Bacteria, and Eucarya (Euryarchaeota/ Crenarchaeota/
kingdom/ evolution) Proc. Nati. Acad. Sci. USA Vol. 87, pp. 4576-4579.
25. Wolfe, R. S. 1972. Adv. Microbiol. Phys. 6, 107–146.
26. Zarnea, G. 1983. Tratat de microbiologie generală, 1, Ed. Academiei. Bucureşti.
27. Zablen, L. B. & Woese, C. R. 1975. J. Mol. Evol. 5, 25–34.
28. Zablen, L. B., Kissel, M. S., Woese, C. R. & Buetow, D. E. 1975. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 72,
2418–2422.
29. Zeikus, J. G. & Bowen, V. G. 1975. Can. J. Microbiol. 21, 121–129.
30. Zeikus, J. G. .1977. Bacteriol. Rev. 41, 514–541.
31. Zuckerkandl, E. & Pauling, L. 1965. J. Theor. Biol. 8, 357–366.
P a g . | 17