Pagina 1

Jurnalul microchimic 160 (2021) 105632

Disponibil online 15 octombrie 2020
0026-265X / © 2020 Elsevier BV Toate drepturile rezervate.

Identificarea și cuantificarea biomarkerului proteinelor de cancer folosind

substrat nanoforest și spectrometru Raman de mână
Hyun Soo Kim a , Taeha Leeb , Jongsu Yuna , Gyudo Lee b , Yoochan Honga , *
Departament de Dispozitive Medicale, Institutul de Mașini și Materiale din Coreea (KIMM), Daegu 42994, Republica Coreea
un 

Departamentul de Biotehnologie și Bioinformatică, Universitatea Coreea, Sejong 30019, Republica Coreea

b 

ARTICLEINFO
Cuvinte cheie:
Nanoforest
Difuzarea Raman a îmbunătățit suprafața
Biomarcator de proteine canceroase
Spectrometru Raman de mână
Identificarea celulelor canceroase
Diagnosticul cancerului
ABSTRACT
Biomarcatorii de cancer, o indicație a celulelor canceroase din organism, pot juca un rol important în diagnostic, prognostic,
și predicția eficacității tratamentului, precum și a recurenței. Aici, am dezvoltat un spectroscopic Raman simplu
metoda care a utilizat un substrat de nanoforest de argint (SNF) și un spectrometru Raman de mână pentru identificare
biomarkeri ai proteinelor canceroase cu sensibilitate foarte mare. În primul rând, diferite concentrații de soluții de etanol au fost
analizat folosind spectrometrul Raman de mână pentru a confirma performanța acestuia. În continuare, funcționalitatea SNF
substrat, cu alte cuvinte, efectul suprafeței îmbunătățit împrăștierea Raman a fost caracterizat prin măsurare
concentrații variate, cunoscute de rodamină 6G. Structura nouă a substratului SNF poate furniza
factor de îmbunătățire de 1,13 × 10 7 . În urma caracterizării, spectrele Raman ale biomarkerilor de cancer,
molecula de adeziune a celulelor epiteliale (EpCAM) și antigenul carcinoembrionar (CEA), au fost examinate folosind
a ținut spectrometrul Raman cu substratul SNF. Până la 0,2 picomoli ai proteinei au fost cu succes
detectat cu o cantitate foarte mică de probe de soluții (~ 2 µl) care conțin biomarkeri de cancer. Dezvoltat
tehnica permite măsurarea simplă și convenabilă a biomarkerilor de proteine canceroase utilizând substratul SNF
și spectrometru Raman de mână. Credem că aceste descoperiri vor motiva crearea de biblioteci Raman pentru
biomarkeri de cancer.
1. Introducere
Cancerul este a doua cauză principală de deces în SUA și Europa.
În toate cazurile de cancer combinate, rata relativă de supraviețuire pe cinci ani este de numai
68% la pacienții albi și 61% la populațiile de pacienți negri [1]. Globalul
peisajul cancerului este complex și s-a prezis că va experimenta o
creșterea continuă a noilor cazuri de cancer și a deceselor în următorii ani
[2,3] . Cu toate acestea, îmbunătățind înțelegerea elementelor cheie din
diagnosticarea cancerului, terapie, factori de risc pentru recurență, prognostic,
și impactul comorbidităților, poate spori decizia clinică,
permițând o gestionare precisă și personalizată a pacienților pentru multe tipuri de
cancerele [4] . Aprofundarea cunoștințelor noastre cu privire la mecanismele cancerului la
nivelurile moleculare și celulare pot permite un diagnostic precoce și
predicții precise ale progresiei, îmbunătățind designul și aplicațiile
terapeutice vizate [5]. Ca atare, clasificarea exactă a
pacienții cu cancer în subtipuri semnificative din punct de vedere clinic ar ajuta la informare
diagnostice raționale și bazate pe dovezi și strategii terapeutice [6] . La
În prezent, s-au căutat eforturi enorme de identificare a cancerelor pe baza
profiluri de expresie ale biomarkerilor, cum ar fi ARNm și proteine [7-9].
De exemplu, aceste studii au clasificat cu succes subtipurile de
cancer de sân și glioblastom [10-12] . Identificarea exactă a
biomarkerii care afectează eficacitatea unei terapii vizate ajută la îmbunătățire
sensibilitate, crescând în cele din urmă rata globală de supraviețuire
[13,14] . În consecință, pentru depășirea limitărilor expresiei-
stratificare bazată și maximizarea valorii medicinii de precizie
cu terapii vizate, este crucial să investigăm mutaționalul
spectrele observate la pacienții cu cancer.
Spectroscopia Raman este o strategie bioanalitică populară pentru detectare și
identificați speciile moleculare [15] . Un compus sau moleculă este unic
Spectrul Raman este denumit amprentă, deoarece corespunde
anumite benzi vibraționale specifice ale unui material [16,17]. Cu toate acestea,
materialele logice au spectre Raman slabe împrăștiate cu fluor
rescență. Abordând acest neajuns, descoperirea suprafeței
împrăștierea Raman îmbunătățită (SERS) a sporit foarte mult utilitatea
Spectroscopie Raman. Amplificarea rapidă a electromagneticului
câmp generat de plasmonii de suprafață excitați local pe metalul nobil
nanostructurile conduc la îmbunătățirea semnalului Raman al unui
moleculă de analit adsorbit [18] . Depunerea unghiului privitor este o
* Autorul corespunzator.
Adresa de e-mail: ychong1983@kimm.re.kr (Y. Hong).
Liste de conținut disponibile la ScienceDirec t

Jurnalul microchimic
pagina de start a jurnalului: www.elsevier.com/locate/microc
https://doi.org/10.1016/j.microc.2020.10563 2
Primit la 31 august 2020; Primit în formă revizuită 12 octombrie 2020; Acceptat la 12 octombrie 2020

Pagina 2
Jurnalul microchimic 160 (2021) 105632
2
tehnică care permite fabricarea de filme nanosculptate cu diferite
morfologii și forme. De asemenea, oferă un nanorod cristalin uniform
matrice cu un raport de aspect ridicat și o rezonanță plasmonică de suprafață localizată
efect. Morfologia și dimensiunile substraturilor SERS sunt cruciale
parametrii care afectează gradul de îmbunătățire a semnalului. Un specific și
morfologia suprafeței repetabile oferă un nivel ridicat de îmbunătățire [19].
S-a constatat că o mare varietate de nanostructuri manifestă SERS
efect, inclusiv suprafețe metalice aspre tratate cu gravare chimică,
filme insulare, agregate de particule coloidale, nanorods și nanofire
fabricate prin metode chimice și electrochimice sau prin nano-
matrice de particule preparate prin litografie nanosferică sau fascicul de electroni
litografie. Din păcate, multe dintre aceste metode de fabricație sunt
fie scumpe, fie consumatoare de timp și sunt dificil de reprodus
creați o morfologie uniformă care maximizează îmbunătățirea SERS.
În această cercetare, am fabricat un substrat de nanoforest de argint (SNF)
folosind un sistem de pulverizare cu o sursă de cluster (Fig. 1A). Performanța
manevrarea unui spectrometru Raman de mână a fost confirmată folosind cunoscut
soluții de etanol și variind timpul de integrare al Ramanului de mână
spectrometru. Limita de detectare a mehotd dezvoltat, o combinație
națiunea substratului SNF și a spectrometrului de mână Raman, a fost
confirmat împotriva modificărilor concentrației de rodamină 6G (R6G), a
sonda Raman reprezentativă, cu doar doi microlitri din probă
volum ( Fig. 1 b). În cele din urmă, s-au încărcat biomarkeri de proteine canceroase
substratul SNF și măsurat pentru semnalul Raman folosind dispozitivul portabil
Spectrometru Raman. Am constatat că ambele proteine biomarker ale cancerului
testate aici pot fi identificate cu succes prin generarea de semnale Raman
sistem (Fig. 1c). Cu aceste rezultate, credem că
a dezvoltat un sistem Raman format din substrat SNF și portabil
Spectrometrul Raman reprezintă o abordare promițătoare pentru identificarea cancerului
biomarkeri proteici din cantități mici de probe biologice (2 µl).
2. Materiale și metode
2.1. Materiale
Argintul a fost achiziționat de la Thermo Fisher Scientific Inc. (Seul,
Coreea) și gazele de heliu (He) și argon (Ar) au fost obținute de la Seul
Specialty Gases Co. (Eumseong, Coreea). Napolitane de siliciu de șase inci erau
obținut de la SK Siltron (Seul, Coreea). R6G și etanolul erau pur
alungat de la Sigma Aldrich Coreea (Seul, Coreea) și celula epitelială
molecula de adeziune (EpCAM) si antigenul carcinoembrionar (CEA) pro-
adolescenții au fost cumpărați de la Abcam (Cambridge, MA, SUA). Al lui Dulbecco
soluție salină tamponată cu fosfat (DPBS) a fost achiziționată de la Welgene Inc.
(Kyeongsan, Coreea).
2.2. Fabricarea nanoforestului de argint (SNF)
Substratul SNF a fost fabricat folosind un sistem de pulverizare încărcat
cu o sursă de cluster așa cum este descris în raportul publicat anterior
[20] . Pe scurt, pentru a fabrica structura metalică nanoporoasă, am folosit
sistem de pulverizare, unde este prezentată o ilustrare schematică a acestei configurări
în Fig. S1 ( Material suplimentars). Mărimea diafragmei și a gazelor
(Ar, He) care sunt introduse în sistemul de pulverizare determină
presiune în interiorul sistemului de pulverizare. În cercetarea actuală, în timp ce
Fig. 1. Ilustrație schematică a măsurării spectrelor Raman pentru proteinele biomarkerului cancerului utilizând un substrat nanoforest și un spectrometru Raman de mână.
HS Kim și colab.

Pagina 3
Jurnalul microchimic 160 (2021) 105632
3
menținând presiunea în interiorul sistemului de pulverizare la aproximativ câteva
sută mTorr, lungimea sistemului de pulverizare și diametrul diafragmei
au fost setate la 50 mm și respectiv 4 mm. Rata de depunere a SNF
caracteristicile substratului sunt dependente de lungimea pulverizării
sistem, presiuni ale sistemului de pulverizare și debitele de gaz de agregare. Noi
a folosit următoarele condiții de fabricație pentru a genera substratul SNF:
250 W putere continuă, 380 mTorr în sistemul de pulverizare și 15 ◦ C pentru
temperatura sursei. Debitele de gaz au fost stabilite la 84 și 14 sccm pentru Ar
și respectiv He. Morfologia substratului SNF a fost confirmată
prin microscopie electronică cu scanare (SEM) (SU8230, Hitachi).
2.3. Pregătirea probelor de biomarkeri de proteine canceroase pe SNF
substrat
Proteinele EpCAM și CEA au fost centrifugate la 12.500 rpm timp de 30 de minute
într-un tub de microcentrifugă de 1,5 ml și supernatantul a fost aruncat.
Ulterior, DPBS a fost adăugat în tub pentru a regla concentrația de
biomarkeri ai proteinelor canceroase de la 0,1 mM la 1 pM atât pentru EpCAM, cât și pentru
CEA. Apoi, 2 μ l din soluțiile DPBS ale biomarkerilor de proteine de cancer au fost
a căzut pe un substrat SNF de 4 × 4 mm 2 și s-a uscat sub flux de aer într-un
glugă laminară.
Fig. 2. a) Spectrele Raman și b) Intensitatea Raman la 886 cm 1 pentru soluția de etanol în funcție de timpul de integrare al spectrometrului Raman de mână. c) Raman
spectre și d) intensitatea Raman la 886 cm 1 după variația concentrației (v / v%) de soluție de etanol, măsurată cu un spectrometru Raman de mână. Insere
reprezintă spectrele Raman în intervalul de la 850 la 900 cm 1 .
HS Kim și colab.

Pagina 4
Jurnalul microchimic 160 (2021) 105632
4
2.4. Măsurători ale spectrelor Raman din soluție și substrat SNF
Spectrele Raman au fost colectate folosind excitație laser de 785 nm cu a
Spectrometru de mână NS-100 Raman de la Nanoscope Systems, Inc.,
Coreea (Fig. S2 în Materialele suplimentare ). Acest instrument dobândește
spectrele într-o secundă și generează rapid spectrul final
raport. Puterea laserului pentru probă a fost de 80 mW și distanța
între probă și spectrometrul de mână Raman a fost păstrat
constantă, astfel încât dimensiunea punctului laser a fost menținută la 1 mm pe substratul SNF
în timpul măsurătorilor spectrelor Raman. Într-un experiment folosind etanol
soluții pentru confirmarea performanței specificației Raman de mână
trometru, timpul de integrare al spectrometrului Raman de mână a fost
s-a schimbat de la 0,1 la 1,0 s. În alte experimente, timpul de integrare a fost
fixat pentru 7,0 s. Pentru măsurători ale spectrelor Raman din probe pe SNF
substrat, spectrele au fost colectate în 10 puncte diferite ale fiecărui substrat
în interiorul regiunii inelului de cafea cu aceleași condiții experimentale (de ex.
intervalul dintre eșantion și spectrometrul portabil Raman, puterea laserului,
timp de integrare și aceleași puncte) pentru analiza statistică.
3. Rezultate si discutii
În primul rând, performanța spectrometrului de mână Raman a fost
confirmată prin utilizarea soluției de etanol pur și prin variația integrării
timpul spectrometrului Raman portabil de la 0,1 la 1,0 s ( Fig. 2 a).
Cel mai puternic vârf de etanol a apărut la 886 cm 1 din cauza
întindere simetrică C – CO. În plus, descrierile altor specificații
vârfurile în spectrele de etanol Raman au fost după cum urmează: vârful la 1.055
cm 1 se datorează vibrației de întindere a C – C, 1.099 cm 1 se datorează
vibrația de întindere a C-C și vibrația asimetrică a C-CO,
1.278 cm 1 este atribuit vibrației răsucite de –CH 2 - și 1.455
cm 1 se datorează deformării asimetrice a –CH 3 și foarfecii
vibrația de –CH 2 -. În cele din urmă, semnalul de intensitate scăzută la 436 cm 1 este
atribuit vibrației de deformare a CO [21] . După achiziție
spectrelor Raman din soluția de etanol pur, intensitățile la
vârf de 886 cm 1 au fost replotate în funcție de timpul de integrare al
spectrometru Raman de mână (Fig. 2b). O linie liniară montată era
generat: y (x) = 32,5x + 397,8 , cu o valoare R 2 de 0,9999. Apoi,
a fost verificată performanța spectrometrului de mână Raman
concentrații variate cunoscute de etanol (v / v%) (Fig. 2c). Mostrele
au fost preparate amestecând etanol și apă, unde 0% reprezintă pur
apă. Potrivit unui studiu publicat anterior[22], vârful Raman
datorită întinderii –OH de apă are o intensitate foarte mică și nu are
se suprapune cu vârful ascuțit al etanolului în jurul valorii de 880 cm 1 , permițând astfel
pentru analiza directă a conținutului de alcool în soluții apoase. Cum era de așteptat,
am constatat că intensitatea vârfului la 886 cm 1 a crescut odată cu
creșterea concentrației de etanol, iar creșterile au fost proporționale
proporțional cu concentrația crescândă de etanol. Prin urmare,
vârful la 886 cm 1 a fost selectat pentru analiza cantitativă a
soluții de etanol (v / v%). Intensitatea vârfului la 886 cm 1 a fost
replotate în funcție de concentrațiile (v / v%) de etanol (Fig. 2d). A
regresie lineară a fost reprezentată grafic ca: y (x) = 317.3x + 599.5 , cu un R 2 valoare
de 0,9952. În mod colectiv, aceste experimente au sugerat această performanță
a spectrometrului Raman de mână a fost potrivit pentru aceste studii.
Următoarele experimente au fost efectuate pentru a evalua performanța
manevrarea substraturilor SNF în combinație cu Raman de mână
spectrometru. Fig. 3a prezintă substratul SNF gol, precum și pre- și
Fig. 3. a) Fotografii ale substratului nanoforestal singur, cu o picătură de rodamină 6 g (R6G) în soluție și după ce soluția R6G s-a uscat. b) Scanare
imagini cu microscop electronic (SEM) ale substratului nanoforest la suprafață și secțiune transversală. Bara de scalare reprezintă 500 nm. c) Spectrele Raman ale R6G pe nanoforest
substraturi cu concentrații variabile de R6G, folosind un spectrometru Raman de mână. d) Intensitatea Raman a R6G la 1.511 cm 1 folosind un Raman de mână
spectrometru.
HS Kim și colab.

Pagina 5
Jurnalul microchimic 160 (2021) 105632
5
post-acoperire cu soluție R6G. Dimensiunea substratului SNF a fost de 4 × 4
mm 2 și doar 2 pl de soluție R6G (1 mM) au fost scăpate pe SNF
substrat. Deoarece picătura de soluție R6G s-a răspândit pe SNF
substrat înainte de uscare, urmele direcționate ale R6G pe SNF au fost
mai mare decât dimensiunea picăturii inițiale de lichid. Fig. 3 b prezintă SEM
imagini pentru suprafața și secțiunea transversală a substratului SNF. Argintul
structurile nanoporoase au fost fabricate așa cum este descris în Materiale și
Secțiunea Metode. Așa cum era de așteptat, dimensiunea nanoparticulelor de argint simple a fost
aproximativ 50-100 nm, iar grosimea structurii nanoporoase a fost
aproximativ 1 μ m. Aceste nanostructuri de argint stratificate au fost ipotezate
amplificați semnalul Raman din diferite probe și era de așteptat să fie
aplicabil pentru biosenzorii pe bază de SERS. Pentru a confirma utilitatea SNF
substrat ca substrat SERS, s-a observat spectrul Raman al R6G
atât în soluție, cât și după ce a fost uscat pe substratul SNF ( Fig. 3c și
Fig. S3 a din Materialul suplimentar s). Cel mai puternic vârf pentru R6G este
observat la 1.511 cm 1 , datorită vibrațiilor aromatice de întindere C-C.
Celelalte vârfuri specifice din spectrele Raman ale R6G reprezintă structuri ca
urmează: vârful de 614 cm 1 se datorează îndoirii C-C – C în plan
fracțiune, 772 cm 1 se datorează vibrațiilor de îndoire C-H în afara planului și
1.129 cm 1 se datorează vibrațiilor de îndoire C-H în plan. Culmile la
1.311, 1.360 și 1.651 cm 1 sunt, de asemenea, atribuiți C-C aromatici
întinzând vibrațiile [23] . Vârful la 1.511 cm 1 a fost selectat ca
vârful reprezentativ, iar intensitățile vârfurilor au fost reprezentate grafic ca a
funcția numărului cunoscut de molecule (moli) de R6G ( Fig. 3 d).
Din acest studiu, limita de detectare a R6G a fost confirmată ca 2,0 × 10 -13
mol (cădere 2 μ l de 0,1 μ soluție M R6G pe substratul SNF). În
soluția, am observat aceleași vârfuri specifice pentru R6G ( Fig. S3 a).
Cu toate acestea, limita de detectare a R6G în soluție a fost de ~ 5.000 de ori
mai mare: 500 μ M de R6G ( Fig. S3 b). Factorul de îmbunătățire al SNF
substratul a fost calculat după cum urmează:
EF =
Eu  SNF
Eu  O
×
C  O
C  SNF
Aici, I  SNF și I  O sunt intensitățile Raman măsurate cu și
fără substrat SNF, respectiv. C  SNF și C  O sunt concentrația
de molecule pentru semnalele Raman măsurate din cele menționate mai sus cu și
fără substrat SNF, respectiv. EF al substratului SNF poate fi
calculat folosind datele din Fig. 3c și Fig. S3A. Concentrațiile de
R6G au fost de 2 × 10-13 mol (0,1 μ M × 2 μ l) atunci când au fost măsurate cu SNF sub-
( C  SNF ) și 1 × 10 -6 mol (500 μ M × 2 mL) atunci când se măsoară fără
Substrat SNF ( C  O ). Intensitățile Raman au fost I  SNF = 6896,90 și I  O =
3052,38, respectiv, EF este, prin urmare, calculat ca 1,13 × 10 7 . Din această
rezultate, a apărut că substratul SNF va fi un SERS valoros
substrat pentru a permite măsurarea sensibilă a proteinelor de la mici
volume de probe folosind un spectrometru Raman de mână.
În cele din urmă, am selectat EpCAM și CEA ca doi biomarkeri model proteici
de cancer. Proteina EpCAM este cunoscută ca factor de inițiere a tumorii pentru mulți
carcinoame deoarece EpCAM este supraexprimat pe celulele maligne de pe o
varietate de tipuri de tumori [24]. În mod similar, CEA este un model de proteină pentru cancer
biomarker a cărui expresie este predictivă pentru creșterea sau regresia
cancere colorectale [25]. Ca și în experimentul anterior, 2 pl de soluții
care conțin diferite concentrații din fiecare proteină au fost aruncate pe
substratul SNF și spectrele SERS au fost ulterior măsurate
(Fig. 4 ). Spectrul Raman al DPBS este prezentat în Fig. S4 ca
control la sol pentru spectrul Raman al biomarkerilor de proteine canceroase. La fel de
așteptat, intensitatea spectrului Raman al DPBS a fost de aproximativ 10
de ori mai mică decât oricare dintre celelalte specii din acest studiu. Pentru EpCAM
proteine (Fig. 4a și Fig. S5 ), cel mai puternic vârf este observat la 827 cm 1
datorită tirozinei, un aminoacid. Celelalte vârfuri specifice din Raman
spectrul EpCAM include: 652 cm 1 datorită N-acetil glucozaminei și
un inel fenilic, 925 cm 1 datorat îndoirii în plan a dezoxiribozei și
1.035 și 1.1162 cm 1 se datorează modului de respirație a inelului simetric
și îndoirea C-H în plan a fenilalaninei. Vârfurile la 1.366,
1.442 și 1.575 cm 1 sunt alocați ν s COO - întindere de triptofan,
CH 2 modul de deformare a proteinelor, și carboxilatul de întindere
vibrația ( ν a COO - ) a triptofanului. Limita de detectare a EpCAM
s-a constatat că proteina are aproximativ 0,2 pmol. Proteina CEA are o importanță majoră
Vârfurile Raman (Fig. 4 b șiFig. S6) la: 859 cm 1 (tirozină), 928 cm 1 (în-
îndoirea plană a dezoxiribozei), 1.051 / 1.133 cm 1 (inelul simetric
modul de respirație și îndoirea C-H în plan a fenilalaninei), 1.397
cm 1 ( ν s COO - întindere de triptofan) și 1.609 / 1.642 cm 1
(grupări carbonil pe vibrația Amidei I [16,18,26,27] . Detectarea
limita CEA a fost, de asemenea, de aproximativ 0,02 pmol. Din aceste rezultate, apare
că combinația dintre substratul SNF și specificațiile Raman portabile
trometrul permite detectarea sensibilă și cuantificarea cancerului
biomarkeri proteici la scara sub-pico din volume mici de probe.
Deși pozițiile vârfurilor au fost similare între cele două pro-
teins, raporturile de intensitate spectrală dintre fiecare vârf au fost ușor
perceptibil. Spectrele Raman ale biomarkerilor de proteine canceroase ar putea fi
analizate și asamblate într-o bază de date pentru simpli, rapizi, sensibili
detectarea din probele pacienților. În plus, substratul SNF este
Se presupune că va fi combinat cu o varietate de platforme microfluidice
[28,29] , ceea ce poate duce la dezvoltarea tehnologiei de laborator pe cip
ogie pentru diagnosticarea punctului de îngrijire. Mai mult, combinație cu ma-
tehnologia de învățare chine va îmbunătăți precizia multiplexării
diagnosticul de cancer bazat pe detectare în rândul diferiților biomarkeri [30] .
Fig. 4. Spectrele Raman ale a) EpCAM și b) Proteinele biomarkerului cancerului CEA la concentrațiile indicate.
HS Kim și colab.

Pagina 6
Jurnalul microchimic 160 (2021) 105632
6
4. Concluzie
Substratul SNF a fost fabricat folosind un sistem de pulverizare cu un
sursă de cluster și performanța substratului SNF combinat cu
un spectrometru Raman de mână a fost evaluat prin variația integrării
timpul de concentrație și concentrațiile de etanol. Aceste studii au arătat o
efect SERS considerabil chiar și cu volume foarte mici de probă (2 µl).
Important, proteinele biomarkerului cancerului au fost ușor identificate și
cuantificat folosind un sistem Raman compus din substratul SNF și a
spectrometru Raman de mână. În viitor, intenționăm să explorăm
posibilitatea unui dispozitiv medical de diagnostic in vitro bazat pe Raman
sistem utilizat în această cercetare.
Declarație de contribuție a autorului CRediT
Hyun Soo Kim: Conceptualizare, metodologie, scriere - original
proiect. Taeha Lee: Metodologie, vizualizare. Jongsu Yun: Metoda lui
ologie, Curația datelor. Gyudo Lee: Supervizare, Scriere - recenzie &
editare. Yoochan Hong: Supraveghere, administrare proiect, scriere -
revizuire și editare.
Declarația de interes concurent
Autorii declară că nu au fonduri financiare concurente cunoscute
interese sau relații personale care ar fi putut părea să influențeze
lucrările raportate în această lucrare.
Mulțumiri
Această lucrare a fost susținută de Institutul de Mașini din Coreea și
Materiale (KIMM) (NK226D), promovarea industriei de siguranță în caz de dezastru
gram finanțat de Ministerul de Interne și Siguranță (MOIS, Coreea) (2019-
MOIS32-028), și Fondul Coreei de Dezvoltare a Dispozitivelor Medicale acordat de
Ministerul Științei și TIC (Coreea) (202012D19).
Anexa A. Date suplimentare
Date suplimentare la acest articol pot fi găsite online la https: // doi .
org / 10.1016 / j.microc.2020.105632 .
Referințe
[1] RL Siegel, KD Miller, A. Jemal, Statistici despre cancer, 2018, CA. Cancer J. Clin. 68
(2018) 7-30, https://doi.org/10.3322/caac.21442.
[2] D. Hanahan, RA Weinberg, Caracteristici ale cancerului: generația următoare, Cell. 144
(2011) 646-674, https://doi.org/10.1016/j.cell.2011.02.013 .
[3] YA Fouad, C. Aanei, Revizuirea semnelor distinctive ale cancerului, Am.  J. Cancer Res. 7
(2017) 1016-1036, https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28560055  .
[4] K. Kourou, G. Rigas, C. Papaloukas, M. Mitsis, DI Fotiadis, Clasificarea cancerului
din datele de tip microarray din serii temporale prin rețele dinamice bayeziene de reglementare,
Calculator. Biol. Med. 116 (2020) 103577, https://doi.org/10.1016/j .
compbiomed.2019.103577.
[5] MH Zangooei, J. Habibi, Modelarea hibridă pe mai multe scale și predicția celulelor canceroase
comportament, PLoS One. 12 (2017), e0183810, https://doi.org/10.1371/journal .
pone.0183810.
[6] L. Wu, A. Teixeira, A. Garrido-Maestu, L. Muinelo-Romay, L. Lima, LL Santos,
M. Prado, L. Diéguez, Profilarea modelelor de mutație ADN prin amprentarea digitală SERS pentru
clasificarea supravegheată a cancerului, Biosens. Bioelectron. 165 (2020) 112392, https: / /
doi.org/10.1016/j.bios.2020.112392 .
[7] D. Bell, A. Berchuck, M. Birrer, J. Chien, DW Cramer, F. Dao, R. Dhir, P. DiSaia, H.
Gabra, P. Glenn, AK Godwin, J. Gross, L. Hartmann, M. Huang, DG Huntsman,
M. Iacocca, M. Imielinski, S. Kalloger, BY Karlan, DA Levine, GB Mills, C.
Morrison, D. Mutch, N. Olvera, S. Orsulic, K. Park, N. Petrelli, B. Rabeno, JS
Rader, BI Sikic, K. Smith-McCune, AK Sood, D. Bowtell, R. Penny, JR Testa, K.
Chang, CJ Creighton, HH Dinh, JA Drummond, G. Fowler, P. Gunaratne, AC
Hawes, CL Kovar, LR Lewis, MB Morgan, IF Newsham, J. Santibanez, JG
Reid, LR Trevino, Y.-Q. Wu, M. Wang, DM Muzny, DA Wheeler, RA Gibbs, G.
Getz, MS Lawrence, K. Cibulskis, AY Sivachenko, C. Sougnez, D. Voet, J.
Wilkinson, T. Bloom, K. Ardlie, T. Fennell, J. Baldwin, R. Nichol, S. Fisher, S.
Gabriel, ES Lander, L. Ding, RS Fulton, DC Koboldt, MD McLellan, T. Wylie, J.
Walker, M. O'Laughlin, DJ Dooling, L. Fulton, R. Abbott, ND Dees, Q. Zhang, C.
Kandoth, M. Wendl, W. Schierding, D. Shen, CC Harris, H. Schmidt, J. Kalicki, K.
D. Delehaunty, CC Fronick, R. Demeter, L. Cook, JW Wallis, L. Lin, VJ Magrini,
JS Hodges, JM Eldred, SM Smith, CS Pohl, F. Vandin, E. Upfal, BJ Raphael,
GM Weinstock, ER Mardis, RK Wilson, M. Meyerson, W. Winckler, G. Getz, RG
W. Verhaak, SL Carter, CH Mermel, G. Saksena, H. Nguyen, RC Onofrio, MS
Lawrence, D. Hubbard, S. Gupta, A. Crenshaw, AH Ramos, K. Ardlie, L. Chin, A.
Protopopov, J. Zhang, TM Kim, I. Perna, Y. Xiao, H. Zhang, G. Ren, N.
Sathiamoorthy, RW Park, E. Lee, PJ Park, R. Kucherlapati, DM Absher, L.
Waite, G. Sherlock, JD Brooks, JZ Li, J. Xu, RM Myers, PW Laird, L. Cope, JG
Herman, H. Shen, DJ Weisenberger, H. Noushmehr, F. Pan, T. Triche Jr, BP
Berman, DJ Van Den Berg, J. Buckley, SB Baylin, PT Spellman, E. Purdom, P.
Neuvial, H. Bengtsson, LR Jakkula, S. Durinck, J. Han, S. Dorton, H. Marr, YG
Choi, V. Wang, NJ Wang, J. Ngai, JG Conboy, B. Parvin, HS Feiler, TP Speed,
JW Grey, DA Levine, ND Socci, Y. Liang, BS Taylor, N. Schultz, L. Borsu, AE
Lash, C. Brennan, A. Viale, C. Sander, M. Ladanyi, KA Hoadley, S. Meng, Y. Du, Y.
Shi, L. Li, YJ Turman, D. Zang, EB Helms, S. Balu, X. Zhou, J. Wu, MD Topal, D.
N. Hayes, CM Perou, G. Getz, D. Voet, G. Saksena, J. Zhang, H. Zhang, CJ Wu, S.
Shukla, K. Cibulskis, MS Lawrence, A. Sivachenko, R. Jing, RW Park, Y. Liu, PJ
Park, M. Noble, L. Chin, H. Carter, D. Kim, J. Samayoa, R. Karchin, PT Spellman,
E. Purdom, P. Neuvial, H. Bengtsson, S. Durinck, J. Han, JE Korkola, LM Heiser,
RJ Cho, Z. Hu, B. Parvin, TP Speed, JW Grey, N. Schultz, E. Cerami, BS Taylor,
A. Olshen, B. Reva, Y. Antipin, R. Shen, P. Mankoo, R. Sheridan, G. Ciriello, WK
Chang, JA Bernanke, L. Borsu, DA Levine, M. Ladanyi, C. Sander, D. Haussler, C.
C. Benz, JM Stuart, SC Benz, JZ Sanborn, CJ Vaske, J. Zhu, C. Szeto, GK
Scott, C. Yau, KA Hoadley, Y. Du, S. Balu, DN Hayes, CM Perou, MD
Wilkerson, N. Zhang, R. Akbani, KA Baggerly, WK Yung, GB Mills, JN
Weinstein, R. Penny, T. Shelton, D. Grimm, M. Hatfield, S. Morris, P. Yena, P.
Rhodes, M. Sherman, J. Paulauskis, S. Millis, A. Kahn, JM Greene, TCGAR
Rețea, (Participanții sunt aranjați în funcție de zona de contribuție și apoi de
instituție.), D. grupuri de lucru și site-uri sursă de țesut, G. centre de secvențiere: BC
of Medicine, B. Institute, WU in S. Louis, C. centre de caracterizare a genomului: BI-
FC Institute, HM School, HI University, U. of SCH University, LBN
Laborator, MS-KC Center, U. of NC la C. Hill, G. centre de analiză a datelor: B.
Institute, JH University, U. of CSC Institute, TU of TMDAC Center, B. core
resursă, D. centru de coordonare, Analize genomice integrate ale ovarului
carcinom, Natura. 474 (2011) 609-615. https://doi.org/10.1038/nature10166.
[8] DM Muzny, MN Bainbridge, K. Chang, HH Dinh, JA Drummond, G. Fowler, C.
L. Kovar, LR Lewis, MB Morgan, IF Newsham, JG Reid, J. Santibanez, E.
Shinbrot, LR Trevino, Y.-Q. Wu, M. Wang, P. Gunaratne, LA Donehower, CJ
Creighton, DA Wheeler, RA Gibbs, MS Lawrence, D. Voet, R. Jing, K. Cibulskis,
A. Sivachenko, P. Stojanov, A. McKenna, ES Lander, S. Gabriel, G. Getz, L. Ding,
RS Fulton, DC Koboldt, T. Wylie, J. Walker, DJ Dooling, L. Fulton, KD
Delehaunty, CC Fronick, R. Demeter, ER Mardis, RK Wilson, A. Chu, H.-JE
Chun, AJ Mungall, E. Pleasance, A. Gordon Robertson, D. Stoll, M. Balasundaram,
I. Birol, YSN Butterfield, E. Chuah, RJN Coope, N. Dhalla, R. Guin, C. Hirst, M.
Hirst, RA Holt, D. Lee, HI Li, M. Mayo, RA Moore, JE Schein, JR Slobodan, A.
Tam, N. Thiessen, R. Varhol, T. Zeng, Y. Zhao, SJM Jones, MA Marra, AJ Bass,
AH Ramos, G. Saksena, AD Cherniack, SE Schumacher, B. Tabak, SL Carter, N.
H. Pho, H. Nguyen, RC Onofrio, A. Crenshaw, K. Ardlie, R. Beroukhim, W.
Winckler, G. Getz, M. Meyerson, A. Protopopov, J. Zhang, A. Hadjipanayis, E. Lee,
R. Xi, L. Yang, X. Ren, H. Zhang, N. Sathiamoorthy, S. Shukla, P.-C. Chen, P.
Haseley, Y. Xiao, S. Lee, J. Seidman, L. Chin, PJ Park, R. Kucherlapati, J. Todd
Auman, KA Hoadley, Y. Du, MD Wilkerson, Y. Shi, C. Liquori, S. Meng, L. Li, YJ
Turman, MD Topal, D. Tan, S. Waring, E. Buda, J. Walsh, CD Jones, PA
Mieczkowski, D. Singh, J. Wu, A. Gulabani, P. Dolina, T. Bodenheimer, AP Hoyle,
J. V Simons, M. Soloway, LE Mose, SR Jefferys, S. Balu, BD O'Connor, JF
Prins, DY Chiang, D. Neil Hayes, CM Perou, T. Hinoue, DJ Weisenberger, DT
Maglinte, F. Pan, BP Berman, DJ Van Den Berg, H. Shen, T. Triche Jr, SB Baylin,
PW Laird, G. Getz, M. Noble, D. Voet, G. Saksena, N. Gehlenborg, D. DiCara, J.
Zhang, H. Zhang, C.-J. Wu, S. Yingchun Liu, S. Shukla, MS Lawrence, L. Zhou, A.
Sivachenko, P. Lin, P. Stojanov, R. Jing, RW Park, M.-D. Nazaire, J. Robinson, H.
Thorvaldsdottir, J. Mesirov, PJ Park, L. Chin, V. Thorsson, SM Reynolds, B.
Bernard, R. Kreisberg, J. Lin, L. Iype, R. Bressler, T. Erkkilä, M. Gundapuneni, Y.
Liu, A. Norberg, T. Robinson, D. Yang, W. Zhang, I. Shmulevich, JJ de Ronde, N.
Schultz, E. Cerami, G. Ciriello, AP Goldberg, B. Gross, A. Jacobsen, J. Gao, B.
Kaczkowski, R. Sinha, B. Arman Aksoy, Y. Antipin, B. Reva, R. Shen, BS Taylor, T.
A. Chan, M. Ladanyi, C. Sander, R. Akbani, N. Zhang, BM Broom, T. Casasent, A.
Unruh, C. Wakefield, SR Hamilton, R. Craig Cason, KA Baggerly, JN Weinstein,
D. Haussler, CC Benz, JM Stuart, SC Benz, J. Zachary Sanborn, CJ Vaske, J.
Zhu, C. Szeto, GK Scott, C. Yau, S. Ng, T. Goldstein, K. Ellrott, E. Collisson, AE
Cozen, D. Zerbino, C. Wilks, B. Craft, P. Spellman, R. Penny, T. Shelton, M.
Hatfield, S. Morris, P. Yena, C. Shelton, M. Sherman, J. Paulauskis, JM Gastier-
Foster, J. Bowen, NC Ramirez, A. Black, R. Pyatt, L. Wise, P. White, M.
Bertagnolli, J. Brown, TA Chan, GC Chu, C. Czerwinski, F. Denstman, R. Dhir, A.
Dörner, CS Fuchs, JG Guillem, M. Iacocca, H. Juhl, A. Kaufman, B. Kohl III, X.
Van Le, MC Mariano, EN Medina, M. Meyers, GM Nash, PB Paty, N. Petrelli, B.
Rabeno, WG Richards, D. Solit, P. Swanson, L. Temple, JE Tepper, R. Thorp, E.
Vakiani, MR Weiser, JE Willis, G. Witkin, Z. Zeng, MJ Zinner, TCGA
Network, GSCBC of Medicine, GSCB Institute, GSCWU in S. Louis, GCCB
Agenția CC, Institutul G.-CCB, G.-CCB și Școala WH și HM, CH
Centrul de caracterizare a genomului Universitatea din Carolina de Nord, G.-CCU din SC
și Universitatea JH, Institutul GDACB, GDACI pentru S. Biologie, GDACMS-K.
C. Center, GDACU al TMDAC Center, U. of C. Genome Data Analysis Centre
Santa Cruz și Institutul Buck, Consorțiul BCRIG, Resurse NCHBC, T.
site-uri sursă și grup de lucru pentru boli, caracterizare moleculară cuprinzătoare
a cancerului de colon și rect la om, Natura. 487 (2012) 330–337. https://doi.org/
10.1038 / nature11252.
HS Kim și colab.

Pagina 7
Jurnalul microchimic 160 (2021) 105632
7
[9] EA Collisson, JD Campbell, AN Brooks, AH Berger, W. Lee, J. Chmielecki, DG
Bere, L. Cope, CJ Creighton, L. Danilova, L. Ding, G. Getz, PS Hammerman, D.
Neil Hayes, B. Hernandez, JG Herman, J. V Heymach, I. Jurisica, R. Kucherlapati,
D. Kwiatkowski, M. Ladanyi, G. Robertson, N. Schultz, R. Shen, R. Sinha, C.
Sougnez, M.-S. Tsao, WD Travis, JN Weinstein, DA Wigle, MD Wilkerson, A.
Chu, AD Cherniack, A. Hadjipanayis, M. Rosenberg, DJ Weisenberger, PW
Laird, A. Radenbaugh, S. Ma, JM Stuart, L. Averett Byers, SB Baylin, R.
Govindan, M. Meyerson, M. Rosenberg, SB Gabriel, K. Cibulskis, C. Sougnez, J.
Kim, C. Stewart, L. Lichtenstein, ES Lander, MS Lawrence, G. Getz, C. Kandoth,
R. Fulton, LL Fulton, MD McLellan, RK Wilson, K. Ye, CC Fronick, CA Maher,
CA Miller, MC Wendl, C. Cabanski, L. Ding, E. Mardis, R. Govindan, CJ
Creighton, D. Wheeler, M. Balasundaram, YSN Butterfield, R. Carlsen, A. Chu, E.
Chuah, N. Dhalla, R. Guin, C. Hirst, D. Lee, HI Li, M. Mayo, RA Moore, AJ
Mungall, JE Schein, P. Sipahimalani, A. Tam, R. Varhol, A. Gordon Robertson, N.
Wye, N. Thiessen, RA Holt, SJM Jones, MA Marra, JD Campbell, AN Brooks,
J. Chmielecki, M. Imielinski, RC Onofrio, E. Hodis, T. Zack, C. Sougnez, E.
Helman, C. Sekhar Pedamallu, J. Mesirov, AD Cherniack, G. Saksena, SE
Schumacher, SL Carter, B. Hernandez, L. Garraway, R. Beroukhim, SB Gabriel,
G. Getz, M. Meyerson, A. Hadjipanayis, S. Lee, HS Mahadeshwar, A. Pantazi, A.
Protopopov, X. Ren, S. Seth, X. Song, J. Tang, L. Yang, J. Zhang, P.-C. Chen, M.
Parfenov, A. Wei Xu, N. Santoso, L. Chin, PJ Park, R. Kucherlapati, KA Hoadley,
J. Todd Auman, S. Meng, Y. Shi, E. Buda, S. Waring, U. Veluvolu, D. Tan, PA
Mieczkowski, CD Jones, J. V Simons, MG Soloway, T. Bodenheimer, SR
Jefferys, J. Roach, AP Hoyle, J. Wu, S. Balu, D. Singh, JF Prins, JS Marron, JS
Parker, D. Neil Hayes, CM Perou, J. Liu, L. Cope, L. Danilova, DJ Weisenberger,
DT Maglinte, PH Lai, MS Bootwalla, DJ Van Den Berg, T. Triche Jr, SB
Baylin, PW Laird, M. Rosenberg, L. Chin, J. Zhang, J. Cho, D. DiCara, D. Heiman,
P. Lin, W. Mallard, D. Voet, H. Zhang, L. Zou, MS Noble, MS Lawrence, G.
Saksena, N. Gehlenborg, H. Thorvaldsdottir, J. Mesirov, M.-D. Nazaire, J.
Robinson, G. Getz, W. Lee, B. Arman Aksoy, G. Ciriello, BS Taylor, G. Dresdner, J.
Gao, B. Gross, VE Seshan, M. Ladanyi, B. Reva, R. Sinha, S. Onur Sumer, N.
Weinhold, N. Schultz, R. Shen, C. Sander, S. Ng, S. Ma, J. Zhu, A. Radenbaugh, JM
Stuart, CC Benz, C. Yau, D. Haussler, PT Spellman, MD Wilkerson, JS Parker,
KA Hoadley, PK Kimes, D. Neil Hayes, CM Perou, BM Broom, J. Wang, Y. Lu,
P. Kwok Shing Ng, L. Diao, L. Averett Byers, W. Liu, J. V Heymach, CI Amos, JN
Weinstein, R. Akbani, GB Mills, E. Curley, J. Paulauskis, K. Lau, S. Morris, T.
Shelton, D. Mallery, J. Gardner, R. Penny, C. Saller, K. Tarvin, WG Richards, R.
Cerfolio, A. Bryant, DP Raymond, NA Pennell, C. Farver, C. Czerwinski, L.
Huelsenbeck-Dill, M. Iacocca, N. Petrelli, B. Rabeno, J. Brown, T. Bauer, O.
Dolzhanskiy, O. Potapova, D. Rotin, O. Voronina, E. Nemirovich-Danchenko, K. V
Fedosenko, A. Gal, M. Behera, SS Ramalingam, G. Sica, D. Flieder, J. Boyd, J.
Weaver, B. Kohl, D. Huy Quoc Thinh, G. Sandusky, H. Juhl, TCGAR Network, D.
grup de lucru de analiză, centre de secvențiere G.: Institutul TE & ELB, WU în St.
Louis, BC of Medicine, BCCA Centre de caracterizare a genomului: Canada
Centrul de Științe ale Genomului Michael Smith, Institutul TE & ELB, HMS și WHAC
Center, Universitatea CH din Carolina de Nord, U. Kentucky, TUEC Center, G. date
centre de analiză: TE & ELB Institute, MS-KC Center, SCI University of
California, OH și S. University, TU al TMDAC Center, B. resursă principală: IG
Consortium, I. Site-uri sursă de țesuturi: Serviciul biologic analitic, B. & W. Hospital,
U. A. în Birmingham, C. Clinic, C. Care, Cureline, E. University, FCC Center,
ILSbio, Universitatea I., Indivumed, Spitalul JF, Profilare moleculară cuprinzătoare
de adenocarcinom pulmonar, Natura. 511 (2014) 543-550. https://doi.org/10.1038/
natură13385.
[10] DC Koboldt, RS Fulton, MD McLellan, H. Schmidt, J. Kalicki-Veizer, JF
McMichael, LL Fulton, DJ Dooling, L. Ding, ER Mardis, RK Wilson, A. Ally, M.
Balasundaram, YSN Butterfield, R. Carlsen, C. Carter, A. Chu, E. Chuah, H.-JE
Chun, RJN Coope, N. Dhalla, R. Guin, C. Hirst, M. Hirst, RA Holt, D. Lee, HI Li,
M. Mayo, RA Moore, AJ Mungall, E. Pleasance, A. Gordon Robertson, JE
Schein, A. Shafiei, P. Sipahimalani, JR Slobodan, D. Stoll, A. Tam, N. Thiessen, R.
J. Varhol, N. Wye, T. Zeng, Y. Zhao, I. Birol, SJM Jones, MA Marra, AD
Cherniack, G. Saksena, RC Onofrio, NH Pho, SL Carter, SE Schumacher, B.
Tabak, B. Hernandez, J. Gentry, H. Nguyen, A. Crenshaw, K. Ardlie, R. Beroukhim,
W. Winckler, G. Getz, SB Gabriel, M. Meyerson, L. Chin, PJ Park, R.
Kucherlapati, KA Hoadley, J. Todd Auman, C. Fan, YJ Turman, Y. Shi, L. Li, MD
Topal, X. He, H.-H. Chao, A. Prat, GO Silva, MD Iglesia, W. Zhao, J. Usary, JS
Berg, M. Adams, J. Booker, J. Wu, A. Gulabani, T. Bodenheimer, AP Hoyle, J. V
Simons, MG Soloway, LE Mose, SR Jefferys, S. Balu, JS Parker, D. Neil Hayes,
CM Perou, S. Malik, S. Mahurkar, H. Shen, DJ Weisenberger, T. Triche Jr, PH
Lai, MS Bootwalla, DT Maglinte, BP Berman, DJ Van Den Berg, SB Baylin, P.
W. Laird, CJ Creighton, LA Donehower, G. Getz, M. Noble, D. Voet, G. Saksena,
N. Gehlenborg, D. DiCara, J. Zhang, H. Zhang, C.-J. Wu, S. Yingchun Liu, MS
Lawrence, L. Zou, A. Sivachenko, P. Lin, P. Stojanov, R. Jing, J. Cho, R. Sinha, RW
Park, M.-D. Nazaire, J. Robinson, H. Thorvaldsdottir, J. Mesirov, PJ Park, L. Chin,
S. Reynolds, RB Kreisberg, B. Bernard, R. Bressler, T. Erkkila, J. Lin, V. Thorsson,
W. Zhang, I. Shmulevich, G. Ciriello, N. Weinhold, N. Schultz, J. Gao, E. Cerami, B.
Gross, A. Jacobsen, R. Sinha, B. Arman Aksoy, Y. Antipin, B. Reva, R. Shen, BS
Taylor, M. Ladanyi, C. Sander, P. Anur, PT Spellman, Y. Lu, W. Liu, RRG
Verhaak, GB Mills, R. Akbani, N. Zhang, BM Broom, TD Casasent, C. Wakefield,
AK Unruh, K. Baggerly, K. Coombes, JN Weinstein, D. Haussler, CC Benz, JM
Stuart, SC Benz, J. Zhu, CC Szeto, GK Scott, C. Yau, EO Paull, D. Carlin, C.
Wong, A. Sokolov, J. Thusberg, S. Mooney, S. Ng, TC Goldstein, K. Ellrott, M.
Grifford, C. Wilks, S. Ma, B. Craft, C. Yan, Y. Hu, D. Meerzaman, JM Gastier-
Foster, J. Bowen, NC Ramirez, AD Black, RE Pyatt, P. White, EJ Zmuda, J.
Frick, TM Lichtenberg, R. Brookens, MM George, MA Gerken, HA Harper, K.
M. Leraas, LJ Wise, TR Tabler, C. McAllister, T. Barr, M. Hart-Kothari, K. Tarvin,
C. Saller, G. Sandusky, C. Mitchell, M. V Iacocca, J. Brown, B. Rabeno, C.
Czerwinski, N. Petrelli, O. Dolzhansky, M. Abramov, O. Voronina, O. Potapova, J.
R. Marks, WM Suchorska, D. Murawa, W. Kycler, M. Ibbs, K. Korski, A. Spychała,
P. Murawa, JJ Brzezinski, H. Perz, R. Łazniak, M. Teresiak, H. Tatka, E.
Leporowska, M. Bogusz-Czerniewicz, J. Malicki, A. Mackiewicz, M. Wiznerowicz,
X. Van Le, B. Kohl, N. Viet Tien, R. Thorp, N. Van Bang, H. Sussman, B. Duc Phu, R.
Hajek, N. Phi Hung, T. Viet The Phuong, H. Quyet Thang, K. Zaki Khan, R. Penny,
D. Mallery, E. Curley, C. Shelton, P. Yena, JN Ingle, FJ Couch, WL Lingle, TA
King, A. Maria Gonzalez-Angulo, GB Mills, MD Dyer, S. Liu, X. Meng, M.
Patangan, TCGA Network, G. centre de secvențiere: WU în S. Louis, G.
centre de caracterizare: BCC Agency, B. Institute, B. & WH & HM School, CH
Universitatea din Carolina de Nord, U. SC Hopkins, G. analiza datelor: BC of Medicine,
I. pentru S. Biology, MS-KC Center, OH & S. University, TU al TMDAC Center,
SCI University of California, NCI, B. resursă principală: resurse NCHBC, sursă T.
site-uri: ABS-IUPUI, Christiana, Cureline, DUM Center, TGPC Center, ILSBio, IG
Consorțiu, M. Clinic, MSKCC, MDAC Center, Comprehensive molecular
portrete ale tumorilor mamare umane, Natura. 490 (2012) 61-70. https://doi.org/
10.1038 / nature11412.
[11] P. Sidaway, subtipuri Glioblastoma revizuite, Nat. Pr. Clin. Oncol. 14 (2017) 587,
https://doi.org/10.1038/nrclinonc.2017.122 .
[12] Y. Zhang, Z. Wang, L. Wu, S. Zong, B. Yun, Y. Cui, combinând multiplex SERS
Nanovectori și analize multivariate pentru profilarea in situ a tumorii circulante
Fenotip celular folosind un cip microfluidic, mic. 14 (2018) 1704433,https: // doi .
org / 10.1002 / smll.201704433.
[13] K. Jao, P. Tomasini, S. Kamel-Reid, GJ Korpanty, C. Mascaux, S. Sakashita,
C. Labbé, NB Leighl, G. Liu, R. Feld, PA Bradbury, DM Hwang, M. Pintilie, M.-
S. Tsao, FA Shepherd, Efectul prognostic al cancerului unic și multiplu legat de cancer
mutații somatice în cancerul pulmonar fără celule mici rezecate, cancerul pulmonar. 123 (2018)
22–29, https://doi.org/10.1016/j.lungcan.2018.06.023 .
[14] J. Jin, X. Wu, J. Yin, M. Li, J. Shen, J. Li, Y. Zhao, Q. Zhao, J. Wu, Q. Wen, C.
H. Cho, T. Yi, Z. Xiao, L. Qu, Identificarea mutațiilor genetice în cancer:
Provocare și oportunitate în noua eră a terapiei țintite, din față. Oncol. 9
(2019) 263, https://doi.org/10.3389/fonc.2019.00263 .
[15] X. Liu, X. Liu, P. Rong, D. Liu, Progrese recente în Raman fără fundal
împrăștiere pentru bioanaliză, TrAC Trends Anal. Chem. 123 (2020), 115765,https: / /
doi.org/10.1016/j.trac.2019.115765 .
[16] S. Shanmukh, L. Jones, J. Driskell, Y. Zhao, R. Dluhy, RA Tripp, Rapid și
Detectarea sensibilă a semnăturilor moleculare ale virusului respirator folosind un argint
Nanorod Array SERS Substrat, Nano Lett. 6 (2006) 2630–2636, https://doi.org /
10.1021 / nl061666f .
[17] S. Kumar, DK Lodhi, P. Goel, P. Neeti, JPS Mishra, O metodă facilă pentru
fabricarea de matrice de nanoroduri de argint PDMS cu catarame ca cuști 3D SERS active pentru
detectarea bacteriilor, Chem. Comun. 51 (2015) 12411–12414,https://doi.org /
10.1039 / C5CC03604F.
[18] SK Gahlaut, D. Savargaonkar, C. Sharan, S. Yadav, P. Mishra, JP Singh, SERS
Platforma pentru diagnosticul de dengue din probe clinice care utilizează un dispozitiv portabil
Spectrometru Raman, anal. Chem. 92 (2020) 2527–2534, https://doi.org /
10.1021 / acs.analchem.9b04129 .
[19] JP Singh, TE Lanier, H. Zhu, WM Dennis, RA Tripp, Y. Zhao, Foarte sensibil
și suprafețe transparente îmbunătățite substraturi de împrăștiere raman realizate de active
matrice ag nanorod condensate la rece, J. Phys. Chem. C. 116 (2012) 20550–20557,
https://doi.org/10.1021/jp305061s.
[20] S. Yun, Y. Hong, Y. Yang, D. Lee, B. Kim, C. Cho, Porost Nanostructures by Lo w
Pulverizare sub vid pentru împrăștiere Raman îmbunătățită la suprafață, J. Nanosci .
Nanotehnologia. 17 (2017) 8528–8533, https://www.ingentaconnect.com/content  /
asp / jnn / 2017/00000017/00000011 / art00123 .
[21] C. Pappas, B. Marianthi, E. Konstantinou, N. Proxenia, S. Kallithraka, Y. Kotseridis,
PA Taranilis, Evaluarea unei metode spectroscopice raman pentru determinare
a conținutului de alcool în spirit grecesc tsipouro, Curr. Rez. Nutr. Științe alimentare. 4 (2016) 1-9,
https://doi.org/10.12944/CRNFSJ.4.Special-Issue-October.01.
[22] Y. Numata, Y. Iida, H. Tanaka, Analiza cantitativă a alcoolului-apă binare
soluții folosind spectroscopia Raman, J. Quant. Spectroscopie. Radiat. Transf. 112
(2011) 1043-1049, https://doi.org/10.1016/j.jqsrt.2011.01.005.
[23] XN He, Y. Gao, M. Mahjouri-Samani, PN Black, J. Allen, M. Mitchell, W. Xiong,
YS Zhou, L. Jiang, YF Lu, Spectroscopie Raman îmbunătățită la suprafață folosind aur
nanotuburi de carbon aliniate orizontal, nanotehnologie. 23 (2012),
205702, https://doi.org/10.1088/0957-4484/23/20/205702.
[24] S. Imrich, M. Hachmeister, O. Gires, EpCAM și rolul său potențial în tumoră-
celule de inițiere, Cell Adh. Migr. 6 (2012) 30-38, https://doi.org/10.4161 /
cam.18953.
[25] J. Jia, P. Zhang, M. Gou, F. Yang, N. Qian, G. Dai, The Role of Serum CEA și
CA19-9 în Evaluări de eficiență și predicții de supraviețuire fără progresie pentru
Pacienți tratați cu Cetuximab în combinație cu FOLFOX4 sau FOLFIRI
Linie de tratament pentru cancerul colorectal avansat, Dis. Marcatori. 2019 (2019)
6812045, https://doi.org/10.1155/2019/6812045.
[26] A. Rygula, K. Majzner, KM Marzec, A. Kaczor, M. Pilarczyk, M. Baranska, Raman
spectroscopia proteinelor: o recenzie, J. Raman Spectrosc. 44 (2013) 1061-1076,
https://doi.org/10.1002/jrs.4335.
[27] B. Brozek-Pluska, K. Miazek, J. Musiał, R. Kordek, Diagnostic fără etichetă și
chirurgia cancerului Ghidul spectrelor Raman pentru colonul uman la diferite excitații
lungimi de undă, RSC Adv. 9 (2019) 40445–40454, https://doi.org/10.1039 /
C9RA06831G .
[28] L. Wang, G. Zhou, X. Guan, L. Zhao, Pregătirea rapidă a Raman cu suprafață îmbunătățită
substrat în canal microfluidic pentru detectarea urmelor de amoxicilină, Spectrochim,
HS Kim și colab.

Pagina 8
Jurnalul microchimic 160 (2021) 105632
8
Acta Partea A Mol. Biomol. Spectroscopie. 235 (2020), 118262,https://doi.org/10.1016 /
j.saa.2020.118262 .
[29] X. He, X. Zhou, Y. Liu, X. Wang, Ultrasensibil, reciclabil și portabil
biosenzor microfluidic de suprafață cu dispersie raman (SERS) pentru ioni uranil
detectare, senzori actuatori B chim. 311 (2020), 127676, https://doi.org /
10.1016 / j.snb.2020.127676 .
[30] N. Banaei, J. Moshfegh, A. Mohseni-Kabir, JM Houghton, Y. Sun, B. Kim, Machine
algoritmii de învățare îmbunătățesc specificitatea detectării biomarkerilor de cancer folosind
Imunoanalize bazate pe SERS în cipuri microfluidice, RSC Adv. 9 (2019) 1859-1868