Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
Curs 2 Fi
Curs 2 Fi
• Carcteristici:
– Structura macromoleculara alcatuita din monomeri -
formeaza lanturi moleculare cu rolul de a stoca informative
ereditara
– Elementele component au structura cu capacitate de
matrita/model de sinteza al altor molecule complementare
– Prezinta stabilitate (la agenti chimici, fizici, mecanici) in
vederea conservarii informatiei ereditare – mecanisme de
reparare
– Asigura continuitatea in evolutie – caracter ereditar
– Poate suferi modificari in succesiunea monomerilor
(rearanjari moleculare) – caracter de variabilitate
• Istoria ADN:
– ADN - Acid timonucleic - extras din timus
– ARN - Acid zimonucleic - extras din drojdia de bere
– Acid deoxiribonucleic - pentoza din structura monomerilor -
deoxiriboza
– Acid ribonucleic - pentoza=riboza
STRUCTURA PRIMARA
BAZE AZOTATE
Clasificare:
- Purinice: (A) - adenina si (G) - guanina
- Pirimidinice: (T) - timina si (C) - citozina
+
PENTOZA (deoxiriboza)
=Nucleozid
Grupul fosforic
– se leaga de C5 si C3
al deoxiribozei
(leg. fosfodiester)
= NUCLEOTID
ADN – STRUCTURA
Structura primara
- structura momocatenara rezultata in urma polimerizarii
nucleotidelor
- 2 nucleotide alaturate se leaga prin intermediul radicalului
fosforic in pozitiile C5-C3
- caracteristica structurii primare este data secventa
(ordinea) nucleotidelor din catena polinucleotidica
ADN – STRUCTURA
STRUCTURA SECUNDARA
Legatura de hidrogen
-Imperecherile dintre bazele azotate dintre cele 2 catene = imperecheri de tip
Watson-Crick
- A=T imperechere de tip Hoogsten, in ADN triplu helix (ADN-H) si in ARNt
STRUCTURA SECUNDARA
Tipuri de ADN
Tipul A
- la concentratii saline mari, in cazul deshidratarii
- in vivo, in ARN in zonele unde gruparea 2’-OH
impiedica adoptarea formei B
- in duplexurile hibride ADN-ARN
Tipul B
-structura generala a ADN, in regiunile active
metabolic (eucromatina)
-Dublul helix prezinta 2 fose: principala si mica
Tipul Z
- rasucit spre stanga, cu cele mai multe nucleotide
per tura de spira (12)
- prezinta o singura fosa
- in polimerii care au baze azotate alterate
- in vitro apare la concentratii mari de saruri
Tipuri de ADN
Tipul de Directia de Perechi de Rotatia pe Diametrul
ADN rotatie a baze pe pas perechi de moleculei
moleculei elice baze Å
A dreapta 11 +34,7 23
B dreapta 10 34,0 19
Z stanga 12 -30 18
STRUCTURA TERTIARA
-Rezulta din rasuciri, plieri sau suprarasuciri ale dublului helix structura 3D
Parametrii de topologie:
Densitatea de suprarasucire (superhelical density): σ, numarul de
super ture pentru o tura de elice
Numarul de inlantuiri L (linking number): numarul de ture ale unei
catene in jurul axei dublului helix intr-o molecula circulara dispusa
ipotetic pe o suprafata plana
Moleculele care nu difera decat prin indicele L = topoizomeri
Numarul de rasuciri T (twisting number): numarul total de ture (nr.
total de baze/nr baze pe tura)
Numarul de supra-rasuciri W (writhing number): 0 pentru molecula
relaxata, “n” pentru forma supra-rasucita
L = W+T
Structura topoizomerazelor
Starea relaxata
-Tensiunea de la nivelul dublului helix este minima,
caracteristica pentru ADN tip B cu 10 perechi de baze pe
tur (10.5pb, Klug, Premiul Nobel 1982)
Starea supra-rasucita
-Supra-rasuciri (supercoiling) pozitive: numarul de
rasuciri creste, tensiunea care apare determina formarea
unei super-helix pozitiv
-Supra-rasuciri negative: scade numarul de rasuciri
helix negativ, cel mai frecvent in natura, si permit o mai
buna interactie cu proteinele si enzimele implicate in
replicare si transcriptie
- la EK supra-rasuciri negative sunt cele care permit o
buna atasare a histonelor
Structura topoizomerazelor
2 clase de topoizomeraze:
Tpoizomeraze de tip I: taie si re-sudeaza o singura catena de ADN, relaxand-o
prin suprimarea superturelor negative. Aduc ADN-ul supra-rasucit la conformatia
sa initiala.
Topoizomeraze de tip II (giraze): taie ambele catene de ADN si apoi le resudeaza
Aplicatiii medicale:
-quinolonele (Negram, acid nalidixic, novobiocina) pentru tratamentul infectiilor
urinare produse de colibacili
- etopozid, taxolul anticancerigeni, blocheaza refacerea legaturilor din ADN
dupa taierea de catre topoizomeraze
Proprietatile fizico-chimice ale ADN
Consecintele compozitiei
- Dozarea ADN pentru continutul in deoxiriboza: coloratia Feulgen
- Absorbtia in UV: la 260nm datorita continutului in baze azotate
Proprietatile mecanice
-Spre deosebire de proteine, scheletul acizilor nucleici este flexibil si extensibil,
esential pentru replicare si transcriptie
Proprietatile fizico-chimice ale ADN
Denaturarea/renaturarea ADN
Fibra de 30 nm = solenoidul (6
nucleosomi pe spira completa)
Fibra de 700 nm