Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
Clasa 1
OXIDOREDUCTAZE EC: 1
D + AH
DH2 + A 2
Denumirea sistematică:
donor de echivalenţi reducători : acceptor de echivalenţi reducători oxidoreductaze .
2
http://slide pdf.c om/re a de r/full/e nz ime -3-oxidore duc ta z e 2/56
DH2 O2 DH2 O2
(Red)
Oxidaze Oxidaze
(Oxigenaze) (Oxigenaze)
D H2O D H2O2
(Ox)
unde DH – substrat donor de hidrogen; AH2 – cosubstrat donor de hidrogen; D-OH este
substrat hidroxilat
http://slide pdf.c om/re a de r/full/e nz ime -3-oxidore duc ta z e
3
3/56
Transportori de hidrogen
COENZIME NICOTINICE
(COENZIME PIRIDINICE)
4
http://slide pdf.c om/re a de r/full/e nz ime -3-oxidore duc ta z e 4/56
Structură chimică: cele două forme biologic active ale amidei nicotinice (vitamina B3):
Nicotinamid adenindinucleotid - NAD+ (în forma oxidată) Acestea sunt compuse din
două nucleotide legate între
Nicotinamid adenindinucleotid fosfat -NADP+ (forma oxidată). ele prin intermediul
grupărilor fosfat, printr-o
NH legătură fosfoanhidridică
O 2
C N
Nicotinamidã N
NH2
+
N N
N NADP+ posedă o
O O Adeninã
5' grupare fosforil
5'
2' 3' CH2 în plus, legată
CH2 O P O P O
1' OH OH OH
O de C2 al restului
4' OH
4' 1' de riboză legat
O 3' 2' de adenină
NAD+
esterificat cu
OH OH
H3PO4
NADP+
OPO3H2 5
http://slide pdf.c om/re a de r/full/e nz ime -3-oxidore duc ta z e 5/56
Mecanism de acţiune
Nucleotidele NAD+ şi NADP+ funcţionează ca acceptori reversibili ai
echivalenţilor reducători: protoni şi electroni, şi deci ca transportori de
hidrogen.
H O
H H O
C NH2 2[H] NH2
C
+ + H+
N N
2[H]
R R
6
http://slide pdf.c om/re a de r/full/e nz ime -3-oxidore duc ta z e 6/56
5/24/2018 Enz ime -3-Oxidore duc ta z e - slide pdf.c om
H O O
H H
4
C NH2 C NH2
5 H H 4
3
+
6 + 2 + D H + 1 + H
N1 H N
R
Substrat oxidat (D)
R
Formula generalã a
Formula generalã a Substrat redus
coenzimelor nicotinice
coenzimelor nicotinice (DH2)
reduse (NADH+ sau NADPH+)
oxidate (NAD+ sau NADP+)
Unul din electroni este utilizat pentru neutralizarea sarcinii atomului de azot
cuaternar în poziţia 1 iar un electron şi un proton dau naştere atomului de
hidrogen care se fixează în poziţia 4, formâdu-se NADH şi NADPH.
Cel de-al doilea proton (H+) eliberat de substrat rămâne liber în mediul de reacţie.
7
http://slide pdf.c om/re a de r/full/e nz ime -3-oxidore duc ta z e 7/56
5/24/2018 Enz ime -3-Oxidore duc ta z e - slide pdf.c om
Caracteristici funcționale
proteic apoenzimatic
• au potențial de oxidoreducere foarte scăzut:
E’o= - 0,32 V
+ +
•
8
http://slide pdf.c om/re a de r/full/e nz ime -3-oxidore duc ta z e 8/56
5/24/2018 Enz ime -3-Oxidore duc ta z e - slide pdf.c om
a l co o l d e h i d ro g e n a za O
CH3-CH2-OH + NAD+ H3C C + NADH + H+
H
Alcool etilic Acetaldehidã
9
http://slide pdf.c om/re a de r/full/e nz ime -3-oxidore duc ta z e 9/56
5/24/2018 Enz ime -3-Oxidore duc ta z e - slide pdf.c om
CH3
CH + NAD+
3 NADH +H
C O HO CH Lactat : NAD+
oxidoreductaza
COOH lactat-dehidrogenaza COOH (enzimă Zn2+ dependentă)
(EC:1.1.1.27)
Acid piruvic Acid L-lactic
NADH + H+
COOH NAD+
COOH
HO CH C O
Malat: NAD+ oxidoreductaza
malat-dehidrogenaza CH2
CH3 (EC:1.1.1.37)
COOH
COOH
Acid L-malic Acid oxalilacetic
10
http://slide pdf.c om/re a de r/full/e nz ime -3-oxidore duc ta z e 10/56
5/24/2018 Enz ime -3-Oxidore duc ta z e - slide pdf.c om
CH2 OH CH2 OH
-glicerofosfat-DH
HC OH O C O O
CH2 O P OH CH2 O P OH
+
NAD
OH OH
Acid -glicerofosforic NADH + H + Dihidroxiacetonfosfat
11
http://slide pdf.c om/re a de r/full/e nz ime -3-oxidore duc ta z e 11/56
5/24/2018 Enz ime -3-Oxidore duc ta z e - slide pdf.c om
12
http://slide pdf.c om/re a de r/full/e nz ime -3-oxidore duc ta z e 12/56
5/24/2018 Enz ime -3-Oxidore duc ta z e - slide pdf.c om
H2 C O PO3H2 H2 C O PO3 H2
Glucozo-6-fosfat-dehidrogenaza
(EC: 1.1.1.49)
O O
OH OH O D-glucozo-6-fosfat-
NADP+ oxidoreductaza
OH OH NADP+ OH
OH OH
NADPH + H+
-D-Glucozo-6-fosfat Acid 6-fosfo-gluconic
13
http://slide pdf.c om/re a de r/full/e nz ime -3-oxidore duc ta z e 13/56
5/24/2018 Enz ime -3-Oxidore duc ta z e - slide pdf.c om
CH3
O
HOOC CH2 C CH2 C ~ SCoA
OH -Hidroxi- -metilglutaril~SCoA
(HMG~SCoA)
2NADPH + 2H+
CH3
OH Acid mevalonic
14
http://slide pdf.c om/re a de r/full/e nz ime -3-oxidore duc ta z e 14/56
5/24/2018 Enz ime -3-Oxidore duc ta z e - slide pdf.c om
H N H N
2 2
C NH2 C O
H N H N
COOH
FACTOR DE
COOH
RELAXARE
L-Argininã L-Citrulinã ENDOTELIALĂ
terahidrobiopterinã (BH4)
Reacția este complexă și flavin mononucleotid (FMN)
are mai mulți cofactori: flavin adenindinucleotid (FAD)
calmodulinã (CaM) 15
http://slide pdf.c om/re a de r/full/e nz ime -3-oxidore duc ta z e 15/56
5/24/2018 Enz ime -3-Oxidore duc ta z e - slide pdf.c om
Flavin-enzime.
Cofactori transportori de hidrogen
cu structură flavinică
FAD
FMN
16
http://slide pdf.c om/re a de r/full/e nz ime -3-oxidore duc ta z e 16/56
5/24/2018 Enz ime -3-Oxidore duc ta z e - slide pdf.c om
•
Sunt grupări prostetice pentru un număr relativ mare de
flavoproteine şi flavin-enzime (strâns legate de partea proteică a
enzimei)
• Alte denumiri: fermentul galben al lui Warburg, ovoflavină,
lactoflavină
• sunt forme biologic active ale vitaminei B2 (riboflavina).
• FMN are structură mononucleotidică,
• FAD are o structură dinucleotidică.
17
http://slide pdf.c om/re a de r/full/e nz ime -3-oxidore duc ta z e 17/56
5/24/2018 Enz ime -3-Oxidore duc ta z e - slide pdf.c om
O
N Nucleul
H3C 5
10
4
6 3 NH izoaloxazinã
7 2
9
8
H3C N N O
1 6,7 dimetil, 9 ribitil
izoaloxazină = RIBOFLAVINĂ
1'CH2
(vitamina B2)
2'CH OH Ribitil
3'CH OH
4'CH OH
OH
5'CH2 O P OH
O
Riboflavină - fosfat
18
http://slide pdf.c om/re a de r/full/e nz ime -3-oxidore duc ta z e 18/56
5/24/2018 Enz ime -3-Oxidore duc ta z e - slide pdf.c om
CH2 Adeninã
CH OH NH2
N
CH OH N
N N
CH OH OH OH
CH2 O P O P O CH2
O
O O
OH OH
Mecanism de acţiune
H
O O
10
H3C N 2[H] H3C N
4 NH 10 NH
9 1
H3C N N O H3C N N O
1 2[H]
H
R R
H+ + e- H+ + e-
FAD sau FMN FADH sau FMNH
(forma oxidatã) 2 2
(forma redusã)
H
O
+
N
.
FMN şi FAD pot funcţiona H3C drept transportori
10 4 NHde hidrogen datorită
capacităţii lor de a lega reversibil hidrogenul la atomii N1 şi N10 din nucleul
H3Cizoaloxazinic.
N N O
În forma oxidată nucleul izoaloxazinic este plan iar în forma redusă are loc
R
o pliere a sa în jurul unei axe imaginare N1-N10.
FADH sau FMN
. .
(semichinonã)
20
http://slide pdf.c om/re a de r/full/e nz ime -3-oxidore duc ta z e 20/56
5/24/2018 Enz ime -3-Oxidore duc ta z e - slide pdf.c om
Caracteristici structurale
• Legătura dintre ribitil şi dimetil-izoaloxazină nu este N-heterozidică
•
o
FMN - Eo’= - 0,10V
–
21
http://slide pdf.c om/re a de r/full/e nz ime -3-oxidore duc ta z e 21/56
5/24/2018 Enz ime -3-Oxidore duc ta z e - slide pdf.c om
Succinat
dehidrogenaza Succinat:FAD
COOH (SDH) HOOC H
C
oxidoreductaza
EC:1.3.99.1
CH2 + Enz + Enz FADH2 (4 atomi de Fe
FAD
CH2 C neheminic, 4 atomi
H COOH
COOH de S legați de
Acid succinic
Acid fumaric proteină)
O
CH3 CH2 CH2 C ~SCoA
butiril~SCoA
FAD
butiri l~SCoA - D H
(EC: 1.3.99.2) FADH2
O
H
CH3 C C
C ~SCoA
H
crotonil ~SCoA 23
http://slide pdf.c om/re a de r/full/e nz ime -3-oxidore duc ta z e 23/56
5/24/2018 Enz ime -3-Oxidore duc ta z e - slide pdf.c om
FAD FADH2
O O
N Xanti n oxidaza N
HN HN
Molibden
N O N N
N
H O2 H Are FAD, molibden și Fe-S
H
Hipoxantina H2 O2 Xantina proteine în structură
FAD O2
Xanti n oxi daza
(EC: 1.1.3.22)
FADH2
H2O2
O
H
N
HN
O
O N N
H H
Acid uric
24
http://slide pdf.c om/re a de r/full/e nz ime -3-oxidore duc ta z e 24/56
Oxidarea aminoacizilor : flavin-enzimele în reacţia catalizată de
5/24/2018 Enz ime -3-Oxidore duc ta z e - slide pdf.c om
NH O
Iminoacid Cetoacid
Catalaza
H2O2 H2O + 1/2 O2
NH2 O
Aminoacid Cetoacid
25
Complexul I Complexul V
NADH+H+
FMN
Fe-Sulf
CoQ
proteine 1 / O
NAD+ 2 2
Citocromi b c1 a-a3
Succinat Complexul III
FAD
CoQH2 H2O
Fe-Sulf Complexul IV
proteine
Fumarat
Complexul I I 26
UBICHINONELE (COENZIMELE Q)
COFACTORI ENZIMATICI
TRANSPORTORI DE HIDROGEN
27
1 gr. metil și
1 lanț poliizoprenoidic
CH3
O
H3 C O 6 CH2 CH C CH2 H
1 2 n
2-decaprenil--5,6-dimetoxi-3-metil-1,4-bezochinona 28
29
Mecanism de acțiune
Enz ime -3-Oxidore duc ta z e - slide pdf.c om
O OH
CH3O R CH3O
+ 2H R
- 2H
CH O CH3 CH3
3
O CH3O
OH
CH3
O
CH3O CH2 CH C CH2 H
10
CH3O CH3
Reducerea ubichinonei la
O Ubichinona (Q)
ubichinol poate avea direct cu
+ e- - e- doi atomi de hidrogen, în trepte,
CH3 prin trei nivele de oxidare ce
-
O
CH3O CH2
includ şi un compus intermediar
CH2 CH C H
semichinonic, care este un
10
radical liber (Q •)
CH3O CH3
O Anion semichinonic (Q )
.-
+ 2H+ - 2H+
+ e- - e-
CH3
OH
CH3O CH2 CH C CH2 H
10
CH3O CH3 31
OH Ubichinol (QH2)
http://slide pdf.c om/re a de r/full/e nz ime -3-oxidore duc ta z e
31/56
5/24/2018
Ubichinona- componentă a lanţului respirator mitocondrialEnz ime -3-Oxidore duc ta z e - slide pdf.c om
Co mplexul I
SH 2
NA D+ FMNH 2
1
CoQ /2 O2
Com plexul II Com plexul IV
NA DH FMN
S Fe2+ Fe3+ Fe2+
+H +
CoQH 2
Succinat FAD H2 O
Com plexul II
32
2 Acetil-CoA
Fenilalanina
Acetoacetil-CoA
Tirozina
HMG-CoA
HMG-CoA reductaza
4-OH-Fenilpiruvat Mevalonat
Mevalonat - P
4-OH-Fenillactat
Mevalonat - PP
Izopentenil - PP
4-OH-Cinamat
trans- Geranil - PP Geranil-geranil -PP
Preniltransferaza
4-OH-Benzoat + Decaprenoil - PP Farnesil - PP
cis-Preniltransferaza
Scualen Poliprenil - PP
Decaprenil- (IZOPRENE)
4-OH-benzoat transferaza Colesterol
Decaprenoil-4-OH-benzoat
Lanţ lateral pentru Izoprenilarea
vitamina E, proteinelor
Coenzima Q10 vitamina A,
vitamina K. Dolicol- 33
pirofosfat
ACIDUL LIPOIC
34
H2
8
C 6
1
7
H2C CH (CH
5 2)4
COOH
S S
Acid -lipoic
O
H2 5 3
8
C 6
CH2 CH2 1
C
H2C CH OH
CH2 CH2
4 2
S S
Acid lipoic
35
H2
• compus biologic activ,
8
C 1
vitamin-like, sintetizat în H2C
7
CH
6
(CH2)4 COOH
organismele vegetale şi 5
animale, inclusiv în S S
36
S S O
37
H2C CH C C 1 H
H2 H2 C
O
funcționale S S
Acid lipoic legat de proteina enzimaticã
(forma oxidatã)
O
R C
OH
Acid gras
• Prin ruperea punţii
O HN
disulfurice, acidul lipoic are H2
Acil
Acil~SCoA
O HN
H2
C C N CH2 CH 2 CH 2 CH2 CH
transportul concomitent
8 6
H2C CH H
C
de hidrogen şi de SH SH
O
grupări acil
Acid lipoic legat de proteina enzimaticã 38
(forma redusã)
Acidul lipoic - cofactor pentru complexe enzimatice Enz ime -3-Oxidore duc ta z e - slide pdf.c om
dehidrogenazice
• Acidul α-lipoic, legat în forma de lipoamidă, funcţionează drept cofactor
(grupare prostetică) î n structura unor complexe enzimatice mitocondriale,
care catalizează reacții de decarboxilare oxidativă a cetoacizilor
potenţial de oxidoreducere Eo’ = -0,29 V, ceea ce îi dă posibilitatea de
a funcţiona împreună cu molecula de FAD
CH3
piruvat-dehidrogenaza O + CO2 + NADH + H+
C O H3C C ~SCoA
TPP, acid lipoic, HS-CoA,
COOH
FAD, NAD+
Acid piruvic Acetil coenzima A
COOH COOH
C O a-cetoglutarat-dehidrogenaza CH2
+ CO2 + NADH + H+
CH2 TPP, acid lipoic, HS-CoA, CH2
FAD, NAD+ O
CH2
C ~SCoA
COOH
Succinil-coenzima A
Acid -cetoglutaric 39
Utilizare terapeutică
Produse farmaceutice
40
Oxidoreductaze transportoare de
electroni
TRANSELECTRONAZE
41
Citocromii
• Keilin – 1925
• Fier-proteine cu localizare mitocondrială
• Participanți activi la lanțul respirator
• Unii sunt localizați în microzomi
• Se cunosc aproximativ 100 citocromi
• Gruparea prostetică: fier-porfirinică
• Au structură heminică
•
Realizează transferul reversibil al unui singur electron- prin intermediul
atomului de fier situat în centrul hemului Fe(II) Fe(III).
42
Citocromii a
• Fier-proteine având o structura de tip
protoporfirinic (nucleu tetrapirolic) ce
are la bază pirolul
43
• Citocromul c = heteroproteină
globulară prezentă în mitocondria
deun
•
la toate
singurorganismele eucariote.
lanţ polipeptidic format
din 104 de aminoacizi.
• 40% din structura polipeptidului
este constituit din lanţuri de tip
-helix, iar restul de tip , sau plieri
neregulate
44
45
Complexul citocromului
cu un maxim culamonoxidul
de absorbţie 450 nm. de carbon (CO) este un pigment (P)
• Apoproteina are o masă moleculară cuprinsă între 45.000 şi 50.000 daltoni.
• Multiplicitatea şi eterogenitatea citocromilor P450 a necesitat elaborarea
unei nomenclaturi bazată pe procentul de omologie al secvenţelor
proteice, această nomenclatură fiind adusă la zi o dată la doi ani.
• În 2009: a 55-a aniversare a descoperirii citocromilor P450, fiind
identificate la om numeroase izoenzime ce prezintă un interes
farmacologic şi toxicologic.
• La om, cele mai implicate enzime în metabolismul medicamentelor sunt
izoformele: CYP3A4, CYP2D6, CYP2C9, CYP1A2, CYP2C19. 46
Transelectronaze
Subclasa 1.11 (acceptor de H2O2)
CATALAZA
EC: 1.11.1.6
HEM-ENZIME
48
49
Oxidoreductaze cupru-dependente
Transelectronaze cu cupru
(cupru-enzime)
50
•
Transportul electronilor se face pe baza transformărilor redox reversibile
ale atomului de cupru, mecanismul de acţiune fiind:
ascorbat oxidaza
• ceruloplasmina
• superoxid-dismutaza
51
Uricaza (sau urat-oxidaza, EC: 1.7.3.3; urat:oxigen-oxidoreductaza) Enz ime -3-Oxidore duc ta z e - slide pdf.c om
primatelor şi a omului.
• Uricaza recombinată (preparată prin inginerie genetică, ADN recombinat) a fost
studiată şi propusă de curând ca posibil medicament în hiperuricemie (gută).
O 1/2 O2 H2O
H O
N N
HN NH2
O O
URICAZA
O N N O N N
H H H
C C
H
C 2O C +
http://slide pdf.c om/re a de r/full/e nz ime -3-oxidore duc ta z e 52/56
5/24/2018
Fenol-oxidazele
Enz ime -3-Oxidore duc ta z e - slide pdf.c om
tirozinaze
•
(sau monofenol
Fenilalanină oxidaze)
-4-hidroxilaza şi catecoleste
(EC: 1.14.16.1)
-oxidaze (sau difenol oxidaze).
o monooxigenază care
catalizează hidroxilarea fenilalaninei la tirozină.
COOH
COOH
H2 N CH
H2 N CH
CH2
CH2
fenil-alanin-4-hidroxilaza
+ NADP+ + H2 O
+ NADPH+H+ + O2
citocrom P450
•
participă la metabolismul oxidativ al acidului ascorbic, cu formarea celor
două forme vitaminice redox active: acid ascorbic şi acid dehidroascorbic.
O C O C
O O C O
HO C
a s c o r b a t o x i d a za O C
HO C
+ H2O
HC HC
+ 1 /2 O2
HO CH Cu+ HO CH
H2C OH H2C OH
54
Ceruloplasmina
Feroxidază (Fe2+:oxigen oxidoreductază, EC:1.16.3.1)
Ceruloplasmina
4Fe2+ + 4H+ + O2 4Fe3+ + 2H2O
55
• metal-enzimă ce conţine Cu2+ şi Zn2+, Mn2+ sau Fe2+ (în cazul bacteriilor)
• descoperită în 1969 de către J. McCord şi I. Fridovich
• SOD catalizează reacţia de dismutare a radicalului superoxid:
.- .- + SOD
O +O + 2H H O +O
2 2 2 2 2