Tema: Analisis Pedigree

Alumno: Deza Morales Luis Alonso

Profesor: Freddy Manayay

Introducción

La definición de inbreeding varia entre criadores y genetistas. Un genetista

ve el inbreeding como un coeficiente numero que sube cuando hay un
ancestro común en el lado del padre y de la madre del pedigree, un criador
considera el inbreeding como algo cercano, como cruces entre padre e hija
o hermanos. Un ancestro común, aun en la octava generación,
incrementara la cantidad medible de inbreeding en el pedigree

El Coeficiente de Inbreeding ( coeficiente de Wright) es un estimado del

porcentaje de todos los pares de genes variables que son homoziguos
debido a la heredabilidad de ancestros comunes. Es también la
probabilidad promedio de que algún par de genes sea homoziguo por la
heredabilidad del ancestro común. Para determinar cuando una cruza en
particular es un outbreeding o inbreeding relativo a una raza, debemos
determinar el coeficiente promedio de inbreeding para esa raza, Este
porcentaje variara según la población de cada raza o la edad de esta
población. Un cruce con un coeficiente de inbreeding de 14% basado en un
pedigree de 10 generaciones, podría considerarse moderado para un
Labrador Retriever (una raza popular con un bajo coeficiente de
inbreeding), pero podría considerarse outbreeding para un Irish Water
Spaniel (una raza rara con un alto porcentaje de coeficiente de inbreeding).

Para que este porcentaje de inbreeding sea acertado, debe estar basado en
varias generaciones. Casos de inbreeding en quinta o posteriores
generaciones a menudo tienen un profundo efecto en la genética de la cría
representada por ese pedigree. En estudios conducidos en razas de perros,
la diferencia en coeficientes de inbreeding basados en cuatro generaciones
versus ocho generaciones varia inmensamente. Un pedigree de cuatro
generaciones conteniendo 28 únicos ancestros para 30 posiciones podría
generar un bajo coeficiente de inbreeding, mientras el mismo pedigree
llevado a 8 generaciones, conteniendo 212 únicos ancestros para 510
posibles posiciones, tuvieron un coeficiente considerablemente alto. Lo que
podría parecer una cruza abierta con mezcla de genes en un par de
generaciones, aparecería como una concentración en línea de genes de un
ancestro de influencia si extendemos las generaciones del pedigree.

ANÁLISIS DE PEDIGREE:
 - Análisis de pedigree es una forma de análisis genético en donde el
genetista hace un diagrama que muestra a un individuo con una
característica estudiada y todos sus familiares conocidos.

- El pedigree indica la presencia o ausencia de esta característica y si

es aplicable la variación de expresión de la misma.

- El propósito es facilitar el análisis genético de una característica

examinando su patrón de herencia en una familia en particular.

- Cuando los genetistas están analizando el pedigree buscan cierto

patrón característico que los ayudará a determinar el modo en que se
hereda la característica estudiada.

El análisis de los datos del pedigrí es una herramienta importante para

describir la constitución genética de las poblaciones. Los principales
indicadores que se utilizan en el estudio de los pedigríes son: tamaño
efectivo de población, número efectivo de ancestros y aportaciones
porcentuales de los ancestros fundadores, estructura de hatos, ganaderías
o subpoblaciones y sus contribuciones con reproductores, intervalo entre
generaciones, índice de conservación genética, y coancestría y distancias
genéticas.

La consanguinidad se presenta cuando se aparean animales

emparentados. En términos generales, todos los animales de una misma
raza están emparentados; sin embargo, se reserva el término de
consanguinidad para el apareamiento de animales más emparentados que
el promedio de la población. En las ganaderías hay aspectos de manejo y
de origen, que influyen en el aumento de los niveles de consanguinidad de
los animales.

Los aspectos de origen se atribuyen a que los animales proceden de un

reducido número de ganaderías fundadoras, mientras que los aspectos de
manejo se atribuyen a que la mayoría de las ganaderías producen sus
propios reemplazos y el número de sementales es muy reducido. La
relación del número de vacas por semental puede ser de 40 ó 50 a 1.

Herencia Dominante Autonómica:

1. El rasgo se transmite en forma continua de una generación a otra.

2. cada uno de los individuos que presentan dicho rasgo proviene de un
progenitor que también presenta dicha característica
3. Tanto en hombre como mujeres se encuentra la característica en la
misma proporción.
4. Aquellos individuos que no presentan la característica no la transmiten a
su descendencia.

Herencia Recesiva Autonómica

1. La característica en cuestión es poco frecuente en la descendencia

2. Si los dos progenitores presentan la característica, tendrán una
descendencia del 100% con dicha característica
3. Si los dos progenitores son portadores darán una descendencia con una
proporción fenotípica de 1:4 para cada nacimiento. Herencia Dominante
Ligada al Sexo.1.Las madres presentan las características teniendo un
genotipo heterocigoto (Aa) la transmiten al 50% de su hijos o hijas
2. Los individuos machos afectados transmiten sus características sólo a
sus hijas
3. La proporción de mujeres afectadas es mayor que la de los hijos varones
4. Aquellas mujeres afectadas que presentan condición homocigoto
transmiten el rasgo a todos sus hijos e hijas
5. La herencia dominante ligada al cromosoma X no puede ser distinguida
de la herencia dominante autosómica observando en la proviene mujeres
afectadas, sino por la observación de la descendencia masculina.

Herencia Recesiva Ligada al cromosoma X:

1. Si el carácter es poco frecuente, los padres y otros parientes del

afectado no lo presentarán a excepción de los tíos maternos y otros
parientes varones de a línea materna
2. Los varones que presentan dicha característica no la transmiten a su
hijos, pero tienen hijas portadoras que si lo transmiten a la mitad de sus
hijos
3. Las mujeres portadoras no manifiestan la característica y lo transmiten a
sus hijos, pero tienen hijas portadoras que si lo transmiten a la mitad de
sus hijos
4. Cada uno de los hijos afectaos (varones) es hijo de una madre portadora,
a excepción de mutantes
5 .Las mujeres que si manifiestan la característica provienen de un padre
afectado y una madre portadora
6. La frecuencia de esta característica es mayor en los hombres que en las
mujeres.

Las mutaciones: Crean alelos nuevos a partir de alelos preexistentes.

Las migraciones: Alteran las frecuencias de los alelos de una población al

mezclarse sus individuos con los de otra población diferente.
La deriva genética: Es un proceso aleatorio que permite el aumento de
un alelo sobre otro en poblaciones pequeñas por un proceso puramente de
azar al ser un muestreo pequeño.

La selección natural: Es un proceso por el que un individuo que está

mejor adaptado a un medio determinado se reproduce más y mejor,
dejando más descendientes.

La falta de panmixia: Sucede cuando no todos los individuos

reproductores de una población tienen las mismas posibilidades para
reproducirse, por la razón que sea.

Pedigree de: "Laurel Hill Braxfield Bilye"

(corresponde a una hembra castrada de raza Setter Gordon)
Para visualizar algunos de los conceptos, miremos el pedigree anterior.
Los ancestros de cría en Linebreeding están en color, de esta manera
ayudamos a visualizar su contribución.

El abuelo paterno, CH Loch Adair Foxfire, y la abuela materna, CH Loch

Adair Firefly WD, son hermanos enteros, haciendo así la primer cruza entre
primos.

El coeficiente de inbreeding para esta primer cruza de primos es del 6,25%

lo que hace un coeficiente de inbreeding suave.

Listas de coeficientes basados en distintos tipos de cruces se demuestras

en la siguiente tabla:

Coeficiente Porcentaje de
Tipo de Cruce de sangre de %
inbreeding ancestro listado
Padre/madre con Hija/hijo 25.0% Padre 75.0%
Hermanos enteros de
25.0% Abuelo común 50.0%
lechigada
Padre con nieta 12.5% Padre 62.5%
Medios Hermanos 12.5% Abuelo común 50.0%
Tíos con sobrinos 12.5% Abuelo común 37.5%
Bis abuelos
Primeros primos 6.25% 25.0%
común

En el pedigree de Bilye, un coeficiente de inbreeding basado en cuatro

generaciones tiene un total de 7,81%. Este no es significantes si lo
comparamos al 6,25% del cruce tan relacionado que habíamos mencionado
en el párrafo anterior, pero veamos que pasa si incrementamos el numero
de generaciones del pedigree y el coeficiente.

Cinco generaciones: 13.34%, seis generaciones 18.19%, siete generaciones

22.78%, ocho generaciones 24.01%, diez generaciones 28.63% y doce
generaciones 30.81%. Este ultimo porcentaje es mucho mas alto del que
encontraríamos si medimos un padre con hija (25%). Como podemos ver
el inbreeding en toda la parte posterior del linaje de ese pedigree
tiene mucha mas influencia en el coeficiente total que la primer
cruza entre primos, que pareciera en principio ser la única gran
influencia.

Pero el acto de saber el grado de inbreeding en un pedigree no es

necesariamente de gran ayuda, a menos que sepamos cuales fueron
exactamente los genes que se concentraron. El porcentaje de coeficiente
sanguíneo, mide la relación entre un ancestro y el individuo representado
por el pedigree. Estima el porcentaje probable de genes pasados desde el
ancestro común. Sabemos que los padres pasan el 50% de sus genes,
mientras que los abuelos el 25%, bis abuelos 12,5% y así sucesivamente.
Por cada vez que un ancestro común se repite en el pedigree, sumamos su
porcentaje de acuerdo a la posición y nos da un estimado de porcentaje de
sangre.
En muchas razas, un individuo influyente puede no aparecer sino
hasta bastante atrás en las generaciones, pero de allí en adelante
lo hará tantas veces que necesariamente contribuirá en gran
proporción de genes al pedigree. Esto puede ocurrir en algunas razas,
por un ancestro prolífico (generalmente un macho de stud), o de pequeña
población de perros originarios de la raza. Basados en un pedigree de 25
generaciones de Bilye, hay solo 852 ancestros únicos que aparecen un total
de veinte millones de veces.

Análisis del Pedigree de Laurel Hill Braxfield Bilye

(25 generaciones)

Primera
Número de veces
Ancestros del Porcentaje generación en la
en que aparece
Linebreeding De Sangre que aparece en
en el pedigree
el pedigree
CH Afternod Drambuie 33.20% 6 33
CH Afternod Sue 27.05% 7 61
CH Afternod Callant 26.56% 5 13
"Grand-Parents" 25.00% 2 1
CH Sutherland Gallant 25.00% 3 2
CH Sutherland MacDuff 25.00% 3 3
CH Sutherland Lass of
25.00% 3 2
Shambray
CH Wilson's Corrie 22.30% 7 200
CH Afternod Buchanon 20.22% 7 48
Loch Adair Diana of
17.97% 5 12
Redchico
CH EEG's Scotia Nodrog
17.76% 8 181
Rettes
Afternod Ember of
17.14% 8 76
Gordon Hil I
CH Afternod Hickory 16.21% 6 27
CH Black Rogue of
15.72% 9 480
Serlway
CH Afternod Woodbine 14.45% 6 15
CH Fast's Falcon of
13.82% 8 66
Windy Hill
Afternod Fidemac 13.67% 5 7
CH Page's MacDonegal II 13.43% 7 56
Afternod Hedera 13.38% 7 56
CH Downside Bonnie of
12.90% 10 708
Serlway
Peter of Crombie 12.76% 11 3.887
"Great-Grand-Parents" 12.50% 3 1
CH Afternod Amber 12.50% 5 5
Ben of Crombie 11.83% 11 7.584
Stylish William 11.18% 13 23.764
Stylish Billie 11.08% 14 70.542
Stylish Ranger 10.80% 15 297.331
CH Afternod Kate 10.74% 6 17
Heather Grouse 10.61% 16 1.129.656
Afternod Hedemac 10.45% 7 28

El análisis anterior muestra la contribución ancestral en este Linebreeding

sobre el pedigree de Bilye. Los perros en color son los que estaban
presentes en el pedigree de cinco generaciones.

El Ch Afternod Drambuie tiene la mayor contribución genética de todos los

ancestros criados en línea.

Aparece 33 veces entre la sexta y octava generación.

Una aparición en la sexta generación contribuye 1,56% de los genes del
pedigree.
Su contribución total es del 33,2% de genes.

De ahí que el ancestro mas influyente en este pedigree no aparece sino

hasta la quinta generación

Su madre Ch Afternod Sue aparece 61 veces entre la séptima y décima

generación y contribuye incluso mas que el mismo abuelo

Los perros fundadores que formaron la raza Gordon setter también juegan
un rol importante en la genética de los perros de hoy. Heather Grouse
aparece mas de un millón de veces entre la décimo sexta y vigésimo quinta
generación. El contribuye por sobre el 10% del pedigree de este perro
Bilye.

Este ejemplo demuestra que la profundidad del pedigree es muy

importante al estimar la cosmética genética de un individuo. Y los genes
defectuosos recesivos portados por Heather Grouse u otros perros
fundadores, se estima que han sido desparramados en la raza.

Blibliografia

1. http://webdeptos.uma.es/genetica/AnaGen/Tema4.pdf
2. webdeptos.uma.es/genetica/AnaGen/Tema4.pdf
3. chapingo.mx/.../Análisis-pedigrí-lidia-2010-Archivos
%20Zootecnia.pdf
4. www.springerlink.com/index/JT157VH826016451.pdf
5. biology.uprm.edu/labs/genetica/8_pedigree2_y_cariotipo.ppt
6. http://es.scribd.com/doc/38257209/ANALISIS-DE-PEDIGREE