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Princpios de Filogenia
Pensando sobre rvores filogenticas
Sim
No
Asas
Inferncia Filogentica
Buscas para recuperar padres relacionamento entre os organismos. genticos histricos do
Inferncia Filogentica
Princpios :
Supem que caractersticas similares so homlogas, at que se mostre o contrrio.
Homologia
Caractersticas (morfolgica, molecular, comportamental) herdadas de um ancestral comum.
Homologias Estruturais
Inferncias Filogenticas
Princpios: - Supem que caractersticas similares so homlogas, at que se mostre o contrrio. - Usa caractersticas compartilhadas e recm herdadas e no caractersticas ancestrais
(Hennig formalizou isso).
Hennig
Sinapomorfia
Compartilhado Derivado Caracter
Australopithecus Homo
Autapomorfia
nico Derivado Caracter
Australopithecus
H. sapiens
Testa Alta
Symplesiomorphy
Compartilhado Ancestral Caracter
Homo
Australopithecus
Bpede
Sinapomorfia
Compartilhado Derivado Caracter
Autapomorfia
nico Derivado Caracter
Simplesiomorfia
Compartilhado Ancestral Caracter
Inferncia Filogentica
Princpios :
. Supe que caractersticas similares so homlogas, at que se mostre o contrrio. . Usa caractersticas derivadas compartilhadas recm herdadas e no caractersticas compartilhadas ancestrais (Hennig formalizou isso). . Relaciona caractersticas marcadores de parentesco. derivadas compartilhadas como
Inferncia Filogentica
Principios:
. Supe que caractersticas similares so homlogas, at que se mostre o contrrio. . Usa caractersticas derivadas compartilhadas recm herdadas e no caractersticas compartilhadas ancestrais (Hennig formalizou isso). . Relaciona caractersticas derivadas compartilhadas como marcadores de parentesco. . A mesma lgica usada para comparao morfolgica ou de dados moleculares como DNA.
Um exemplo simples
CANRIO Esqueleto interno Asas 2 patas Penas sangue quente SAPO Esqueleto interno Sem asas 4 patas Sem plo ou penas sangue-frio GAMB Esqueleto interno Sem asas 4 patas Plo sangue quente
Estado do Caracter
Externo (0)
Esqueleto
Caracter
Esqueleto
Sim
No
Asas
Mas.
Asas de pssaros so homlogas s patas frontais dos sapos e gambs. E NO homlogas asas de abelhas.
Ento
No
Asas
PATAS
Mas.
As asas de pssaros so Homlogas as patas frontais de sapos e de gambs ento Pssaros tem 4 patas!!
Ento
Realmente. Patas
Somente Pele
Penas
Plos
Ns podemos testar se estes grupos compartilham um ancestral comum usando outros caracteres...
Externo
Interno
No
Esqueleto
Asas
Patas
Pecilotrmico (sangue frio) Endotrmico (sangue quente) Somente pele Penas
Plos
Metabolismo
Revestimento do corpo
Como podemos combinar as informaes dos caracteres diferentes para inferir uma filogenia total?
Externo
Interno
Esqueleto
Asas
Patas
Somente pele
Penas
Plos
Metabolismo
Revestimento do corpo
Como podemos combinar as informaes dos caracteres diferentes para inferir uma filogenia total?
Quando tiver poucos caracteres, voc pode fazer isto em sua cabea, mas...
Quando bioinformtica.
tiver
muitos
caracteres,
ns
utilizamos
Comparao de Mtodos
Neighbor-joining Usa somente pairwise distncias Minimiza a distncia entre os vizinhos mais prximos Muito rpido Problemas com o local optima Maximum parsimony Usa somente caractersticas derivadas compartilhadas Minimiza a distncia total Lento Falha das suposies quando a evoluo for rpida Maximum likelihood Usa todos os dados (Verossemelhana) Maximiza a probabilidade de ter rvore certa dentro do modelo de evoluo escolhido. Muito lento Altamente dependente do modelo suposto da evoluo
Bom para sries de dados Bom para gerar rvores Melhor opo quando muito pequenas e para rvores preliminares e escolher tiver menos que 30 taxa e construdas testando outros rpido entre vrias rvores. homoplasia rara. mtodos
Tony Weisstein, http://bioquest.org:16080/bedrock/terre_haute_03_04/phylogenetics_1.0.ppt