Tema 4.

- Principios generales de metabolismo, respiracin y fermentacin

Microbiologa General Curso 2008-2009

Principios generales de metabolismo, respiracin y fermentacin

Esquema general de metabolismo. Catabolismo y anabolismo. Metabolismo primario y secundario. Categoras de microorganismos segn su metabolismo. Mecanismos de generacin de energa:
fotosntesis fosforilacin oxidativa fosforilacin a nivel de substrato

Conceptos de respiracin y fermentacin. Respiracin aerobia y anaerobia. Metabolismo central: catabolismo y anabolismo Diversidad de fermentaciones:
alcohlica, homolctica, heterolctica, cido-mixta, butanodilica, Propinica acetona-butanol.

MICGRAL2007

Otras fermentaciones. Metabolismo secundario. Fijacin de nitrgeno.

Esquema general de metabolismo

Esquema general de metabolismo

Kenneth Todar University of Wisconsin-Madison Department of Bacteriology

Categoras de los organismos segn su metabolismo

Fuente de Energa Luz Foto Quimio Enlaces qumicos

Fuente de carbono

Inorgnico (CO2)

- lito -

- organo -

Orgnico (azcares, lpidos, aminocidos)

Fotolitotrofos Plantas Bacterias y arqueas fotosintticas

Quimiolitotrofos Bacterias Arqueas

Fotoorganotrofos Bacterias Arqueas

Quimioorganotrofos Bacterias, Arqueas, Hongos y Animales

MICGRAL2007

Categoras de los organismos segn su metabolismo

Fuente de Energa Luz Foto Quimio Enlaces qumicos Orgnico (azcares, lpidos, aminocidos) Quimioorganotrofos

Fuente de carbono

Inorgnico (CO2)

- lito -

- organo -

Lwoff, van Niel, Ryass, Tatum (1946)

Fotolitotrofos Plantas Bacterias y arqueas fotosintticas

Quimiolitotrofos

Fotoorganotrofos

Bacterias Arqueas

Bacterias Arqueas

Bacterias, Arqueas, Hongos y Animales

Auttrofo: capaz de sintetizar sus propios metabolitos esenciales Hetertrofo: incapaz de sintetizar sus propios metabolitos esenciales

Categoras de los organismos segn su metabolismo

Autotrophs Energy Source Carbon Source Name Example Most photosynthetic bacteria, e.g. Chromatium (anaerobic), Cyanobacteria (aerobic)

Light

Inorganic

Photoautotroph Chemolithotrophic autotroph (chemoautotroph) Chemoorganotrophic autotroph

Inorganic Organic Heterotrophs: Light Inorganic Organic

Inorganic Inorganic

Nitrobacter Pseudomonas oxalaticus

Organic Organic Organic

Photoheterotroph Chemolithotrophic heterotroph ("mixotroph") (Chemo)heterotroph

Purple and green photosynthetic bacteria,

e.g. Rhodospirillum Desulphovibrio E. coli

Mecanismos de generacin de energa

fotofosforilacin: fotosntesis fosforilacin oxidativa fosforilacin a nivel de substrato Fosforilacin
AMP-P + Pi AMP~PP

Mecanismos de generacin de energa

fotosntesis

Fotosntesis anoxignica Slo PSI Bacterias rojas y prpura

Fotosntesis oxignica PSII y PSI Cianobacterias

Mecanismos de generacin de energa

fotosntesis

Mecanismos de generacin de energa

fotosntesis

Cross-section of the R. sphaeroides ICM, illustrating the function of the major components of this bioenergetic membrane. The figure depicts the orientation of ICM components relative to the cytoplasmic and periplasmic compartments. Abbreviations: Bchl, bacteriochlorophyll; Bchl2, bacteriochlorophyll special pair; ADP, adenosine diphosphate; ATP, adenosine triphosphate; Pi, phosphate; e, electron; Q, ubiquinone; cyt c2, cytochrome c2; B800850 & B875, light harvesting complexes, respectively.
doi:10.1016/j.mib.2006.10.005

Mecanismos de generacin de energa

fosforilacin oxidativa
Substrato reducido Substrato oxidado C6H12O6 + 6 O2 6CO2 + 6H2O

Energa

G0= - 317.66 kcal/mol

C6H12O6 + [NAD+] [NADH + H+] + 6O2

6CO2 + [NADH + H+] [NAD+] + 6 H2O

Glucolisis + Ciclo Krebs Respiracin

Energa

Mecanismos de generacin de energa

fosforilacin a nivel de substrato
1,3-difosfoglicerato

Fosfoglicerato quinasa G'o= - 4.5 kcal/mol

ADP ATP

3-fosfoglicerato

Conceptos de respiracin y fermentacin

El contenido de NAD+ de la clula es limitado y puede agotarse

C6H12O6 + [NAD+] [NADH + H+] + 6O2

6CO2 + [NADH + H+] [NAD+] + 6 H2O

La respiracin y la fermentacin son procesos que recuperan el contenido celular de NAD+

En la RESPIRACIN, el [NADH2] se oxida usando un aceptor de electrones EXTERNO En la FERMENTACIN, el [NADH2] se oxida usando un aceptor de electrones INTERNO

Respiracin aerobia

CO2 ATP sntesis Compuesto orgnico Flujo de carbono Biosntesis Flujo de electrones

O2

NADH + H+ + O2

NAD+ + H2O

Respiracin anaerobia

CO2 ATP sntesis Compuesto orgnico Flujo de carbono Biosntesis Flujo de electrones NO3SO4= Aceptores de electrones orgnicos

NADH + H+ + 2 NO3-

NAD+ + 2 NO2- + H20

Torre de electrones
e-

Par donador / aceptor

2H+ / H2 (-0.38) 6 eCO2 / metanol (-0.38) 6 eNAD+ / NADH (-0.32) 2 eCO2 / acetato (-0.28) 8 eS0 / H2S (-0.28) 2 eS04= / H2S (-0.22) 8 ePiruvato / lactato (-0.19) 2 eS4O62- / S2O32- (-0.024) 2 eFumarato / succinato (+0.03) 2 e-

Ubiquinona ox/red (+0.11) 2 eCitocromo c ox/red (+0.25) 1 eCitocromo aox/red (+0.39) 1 e-

Cuanto ms grande sea la cada de potencial, mayor ser la energa liberada

NO3- / NO2- (+0.42) 2 e-

NO3- / N2 (+0.74) 5 eFe3+ / Fe2+ (+0.76) 1 e O2 / H2O (+0.82) 2 e-

Potencial oxidante

Citocromo box/red (+0.035) 1 e-

Potencial reductor

CO2/glucosa (-0.43) 24 e-

Respiracin
Respiracin aerobia
Glicolisis + ciclo TCA

Respiracin anaerobia
Glicolisis + ciclo TCA

GLUCOSA

GLUCOSA

ATPasa

SISTEMA DE TRANSPORTE DE ELECTRONES

ATPasa

SISTEMA DE TRANSPORTE DE ELECTRONES

NO3-

NO2-

Exterior de la clula

Cadena transportadora de e-

Membrana celular

Transportador de eoxidado

Transportador de ereducido

Interior de la clula

Metabolismo de la glucosa

Glucosa

Conversin de la energa por la ATPasa

Principios generales de metabolismo, respiracin y fermentacin

Esquema general de metabolismo. Catabolismo y anabolismo. Metabolismo primario y secundario. Categoras de microorganismos segn su metabolismo. Mecanismos de generacin de energa:
fotosntesis fosforilacin oxidativa fosforilacin a nivel de substrato

Conceptos de respiracin y fermentacin. Respiracin aerobia y anaerobia. Metabolismo central: catabolismo y anabolismo Diversidad de fermentaciones:
alcohlica, homolctica, heterolctica, cido-mixta, butanodilica, Propinica acetona-butanol.

Otras fermentaciones. Metabolismo secundario. Fijacin de nitrgeno.

Metabolitos primarios y secundarios

METABOLITOS PRIMARIOS:
-Se producen en el curso de las reacciones metablicas anablicas o catablicas que tiene lugar durante las fases de crecimiento y que contribuyen a la produccin de biomasa o energa por las clulas. -Se producen principalmente en la trofofase o fase de crecimiento.

METABOLITOS SECUNDARIOS:
-Se producen por rutas anablicas especializadas cuando no hay crecimiento. -Significado evolutivo controvertido por ser imprescindibles. Pueden ser una estrategia para mantener en funcionamiento los sistemas metablicis cuando no hay crecimiento. -Son indicativos de diferenciacin y se producen durante la idiofase de los cultivos.

Catabolismo de la Glucosa RUTA DE EMBDEN-MEYERHOF (EM) RUTA ENTNER-DOUDOROFF RUTA DE LAS PENTOSAS FOSFATO RUTA DE LA FOSFOCETOLASA

Ruta de Embden-Meyerhoff
Transporte de la glucosa

ATP FFK

AMP

Efecto Pasteur

- La ms comn - Funciona en condiciones aerobias y en anaerobias. - La ruta produce: 2 piruvato (C3) 2ATP 2NADH + 2H+

Ruta de Embden-Meyerhoff

Kenneth Todar University of Wisconsin-Madison Department of Bacteriology

Ruta de Entner-Doudoroff

Glucosa + 2 NAD + ADP+ Pi 2 Piruvato + 2 NADH + ATP

Ruta de Entner-Doudoroff
- Presente en ciertas Gram-negativas aerobias como Pseudomonas. - Muy rara en hongos - Relativamente infrecuente como va de fermentacin
(KDPG)
Kenneth Todar University of Wisconsin-Madison Department of Bacteriology

Zymomonas

gave azul

Aguamiel Pulque Tequila

Ruta de las Pentosas fosfato - Presente en muchas bacterias y en la mayora de los eucariontes. - Puede ser simultnea a la ruta EM. - Funciona en condiciones aerobias y anaerobias. -Importancia en catabolismo y en anabolismo.
2 fructosa-6-fosfato (C6) gliceraldehdo-3-fosfato (C3) 3CO2 + 6NADPH + 6H+

3 Glucosa-6-fosfato (C6) 6NADP+ + 3 H2O

a ut R

de

s la

sa o nt pe

Ruta de la Fosfocetolasa o de Warburg-Dickens (WD)

Fosfocetolasa
Es la ruta que siguen ciertas bacteria lcticas (especialmente Lactobacillus y Leuconostoc) Se puede considerar una variante de la ruta de la PF puesto que se forma un azcar C5 y, por consiguiente, tiene lugar una descarboxilacin. Sin embargo, en la ruta WD la enzima fosfocetolasa rompe el azcar C5 y de lugar a dos ramas que coinciden a la formacin de lactato y etanol en un proceso de fermentacin heterolctica.

Fermentacin heterolctica
Kenneth Todar University of Wisconsin-Madison Department of Bacteriology

Ciclo de Krebs

Nucletidos oxidados

Nucletidos reducidos

Exterior de la clula

Cadena transportadora de e-

Membrana celular

Transportador de eoxidado

Transportador de ereducido

Interior de la clula

Metabolismo de la glucosa

Glucosa

Principios generales de metabolismo, respiracin y fermentacin Diversidad de fermentaciones:

alcohlica, homolctica, heterolctica, cido-mixta, butanodilica, Propinica acetona-butanol.

ALCOHLICA:

Fermentaciones

- En la fermentacin etanlica o alcohlica: el piruvato se reduce para formar etanol y CO2 : Glucosa + 2ADP + 2Pi 2etanol + CO2 + 2ATP - Es el proceso de fermentacin que lleva a cabo Saccharomyces cerevisiae (pocas bacterias).

Fermentaciones
HOMOLCTICA: -Su nico producto final es el cido lctico. Su ecuacin global es: Glucosa + 2ADP + 2Pi 2 cido lctico + 2 ATP Estas bacterias producen el piruvato por catabolismo de la glucosa siguiendo la ruta de Embden-Meyerhof. -Proceso presente en muchas bacterias lcticas: Streptococcus (grupo enterococos), Pediococcus y varios grupos de Lactobacillus.

Fermentacin heterolctica
Su producto final no es exclusivamente cido lctico. El proceso tiene un rendimiento menor que la fermentacin homolctica. El piruvato de esta ruta procede de la va de las pentosas. La reaccin global es: Glucosa ADP + Pi
Ac. Lctico + etanol CO2 + ATP

Este proceso lo llevan a cabo bacterias del grupo lctico pertenecientes a los gneros Leuconostoc y Lactobacillus.

Fermentacin cido mixta

Produce cido actico, etanol, H2, CO2 y proporciones diferentes de cido lctico o propinico (frmico) segn las especies. La llevan a cabo las enterobacterias. En esta ruta de fermentacin se produce ATP adems de la reoxidacin del NADH+H+.

Hidrogenoliasa frmica

Fermentacin butanodilica
Variante de la fermentacion cido mixta. Presente en algunas enterobacterias como Klebsiella, Serratia y Erwinia. En esta ruta se produce acetona que se detecta mediante la reaccin de VogesProskauer

Voges-Proskauer

Fermentacin del cido propinico

Proceso complejo en el que se genera acetato, CO2 y cido propinico como productos finales. Ruta fermentativa la presentan las bacterias del tipo Propinobacterium y otras anaerobias estrictas presentes en el rumen de herbvoros

Fermentacin de acetona-butanol

Tipo de fermentacin llevado a cabo por bacterias anaerobias estrictas del gnero Clostridium. Se producen compuestos orgnicos disolventes de gran importancia industrial

Kenneth Todar University of Wisconsin-Madison Department of Bacteriology

Reaccin de Stickland llevada a cabo por algunas bacterias del gnero Clostridium

Fermentacin de aminocidos: reaccin de Stickland

NAD+ NADH 2 Acetil-P 2 ADP 2 Pi 2 Acetato- + 2 NH3

2 ATP

Alanina

NAD+ NADH

CoA CO2 Pi CoA

Piruvato + NH3

Glicina Aminocidos que participan en la reaccin de Stickland Aminocidos oxidados Aminocidos reducidos Glicina Prolina Hidroxiprolina Triptfano Arginina

Acetil-CoA

Acetil-P

ADP ATP

Acetato-

Alanina Leucina Isoleucina Valina Histidina

Metabolismo central

Rutas anablicas

Caractersticas comunes de los metabolitos secundarios

Tienden a producirse cuando el crecimiento est limitado (cultivo contnuo). Se forman por enzimas especficos a partir del metabolismo central. No son esenciales para el crecimiento o para el metabolismo central. Son especficos para cada especie, y a veces, de cada cepa.

Familias de metabolitos secundarios POLIQUTIDOS TERPENOS AMINOCIDOS

POLIQUTIDOS
Est presente en bacterias, hongos y en plantas. Sirve nicamente para la produccin de metabolitos secundarios. Parte del malonil-CoA que forma el primer paso en la sntesis de cidos grasos. Ejemplos: griseofulvina (antibitico producido por Penicillium griseofulvum) aflatoxinas (toxinas producidas por Aspergillus flavus y por A. parasiticus) ocratoxinas (toxinas producidas por algunos tipos de Aspergillus y de Penicillium) lovastatina (producida por A. terreus)

TERPENOS
Se inician a partir del Acetil-CoA. Produce tanto metabolitos primarios (carotenos, esteroles) como secundarios. Ejemplos: Ciertos carotenos. Toxinas como la toxina T2 y los tricotecenos (producidos por alguna especie de Fusarium).

MICGRAL2007

Rutas de sntesis de las familias de metabolitos secundarios

Terpenos Poliqutidos

MICGRAL2007

Rutas de aminocidos
RUTAS QUE PARTEN DE AMINOCIDOS AROMTICOS
Compuestos alucingenos tales como el cido lisrgico, la psilocibina (Psylocibe) y la muscarina (Amanita muscaria).

RUTAS QUE PARTEN DE AMINOCIDOS ALIFTICOS

Penicilinas (Penincillium chrysogenum) Toxinas como la falotoxina (Amanita phalloides)