La nueva generacin de Microbio Los cazadores Un brote de bacterias transmitidas por los alimentos mato a muchas personas en Alemania.

mdicos de Houston se preguntaban que hacer en caso semejante; en que un paciente se presentara muy enfermo, se agravara rpidamente, no se identificara la causa y como prevenir una posible epidemia. Hablando de eso un medico comento que algo as acababa de suceder que un paciente acababa de morir de lo que pareca ntrax por inhalacin. Para casos como este se cuenta con nueva tecnologa que permite determinar la secuencia completa del desconocido microorganismo esto significa una nueva etapa en la microbiologia los mtodos de secuenciacin rpidos de genomas enteros microbianos estn revolucionando . El primer genoma bacteriano fue secuenciado en 1995 que requiri 13 Meses de trabajo; Los investigadores de hoy puede secuenciar el ADN que constituye un micro- genoma en pocos das, incluso, con equipos de ltima generacin, en un da. Se puede obtener al mismo tiempo las secuencias de todos los microorganismo en los dientes o en la saliva o en una muestra de aguas residuales. Y el costo se ha reducido considerablemente En una revisin reciente, el Dr. David A. Relman, profesor de medicina, microbiologa y inmunologa en la Universidad de Stanford, escribi que los investigadores haban publicado 1.554 secuencias bacterianas completas y se trabaja en 4.800 ms. tienen secuencias de 2.675 especies de virus y tienen las secuencias de decenas de miles de cepas del virus de la gripe (40.000), ms de 300.000 cepas de VIH. Con la secuenciacin del genoma rpido es posible localizar el manual de operaciones de los microorganismos y arreglar las fallas El Dr. Matthew K. Waldor de la Escuela Mdica de Harvard, dijo que la nueva tecnologa "est cambiando todos los aspectos de la microbiologa es slo de transformacin ". Un grupo est comenzando a desarrollar lo que llama la enfermedad de mapas meteorolgicos. La idea es conseguir muestras de las plantas de tratamiento de aguas residuales o lugares pblicos como el metro o los hospitales y obtener de forma rpida la secuencia de los genomas de todos los microorganismos. Eso les dir exactamente que bacterias y virus estn presentes y con que frecuencia. Con estas herramientas, los investigadores pueden crear una especie de mapa del tiempo de los patrones de la enfermedad. Y como pueden tomar precauciones contra las que empiezan a surgir como el SARS, por ejemplo que es resistente a los antibiticos. Otros investigadores estn secuenciando los genomas bacterianos para encontrar donde se originaron las enfermedades. por ejemplo Para estudiar el origen de la peste bubnica que azot a Europa en el siglo 14, los investigadores compararon los genomas de las bacterias de hoy en da, que son ligeramente diferentes en distintos pases. Trabajaron con versiones anteriores, que fueron capaces de crear un rbol familiar que coloca el origen del microorganismo en China, de 2.600 a 2.800 aos atrs. Y otros investigadores como el Dr. Relman, estn estudiando microorganismos que no causan dao en el cuerpo humano. Se encontr, que las bacterias en saliva son diferentes de

aquellas que se encuentran en los dientes y que las bacterias en un diente son diferentes a las bacterias de los dientes adyacentes. Esas bacterias de la boca, dicen los investigadores pueden dar pistas de la enfermedad de las encas infeccin humanas muy comunes. Todas estas nuevas tcnicas se pusiern a prueba cuando el Dr. Musser y sus colegas recibiern a un paciente,hombre de 39 aos de edad, que viva a unas 75 millas de Houston,en una zona rural era soldador que se encontraba en su casa cuando de repente empez a toser y vomitar con sangre, tenia fuertes dolores de cabeza, pecho y abdomen. Los mdicos le administraron antibiticos pero a pesar de estos esfuerzos, el hombre muri. Antes de que muriera se le realizaron estudios mediante los cuales los mdicos observaron que en sus pulmones haba bacterias en forma de bastn, caractersticos del ntrax lo que fue confirmado tras hacer la autopsia. Los investigadores hicieron crecer en cultivos estas bacterias con lo que se determino que a aparte del ntrax haba microorganismos pertenecientes a los Bacillus. Sin embargo das despus descubriern que no se trataba de ntrax pero que estaban estrechamente relacionados ya que tiene genes de la toxina del ntrax; que las bacterias que causaron la muerte del hombre eran de origen natural. Y ya que era un soldador tenia los pulmones crnicamente irritados por las partculas metlicas finas como viva en una zona rural, zona donde viven las bacterias en el suelo es muy probable que su enfermedad se haya debido a esta mezcla de circunstancias. Otro caso similar es que les ocurri al Dr. Waldor y sus colegas cuando se hicieron la pregunta de por que Hait fue sacudida por el clera tras el terremoto del 2010. El clera no se haba visto en Hait durante ms de un siglo. Por qu la epidemia repentina? Los cientficos rpidamente secuenciaron el genoma de la bacteria en Hait y lo compararon con cepas conocidas del clera de todo el mundo. Su resultado fue que la cepa de Hait era diferente de la bacteria del clera en Amrica Latina y frica, pero idntica a la del sur de Asia. As que los investigadores concluyeron que el terremoto fue indirectamente responsable de la epidemia. Muchos de los rescatistas que llegaron a Hait vivian en el sur de Asia, donde el clera fue endmica. "una o ms personas trajeron el clera a Hait" dijo el Dr. Waldor. El Dr. Schadt, el presidente de la gentica en el Monte Sina Facultad de Medicina y director cientfico de Pacific Biosciences, quiere hacer mapas de enfermedad en el tiempo. Comenz con estudios piloto, en las oficinas de su compaa. Durante varios meses analizaron los genomas de microorganismos en las superficies, como los escritorios,las computadoras y en los sanitarios. A medida que la temporada de gripe comenz, las superficies se llenaron con ms y ms microorganismos de gripe hasta que, todas las superficies ya tenan el virus de la gripe. La superficie ms contaminada fueron los interruptores de control de los proyectores en la sala de conferencias. "Todo el mundo lo toca y nunca se limpian" dijo el Dr. Schadt quien Tambin analizo su casa y descubri, para su consternacin, que el mango de la puerta de su refrigerador estaba contaminado con los microorganismos que tienen las aves de corral y cerdo.se dio cuenta que la gente abre la puerta del refrigerador para devolver la carne sin lavarse las manos. El estudio piloto ms interesante, fue el anlisis de las aguas residuales. Observo que habia no slo los microorganismos causantes de enfermedades, sino tambin los microorganismos que viven en alimentos especficos, como el pollo o los pimientos o los tomates. " es como la epidemiologa de la salud pblica'", dijo. "Podramos empezar a evaluar la composicin de la dieta de una regin y que se correlacionan con la salud ".

El doctor Relman, por su parte, se centra en la gran mayora de los microorganismos que viven pacficamente en en el cuerpo humano. Hay mucho ms genes bacterianos que los genes humanos en el cuerpo.en un estudio analiz 124 muestras de heces de los europeos y encontraron un promedio de 536,122 genes nicos en cada muestra, y 99,1 por ciento eran de bacterias. En un estudio reciente encontraron que las bacterias en los intestinos de muchos japoneses tienen un gen de una enzima para romper un tipo de algas que se envuelve el sushi. Las bacterias intestinales al parecer tomaron el gen de las alga roja que se encuentra en el ocano. Pero si estas vastas comunidades de microorganismos son tan importantes como los investigadores piensan para mantener la salud, el doctor Relman pregunt, qu sucede cuando las personas toman antibiticos?;Con las comunidades microbianas que se encontraban en el intestino utilizando una rpida? secuenciacin del genoma de todos los microorganismos en muestras de heces, se encontr que regresaron, pero que la comunidad microbiana no era exactamente como lo era antes de los antibiticos Y si una persona toma el mismo antibitico por segunda vez, seis meses aproximadamente despus de la primera dosis, los microorganismos tardan ms en volver y esa comunidad vuelve mas cambiada. Ahora, l y sus colegas estn buscando a los bebs, teniendo la piel, la saliva durante los dos primeros aos de vida, el tiempo en que las comunidades de microorganismos se estn estableciendo en el cuerpo. "Esperamos que los bebs se expongan a los antibiticos - no se necesita tanto tiempo",dijo el Dr. Relman. El objetivo, dice, es para evaluar los efectos de los microorganismos de los bebs, sobre todo cuando los bebs reciben dosis repetidas de antibiticos que no son realmente necesarias.