Tests Non Paramtriques

J Gaudart, LERTIM, Facult de Mdecine Marseille

Plan
1. 2. 3. 4. 5.

Paramtriques ou non? Test d'une distribution de probabilit Comparaison de moyennes Comparaison de pourcentages Corrlation

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III. Test de comparaison de moyennes: Test de Wilcoxon

1. Paramtriques? 2. Distribution 3. Moyennes 4. Pourcentages 5. Corrlation

Comparaison de 2 moyennes observes Principe

Soit 2 chantillons de nA et nB valeurs, (xA,1,xA,2,xA,n) et (xB,1,xB,2,xB,n) de 2 V.A. XA et XB

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1. Paramtriques? 2. Distribution 3. Moyennes 4. Pourcentages 5. Corrlation

H0: XA et XB ~> mme distribution de probabilit moyennes identiques H1: distributions sont diffrentes

Non prise en compte des valeurs observes Seulement des rangs, aprs rangement par ordre croissant

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Cas o XA et XB sont semblables: Les nA observations sont rparties au hasard sur l'ensemble des (nA+nB) observations, de mme que les nB observations

1. Paramtriques? 2. Distribution 3. Moyennes 4. Pourcentages 5. Corrlation

xA,1, xB,1, xA,2, xB,2, xB,3, xA,3, xB,4, xA,4,xA,5, xB,5 ,xB,6 ,xA,6
XA

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Cas o XA et XB sont semblables: Les nA observations sont rparties au hasard sur l'ensemble des (nA+nB) observations, de mme que les nB observations

1. Paramtriques? 2. Distribution 3. Moyennes 4. Pourcentages 5. Corrlation

xA,1, xB,1, xA,2, xB,2, xB,3, xA,3, xB,4, xA,4,xA,5, xB,5 ,xB,6 ,xA,6

XB

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Cas o XA et XB sont semblables: Les nA observations sont rparties au hasard sur l'ensemble des (nA+nB) observations, de mme que les nB observations
1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12

1. Paramtriques? 2. Distribution 3. Moyennes 4. Pourcentages 5. Corrlation

xA,1, xB,1, xA,2, xB,2, xB,3, xA,3, xB,4, xA,4,xA,5, xB,5 ,xB,6 ,xA,6
Somme des rangs de XA (39) Somme des rangs de XB

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Cas o XA et XB sont diffrentes: Les nA observations ne sont pas rparties au hasard sur l'ensemble des (nA+nB) observations

1. Paramtriques? 2. Distribution 3. Moyennes 4. Pourcentages 5. Corrlation

xA,1,xA,2,xA,3,xA,4,xA,5,
XA

,xA,6

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Cas o XA et XB sont diffrentes: Les nA observations ne sont pas rparties au hasard sur l'ensemble des (nA+nB) observations

1. Paramtriques? 2. Distribution 3. Moyennes 4. Pourcentages 5. Corrlation

xB,1,

,xB,2,xB,3,xB,4,xB,5,xB,6
XB

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Cas o XA et XB sont diffrentes: Les nA observations ne sont pas rparties au hasard sur l'ensemble des (nA+nB) observations

1. Paramtriques? 2. Distribution 3. Moyennes 4. Pourcentages 5. Corrlation

, xA,1,xA,2,xA,3,xA,4,xA,5, xB,1,xA,6 ,xB,2,xB,3,xB,4,xB,5,xB,6

XA XB

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10

Cas o XA et XB sont diffrentes: Les nA observations ne sont pas rparties au hasard sur l'ensemble des (nA+nB) observations
1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12

1. Paramtriques? 2. Distribution 3. Moyennes 4. Pourcentages 5. Corrlation

, xA,1,xA,2,xA,3,xA,4,xA,5, xB,1,xA,6 ,xB,2,xB,3,xB,4,xB,5,xB,6

Somme des rangs de XA (22) < Somme des rangs de XB(56)

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Remarques

1. Paramtriques? 2. Distribution 3. Moyennes 4. Pourcentages 5. Corrlation

Valeurs exactes des observations inconnues mais rangs connus Test de Wilcoxon applicable

Test de Mann-Whitney quivalent Comparaisons de plus de 2 distributions observes Test de Kruskall-Wallis (principe identique)

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12

1. Paramtriques? 2. Distribution 3. Moyennes 4. Pourcentages 5. Corrlation

Conditions dapplication
Indpendance des individus Pas (peu) dex-aequo

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TAS~Tabac 1. Hypothses: H0: la TAS est en moyenne identique chez les

fumeurs et les non fumeurs

Exemple

1. Paramtriques? 2. Distribution 3. Moyennes 4. Pourcentages 5. Corrlation

H1:

la TAS moyenne est diffrente chez les fumeurs et les non fumeurs

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14

TAS~Tabac 1. Hypothses: H0: la TAS est en moyenne identique chez les

fumeurs et les non fumeurs

Exemple

1. Paramtriques? 2. Distribution 3. Moyennes 4. Pourcentages 5. Corrlation

H1:

la TAS moyenne est diffrente chez les fumeurs et les non fumeurs

2. Prdiction sous H0:

110,112,119,121,129,130,131,...137,139,141,143...,171,181 Somme des rangs de TASnfSomme des rangs TASf

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TAS~Tabac 1. Hypothses 2. Prdiction sous H0 3. Confrontation

wilcox.test(TAS~Tabac)

Exemple

1. Paramtriques? 2. Distribution 3. Moyennes 4. Pourcentages 5. Corrlation

110,112,119,121,129,130,131,...137,139,141,143...,171,181

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TAS~Tabac 1. Hypothses 2. Prdiction sous H0 3. Confrontation

wilcox.test(TAS~Tabac)
Wilcoxon rank sum test with continuity correction

Exemple

1. Paramtriques? 2. Distribution 3. Moyennes 4. Pourcentages 5. Corrlation

110,112,119,121,129,130,131,...137,139,141,143...,171,181

Test data: TAS by Tabac W = 39.5, p-value = 0.0009431 alternative hypothesis: true mu is not equal to 0
Warning message: impossible de calculer la p-value exacte avec des ex-aequos in: wilcox.test.default ...

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TAS~Tabac 1. Hypothses 2. Prdiction sous H0 3. Confrontation

wilcox.test(TAS~Tabac)
Wilcoxon rank sum test with continuity correction data: TAS by Tabac W = 39.5, p-value = 0.0009431 Donnes alternative hypothesis: true mu is not equal to 0 Warning message: impossible de calculer la p-value exacte avec des ex-aequos in: wilcox.test.default ...

Exemple

1. Paramtriques? 2. Distribution 3. Moyennes 4. Pourcentages 5. Corrlation

110,112,119,121,129,130,131,...137,139,141,143...,171,181

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18

TAS~Tabac 1. Hypothses 2. Prdiction sous H0 3. Confrontation

wilcox.test(TAS~Tabac)
Wilcoxon rank sum test with continuity correction data: TAS by Tabac W = 39.5, p-value = 0.0009431 alternative hypothesis: true mu is not equal to 0

Exemple

1. Paramtriques? 2. Distribution 3. Moyennes 4. Pourcentages 5. Corrlation

110,112,119,121,129,130,131,...137,139,141,143...,171,181

petit p
Warning message: impossible de calculer la p-value exacte avec des ex-aequos in: wilcox.test.default ...

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TAS~Tabac 1. Hypothses 2. Prdiction sous H0 3. Confrontation 4. Interprtation

Exemple

1. Paramtriques? 2. Distribution 3. Moyennes 4. Pourcentages 5. Corrlation

p< 0,05 Test significatif On rejette H0, au risque =5% Il y a une diffrence entre les 2 groupes Dans le sens les fumeurs ont une TAS moyenne plus leve que les non-fumeurs
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Remarques
Test de Wilcoxon

1. Paramtriques? 2. Distribution 3. Moyennes 4. Pourcentages 5. Corrlation

wilcox.test(TAS~Tabac)

Test de Kruskall-Wallis (plus de 2 moyennes)

kruskal.test(TAS~ATCD)

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21

Exercice

TAS~SEXE

1. Paramtriques? 2. Distribution 3. Moyennes 4. Pourcentages 5. Corrlation

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22

TAS~SEXE 1. Hypothses: H0: la TAS est en moyenne identique chez les

hommes et les femmes

Exercice

1. Paramtriques? 2. Distribution 3. Moyennes 4. Pourcentages 5. Corrlation

H1:
les femmes

la TAS moyenne est diffrente chez les hommes et

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23

TAS~SEXE 1. Hypothses: H0: la TAS est en moyenne identique chez les

hommes et les femmes

Exercice

1. Paramtriques? 2. Distribution 3. Moyennes 4. Pourcentages 5. Corrlation

H1:
les femmes

la TAS moyenne est diffrente chez les hommes et

2. Prdiction sous H0:

110,112,119,121,129,130,131,...137,139,141,143...,171,181 Somme des rangs de TASfSomme des rangs TASh

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TAS~SEXE 1. Hypothses 2. Prdiction sous H0 3. Confrontation

wilcox.test(TAS~SEXE)

Exercice

1. Paramtriques? 2. Distribution 3. Moyennes 4. Pourcentages 5. Corrlation

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25

TAS~SEXE 1. Hypothses 2. Prdiction sous H0 3. Confrontation

wilcox.test(TAS~SEXE)
Wilcoxon rank sum test with continuity correction data: TAS~SEXE W = 93.5, p-value = 0.1997 alternative hypothesis: true mu is not equal to 0 Warning message: impossible de calculer la p-value exacte avec des ex-aequos in: wilcox.test.default...

Exercice

1. Paramtriques? 2. Distribution 3. Moyennes 4. Pourcentages 5. Corrlation

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TAS~SEXE 1. Hypothses 2. Prdiction sous H0 3. Confrontation 4. Interprtation

Exercice

1. Paramtriques? 2. Distribution 3. Moyennes 4. Pourcentages 5. Corrlation

p> 0,05 Test Non significatif Non rejet de H0, au risque On ne met pas en vidence de diffrence entre les 2 groupes

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Rfrences
ditions INSERM

1. Paramtrique? 2. Distribution 3. Moyennes 4. Pourcentages 5. Corrlation

Jean Bouyer: Mthodes statistiques, Mdecine-Biologie,

Contact
jean.gaudart@univmed.fr
http://cybertim.timone.univ-mrs.fr/ Labo. dEnseignement et de Recherche sur le Traitement de lInformation Mdicale,

Facult de Mdecine de Marseille

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