J.M.A. Lobaccaro. Biologie LEA2.

A. Introduction la biologie

1. Introduction : tres vivants structurs : organisation structurale + fonctionnelle. Ils sont composs de cellules. Lanalyse chimique : 95% = C, H, O, N, P, S + autres ions interaction avec lenvironnement mtabolisme : conservation de lorganisation interne -> dcomposition de la matire nutritive pour -> matriaux de construction -> homostasie i. mtabolisme = ensemble des changes entre ltre vivant et son milieu : anabolisme = synthse. Catabolisme = dgradation ii. tre vivant = systme ouvert : dans lenvironnement : matire premire et lnergie ; dchets en dissipant de la chaleur. Reproduction = redistribution dlment du programme susceptible de sexprimer sous forme de caractre = gne, sous forme dADN. adaptation : caractristiques propres lenvironnement. Carbone = atome du vivant Silicium = atome du monde inerte . Carbone entre dans la composition des principales macromolcules des cellules : polysaccharides lipides protines acides nucliques 2. Les molcules informationnelles

2.1. Glucides. compose les sucres -> molcules nergtiques (glucose, amidon glycogne) + structure des membranes -> processus de reconnaissance Lipides. rserve nergtique. phospholipides, cholestrol. Constituants essentiels des membranes biologiques. Par exemple :

Protines. Constitus dacides amins. Cest le support essentiel des molcules informationnelles. Prsentent de nombreux rles varis : structure et soutien transport hormone anticorps/antigne -> rponse immunitaire enzymes Les protines sont codes par les gnes. La structure de la protine est indispensable son activit. 2.2. ADN et ARN Les acides nucliques portent linformation gntique sous forme de gne = caractre transmissible. ADN : acide dsoxyribonuclique = trs grande molcule. Structure : dsoxyribose = sucre qui sert de squelette + groupements phosphates qui relient les sucres entre eux = montants dune chelle Des bases : adnine, thymine, guanine et cytosine qui forment les barreaux de lchelle. LADN est une molcule double brin dont les barreaux sont constitus des bases appareilles deux par deux selon le modle constant : A-T et G-C.. Cest une chelle torsade. Les bases sont lintrieur et le squelette phosphocarbon lexterieur. ARN : acide ribonuclique. Voisine de lADN. Le sucre est le ribose. On trouve quatre bases A, C, G et U (uracile) la place de T. LARN na pas de structure supramolculaire organise. ARN messager, ARNm = support du transport de linformation gntique

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ARN ribosomal, ARNr = on les retrouve dans les ribosomes ARN de transfert, ARNt = porte les acides amins lors de la traduction.

3. Les constituants essentiels dune cellule eucaryote Cf schma fait en cours 3.1. La membrane cellulaire Structure qui circonscrit la cellule. Bi-couche lipidique qui a une consistance huileuse dans + des protines qui donnent un aspect toujours changeant. Diffrents types de protines membranaires dont les rcepteurs = captent les molcules qui influencent lactivit cellulaire. + Chanes glucidiques accroches certaines protines ou lipides (glycoprotines ou glycolipides) -> reconnaissance des cellules entre-elles (cf greffes). Membrane plasmique = frontire entre le milieu extrieur et le milieu intrieur (cytoplasme). Slectivement permable des molcules de petites tailles qui la traversent facilement, ou des lipides. 3.2. Les organites Petites structures aux fonctions spcifiques et responsables de la croissance et de la reproduction des cellules. 1) synthse et dgradation des macromolcules 2) fournit lnergie la cellule (producteurs dnergie) 3) maintien de la forme de la cellule et dplacement.

Fonction : reproduction cellulaire et contrle de la synthse des protines.

Noyau : enveloppe nuclaire qui entoure les chromosomes et les nucloles. Organite le plus volumineux de la cellule Centre de contrle de la cellule

Rticulum endoplasmique : systme de ramifications constitues de chenaux aplatis et de tubes qui parcourent le cytoplasme et stendent jusqu la membrane nuclaire. La mb est donc en continuit avec la membrane externe de lenveloppe nuclaire. Rticulum endoplasmique granulaire : ils sont piquets de ribosomes = lieux de synthse des protines. Rticulum endoplasmique lisse : lieux de synthse des lipides. Le RE sert acheminer des matriaux dune partie de la cellule un autre. Appareil de Golgi : empilement de 6 10 sacs membranaires aplatis (= saccules). Organite spcialis dans lemballage et la scrtion des macromolcules + modifications, ajout de sucres aux protines. Lysosomes : fonctions digestives. = Vsicules riches en enzymes hydrolytiques ou digestives -> brisent les macromolcules. Ces enzymes doivent rester isols du reste de la cellule pour ne pas la dtruire. Vacuoles : se retrouvent dans les cellules vgtales. = gros sacs membranaires qui occupent tout lespace et qui servent de rservoir pour des substances en fortes concentrations : sucres, sels, pigments.

Fonctions : synthse et dgradation.

Fonctions : fourniture de lnergie.

Chloroplastes : contiennent la chlorophylle qui captent lnergie solaire pour synthtiser des glucides. = photosynthse : nergie solaire est transforme en nergie chimique (Energie + CO2 -> glucide + O2). Pendant la photosynthse : 2 phases : Phase claire : formation de lATP et libration de lO2 Phase sombre : formation des sucres par fixation de CO2 Mitochondries : contiennent des enzymes charges de briser les molcules nutritives (riches en nergie) pour fabriquer lATP (= molcule nergtiques de la cellule !) = centrale nergtique de la cellule car elle produit lATP ncessaire aux ractions cellulaires.

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Attention : chloroplaste et mitochondrie contiennent de lADN qui leur est spcifique.

Cytosquelette : sert de support aux organites. microfilaments : fibrilles fines qui forment des faisceaux -> contraction de la cellule. microtubules : cylindre parpills dans le cytoplasme. Forment les cils, flagelles, les centrioles. Cils et flagelles : structures associes aux mouvements. 3.3. La reproduction cellulaire Rplication. Reproduction est une des caractristiques des tres vivants. Durant la division cellulaire, le matriel gntique (ADN) se distribue entre les cellules nouvellement formes. Noyau : contient une matire fondamentale que lon appelle chromatine constitue en partie dADN. Chez la cellule qui ne se divise pas la chromatine est disperse. Chez la cellule qui se divise, la chromatine se condense pour former des structures torsades = chromosomes. Le nombre est caractristique dune espce. Au niveau molculaire. Il est important que chaque cellule ait le mme contenu en ADN. -> processus de rplication = processus par lequel lADN peut faire une copie (exacte !) de lui-mme. Il faut une matrice = moule servant reproduire la forme complmentaire. 1) ADN mre-> ouverture de la double hlice dADN (fermeture Eclair) 2) Ajout de nuclotides par appariement des bases complmentaires (A+T et G+C). 3) Les nuclotides sont relis et une nouvelle charpente se forme. 4) La fermeture Eclair se referme -> deux brins ADN filles identiques loriginal. Au niveau macroscopique : mitose : division cellulaire somatique

Fonctions : architecture et dplacement.

On appelle cycle cellulaire lintervalle entre chaque division cellulaire Les phases du cycle cellulaire Chaque cycle cellulaire consiste dans 4 phases successives : phase G0 ltat de repos des cellules qui ne se divisent pas. phase G1 ( pour Gap ou Growth phase 1) phase S (DNA synthesis) phase G2 (pour Gap ou Growth phase 2), phase M (pour mitose ou miose) Phase G0 = priode, plus ou moins longue, pendant laquelle la cellule est dans un tat de repos, non prolifratif. Sous l'effet de facteurs externes, passer de ltat de repos G0 ltat actif G1. Phase G1 = phase du cycle cellulaire la plus longue. La cellule crot en taille, et fabrique les protines cytoplasmiques qui seront ensuite divises pour les cellules filles. La synthse de DNA ou phase S = La cellule duplique son matriel hrditaire (rplication de l'ADN) et une copie de chacun de ses chromosomes est effectue. Phase G2 = phase de contrle de la bonne duplication du matriel gntique. La cellule prpare la division cellulaire. La phase M = mitose, priode de division cellulaire : les chromosomes, le matriel nuclaire et cytoplasmique sont diviss entre les deux cellules filles.

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Description histologique de la phase M La phase M s'observe facilement au microscope : Condensation des chromosomes (prophase) dans le noyau encore intact. L'enveloppe nuclaire se disperse. Les chromosomes s'alignent au milieu du fuseau, pour former la plaque mtaphasique (Mtaphase). Les deux chromatides se sparent et migrent vers les ples du fuseau. Les deux ples du fuseau s'loignent l'un de l'autre (Anaphase). Les deux cellules filles se sparent, les chromosomes disparaissent pour laisser place une chromatine fine diffuse, l'enveloppe nuclaire se reforme, puis la membrane cytoplasmique, et un nouveau rseau de microtubules apparat dans le cytoplasme (Tlophase). miose : division cellulaire germinale (moiti des chromosomes). 3.3.1. transcription = passage du message gntique de lADN sur ARNm Existe une co-linarit entre lADN, lARN et la protine. Le message gntique se trouve dans le noyau alors que la synthse des protines a lieu dans le cytoplasme (ribosome). Rappel : la molcule dARN diffre de la molcule dADN en trois points : un seul brin le ribose luracile remplace la thymine La production dARN a lieu dans le noyau partir de lADN, toujours selon le principe de lappariement des bases A+U, G+C. Dans lADN, le brin codant est celui qui porte linformation gnique. LARNm est donc la copie parfaite du brin codant (sauf que les T sont remplacs par les U). LARNm quitte le noyau et se rend jusquaux ribosomes pour dicter la squence dans laquelle les acides amins devront se lier pour former la protine. Le code gntique : cest le code qui permet la transformation ARN->protine. Cest un code universel ! La squence des bases de lADN correspond la squence des acides amins des protines. Il repose sur une combinaison comprenant 3 bases ou triplet. 3.3.2. Traduction = synthse des protines partir des codons de lARNm. Elle utilise le ribosome et le RE. Ce mcanisme fait intervenir deux autres types dARN : ARN transfert et ARNr. Ainsi chaque gne (ensemble de codons) est traduit en une protine prcise dont une seule erreur de traduction peut causer une maladie grave (modification de lactivit ou de la structure 3D). 4. La cellule procaryote La microbiologie tudie les organismes qui sont trop petits pour tre vus lil nu -> micro-organismes Les micro-organismes : apportent de nombreux avantages dans la socit (pain, fromage, bire, antibiotique, vaccins, vitamines, etc) causent aussi des problmes aux hommes et la socit : responsable des maladies : tuberculose bacille de Koch. peuvent transformer la matire organique et inorganique. Aujourdhui, la microbiologie a bcp contribu aux domaines de la biochimie et de la gntique : ces micro-organismes sont simples, se dveloppent rapidement et peuvent tre cultivs en grande quantit. 4.1 organisation et structure Cellule procaryote = caractristique des protistes infrieurs, et en particulier des bactries. cest une cellule plus petite et plus simple

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Toutes les bactries sont procaryotes.

Principales formes bactriennes. A. Forme sphrique. Caractrise les coques : diplocoque, pneumocoque, gonocoques et mningocoques (rniformes), streptocoques (chanette plus ou moins longue de coque), staphylocoque (en grappe) B. Cylindrique. Bacille (btonnet droit), vibrion (btonnet incurv) C. Spirale. Endospore : structure rsistante capable de survivre durant de longues priodes dans un environnement dfavorable. Cest une structure dormante qui se dveloppe dans la cellule et qui rsiste la chaleur et la dessication. Organisation de la cellule bactrienne. La cellule est entoure dune paroi qui lui donne forme et sa rsistance. Entoure dune second enveloppe plus fine et plus dlicate : la membrane plasmique. Fonction respiratoire, rle de barrire : diffusion, transports passifs et actifs. Le hyaloplasme sous-jacent est un fluide aqueux : sels minraux, ribosomes, lments nutritifs, enzymes mais aucun organite dcrits dans la cellule eucaryote. Lappareil nuclaire se distingue par son aspect fibrillaire, cest une boucle dADN. Les granules de rserve contiennent de lamidon, du glycogne. La paroi, la membrane, le cytoplasme et lappareil nuclaire reprsentent les structures essentielles de la cellule. Dautres peuvent sy adjoindre la capsule (enveloppe externe). Rle de protection et contribue la survie. les flagelles (mobilit). les pili (rle sexuel).

ne possde pas un vrai noyau dpourvue dorganites