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Manual de Bergey
En 1923, David Bergey, catedrtico de bacteriologa en la Universidad de Pennsylvania, y cuatro colaboradores ms, publicaron un manual sobre caractersticas de las bacterias de inters mdico conocidas hasta entonces, que poda utilizarse para la identificacin bacteriana. Este manual, el Bergey's Manual of Determinative Bacteriology, ha sido utilizado en muchos laboratorios de Microbiologa de todo el mundo y ha ido actualizndose a lo largo de los aos hasta que apareci la novena y ltima edicin en 1994. (ver historia ) En 1984, se public la primera edicin de un manual enfocado ms a la clasificacin que a la identificacin: el Bergey's Manual of Systematic Bacteriology. Esta nueva publicacin constaba de cuatro volmenes que se fueron publicando en los siguientes cinco aos. La clasificacin propuesta por esta primera edicin del Bergey's Manual of Systematic Bacteriology est basada en la tincin de Gram. As, agrupa a todas las bacterias en un solo Reino: el Procaryotae, en el que se reconocen cuatro divisiones: Gracilicutes (procariotas, con pared celular, gramnegativas), Firmicutes (procariotas, con pared celular, grampositivas), Tenericutes (procariotas, sin pared celular) y Mendosicutes (procariotas filogenticamente anteriores a las divisiones mencionadas, como las arquebacterias y otras) En esta primera edicin de la nueva etapa, las bacterias se distribuyen en secciones. Las distintas secciones se han constituido sobre la base de caracteres descriptivos morfolgicos y metablicos, por ejemplo, espiroquetas, cocos y bacilos aerobios gramnegativos, cocos grampositivos, etc. En cada una de las 33 secciones que lo componen se engloban distintos rangos taxonmicos que varan considerablemente. Algunos llegan a tratar de divisiones, en tanto que otros se ocupan de gneros. Un carcter que se mantiene constante es el estudio de gneros y sus correspondientes especies, categoras taxonmicas ambas que son fundamentales en su estructuracin. Los que no encajan perfectamente en alguna de las familias o secciones se les denomina gnero de afiliacin dudosa o se incluyen en el de otros gneros. Las especies no bien descritas, definidas sin cepa tipo, neotipo o de referencia, se catalogan como species incertae sedis. Las propiedades empleadas para la diferenciacin son: caractersticas morfolgicas microscpicas, morfologa de las colonias y pigmentacin, condiciones de crecimiento y nutricin, fisiologia y metabolismo, caracteristicas genticas, plsmidos y bacterifagos, estructura antignica, patogenicidad y ecologa. En general, en cada especie se incluye la cepa tipo. Ha habido un progreso considerable en el campo de la taxonoma bacteriana desde 1984, el ao de la publicacin del primer volumen del Bergey's Manual of Systematic Bacteriology. El nmero de especies nombrada se ha duplicado, y hay ms de 170 nuevos gneros descritos. En particular, el anlisis del rRNA, del DNA y de las protenas, ha hecho posible el anlisis filogentico de las bacterias. A consecuencia de ello, la segunda edicin del Bergey's Manual of Systematic Bacteriology ser fundamentalmente filogentica en vez de fenotpica, y por consiguiente, muy diferente de la primera edicin. En 2001 apareci el primero de los cinco volmenes de la segunda edicin del Bergey's Manual of Systematic Bacteriology. Esta segunda edicin se publicar en cinco volmenes, y contendr ms informacin ecolgica que clnica. Hasta ahora no se han publicado ms volmenes.
Gustavo A. Daz Martn. I. E. S. Jaime Ferrn Cla. Profesor Tcnico de Formacin Profesional. San Fernando de Henares. (28830 Madrid) Curso 2004-2005 Cdigo 28038616
A diferencia de la primera edicin la clasificacin se resume en dos dominios, Archaea y Bacteria que poseen en total 14 Reinos. La nueva edicin no estar disponible en su totalidad hasta dentro de algunos aos (hasta la fecha solo se ha publicado el Volumen I), pero conocemos la organizacin de su estructura, que transcribiremos a continuacin. Volumen I: Trata del dominio Archaea, en su totalidad y de algunas bacterias Gram negativas especiales, como las Cianobacterias. En este volumen no hay casi ninguna bacteria de importancia clnica. Volumen II: Proteobacterias, bacterias Gram negativas . Dividido en cinco secciones (alfa, beta, delta, gamma y psilon proteobacterias), el reino Proteobacteria agrupa a la mayor parte de las bacterias Gram negativas de importancia clnica. Neisseria, Brucella, Legionella, Pseudomonas, Haemophilus, Campylobacter y Enterobacterias, pertenecen a este reino. Volumen III: Tratar sobre los Gram positivos con bajo contenido en G+C. Aqu aparecern gneros como Staphylococcus, Streptococcus, Enterococcus, Clostridium y Bacillus Volumen IV: Contendr una sola seccin que agrupar a todos los Gram positivos con alto contenido en G+C Los gneros ms conocidos de este volumen sern Mycobacterium y Corynebacterium. El Volumen V tratar de otras bacterias Gram negativas, agrupadas en ocho secciones diferentes. No tienen ningn factor en comn. Los gneros ms importantes desde el punto de vista clnico sern Chlamydia, Treponema, Borrelia o Bacteroides
A pesar de todos estos cambios y avances en los criterios de clasificacin, la identificacin sigue basndose en la distincin entre gneros y especies, que apenas se han modificado. Por este motivo podemos seguir utilizando sin mayores dificultades la novena edicin del Bergey's Manual of Determinative Bacteriology (que adems es el nico que poseemos) hasta que se complete la publicacin de la segunda edicin del Bergey's Manual of Systematic Bacteriology A pesar de que no disponemos de ms referencias sobre los restantes volmenes de la segunda edicin, s podemos disponer de la clasificacin "oficial" que en ellos se recoger. El ltimo ndice publicado de la clasificacin de bacterias se actualiz en abril del 2001 y est a vuestra disposicin en la pgina web del Manual Bergey`s. Una copia de este ndice est a vuestra disposicin en el Laboratorio de Microbiologa, y sobre dicha copia debis establecer los rangos taxonmicos del microorganismo que os ha sido asignado.
Captulo II: La naturaleza de los esquemas de clasificacin bacterianos Los esquemas de identificacin no son los esquemas de clasificacin, aunque pueda existir una cierta similitud. Un esquema de identificacin para un grupo de microorganismos ser establecido solo despus de que el grupo haya sido clasificado inicialmente ( es decir, siendo reconocido como diferente de otros microorganismos); est basado en uno o ms caracteres o sobre un patrn de caracteres que todos los miembros del grupo tienen y que otros grupos no tienen. Los caracteres usados no son generalmente aquellos que se utilizan en la clasificacin del grupo; por ejemplo, la clasificacin puede estar basada en un estudio de hibridacin del DNA/DNA, mientras que la identificacin puede basarse sobre caracteres fenotpicos que se correlacionan bien con la informacin gentica. En general, los caracteres escogidos para un procedimiento de identificacin deben ser fcilmente determinables, mientras que aquellos que son usados para la clasificacin pueden ser bastante difciles de determinar (tales como los valores de homologa del DNA). Los caracteres estudiados deberan ser tambin pocos en cantidad, mientras que la clasificacin puede involucrar un gran nmero de caractersticas, tal y como sucede en el estudio de la taxonoma numrica. Estas particularidades ideales de un sistema de identificacin no siempre puede ser posibles, particularmente con gneros o especies que no son susceptibles de ser caracterizados por los tradicionales test bioqumicos o fisiolgicos. En tales casos, puede ser necesario acudir a procedimientos relativamente complicados para conseguir una identificacin correcta procedimientos tales como la electroforesis de protenas celulares en gel de poliacrilamida (PAGE), la composicin lipdica celular o la hibridacin de cidos nucleicos. Las reacciones serolgicas, que generalmente tienen un valor limitado en la clasificacin, a menudo tienen enorme valor para la identificacin. Los test de aglutinacin en porta, las tcnicas de anticuerpos fluorescentes, y otros mtodos serolgicos, pueden ser realizados sencilla y rpidamente y generalmente suelen ser muy especficos; por esta razn ofrecen los medios necesarios para la identificacin presuntiva y rpida de las bacterias. Su especificidad no es del 100%, y es necesaria la confirmacin de la identificacin por test bioqumicos o fisiolgicos adicionales. En algunos gneros y especies, la identificacin puede basarse no en unos pocos tests, sino sobre un patrn dado por la aplicacin de un batera completa de tests. Los miembros de la familia Enterobacteriaceae representan un ejemplo tpico de esto. Para disminuir la necesidad de inocular un gran nmero de medios en tubo, se han desarrollado una gran variedad de sistemas multitest rpidos y adecuados para usar en la identificacin de diversos taxones, sobre todo aquellos de importancia mdica.