TEMA 7: NIVELES DE ORGANIZACIN ESTRUCTURAL DE LAS PROTENAS.

PROPIEDADES DE LAS PROTENAS Estructura primaria (secuencia) Estructura secundaria (plegado local) Hlice alfa Lmina beta Estructura terciaria (plegado global) Protenas fibrosas: queratinas, fibrona, colgeno, elastina Protenas globulares Patrones de plegado Caractersticas Termodinmica Cintica del plegado Movimientos Estructura cuaternaria (asociaciones de varias cadenas) Asociaciones homotpicas Asociaciones heterotpicas

Propiedades

ESTRUCTURA PRIMARIA

ENLACE PEPTDICO: formacin de un enlace amida (covalente)

entre el grupo -carboxilo de un aa y el grupo -amino de otro (dipptido). - Configuracin TRANS - Prdida de una molcula de agua - Extremo amino y extremo carboxilo

ESTRUCTURA SECUNDARIA- 1

Plegado local y estable

(Linus Pauling) Longitudes y ngulos de enlace Interacciones de Van der Waals Enlace amida (peptdico) en un plano y posicin trans

Algn tipo de enlace no covalente para estabilizar el plegado regular: enlaces de hidrgeno (aa-N H O = C-aa) HLICE LMINA GIROS

ESTRUCTURA SECUNDARIA- 2
HLICES Dextrgiras (D) o levgiras (L)

Nmero de residuos por vuelta: n Nmero de tomos entre un enlace de hidrgeno, incluyendo los tomos que intervienen en el enlace: N Paso (p) Elevacin (h)

HnN

ESTRUCTURA SECUNDARIA- 3 HLICES -Los enlaces de hidrgeno se forman dentro de una nica cadena polipeptdica (en todas las hlices). - Casi paralelos al eje de la hlice (todas las hlices) - R hacia el exterior
3

-Cada O del carbonilo est unido por enlace de hidrgeno al protn de la amina del cuarto residuo ms adelante de la hlice alfa

4
C

2 1 5 13
6 C 3

7 9 8 10
C 2

HnN

n: residuos/vuelta. Entero no
12

N: tomos/enlaces de H
C 1

11

HLICE : H3,613

Hlice

ESTRUCTURA SECUNDARIA- 4

3
2

Hlice 310

Hlice 4,416

ESTRUCTURA SECUNDARIA- 4 LMINA

Cadenas polipeptdicas adyacentes (2 ms) Enlaces de hidrgeno casi perpendiculares a las cadenas

PARALELAS ANTIPARALELAS

Cadenas laterales por encima y por debajo del plano de la hebra

Lmina

Hlice

Paralela
Un aa establece puentes de H con 2 aa distintos de la otra cadena

Antiparalela

Un aa establece puentes de H con un slo aa de la otra hebra

ESTRUCTURA SECUNDARIA- 5
GIRO

GAMMA

BETA

ESTRUCTURA TERCIARIA- 1
Superplegamientos de la estructura secundaria constituyendo formas tridimensionales complejas que se mantienen:

Enlaces fuertes Puentes disulfuro Enlaces dbiles Enlaces de hidrgeno Fuerzas de Van der Waals Interacciones inicas Interacciones hidrofbicas
PROTENAS FIBROSAS (Queratinas, Fibrona, Colgeno y Elastina) Estructurales. Forma filamentosa o alargada. PROTENAS GLOBULARES Qmicas

Queratinas

-Q: pelo, ua, piel Ncleo, citoplasma y superficie celular

Hlice alfa Puentes disulfuro: Cys Monmero: Hlice alfa

300 r

Dmero: enrollamiento a izquierdas

Protofilamento: pares de dmeros se asocian (4 cadenas)

Protofibrilla: 2 pares de protofilamentos se asocian (8 cadenas)

Colgeno

P ms abundante en vertebrados: huesos, tendones, piel Tropocolgeno: hlice triple (1000 residuos). Cada cadena: hlice a la izquierda Las tres cadenas se enrollan a la derecha

Gly-X-Y X: prolina Y: prolina o hidroxiprolina

300nm 64nm

Sntesis de colgeno
RE y CITOSOL:
Formacin de la cadena polipeptdica (1500 residuos) Hidroxilacin Unin de azcares (gal, glu) PROCOLGENO

enrollamiento de 3 cadenas

ESPACIO EXTRACELULAR:
PROCOLGENO (3)

TROPOCOLGENO 1000 RESIDUOS

COLGENO

PROTENAS GLOBULARES

Estructuras muy compactas

Mayora de las protenas formadas por ms de un dominio (regin compacta plegada localmente, de la estructura terciaria). Los dominios estn conectados entre s por la cadena polipeptdica).

1 -Interior y exterior definidos: residuos hidrfobos en el interior, hidrfilos en el

exterior

2 -Giros para cambiar de una configuracin a otra

3 -No todas pueden englobarse en una determinada configuracin

4 -Lmina beta con enrollamiento a la izquierda o giros

FACTORES QUE DETERMINAN LA ESTRUCTURA GLOBULAR

SECUENCIA DE AMINOCIDOS FACTORES TERMODINMICOS: plegamiento es un proceso favorecido termodinmicamente

Entropa conformacional: negativa por las interaccin entre grupos dentro de la molcula Interacciones carga-carga Enlaces de hidrgeno internos Interacciones de Van der Vaals

Efecto hidrfobo

Chaperoninas y priones

ESTRUCTURA CUATERNARIA: ASOCIACIN DE SUBUNIDADES

HOMOTPICAS: Cadenas polipeptdicas idnticas o casi idnticas HETEROTPICAS: Cadenas polipeptdicas MUY DISTINTAS Enlaces de Hidrgeno Puentes salinos Van der Waals Interacciones hidrfobas Enlaces disulfuro

INTERACCIONES HOMOTPICAS A Simetra helicoidal A B A B A B B

Simetra punto-grupo A B B A

Interaccin heterloga

Interaccin isloga

INTERACCIONES HETEROTPICAS

BPTI

TRIPSINA

PROTENAS Y pH

PROTENAS CIDAS (PI bajo)

PROTENAS BSICAS (PI alto)

Grupos ionizables de las R de los residuos de aa en sus cadenas Grupos amino y carboxilo terminales