BIOCHIMIE

INTRODUCERE
M. Horowitz:

Viaa posed proprietile de replicare,
cataliz i mutabilitate.

Biochimia este studiul vieii la nivel molecular

Este n legtur strns cu biologia molecular
i celular





Obiectivele majore ale biochimiei:

- izolarea moleculelor din celule
- determinarea structurii lor
- analiza modului lor de funcionare
- apariia vieii
- studiind procesele chimice din toate formele de via:
microorganisme, plante, insecte, mamifere

Biochimia devine:
Limbajul comun pentru fiziologie, farmacologie,
genetic i microbiologie










Dei lumea vie prezint o enorm diversitate, exist
totui o remarcabil similaritate n biochimia acestor
forme de via.

De exemplu, codificarea i expresia informaiei
ereditare, principalele ci metabolice sunt identice la
imensa majoritate a lumii vii.

Fiinele vii prezint o enorm diversitate, de
exemplu n organismul uman gsindu-se peste
100 000 de specii moleculare diferite.

Structura lor prezint o mare regularitate, bazat
pe organizarea ierarhizat a moleculelor
componente.





Organismele, din punct de vedere anatomic i citologic, sunt constituite:
+ organe, alctuite din
+ esuturi, iar acestea sunt alctuite la rndul lor din
+ celule compuse din
+ organite subcelulare.

Biochimie
Organitele sunt constituite din ansamble supramoleculare care sunt
organizate n macromolecule cu masa molecular de la cteva mii n sus:
- proteine (21 de aminoacizi)
- acizi nucleici (8 nucleotide)
- polizaharide (8 tipuri de glucide)
- lipide
Aceste macromolecule sunt constituite la rndul lor din cteva specii
monomerice, fapt ce uureaz enorm sarcina cercettorilor.
Principalii compui chimici prezeni n
corpul uman
Element Abundena
(%)
Element Abundena
(%)
Carbon 50 Sulf 0.8
Oxigen 20 Sodiu 0.8
Hidrogen 10 Clor 0.4
Azot 8.5 Magneziu 0.1
Calciu 4 Fier 0.01
Fosfor 2.5 Mangan 0.001
Potasiu 1
Alte elemente sunt necesare n cantiti mici:
iodul, cobaltul, molibdenul, seleniul, nichelul, zincul,
etc).

Chiar dac n unele cazuri nu se cunoate precis rolul
lor biologic, aceste elemente sunt necesare unor
organisme pentru cretere i dezvoltare normal.

Aceste elemente se leag ntre ele prin legturi
preponderent covalente formnd diverse structuri
moleculare.

Dintre diferitele tipuri de molecule din organite i citosol
care intr n constituia lumii vii, apa, coninut n
proporie de 64% este componentul cel mai abundent.
Compoziia chimic a corpului uman
Substana Abundena (%)
Proteine 15
Grsimi 15
Glucide 1
Apa 64
Minerale 5
PROTEINE
Proteinele sunt substane macromoleculare organice cu structur
polipeptidic, n care unitile de baz le reprezint cei 21 de
aminoacizi proteinogeni.
Proteinele au un rol esenial n constituirea i funcionarea lumii vii.
Proteinele constituie elementele structurale de baz n celul,
esut i organ, ndeplinind o serie de funciuni:
proteinele cu funcie catalitic (enzimele) catalizeaz toate
reaciile metabolice;
exprimarea informaiei genelor necesit activitatea unui mare
numr de proteine care coopereaz cu acizii nucleici n procese
ca : replicarea ADN, sinteza ARN i a proteinelor;
asigur contracia muscular, mobilitatea celular, procese
de transport intra i intercelular;
asigur imunitatea celular i procesele de transmitere a
semnalelor nervoase i hormonale;
rol energetic, cca. 20% n energetica organismului provenind
din oxidarea aminoacizilor proteinogeni.
PROTEINE
Chimic, proteinele sunt constituite din aminoacizi,
legai ntre ei prin legturi peptidice.
Numrul acestora este variabil, ntre 40 - 40.000, ceea
ce ar corespunde unor mase moleculare cuprinse ntre
5000 - 4.200.000 Da.
Diversitatea proteinelor din natur se bazeaz pe
posibilitile, practic nelimitate, de combinare a celor 21
aminoacizi proteinogeni. Astfel din 20 de aminoacizi se
pot obine 202 (400) dipeptide diferite sau 203 (8000)
tripeptide diferite sau 204 (160.000) tetrapeptide diferite
.a.m.d.
Aceast diversitate permite existena de proteine
specifice fiecrui organism, organ, esut, celul.
AMINOACIZI

substane organice cu funciune mixt; conin n molecul att o
grupare aminic (-NH2) ct i una carboxil (-COOH) legate de
acelai atom de carbon.
Aminoacizii mai conin catene saturate, nesaturate, aromatice sau
heterociclice.
Funcie de originea lor pot fi naturali sau artificiali
Se cunosc aproximativ 300 aminoacizi (AA) naturali,
21 AA proteinogeni n constituiA tuturor formelor de via,
specificai prin codul genetic.
AA prezeni n proteine - 90% din totalul lor (6-8 g/100 ml)
AA proteinogeni liberi 10% (0,05 g/100 ml)
derivai, care rezult, de fapt, postrannslaional; de ex.
hidroxiprolina, hidroxilizina, cistina ce provine din oxidarea a
dou cisteine la nivelul gruprii SH, la o legtur S-S-, etc. Alte
modificri posttranslaionale la nivelul aminoacizilor pot fi metilri,
formilri, acetilri, prenilri, carboxilri, fosforilri.
aminoacizi liberi neproteinogeni, cu rol funcional
Structura chimic a aminoacizilor
proteinogeni

o
R CH
NH
2
COOH
Aminoacizi cu catena lateral R alifatic
Glicina (glicocol)
Gli (G)
Alanina Ala (A)

Valina Val (V)

Leucina Leu (L)

Isoleucina Ile (I)

CH
2
NH
2
COOH
CH
3
CH
NH
2
COOH
CH
3
CH
3
CH CH COOH
NH
2
CH
3
CH
3
CH CH
2
CH
NH
2
COOH
CH
CH
3
CH
NH
2
COOH CH
2
CH
3
Aminoacizi cu catena lateral R
coninnd grupri hidroxil (OH)

Serina Ser (S)


Treonina Thr (T)


Tirozina Tir (Y)
CH
2
OH
CH COOH
NH
2
CH
3
CH
OH
CH
NH
2
COOH
C H
2
C H
N H
2
C O O H H O
Aminoacizi cu catena lateral R
coninnd sulf (S) i seleniu (Se)

Cistein Cis (C)


Metionin Met (M)


Selenocistein Se-Cis
CH
2
SH
CH
NH
2
COOH
CH
3
S ( CH
2
)
2
CH
NH
2
COOH
C H
2
C
H
SeH NH
2
COOH
Aminoacizi cu catena lateral R
coninnd grupare acid i amidele lor
Acid aspartic Asp (D)

Asparagin Asn (N)

Acid glutamic Glu (E)

Glutamin Gln (Q)

HOOC CH
2
CH
NH
2
COOH
H
2
NOC CH
2
CH
NH
2
COOH
HOOC CH
2
CH
2
CH COOH
NH
2
H
2
NOC CH
2
CH
2
CH COOH
NH
2
Aminoacizi cu catena lateral R
coninnd grupare bazic

Lizina Lis (K)

Arginina Arg (R)

Histidina His (H)

NH
2
CH
2
( CH
2
)
3
CH
NH
2
COOH
NH
2
C NH
NH
( CH
2
)
3
CH COOH
NH
2
N H N
C H
2
C H
N H
2
C O O H
Aminoacizi cu catena lateral R
coninnd inel aromatic

Fenilalanin Phe (F)


Tirozin Tir (Y)

Triptofan Trp (W)

C H
2
C H
N H
2
C O O H
C H
2
C H
N H
2
C O O H H O
H
N
CH
2
CH COOH
NH
2
Iminoacid

Prolin Pro (P)
N
COOH
H
Aminoacizi neproteinogeni cu rol
funcional
-alanina - component al
coenzimei A, structura unor dipeptide

GABA neurotransmitor

ac. -amino- levulinic
intermediar n sinteza hemului
Citrulina intermediar n
ureogenez

Ornitina intermediar n
ureogenez

Homocisteina - intermediar n
metabolismul unor aminoacizi


H
2
NCH
2
CH
2
COOH


H
2
NCH
2
CH
2
CH
2
COOH

H
2
NCH
2
COCH
2
CH
2
COOH

H
2
NCONH(CH
2
)
3
CH(NH
2
)COOH

H
2
N(CH
2
)
3
CH(NH
2
)COOH


HS(CH
2
)
2
CH(NH
2
)COOH
Aminoacizi neproteinogeni cu rol
funcional
Homoserina - intermediar n
metabolismul unor aminoacizi

PABA - factor de cretere pt. bac-
terii, component al acidului folic

DOPA - intermediar n sinteza
catecolaminelor

T3 - hormon tiroidian

T4 tiroxin - hormon tiroidian
HO(CH2)2CH(NH2)COOH


H
2
NC
6
H
4
COOH

H O
H O
C H
2
C H ( N H
2
) C O O H
H O
I
O
I
I
C H
2
C H
N H
2
C O O H
H O
I
O
I
I
C H
2
C H
N H
2
C O O H
I

Proprietile aminoacizilor

Proprietile fizice
- substane solide,
- puncte de topire ridicate (peste 200C) i se
descompun nainte de a se topi.
- se dizolv, ntr-o msur mai mare sau mai mic, n
ap,
- sunt greu solubili n solveni nepolari (eter, cloroform,
benzen, etc.).
- sunt uor solubili n soluii diluate de acizi sau baze.

Proprietile optice















C H H
2
N
C
R
HO O
C NH
2
H
C
R
OH O
L aminoacid D aminoacid
n structura proteinelor nu se ntlnesc dect LAA, deoarece proteinele
sunt sintetizate cu ajutorul enzimelor, care au stereospecificitate i nu
insereaz dect Laminoacizi n lanul proteic.
Aminoacizii din seria D apar numai ocazional, la unele
microorganisme mai ales, unde ndeplinesc roluri specifice (de ex. n
antibiotice polipeptidice)
Izoleucina i treonina au un carbon asimetric adiional, atomul C
Proprietile acido-bazice
electrolit amfoter La pH-ul plasmei sanguine (7,4) sau al spaiului
intracelular (7,1), gruparea carboxil exist aproape n ntregime sub forma
ionului carboxilat (COO-). La aceste valori de pH, majoritar gruparea
aminic este n forma protonat (NH
3
+
). -> soluie tampon

B A
R CH
COOH
NH
2
R CH
COO
-
NH
3
+
pH > 7
-
pH < 7
+
NH
3
+
R CH COOH
H
+
R CH
NH
2
COOH
H
+
R CH
NH
2
COO
-
pH izoelectric (pI)
La o anumit valoare a pH-ului, ionizarea gruprilor NH
2
i COOH este
egal; la acest pH, aminoacidul este neutru din punct de vedere electric i
are solubilitate minim

pI
pK pK
COOH
NH
=
+

+
o
o
3
2
2
pK pK
pI
COOH R COOH o
+
=
2
pK pK
pI
3 3
NH R NH
+ +
o
+
=
Nr. crt. Aminoacid pK

COOH

pK

NH3+

pK
R
pI
1 Alanin 2,35 9,69 6,02
2 Arginin 2,17 9,04 12,48 10,76
3 Acid aspartic 2,09 9,82 3,86 2,97
4 Asparagin 2,02 8,8 5,41
5 Cistein 1,71 10,78 8,33 5,02
6 Fenilalanin 1,83 9,13 5,98
7 Glicocol 2,34 9,60 5,97
8 Glutamin 2,17 9,13 5,65
9 Acid glutamic 2,19 9,67 4,25 3,22
10 Histidin 1,82 9,17 6,00 7,58
11 Izoleucin 2,36 9,68 6,02
12 Leucin 2,36 9,60 5,98
13 Lizin 2,18 8,95 10,53 9,74
14 Metionin 2,28 9,21 5,75
15 Prolin 1,99 10,60 6,10
16 Serin 2,21 9,15 5,68
17 Tirosin 2,20 9,11 10,07 5,65
18 Treonin 2,63 10,43 6,53
19 Triptofan 2,38 9,38 5,88
20 Valin 2,32 9,62 5,97
Valorile pKa (la 25C) i pH-ul izoelectric (pI)
al aminoacizilor proteinogeni
Aminoacizi cu R hidrofob, nepolar:
Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Trp, Met
Aminoacizi cu R polar, dar fr sarcin
electric (la pH fiziologic):
Ser, Tre, Tir, Cis, Asn, Gln, Gli.
Aminoacizi cu R ncrcat negativ (-) la pH-ul
fiziologic: Asp, Glu.
Aminoacizi cu R ncrcat pozitiv (+) la pH-ul
fiziologic: Liz, Arg, His.
Proprietile chimice

reacii chimice comune:
determinate de prezena gruprii CNH
2

- dezaminare,
- transaminare,
- acilare, alchilare,
- formare de baze Schiff cu aldehidele,
- amidificare cu gruparea COOH de la alt aminoacid
determinate de prezena gruprii Co-COOH
- esterificare,
- anhidrizare,
- decarboxilare - cu formare de amine,
- amidificare, de ex. cu gruparea NH
2
de la alt
aminoacid cu formarea legturii peptidice
electrolii amfoteri
Proprieti particulare
Cisteina punte disulfidic cistina
-SH nucleofil excelent



Serina, treonina, tirozina esteri fosforici

2
- 2H
+ 2H
CH
CH
2
COOH
SH
NH
2
CH
2
CH
COOH
NH
2
S S CH
2
H
COOH
NH
2
C
+ ATP
+ ADP
(+
CH
2
CH
COOH
OH
NH
2
( H
3
PO
4
)
CH
2
CH
COOH
NH
2
O PO
3
H
2
H
2
O)
Liz prin gruparea NH
2
suplimentar are rol n realizarea unor activiti
enzimatice sau n stabilirea legturii protein - cofactor enzimatic sau
formarea de reele n structurile colagenului i elastinelor.

Tir i His, prin posibilitile oferite de componentele lor R specifice (de
ex. HO-fenolic, respectiv NH-imidazolic, prin fixare respectiv cedare de
protoni) au rol n activitatea enzimatic a unor proteine, precum i n
constituirea unor molecule funcionale (de ex. hemoglobin).

Ala, Val, Leu i Phe n schimb, datorit caracterului hidrofob al
componentei lor R specifice sunt aminoacizi care confer proteinei n care
sunt prezente, predispoziii privind crearea unor anumite elemente de structur
spaial (prin legturi apolare).

Aminoacizii nu absorb radiaia luminoas n domeniul vizibil (sunt incolori).
Fenilalanina, tirozina, triptofanul i histidina absorb radiaia n domeniul
250 290 nm, fiind responsabili pentru absorbia de radiaie a proteinelor n
domeniul respectiv.
Reacii de culoare ale aminoacizilor

Ninhidrina Fluorescamina
Formarea de legturi peptidice
O
O
O
O
O
O
CH H
2
N C
O
OH H
H
N CH COOH
H
2
N CH NH
O
CH COOH C
R
1
R
2
R
2
R
1
H
2
O
+H
2
O
Structura proteinelor
Legtura peptidic





datorit conjugrii p-t legtura este parial dubl
R
2
N CH C OH
O
o
H
H
2
HN CH
R
1
C
O
o
R
2
N CH C OH
O
o
H
2
HN CH
R
1
C OH
O
o
+
Legtura peptidic
Dipeptid

I II III
C
C N
P
O
C
H
+
-
C
C N
P
O
C
H
C
C N
P
O
C
H
+
-
o
o
Consecinele acestui fenomen:
legtura C
P
-N avnd caracter parial de dubl legtur
nu mai permite rotaia liber a substituenilor celor doi
atomi participani i toi cei ase atomi implicai devin
coplanari;
adoptarea unui aranjament trans pentru atomii H, O i
pentru radicalii R ai celor doi aminoacizi implicai,
aranjament care este cel mai stabil din punct de vedere
energetic;
gruparea NH nu ionizeaz datorit dublei legturi ce
o transform n grupare imino =N-H;
rotaia liber este permis doar n jurul atomului Co
(Co-N, Co-CP), existnd astfel posibilitatea apariiei
unor conformaii diferite ale proteinei n structura de
ansamblu
Natura catenelor laterale
Orientarea catenelor. n general radicalii nepolari (Val, Leu,
Ile, Met, Phe) sunt orientai spre interiorul proteinei, n timp ce
radicalii polari ionizabili (Asp, Glu, His, Arg, Lis) sunt ndreptai spre
suprafaa proteinei, permind acesteia s formeze legturi cu apa.

Formarea de legturi ntre catenele laterale cum ar fi :
legturi de hidrogen ntre componentele legturilor peptidice
(carbonil i imino) ale celor dou catene
punte de sulf ntre dou resturi de cistein
legturi ionice ntre formele ionizate ale - COOH i - NH
2
legturi esterice ntre gruprile COOH i OH
legturi hidrofobe (Van der Waals) ntre catenele de aminoacizi
hidrofobe (Val, Leu, Ile, Phe, Trp)
Legturi de hidrogen ntre gruprile OH ale aminoacizilor Ser,
Tre i Tir
Organizarea structural a proteinelor
n structura proteinelor se disting dou nivele
principale:
structura de baz (primar) ce const n
secvena catenei polipeptidice a proteinelor
constituit pe baza naturii chimice, proporiei i
succesiunii aminoacizilor componeni.
Conformaia sau organizarea superioar,
rezultat al orientrii tridimensionale a catenei
polipeptidice

Structura primar

Reprezint numrul, tipul i ordinea aminoacizilor n
secvena proteinei
realizat prin legturile peptidice dintre aminoacizii
componeni
Secvena de aminoacizi dintr-o protein este unic, ea
aflndu-se sub un strict control genetic
Structura tridimensional i implicit activitatea biologic
a unei proteine sunt dependente i controlate de
secvena de aminoacizi caracteristic structurii primare.
Modificarea acestei secvene prin nlocuirea,
adugarea sau eliminarea unuia sau mai multor
aminoacizi duce la modificarea conformaiei i implicit a
funciei biologice a proteinei respective.
Compararea secvenelor este utilizat curent n evaluarea similitudinii
proteinelor la nivelul structurii i funcionrii. Aceste comparaii iau
n considerare alinierea secvenelor astfel nct s existe un maxim de
resturi de aminoacizi identici.
- Dou secvene sunt denumite omoloage dac secvenele lor
au un grad nalt de similitudine. Termenul de proteine analoage
denumete proteine care au structuri similare dar nu au rapoarte de
evoluie ntre ele.
Deosebirile pot fi date de substituia unui aminoacid cu un altul.
Aceste substituii pot fi:
- Conservative atunci cnd un aminoacid este substituit cu altul
avnd aceeai polaritate (Val Ile). Aceste substituii apar la aceeai
protein dar de la specii diferite. Dac un aminoacid este gsit n aceeai
poziie, el se numete reziduu invariabil i se consider c are un rol
esenial n structura sau funciile proteinei.
- Neconservative atunci cnd un aminoacid este substituit cu
altul avnd polaritate diferit. Aceast substituie produce modificri
severe n proprietile proteinei rezultate. n cazul substituiilor de
aminoacizi au importan deosebit polaritile aminoacizilor, dar i
volumul i aria suprafeei aminoacizilor.
Nomenclatura peptidelor
CH
2
H
2
N CO NH CH
CH
3
COOH H
2
N CH
CH
3
CO NH CH
2
COOH
Glicil - alanin sau Gli - Ala Alanil - glicin sau Ala - Gli
Datorit posibilitilor de legare a acelorai aminoacizi n secvene diferite,
peptidele pot prezenta fenomenul de izomerie de structur.
Proprietile peptidelor
Legtura peptidic este neionizat la orice pH de
interes fiziologic. Formarea de peptide din aminoacizi
la pH 7,4 este, prin urmare, acompaniat de pierderea
unei sarcini pozitive i a uneia negative per legtur
peptidic format.
Peptidele sunt, totui, molecule ncrcate electric la pH-
ul fiziologic datorit gruprilor lor C- i N-terminale i a
altor grupri funcionale prezente n aminoacizii polari.
Prin urmare, proprietile electrochimice ale
peptidelor sunt similare cu ale aminoacizilor, fiecare
peptid avnd un pH izoelectric (pI).
Reacia biuretului cu sulfat de cupru n mediu bazic
Determinarea constituiei peptidelor
Stabilirea felului aminoacizilor i proporiile n care acetia intr n
constituia peptidelor

Hidroliza n cataliz acid se realizeaz cu HCl 6N la 110C, n tub
nchis vidat, timp ndelungat (pn la 96 ore). n aceste condiii tot
Trp, Cis i mare parte din cistin sunt distrui; Ser i Tre se
recupereaz incomplet.
Hidroliza n cataliz bazic, care distruge Ser, Tre, Arg i Cis i
racemizeaz toi aminoacizii este utilizat pentru analiza Trp.

Dup hidroliz, aminoacizii pot fi separai i identificai prin
metode cromatografice (ex. cromatografie de schimb ionic automat
sau HPLC).
Urmeaz apoi operaia de determinare a secvenei lanurilor
polipeptidice, aceasta ncepnd prin cunoaterea aminoacizilor
terminali
Determinarea aminoacidului N-terminal
metoda Edman cu izotiocianat de fenil
+
N
C
S
N
N
NH
2
R
H
H
CH
O
O
O
O
S
N
N
CH
CH
H
H
H
N NH
C R
C
C
C
R'
R'
+
H
2
O
H
+
N
H
CH
NH
2
C
O
N NH
S
R
O
C
R'
ni t romet an
O
metoda Sanger cu 2,4dinitrofluorbenzen
+
NO
2
F H
H
N CH
R
COOH O
2
N O
2
N
NO
2
N
H
CH
R
COOH
Aminoacidul C-terminal
+ cu sulfocianur de amoniu n mediu de acid acetic i
anhidrid acetic (se formeaz 1acil2tiohidantoina peptidului
care, tratat cu baze, elibereaz aminoacidul C-terminal sub
form de 2tiohidantoin;
+ cu hidrazin, ceea ce face s cliveze toate legturile
peptidice, transformnd toate resturile de aminoacizi n
aminoacid-hidrazide, cu excepia aminoacidului C-terminal care,
eliberat ca aminoacid liber, se identific cromatografic.
Pe cale enzimatic,
- aminopeptidaze
- carboxipeptidaze
Peptidele naturale mai importante
Glutationul este o tripeptidic atipic
GluCisGli
o

CH
2
CH
2
CH
2
CH
2
CO N
SH
H
2
N CH COOH
CH CO
NH
COOH
funcioneaz ca un sistem redox, prezint dou forme:
redus (prescurtat GSH) i oxidat (prescurtat GSSG).
particip la procese de oxido-reducere n majoritatea
esuturilor (cu rol deosebit n hematii) i
activator al multor sisteme enzimatice
Oxidarea neenzimatic (n cataliza ionilor de cupru i
fier).
GSH + HSG GSSG + 2H+ + 2e

Oxidare cu peroxizii aprui la nivel celular datorit
proceselor oxidative normale sau favorizate de un numr
de medicamente (glutation peroxidaza).

glutation
peroxidaza
G-SH + R-OOH G-SS-G + R-OH + H
2
O
Reducerea formei oxidate nu se poate face dect n
prezena unei enzime glutation reductaza (NADPH -
dependent).





glutationul redus reprezint forma activ. Posibilitatea
aceasta de interconversiune reprezint, de fapt,
mecanismul de aciune al glutationului, care, putnd
ceda i accepta hidrogen, face parte din categoria
transportorilor neenzimatici de hidrogen.

Glutationul, pe lng rolul de antioxidant celular mai
ndeplinete i alte funcii: de depozit al cisteinei, de
conjugare a unor compui n vederea eliminrii lor
din organism, etc
G-SS-G + NADPH + H
+
glutation
reductaza
2GSH + NADP
+
Peptide cu rol hormonal

hormonii hipofizei posterioare, ocitocina i vasopresina sunt
nonapeptide ciclice.
hormonii hipotalamici (factorii de eliberare sau de inhibare a
eliberrii hormonilor hipofizari) sunt peptide mici, uneori cu structur
modificat. Astfel TRH-ul este piroglutamilhistidilprolinamid.
Hormonii importani ca insulina, parathormonul, ACTH-ul,
calcitonina, au structur peptidic.
Angiotensina II, cel mai puternic hormon hipertensiv, este un
octapeptid.

Endorfinele i encefalinele, substane endogene cu rol funcional
i cu efect analgezic puternic

Peptidele antibiotice sunt produse de microorganisme. Au o
structur peptidic, deseori ciclic i pot conine i Daminoacizi
(ex. gramicidina S este un decapeptid, atipic, ciclic; actinomicina
D este format din dou pentapeptide; acidul 6aminopenicilanic,
substana de baz a penicilinei i precursor pentru multe peniciline
sintetice, este un dipeptid atipic).