Acercamiento biosinttico de los productos naturales

Biosntesis
Formacin

de un compuesto qumico por un organismo vivo.

Biognesis:

Produccin o generacin de organismos vivos desde otros organismos vivos.

 Organismos

varian ampliamente en su capacidad de sintetizar y transformar compuestos qumicos. Por ejemplo, las plantas son muy eficientes en sintetizar compuestos orgnicos via fotosntesis desde materiales inorgnicos encontrados en el ambiente, mientras que otros organismos , tales como animales y microorganismos los deben obtener consumiendo plantas.

La ruta para generalmente modificar y sintetizar carbohidratos, proteinas, cidos grasos y cidos nucleicos son esencialemente los mismos en todos los organismos, fuera de variaciones menores. Estos procesos son colectivamente descritos com metabolismo primario, siendo los compuestos involucrados en estas rutas denominados como metabolitos primarios.

Metabolismo primario( Bioqumica)

Friedrich Whler, pedagogo y qumico alemn, naci en Eschersheim (hoy parte de Frncfort sobre el Main) el 31 de julio de 1800 y muri en Gotinga el 23 de septiembre de 1882.

Origen de los Productos Naturales

Conocido desde hace 6.000 aos en Asiria y en Babilonia. Se usaba para pegar ladrillos y piedras y en el calafateo (sellado).

Algunos lo llamaban nafta y saban que se encenda al contacto con una llama o slo a la vista del espelendor de la misma.

 Los

metabolitos secundarios, son encontrados slo en organismos especficos, o grupos de ellos, y son una expresin de la individualidad de la especie. metabolitos secundarios no son necesariamente producidos en todas las condiciones, y en la mayora de los casos la funcin de estos y sus beneficios nos son conocidos.

Los

Algunos metabolitos secundarios son producidos con fines especficos, por ejemplo: 1. Materiale txicos que proveen defensa contra predadores. 2. Semioqumicos 3. Agentes colorantes para atraer o avisar a otras species

Metabolismo secundario( Qumica de productos naturales).

Los building blocks

Los

building blocks para metabolitos secundarios son derivados del metabolismo.

nmero de building blocks necesarios es sorprendemente poco.

El

1. 2. 3. 4.

5.

Los ms importantes building blocks empleados en la biosntesis de metabolitos secundarios son derivados de: Acetil coenzimo A (acetyl-CoA) cido shikimico cido mevalnico 1-deoxixilulosa 5-fosfato Amino cidos

1. Ruta del Acetato

La forma en la cual el acetato es usado en la mayora de sus importantes reacciones boqumicas es como acetyl coenzyme A (acetyl-CoA). Acetyl-CoA es formado por decarboxilacin oxidativa del producto de la ruta glicoltica, el cido pirbico. Importantes metabolitos secundarios son formados de esta ruta: 1. Fenoles 2. Prostaglandinas 3. Antibiotics macrlidos

Coenzyme A: presente en todas las clulas que funcionan como un transportador de grupo acilo.
NH2 N O RS N H N H O H3C CH3 O OH OH P O OH P O HO HO O OH P O N O
O

N N

2. Ruta del shikimato

El cido shikimico es producido desde una combinacin de fosfoenolpiruvato, un intermediario de la ruta glicoltica, y eiytrosa 4-fosfato de la ruta de la pentosa fosfato. La ruta del shikimato conduce a: 1. Fenoles 2. Derivados del cido cinmico 3. Lignanos 4. Alcaloides

3. Ruta del Mevalonato

El

cido mevalonico es por si mismo por tres moleculas de acetyl-CoA, pero la ruta del mevalonato canaliza acetatos dentro de una serie de compuestos ms que la ruta del acetato.

4. Ruta de Deoxyxylulose phosphate

Deoxyxylulose phosphate surge de una combinacin de dos intermediarios de la ruta glicoltica, llamados cido pirbico y glyceraldehyde 3-phosphate. Las rutas del mevalonato y de and deoxyxylulose phosphate son en conjunto responsables de la biosntesis de un basto arreglo de metabolitos terpenoides y esteroides.

5. Ruta de los amino cidos

Peptidos,

proteinas, alcaloides y muchos antibioticos son derivados de amino cidos. de la ruta glicoltica y del ciclo de Krebs son usados en la construccin de muchos de ellos. amino cido aromaticos fenilalanina, tirosina, y triptofano son por ellos mismos productos de la ruta del shikimato

Intermediarios

Los

Los metabolitos aecondarios pueden ser sintetizados por una combinacin de varios building blocks del mismo tipo, o por una mezcla de diferentes building blocks. Muchos metabolitos secundarios tambin contienen una o ms unidades de azcar en su estructura. Para apreciar cmo un producto natural es elaborado, es importante ser capaz de: 1. Disectar su estrutura en los building blocks bsicos desde los cuales fue hecho. 2. Proponer cmo estos fueron mecanisticamente unidos.

 Los

tomos de oxgeno pueden ser introducidos y removidos por una variedad de procesos, por ello no son considerados en el inicio del anlsis, excepto como un sealizador de origen acetato o shikimato.
pocos building blocks son rutinariamente empleados. La siguiente lista incluye aquellos ms frecuentes para producir esqueletos carbonados y nitrogenados de un producto natural.

Relativamente

 C1: El ms simple de los building blocks

esta compuesto por un nico tomo de carbono, usualmente en le forma de metilo, y ms frecuentemente est unido a oxgeno o nitrgeno, y ocasionalmente a carbono. Es derivado del S-metil de L-metionina.

C2: Una unidad de dos carbonos podra ser

suministrada por acetyl-CoA. Acetyl-CoA es primero convertida al ms reactivo malonilCoA antes de su incorporacin.

 C5: La cadena ramificada C5 isopreno es

una cxaracterstica de compuestos formados desde las rutas mevalonato o deoxyxylulose phosphate.

C6C3: Esto se refiere a una unidad fenil

propil y es obtenida desde el esquelto carbonado o de los amino cido Lphenylalanine or L-tyrosine.

C6C2N: Nuevamente, este building block

es formado de ya sea L-phenylalanine or Ltyrosine.

 Indol.C2N: el tercer de los amino cidos

aromaticos es L-tryptophan.

C4N: la unidad C4N es usualmente

encontrada como un sistema pirrolidino heterocclo y es producida desde Lornithine (un mino cido no proteico).

C5N: se produce desde L-lysine y la

unidad tiende a ser encontrada como sistema de anillo piperidina.

El mecanismo de construccin
Los metabolitos secundarios son biosintetizados por una secuencia de reacciones que son catalizadas por enzimas. Las enzimas tiene el poder de efectuar transformaciones: 1. Ms eficientemente y ms rapidamente que la anloga qumica. 2. Bajo condiciones muchos ms suaves. 3. Llevar a cabo reacciones estereoespecficas.

Reacciones de alquilacin 2. Reordenamientos de Wagner-Meerwein 3. Reacciones de Aldol y Claisen 4. Fomacin de bases de Schiff y reaccin de Mannich 5. Transaminacin 6. Reacciones de decarboxilacin 7. Reacciones deoxidacion and reduccin 8. Acoplamiento oxidativo fenlico 9. Reacciones de glicosilacin
1.