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Proteínas

Estructura y Función
Dr. Giuliano Bernal Dossetto
Departamento de Ciencias Biomédicas
Facultad de Medicina
Universidad Católica del Norte
Estructura Primaria de las Proteínas

 La estructura tridimensional de una proteína está determinada


por su secuencia de aminoácidos (Estructura primaria).
 La función de una proteína depende de su estructura.
 Insulina es un buen ejemplo para la comprensión de la
estructura y la función de una proteína, y su evolución en distintas
especies.
 Es producida en las células β del páncreas a partir de un
precursor inactivo, proinsulina.
 Proinsulina posee 86 aa y 3 puentes disulfuro entre las cadenas.
Diferencias en insulinas usadas en el
tratamiento de la Diabetes Mellitus
 Tanto las insulinas porcina y bovina fueron usadas
exitosamente en el tratamiento de la diabetes.
 Sin embargo pequeñas diferencias en su secuencia,
respecto de la insulina humana, inducía una respuesta
inmunológica en algunos pacientes.
 La insulina porcina es más aceptable en el tratamiento de
la diabetes debido a que presenta mayor similitud en su
secuencia con la humana.
 La insulina humana es producida mediante ingeniería
genética o mediante modificación de la insulina de cerdo.
Variations in positions A8, A9, A10, and B30
of Insulin
Species A8 A9 A10 B30
Human Thr Ser Ile Thr
Cow Ala Ser Val Ala
Pig Thr Ser Ile Ala
Sheep Ala Gly Val Ala
Horse Thr Gly Ile Ala
Dog Thr Ser Ile Ala
Chicken* His Asn Thr Ala
Duck* Glu Asn Pro Thr
Anemia falsiforme
(Sickle Cell Anemia)

 Ocurre por una mutación en la 6º posición de la cadena


β de la hemoglobina.
 Es una sustitución de Glu por Val, lo que da origen a la
Hemoglobina S (HbS).
 HbS en su conformación “deoxi” polimeriza con otras
HbS, lo que lleva a una formación fibrilar y precipitación
de estos complejos.
 Esto induce una característica forma de hoz en los
glóbulos rojos y solo los homocigotos para para HbS
desarrollan la enfermedad.
Niveles estructurales de las
proteínas
 Estructura primaria: Corresponde a la estructura
covalente, lo cual incluye la secuencia de aminoácidos y
la posición de los puentes disulfuro.
 Estructura secundaria: Se refiere al empaquetamiento
local del esqueleto polipeptídico en forma de hélice, hoja
plegada u otra conformación al azar.
 Estructura terciaria: Corresponde a la estructura
tridimensional del polipéptido.
 Estructura cuaternaria: Se refiere a la asociación no-
covalente de subunidades polipeptídicas discretas en
una proteína oligomérica.
Estructura secundaria
 La conformación de un polipéptido depende de los
ángulos rotacionales de los enlaces covalentes que
contribuyen a la cadena.
 Los enlaces phi (φ) y psi (ψ) entre el N y el carbono α, y
entre este y el carbonilo respectivamente, contribuyen a
estos ángulos rotacionales.
 Una estructura secundaria regular se forma en
segmentos donde todos los ángulos φ y ψ son iguales.
 Las conformaciones α-hélice y hoja-β son las
estructuras secundarias termodinámicamente más
estables.
Polypeptide chain showing
φ, ψ, and peptide bonds for
residue Ri within a
polypeptide chain.
Estructura α-hélice
 Es la conformación mas común en las proteínas.
 El esqueleto polipeptídico gira en forma dextrógira sobre
un eje imaginario.
 Los grupos R de los aminoácidos se orientan fuera de
este esqueleto.
 Se estabiliza por puentes de H internos entre el H unido
al N del enlace peptídico y el O del carbonilo
posicionado 4 residuos más adelante en la cadena.
 Esto genera un giro cada 3.6 residuos de aminoácidos
α-hélice
Factores que afectan la estabilidad
de la α-hélice
 Repulsión electroestática entre residuos
sucesivos de aminoácidos con grupos R cargados
(Glu, Asp, Lys, Arg).
 Residuos adyacentes con grupos R voluminosos

 Presencia de residuos de prolina o glicina

 Interacción entre los aminoácidos de los extremos


de la cadena y el dipolo eléctrico inherente a la α-
hélice.
Estructura β
 Una cadena polipeptídica en una estructura β se
encuentra unida mediante puentes de H a otra región
polipeptídica alineada en forma paralela o antiparalela.
 Los grupos R se proyectan sobre o bajo el plano de la
estructura β.
 Las cadenas polipeptídicas están extendidas en zigzag y
se posicionan lado por lado, formando una estructura
similar a hojas de papel plegadas.
 Para que dos o más hojas β están cercanas, los grupos
R deben ser relativamente pequeños.
 Fibroína de la seda y de la telaraña poseen un alto
contenido en Gly y Ala.
Estructura terciaria
 Este tipo de estructura define la posición de cada átomo
del polipéptido en el espacio.
 Aminoácidos ubicados muy lejanos entre sí dentro de
una cadena polipeptídica y que pueden pertenecer a
diferentes estructuras secundarias pueden interaccionar
en la estructura terciaria.
 Un polipéptido de mayor tamaño generalmente presenta
diferentes regiones semi-independientes denominadas
dominios.
 En proteínas multifuncionales cada dominio puede
realizar una tarea diferente.
Tertiary structure of sperm whale myoglobin
Estructura cuaternaria
 Algunas proteínas contienen dos o más cadenas
polipeptídicas, las cuales pueden ser idénticas o
completamente diferentes.
 El arreglo de estas subunidades en complejos
tridimensionales constituye una estructura
cuaternaria.
 Las subunidades en este tipo de arreglo se
encuentran por lo general unidas de forma no
covalente.
The quaternary structure of
deoxyhemoglobin
Proteínas fibrosas
 Contienengrandes regiones de estructura
secundaria regular y forma cilíndrica
 Poseenbaja solubilidad en agua y un rol
mas estructural que dinámico.
 Otorgan fuerza y/o flexibilidad a las
estructuras que forman.
 Colágeno,elastina, keratina y
tropomiosina son todas proteínas fibrosas.
α-queratina
 Presente en la piel, pelo y uñas.
 Posee estructura cuaternaria
 Está estabilizada por puentes disulfuro.
 Posee repeticiones en tándem de siete residuos
aminoacídicos.
 Estas repeticiones generan dos vueltas de hélice que
exponen una cara hidrofóbica que a su vez interactúa
con residuos hidrofóbicos de otras queratinas
 Forman una estructura superenrollada de dos o tres
cadenas polipeptídicas.
Structure of hair
Colágeno
• Compone el tejido conectivo como tendones, cartílago,
matriz orgánica de huesos y córnea del ojo.
• La hélice del colágeno es diferente de la α-hélice, es
levógira, posee 3 residuos por cada giro y se denomina
cadena α.
• Aminoácidos presentes en el colágeno: Glicina 35%,
Alanina 11%, Prolina 21%
• La gelatina deriva del colágeno y tiene poco valor
nutricional porque no contiene aa esenciales para la dieta
humana.
• La fibrilla del colágeno consiste de tres cadenas
enrolladas de forma dextrógira que se pueden asociar entre
si de más de 30 formas distintas en mamíferos.
Structure of
collagen fibrils
Major Collagen Molecules
Enfermedades de la síntesis de
colágeno
 El colágeno es la proteínas más abundante de los
tejidos, por ende muchos órganos dependen de él.
 La síntesis de colágeno anormal induce alteraciones a
nivel cardiaco, óseo, cutáneo, articulaciones y visión.
 Síndrome de Ehlers-Danlos se presenta con una
osteogénesis imperfecta y escorbuto.
 El síndrome se produce por mutación en los genes que
codifican colágeno, o modificacióones post-
traduccionales alteradas de este, mediadas tal vez por
ausencia de los cofactores enzimáticos necesarios para
estas modificaciones.
Proteínas globulares
•Presentan diversidad estructural y funcional.
•Proteínas de este tipo son: enzimas, proteínas de transporte,
proteínas motoras, proteínas reguladoras, inmunoglobulinas,
entre otras.
Lipoproteínas
 Complejos de proteínas y lípidos que se encuentran en el
plasma.
 Los cambios en su concentraciones relativas son predictivos
de aterosclerosis.
 Su función es transportar lípidos entre los tejidos y participar
en el metabolismo lipídico.
 En humanos se distinguen 5 tipos: Quilomicrones, VLDL, IDL,
LDL y HDL, las cuales se distinguen por su densidad.
 El componente proteico se denomina apolipoproteína y cada
lipoproteína posee una composición característica de estas,
las cuales varían entre 6 kDa (ApoC-1) a 550 kDa (ApoB-
100).
Lipoprotein
Hiperlipidemias
 Corresponden a desórdenes en las tasas de síntesis o clearance
de lipoproteínas de la sangre.
 Se detectan de acuerdo al nivel plasmático de triacilgliceroles y
colesterol, y se clasifican de acuerdo al tipo de lipoproteína
elevada.
 Tipo I: Se debe a la acumulación de quilomicrones.
 Tipo II: Caracterizada por niveles elevados de LDL.
 Tipo III: Debida a anormalidades de ApoE.
 Tipo IV: Niveles de VLDL aumentados, generalmente debido a
obesidad, abuso de alcohol o diabetes.
 Tipo V: Asociada con altos niveles de quilomicrones y
pancreatitis
Hipolipoproteinemias
 La abetalipoproteinemia se caracteriza por ausencia de
quilomicrones, VLDLs y LDLs debido a la incapacidad de
sintetizar ApoB-100 y ApoB-48.
 Hay acumulación de lípidos en las células del intestino
delgado, mal absorción de grasas, acantocitosis y
retardo mental.
 La enfermedad de Tangier es autosómica recesiva en la
cual el nivel de HDL es 1-5% del valor normal.
 Acumulan colesterol pudiendo desarrollar
hepatomegalia.
Glicoproteínas
 Frecuentes en la membrana plasmática, matriz extracelular y
plasma sanguíneo.
 Proveen información para la identificación entre células y
distintos ligandos.
 Otorgan los determinantes antigénicos de los grupos
sanguíneos sobre los eritrocitos.
 El contenido puede variar de un 4% en IgG a 82% en
glicoproteínas gástricas.
 Los residuos pueden unirse a lo largo de toda una cadena
polipetídica o estar concentrados en un domunio particular.
 Los enlaces covalentes mas frecuentes son N-glicosídico y
O-glicosídico.
Hemoglobina glicosilada
 HbA1c se forma no-enzimáticamente en los glóbulos
rojos uniendo glucosa con el NH2-terminal de la cadena
β de la hemoglobina.
 La concentración de HbA1c depende de la concentración
de glucosa en la sangre y la duración de la
hiperglicemia.
 Durante una hiperglicemia prolongada HbA1c puede
llegar al 12% o más de la hemoglobina total.
 Pacientes con diabetes mellitus tienen niveles elevados
de glucosa sanguínea y por ende de HbA1c.
Priones y encefalopatías
espongiformes
 Los priones son proteínas que actúan como agentes
infecciosos en ausencia de DNA o RNA.
 Enfermedad de Creutzfeldt-Jacob es la más común de
las enfermedades priónicas.
 La enfermedad puede generarse por mutación
heredada, espontánea o un proceso infeccioso.
 La proteína normal PrPc cambia a una conformación
tóxica PrPSc por una mutación de lisina a prolina.
 PrPSc polimeriza en fibras amiloides insolubles lo cual
causa los efectos neurotóxicos.
The Prion Diseases
A stained section of the
cerebral cortex from a
patient with Creutzfeldt-
Jacob disease shows
spongiform degeneration.
Cromatografía
Cromatografía de
afinidad
Electrophoresis

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