AMINOACIDOS

ASPECTOS GENERALES DE LOS AMINOCIDOS

Desde el punto de vista qumico, los aminocidos (AA) son cidos orgnicos con un grupo amino en posicin alfa. Segn esta definicin, los cuatro sustituyentes del carbono alfa (C) en un aminocido son: el grupo carboxilo un grupo amino un tomo de hidrgeno una cadena lateral R, que es caracterstica de cada AA

Aminocidos
Grupo amino (protonado)

Grupo carboxilo (disociado)

COO H 3N
Cadena lateral

C H R
Carbono a

CLASIFICACIN DE LOS AMINOCIDOS

Aunque la mayora de los AA presentes en la Naturaleza se encuentran formando parte de las protenas, hay algunos que pueden desempear otras funciones. Hay, por tanto, dos grupos de AA:

aminocidos proteicos aminocidos no proteicos

AMINOCIDOS PROTEICOS
Los AA proteicos se dividen, a su vez, en dos grupos:

amincidos codificables o universales, que permanecen como tal en las protenas

amincidos modificados o particulares, que son el resultado de diversas modificaciones qumicas posteriores a la sntesis de protenas

AMINOCIDOS PROTEICOS CODIFICABLES Los AA proteicos codificables son 20: 1. Alanina (Ala, A) 2. Cistena (Cys, C) 3. Asprtico (Asp, D) 4. Glutmico (Glu, E) 5. Fenilalanina (Phe, F) 6. Glicina (Gly, G) 7. Histidina (His, H) 8. Isoleucina (Ile, I) 9. Lisina (Lys, K) 10. Leucina (Leu, L) 11. Metionina (Met, M) 12. Asparragina (Asn, N) 13. Prolina (Pro, P) 14. Glutamina (Gln, Q) 15. Arginina (Arg, R) 16. Serina (Ser, S) 17. Treonina (Thr, T) 18. Valina (Val, V) 19. Triptfano (Trp, W) 20. Tirosina (Tyr, Y)

De estos 20 AA, la mitad pueden ser sintetizados por el hombre, pero el resto no, y por lo tanto deben ser suministrados en la dieta: son los AA esenciales. Son AA esenciales: Val, Leu, Ile, Phe, Trp, Tyr, Thr, Cis, Met y Lys. Adems, en recin nacidos el AA His es esencial porque su organismo todava no ha madurado lo suficiente como para poder sintetizarlo.

Los AA proteicos se pueden clasificar en funcin de:

la naturaleza y propiedades de la cadena lateral R

la polaridad de la cadena lateral R

CLASIFICACIN DE LOS AMINOCIDOS EN FUNCIN DE LA NATURALEZA DE SU CADENA LATERAL

Segn este criterio, se distinguen los siguientes grupos: 1.- ALIFTICOS NEUTROS CON CADENA NO POLAR: En ellos la cadena lateral es un hidrocarburo aliftico.

Pertenecen a este grupo: G, A, V, L e I. Glicina, Gly, G Alanina, Ala, A Valina, Val, V Leucina, Leu, L Isoleucina, Ile, I

ALIFTICOS NEUTROS CON CADENA NO POLAR

-

COO H 3N
+

COO H 3N
+

COOH 3N + C H CH H 3C CH3

C H H

C H CH3

Glicina Gly, G

Alanina Ala, A

Valina Val, V

ALIFTICOS NEUTROS CON CADENA NO POLAR

COOH 3N + C H CH2 CH H 3C CH3

Leucina Leu, L

COOH 3N + C H CH H 3C CH2 CH3

Isoleucina Ile, I

CARACTERISTICAS
Fundamentalmente es la hidrofobicidad de la cadena lateral (con excepcin de G) Suelen ocupar el interior de las protenas globulares, donde contribuyen a la estructura global de la protena debido al efecto hidrofbico (micela proteica) Reactividad qumica muy escasa

2.- ALIFTICOS NEUTROS CON CADENA POLAR NO IONIZABLE (HIDROXIMINOACIDOS): Poseen un grupo alcohlico en su cadena lateral. Son la T y S.

Treonina, Thr, T Serina, Ser, S

COOH 3N
+

C H CH2OH

Serina Ser, S

COOH 3N + C H CH3 H C OH

Treonina Thr, T

Hidroxiaminocidos

Hidroxiaminocidos
El grupo -OH de la serina es fundamental en el centro activo de muchas enzimas (serin proteinasas, p.e.) Forma enlaces glicosdicos con oligosacridos en ciertas glicoprotenas El grupo -OH tanto de S como de T es susceptible de fosforilacin: importante modificacin postraduccional que regula la actividad de muchas protenas

3.- NEUTROS AROMTICOS: La cadena lateral es un grupo aromtico: benceno en el caso de la F, fenol en el caso de la Y e indol en el caso del W. Estos AA, adems de formar parte de las protenas son precursores de otras biomolculas de inters: hormonas tiroideas, pigmentos o neurotransmisores.

Fenilalanina, Phe, F Tirosina, Tyr, Y Triptfano, Trp, W

COO-

COOH 3N
+

COOH3 N+ C H CH2

H 3N +

C H CH2

C H CH2

Fenilalanina Phe, F
OH

Tirosina Tyr, Y
NH

Triptfano Trp, W

Aminocidos Neutros Aromticos

Aminocidos Neutros aromticos

La presencia de sistemas aromticos hace que absorban luz UV en torno a 280 nm; la absorcin UV de las protenas se debe a su contenido en estos aminocidos Fenilalanina y Triptfano son hidrofbicos

4.- AMINOCIDOS CON AZUFRE o TIOAMINOCIDOS: Contienen azufre. Son Cistena y Metionina .

Tioaminocidos
COOH 3N + C SH H CH2

Cistena Cys, C

COOH 3N + C H CH2 CH2 S CH3

Metionina Met, M

Tioaminocidos

Importante papel estructural de la cistena por la posibilidad de formar enlaces disulfuro con otro residuo de cistena La cistena participa en el centro activo de muchas enzimas La metionina es el aminocido iniciador de la sntesis de protenas (codon AUG)

5.- AMINOACIDOS ACIDOS (Dicarboxlicos) Y SUS AMIDAS: Son el cido asprtico (D) y el cido glutmico (E).

Asprtico, Asp, D Glutmico, Glu, E

Sus amidas correspondientes son la asparragina (N) y la glutamina (Q).

Asparragina, Asn, N Glutamina, Gln, Q

Aminocidos dicarboxlicos y amidas

COOH 3N + C H CH2 COOH 3N + COOC H CH2 CONH2

COOC H CH2 CH2 COOH 3N+

COOC H CH2 CH2 CONH2

H 3N +

c.Asprtico Asp, P NE

Asparragina Asn, N NE

c.Glutmico Glu, E NE

Glutamina Gln, Q NE

Aminocidos dicarboxlicos y sus amidas

Todos ellos son importantsimos intermediarios en el metabolismo nitrogenado, sobre todo E y Q

Forman parte del centro activo de las glicosidasas y de las serin enzimas (trada SHD)
Proveen a la protena de superficies aninicas que sirven para fijar cationes (p.e., Ca++)

6.- AMINOACIDOS BSICOS: La cadena lateral contiene grupos bsicos. El grupo bsico puede ser un grupo amino (K), un grupo guanidino (R) o un grupo imidazol (H).

Lisina, Lys, K Arginina, Arg, R Histidina, His, H

COOH 3N + C H CH2 CH2 CH2 CH2 NH3

+

COOH 3 N+ C H CH2 CH2 CH2 NH

+

COOH 3N + C H CH2 NH+ HN

Lisina Lys, K
H2 N C

Arginina Arg, R

NH2

Histidina His, H

Aminocidos dibsicos

Aminocidos dibsicos
Lisina sirve para formar intermediarios covalentes en catlisis enzimtica (bases de Schiff) Lisina es el aminocido que une determinadas coenzimas a la estructura de la protena

Arginina es un importante intermediario en el ciclo de la urea

Histidina forma parte del centro activo de muchas enzimas, debido al carcter nuclefilo del imidazol Histidina contribuye al tamponamiento de los medios biolgicos por tener un pKa cercano al pH intracelular

7.- IMINOCIDOS: Tienen el grupo a-amino sustitudo por la propia cadena lateral, formando un anillo pirrolidnico. Es el caso de la P.

Aminas secundarias (Iminocidos)

COO NH2
+

Prolina Pro, P NE

Constituye una excepcin el AA prolina, con un anillo pirrolidnico, que puede considerarse como un -aminocido que est Nsustitudo por su propia cadena lateral

Prolina
Importante papel estructural: su presencia dificulta la formacin de estructura secundaria

Como tal o modificado por hidroxilacin (4-hidroxiprolina) es muy abundante en el colgeno

CLASIFICACIN DE AMINOCIDOS SEGN LA FUNCIN DE LA POLARIDAD DE SU CADENA LATERAL

Aminocidos apolares o hidrofbicos: - A, V, L, I, F, W, M, P Aminocidos polares sin carga elctrica: - G, Y, S, T, C, N, Q Aminocidos polares con carga elctrica: - Aninicos (-): D, E - Catinicos (+): K, R, H

Isomros pticos

 En

todos los AA proteicos, excepto en la glicina (Gly), el carbono a es asimtrico y por lo tanto, son pticamente activos. Esto indica que existen dos enantimeros (ismeros pticos), uno de la serie D y otro de la serie L. Los AA proteicos son invariablemente de la serie L.

Aminocidos: estereoisomera

COOH H 2N C H R

CHO HO C H CH2OH

L-Alanina

L-Gliceraldehido

Aminocidos: estereoisomera

COO+

COOH C NH3+ CH3

H 3N C H CH3

L-Alanina

D-Alanina

COO
+

COOH 3N C H H C CH3 CH2 CH3

H3 N C H H C OH CH3

L-Treonina

L-Isoleucina

PROPIEDADES DE LOS AMINOACIDOS

La cistena (C) tiene gran importancia estructural en las protenas porque puede reaccionar con el grupo SH de otra C para formar un puente disulfuro (-S-S-), permitiendo el plegamiento de la protena. Por este motivo, en algunos hidrolizados proteicos se obtiene el AA cistina, que est formado por dos cistenas unidas por un puente disulfuro.

H N

O HC SH C

H N HC SH

O C

CH2

CH2

O C C CH2 S S CH2 C H N

N H C O

COO+

H 3N C H CH2 SH

Cistena

COO+

COOH3N CH

H3N CH

CH2 S S CH2

Cistina

PROPIEDADES DE LOS AMINOCIDOS

Los AA son excelentes amortiguadores, gracias a la capacidad de disociacin del grupo carboxilo, del grupo amino y de otros grupos ionizables de sus cadenas laterales (carboxilo, amino, imidazol, fenol, guanidino, etc).

Equilibrios de ionizacin de los grupos ionizables de un AA

Valores de pKa de los aminocidos

I
COOH H3N+ C H CH3
H 3N +

II
COOC H CH3

III
COOH 2N C H CH3

Titulacin de aminocido neutro

14

12

III
10

pH
6

II
4

0 0 1

I
2

Base aadida (uu. arbitrarias)

I
COOH H3N+ C H CH2 COOH

II
COOH 3N + C H CH2 COOH H 3N +

III
COOC H CH2 COO-

IV
COOH 2N C H CH2 COO-

Titulacin de aminocido dicarboxlico

14

12

IV
10

pH

III
6 4

II I

0 0 1 2 3

Base aadida (uu. arbitrarias)

Titulacin de aminocido dibsico

14

IV
12

10

III

pH
6

II

0 0 1 2

I
3

Base aadida (uu. arbitrarias)

I
COOH H3N+ C H (CH2)4 NH3+

II
COOH 3 N+ C H (CH2)4 NH3+

III
COOH 2N C H (CH2)4 NH3+

IV
COOH 2N C H (CH2)4 NH2

El comportamiento cido-base de los AA es el que va a determinar las propiedades electrolticas de las protenas, y de ellas dependen, en gran medida, sus propiedades biolgicas. En el modelo de interaccin protena-ligando, la carga elctrica de una y otro juegan un papel fundamental. Por este motivo, la funcin de las protenas es extraordinariamente sensible al pH: A pH bajo, la mayor parte de los grupos disociables estarn protonados, y por lo tanto habr un gran nmero de cargas positivas en la protena

A pH elevado, los grupos disociables no estarn protonados, con lo cual habr mayor nmero de cargas negativas

Los grupos cido-base dbiles presentan una capacidad tamponadora mxima en la zona prxima al pKa. Hay que destacar el hecho de que estos valores de pKa calculados para los AA en disolucin pueden verse ligeramente modificados en el entorno proteico. Se observa que el nico grupo lateral con un pKa prximo al pH fisiolgico es la cadena lateral de la histidina. Por ello, las protenas ricas en este AA se comportarn como excelentes amortiguadores fisiolgicos.

 Cambios

en el pH se traducen en cambios en el nmero de cargas de la protena, y estos cambios pueden inhibir la interaccin de la protena con un ligando determinado. Por este motivo, muchas protenas (enzimas, sobre todo) slo pueden funcionar en un margen relativamente estrecho de pH. Aqu radica la importancia del mantenimiento de valores constantes de pH en el medio interno del organismo

AMINOCIDOS PROTEICOS MODIFICADOS

Una vez que los AA codificables han sido incorporados a las protenas, pueden sufrir ciertas transformaciones que dan lugar a los AA modificados o particulares. Entre las modificaciones ms frecuentes destacan: HIDROXILACIN: Ejemplos tpicos son la 4-hidroxiprolina o la 5-hidroxilisina, que se encuentran en proporcin importante en el colgeno. Estos AA se incorporan a la protena como P o como K, y son posteriormente hidroxilados. CARBOXILACIN: El E, por carboxilacin post-sinttica se convierte en cido g-carboxiglutmico.

4-hidroxiprolina

5-hidroxilisina

- carboxiglutmico

Reacciones Quimicas

ADICIN DE IODO: En la tiroglobulina (una protena del tiroides), la Tirosina sufre diversas reacciones de iodacin y condensacin que originan AA como la monoiodotirosina, diiodotirosina, la triiodotirosina o la liotirosina.

CONDENSACIN: La cistina es el resultado de la unin de dos C por medio de un puente disulfuro (-SS-).

COO+

H 3N C H CH2 SH

Cistena

COO+

COOH3N CH

H3N CH

CH2 S S CH2

Cistina

AMINOCIDOS NO PROTEICOS
Se conocen ms de un centenar, sobre todo en plantas superiores, aunque su funcin no siempre es conocida. Se pueden dividir en tres grupos:

1.- D-AMINOCIDOS: La D-Ala y el D-Glu forman parte del peptidoglicano de la pared celular de las bacterias. La gramicidina S es un pptido con accin antibitica que contiene DPhe. En ciertos pptidos opioides de anfibios y reptiles tambin aparecen D-aminocidos.DAlaD-GluD-Phe

2.- -AMINOCIDOS NO PROTEICOS:

La L-ornitina y la L-citrulina son importantes intermediarios en el metabolismo de la eliminacin del nitrgeno y la creatina (un derivado de la G) juega un papel importante como reserva de energa metablica. Tambin pertenecen a este grupo la homoserina y la homocistena.

Aminocidos no proteicos: intermediarios metablicos

COO+

COO+

COO+

COO+

H3N C H CH2 CH2 CH2 NH3+

H3N C H CH2 CH2 CH2 NH

H3N C H CH2 CH2 SH

H3N C H CH2 CH2OH

O C NH2

Homocistena

Homoserina

Ornitina

Citrulina

Aminocidos no proteicos: DOPA

COO+

H 3N C H CH2

Catecolaminas

Hormonas tiroideas
HO OH

L-DOPA (dihidroxifenilalanina)

Melanina

w-Aminocidos

COOCH2 CH2 NH3

+

COOCH2 CH2 CH2 NH3+

GABA g-Aminobutirato

b-Alanina

Modificaciones postraduccionales, 1

COOH HO C H2C NH2+ CH2 HC COO+

H3 N C H CH2 CH2 H C OH CH2 NH3+

+

COOH3N C H CH2 HC COOCOO-

4-hidroxiprolina

4-carboxiglutmico
5-hidroxilisina

SYSMEHFRWGKPV a-MSH (hormona estimulante de los melanocitos) SYSMEHFRWGKPVGKKRRPVKVYPDAGEDQSAEAFPLEF ACTH (Hormona corticotropa)

CYIQNCPLG

Oxitocina

CYFQNCPRG
CYFQNCPKG

Arginin-Vasopresina
Lisin-Vasopresina

Hormonas peptdicas

TRH (Hormona liberadora de tirotropina)

NH2 O O NH NH O N NH
Piroglutamil-histidil-prolinamida

CO N

CH2

ECA
DRVYHPFHL Angiotensina I HL

DRVYHPF
Angiotensina II

RPPGFSPFR KRPPGFSPFR

Bradiquinina Kalidina

Pptidos vasoactivos