IBt/UNAM

Acidos Nucleicos (bioqumica y biofsica) Nomenclatura. Reactividad del esqueleto. Desnaturalizacin. Dao y reparacin. Enzimologa bsica de Acidos Nucleicos. Secuenciacin y sntesis de Acidos Nucleicos.

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Acidos Nuclicos (estructuras)

Papel moderno de DNA y RNA. Fuerzas que intervienen. Flexibilidad y polimorfismo del DNA. Topologa. Acidos Nuclicos y Genomas.

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Acidos Nucleicos
Bioqumica y Biofsica

Acidos Nucleicos (bioqumica y biofsica)

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Nomenclatura. Notacin. Tipos de bases. RNA vs. DNA

Acidos Nucleicos (Seccin Bioqumica)

Acidos Nucleicos (bioqumica y biofsica)

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Tautomera Bases Raras

Acidos Nucleicos (Seccin Bioqumica)

Acidos Nucleicos (bioqumica y biofsica)

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Reactividad del esqueleto.

H+, OH- (RNA vs. DNA).

Fragilidad mecnica y sus implicaciones.

Acidos Nucleicos (Seccin Bioqumica)

Acidos Nucleicos (bioqumica y biofsica)

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Reactividad del esqueleto. Despurinacin. Metilacin. Desaminacin. Implicaciones de sustitucin en anillo en la reactividad del esqueleto.

Acidos Nucleicos (Seccin Bioqumica)

Acidos Nucleicos (bioqumica y biofsica)

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Desnaturalizacin. Tm (Composicin de bases, efecto de sal).

Acidos Nucleicos (Seccin Bioqumica)

Acidos Nucleicos (bioqumica y biofsica)

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Desnaturalizacin. UV. Hipercromicidad

Acidos Nucleicos (Seccin Bioqumica)

Acidos Nucleicos (bioqumica y biofsica)

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Hibridacin. Fenmeno notable. Utilizacin.

PNA

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Hibridacin multiple en chips

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Secuenciacin y sntesis de Acidos Nucleicos.

Sntesis: Problema bsico resuelto (fase slida, grupos protectores, automatizacin. Dinmica de la sntesis comercial). DNA vs. RNA. Secuenciacin: Mtodos originales. Mtodo actual. Mtodos futuros.

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Sntesis Qumica de DNA

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Secuenciacin Enzimtica
Estado del arte: electroforesis capilar

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Desarrollos futuros

Degradacin enzimtica (procesiva) de moleculas individuales. Depende de la deteccin de una sola molcula
Deteccin electroqumica (canales en membranas) del paso de una sola molcula.

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Dao y reparacin. Enzimologa importante. Motor de la evolucin.

Acidos Nucleicos (Seccin Bioqumica)

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Enzimologa bsica de Acidos Nucleicos.

Nucleasas (inespecficas, restriccin, dependientes de estructura o estado). Nick. Gap. Fosfatasas, cinasas. Ligasas Metilasas.
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Papel moderno de DNA y RNA. (Papel primitivo. Por qu la pregunta?) Estructura clsica del DNA. (Cmo sabemos que es as? Watson y Crick fu un modelo satisfactorio.)
Medidas. Complementaria. Antiparalela. Implicaciones de la estructura propuesta.
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Libertad Conformacional

Acidos Nucleicos (Seccin Bioqumica)

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Estructura de Acidos Nuclicos: Fuerzas que intervienen.

(Sern las mismas que en protenas?). Hidrofobicidad y apilamiento (stacking). Puentes de hidrgeno (complementaridad estrica y direccin). Implicaciones que perfilan estructuras alternativas. Fuerzas electrostticas. Realmente desestabilizan. (Pensar consecuencias)

Acidos Nucleicos (Seccin Bioqumica)

Stacking
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Acidos Nucleicos (Seccin Bioqumica)

Apareamiento de Bases
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Acidos Nucleicos (Seccin Bioqumica)

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Flexibilidad y polimorfismo del DNA.

DNA A.
DNA Z. DNA H. Bending y kinking. Polimorfismo e interaccin protena-DNA. (Contenido informacional de los surcos).

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DNA B

DNA A

Acidos Nucleicos (Seccin Bioqumica)

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DNA B

DNA A

Acidos Nucleicos (Seccin Bioqumica)

DNA Z
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Acidos Nucleicos (Seccin Bioqumica)

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Telmeros

Acidos Nucleicos (Seccin Bioqumica)

Interaccin Protena-DNA
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Acidos Nucleicos (Seccin Bioqumica)

Topologa.
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Loops. Cruciformes.

Lineal vs. circular (crculos efectivos). Superenrrollamiento.

Acidos Nucleicos (Seccin Bioqumica)

Superenrrollamiento
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Acidos Nucleicos (Seccin Bioqumica)

Superenrrollamiento
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Acidos Nucleicos (Seccin Bioqumica)

Superenrrollamiento
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Al disminuir L, se facilitan los procesos de replicacin y transcripcin.

Acidos Nucleicos (Seccin Bioqumica)

Superenrrollamiento
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Acidos Nucleicos (Seccin Bioqumica)

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Estructura de RNAs (tRNA y rRNA)

RNA de transferencia
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Acidos Nucleicos (Seccin Bioqumica)

RNA ribosomal
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Acidos Nucleicos (Seccin Bioqumica)

Acidos Nuclicos y Genomas

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Diversidad de tipos y tamaos. Avance sostenido de la ciencia genmica

Acidos Nucleicos (Seccin Bioqumica)