Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
16.10.2013
Structura primar Proteine cu structura secundar Keratina; Colagenul; Elastina Structura teriar Structura cuaternar
Proteine
Compui macromoleculari Sunt 1010 1012 tipuri de proteine n lumea vie
Clasificarea proteinelor
proteinele conjugate conin grupri adiionale (prostetice) hem (hemoglobina, mioglobina, citocromii, catalaza); coenzime provenite din vitamine (succinat dehidrogenaza, transaminazele, lactat dehidrogenaza); metale (feritina, ceruloplasmina); acizi nucleici (ribozomii, nucleozomii);
Proteine fibrilare
insolubile n ap extracelulare, cu roluri de susinere: collagen, cheratin, miozin, elastin.
transport:
- albuminele serice (transport cationi, vitamine, metabolii) -hemoglobina (transport oxigen) -transferina (transport fier)
Structura proteinelor
Organizare structural: -structura primar; -secundar; -teriar; -cuaternar
a).Structura primar
Aminoacid Legtur
peptidic
b).Structur secundar
-foaie pliat
-helix Legturi de hidrogen
c).Structura tertiar
Lasou
d).Structura cuaternar
O H3 N+ CH R1 C N H
R2 CH C O
H N
O CH C R3
pentru:
a. patologia molecular
anemia falciform rezult din nlocuirea Glu din poziia 6 a lanului al Hb cu Val
necovalente
Mioglobina i hemoglobina au fost primele proteine pentru care s-a stabilit structura tridimensional prin difracie cu raze X In 1962 Perutz i Kendrew au primit premiul Nobel pentru aceast realizare Sunt reprezentate zonele de helix i gruparea prostetic numit Hem
Cine determin realizarea structurii secundare i teriare a proteinelor ??? -axul catenei polipeptidice i cele -20 de tipuri de radicali legai la C
O H3 N
+
R2 N H CH C O
H N
O CH C R3
CH R1
structura
Structura -helix
C
lanul din L-aa se rsucete n jurul unui ax, la nivelul legturilor simple;
C
O
C C
HO
N C N C
O H
C N
HO O H
N
HH NN NN
O
N
Caracteristicile helixului
elice dreapt; distana ntre 2 aa pe vertical este 0,15 nm; pasul elicei, este de 0,54 nm i cuprinde 3,6 aa per pas; diametrul elicei este de 1,01 nm; radicalii R ai tuturor aa sunt orientai spre exteriorul -helixului
a)
b)
R R
0.54 nm 3,6 aminoacizi per tur Catena polipeptidic
R R R R
Mioglobina, protein globular, conine 75% structur Keratina, proteina fibrilar, conine aproape 100% structur
Tipuri de structuri
structur cu lanuri antiparalele
H N N R O H R O R O H N N H R O R O H N
H N
H N
H N
N O R H O R
N H O
H N
H N
H N
N R O H R O
N H R O
H2 N HOOC
Structura este n proporie de ~100% n fibroina din mtase; Structurile conin ntre 2-12 catene polipeptidice; Fiecare caten conine pn la 15 resturi aa.
Structura primar
-au un coninut ridicat de Cys
Structura secundar
dimer protofilament protofibrile microfibrile
macrofibrile
a) Dimer
b) Protofilament
c)Microfibril
Capete N-terminale
~450 A
Capete C-terminale
Protofibril
Proprietile keratinelor
Keratinele pot fi: - cu coninut ridicat n sulf hard;
- cu coninut sczut n sulf soft Legturile disulfurice pot fi rupte prin reducere cu mercaptani. Tratarea prului cu un agent oxidant restabilete legturile de sulf ntr-o conformaie nou
Colagenul.
este cea mai abundent protein fibroas
(~25% din masa proteinelor organismului uman)
Deficiena vitaminei C afecteaz hidroxilarea i, prin urmare, obinerea unui colagen normal.
Structura secundar
trei lanuri polipeptidice , fiecare formnd cte o elice cu rsucire spre stnga, se nfoar unul n jurul celuilalt
pasul elicei din lanurile este 9,3 (din cauza prolinei) pasul triplei elice este de ~28
Triplu helix
Tropocolagen
Fibrila de colagen
Fibra de colagen
microfibrilele sunt stabilizate prin legturi covalente ncruciate la care particip resturile de Lys i His
numrul legturilor ncruciate crete cu vrsta microfibrilele se dispun n mod deosebit n diverse organe
La mamifere:
19 varieti de colagen 30 lanuri , distincte genetic cel mai rspndit este colagenul de tip I [1 (I)]2 . 2(I)
Colagenul, odat format, este relativ stabil metabolic; Reinoire 6 luni piele, 2 luni muschi, 1 luna ficat Degradarea colagenului este crescut n foame i n diferite stri inflamatorii, enzime colagenaze
Elastina este cea mai important protein din esuturile care necesit
elasticitate (plmn, artere, unele ligamente elastice). masiv in aorta
nu conine:
unitatea repetitiv (Gly-X-Y) triplul helix carbohidrai
Se sintetizeaz n fibroblati sub form de tropoelastin n care cteva resturi de prolin sunt hidroxilate la hidroxiprolin
Enzima elastaza
conectnd:
proteine extracelulare (colagen, laminin)
mucopolizaharide (proteoglicani)
receptori membranari (integrine)
Structuri supersecundare
In structura proteinelor globulare se combin elemente de structur secundar -helix
-foaie pliat
secvene nerepetitive
Unitate --
Greek key
-meander
-barell
Resturile prolil, mpiedic rsucirea elicoidal a lanurilor polipeptidice Resturile glicil, confer lanurilor polipeptidice flexibilitate structuri de forma literei , formate din 6 pn la
a).Structura primar
Aminoacid Legtur
peptidic
b).Structur secundar
-foaie pliat
-helix Legturi de hidrogen
c).Structura tertiar
Lasou
d).Structura cuaternar
NH CH CO Aspartil
CH2 COO
-
NH H3N
+
(CH 2) 4
CH CO Lizil
Puni de hidrogen
ntre radicalii cu grupri: -alcoolice (din Ser, Thr) -fenolice (din Tyr) -amidice (din Gln i Asn):
NH CH CH2 OH CO Seril
H O
CH2
NH CH CO Seril
Interaciuni hidrofobe
ntre resturile aa nepolari ca Val, Leu, Ile, Phe, Ala:
NH CH CH3 CO Alanil
H3 C CH H3 C
NH CH CO Valil
Legturi disulfurice
ntre resturi de Cys
NH CH CO Cisteinil CH 2 S NH S CH 2 CH CO Cisteinil
Radicalii nepolari de la Val, Leu, Ile, Met i Phe ocup n cea mai mare parte interiorul proteinei, fiind lipsii de contactul cu apa Radicalii polari, cu sarcin electric de la Arg, His, Lys, Asp i Glu sunt de obicei localizai la suprafaa proteinei n contact cu apa. Gruprile polare nencrcate electric de la Ser, Thr, Asn, Gln i Tyr sunt de obicei la suprafaa proteinei dar se pot localiza i n interiorul moleculei.
Titina = conectina codificat de gena TTN (363 exoni) Este o protein gigant (varianta uman conine 34.350 amino acizi), Metionin-------Izoleucin responsabil de elasticitatea musculaturii striate funcioneaz ca un arc molecular it serves as an adhesion template for the assembly of contractile machinery in muscle cells
Mioglobina
protein globular se afl n muchi rezervor tisular de oxigen. conine o parte proteic numit globin i o grupare neproteic denumit hem.
Hem
75% din lanul polipeptidic formeaz -helix Lanul polipeptidic cuprinde 8 segmente elicoidale (denumite A, B, C, .H) Prolina se afl n 4 puncte de terminare a elicelor
C F G E H B
Neuroglobina
-a fost identificat n anul 2000 ca protein implicat n homeostazia celular a oxigenului -n 2003 s-a stabilit structura tridimensional 3D a neuroglobinei umane
Monomer care leag reversibil oxigen, mult mai puternic dect Hb -furnizeaz protecia creierului n condiii de hipoxie sau ischemie
Structura cuaternar
proteine oligomere, sunt alctuite din mai multe lanuri peptidice, numite protomeri
Asamblarea protomerilor, structura cuaternar, se realizeaz numai prin fore slabe necovalente Complementaritatea suprafeelor de contact asigur un grad nalt de specificitate structurilor cuaternare
Proteina
Numr protomeri
Creatin kinaza
Miozina
80
468
2
2
40
212
Lactat dehidrogenaza
150
35
4 4 8
92,5 16 18
Glutamin sintetaza
592
12
48,5
aperonii moleculari
sunt proteine care:
favorizeaz mpturirea corect a proteinelor; permit proteinelor greit mpachetate s se rearanjeze n forma lor nativ; faciliteaz transportul proteinelor prin membrane
Clivare enzimatic
Bolile prionice
Prionii sunt proteine implicate n maladii ca:
Forma neinfecioas a prionilor este prezent n creierul mamiferelor fiziologic normale, pe suprafaa neuronilor i a celulelor gliale Ea are aceiai structura primar cu proteina infecioas
Agentul infecios este, o versiune modificat a proteinei normale, care acioneaz ca template pentru transformarea proteinei normale ntr-o form patogenic.
Curs 4
23.10.2013
Hemoproteine
Mioglobina
Hemoglobina; citocromii
Proteine plasmatice
serumalbumine
globuline
Hemoproteinele
proteine conjugate (hem + parte proteic):
-hemoglobina; -mioglobina; -citocromii; -diverse oxidaze i peroxidaze
Hemul
Hem = grupare prostetic -conine Fe2+ i protoporfirina IX Protoporfirina IX = compus tetrapirolic, cu caracter aromatic, cu urmtorii substitueni: 1, 3, 5, 8 grupri CH3 (metil, M); 2, 4 grupri CH=CH2 (vinil); 6,7 grupri CH2-CH2-COOH (propionic, P)
M HC N P HC H N
V CH N CH V
N H
P M Protoporfirin IX
Mioglobina
protein globular se afl n muchi rezervor tisular de oxigen
Hem
conine o parte proteic numit globin i o grupare neproteic denumit hem. (87 prox 58 distal)
Legarea O 2 n mioglobin
leag reversibil un mol de O 2
Mb + O2 MbO2
la nivel
His proximal
N Fe N
O=O
2+
N
His distal
Metmioglobin
Mb n care se afl Fe3+ nu poate lega O2 oxigenul este nlocuit cu o molecul de ap
Curba de oxigenare a Mb
100
Saturare cu O2 (%)
Arc de hiperbol
Mb
80 60 40 20
20
40
60
Hemoglobina
protein intracelular (eritrocite) Tetrameric (are structur cuaternar) d culoarea sngelui fiecare subunitate a Hb = hem + globin, unde se leag oxigenul hem din Mb hem din Hb
Structura hemoglobinei
protein oligomer
a)
b)
Specii moleculare de Hb
Hb A1 = Hb A2 = d
Hb F = g
Hb E = e
Rolul fiziologic al Hb
Hb transport
O2 de la plmn la esuturi CO2 i protonii de la esuturi la plmn.
Hb
HbO2
Hb(O2)2
Hb(O2)3
Hb(O2)4
Mioglobin
Hemoglobin (pH=7,4)
Saturare cu O2 (%)
80 60 40 20
Tesut
Plmn
NH3
Asp 94 Arg 141 Lys 40 His 146 Asp 94 Asp 126 Asp 126 Lys 40
His 146
COONH3+
COONH3
+
Arg 141
COONH3+
COO-
Planul protoporfirinei
H2C C CH N CH H2C CH N
Fe
2+
Fe
2+
Histidina proximal (F 8)
O2
CH
Forma T
Helix F
Fe
Planul protoporfirinei
O2
-temperatura
-pH-ul -presiunea CO2 -2,3-bisfosfogliceratul
100
Saturare cu O2 (%)
pH=7,6 pH=7,4
80 60 40 20 pH=7,2
20
40
60
muchiul n contracie, P <20 torri. Muchiul genereaz acid lactic pH-ul poate ajunge de la 7,4 la 7,2.
NH2 + CO2
anhidraza carbonic
H2CO3
-
H + HCO3
Plmn
Expirare CO2+H2O CO2
AC
Snge
Muschi
Respiratie
HCO3- +H+
HCO3- +H+
AC
CO2
CO2+H2O
H2O MbO2 Hb O2 O2
HbO2
HbO2
Mb pO2=20 tori
OC H H C C O O PO32O PO3
2-
H D-2,3-bisfosfoglicerat
Structura hemoglobinei
protein oligomer
a)
b)
His 2
NH3+
NH3+
His 2
Lys 82
His 143
100
Saturare cu O2 (%)
80
Cu 2,3-BPG
60 40 20
20
40
60
100
Saturare cu O2 (%)
80 60 40 20
O2 trece de la oxihemoglobina matern la deoxihemoglobina fetal Hematii de la mam
20
40
60
Hb transport NO, vasodilatator, la celulele din pereii capilarelor tisulare favoriznd eliberarea O2
Aspecte clinice
Glicozilarea Hb A1 n diabetul zaharat
Citocromii
transport electroni
Structura citocromului c
In legtur cu Hb este corect afirmaia: A. Hb leag 4 molecule de 2,3-bisfosfoglicerat B. OxiHb i dezoxiHb au aceiai afinitate pentru protoni C. Acidoza (scderea pH-ului) micoreaz sigmoidicitatea curbei de saturare cu oxigen a Hb D. Hb transport NO la celulele din pereii capilarelor tisulare favoriznd eliberarea O2 E. Afinitatea Hb pentru oxigen scade cu creterea procentului de saturare cu oxigen a acesteia
Structura hemoglobinei
protein oligomer
a)
b)
Proteinele plasmatice
Concentraia proteinelor Linia de start plasmatice 7g/dl
g
Alb
Serumalbuminele
proteine sintetizate n ficat
Au pI = 5 La pH-ul fiziologic migreaz spre anod avnd o ncrcare negativ
Globulinele
-globulinele care cuprind: -antiproteaza (antitripsina), apolipoproteina A; -globulinele care cuprind: haptoglobina, ceruloplasmina; -globulinele care cuprind: transferina, apolipoproteina B, componentele C3 i C4 ale complementului g-globulinele care cuprind: anticorpii
Inflamaie cronic
(endocardit bacterian, tuberculoz, poliartrita cronic, colagenoze= (Proliferare plasmocite din mduv, ganglioni, splin)
Sindrom nefrotic
Cresc proteinele serice cu mas mare (2 macroglobulina, fibrinogenul, lipoproteinele i IgM) dei nu se elimin renal i au turnover rapid
Scderea concentraiei albuminelor serice duce la reducerea presiunii coloid osmotice a plasmei (apariie edeme) fapt ce stimuleaz sinteza hepatic de proteine
Curs 5
Imunoglobuline
30.10.2013
Imunoglobulinele
VL
VL Lant usor CL CL
COO-
VH Lant CH 1 greu
OOC
VH CH 1
Fab
Papaina
OHC
Fab
Zon flexibil
CHO Zon de legare a complementului
CH 2 Fc CH 3
CH 2
Punti de sulf
CH 3
OOC
COO-
Cine le produce ??? sunt elaborate de limfocite B (plasmocite) n urma unui stimul antigenic;
Limfocite
organele limfoide primare (timus i mduva hematogen).
organele limfoide secundare (splin, ganglioni limfatici, amigdale) limfocite circulante - aproximativ 25% din elementele figurante albe
Dup mecanism rspunsul imun poate fi: Umoral mediat de limfocitele B Celular mediat de limfocitele T
Antigen
Y
Limfocite B
Diferentiere proliferare
Plasmocite
Ig
(Y)
recunosc numai epitopii rezultai din procesarea antigenelor native i care au fost expui la suprafaa celulelor prezentatoare de antigen (macrofage, monocite, limfocite B, celule dendritice) n conjuncie cu moleculele MHC II (complexul major de histocompatibilitate).
Limfocitele T
-celule T killer
-celule T helper -celule T supresoare
Antigeni
antigeni = orice substan
exo- sau endogen
In ce const declanarea unui rspuns imun ??? stimularea producerii de Ac sau receptori celulari care se pot cupla specific cu Ag inductor.
Proprietile antigenelor
Imunogenitatea = Ag determin organismul s produc un rspuns;
Imunogenicitate
Antigen
Y
Limfocite B
Diferentiere proliferare
Plasmocite
Ig
(Y)
Specificitatea
determinani antigenici sau epitopi = locul specific de pe antigen la care se leag anticorpul
Antigenele pot fi: imunogene sau complete -declanaz rspuns imun -reacioneaz specific cu produsele rezultate haptene sau Ag incomplete -greutate molecular mic -reacioneaz cu Ig specifice -nu pot iniia un rspuns imun umoral tradus prin producie de anticorpi, dect cuplate cu o macromolecul purttoare.
Condiii de antigenicitate
s fie non-self s aib o greutate molecular mai mare de 10.000 dal s aib conformaie spaial stabil structura chimic s fie ct mai complex
Clase de antigene
Proteinele sunt cele mai puternic antigenice Glucidele i lipidele pot deveni antigene numai legate de proteine. Acizii nucleici sunt slab antigenici.
Structura anticorpilor
Anticorpii sunt tetrameri cu formula molecular H2L2
-dou lanuri grele identice H (heavy) -dou lanuri uoare identice L (light)
VL
VL Lant usor CL CL
COO-
VH Lant CH 1 greu
OOC
VH CH 1
Fab
Papaina
OHC
Fab
Zon flexibil
CHO Zon de legare a complementului
CH 2 Fc CH 3
CH 2
Punti de sulf
CH 3
OOC
COO-
Funciile imunoglobulinelor
recunosc Ag i se combin cu el
Ag + Ac
Ag - Ac
Clasele de anticorpi
IgG cu lanuri grele de tip g; i lanuri uoare l sau k
IgA cu lanuri grele de tip ; i lanuri uoare l sau k IgM cu lanuri grele de tip m; i lanuri uoare l sau k IgD cu lanuri grele de tip d; i lanuri uoare l sau k IgE cu lanuri grele de tip e; i lanuri uoare l sau k
Rolul anticorpilor
IgG -sunt monomeri bivaleni -75-80% din Ig organismului -traverseaz bariera placentar -IgG apar dup IgM i IgE -se afl n snge, limf, lichide interstiiale -se sintetizeaz n cantiti mari. -activeaz complementul
IgA
IgM
sunt pentameri cu cinci situsuri de legare a Ag
reprezint 3% din Ig organismului. se gsesc predominant intravascular (80%). pot traversa bariera vascular alterat, aprnd n focarele inflamatorii. nu se transmit transplacentar, dar apar n concentraii reduse n colostru i secreii. IgM intervin dup IgE, dar naintea IgG.
IgE
sunt monomeri, sunt bivalente. se mai numesc reagine. IgE sunt circulante sau fixate la suprafaa mastocitelor, avnd rol n strile de hipersensibilitate de tip anafilactic. Dup imunizare, sunt primii anticorpi care apar (ntre ziua a 7-a i a 10-a). Nu activeaz complementul.
IgD
sunt monomeri, sunt bivalente. reprezint 0,2% din totalul Ig serice. IgD se afl pe suprafaa limfocitelor B, n structura receptorilor.
n legtur cu hepatenele sunt corecte afirmaiile: A.Sunt macromolecule B.Pot funciona ca antigene complete C.Legate covalent de o macromolecul pot funciona ca determinani antigenici D.Se leag puternic de anticorpii specifici E.Nu acioneaz niciodat ca determinani antigenici
Care dintre afirmaiile de mai jos n legtur cu imunoglobulinele nu sunt corecte ? A. Legarea antigenului se face printr-un domeniu situat la capetele carboxi-terminale B. Migreaz electroforetic cu fraciunea gama a globulinelor plasmatice C. Leag antigenul prin legturi covalente D. Contine legaturi disulfurice intre lanturile de tip H E. Pot functiona ca receptori de membran ai limfocitelor B, pentru antigeni nativi
Factorul III sau factorul tisular este produs de endoteliul vascular F III + Ca2+ activeaz F VII
Calea intrinsec
Kalikrein, Kininogen
Factor XII
Factor XI
Factor IX
Factor IXa
VIIIa VIII
Factor X Factor X a
Va V
Factor X
Protrombina II
Trombin
Factor XIII
Fibrinogen I
Fibrin
Factor XIIIa
Fibrinogenul
Factorul I al coagulrii protein plasmatic hidrosolubil este precursorul fibrinei (Factorul Ia) Concentraia plasmatic: 200-400 mg/dl (2-3% din proteinemia total)
Structur
Este un hexamer (ABg) Lanurile B i g au oligozaharide legate N-glicozidic
Fibrinopeptidul A Fibrinopeptidul B
Lantul A
Lantul B Lantul g
-COO-
-NH3+ 47,5 nm
-COO-
Transformarea fibrinogen-fibrin
Fibrinogen H2 O Fibrinopeptide Monomer de fibrin Agregare
2.Legtura:
O OC CH R NH CH CH 2 CO NH CH
COO
CO
COO CH 2 CH 2 Protrombin NH CH
O OC CH O2; CO2
COO CH 2
CO OH CH 3 R OH
Protrombin O
NH
CH
CO
CH 3 R O
Trombina
proteaz care activeaz un numr mare de factori din cascada de coagulare: fibrinogen (factorul I); factorul de stabilizare a fibrinei (factorul XIII); factoru V; factorul VIII; factorul XI.
Natural
antitrombina III
proteina C este o serin proteaz plasmatic, dependent de vitamina K, activat de trombin, care transform factorii activi VIIIa i Va n forme inactive
Complexul trombin-trombomodulin:
Urokinaza Factorul tisular activator al plasminogenului Streptokinaza (o proteinaz bacterian cu activitate similar, sunt utilizate n clinic pentru dizolvarea chiagurilor formate n urma unor afeciuni cardiace).
Care dintre afirmatiile de mai jos, referitoare la fibrinogen, sunt corecte ? A. Este necesar transformrii protrombinei in trombin B. La pH fiziologic, molecula este ncrcat negativ C. Nu prezint structur cuaternar D. Are solubilitate n ap mai mic dect fibrina, ntruct are masa molecular mare E. Conine resturi de tirozin sulfatate