GENOMA HUMANO

Ms. CRUZ BRICEO MARIA

DPTO DE MORFOLOGIA HUMANA

GENOMA :
Es el conjunto completo de informacin
almacenada en el ADN de un organismo,
en particular en cada una de sus clulas
30 ,000
Funciones:
Incluye:
Protenas involucradas en el transporte de protenas
Protenas involucradas en los procesos bioqumicos
Plegamiento de Protenas
Protenas inmunolgicas
Proteans estructural
Pares de base:3x10
9
pares de bases
Genes: 30000
Cromosomas: 22 - X - Y ( 50 263Mb)
50 000 000 a 250 000 000 pb
GENOMA NUCLEAR
CROMOSOMA
TAMAO DEL ADN DE CADA CROMOSOMA (kb)
FUNCIONES DEL GENOMA NUCLEAR
ALMACENAR INFORMACION
DUPLICAR INFORMACIN PARA TRANSMITIRLO
DE GENERACIN EN GENERACIN (REPLICACIN)
EXPRESAR LA INFORMACIN (TRANSCRIPCIN Y
SINTESIS DE PROTNAS)
FILOGENIA
1982
DIFRENCIAS ENTRE LAS ESPECIES
1. Inversiones pericentricas: cromosomas 1 y 18
2. Inversiones paracentricas: 4,5,9,12,15 y 16 del hombre y
el chimpancs
3. Inversiones peri y paracentricas: cromosoma 16 del
hombre y del gorila
4. Heterocromatina constitutiva
a. Variaciones en la cantidad centromrica en la cuatro
especies, cromosomas 1,9,16,13,15,21,22
b. Diferencias en el tamao del Y
c. Presencia de otras bandas
5. Presencia banda telmericas terminales en cromosoma X
Inv. pericentrica Fusin
Inv. pericentrica
Bandas telmericas
Tamao del
cromosoma Y
C1 C2 C18 C X C Y
6. Localizacin de los organizadores nucleolares
a. Humano: 13,14,15,21,22
b. Chimpancs: 13,14,18,21,22
c. Gorila: 13, 21,22
d. Orangutn: 2p, 3p, 7q, 13,14,15 y 22

De los monos al hombre
Fusin del cromosoma 2p y 2q reduce de 24 a 23 pares de
cromosomas
SIMILITUDES (SIN CONSIDERAR LA HETEROCROMATINA)

A. Hombre y chimpancs: 13 cromosomas
3-8, 10, 11, 13, 14, 19-22 y XY
B. Hombre gorila: 9 cromosomas
3, 6, 11, 13, 19-22 y XY
C. Orangutn: 8 cromosomas
5, 6, 12, 13, 14, 19, 21 y 22


Cromosomas Comparacin con el cariotipo humano
Chimpanc Gorila orangutn
1 Ausencia de constriccin Ausencia de constriccin Ausencia de constriccin
2 Fusin telomrica Fusin telomrica Fusin telomrica
3 Similar Similar Inversin pericentrica
4 Inversin pericentrica Inversin pericentrica Inversin pericentrica
5 Inversin pericentrica Inversin pericentrica Similar
6 Similar Similar Similar
7 Similar Similar Rearreglo
8 Similar Inversin pericentrica Rearreglo
9 Ausencia de Constriccin Rearreglo Rearreglo
10 Similar Inversin pericentrica Rearreglo
11 Similar Similar Similar
12 Inversin pericentrica Inversin pericentrica Similar
13 Similar Similar Similar
14 Similar Similar Similar
15 Similar Similar Similar
16 Ausencia de constriccin Rearreglo Rearreglo
17 Inversin pericentrica Inversin pericentrica Inversin pericentrica
18 Rearreglo Rearreglo Rearreglo
19 Similar Similar Similar
20 Similar Similar Similar
21 Similar Similar Similar
22 Similar Similar Similar
X Similar Similar Similar
Y Ausencia del segmento distal Similar Similar
FUNCIONES DEL GENOMA NUCLEAR
ALMACENAR INFORMACION
DUPLICAR INFORMACIN PARA TRANSMITIRLO
DE GENERACIN EN GENERACIN (REPLICACIN)
EXPRESAR LA INFORMACIN (TRANSCRIPCIN Y
SINTESIS DE PROTNAS)
TIPOS DENOMINACION CARACTERISTICAS

CODIFICANTE Elementos Propios

Elementos
accesorios
ARNr, ARNt, ARNm

Retroposones
Transposones

NO
CODIFICANTE

Funcin estructural

Funcin reguladora


Funcin
desconocida

ADNsat centromerico
ADN Telomerico
Promotores
Intensificadores
Silenciadores
ADN intergnico


SECUENCIAS DE GENOMA NUCLEAR
SEGN SU FUNCION
A. SECUENCIAS CODIFICANTES
GENES RNA
RIBOSOMICOS rRNA
TRANSFERENCIA tRNA
NUCLEAR PEQUEO snRNA
NUCLEOLAR PEQUEO snoRNA
OTROS: MICRO-RNA miRNA

GENES ARN
miRNA
A. miRNA de C. elegans miRNA humano
B. Mi RNA reguladores antisentido
GENES ARNt
497 GENES agrupados en 49 familias
61 codones son reconocidos por 40 tRNA
Localizacin: todos cromosomas (excepto 22 y Y)
GENES QUE CODIFICAN POLIPEPTIDOS
A. Varan de tamao y contenido de exnes
4563 aa
3685 aa
B. Diversidad de organizacin intron -exon
C. Tipo de genes:
a. Genes idnticos
Genes de Histonas:
86 sec. En Cromosoma 10
2 grupos grandes en cromosoma 6

Genes Ubiquitinas
Localizacin diversa
En serie de repeticiones
En unidades monmeras
b. Genes similares en sentido funcional
c. Genes relacionados en sentido funcional
Secuencia no relacionada pero si presentan
relacin funcional
Sus productos pueden ser
Subunidades de la misma protena
Subunidades de la misma estructura
marcomolecular
Componentes de la misma va metablica
Componentes de la misma va de desarrollo
d. Genes bidireccionales o genes
superpuestos
No son comunes
Utilizan marcos de lectura en cadena de
sentido comn
Presentan organizacin gnica bidireccional

Ejm. Genes HLA
e. Genes dentro de genes
Localizados dentro de otros genes
snoRNA
Incluidos en intrones de genes grandes





Unidades policistrnicas.
f. Familia gnicas comunes
i. familia gnicas comunes: genes de histonas
ii. Familia de genes que codifican protenas con
dominios altamente conservados
Homologa notable en regiones conservadas
Homologa baja en regiones no conservadas

iii. Familia de genes que codifican productos
con secuencias conservadas cortas
Caja DEAD = asp Glu Ala Asp
Ejem. Protena que participan en el splicing
Caja WD: Triptofano - aspartato
Ejm Protenas reguladoras: divisin celular
transcripcin
Modificaciones post transcripcionales
iv. Superfamilias
-Codifican productos relacionados desde el punto de vista
funcional
Ejem. - Ig
- Globinas: y Mioglobia, neuroglobina
- Receptores acoplados a proteinas G
v. Familias gnicas organizadas en grupos
pequeos o esparcido
Familias gnicas organizadas en un grupo
aislado
Organizacin gnica tnden
rRNA
Grupo cerrado: regin de control de locus nico
Idnticos en secuencia y funcin
Globinas
Grupo compuesto: relacin fsica, pero no en
secuencia , ni en funcin
HLA factores Complemento

Familia de genes organizadas en mltiples
grupos gnicos
Ejm Globina
Histonas
Receptores olfatorios







Familia de gnicas dispersas
Surgen por
Genomas diferentes
Duplicaciones del gen o genoma
isoformas de proteinas mitocondriales y nucleares
Familia PAX
Retrotranscripcin
cDNA







g. Familias multignicas
Pseudogenes no procesado en un grupo genico
Pueden originarse por:
Duplicaciones alteran elementos codificantes o
reguladoresNo funcional
Inserciones de secuencia de ADN complementario
Transcripto sin sec. promotoras-- transcriptasa
inversa --- ADN
Inserciones de codones terminales
Ejemplo:
- globinas
- NF1
Genes truncados y fragmento de genes
internos en un grupo gnico
HLA I



HLA II
Pseudogenes no procesados en una familia
gnica dispersa
Pseudogenes procesados: Son mas frecuentes
Caracteriza por : extremo 3` con poli A (semejante ARNm)
No tiene intrones (proviene de ARNm)
Se encuentran truncados 5`(falla transcriptasa)
Ejemplos: genes B tubulina, Inmunoglobulina
Mecanismo de origen:
1. DE REPETICIN EN TANDEN
a. ADN SATLITE:
10 al 15% de secuencias repetidas del genoma.
Secuencias cientos Kb repetidas en tanden: 5 171 pb
La mayor parte se localiza en centrmeros en la regin
pericentromrica de todos los cromosomas, tiene
funcin estructural, carece de orgenes de replicacin
La menor parte de DNA Sat. est disperso por todo el
genoma, tiene funcin amortiguadora de las mutaciones.

B. SECUENCIAS DE NO CODIFICANTES
b. ADN Sat. alfoide: : centrmeros
Unidades de 171 pb longitud millones de pb
Motivo: CTTCGTTGGAAACGGGA
Fija protenas centromricas CENP-B:
Es especfico para cada cromosoma :
c. ADN : 68 pb
Cromosomas: 13-15, 21,22,9,1, Y
ADN Sat -1: 42 pb pericentromrico
ADN Sat-2: 5 pb (>cromosomas) conservado
d.ADN MINISATLITE : 10
2
- 10
3

VNRT : repeticin en tanden de nmero variables
Muy polimorficos,
a. ADN minisatelite telomrico
- Porcin terminal de telomeros:10-15 Kb
- Secuencia repetida: 5 TTAGGG 3
b. ADN minisatelite hipervariable:
- Presente en proximidades del telmero (otros lugares)
-Secuencias cortas de 9-64pb repetidas en tnden
- Secuencia comn GGGCAGGAXG, que constituye una
secuencia seal para la recombinacin general
- No transcriben, excepto MUC1 en 1p -- codifica
protena polimrfica
e. ADN MICROSATELITE: 10
4

Muy polimorfico
Unidades repetitivas son de 2,3 4 nucleotidos:(CA)n, (TG)n
Localizados por todo el genoma
Raro aparecen en secuencias codificantes excepto
trinucleotidos en ciertas alteraciones hereditarias
CTG exon 1 del FMR1 implicado en S. X frgil
CTG extremo 3 del gen de la distrofia miotnica
CAG en el gen de Huntingtina del S. Corea de Huntington
(informa una sec. poliglutamina)
Ejemplo: SNP
f. ADN TELOMRICO: 10
4

10 Kb.
TTAGGG dispuesta de 2000 a 10000 veces seguidas
Su longitud vara con la edad de la clula
Espermatozoide tiene 15 Kb
Clula somtica 1,2 Kb
Linfocitos en cultivo:
normales 47 7.7 pb menos por ao
S. Down 133 5.5 pb menos por ao

2. DNA NO CODIFICANTE REPETIDO DISPERSO
RETROPOSONES o SECUENCIAS INTERCALARES:
10 - 10
2

a. LINES: Long interspersed nuclear elements : 1- to 5-kb
L1 o L1H 6.4 Kb
Localizados en bandas G
20,000 a 40,000 Copias
Origen: ARN transcriptasa inversa ADN integra al genoma
Esta implicado como causa de mutaciones, al proveer sitios de
recombinacin anormales tanto intra como intercromosmicos
L1 cromosoma 22 transloca al X gen de Factor VIII de Coagulacin
--------- Hemofilia
Estructura general de Retrotranspososnes
encontrados en genomas eucariotas
A. Ratn: retrovirus Moloney murine leukemia
virus (MoMLV)
B. Drosophila: copia de Retrotransposon
C. Levadura: yeast retrotransposon Ty1
D. Humano. LINE
Genos retrovirales:Gag, pol, and env
ORF =marco de lectura abierto
AAA = cola poly (A)
Tringulos: direccin de repeticiones terminales
Flechas= direction de transcripcion.
(Modified from J. R. S. Fincham, Genetic Analysis: Principles, Scope
and Objectives. Blackwell, London, 1994.)
B. SINES: Short interspersed nuclear elements
Alu 150 Mb (5% del genoma humano)
Sitio de restriccin 5AGCT 3 para enzima Alu I
(Artrhrobacter lacteus)
Existen 500000 copias de secuencias de 300 pb
Localizados en las banda R
Estas secuencias se originaron por retrotranscripcin
ARN 7SL ----Transcriptasa inversaADN que se integra al genoma
ARN: partcula seal ( participa en la sntesis de protenas)

Figure 7.18. Structures of full-length Alu and LINE-1 repeats. The consensus
standard Alu dimer is shown with two similar repeats terminating in an (A)
n
/(T)
n

like sequence. They have different sizes because of the insertion of a 32 bp
element within the larger repeat. Alu monomers also exist in the human genome,
as do various truncated copies of both monomers and dimers. The consensus full-
length LINE-1 element is 6.1 kb long but most LINE-1 elements are truncated
and the average size is very much smaller. ORF1, ORF2, open reading frames 1
and 2.
Elementos repetitivos encontrados en Gen de la enzima del hgado,
la oxidasa homogentistica HGO (alcaptonuria)
Modific de B. Granadino, D. Beltrn-Valero de Bernab, J. M. Fernndez-Can, M. A. Pealva, y S. Rodrguez de Crdoba,
C. TRANSPOSONES: 10 - 10
2

Mviles, Sec. Como retrovirus. Ejm. THE humano
Categoras: Transposones de DNA/ retrotransposones

Transposones humanos de repeticiones terminales largas (RTL)

Bicatenario circular, 16569 pb (0,5% del genoma)
Presenta dos cadenas con secuencias de bases diferentes:
Cadena pesada H: rica en G Cadena ligera L: rica en C
N ADN: cientos o miles de copias por mitocondria
Posee poco ADN repetitivo, no intrones
Expuesto a radicales libres (liberados por Fosforilacin oxidativa)
Mutaciones con mayor frecuencia
Los sistemas de reparacin son menos eficientes que los del ADN
nuclear
Cdigo gentico diferente al del ncleo
Es transmitido por herencia materna
GENOMA MITOCONDRIAL
GENES MITOCONDRIALES:
37 genes: 28 en la cadena pesada
9 en la cadena ligera
24 codifican ARN: 2 ARNr,
22 ARNt

13 polipeptidos: 7 subunidades del complejo I: ND1- NAD6
1 subunidad del citocromo b
3 subbunidades citocromo oxidasa COI-COIII
2 subunidades de ATPasa: 6 y 8

8 x 4
14 x 2 60 codones
37 Genes
H : 28
L : 9
22 : ARNt
2 : ARNr
13 : polipeptidos

Genes parcialmente solapados
El saludo no es sinnimo de status es educacin