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El genoma humano y su estudio.

DEFINICIONES

Genoma: Conjunto total del material gentico hereditario presente en una clula,
tanto nuclear como extranuclear, codificante o no.
Clase de material gentico:
cido Desoxirribonucleico (ADN): la > de los organismos.
cido Ribonucleico (ARN): algunos virus.
Tipo de material gentico:
Codificante: Genes.
Codifica toda la informacin celular (metabolismo, fisiologa, morfologa,
comportamiento, embriognesis, crecimiento y desarrollo fsico y mental,
reproduccin, entre otras).

No Codificante: intergnico e intragnico.


Ubicacin del material gentico (Eucariotas):
Nuclear
Mitocondrial

El genoma humano y su estudio.


Ncleo Eucariota:
Doble membrana nuclear.
Genoma Nuclear
Ciclo celular:
Interfase:
Cromatina.Filamentoso y
disperso.
Divisin Celular:
Cromosoma.

Contiene ~ 90% del ADN.


Organizado en cromosoma,
en tamao y n variable,
segn la especie.
Magnitud del genoma:
En n de cromosomas:
Haploides: n
Diploides: 2n
En longitud:
pb (pares de bases)
nt (nucletidos)

LEPTOTENO
ZIGOTENO
PAQUITENO
DIPLOTENO
DIACINSIS

El genoma humano y su
estudio
COMPARACIN DEL GENOMA NUCLEAR Y MITOCONDRIAL
G Nuclear

G Mitocondrial

Tamao

N de Mol Dif.

Forma

N total de Mol
23 cromosomas (haploides)
46 cromosomas (diploides)

Proteinas
asociadas

N de genes

3000 Mb

16,6 Kb
24 (X,Y)

Lineal

1 Molcula
Circular

Histonas

Ninguna

<30000

37

Miles

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G Nuclear

G Mitocondrial

ADN repetitivo

Abundante

Escaso

Transcripcin

Individual

Policistrnica

Intrones

Presentes

Ausentes

ADN Codificante

1,5 %

95 %

Recombinacin

Presente

Ausente

Herencia

Mendeliana

Materna

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CONSTITUCIN
Azcares:
2-Desoxiribosa
Ribosa
cido Fosfrico:
Monofosfato
Difosfatos
Trifosfatos

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Niveles de Organizacin (Condensacin, Empaquetamiento) del ADN.

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Niveles de Organizacin (Condensacin, Empaquetamiento) del ADN.

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Niveles de Organizacin (Condensacin, Empaquetamiento) del ADN.

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Cdigo Gentico:

Cuatro Nucletidos: A, G, C y T (U).


Codn o Triplete: lectura de la
secuencia de ADN o ARN de tres en
tres nucletidos.
Combinaciones posibles de tres
nucletidos = 64 codones.
64 Codones:
61 codones: codifican para 20
aminocidos biolgicamente
importantes.
3 codones de Terminacin (paro o
sin sentido):
UAA, UAG y UGA.
No codifican para ningn
aminocidos.
Origina la finalizacin de la
sntesis de protenas.
Codn de Inicio:
AUG: Codifica nicamente
para Metionina (Met)
La sntesis, de la mayora de
las protenas, se inicia con
Metionina.

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CDIGO GENTICO:
Degenerado:
Un aminocido puede ser
codificado por mas de un codn
(codones sinnimos).
Disminuye la posibilidad de que
mutaciones puntuales puedan
provocar la incorporacin de un
aminocido distinto, y por ende,
prdida de la funcin proteica.

Universalidad:
Inicialmente se crea que exista
una correspondencia entre
codones y aminocidos,
independiente del organismo
estudiado.
Casi universal: Hay excepciones,
pocas, a la regla.
Los procariotas, eucariotas y
mitocondrias de plantas,
comparten el mismo cdigo
gentico.
Un antepasado comn.

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Heterocromatina:
Aspecto: Se tie intensa/.
Condensacin: mxima
Clasificacin:
Constitutiva:
Permanente/ condensada
en todo el ciclo celular, a
excepcin durante su
replicacin.
Ej: Centromeros y
telomeros.
Facultativa:
Puede pasar a eucromatina
bajo ciertos estmulos. Ej:
Cromos. X.
Al final de la fase G2 toda la
cromatina esta como
heterocromatina.
Transcripcionalmente inaccesible.

Eucromatina:
Aspecto: Se tie debilmente y
de manera difusa.
Condensacin: menos
condensada.
Transcripcionalmente
accesible: la molcula de ADN
es accesible a protenas
(factores de transcripcin, ADN
polimerasas, ARN polimerasas,
entre otras).
Expresin gnica.

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Clasificacin del genoma Humano
segn su organizacin:
ADN de copia nica: Secuencias
nucleotdicas (exones) presentes una vez o
muy pocas veces en el genoma.
ADN repetitivo: Secuencias nucleotdicas
(intrones) repetidas en nmero variable.

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ADN repetitivo: repeticiones de cientos a
millones de veces en el genoma.
Clasificacin:
ADN disperso:
20 % del genoma
Repeticin regular: cada 4 Kb.
Ejemplos: secuencia Alu (familia Alu), secuencia
Kpn, (familia Kpn),
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ADN satlite:
10 % del genoma
Secuencias repetidas en tandem.
Clasificacin:
ADN --satlite: unidad de repeticin de 171 pb.
Repeticiones en millones de veces en el genoma.
ADN minisatlite o VNTR: Unidad de repeticin
entre 10 y 70 pb, Repeticiones de miles de veces
en el genoma.
ADN microsatlite, o STR: unidad de repeticin 2
- 4 nucletidos. Repeticiones: cientos de veces en
el genoma.

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Homocigoto: ambos alelos de un par de cromosomas homlogos son


idnticos.
Heterocigoto: ambos alelos de un par de cromosomas homlogos son
diferentes.
Heterocigoto simple.
Heterocigoto compuesto.
Hemicigoto: El hombre por tener un (01) solo cromosoma X y un (01) cromosoma Y
es Hemicigoto para casi todos los alelos de los cromosomas X y Y, a excepcin de los
alelos localizados en las regiones pseudoautosmicas.

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Genotipo: la constitucin genmica de un organismo.
Fenotipo: conjunto de rasgos o caracteres
INTERNOS O EXTERNOS (morfolgicos,
anatmicos, fisiolgicos, bioqumicos y moleculares)
resultantes de la expresin del genotipo. El trmino
implica la interaccin entre el genotipo y el medio
ambiente.
Medio Ambiente: conjunto de factores internos y
externos al organismos que influyen sobre su
genotipo con la consiguiente expresin fenotpica.
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OMIM ntry
Statistics:

Prefix

Number of Entries in OMIM (Updated 23 July 2012) :


Autosomal
X Linked
Y Linked
Mitochondrial

Totals

* Gene description

13,241

643

48

35

13,967

+ Gene and
phenotype,
combined

142

149

# Phenotype
description,
molecular basis
known

3,240

262

28

3,534

% Phenotype
description or
locus, molecular
basis unknown

1,627

135

1,767

Other, mainly
phenotypes with
suspected
mendelian basis

1,779

125

1,906

20,029

1,170

59

65

21,323

Totals

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Mutacin:
Alteracin o cambio en la secuencia del ADN:
Genoma Nuclear o Miticondrial
Codificable (gen estructural) o no codificable (regulacin de la
expresin gnica)
Heredable (clulas germinales) o no (clulas somticas).
Principal causa de variabilidad gentica.
Importancia:
Evolucin de las especies.
Identidad gentica de un individuo.

Heredobiolgicas
Identificacin de individuos.
Pruebas forenses.
Migraciones humanas.

Diagnstico de enfermedades:
Propsito.
Dx Prenatal.

Tratamiento de enfermedades:
Cncer.
Clulas madres.

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La reaccin en cadena de
la polimerasa (PCR)
Obtencin millones de
copias de un fragmento
mediante la amplificacin
selectiva in vitro de ADN,
basada en las
propiedades de
desnaturalizacin,
renaturalizacin e
hibridacin del ADN.

Taq
polimerasa

Primers

dntp
s

Desnaturaliz
acin 95C
n ciclos

Alineacin
45C

Extensin
72C

2 nuevas copias

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Tecnologa del ADN
Recombinante:
Enzimas de Restriccin
Clonaje Molecular
Vectores de Clonacin
Plasmidos
Bacterifagos
YACs (Plsmido de gran
tamao)
Cosmidos (Plsmidos +
Fago)

ER
AGTTGTACCTCACTTGGAAAAA
TCAACATGGAGTGAACCTTTTT
AGTTGTA
TCAACAT

CCTCACTTGGAAAAA
GGAGTGAACCTTTTT

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ANEMIA FALCIFORME

A:

CCT
pro

GAG GAG
glu
glu

S:

CCT
pro

GTG
val

GAG
glu

C:

CCT
pro

AAG
lys

GAG
glu
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Diagnstico Molecular Distrofia Muscular
Duchenne/Becker

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Diagnstico Molecular Fibrosis Qustica:
F508
cN

98 pb
95 pb

cH feto cF508

Alelo Normal: 98 pb
Alelo Mutado: 95 pb

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CASO DE PATERNIDAD: D1S80

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