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AD

N
Integrantes:
Carlos Roberto Alfaro
Martnez

Estructura Fsica
Estructura Qumica
Propiedades Fisicoqumicas
Modelo A, B y Z
ADN Lineal y Circular

Dr. Sergio Arrevillaga


Domnguez

El descubrimiento de los cidos nucleicos se debe a Meischer


(1869), el cual trabajando con leucocitos y espermatozoides de
salmn, obtuvo una sustancia rica en carbono, hidrgeno, oxgeno,
nitrgeno y un porcentaje elevado de fsforo. A esta sustancia se le
llam en un principio Nuclena, por encontrarse en el ncleo.
Aos ms tarde, se fragment esta nuclena, y se separ un
componente proteico y un grupo prosttico, este ltimo, por ser
cido, se le llam cido Nucleico.
En los aos 30, Kossel comprob que tenan una estructura
bastante compleja.
En 1953, James Watson y Francis Crick, descubrieron la estructura
tridimensional de uno de estos cidos, concretamente del cido
Desoxirribonucleico (ADN).

Componentes
Estructura de soporte: La estructura de soporte de una hebra de ADN
est formada por unidades alternas de grupos fosfato y azcar
(desoxirribosa).27 El azcar en el ADN es una pentosa, concretamente,
la desoxirribosa.

cido fosfrico:
Su

frmula qumica es H3PO4. Cada nucletido puede contener uno

(monofosfato: AMP), dos (difosfato: ADP) o tres (trifosfato: ATP) grupos


de cido fosfrico, aunque como monmeros constituyentes de los
cidos nucleicos slo aparecen en forma de nuclesidos monofosfato.

Desoxirribosa:
Es un monosacrido de 5 tomos de carbono (una pentosa)
derivado de la ribosa, que forma parte de la estructura de
nucletidos del ADN. Su frmula es C5H10O4. Una de las
principales diferencias entre el ADN y el ARN es el azcar,
pues en el ARN la 2-desoxirribosa del ADN es reemplazada
por una pentosa alternativa, la ribosa.

Las

molculas de azcar se unen entre s a travs de

grupos fosfato, que forman enlaces fosfodister entre los


tomos de carbono tercero (3, tres prima) y quinto (5,
cinco prima) de dos anillos adyacentes de azcar

Bases nitrogenadas:

Las cuatro bases nitrogenadas mayoritarias que se encuentran en el ADN son la


adenina (A), la citosina (C), la guanina (G) y la timina (T). Cada una de estas cuatro
bases est unida al armazn de azcar-fosfato a travs del azcar para formar el
nucletido completo (base-azcar-fosfato).

Las bases son compuestos heterocclicos y aromticos con dos o ms tomos de


nitrgeno, y, dentro de las bases mayoritarias, se clasifican en dos grupos: las bases
pricas o purinas (adenina y guanina), derivadas de la purina y formadas por dos
anillos unidos entre s, y las bases pirimidnicas o bases pirimdicas o pirimidinas
(citosina y timina), derivadas de la pirimidina y con un solo anillo.

citosin
a

timina

guanin
a

adenin
a

PROPORCIONES DE LAS BASES NITROGENADAS: REGLAS DE CHARGAFF


Al

principio se pensaba que los cidos nucleicos eran la repeticin

montona de un tetranucletido, de forma que no tenan variabilidad


suficiente para ser la molcula biolgica que almacenara la informacin.
Sin embargo, Chargaff (1950) demostr que las proporciones de las bases
nitrogenadas eran diferentes en los distintos organismos, aunque seguan
algunas reglas. Estas reglas de Chargaff se cumplen en los organismos
cuyo material hereditario es ADN de doble hlice y son las siguientes:

Estructura
El ADN es una molcula bicatenaria, es decir, est formada
por dos cadenas dispuestas de forma antiparalela y con las
bases

nitrogenadas

enfrentadas.

En

su

estructura

tridimensional, se distinguen distintos niveles:


Estructura

primaria:

Secuencia

de

nucletidos

encadenados.
Estructura secundaria: Es una estructura en doble hlice.
Estructura terciaria: Se refiere a cmo se almacena el
ADN

en

un

espacio

reducido,

para

formar

cromosomas.
Estructura cuaternaria: formacin de cromosomas

los

Estructuras en doble hlice


El

ADN existe en muchas conformaciones. Sin embargo, en

organismos vivos slo se han observado las conformaciones


ADN-A, ADN-B y ADN-Z

De las tres conformaciones, la forma "B" es la ms comn en


las condiciones existentes en las clulas. Las dos dobles
hlices alternativas del ADN difieren en su geometra y
dimensiones.

La forma "A" es una espiral que gira hacia la derecha, ms amplia que la "B", con
una hendidura menor superficial y ms amplia, y una hendidura mayor ms
estrecha y profunda. La forma "A" ocurre en condiciones no fisiolgicas en formas
deshidratadas

de

ADN,

mientras

que

en

la

clula

puede

producirse

en

apareamientos hbridos de hebras ADN-ARN, adems de en complejos enzima-ADN.

Los

segmentos de ADN en los que las bases han sido modificadas por metilacin

pueden sufrir cambios conformacionales mayores y adoptar la forma "Z". En este


caso, las hebras giran alrededor del eje de la hlice en una espiral que gira a mano
izquierda, lo opuesto a la forma "B" ms frecuente. Estas estructuras poco
frecuentes pueden ser reconocidas por protenas especficas que se unen a ADN-Z y
posiblemente estn implicadas en la regulacin de la transcripcin.

Formas de presentacin del ADN


ADN virales
En los virus puede encontrarse

ADN de una sola cadenacomo ocurre en el M13, cuyos 6408

nucletidos forman una sola hebra circular; de forma similar ocurre en el virus X174 donde
tambin el ADN es monofibrilar y circular con 5386 nucletidos. Otros virus como los
bacterifagos (virus que infectan bacterias) o simplenmente fagos de E. colide la serie T
presentan su ADN bicatenario y lineal. El fago T4 tiene una sola molcula lineal de ADN, de
unos 166000 pb, y en vez de citosina presenta la hidroximetilcitosina y el T7 contiene 39 930
pb,cuya secuencia ha sido determinada

Plasmidos
Otra forma

de nresentacin del ADN son los plsmidos. Se trata de

molculas circulares de doble banda, que se encuentran ubicadas en el


citoplasma
procariontes

especialmente
o

de

eucariontes.

los

Estos

organismos
plsmidos

monocelulares,
tienen

su

sean

replicacin

autnoma y suelen poseer genes importantes para la clula, por ejemplo,


los plsmidos F que contiene el factor de fertilidad, los R que contienen
genes que confieren resistencia a la accin de antibiticos y los Col que
codifican toxinas que producen la muerte de otros organismos.

ADN mitocodrial
En las clulas eucariontes

existe adems el ADN mitocondrial

(ADNmt) que, como su nombre indica, se localiza en este


organulo citoplasmtico; constituye menos del 1 % del ADN
celular y se presenta como una molecula circular duplohelicoidal
que en el humano tiene 16 569 pb. A veces se presenta como
varios crculos encadenados Y,en otras con un gran crculo
cerrado con 2 molculas unidas por enlace covalente en una
forma tipo cabeza-cola.

Cromosoma bacteriano
La mayora de las bacterias presentan sus genes en una sola molcula de ADN
de doble hebra circular superenrollado. En E. coli la longitud total del crculo
es aproximadamente 1300 m, lo que es igual a la longitud de 50 dimetros
bacterianos, por tanto debe estar muy plegado,si tenemos en cuenta que la
hacteria tiene un dimetro de 1 m y una longitud de 3 m. Este ADN est
asociado con ARN y protenas,se presenta con una armazn central muy
compactada de la cual irradian de 35 a 45 asas de ADN superenrollado, lo cual
hace que el corte transversal sea slo de 2 m; sus 3 x 1O 6 pb le confieren un
peso por partcula de

2 x 109.

Cromosoma eucarionte
El ADN de las

clulas

eucariontes

fundamentalmente en el ncleo celular,

se

donde est

encuentra
unido a

protenas, formando asociaciones complejas de nucleoprotenas.


El grado de "empaquetamiento" de esas nncleoprotenas vara
sensiblemente durante el ciclo celular, mostrando la forma ms
compacta enlametafase de la mitosis y lams relajada durante la
interfase.A la forma que adopta en la interfase se le denomina
cromatina y a la que adopta en la mitosis, cromosoma

Desnaturalizacin del ADN


Cuando una solucin de ADN doble helicoidal

se calienta por encima de una temperatura


determinada, las 2 cadenas se separan y las
propiedades del ADN se alteran, este
proceso se conoce como desnaturalizacin
del ADN; de esas propiedades la ms til
para seguir el desarrollo del proceso es la
absorcin de luz ultravioleta.
Los anillos aromticos absorhen la luz
ultravioleta con menor intensidad cuando
estn apilados en la duhle hlice que cuando
estn libres en disolucin; ese aumento de
absorcin luminosa, que puede llegar a ser
hasta de 40 % en todas las longitudes de
onda,
recibe
el
nombre
de
efecto
hipercrmico.

ABSORBANCIA A 260 nm

Absorbancia a 2.600:El estado fsico de los


cidos nucleicos est relacionado con su capacidad
de absorcin de la luz ultravioleta (UV) a 2.600. El
menor grado de absorcin se produce en estado de
doble

hlice,

la

absorcin

aumenta

cuando

se

produce la desnaturalizacin pasando a estado de


hlice sencilla (efecto hipercrmico, aumento de la
absorbancia) y, por ltimo, si degradamos este ADN
de hlice sencilla a nivel de nucletidos libres, de
nuevo aumenta la absorbancia.

Solubilidad y precipitacion
En

agua si es soluble, porque presenta carga. Una es por

grupo fosfatos expuestos que se encuentran en el ADN.La


interaccin entre el agua y los grupos fosfatos forman capas
de hidratacin, ya que estos al presentar cargas pueden
interactuar con la parte polar delagua.

Al ser el ADN indisuluble en etanol ( y en todos los dems


alcoholes), este hace que el ADN precipite, El etanol
bloquea las interacciones entre el agua y el ADN,
precipitando al ultimo. Por lo general se utiliza el etanol
frio, pues a mas baja temperatura hay menor solubilidad.

Con el etanol a temperatura ambiente tambin precipita


pero el rendimiento es menor. Algunas veces sin embargo
es

adecuado

precipitar

con

etanol

temperatura

ambiente para que no precipiten otras molculas, como


es el caso de las reacciones de secuenciacin

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