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Universidad Autnoma de Baja California

Unidad Ciencias de la Salud

M.C. Evelia Escalante Gamez

ENZIMAS
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Garcia Delgadillo Karla Vanessa
Gallegos Figueroa Denni

INTRODUCCION
Enzima: Molcula de naturaleza proteica y estructural que catalizan
reacciones qumicas.
Hasta hace poco tiempo se consideraba que todas las enzimas eran
protenas, hasta que se comprob la existencia de varias molculas
de RNA catalticas (Ribozima).
La mayora de las reacciones qumicas requieren de energa inicial,
que se aporta en forma de calor.
La reaccin qumica tiene lugar cuando las molculas que chocan
poseen una cantidad mnima de Energa libre de activacin.

No todas las colisiones producen reacciones qumicas, ya que no todas las


molculas poseen la energa suficiente. Otra manera de aumentar las
colisiones es aumentando la concentracin de los reactantes.

P R O P I E DA D E S
Estado de Transicin:

Un catalizador reduce la
energa de activacin de
una reaccin.

Las enzimas realizan su trabajo a temperaturas bastante moderadas y son


bastante especificas en las reacciones que catalizan cada una de ellas.
La diferencia entre los catalizadores inorgnicos y las enzimas es su
estructura.
El sustrato se une al sitio activo
de la enzima, sin embargo no
es solo el lugar de unin.
La informacin en el sitio activo
orienta de forma ptica al
sustrato.

Cada enzima se une a un nico tipo de sustrato, debido a que ambos


tienen estructuras complementarias

Algunas enzimas requieren para sus actividades componentes no proteicos.


Los COFACTORES pueden ser iones (Mg), o molculas orgnicas complejas
(coenzimas).

Las actividades de algunas enzimas


pueden regularse, principalmente a
travs de la unin de inhibidores.

Los inhibidores se unen a la


enzima para disminuir su
actividad.

CLASIFICACION
OXIDORREDUCTASAS

TRANSFERASAS

OxidacinReduccin

Hay transferencia
de grupos de una
molcula a otra.

Ejemplos:
deshidrogenasa,
oxigenasas,
reductasas

Ejemplos: (grupos)
amino, carboxilo.
transcarboxilasas

HIDROLASAS

LIASAS

Se produce rotura de enlaces


por la adicin de agua.
Ej. : esterasas, fosfatasas,
peptidasas
Se eliminan grupos (CO2,NH3)
para formar dobles enlaces
Ej. : liasas, hidratasas, sintasas

ISOMERASAS

LIGASAS

Reordenamiento
moleculares

Formacin de enlace
entre 2 molculas de
sustrato

- Epimerasas: Inversin de
tomos de carbono asimtrico
- Mutasas: transferencia
intramolecular de grupos
funcionales

La energa para estas


reacciones la aporta la
hidrlisis del ATP.

Cintica
enzimtica
La cintica enzimtica es el estudio cuantitativo de la catlisis enzimtica.
La velocidad de una reaccin bioqumica es el cambio de la concentracin
de un reactante o producto por unidad de tiempo
Uno de los modelos mas tiles en la investigacin de las velocidades
enzimticas fue propuesto por Leonor Michaelis y Maud Menten en 1913.

CINETICA DE
MICHAELIS-MENTEN
El concepto del complejo enzima-sustrato es central para la cintica de
Michaelis-Menten.

Introdujeron una nueva constante: Km


y obtuvieron la ecuacin:

Km es la concentracin de
sustrato a la que la enzima
tiene la mitad de la
velocidad mxima

Numero DE RECAMBIO
(Kcat)

Es el numero de molculas de sustrato convertidas en producto por unidad


de tiempo por una enzima saturada de sustrato
(Et) = concentracin total de la enzima

LINEWEAVER - BURK
Reordenaron la ecuacin MichaelisMenten obteniendo su inverso

Se presentan las inversas de las


velocidades iniciales frente a las
inversas de las concentraciones
de sustrato.

Inhibicion ENZIMATICA
Los inhibidores son molculas que reducen la actividad de las enzimas
Son importantes para:
1) Son un medio importante para regular rutas metablicas
2) Numerosos tratamientos clnicos se fundamentan en la
inhibicin enzimtica
3) Ayudan a disear tcnicas que se utilizan para demostrar la
arquitectura fsica y qumica y las propiedades funcionales de
las enzimas
Se describen 3 clases de inhibidores:
1. Competitivos
2. Acompetitivos
3. No competitivos

INHIBIDORES COMPETITIVOS
Se unen de forma reversible a la enzima libre, y no al complejo ES,
formando un complejo enzima-inhibidor (EI)
Con frecuencia, el sustrato y el inhibidor compiten por el mismo lugar
de la enzima

NHIBIDORES ACOMPETITIVOS
El inhibidor solo se une al complejo ES, y no a la enzima libre
La inhibicin acompetitiva suele darse en las reacciones en las
que las enzimas unen mas de un sustrato

NHIBIDORES NO COMPETITIVO
El inhibidor se une a un lugar diferente del lugar activo
La unin del inhibidor ocasiona la modificacin de la enzima que
impide la formacin del producto

MECANISMOS CATALITICOS
Varios factores contribuyen a la catlisis enzimtica:
Los efectos de proximidad y tensin
Los efectos electroestticos
La catlisis acidobasica
La catlisis covalente

EFECTOS DE PROXIMIDAD Y TENSIN

Para ocurra una reaccin bioqumica el sustrato debe acercarse a los grupos funcionales
catalticos (grupos de las cadenas laterales que participan en un mecanismo cataltico)
dentro del lugar activo. Adems, el sustrato debe orientarse de forma precisa hacia los
grupos catalticos. Una vez situado el sustrato correctamente, un cambio de la
conformacin enzimtica puede dar lugar a un complejo enzima-sustrato tensado

EN GENERAL CUANTO MAS FUERTE PUEDE UNIR EL LUGAR ACTIVO AL


SUSTRATO MIENTRAS ESTE ESTA EN SU ESTADO DE TRANSICION, MAYOR ES LA
VELOCIDAD DE LA REACCION.

EFECTOS ELECTROSTTICOS

Debido a que el agua al unirse el sustrato est en gran medida excluido del sitio activo
la constante dielctrica local suele ser baja. La distribucin de carga en el lugar activo
relativamente anhidro puede influir sobre la reactividad qumica del sustrato.

UNA UNIN MS EFICAZ DEL SUSTRATO DISMINUYE LA ENERGA LIBRE DEL


ESTADO DE TRANSICIN, LO CUAL ACELERA LA REACCIN.

CATLISIS ACIDOBASICA

Los grupos qumicos pueden hacerse ms reactivos aadiendo o eliminando un protn.

Los lugares activos de las enzimas contienen grupos de las cadenas laterales que
actan como donadores o aceptores de protones. Estos grupos se denominan cidos
generales o bases generales.

Por ejemplo, la cadena lateral de la histidina (que se denomina grupo imidazol) con
frecuencia participa en la catlisis acidobsica concertada debido a que su intervalo de
pKa es cercano al pH fisiolgicosica. El anillo imidazol protonado puede servir como
cido general y el anillo imidazol desprotonado puede servir como base general:

HIDROLISIS DE UN ESTER

Los steres pueden hidrolizarse de varias formas:


(a) catlisis por ioo hidrxido libre, (b) catlisis por
base general y (c) catlisis por cido general

La hidrlisis del ster puede tambin ser catalizada


por un cido general .

Al unirse el oxgeno del grupo carbonjlo del ster al


protn, el tomo de carbono se hace ms positivo.
Entonces el ster se hace ms susceptible al
ataque nuclefilo por una molcula de agua

Debido a que el agua es un nuclefilo dbil, la


hidrlisis de un ster es relativamente lenta en
disolucin neutra. La hidrlisis del ster tiene lugar
mucho ms rpidamen- te si aumenta el pH

CATLISIS COVALENTE

En algunas enzimas un grupo nuclefilo de una cadena lateral forma un enlace covalente
inestable con un grupo electrfilo en el sustrato. El complejo enzima-sustrato forma
entonces el producto

Una clase de enzimas denominada serina proteasas utllizan el grupo - CH2 - OH de la


serina como nuclefiJo para hidrolizar los enlaces peptdicos.

Ej. de serina proteasas se encuentran las enzimas digestivas tripsina y quimotripsina, y


la enzima de la coagulacin de la sangre trombina

EJEMPLO:

Durante el Plimer paso, el nuclefilo ataca al grupo carbonilo. Al formarse el enlace ster,
se rompe el enlace peptdico. El intermediario aciloenzima resultante es hidrolizado por
el agua en una segunda reaccin

FUNCIN DE LOS COFACTORES EN LA


CATLISIS ENZIMTICA

Las cadenas laterales de los aminocidos del lugar activo son las
responsables principales de catalizar las transferencias de protones en las
sustituciones nuclefilas.

Para catalizar otras reacciones, las enzimas requieren cofactores no


proteicos, es decir, cationes metlicos y coenzimas.
Se presentan las propiedades estructurales y las reactividades qumicas de
cada grupo.

METALES

Los metales importantes en los seres vivos son de dos clases: metales de transicin (ej.,
Fe2+ y Cu2+) y metales alcalinos y alcalinotrreos (ej., Na+, K+, Mg2+ Y Ca2+). Debido
a sus estructuras electrnicas, los metales de transicin suelen participar en la catlisis

Varias propiedades de los metales de transicin los hacen tiles en la catlisis. Los iones
metlicos proporcionan una concentracin elevada de cargas positivas que es
especialmente til para la unin de las molculas pequeas. Debido a que los metales de
transicin actan como cidos de Lewis (aceptores de pares electrni- cos), son eficaces
electrfilos.

EJEMPLO:

cuando el cofactor z' de la anhidrasa carbnica polariza una molcula de agua, se


forma un grupo Zn2+-OH unido. El grupo OH (que acta como nuclefilo) ataca al CO2 y
lo convierte en HCO)":

COENZIMAS

son molculas que dan verstilidad a las enzimas porque aportan grupos reactivos que no
estn presentes en las cadenas laterales de sus aminocidos o porque pueden actuar
como tranporte de molculas de sustrato.

La mayora de las coenzimas derivan de las vitaminas, se dividen en dos clases:


hidrosolubles y Iiposolubles.

EJEMPLO

La alcohol deshidrogenasa cataliza


la oxidacin reversible del etanol
para for- mar acetaldehdo:

Durante esta reaccin, el NAO+


acepta un ion hidruro (un protn sin
electrones) del etanol, la molcula
de sustrato que va a sufrir la
oxidacin. Obsrvese que se eliminan de las molculas de sustrato el
equivalente a dos tomos de
hidrgeno, de forma que se
produce un H+, adems del ion
hidruro

La reduccin reversible del NAD+

La riboflavina (vitamina B2) es un componente de dos


coenzimas: mononucle- tido de flavina (FMN) y dinucle6tido
de flavina y adenina (FAD), El FMN Y el FAD actan como
grupos prostticos firmemente unidos en una clase de
enzimas denominadas flavoprotenas Estas en- zimas, que
catalizan reacciones de oxidacin-reduccin, utilizan el grupo
isoaloxa- cina del FAD o el FMN como donador o aceptor de
dos tomos de hidrgeno. La succinato deshidrogenasa es
un ejemplo destacado de flavoprotena. Cataliza la oxidacin del succinato para formar fumarato, una reaccin
importante en la producion de energa.
Las flavoprotenas son
un grupo diverso de
catalizadores, que actan
como deshidrogenasas,
oxidasas e hidroxilasas.

EFECTOS DE LA TEMPERATURA Y DEL PH


SOBRE LAS REACCIONES CATA LIZA DAS POR
LAS ENZIMAS

TEMPERATURA

Cuanto mayor es
la temperatura,
mayor es la
velocidad de
reaccin.

las enzimas son protenas que se desnaturalizan a temperaturas elevadas.

Cada enzima tiene una temperatura ptima a la que acta con su mxima
eficacia Debido a que las enzimas son protenas, los valores de temperatura
ptima dependen del pH y de la fuerza inica.

Si la temperatura se incrementa ms all de la temperatura ptima, la actividad


enzimtica desciende bruscamente.

la temperatura
ptima de la
mayora de las
enzimas del ser
humano est
prxima a los
37 oc.

PH

La concentracin de ion hidrgeno afecta a las enzimas de diversas formas. En primer


lugar, la actividad cataltica est relacionada con el estado inico del lugar activo

ejemplo, la actividad cataltica de una determinada enzima requiere la forma protonada


del grupo amino de una cadena lateral. Si el pH es lo suficientemente alcalino para que
el grupo pierda su protn, la actividad enzimtica puede deprimirse.

Los pH ptimos de las enzimas varan considerablemente. Por ejemplo, el pH ptimo de


la pepsina, una enzima proteoltica que se produce en el estmago, es aproximadamente
de 2. Para la quimotripsina, que digiere las protenas en el intesti- no delgado, el pH
ptimo es de aproximadamente 8.

Los cambios
drsticos del pH
frecuentemente
conducen a la
desnaturalizacin.

MECANISMOS DETALLADOS DE LA
CATLISIS ENZIMATICA

QUIMOTRIPSINA

La quimotripsina es una protena de 27 000 D que pertenece a las serina proteasas. Los
lugares activos de todas las serina proteasas contienen un conjunto caracterstico de
residuos de aminocido. En la guimotripsina son His 57, Asp 102 y Ser 195.

El residuo de serina del lugar activo desempea un papel especialmente importante en


los mecanismos catalticos de este grupo de enzimas.

La eliminacin del protn del grupo OH de la serina la convierte en un nuc!efilo ms


eficaz. La guimotripsina cataliza la hidrlisis de los enlaces peptdicos adyacentes a los
aminocidos aromticos.

El Paso (a) de la figura muestra el complejo


inicial enzima-sustrato. El Asp 102, la His 57 y
la Ser 195 estn alineados. Adems, el anillo
aromtico del residuo de feniJalanina del
sustrato est asentado en un bolsillo de umn
hidrfobo, y el enlace peptdico del sustrato
tiene un enlace de hidrgeno con los grupos
NH amida de la Ser 195 y la Gly 193. El
oxgeno del hidroxilo nuclefilo de la Ser 195
desencadena un ataque ouclefilo sobre el
carbono carbonilo del sustrato. El oxia- ni6n,
que se forma al moverse la carga negativa
hacia el oxgeno del carbonilo, est
estabilizado por enlaces de hidrgeno con el
NH amida de la Ser 195 y la Gly 193. El
intermediario tetradrico, que se muestra en el
Paso (b), se descompone para formar el
intermediario acil-enzima unido covalentemente
(Paso c). La His 57, ac- tuando como cido
general, se cree que facilita esta
descomposicin. En los Pasos (d) y (e), se
invierten los dos pasos previos. Con el agua
actuando como nuclefilo atacante, se forma un
intermediario tetradrico (oxianin). En el Paso
(f) (el com- plejo final enzima-producto) se ha
roto el enlace entre el oxgeno de la serina y el
carbono carbonilo. La serina vuelve a formar un
enlace de hidrgeno con la His 57.

ALCOHOL DESHIDROGENASA

Recuerde que la alcohol deshidrogena- sa, una enzima que se encuentra en la mayora
de las clulas eucariotas (p. ej., hgado de los animales, hojas de las plantas y
levaduras), cataliza la oxidacin rever- sible de un alcohol para formar un aldehdo:

En esta reaccin, en la que se eliminan dos electrones y dos protones, la coenzima NAO
acta como aceptor electrnico. El lugar activo de la alcohol deshidrogenasa contiene
dos residuos de cistena (Cys 48 y Cys 174) y un residuo de histidina (His 67), todos
ellos coordinados con un ion Zn. Tras la unin del NAO+ al lugar activo, entra el sustrato
etanol y se une al Zn2+ como anin alcoholato . El efecto electrosttico del Zn2+
estabiliza el estado de transicin.

REGULACIN ENZIMTICA

Los seres vivos han producido mecanismos sofisticados para regu lar las
rutas bioqu micas. La regulacin es esencial por varias razones:

1. Mantenimiento de un estado ordenado. La regulacin de cada ruta da


lugar a la produccin de las sustancias que se requieren para mantener la
estructura y funcin de la clula de una forma conveniente y sin desperdiciar
los recursos.

2. Conservacin de la energa. Las clulas controlan constantemente las


reacciones que generan energa, de forma que consumen los nutrientes
suficien-tes para satisfacer sus requerimientos energticos.

3. Respuesta a las variaciones ambientales. Las clulas pueden realizar


ajus- tes relativamente rpidos de las variaciones de temperatura, pH, fuerza
ini- ca y concentracin de nutrientes debido a que pueden aumentar o
disminuir las velocidades de reacciones especficas.

La regulacin de las rutas bioqumicas es compleja. Se consigue principal mente


ajustando las concentraciones y las actividades de determinadas enzimas.

El control se realiza por:

(1) control gentico


(2) modificacin covalente
(3) regulacin alostrica
(4) compartimentalizacin.

Control gentico

La sntesis de las enzimas como respuesta a las variaciones de las necesidades meta- blicas, un
proceso que se denomina induccin enzimtica, permite a las clulas responder de forma eficaz a las
variaciones del ambiente

La sntesis de determinadas enzimas tambin puede inhibirse de forma especfi- ca. En un proceso que
se denomina represin, el producto final de una ruta metabli- ca puede inhibir la sntesis de una enzima
clave de la ruta.

Modificacin covalente

Algunas enzimas se regulan por la interconversin reversible entre sus formas activa e inactiva. Estos
cambios de la funcin estn producidos por diversas modificacio- nes covaJentes. Muchas de estas
enzimas poseen residuos especficos que pueden estar fosforilados y desfosforilados.

Varias enzimas se sintetizan y almacenan en forma de precursores inactivos denominados proenzimas o


zimgenos. Los zimgenos se convierten en las en- zimas activas por la rotura irreversible de uno o
varios enlaces peptdicos

Regulacin alostrca

En cada ruta bioqumica hay una o varias enzimas cuya actividad


cataltica puede modularse en respuesta a las necesidades celulares.
Estas enzimas reguladoras nor- malmente catalizan el primer paso de la
ruta

Existen dos estrategias principales para controlar las enzimas


reguladoras: la modificacin covalente y la regulacin alostrica.

Las clulas utilizan la regulacin alostrica para responder de forma


eficaz a determinadas variaciones de las condiciones intracelulares.
Recuerde que las enzimas alostricas habitualmente estn formadas por
varios protmeros cuyas propie- dades estn afectadas por molculas
efectoras.

Los efectos alostricos pueden ser positivos o negativos. Recuerde que


las curvas de unin de las enzimas alostricas son sigmoideas. La unin
de un efector desplaza la curva hacia una actividad mayor o menor,
dependiendo de si es un activador o un inhibidor

El CTP acta como inhibidor de la acti vidad ATCasa. ste


es un ejemplo de retroinhibicin negativa, un proceso en el
que el producto de una ruta inhibe la actividad de la enzima
que marca el ritmo de la ruta

En el modelo secuencial, se supone que la protena es


flexible. La unin de un ligando a un protmero en una
protena con valias subunidades produce un cambio de
conformacin que se transmite a los protmeros adyacentes.
El modelo secuen- cial ms sofisticado (Fig. 6.24) permite
las conformaciones intermedias que se supo- ne son una
situacin ms real que las conformaciones del modelo
concertado ms sencillo. Tambin se ha observado la
cooperatividad negativa.

GRACIAS

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