BIOCHIMIE METABOLIQUE

Généralités et Energie de la cellule (cours 1)

La glycolyse (cours 2)

Le cycle du citrate ou cycle de Krebs(cours 3)

La néoglucogenèse
Le cycle des pentoses phosphates (cours 4)

Le métabolisme des lipides (cours 5)

Le métabolisme des acides aminés (cours 6)

Cycle du citrate : plaque tournante du métabolisme (cours 7)

GENERALITES SUR LE METABOLISME

1. Le métabolisme : Anabolisme et Catabolisme

1.1. Catabolisme
1.2. Anabolisme

2. L ’autotrophie et l’hétérotrophie

3. Vue d ’ensemble du métabolisme

GENERALITES SUR LE METABOLISME

1. Le métabolisme : Anabolisme et Catabolisme

1.1. Définition
GENERALITES SUR LE METABOLISME

1. Le métabolisme : Anabolisme et Catabolisme

Par définition, le métabolisme est l ’ensemble

des transformations de matière et d ’échange
d ’énergie dont l ’être vivant est le siège.

Il comporte deux phases concomitantes et

inverses, l ’anabolisme et le catabolisme.
GENERALITES SUR LE METABOLISME

1. Le métabolisme : Anabolisme et Catabolisme

1.2. Catabolisme

Ensemble de réactions biochimiques qui

extraient de molécules complexes leur énergie
(réactions dites exergoniques) et leur matière
sous forme de molécules simples .
GENERALITES SUR LE METABOLISME

1. Le métabolisme : Anabolisme et Catabolisme

1.3. Anabolisme (photosynthèse et biosynthèses)

Ensemble de réactions biochimiques qui utilisent

énergie (réaction dites endergoniques) et matière
(sous forme de molécules précurseurs) pour la
synthèse des molécules complexes propres à
l ’organisme.
 GENERALITES SUR LE METABOLISME

1. Le métabolisme : Anabolisme et Catabolisme

1.4. L’énergie

L ’énergie libérée par les réactions très exergoniques

du catabolisme est convertie en « monnaie ATP »

L ’énergie libérée par les réactions d ’oxydation du

catabolisme est conservée dans des transporteurs
d ’électrons (NADH, H+; FADH2 et NADPH,H+)
la plus grande part est convertie en ATP ou utilisées
à des synthèses réductrices.
 GENERALITES SUR LE METABOLISME

2. L ’autotrophie et l’ hétérotrophie

Les autotrophes par photosynthèse ou phototrophes

Les autotrophes par chimiosynthèse

ou chimiolithotrophes

Les hétérotrophes ou chimio-organotrophes

 GENERALITES SUR LE METABOLISME

2. L ’autotrophie et l’ hétérotrophie

Le monde vivant est parcouru par un double courant :

- d ’atomes de carbone
- d ’électrons
 GENERALITES SUR LE METABOLISME

2. L ’autotrophie et l’ hétérotrophie

C
Organique
photosynthèse réduit
respiration

( 1/2 O2 + 2H+ +) 2e- 2e- (+2H+ + 1/2 O2)

C
Minéral
oxydé

H2O
GENERALITES SUR LE METABOLISME

1. Le métabolisme : Anabolisme et Catabolisme

1.1. Catabolisme
1.2. Anabolisme

2. L ’autotrophie et l’hétérotrophie

3. Vue d ’ensemble du métabolisme

GENERALITES SUR LE METABOLISME

3. Vue d ’ensemble du métabolisme

B E2 A B C D
E1
E1 E2 E3
E C

E4 D E3
 GENERALITES SUR LE METABOLISME

3. Vue d ’ensemble du métabolisme

ANABOLISM E CATABOLISME

Acide lactique SANG Acide lactique + CO2 H2O

Acide lactique
FOIE MUSCLE
glucose
glycogène glycogène

Cycle de Cori
 L ’ENERGIE CELLULAIRE

Introduction

1. Le couplage énergétique

2.Les composés riches en énergie ou

composés à haut potentiel énergétique
2.1. L ’adénosine triphosphate ou ATP
2.1.1. La structure
2.1.2. L ’hydrolyse de l ’ATP
2.2. Les principaux composés riches en énergie
2.2.1. Les phosphates
2.2.2. Les acyles
2.3. Origine et rôles des composés riches en énergie
 L ’ENERGIE CELLULAIRE

1. Le couplage énergétique

Réaction qui libère de l ’énergie = exergonique

sa variation d ’énergie libre (∆ G° ’) est de signe négatif.

Réaction qui consomme de l ’énergie = endergonique

sa variation d ’énergie libre (∆ G° ’) est de signe positif.
 L ’ENERGIE CELLULAIRE

2.Les composés riches en énergie ou

composés à haut potentiel énergétique
2.1. L ’adénosine triphosphate ou ATP
2.1.1. La structure

Adénine-Ribose- P -O~ P -O~ P

 L ’ENERGIE CELLULAIRE

2.Les composés riches en énergie ou

composés à haut potentiel énergétique
2.1. L ’adénosine triphosphate ou ATP
2.1.2. L ’hydrolyse de l ’ATP

ATP + H2O ADP + Pi ∆ G°’ ~ -30.5 kJ/mol

ADP + H2O AMP + Pi ∆ G°’ ~ -30.5 kJ/mol

 L ’ENERGIE CELLULAIRE

Introduction

1. Le couplage énergétique

2.Les composés riches en énergie ou

composées à haut potentiel énergétique
2.1. L ’adénosine triphosphate ou ATP
2.1.1. La structure
2.1.2. L ’hydrolyse de l ’ATP
2.2. Les principaux composées riches en énergie
2.2.1. Les phosphates
2.2.2. Les acyles
2.3. Origine et rôles des composés riches en énergie
 L ’ENERGIE CELLULAIRE

2.2. Les principaux composés riches en énergie

2.2.1. Les phosphates

les di-phosphates et les tri-phosphates

les acyl-phosphates ex : 1, 3 bisphosphoglycérate

les énol-phosphates ex : phosphoénolpyruvate

les amidine-phosphates ex : créatine phosphate

 L ’ENERGIE CELLULAIRE

2.2. Les principaux composés riches en énergie

2.2.2. Les acyles

acétylCoA
 L ’ENERGIE CELLULAIRE

2.3. Origine et rôles des composés riches en énergie

Origine de l ’ATP
Phosphorylation de l ’ADP

Origine de l ’énergie nécessaire

Phosphorylation liée au substrat (10%)

Les oxydations phosphorylantes

et les photo-phosphorylation (90%)
 L ’ENERGIE CELLULAIRE

2.3. Origine et rôles des composés riches en énergie

Rôle de l ’ATP
Phosphorylation du substrat

Activation d ’un substrat S1 préalablement

à sa condensation avec un substrat S2

Simple transfert d ’énergie