Modelacin De Catlisis

Enzimtica Con Enzimas

Alostericas
Por Avilez Tellez Irving antonio

QUE ES UNA ENZIMA ALOSTERICA?

CUAL ES SU OBJETIVO?
Son enzimas que cambian
su conformacin al unirse un
efector, lo que conduce a un cambio aparente en la afinidad
de unin de otro ligando en un sitio distinto de la molcula.

Regular la velocidad de la reaccin que catalizan en funcin

de la concentracin de un inhibidor que regula su actividad
enzimtica generando un curva de saturacin sigmoidal
cracteristica.

QU ES LO QUE VAMOS A ESTUDIAR?

Se va a estudiar la la
condensacin de carbamil-fosfato
con aspartato para producir
Ncarbamil-L-aspartato y
ortofosfato.

CARACTERSTICAS DE LA REACCIN

Esta es una reaccin inicial de la sntesis de las pirimidinas

componentes de los cidos nucleicos.

La reaccin procede en orden comenzando por la unin

del carbamil-fosfato en el sitio cataltico, lo cual induce
un cambio conformacional en la enzima que permite la
unin del aspartato.

FUNDAMENTOS
TEORICOS

Sistema enzimtico sin regulacin

alostrica
La catlisis mediante la enzima (E) de la transformacin de un sustrato (S) al
producto (P) se representa por la reaccin:

donde C simboliza la formacin de un complejo enzima-sustrato de transicin

qumica y ki (i = 1, 2, 3) son constantes de reaccin.
Balance de
masa descrito
por Chaplin y
Bucke

Se puede demostrar a partir de la

suposicin de:
Un estado pseudo-estacionario
para el complejo enzimasustrato [d(C)]/dt=0
Definiendo el parmetro Km
(constante de Michaelis)

Para que a resumidas cuentas

el calculo de la velocidad de
reaccin r de la reaccin

Anlisis Michaeliano para un sistema

enzimtico alosterico
Establece la existencia de dos estados conformacionales enzimticos, R y
T, donde R corresponde a la enzima alostrica activa y T al estado de
menor actividad cataltica

El estado R se transmuta al T por la unin con la molcula inhibidora

I: R + I T.

El sustrato S produce al intermediario P1 por la accin de la enzima alostrica E1. La

molcula P1 es el sustrato de la enzima E2 que cataliza la formacin de P2, el cual
se acumula en el sistema. P2 es un inhibidor alostrico de E1.

Balances de materia

Con un razonamiento similar al

de L. Michaelis, esto
es, considerando que d[C1]/dt
= d[C2]/dt = 0; la
velocidad r1 de la reaccin
(5a)

para la velocidad r2 de la reaccin (5b)

Anlisis cintico de Hill para

enzimas alostricas
Esta es un teora que se fundamenta en las interacciones en
el equilibrio entre varias molculas.

Por ejemplo si la usamos para explicar nuestro procesos

vamos a tener que en la reaccin enzimtica catalizada
por la aspartato transcarbamilasa primero se presenta la
unin con un sustrato y luego con el otro, antes de que
ocurra la reaccin que genera al producto.

Y en donde vamos a tener que la

ecuacin que explica se velocidad es:

conocida como la ecuacin de Hill (Weiss, 1997). El parmetro n

representa el nmero de sitios de regulacin en la enzima, y el
parmetro KH reagrupa las constantes de reaccin del paso limitante en
el esquema

Anlisis molecular de la cinetica

enzimtica alostrica
Vamos a explicarla a partir de la teora de E. Marchi y J. Horas (1980),
propusieron un modelo basado en la funcin de particin Z para describir
los estados R y T de la enzima. El modelo considera parmetros
asociados a las energas de interaccin entre las subunidades catalticas
y regulativas que conforman al complejo enzimtico aspartato
transcarbamilasa.

La velocidad de la reaccin
enzimtica alostrica est
expresada mediante
(Marchi y Horas, 1980)

donde y representa la
probabilidad de que un sitio
regulativo est ocupado, y por
tanto es proporcional
a la concentracin de sustrato.

Anlisis basado en agentes de enzimas

alostricas y simulacin de Monte Carlo para
reacciones enzimticas alostricas
La modelacin de reacciones enzimticas puede plantearse
suponiendo a las molculas como agentes con propiedades
definidas y reglas de interaccin formales. Las especies qumicas
participantes en la reaccin son agentes con dos propiedades:

El tipo de agente (sustrato, enzima, complejo enzima-sustrato o

producto), y

La orientacin espacial del agente (definida por dos estados

posibles, 0 o 1).

El progreso de la reaccin enzimtica se define mediante la aplicacin de tres

reglas de interaccin:
Regla de reaccin (dos agentes producen reaccin si y slo si uno es del tipo
sustrato y el otro del tipo enzima)
Regla de orientacin (dos agentes producen reaccin si las orientaciones
espaciales de los agentes coinciden)
Regla alostrica (un agente E1 no reacciona si est unido a un agente P2). El
espacio discretizado donde la reaccin ocurre se simboliza como un arreglo
matricial de agentes

Metodologa
Datos
experimentales

Cinticas
enzimticas de
Michaelis-Menten

Cintica de Hill para

enzimas alostricas

Modelacin basada
en agentes de
reacciones
enzimticas

Cintica basada en
el modelo de la
aspartato
transcarbamilasa
alostrica

Resultados
Curvas hiperblicas de saturacin de sustrato
para la subunidad cataltica de la aspartato
transcarbamilasa de Escherichia coli

Curvas sigmoidales de saturacin de

sustrato para el complejo enzimtico
de la aspartato transcarbamilasa de
Escherichia coli.

Comparativo de datos experimentales y

de modelacin basada en agentes para
la reduccin de actividad enzimtica en
la aspartato transcarbamilasa debida al
inhibidor de control alostrico.

Conclusin
El modelo de cintica enzimtica ms utilizado es la ecuacin
de Michaelis-Menten. Sin embargo, esta ecuacin se restringe
a enzimas no alostricas. An
la ecuacin de Michaelis extendida para sistemas enzimticos
alostricos simplificados tiene limitaciones. Otros modelos
cinticos estructurados describen adecuadamente el
comportamiento sigmoidal caracterstico de las enzimas
alostricas, pero su uso en el anlisis cintico de las
reacciones enzimticas depende de la estimacin de
parmetros cinticos, que regularmente introduce errores
debidos a la imprecisin en los valores numricos de los
parmetros.

Muchas gracias, espero les haya

gustado