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ENZIMAS
E + S ---------- CES -------- E + P
Los enzimas son protenas que catalizan reacciones qumicas en los seres
vivos.
Casi todas las enzimas son protenas, sin embargo el descubrimiento que
existen molculas de RNA catalticamente activas indican que las protenas
no tienen un monopolio absoluto como catalizadores.
Las enzimas son protenas que son producidas de manera natural por todos los
seres vivos.
Las enzimas aceleran las reacciones qumicas del organismo.
La digestin es una reaccin qumica en la cual diferentes enzimas se unen a
molculas de alimento de alto peso molecular (substratos) para formar
complejos
enzimticos .
Las enzimas aceleran la ruptura de esas molculas grandes en molculas ms
pequeas las cuales son absorbidas a travs de la membrana intestinal para ser
utilizadas por el animal para el crecimiento.
Cada enzima es especialmente especfica a su substrato, sera como una llave
que solamente encajara en su cerradura.
CATALISIS
CATALISIS deriva del griego desatar se define como:
aceleracin de reacciones qumicas por adicin de pequeas cantidades de
sustancias extraas al sistema reaccionante llamados catalizadores
CATALIZADOR
Un catalizador es una sustancia que acelera una reaccin qumica,
hasta hacerla instantnea o casi instantnea. Un catalizador acelera la
reaccin al disminuir la energa de activacin.
Reaccin
Descomposicin
de H2O2
Catalizador
Temperatura(C)
Energa(Kcal/mol)
Ninguno
20
Fe2+
22
10
22
1,7
Catalasa
18
Enzimas: Nomenclatura
Muchas enzimas se nombran aadiendo el sufijo -asa al nombre de su
sustrato. Por ejemplo, la ureasa es la enzima que cataliza la hidrlisis de
urea y la fructosa 1,6-bisfosfatasa hidroliza la fructosa 1,6-bisfosfatasa
Sin embargo, existen enzimas como la tripsina PEPSINA y quimotripsina
que tienen nombres que no especifican su actividad.
La clasificacin de las enzimas por la Comisin Internacional de
Enzimas (CIE) esta determinado:
NOMBRE RECOMENDADO, Generalmente es corto y apropiado para
su uso habitual
NOMBRE SISTEMATICO, identifica la reaccin que cataliza
NUMERO DE CLASIFICACION, se emplea cuando se precisa la
identificacin inequvoca de la enzima, tal como ocurre en las revistas
internacionales de investigacin y libros especializados.
Grupo transferido
Nombre sistemtico:
ATP: creatin-fosfotransferasa
Donador
Aceptor
Nmero sistemtico
Enzyme
Comission
Grupo Subgrupo
EC 2.7.3.2
Enzima
Sub-subgrupo
Grupo transferido
Nombre sistemtico:
Aceptor
Nmero sistemtico
Enzyme
Comission
Grupo Subgrupo
EC 2.7.1.1
Sub-subgrupo
Enzima
OXIDOREDUCTASAS
Ared + Box
Aox + Bred
AH2 + B
A + BH2
Grupo 1: Oxidorreductasas
Catalizan reacciones de oxidorreduccin
Ared + Box
Aox + Bred
Aceptor
EC 1.1.3.4
Nombre comn:
Glucosa oxidasa
TRANSFERASAS
Catalizan la transferencia de un grupo qumico (distinto del
hidrgeno) de un sustrato a otro, segn la reaccin:
A-B + C
A + C-B
glucosa + ATP
ADP + glucosa-6-fosfato
Grupo 2: Transferasas
Catalizan reacciones de transferencia de grupo:
A-X + B
A + B-X
EC 2.7.1.1
Grupos monocarbonados
Grupos aldehido o ceto
Aciltransferasas
Glicosiltransferasas
Alquil- o Ariltransferasas
Grupos nitrogenados
Grupos fosfato
Grupos sulfato
HIDROLASAS
Catalizan las reacciones de hidrlisis:
A-B + H2O
AH + B-OH
lactosa + agua
glucosa + galactosa
Grupo 3: Hidrolasas
Catalizan reacciones de hidrlisis
A-B + H2O
A-OH + H-B
3.1.-.3.2.-.3.3.-.3.4.-.3.5.-.etc.
LIASAS
Catalizan reacciones de ruptura o
soldadura de sustratos:
A-B
A+B
Un ejemplo es la acetacetato
descarboxilasa, que cataliza la reaccin:
cido acetactico
CO2 + acetona
Grupo 4: Liasas
Catalizan reacciones reversibles de adicin de un grupo a
un doble enlace:
AXB
A=B + X
COOCH
CH
COOFumarato
(trans-)
H2O
COOHO CH
CH2
COOL-Malato
- Descarboxilasas
- Aldolasas
- Anhidrasa carbnica
- Adenilato ciclasa
ISOMERASAS
Catalizan la interconversin de ismeros:
A
dihidroxiacetonafosfato
glucosa-6fosfato
fosfoglucosa
isomerasa
fructosa-6fosfato
Grupo 5: Isomerasas
Catalizan reacciones de isomerizacin
Algunas reacciones isomersicas:
- Racemasas
- Oxidorreductasas intramoleculares
- Mutasas o transferasas intramoleculares
LIGASAS
Catalizan la unin de dos sustratos con
hidrlisis simultnea de un nucletido
trifosfato (ATP, GTP, etc.):
A + B + XTP
A-B + XDP + Pi
oxaloacetato + ADP + Pi
Grupo 6: Ligasas
Catalizan la unin de dos grupos qumicos a expensas
de la hidrlisis de un enlace de alta energa.
A + B + ATP
A-B + ADP + Pi
O bien
C + D + ATP
- Aminoacil-tRNA sintetasas
- Glutamina sintetasa
- Carboxilasas
COENZIMAS
HALOENZIMA
APOENZIMA
COFACTOR
GRUPO
PROSTETICO
INORGANICOS
COENZIMAS
COENZIMAS.
COENZIMA A
TRANSFERASA
CoA-SH
UBIQUINONA
CoQ
ATP
Ac. PANTOTENICO
NO TIENE
Ac. FOLICO
NO TIENE
NICOTINAMIDA
NAD
NIACINA
ADENOSINA DINUCLEITIDO FOSFATO
LIGASA,
DESHIDROGENASAS
TRANSFERASAS
FOSFORILASA
OXIDOREDUCTASA
NADH
FLAVINA ADENINA FMN
MONONUCLEOTIDO Y
DINICLEOTIDO
FAD
RIBOFLAVINA
OXIDOREDUCTASAS
GRUPO PROSTETICO
BIOTINA Vit H
Ac. LIPOICO
DESCARBOXILASAS
AC. LIPOICO
HEMINA
HEM
PEROXIDASAS CATALASAS
Enfermedades
carenciales
VITAMINAS
FUNCIONES
C (cido ascrbico)
Coenzima de algunas
peptidasas. Interviene en la Escorbuto
sntesis de colgeno
B1 (tiamina)
Coenzima de las
descarboxilasas y de las
enzima que transfieren
grupos aldehidos
B2 (riboflavina)
Constituyente de los
coenzimas FAD y FMN
B3 (cido pantotnico)
Constituyente de la CoA
B5 (niacina)
B6 ( piridoxina)
Beriberi
Dermatitis y lesiones en
las mucosas
Fatiga y trastornos del
sueo
Constituyente de las
Pelagra
coenzimas NAD y NADP
Interviene en las reacciones
de transferencia de grupos Depresin, anemia
aminos.
B12 (cobalamina)
Coenzima en la
transferencia de grupos
metilo.
Anemia perniciosa
Biotina
Fatiga, dermatitis...
Los cofactores pueden ser iones inorgnicos como el Fe++, Mg++, Mn++,
Zn++ etc. Casi un tercio de los enzimas conocidos requieren cofactores.
Cuando el cofactor es una molcula orgnica se llama coenzima.
Muchos de estos coenzimas se sintetizan a partir de vitaminas.
En la figura inferior podemos observar una molcula de hemoglobina
(protena que transporta oxgeno) y su coenzima (el grupo hemo).
Cuando los cofactores y las coenzimas se encuentran unidos covalentemente al
enzima se llaman grupos prostticos. La forma catalticamente activa del enzima,
es decir, el enzima unida a su grupo prosttico, se llama holoenzima. La parte proteica
de un holoenzima (inactiva) se llama apoenzima, de forma que:
Activadores Metlicos
Elemento
Enzima Activada
Zn++
Mg++
Mn++
Mo
Fe2+, Fe3+
Cu2+
Ca2+
K+
Co
Ni
Ureasa.
E+S
CES
E+P
E+S
CES
E+P
"Se puede, sin simplificar casi, admitir que cada enzima, en el organismo,
ejerce su actividad cataltica en un solo punto del metabolismo. Es ante todo
por su extraordinaria efectividad de accin que las enzimas se distinguen de
los catalizadores no biolgicos empleados en laboratorio o en la industria.
Entre estos ltimos los hay muy activos, es decir capaces en muy pequea
cantidad de acelerar considerablemente diversas reacciones. Ninguno de estos
catalizadores, no obstante, se aproxima en especificidad de accin a la enzima
ms vulgar.
Los enzimas son muy especficos, discriminando fcilmente entre sustratos con
estructuras muy similares. Existen dos principios fundamentales que estn
interrelacionados y que proporcionan una explicacin general de cmo
funcionan los enzimas. Primero, el poder cataltico de los enzimas proviene en
ltimo trmino de la energa libre emitida al formarse los mltiples enlaces
dbiles e interacciones que se producen entre el enzima y el sustratro. Esta
energa de fijacin proporciona tanto especificidad como catlisis. Segundo, las
interacciones dbiles son ptimas en el estado de transicin de la reaccin; los
sitios activos de los enzimas son complementarios no a los sustratos, si no a
los estados de transicin de las reacciones que catalizan.
La misma energa de fijacin que aporta energa para la catlisis tambin hace
que el enzima sea especfico. La especificidad se refiere a la capacidad de un
enzima de discriminar entre dos sutratos competitivos.
ESPECIFICIDAD
La especificidad es la propiedad que tiene las enzimas de actuar sobre
determinado sustrato y funcin y no sobre otra. Para demostrar la especificidad
de la amilasa se podra probar la actividad de la amilasa con almidn, con
celulosa y con glucgeno. Estas son molculas parecidas, y sin embargo hay
diferentes enzimas que degradan a cada una de ellas
TIPOS DE ESPECIFICIDAD
ESPECIFICIDAD DE GRUPO
ESPECIFICIDAD DE GRUPO O ENLACE.
Enzimas que reconocen al sustrato como enlace quimico particular:
Ej.
Peptidasas ( tripsina, pepsina) atacan los enlaces peptidicos.
Tripsina -- ataca el grupo COOH del enlace donde este dado por lisina o
arginina
Proteasas actua sobre los enlaces donde se encuentren los AA basicos o
alifaticos
Pepsina --- Actua sobre los enlaces que contienen AA aromaticos o acidos.
ESPECIFICIDAD ESTEQUIOMETRICA
H C COOH H C COOH
HOOC C H H C COOH
cido fumrico (trans) cido malico (cis)
Aa de
conformaci
n
Aa de
contacto
Aa cataliticos
Prcticamente todas las reacciones qumicas que tienen lugar en los seres
vivos estn catalizadas por enzimas. Los enzimas son catalizadores especficos:
cada enzima cataliza un solo tipo de reaccin, y casi siempre acta sobre un nico
sustrato o sobre un grupo muy reducido de ellos. En una reaccin catalizada por
un enzima:
E+S
CES
E+P
1.- El enzima y su
sustrato
3.- Formacin de
productos
Mecanismos de eficencia
catalitica
- PH
-
TEMPERATURA
- - CONCENTRACIN DE LA ENZIMA
- - CONCENTRACIN DEL SUSTRATO
Los enzimas poseen grupos qumicos ionizables (carboxilos -COOH; amino -NH2;
tiol -SH; imidazol, etc.) en las cadenas laterales de sus aminocidos. Segn el pH
del medio, estos grupos pueden tener carga elctrica positiva, negativa o neutra.
Como la conformacin de las protenas depende, en parte, de sus cargas elctricas,
habr un pH en el cual la conformacin ser la ms adecuada para la actividad
cataltica. Este es el llamado pH ptimo. (Para activar la animacin de la
Figura de la derecha, pulsar la opcin "Recargar" del navegador).
La mayora de los enzimas son muy sensibles a los cambios de pH. Desviaciones
de pocas dcimas por encima o por debajo del pH ptimo pueden afectar
drsticamente su actividad. As, la pepsina gstrica tiene un pH ptimo de 2,
la ureasa lo tiene a pH 7 y la arginasa lo tiene a pH 10 (Figura de la izquierda).
Como ligeros cambios del pH pueden provocar la desnaturalizacin de la protena,
los seres vivos han desarrollado sistemas ms o menos complejos para mantener
estable el pH intracelular: Los amortiguadores fisiolgicos.
CINETICA ENZIMATICA
Y = ax/b+x
el diagrama de Eadie-Hofstee.
Con el siguiente tutorial de la cintica de Michaelis-Menten realizado en la
Universidad de Virginia , se puede simular el comportamiento de
una enzima variando las constantes cinticas.
INHIBIDORES ENZIMATICOS
Los inhibidores enzimticos son molculas que se unen a enzimas y
disminuyen su actividad. Puesto que el bloqueo de una enzima puede matar a
un organismo patgeno o corregir un desequilibrio metablico, muchos
medicamentos actan como inhibidores enzimticos
Tambin son usados como herbicidas y pesticidas. Sin embargo, no todas las
molculas que se unen a las enzimas son inhibidores; los activadores
enzimticos se unen a las enzimas e incrementan su actividad
La unin de un inhibidor puede impedir la entrada del sustrato al sitio activo de la
enzima y/u obstaculizar que la enzima catalice su reaccin correspondiente.
Modelo estructural de la proteasa del
virus del SIDA unida a un inhibidor de la
proteasa, el ritonavir. La estructura de la
proteasa se muestra mediante cintas de
color rojo, azul y amarillo, mientras que el
inhibidor es representado por una
estructura de esferas y varillas
Ciertas molculas pueden inhibir la accin cataltica de un enzima: son los inhibidores.
Estos inhibidores bien pueden ocupar temporalmente el centro activo por semejanza estructural
con el sustrato original (inhibidor competitivo) o bien alteran la conformacin espacial del enzima,
impidiendo su unin al sustrato (inhibidor no competitivo) (Figuras inferiores).
Inhibidor competitivo
Inhibidor no competitivo
INHIBIDORES IRREVERSIBLES
enzima
GRACIAS