Reparacin del DNA

Sistemas de reparacin del DNA

Escisin de la regin daada seguida de remplazamiento preciso

Escisin de base
Escisin de nucletidos
Reparacin de errores de replicacin
a) Desapareamientos (mismatch repair)
b) Translesin (by-pass)

Reparacin de roturas de doble cadena

a) Unin de extremos no-homlogos
b) Unin de extremos homlogos: recombinacin homloga

Reparacin por escisin

Etapas principales
Reconocer la lesin
Eliminar la lesin escindiendo parte de una de las hebras
Nueva sntesis para llenar el hueco
Sellar la mella para reestablecer la continuidad del DNA

Reparacin por escisin de base

Reparacin por escisin de nucletido

Una glucosilasa elimina la base, deja la

cadena intacta

Un corte doble elimina la lesin, se

elimina un oligonucletido

La AP endonucleasa corta la cadena,

la AP liasa elimina el azcar

(12-13 nucletidos en E. Coli, 27-29

en humanos)

La DNA polimerasa rellena el hueco

La DNA polimerasa rellena el hueco

La DNA ligasa sella la mella

La DNA ligasa sella la mella

Reparacin por escisin de base

UNG

DNA glucosilasa: hidroliza el enlace -glucosdico

que une la base daada al azcar.
Existen al menos 6 tipos de gluocosilasas
(reconocen desaminaciones de C y A; bases
oxidadas o alquiladas; bases con anillos alterados,
etc)
Genera un sitio sin base: apurnico o
apirimidnico. Sitio AP
AP endonucleasa: rompe el enlace
fosfodister del sitio AP gererado
por la glucosilasa

Sistema de replicacin: DNA

polimerasa I y DNA ligasa

Fig 5-50a .- Biologa Molecular de la Clula 4 ed., Alberts y col.

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Reparacin por escisin de base

En humanos
La desaminacin de 5-metil-C (habituales en secuencias CG)
deja T en lugar de U, actan glucosilasas que reconocen el par desapareado
T:G, eliminando preferentemente la T, sin embargo a veces elimina la G,
produciendo una mutacin.

La AP endonucleasa ms importante es APE1

Corta la cadena por el lado 5 del sitio AP
Recluta la DNA pol b
La DNA pol b, que tiene dos actividades enzimticas,
elimina el fosfato-azcar absico, con su actividad AP liasa,
y rellena el hueco con su actividad polimerasa

Reparacin por escisin de base

Despurinacin de G

El sistema de reparacin por

escisin de base repara los
daos en el DNA producidos por
despurinacin de bases, a partir

de AP endonucleasa

Fig 5-50 .- Biologa Molecular de la Clula 4 ed., Alberts y col. (modificada)

Reparacin por escisin de nucletido

Este sistema de reparacin acta sobre una gran variedad de lesiones

Dmeros de pirimidina
Modificaciones qumicas con carcingenos: benzopireno, aflatoxina y con
agentes quimioterpicos como cisplatino
Bases desapareadas y pequeos lazos del DNA

Es el sistema de reparacin ms genrico y flexible

Reparacin por escisin de nucletido

De forma general este sistema implica:

Deteccin del dao: mecanismo de

escaneo
Actividad endonucleasa: ESCINUCLEASA
DNA helicasa
Sistema de replicacin: DNA polimerasa y
DNA ligasa

Fig 5-50 .- Biologa Molecular de la Clula 4 ed., Alberts y col.

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Reparacin por escisin de nucletido

Sistemas enzimticos en E. Coli: 4 componentes

Funcin

Componente

Escaneo DNA

UvrA

Nucleasa: ESCINUCLEASA

UvrB, UvrC

Helicasa

UvrD

Sistema de replicacin

DNApol I/DNApol II; ligasa

Reparacin por escisin de nucletido (E. Coli)

Fig 9-16 .- Biologa Molecular del Gen 5 ed., Watson y col.

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Reparacin por escisin de nucletido

Comparacin en E. Coli y en humanos

Funcin

E. Coli

Humanos

Escaneo DNA

UvrA

XPA, XPC; RPA

Nucleasa:
ESCINUCLEASA

UvrB, UvrC

XPF, XPG

Helicasa

UvrD

XPB, XPD

Sistema de
replicacin

DNApol I/DNApol II;

ligasa

DNApol /; ligasa

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Reparacin por escisin de nucletido

en humanos

Biologa Celular y Molecular 5 ed., Lodish y col.

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Reparacin de desapareamientos post-replicativos o apareamiento

incorrecto de base o MisMatch Repair (MMR)
Enzimas MMR en E. Coli: 4 componentes

Funcin

Componente

Escaneo DNA

MutS

Reparacin de errores

Sistema de replicacin

MutL
MutH (endonucleasa)
MutU (UvrD helicasa)
DNApol III; ligasa

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Reparacin de desapareamientos post-replicativos (MMR)

Cmo se reconoce la cadena daada?

El sistema tiene que distinguir la base errnea en la cadena hija, sin afectar a
la cadena molde

Sistema MMR

La cadena hija permanece sin metilar en las secuencias GATC varios minutos
despus de su sntesis
Fig 14-29 .- Genes VII., Lewis.

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(E. Coli)

Reparacin de desapareamientos

Los apareamientos incorrectos son

reconocidos por un homodmero MutS, al que
se une MutL

Los 2 monmeros MutS crean un bucle que

contiene el apareamiento incorrecto
La endonucleasa MutH se une a sitios
hemimetilados, permanece inactiva hasta que
interacciona con el complejo MutL-MutS
MutH corta la hebra hemimetilada, del lado 5
3 del desapareamiento

Fig 25-20 .- Lehninger 3 ed

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Reparacin por sntesis de translesin (TLS)

Polimerasas de translesin:
Familia Y de DNA polimerasas

E. Coli

Sintetizan DNA a travs del sitio

de la lesin

Son dependientes de molde

Incorporan nucletidos de una
manera independiente de
apareamiento de bases, por eso
cometen errores con frecuencia

Fig 9-18 .- Biologa Molecular del Gen 5 ed., Watson y col.

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Reparacin de roturas de doble cadena

Las roturas de doble cadena son potencialmente letales
Causas de rotura de doble hebra
Radiaciones ionizantes
(rayos g, rayos X)
Especies de oxgeno reactivas
Quimioterpicos (bleomicina)

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Unin de extremos no-homlogos

KU desenrrolla los extremos

del molde hasta que
regiones muy cortas (2-6 pb)
puedan aparearse

DNA-PK: Protena quinasa

dependiente de DNA
Protena KU: ATPasa
dependiente de DNA con
actividad helicasa

p. ej.: nucleasas; eliminan los extremos

no apareados

Se eliminan pb

Fig 23-32 .- Biologa Celular y Molecular 5 ed., Lodish y col.

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Unin de extremos homlogos:

recombinacin homloga

ATM: protena quinasa

activada por rotura de cadena
doble

RAD51: conduce el
apareamiento de DNA
homlogos e invasin de
cadenas

Un filamento nucleoproteco
busca la secuencia homloga de
DNA doble sobre la cromtida
hermana
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20

21

Biologa Celular y Molecular 5 ed., Lodish y col.