Pamela Stone Proc. Nati. Acad. Sci. USA Vol. 74, No. 1, pp. 198-202, Enero de 1977 Bioqumica Introduccin La fidelidad de la sntesis de protena es substancialmente mayor que la especificidad del reconocimiento del complejo codn-anticodn de la que se esperara una energtica conocida de las pares de bases en solucin.
Para probar la sugerencia de que la especificidad
de reconocimiento se puede incrementar por lectura a prueba de errores cintica asociada a hidrlisis de GTP se estudiaron los complejos ternarios del Factor de Elongacin polipetdico Tu(EFTu ) y el GTP con ribosomas programados con poli-u. Con la mayora de los complejos ternarios no anlogos, incluyendo 2 que se aparean con las bases UUU 5 y 3, el rechazo ocurre sin hidrlisis de GTP, presumiblemente por una reaccin de unin inversa. Sin embargo con complejos que contienen Leu e Ile tRNAs las cuales se aparean correctamente con el sitio 3 y las bases intermedias, la hidrlisis del GTP se estimula aunque el aatRNA no fue retenido por los ribosomas. Estos resultados nos demuestran la existencia de un paso de lectura a prueba de errores dependiente de GTP Estas investigaciones han demostrado que todos los pares estndar posibles entre G-U se acercan en energa de unin a los pares estndar. La energa liberada de la unin de un par G-U difiere de los pares que son correctos A-U y G-C por tan solo 2-3kcal/mol. Con excepcin de la base del codn 3 donde el bamboleo permite a G-U se un par de bases estndar en el cdigo gentico, el apareamiento de G-U casi siempre resultara en una unin con el aatRNA incorrecto. El ribosoma y sus asociados deben por lo tanto aumentar la especificidad del apareamiento codn-anticodn, a travs de un mejoramiento en la exactitud del apareamiento de bases. Hopfield propuso un mecanismo alternativo para incrementar la especificidad de la union de aatRNAs; un paso de lectura a prueba de errores. La lectura a prueba de errores debera ser conducida por la Esta caracterstica sugiere un mtodo de deteccin de lectura a prueba de errores, ya que slo ese mtodo de rechazo de error debe consumir GTP. Hemos estudiado el mecanismode rechazo de error en la reaccin de ribosomas poli(U)- programados con una variedad de no analogos de aa-tARN, en presencia de factor de elongacin del polipptido Tu (EFTu) y GTP. Los resultados indican que ciertos aa-tARN estimulan la hidrlisis de GTP y todava no se conservan en la ribosoma. Nuestras conclusiones por lo tanto implican una reaccin de lectura a prueba de errores, del tipo postulada por Hopfield, en la sntesis de protenas Material y Mtodos Ribosomas y EFTu de E. coli MRE600 En la preparacin de aatRNA se usaron aminocidos etiquetados con H3 preparados con una sola tanda de una mezcla de aatRNA sintetasas, preparadas de E. coli MRE600 estos fueron Phe25; leu65; Ile84; Lys30; Tyr60 y Val12.5 Los ribosomas con Poli-u y N-acetil- fenilalanil-tRNA en el sitio P (donador), se prepararon enzimticamente por incubacin de ambos componentes. Para preparar el complejo ternario EFTu- GTP-aatARN, EFTu-PIB se incub con el fosfoenolpiruvato y piruvato quinasa, se agrego GTP para proveer actividad especifica y por ultimo se agrego AminoaciltRNA y se filtro para eliminar EFTu no acomplejados. La reaccin de unin se inicio por medio de la mezcla de 4 volmenes del complejo ternario y un volumen de Ribosoma-PolyU-AcPhetRNA a 0C. Se determinaron las uniones de [H3]aatRNA con los Ribosomas mediante el metodo de Niremberg y Leder. Resultados El postulado del mecanismo de rechazo de error se esperara que este asociado con una pequea cantidad de la hidrlisis de GTP, ya que representa una segunda vida de la defensa, la mayora de los errores son detectados en el primer paso discriminativo antes FIG. 1. La hidrlisis de GTP en complejos de la hidrlisis de GTP. ternarios anlogos y no anlogos. Un complejo ternario [1600 l (alrededor de 300 pmol)] de [3H] - aa-tRNA, [. -32PJGTP, y EFTu (Material y Mtodos) fue aadido a 400 L (1nmol) de un complejo preformado AcPh-tRNA-poli (U)-ribosoma a 0 . Las muestras (150 l) fueron retirados en el momento indicado y el contenido de 32P, fue determinado. Hidrlisis de GTP asociada a complejos ternarios anlogos y no anlogos Como se observo en trabajos previos cuando se incuba un complejo ternario Phe-tRNA, EFTu, y [-32P]GTP con ribosomas programados con poly(U), GTP se hidroliz rpidamente con la produccin de Pi32i (Fig. 1), y la Phe-tRNA se uni a los ribosomas.
En comparacin con el complejo ternario
que ocupaba la Lisina que debera interactan muy mal con el codn UUU, mostr una muy baja tasa de hidrlisis Con otros complejos ternarios las tasas de hidrlisis de GTP variaban ampliamente. Con Val y Tir la tasa no excedia el valor de fondo. Con Ile la tasa fue tres veces el valor de fondo. Con Leu era an mayor (aunque todava slo una pequea fraccin de la observada con Phe). Con Leu la actividad GTPasa declin rpidamente al nivel de fondo, mientras que con la Ile se mantuvo elevado mucho ms