UNIVERSIDAD NACIONAL

AUTNOMA DE MXICO
FACULTAD DE ESTUDIOS SUPERIORES ZARAGOZA
Carrera: Qumico Farmacutico Biolgica

MICROBIOLOGIA I

MICROBIOLOGIA DEL
SUELO
Noyola Hernndez Isaac Emmanuel
Pineda Jimnez Ilze Dayann
Snchez Ramrez Yolanda Lizbeth
Vzquez Abarca Oswald
 SUELO
Se refiere al material exterior, poco compacto, de la superficie terrestre,
un extracto caractersticamente diferente del lecho rocoso subyacente.
Es la regin que sustenta la vida vegetal .
Contiene gran variedad de bacterias, actinomicetos hongos, algas y
protozoarios
Es un sistema dinmico en interacciones biolgicas en la naturaleza donde
se realizan las reacciones bioqumicas involucradas en
o la descomposicin de materia orgnica
o Nutricin de cultivos agrcolas
o Intemperizacin de las rocas
 Componentes
del suelo

Materia Material Organismos

Agua Aire
mineral organico vivos
 LOS SUELOS ESTN DIVIDIDOS SEGN SU
TEXTURA:

Arenoso arcillosos: 35% o ms de arcilla y 45% o ms de arena

Limo-arcillosos: 40% de arcilla y 40% o ms de limo
Margosos o francos: contienen igual proporcin de arena, limo y arcilla.
Ideales para la agricultura.

La textura del suelo influye en las comunidades de microorganismos

porque de ella depende la aireacin y la disponibilidad de agua
 Los microbios en el suelo

Controlan la
Contribuyen a la formacin de materia orgnica
disponibilidad de

muchos nutrientes
la convierten en cido carbnico o cidos
importantes para las
orgnicos
plantas

disuelven rocas
 La actividad microbiana es limitada por el
agua (sequa,humedad ) y estado de los
nutrientes

La actividad microbiana es clave en la

productividad de los suelos.
Los microbios pueden existir varios cientos
de metros por debajo de la superficie de la
Tierra
EN UN GRAMO DE SUELO DEL HORIZONTE A PUEDEN
HABER:
2500 millones de bacterias
+
medio milln de hongos
+
50 000 algas
+
30 000 protozoos
ASPECTOS FISICOS Y QUIMICOS
 ASPECTOS FISICOS
TEXTURA
ESTRUCTURA
POROSIDAD
PROFUNDIDAD
 TEXTURA

Es la proporcin en la que se encuentran distribuidas las partculas

elementales que lo pueden conformar .
Puede clasificarse en 3 grupos bsicos que son: la arena, el limo y las
arcillas.

La textura del suelo influye en las comunidades de microorganismos

porque de ella depende la aireacin y la disponibilidad de agua.
 En los suelos arenosos los grnulos son mas grandes, tienen
pocas reservas de nutrientes.

Los suelos limosos tienen grnulos de tamao intermedio, son

pesados y poco nutrientes.

Los suelos arcillosos estn formados por partculas muy pequeas

, no drenan ni se desecan fcilmente contienen buena reserva de
nutrientes.
 Para determinar el tipo granulomtrico o clase textural del
suelo se utilizan varios mtodos entre los ms utilizados: los
diagramas triangulares, utilizando de referencia un
tringulo equiltero, donde un lado corresponde a la arcilla, el
otro al limo y el tercero a la arena, cada uno de sus lados
graduado de 10 en 10 y va de 0 a 100 y sobre la retcula se
transporta la cantidad de elemento que presenta.
 ESTRUCTURA

Cuando las partculas individuales se agrupan toman el

aspecto de partculas mayores y se denominanagregados,
generalmente en la capa superficial del suelo.
 COMPOSICIN DEL SUELO
Los suelos estn formados Poro Pelcula de Agua

de materia slida y
espacio poroso. Materia orgnica

El espacio poroso es O2 Arena

CO2,H
ocupado por diferentes 2S,
proporciones de aire y CH4

agua, dependiendo de las Arcilla

condiciones de humedad.
Cada poro y espacio
poroso, afecta el Hifa
movimiento y retencin Bacterias

del agua.
 POROSIDAD

Fraccin agua/gases.
Los espacios que hay entre las
partculas slidas del suelo,
contienen diversas cantidades de
dos componentes principales:
agua y aire.
Porcentaje de espacios vacos
respecto al volumen total del
suelo.
Describe eltamao medio de los agregados
individuales.
 PROFUNDIDAD.

Es importante ya que de esta depende el volumen de agua que el suelo puede almacenar.

A mayor profundidad mayor densidad aparente

En una planta la raz de esta profundizar hasta donde las condiciones de aireacin y drenaje le permitan respirar adecuadamente.
 AGUA
Entre los agentes qumicos ms importantes ha de
sealarse el agua, que en el suelo puede considerarse bajo
tres aspectos:
Agua higroscpica, equivalente al contenido en agua del
suelo desecado al aire a las que est ligada intensamente
por fuerzas moleculares.
Agua capilar, constituida por la porcin de agua del suelo
distinta de la higroscpica mantenida por fuerzas de
tensin superficial
Agua de gravitacin, formada por la porcin de agua del
suelo que por la accin de la gravedad.
 ACCION BIOLGICA
En la accin biolgica desempea un
papel preponderante la vegetacin,
correspondiendo a los animales un papel
secundario.
La intervencin de los vegetales en el
proceso de formacin y evolucin del
suelo es mltiple y compleja.
Los animales afectan al suelo por sus
actividades cavadoras y minadoras,
por sus deyecciones y cadveres.
 Los vegetales aportan al suelo sus restos son
punto de partida de la formacin del humus, y
mediante la accin de vegetales de organizacin
inferior, de microorganismos, llevan a cabo el
complicado proceso de la demolicin y
mineralizacin de los restos animales y
vegetales para incorporarlos de nuevo al ciclo de
la materia viva.
 CICLO DE LA MATERIA ORGNICA
CO2
Restos vegetales
Fotosntesis desaparecen bajo la accin
de la microfauna y la
microflora del suelo
Cada de ramas, hojas,
frutos..

Microfauna del suelo

Microorganismos del suelo

Mineralizacin Humificacin
 ASPECTOS QUMICOS.
pH
Intercambio de cationes
Materia orgnica
 PH
La asimilacin del aprovechamiento de nutrientes del suelo esta
influenciada por el pH, algunos agentes se pueden bloquear en
determinadas condiciones de pH.
 CAPACIDAD DE INTERCAMBIO
CATINICO
Es el proceso reversible
por medio del cul los Cl- Cl-
cationes y aniones se HCO3-
intercambian entre fases K + NO 3
-
Na +
Na +
slidas manteniendoSO4-2 -
equilibrio qumico. OH
Ca+ + Arcilla - Na+
Los nutrientes inorgnicos
-
para microorganismos ySO4 -2
Ca ++ OH
Na+
plantas estn presentes K+ H+
en la solucin del suelo HCO3- OH-
como iones. NO3- HCO -
3
Intercambio catinico:
Los cationes apresados por las
partculas de arcilla pueden:
Ser reemplazados por otros
cationes
Ser liberados a la solucin del
suelo para ser tomados por plantas
y microorganismos.

Los aniones (NO3-, SO4-2, HCO3-, y OH-) son lixiviados del suelo ms
rpidamente que los cationes ya que no pueden fijarse a las partculas de
arcilla.
 PORCIN ORGNICA.

La materia orgnica procede de plantas, animales y microorganismos esta

constituida por un conjunto heterogneo en distintos estados ,constituidos
por un amplia gama de sustancias: hidratos de carbono, resinas, ligninas,
compuestos nitrogenados al llegar a suelo por su alto contenido de humedad
ejerce accin estimulante sobre la actividad microbiana.
 HUMUS
Se denomina humus a la porcin orgnica del suelo, es un producto de las
actividades de sntesis y descomposicin de la microflora
Es un agregado complejo de sustancias amorfas, de coloracin parda a
negra, que se origina durante la descomposicin de los residuos animales y
vegetales.

El humus se caracteriza por una gran capacidad de combinarse con varios

constituyentes inorgnicos del suelo, de absorber agua y de hincharse ,por
propiedades fsico-qumicas que hacen de l un valioso constituyente de los
substratos que soportan la vida vegetal y animal; puede considerarse como
un depsito regulador de elementos qumicos indispensables para el
mantenimiento de la vida vegetal sobre la tierra.
 MICROORGANISMOS DEL SUELO
Contiene cinco grupos principales:
Bacterias
Actinomicetos
Hongos
Algas
Protozoarios
La mayor actividad de los M.O. se realiza desde la superficie del suelo hasta
unos 20 cm de profundidad.

En suelos aireados adecuadamente predominan bacterias y hongos, sin

embargo en suelos con poco O2 las bacterias son responsables de los
cambios qumicos y biolgicos.
 FACTORES QUE AFECTAN LA VARIABILIDAD
DE LOS MICROORGANISMOS
FACTORES PRIMARIOS
La humedad
Temperatura
Materia orgnica
pH

FACTORES SECUNDARIOS
Estacin del ao
Profundidad
Todos los habitantes de una localidad en particular forman una comunidad,
que es caracterstica de un suelo dado, definida por las propiedades fsico-
qumicas del medio y microbiota.
 BACTERIAS
Son los microorganismos mas abundantes y pequeos, pueden ser
aerobias, anaerobias o facultativas.
Tienen un importante papel en las redes trficas terrestres, cerrando
tambin los ciclos biogeoquimicos.
 AGRUPACIN DE BACTERIAS POR
CARACTERSTICAS MORFOLGICAS
 BIOTA NATIVA Y BIOTA INVASORA
Gneros nativos o
autctonos: Son residentes
verdaderos del suelo, las especies
nativas tienen fases de
permanencia por largo tiempo sin Las invasores o aloctonas: Los gneros aloctonos, no son activos en
las transformaciones de la materia orgnica del suelo, permanecen cierto
actividad metablica, aunque tiempo inactivas o crecen por corto tiempo, por ello no contribuyen en
las interacciones ecolgicas.
mediante induccin nutricional
proliferan de acuerdo con su
capacidad bioqumica.
 CLASIFICACIN POR SU
FISIOLOGA
Bacterias Autotrficas y Bacterias Heterotrficas(Gram +
Autotrficas Facultativas o -)
Fijan N2, Bacterias que fijan
Bacterias Nitrificantes N2libremente, Anaerobias,
Aerobias
Requieren N2combinado con
Bacterias de Azufre
aminocidos, amonio y nitrato
Aerobias y Anaerobias. Aerobias
Bacterias que oxidan
no son formadoras de esporas
 GNEROS BACTERIANOS MAS
IMPORTANTES AGRCOLAMENTE
Transforman los compuestos orgnicos e inorgnicos que favorecen la
nutricin de las plantas.
Bacillus, Pseudomonas, Azotobacter, Azospirillum, Nitrosomonas,
Nitrobacter, Clostridium, Thiobacillus, Lactobacillus y Rhyzobium.
 ENFERMEDADES CAUSADAS POR BACTERIAS
DEL SUELO

Agente etiologico Enfermedad

Clostridium botulinum Botulismo
Clostridium tetani Ttanos
Bacillus anthracis ntrax (carbunco)
Listeria monocytogenes Listeriosis
Erysipelothrix rhuziopathiae Erisipeloides
Coxiella burnetii Fiebre Q
Streptococcus (Patgenos) Faringitis, Mal de la bacteria devoradora de
carne, neumona, meningitis, entre otras.
Salmonella sp Salmonelosis y enfermedades sistmicas
 TTANOS
Proceso neurolgico, caracterizado por espasmos y aumento del tono
muscular que se deben a latetanoespasmina, una potente toxina
proteica, elaborada porClostridium tetani.
Lasesporasde la bacteriaC. tetanise encuentran en el suelo, en las heces
y en la boca de animales. En su forma de espora,puede permanecer
inactiva en el suelo.
Se puede contraer la infeccin por ttanos cuando las esporas penetran en
el organismo a travs de una lesin o una herida. Las esporas se
convierten en bacterias activas que se diseminan en el cuerpo.
 ALGAS
Estn ampliamente distribuidas en la superficie de los suelos
El contenido de humedad limita su desarrollo
Son fotosintticas, dependen de la luz
Son unicelulares o filamentosas
Se dividen en: Cloroficeas o algas verdes
 ALGAS MAS COMUNES
Algas verde-azuladas (Cianoficeas)
Tolypothrix
Anabaena
Nostoc
Algas verdes (clorofitas)
Bacillariophyceae (Diatomeas)
 ACTINOMICETOS
o Son microorganismos caracterizados por ser organismos intermedios
entre los hongos y las bacterias.

o Tienen aspecto filamentoso y, al igual que los hongos, la capacidad

de segregar antibiticos (estreptomicina, aureomicina, terramicina,
cloromicetina y tetraciclina).

o Por otro lado, como las bacterias, los actinomicetos realizan

numerosas reacciones bioqumicas y participan en el proceso de
formacin de humus y en la alimentacin de las plantas al
mineralizar la materia orgnica.

o algunas especies pueden fijar nitrgeno atmosfrico en asociacin

con algunas especies de rboles
 DISTRIBUCIN

Se pueden
encontrar en:
Suelos
Estircol
fondo de los
ros
Fondo de los
lagos
 caractersticas

En general prefieren los medios alcalinos

Se presentan en forma de conidias o hifas
vegetativas

son predominantemente saprfitos aunque se

conocen patgenos de plantas, animales
domsticos e incluso humanos.

Los actinomicetosson aerobios y de gran

importancia en relacin con la disolucin de la
materia orgnica del suelo y la liberacin de
nutrientes de ella.
 Son hetertrofos

Otros son parsitos de plantas superiores.

Contienen esporas que le dan resistencia a la

desecacin

Algunos son mesofilos con T optima en intervalo

de 25 a 30 C

Otros son termfilos, crecen en condiciones de

55-65C

Algunos actinomicetos secretan sustancias

probiticas o antibiticas al medio
 CARACTERISTICAS DE SUELOS

El tamao de las colonias dependen

del tipo de suelo

Caractersticas fsicas

Contenido de materia orgnica

humedad

pH del medio

estaciones del ao

Practicas de cultivo
 c ti no micetos
ea
Familias d
 ENFERMEDADES CAUSADAS POR
ACTINOMICETOS
Plantas

Roa de la papa causado por

Streptomyces scabies
 Animales y humanos
la infeccin por Nocardia
Nocardiosis, es una infeccin poco frecuente causada por la bacteria
Nocardia asteroides.
La enfermedad se contrae por inhalacin de polvo contaminado o cuando la
bacteria nocardia ingresa por una herida abierta.

Figura 1. Tincin de
Kinyoun directa de
muestra clnica
Pulmones
Los sntomas de infeccin pulmonar por nocardia son:
fiebre espordica
cansancio
sudoracin nocturna
Piel
Esta es la segunda rea ms comnmente afectada. Entre los sntomas de celulitis debida nocardia estn los siguientes:
llagas abiertas supurantes
salpullidos
ganglios linfticos inflamados
Otras reas
Si bien es menos comn, la infeccin por nocardia puede afectar otras partes del cuerpo y causar distintos sntomas, como por ejemplo:
Infeccin del aparato gastrointestinal:
nuseas
inflamacin del hgado y bazo
prdida de peso repentina
vmitos
Infeccin cerebral:
convulsiones
cefalea (dolor de cabeza)
confusin
mareos
fiebre
 HONGOS
Aportan gran parte significativa de biomasa, debido al dimetro de su
filamento y son los principales agentes de descomposicin en ambientes
cidos.
Los hongos participan en la formacin de humus al degradar vegetales y
animales(restos orgnicos).
Otros hongos originan patogenicidad y pueden invadir tejidos vivos, estos
salen a la superficie del suelo y por accin del viento se transportan hasta ser
inhalados en partes vulnerables del cuerpo.

Incluso se introducen junto con la tierra daan los pies, esto en los trpicos
donde mucha gente camina descalza.
Mineralizacin de la materia orgnica
Descomposicin de hojas (Sucesin)

Tiempo (las fases pueden ser simultneas)

Hongos: glucfilos Hongos Hongos lignolticos :

utilizacin de las celulolticos: degradacin de la
sustancias metabolismo de la lignina
hidrosolubles celulosa

Bacterias: transforman residuos fngicos y productos no

consumidos por las hifas.
 PRINCIPALES HONGOS DEL SUELO
Principales hongos filamentosos del suelo

Absidia Glioladium
Acrostalagmus Monilla
Acremonium Mortierella
Alternaria Mucor
Aspergillus Penicillium
Botrytis Candida
Cephalosporium Pythium
Cunninghamella Rhizoctonia
Chaetomium Rhizopus
Cladosporium Trichoderma
Cylindrocarpon Sporothrixschenckii
Fusarium Zygorynchus
Plasmodiophora brassicae
 MICORRIZAS
Son hongos que crecen en relaciones de simbiosis
con las races de las plantas. Esta simbiosis
estimula la competitividad de las plantas pues
mejora la nutricin de las plantas, particularmente
fsforo y otros nutrimentos.
Existen dos tipos de relaciones con micorrizas:
I. Endomicorrizas
II. Ectomicorrizas
 En las ectomicorrizas el
micelio invade la raz sin
entrar en el interior de las
clulas, de aqu el nombre de
ectomicorrizas.
 En las endomicorrizas el
micelio invade la raz,
inicialmente es intercelular,
pero luego penetra en el
interior de las clulas
radicales, desde la
rizodermis hasta las clulas
corticales.
 PROTOZOARIOS
Caractersticas.
Fase activa.
Fase de reposo.

Reproduccin. Alimentacin.

Son predadores y se alimentan de

Asexual.
Bacterias, otros protozoarios y algunas veces de hongos, aunque tambin
pueden alimentarse de materia orgnica.

Locomocin.
Mastigophora ( flagelos )
Sarcodina (pseudopodos )
Ciliophora ( cilios )
 NUTRICIN.
La energa necesaria para el crecimiento de los protozoarios se obtiene de
varias maneras.

Saprobica.

Fagotrofica.
 NUTRICIN FAGOTROFICA.

En la nutricin fagotrofica, la partcula alimenticia ingerida es rodeada

por una vacuola, donde se lleva a cabo la digestin.
Los protozoarios tienen la capacidad de formar las enzimas necesarias
para llevar a cabo la descomposicin de protenas, polisacaridos y
lpidos.
Existen casos de canibalismo.
Selectivos en la presa que consumen.
 PRESAS DE PROTOZOARIOS

Organismos fcilmente digeridos.

Especies consumidos lentamente.
Organismos atacados solo en raras ocasiones o que no son atacados.

Consumen especies bacterianas en forma de bastn, cocos y alguna

especies de Mycobacterium o algas.
Las esporas de Clostridium, las hifas y esporas de hongos son resistentes
al ataque de protozoarios.
 INFLUENCIA AMBIENTAL
Suelo: se encuentran en gran cantidad cerca de la superficie del suelo.

Humedad: los flagelados son tolerantes a poca humedad y pueden

desarrollar en condiciones seca.
Los ciliados son abundantes solo en niveles de humedad altos.

No hay estudios con respecto a la influencia de concentracin de

hidrgeno y temperatura.

Crecen a bajas tensiones de oxgeno o en completa anaerobiosis.

 IMPORTANCIA EN EL SUELO.

Regulan el tamao de comunidad bacteriana: se a observado un

descenso rpido y brutal de bacterias en presencia de protozoarios.

Los protozoarios pueden estimular ciertas transformaciones bacterianas,

tales como la utilizacin de N2 o la degradacin de materiales orgnicos
que contienen fsforo. (An que no hay un mecanismo de estmulacion).
 "LOS PRESTADORES NO
ELIMINAN POR COMPLETO A SU
PRESA."
Hiptesis.

a) La porcin de clulas en la poblacin presa que es consumida

disminuye conforme la densidad del depredador aumenta.
b) Las clulas pequeas de las presas son protegidas por poros del suelo
no penetrados por protozoarios grandes.
c) El prestador mismo puede ser atacado por parsitos u otros
organismos.
 ENFERMEDADES
La importancia del suelo como un reservorio para especies infecciosas
an permanece incierta.

Disenteria amebana producida por Entamoeba histolytica.

Meningoencefalitis causada por Naegleria.

VIRUS
 CARACTERSTICAS.

Cada partcula viral necesita un hospedero.

Estn limitados a su hospedero.

Especificidad del hospedero.

 Hace apenas unos pocos aos que se ha prestado considerable atencin
al comportamiento de estos agentes infecciosos.

Las pruebas de la existencia de estos parsitos submicroscopicos se

basan nicamente en que se han encontrado en las clulas entidades
estructurales parecidas a los virus.

An no se ha establecido si estas partculas son realmente virus o si

existen en el suelo.
 Se conoce ms acerca de la ecologa de los bacteriofagos que de otras
clases de virus.

Algunas pruebas comunes indican que los bacteriofagos no son

numerosos en el suelo, solo aumentan si el hospedero aumenta.

El aumento se da por la lisis provocada por el bacteriofago en el

hospedero, da un aumento del bacteriofago y una disminucin del
hospedero.
 TIPOS DE BACTERIOFAGOS.
Liticos o virulentos: provocan la lisis del hospedero.

Lisogenicos: hospederas que llevan en su interior el virus, transfiriendo a

las clulas hijas la unidad infecciosa, sin provocar la lisis.
 IMPORTANCIA DE LOS VIRUS EN
EL SUELO.
Es difcil determinar la importancia o ecologa de los virus en el suelo, ya
que los virus que atacan nunca son numerosos.

Solo se les atribuyen ciertas caractersticas como:

Regulacin de la poblacin de insectos.
Capacidad ltica, destruyendo las cepas bacterianas susceptibles.
Es posible que participen en la traduccin bacteriana.
 ENFERMEDADES.
Enfermedad de la seta comercial Agaricus bisporus.

Viris del mosaico del tabaco.

 REFERENCIAS
Teodoro Carrada Bravo. Avances recientes en el diagnostico de
laboratorio, histopatologa y epidemiologia en Mxico. 2012. disponible
en: http/www.mediagraphic.com
Departamento de microbiologa y parasitologa. UNAM. 2016
Marcelo A. Sagardoy. Biologa del suelo. Universidad nacional del sur.
http://edafologia.fcien.edu.uy/archivos/Practico%203.pdf
ftp://ftp.fao.org/fi/CDrom/FAO_training/FAO_training/general/x6706s/x670
6s07.htm
http://
www.funprover.org/formatos/manualTomate/Propiedades%20Fisica%20del
%20Suelo.pdf
http://www.biologia.edu.ar/fungi/micorrizas.htm