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Las sec. L3 y S7
Se determinaron las Se amplifico por PCR con
fueron transcritas a
secuencias 5y 3de 30 ciclos, con un T de
DNAc por el kit de
la PCR por el mtodo 94C X 1 min y 50C X 1
amplificacin
RACE. min
MARATHON
Una vez introducido en
Los fragmentos
E. coli XL-1 Blue, se Se realiz una
fueron clonados en el
seleccionaron clones subclonacin en el
vector pMosBlueT por
viables al azar y se vector pUC118 y se
TA clonning e
analizaron ambas secuenciaron S7 y L3
introducido en E. coli
secuencias.
Se llevo acabo un
alineamiento y un
anlisis filogentico por
CLUSTALW del DNA
Databank of Japan.
L3: 2,768 nucletidos, con una composicin de 30.7% A, 17.8% C, 24.4% G y 27.1% T, que
codifican a VP3, de 899 aminocidos y 103 kDa.
Comparte motivos con S7, 6 nucletidos en cada extremo: 5'-GTTAAA... Y ...ACTTAC-3
S7: 1,162 nucletidos con composicin 30.6% A, 19.7% C, 24.3% G y 25.4% T que
codifican a VP7, de 349 aminocidos y 38 kDa
VP3 y VP7
93% y 92%
Australia
80% y 81%
EEUU
El virus hemorrgico epizotico aislado de Japn, Australia y EEUU comparten
secuencias homologas altamente conservadas, pero a pesar de ello sus relaciones
genticas siguen siendo desconocidas.
Segn el estudio las otras protenas VP2 y VP5 son las mas variables en los Orbvirus
y no comparten relaciones filogenticas.
Las protenas internas de la cpside, especialmente VP7 que es importante para la
unin a la clula del insecto, es considerada importante para la inefectividad de
atacar sus clulas.
Se sugiere que las cepas de Australia y Japn son subtipos de la cepa EHDV-2 debido
al estudio filogentico.
La ubicacin geogrfica tan variada en la que estos virus fueron aislados supone una
variacin significativa en sus secuencias, a pesar de eso comparten motivos
conservados, as como un alto grado de homologa. Esto nos habla de la gran
adaptacin que pueden llegar a tener los virus y su complejos mecanismos de
accin.
Los estudios presentados pueden ayudar al desarrollo de una vacuna, debido a que
se conoce mejor su estructura y funcin de las protenas.
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