Biochimie i

Biofizica
Conf. Dr. Mihaela Badea
 Continutul disciplinei
Introducere in studiul biochimiei. Apa

Zaharide (Monozaharide, Oligozaharide,

Polizaharide)

Aminoacizi. Peptide. Proteine.

Enzime

Lipide si membrane

Acizi nucleici. Vitamine. Hormoni

 Continutul disciplinei

Lucrari practice
- Tehnici de laborator

+ Biofizica notiuni de teorie si

aplicatii practice
 Bibliografie
Coman Gh, Draghici C, Badea M., Bigiu N, Codrut
Ciurea, Biochimie Ilustrata, Editura Universitatii
Transilvania din Brasov, 2011
Coman Gh, Draghici C, Badea M., Bigiu N,
Codrut Ciurea, Biochimie Descriptiva, Editura
Universitatii Transilvania din Brasov, 2009
Coman Gh., Badea M., Draghici C., Ciurea C.,
Virtosu A., Biochimie. Elemente de biochimie
descriptiva si energetica biochimica, 2005, Ed.
Univ. Transilvania, Brasov;
Coman Gh., Badea M., Draghici, C., Dumitrescu L.,
Tiut M., Biochimie. Reactii care se desfasoara in
organismele vii, Ed. Ermetic, Brasov, 2003
 Bibliografie
Coman Gh., Badea M., Draghici C., Biochimie
problematizata, Ed. Lux Libris, Brasov, 2000
S. Gocan, Gh. Coman, Imunochimie analitica, Ed
Lux Libris, Brasov, 19995
Thomas M. Devlin (Editor), Textbook of
Biochemistry with Clinical Correlations, Ed. Wiley-
Liss, Hoboken, 2006
N.V. Bhagavan, Medical Biochemistry, Harcourt
Academic Press, Burlington, 2002
 Examinare

Partial 1 40% - scris traditional

Partial 2 40% - scris traditional
Examen de laborator 20% - oral

OBS prezenta la laboratoare este

OBLIGATORIE
Chimia biologic sau biochimia
aplicaie a teoriilor chimiei organice n
studiul sistemelor vii.

unul din cele mai dinamice domenii din

ansamblul tiinelor contemporane, cu
implicaii profunde n diferite ramuri ale
biologiei teoretice i aplicate.
 Chimia biologic sau biochimia
tiina care studiaz materia vie i
fenomenele specifice
organizarea molecular,
compoziia chimic
corelaiile biomoleculelor componente i al
proceselor de transformare (degradare i
biosintez) a acestora, prin care se
genereaz i se utilizeaz energia necesar
manifestrilor vitale.
 Metabolism celular
Reaciile organice
sistem dinamic, continuu i interdependent la

nivelul celulei vii.

au loc ntotdeauna n ap (ca solvent),
sunt catalizate de enzime
se desfoar foarte rapid, dar controlat,
temperaturi apropiate de cea a camerei.

Suma tuturor acestor reacii reprezint

metabolismul celular i asigur pe de o
parte energia necesar funciilor vitale ct i
componentele celulare proprii necesare
pentru dezvoltare i regenerare.
 sistem viu un ansamblu de reacii
metabolice a cror coordonare este
asigurat prin mecanisme biochimice de
reglare i control.

bacterii primitive . om
acelai set de reacii i mecanisme chimice
servete pentru a produce funciile vieii n toate
organismele
moleculele fundamentale care parcurg aceste
ci metabolice se regsesc n toate speciile
Plante
energia (Soare)
substanele organice (sintez din CO2 i H2O)

Animale
moleculele (mediu) oxidare energia + CO2
energia legturilor chimice, moleculelor labile
travaliul muscular,
impulsurile electrice i nervoase,
percepia senzorial,
termoreglarea
sinteza moleculelor necesare creterii i multiplicrii
celulelor.
Biosisteme
structuri organizate n trepte, cu grade
diferite de complexitate: celule, esuturi,
organe, organisme, cu variaii taxonomice;
structuri spaio-temporale ritmicitate
cu frecvene bine determinate
structuri moleculare repetitive i
constituite pe principiul identitii
(concepie de baz a geneticii moderne);
Principiile organizrii structurilor
biologice
geometrii constructive de minim energie
scderea energiei libere i travaliu maxim
(chimic, osmotic, mecanic);
sistemele biologice sunt termodinamic
deschise i ireversibile;
complementaritatea i specificitatea
structurii biomoleculelor
Principiile organizrii structurilor
biologice
structuri discontinue (uniti de dimensiuni
bine definite) uniti structurale de nivel
superior de organizare;

diversitatea i complexitatea au la baz

economia i simplitatea
20 aminoacizi standard,
2 baze purinice
3 baze pirimidinice.
 Bioelemente
Macrobioelemente (99%)
C, O, H, N, P, S, Cl, Na, K, Ca, Mg
rol plastic structura substanelor din organism
celule i lichide biologice.
Oligobioelemente (microbioelementele)
rol important n moleculele biologic active:
enzime (Zn, Mn, Cu), hormoni (I) vitamine (Co)
hemoglobin i citocromi (Fe).
Ultramicrobioelemente
Ag, Ba, Be
 Biomolecule
glucide

lipide

aminoacizi - peptide-proteine

baze azotate nucleotide - polinucleotide

vitamine

hormoni

compui macroergici
 Rolul biomoleculelor
structural
catalitic
informaional
reglator
energetic

Interacii intra i inter-moleculare

ionice
covalente polare, nepolare, covalent-
coordinative

legturi de hidrogen,
van der Waals ->hidrofobe
 Legturi chimice
Legturi ionice (electrostatice)
formarea ionilor pozitivi si negativi
atracia electrostatic
Legturi covalente nepolare
nu exist diferene de electronegativitate
Legturi covalente polare
exist diferene de electronegativitate ntre
nemetale
Legturi covalent coordinative
de tip donor acceptor de perechi de electroni
Legturile covalente heteronucleare

proteine -C-N-C-

zaharide -C-O-C-

O
acizii nucleici
-C-O-P-O-C-
OH

mai puin stabile situsuri de clivare

chimic n procesele de degradare.
Legturile de hidrogen
interacii necovalente care se exercit
intramolecular sau intermolecular
natur electrostatic sarcini electrice
pariale de semn opus
for de tip coulombian
Legturile de hidrogen
energie 3-7 Kcal/mol

mai puternice dect legturile van der Waals

mai slabe dect cele covalente

direcionare spaial
Legturile de hidrogen
Legturile van der Waals
se manifest ntre doi atomi aflai la
distane cuprinse ntre (3-4)
sunt mai slabe (1Kcal/mol)
mai puin specifice
distribuia neuniform n timp, a sarcinii
electrice din jurul atomilor (asimetria
tranzitorie) asimetrie n distribuia
electronilor din jurul atomilor din apropiere.
Interaciile hidrofobe
tendina de grupare a moleculelor
nepolare n prezena apei.
se materializeaz prin eliminarea apei din
sistem
sunt nestoiechiometrice

Exemple
constituirea membranelor
interacii specifice enzim-substrat sau
antigen-anticorp.
 Apa. Sisteme apoase
Rolul apei
structural;
mediu lichid;
stabilizator al mediului biologic;
generator de ioni hidroniu i hidroxid necesari
pentru realizarea proceselor de tamponare, de
cataliz enzimatic i hidroliz;
efector direct al reaciilor de hidratare, hidroliz,
oxidare;
mediu de vehiculare a diferitelor substane
termoregulator.
Apa. Structur
structur angular
distane egale - 0,9584
unghiul de valen - 104,54o
2-
dipolul electric al apei

(sistem asimetric)
O
+ +
H H

2 legturi s ntre H s i O sp3

legturi de hidrogen intermoleculare
 Apa. Structur
ghea tetraedru prin intermediul
legturilor de hidrogen
la topire, se rup 15% din legturile de
hidrogen din cristalul de ghea,
la 40oC aproximativ jumtate din legturile de
hidrogen sunt distruse.

vapori moleculele de ap sunt libere,

nemaiexistnd legturi de hidrogen
intermoleculare.
 Solubilitatea n ap
Compui ionici
disociere
hidratarea ionilor
Compui neionici, dar polari
legturi de hidrogen cu moleculele apei
Compui nepolari, ce posed i grupri
polare
interacii hidrofobe HOH
micele (acizi nucleici, lipide, proteine)
hidrofil (lipofob)
hidrofob (lipofil) HOH
 Ionizarea apei
acid + e- baza
Lewis - schimb electroni:

Bronsted - schimb protoni: acid - H+ baza

+ -
caracter acid H2O H + HO
- +
H2O + A HA + HO

+ +
caracter bazic H2O + H H3O
+ -
H2O + HB H3O + B
Molecula apei prezint caracter amfoter
 Constanta echilibrului de disociere a apei
K
H HO

H2O
Produsul ionic al apei
K W H HO

10 14
mol / l
2 2

pH = - lg [H+] - Sorensen
pOH = - lg [HO-]
Pentru apa pur (250C; 1atm)
[H+]=[HO-]=10-7 mol/L
pH=pOH = 7
Sisteme apoase
apa nedisociat - concentraie molar
mare i constant
sisteme apoase conjugate acid-baz
HA + H2O H3O+ + A-
acid baza acid baza
conjugat conjugata

Sisteme tampon
mecanisme
- +
adaugare acid A +H HA
+ -
adaugare baza H3O + HO 2 H2O
Relatia Henderson-Hasselbach
- +
A +H HA
[A - ] [H ]
K
[HA]
[baza]
pH pK lg
[acid conjugat]
Punct de tamponare maxim
[baz] = [acid conjugat]
pH = pK
Titrarea unui acid slab cu o baz tare

CH3COOH + ( Na+ + HO- ) CH3COO- + Na+ + H2O

pH

E
7 C
( )
B D
A
0 0,5 1 Eq HO- / Eq H+
Titrarea acizilor polibazici
H3PO4, H2CO3

trepte de ionizare corespunztoare cedrilor

de protoni diferite - salturi de pH - puncte de
echivalen

intervale de tamponare - puncte de

tamponare maxim
 Reglarea valorilor de pH din
organismele vii
se realizeaz prin intermediul substanelor
dizolvate manifest caracter acido-bazic
constituie cupluri de tamponare,
n care acizii i bazele lor conjugate se opun
variaiilor de pH, atunci cnd substane cu
caracter acid sau bazic, rezultate din procesele
metabolice, ptrund n lichidele biologice
 Reglarea valorilor de pH din
organismele vii
Fluidele i electroliii din organismul uman se gsesc n
trei compartimente distincte, ntre care exist posibiliti
diverse de comunicare:
fluidul intracelular;
sngele i limfa din canalele vasculare;
fluidul interstiial din esuturile nevasculare.

Pentru sngele normal uman, intervalul fiziologic de pH

este 7,35-7,45.
Orice valoare a pH-ului n afara intervalului fiziologic,
pentru sngele uman, presupune existena unei stri
patologice, iar atingerea valorilor 6,8 sau 7,8 presupune
moartea individului.
Acidoza
Dac valoarea pH-ului sngelui scade sub 7,35

producerea excesiva de produi cu caracter acid la

nivelul esuturilor (acidoza metabolic)

eliminrea diminuata prin intermediul rinichiului a

metaboliilor cu caracter acid (acidoza renal).
 Acidoza metabolic
diabet, post prelungit, dehidratarea sever,

organismul utilizeaz proteinele proprii i

lipidele pentru obinerea energiei, n defavoarea
zaharidelor,

este datorat deficitului de bicarbonat (scderii

coninutului de dioxid de carbon plasmatic)
 Acidoza renal
se produce n sindromul clinic de uremie

apare datorit scderii funciei tubulare renale

ionul de hidroniu este reinut n circuitul

sanguin

n acidoza avansat se produc depresii

nervoase, come i poate surveni i moartea.
 Alcaloza
se instaleaz atunci cnd pH-ul sngelui depete
valoarea 7,45.

alcaloza se poate ntlni n ingestia excesiv a unor

medicamente cu caracter bazic sau dup vomele repetate.
alcaloza metabolic este datorat excesului de bicarbonat
(creterii coninutului dioxidului de carbon plasmatic).

n alcaloz, sistemul nervos central este neexcitat, se

instaleaz spasmul muscular, convulsiile i disfunciile
respiratorii.
 Determinarea pH-ului
aplicabilitate n biologie, oceanografie,
agricultur, industrie, MEDICINA
pH-ul sngelui este aproximativ constant
(soluie tampon) un pH mai acid poate s apar
datorit alimentaiei carnate sau n urma
eforturilor musculare accentuate. Un pH mai
bazic poate s apar n urma alimentaiei
vegetariene.
la pH 6,9 saliva este activ, iar la pH mai mic (4
uniti) este inactiv.
 Determinarea pH-ului
pH-ul mic al coninutului stomacal se explic
prin cantitatea de HCl existent la acest nivel.

n intestinul gros, pH-ul este cuprins n

intervalul 6-7, iar la finalul digestiei este practic
neutru.

pH-ul urinei variaz n intervalul 4,5 - 8, n

funcie de metaboliii eliminai.
14 soda caustica

13
12 amoniac

11

10

9 sapun

8
ocean
sange f iziologic (7,35 - 7,45)
7 saliva proaspat de vaca (6,5-6,6)
lapte
ploaie matern (6,8-6,9)
6
apa minerala
5
4
suc de portocale
3 vin, suc de lamaie

1 suc gastric

0 HCl