Ecologia Microbiana

ECOLOGA
MICROBIANA
Mara Cecilia Arango Jaramillo

Microbiologa del ambiente
o
Ecologa microbiana:
Estudio
de las interrelaciones entre los
microorganismos,
entre ellos con otros organismos
y con el ambiente que los rodea
Los microbios son las criaturas ms
minsculas en la tierra, pero tienen un
impacto enorme en nosotros y en
nuestro ambiente:
Estn en cualquier lugar de nuestro
entorno: suelo, agua y aire.
Son los que estn en mayor nmero y
poseen la mayor capacidad para
efectuar cambios en cualquier
ecosistema

La ecologa microbiana
es compleja debido a la
mltiples interacciones
de los microorganismos.

CARACTERSTICAS
DE LOS
ECOSISTEMAS
MICROBIANOS

Caractersticas de los ecosistemas microbianos:
Capacidad de los microorganismos para

transformar el ambiente
Adaptacin y mutacin de los microorganismos
Tamao del hbitat
Suministro de alimento
Diversidad de especies microbianas
Dinmica de poblaciones
Asociaciones microbianas en ecosistemas
Capacidad de los
microorganismos para
transformar el ambiente
La naturaleza y la gran magnitud de
las actividades metablicas de los
microorganismos

Producen importantes cambios en el
ambiente
Los microorganismos
Cambios que participan en el
iniciales: primer nivel de cambio

Transformacin del productos inadecuados
sustrato para su utilizacin
posterior

Agotamiento de
alimentos Otros microorganismos
los utilizan

Elaboracin de
productos finales reponen los nutrientes
Caractersticas de los microorganismos para
desarrollar su actividad de transformacin
ambiental:
rea grande en contacto con el sustrato

que facilita la accin enzimtica
(Volumen/rea)
Rpido ndice de desarrollo
Gran capacidad de los diferentes
microorganismos para degradar todos los
compuestos naturales en el ambiente

Adaptacin y mutacin
La supervivencia y el crecimiento de una
especie dentro de una comunidad
biolgica
requieren
Capacidad para ajustarse a las condiciones
ambientales cambiantes.

Los microorganismos se
Genotipo: La acomodan a los cambios
informacin temporales del ambiente
gentica de
cada individuo
Mediante la adaptacin
fenotpica:
Fenotipo:La
Respuesta del
expresin del
microorganismo a cambios
genoma
temporales
afectada por el
medio
ambiente Est limitada por el genotipo.

Las condiciones ambientales
determinan que diferentes
tipos genticos de
microorganismos puedan
competir con otros

Slo los mejor ajustados pueden
sobrevivir

Muchos microorganismos pueden crecer a lo
largo de una amplia gama de temperaturas.
Su efectividad metablica no es la misma a
las temperaturas extremas.
ptima La capacidad
adaptativa est
entre los
lmites del
genotipo.
Temperatura
Cuando sucece un cambio
fsico o qumico como:
Teminacin del alimento
Cambios drsticos de
temperatura o pH
La primera
Las condiciones se dejar su
hacen ms lugar a la
favorables para otra mejor
especie adaptada
Accin selectiva de los factores ambientales sobre
las poblaciones de microorganismos
Bacterias
Sucesin ecolgica
Ciliados vida libre
Zooflagelados
Fitoflagelados Ciliados fijos
Sarcodina
Suctoria
Tiempo
Predominio relativo de microorganismos de un lote de

desperdicios orgnicos (modificado de Pelczar, 1982)
La capacidad de un
microorganismo de
adaptarse al
La adaptacin puede ser:
ambiente es
hereditaria , pero el Evolutiva
estado fenotpico Fenotpica o fisiolgica
que resulta de la
adaptacin, puede
no ser heredado.

1. Adaptacin evolutiva
Esta adaptacin incluye los
cambios del genotipo por seleccin
Estos cambios se producen por:

Mutacin espontnea
Intercambio gentico bacteriano

Mutacin espontnea o inducida
Hay oportunidades El mutante es un

para un cambio en organismo cambiado
el genotipo como permanentemente.
resultado de una Si es capaz de
mutacin. prosperar en el
AAT G C AT T G C TA
ambiente, el mutante
se perpeturar, de
AAT G C AT T G C TA lo contrario perecer.
AAT G G AT T G C TA
Intercambio gentico bacteriano
Los cambios genotpicos en

las clulas tambin se efectan
por el intercambio de genes
bacterianos en la naturaleza
Transformacin
Transduccin
Conjugacin

Transferencia gnica mediante
transduccin.
Transduccin: un
bacterifago se adhiere a
una bacteria y le inyecta su
ADN
Se produce entre bacterias que viven en el

epiliton, o pelcula gelatinosa que recubre
las rocas sumergidas de los ros
Robert V.Mara Cecilia
Miller, Arango Jaramillo
Scientifican american,1998
Robert V.Mara Cecilia
Miller, Arango Jaramillo
Scientifican american,1998
Transferencia de plsmidos por
conjugacin
En las bacterias gram-
negativas, una clula
donadora establecen
contacto con una clula
receptora mediante un pili,
facilitando as el
acercamiento de las dos
bacterias
Se forma un puente (poro)
Robert V. Miller, Scientifican
amarican,1998 entre las dos clulas.
Robert V. Miller, Scientifican
amarican,1998

En la bacterias
gram-positivas la
conjugacin es
similar.
Pero, para atraerse,
las bacterias no
utilizan pili sino
seales qumicas.

Transferencia de genes por
transformacin
Las clulas absorben ADN libre liberado
por una bacteria muerta.
El ADN es atrapado e introducido por un
complejo protenico en la superficie de la
bacteria.
Enzimas degradan una de las dos cadenas
de la molcula.
La otra cadena puede acabar integrndose
en el cromosoma de la bacteria
Tambin
puede ocurrir
en bacterias
gram-
negativas a
travs de un
mecanismo
distinto.
Transformacin en una bacteria gram-positiva

Robert V. Miller, Scientifican amarican,1998
Robert V. Miller, Scientifican amarican,1998
http://193.146.205.151/web/articulos/articulos.htm
2. Adaptacin fisiolgica o fenotpica
Es la respuesta de los
organismos a los cambios
temporales
Esta adaptacin o ajuste

se da entre los lmites del
genotipo
En altas
temperaturas todos
los microorganismos
Ocurren en pierden sus flagelos
todos los y esta condicin
individuos de permanece por
una poblacin varias generaciones
expuestos al Cuando son
cambio incubados a
temperatura normal,
recuperan los
flagelos

Interacciones genoma - ambiente
Genoma fijo en ambiente variable
Genoma variable en ambiente fijo
Genoma variable en ambiente variable

Genoma fijo en
ambiente variable
La adaptacin en este Microorganismos

caso es fisiolgica o capaces de crecer en
fenotpica un medio mnimo a
temperatura moderada
Los microorganismos
deben adaptarse a la pueden crecer a
variabilidad de las temperaturas elevadas
condiciones para si se les proporcionan
sobrevivir factores de crecimiento
adicionales

Genoma variable
en ambiente fijo
Adaptacin gentica :
Los factores ambientales no cambian,
el genoma es el factor variable:
Por mutacin espontnea o inducida
Por intercambio gentico

Genoma variable en
ambiente variable
Es una adaptacin evolutiva

La supervivencia de los microorganismos
mejor adaptados a los cambios permiten
la seleccin de un genoma ms que otro.
Las mutaciones y el intercambio de
genes intervienen en la adaptacin
La naturaleza selecciona los mejor
adaptados
Dinmica de poblaciones
Un tipo de microorganismos prospera en

su ambiente
slo mientras las condiciones son
favorables
para su crecimiento y supervivencia.

Un cambio fsico o qumico:
agotamiento de nutrientes
cambio en el pH o temperatura
concentracin de oxgeno

hace las condiciones de crecimiento ms
favorables para otra especie

el organismo adaptado a las condiciones que
prevalecan antes,
cede su lugar a un organismo mejor adaptado a las
nuevas.
Las condiciones
ambientales tienen
efecto selectivo
sobre las
poblaciones
microbianas.

Tamao del hbitat
Son de diferentes tamaos:
Una laguna o un estanque
La rizosfera
Microhbitats dentro de ellos donde una
comunidad se establezca
La boca o los dientes de los animales
El rumen de los herbvoros
Un tronco cado
La localizacin y delimitacin de los hbitats
microbianos no siempre son fciles de precisar
Suministro de alimento
En los hbitats Los cambios en la
naturales la naturaleza qumica
cantidad de y en la composicin
alimento es mucho de los materiales
menor que en nutritivos tienen
medios de influencia selectiva
laboratorio en la microbiota

Como la Adems,
concentracin de una especie puede
nutrientes flucta, depender de otra
resultan alzas y para la transformar
bajas en el los sustratos en
desarrollo alimento disponible
o degradar
sustancias txicas

Diversidad de especies
microbianas
Los microbios nos rodean por todas

partes: aire, agua, suelo.
1 gramo de suelo frtil
contiene 1.000.000.000 microbios
miles de especies.

Muchos aos de
evolucin han
creado una
impresionante e
inimaginable
diversidad de
microbios.

A pesar de su abundancia:
La mayora de los tipos de microbios
siguen siendo desconocidos.
Se estima que conocemos menos
el de 1 % de las especie
microbianas en la tierra.
De ms de un milln de
especies de bacterias
que se sospecha que
existen, solo cerca de
4200 estn descritas.
Microorganismos en ambiente natural
raramente se encuentran en cultivos puros.
Las transformaciones qumicas realizadas

por consorcios de microorganismos no
pueden determinarse recopilando las
propiedades bioqumicas de cada
especie en cultivo puro

Esto se debe a ocurren varios tipos de
interaccin entre especies, que no se
dan en cultivo puro.
Asociaciones microbianas
en ecosistemas
Los microorganismos de un ecosistema

presentan asociaciones e interacciones :
Entre microorganismos
Entre microorganismos y de
organismos superiores.

Entre microorganismos diferentes:
Neutralismo, 0/0:
Dos organismos tan diferentes que no

compitan por alimento ni se inhiben
aunque ocupen el mismo espacio
Es muy difcil que dos poblaciones de
microorganismo que estn en contacto
ntimo no se afecten

Competencia, -/-:
Los organismos que se establecen el
mismo nicho ecolgico

Necesitan los mismos alimentos y
condiciones ambientales

tienen gran influencia entre s

El mejor adaptado predomina o elimina
completamente a los otros
Las colonias que en En las
una placa estn fermentaciones
muy juntas compiten lcticas al principio
por alimento y hay muchos tipos de
espacio bacterias pero al
final predominan
una o dos

En cobayos
Entamoeba
histolytica es
incapaz de producir
amebiasis clnica
cuando Escherichia
coli est presente

Antagonismo, +/-:
un caso de competencia?
Pseudomonas
Antibiosis: Una aeruginosa produce
mixobacteria aislada pigmentos que inhiben
de un estanque de la germinacin de
peces lisa muchas Aspergillus terreus
especies de algas
verdeazules Staphylococcus aureus
unicelulares o produce sustancias
filamentosas y otras antifngicas que causan
alteraciones e
bacterias.
hinchazn en las hifas
de Aspergillus terreus
Lactobacillus
produce y tolera
condicianes Escherichia coli y
marcadas de Staphylococcus
acidez aureus crecen bien en
cultivo puro pero
Otros
cuando crecen juntas,
microorganismos
S. aureus crece
no son capaces
menos, porque E. coli
de desarrollarse
tiene un tiempo de
en las
generacin ms corto
condiciones
y agota rpidamente
establecidas por
los nutrientes
los lactobacilos
El hongo Geotrichum
candidum

Metaboliza cido
lctico que si se
acumula

No permite el
crecimiento de otros
microorganismos

Mutualismo, +/+:
Simbiosis en que Cuando la relacin

ambos organismos no es obligatoria se
resulta benefiados le llama
cooperacin

Ambas
Intercambio de bacterias
alimentos entre crecen en
dos especies, simbiosis
sintrofismo:
Lactobacillus
arabinosus y
Streptococcus Lactobacillus
arabinosus
fecalis Streptococcus
fecalis
Incubacin en horas

Escherichia coli y
Saccharomyces Steeptococcus
cereviciae produce fecalis:
ornitina a partir de
Creciendo juntas
arginina
producen putrescina
Escherichia coli a partir de la
transforma la arginina
ornitina en
Separadas no la
putrescina
producen

Streptococcus cremoris y
Streptococcus lactis,
creciendo juntas producen
mayor cantidad de cido
lctico que cuando crecen
separadas

Thiobacillus ferroxidans y
Beijerinkia lactocogenes,
en simbiosis
Thiobacillus ferroxidans
cultivo puro
Beijerinkia lactocogenes
cultivo puro
Tiempo en horas
Produccin de metabolitos diferentes.

Thiobacillus ferroxidans y Beijerinkia
lactocogenes en la descomposicin de triturado
de metales sin fuente de nitrgeno y carbono
Aire
N2 O2 CO2
Triturado, mezcla y filtrado
S, P y huellas de metales
Bacterias fijadoras de N2 Bacterias fijadoras de CO2,

Beijerinkia lactocogenes Thiobacillus ferroxidans
Compuestos nitrogenados
Carbono orgnico

Proteus vulgaris y
Staphylococcus
aureus, fermentan La misma relacin
lactosa. se da entre
En cultivo puro Staphylococcus
Producen cido y no aureus y
producen gas Escherichia coli
Si crecen juntas
producen cido y
gas

Saccharomyces Las bacterias
cereviciae produce anaerobias
cido nicotnico productoras de
necesario para el metano le
crecimiento de proporcionan la
Proteus vulgaris materia prima
necesaria a las que
Las bacterias oxidan metano
hetertrofas producen
iones amonio
necesarios para
Nitrosomonas
Influenza porcina
slo se produce si
estn presentes
simultneamente:
Tarpeia suis (virus)
Haemophilus suis
(bacteria)

Lquen:
El hongo obtiene del alga productos
metablicos como glucosa y
alcoholes
El alga se beneficia de la capacidad
que tienen las paredes del hongo
para retener agua

Comensalismo, +/0:
Levaduras/bacterias
Cuando el medio tiene alta concentracin
de azcar las levaduras crecen pero no las
bacterias
Cuando los hongos han metabolizado parte
del azcar, el medio queda acondicionado
para que las bacterias se desarrollen
Las levaduras tambin producen vitaminas
favorables a las bacterias
Las
asociaciones
comensales
permiten el
desarrollo de
especies
anaerobias y
facultativas en
medios
aerbicos
Colonias de
Hemophilus cercanas
Staphylococcus a las de
aureus y Staphylococcus eran
Hemophilus ms grandes
influenzae fueron
tomadas de un frotis Staphylococcus
de garganta produca NAD que
aprovechaba
Hemophilus

Las bacterias Muchas bacterias
fotosintticas producen la enzima
productoras de penicilinasa
azufre:
Oxidan el H2S inactiva la penicilina
permitiendo el

desarrollo de
especies sensibles permitiendo el
a l. desarrollo de las
bacterias sensibles
Parasitismo, +/-:
Un organismo vive a El parsito depende

expensas de otro. del husped y vive
le roba a otro en contacto fsico y
organismo los metablico con l
nutrientes
El parsito se Eventualmente el
alimenta de las husped muere
clulas o lquidos
del husped
La bacteria Gram - Hongos que
Bdelovibrio parasitan hongos
bacteriovorus
Hongos que
Vive en el suelo y en parasitan algas
las aguas de
Los virus son
drenaje
parsitos de
Es hongos, algas y
extraordinariamente bacterias
mvil
Se pega a la clula
husped y la lisa
Depredacin, +/-:
Los protozoos se
alimentan de:
Muerte e ingestin
Hongos
de microorganismos
Algas
de una especie por
Bacterias
los de otra especie
Los hongos
mucilaginosos de
bacterias
Didinium depreda a
Paramecium

Interacciones de los microbios con plantas
y animales:
Interacciones Planta-Microbio
Simbiosis Mutualista: Rhizobium: convierte el
nitrgeno a una forma que puede ser utilizado
por las plantas.
Parasitismo: enfermedad
Interacciones Animal-Microbio
Simbiosis Mutualista: Microflora beneficica del
tracto instestinal de las termitas
Parasitismo: enfermedad
Importancia de
la ecologa
microbiana
Ecologa Global
Los microbios son el fundamento del
sistema Tierra (Gaia), porque son
responsables de la mayora de los
ciclos de elementos
Ciclos Geoqumicos Globales

Carbn
Nitrgeno
Hierro
Azufre
Desde un punto de vista global, las
bacterias juegan un rol muy
importante :
Son la base de los ciclos de reciclaje
de nutrientes y elementos del
ecosistema
Las algas y cianobacterias

contribuyen a la base energtica de
los ciclos mediante la fotosntesis

Si los microorganismos Qu papel
fueron los responsables desempean los
de la creacin de la microbios en la
atmsfera terretre tendencia al
calentamiento global?
Qu papel
desempean
los microbios
en el El Nio?

Ecologa humana
Somos huspedes de billones de
microbios que colonizan nuestro tracto
intestinal, nuestra piel, pelo, dientes.
El estudio de la microbiota humana

puede aclarar relaciones muy
complejas.
La colonizacin microbiana a veces nos
causa problemas cuando resulta en
enfermedad.

Aplicacin de ecologa humana: la
epidemiologa
La epidemiologa, tambin se aplica a

plantas cultivadas y animales
domsticos

Exobiologa
La vida existe en otra parte del

universo?
Si hay vida en otra parte en el universo,
probablemente es microbiana.
Noticia en 1996:
evidencia de
vida microbiana
en el pasado de
Marte.
Contina la
bsqueda para
detectar vida
ms all de
nuestro propio
planeta.

Mientras tanto, los
microbios
desempearn un
papel dominante en
la exploracin y
colonizacin del
espacio.

Reciclaje
Los microorganismos
reciclan la mayora de los
desechos orgnicos en
recursos reutilizables.

Los seres humanos han aprovechado la
potencia de los microbios para reciclar en varios
sistemas:
Tratamiento de desechos: Los microbios se utilizan

en el tratamiento de las aguas residuales para reciclar
nutrientes, recuperacin del metano y el control de
enfermedades.
Tratamiento de residuos animales: Los microbios
limpian los desechos producidos por los animales del
domsticos

Compostaje: Prctica de moda para
convertir las basuras de la cocina, las fincas,
las plazas de mercado, los mataderos, etc.,
en un abono rico para el suelo.
Aunque las lombrices han conseguido muy
buena fama por su contribucin al la
produccin de humus, los verdaderos obreros
de la humificacin son los microbios.
Compostaje municipal Miles de toneladas de
hojas, recortes de hierba y basuras orgnicas
son compostadas en grandes instalaciones
municipales.
Bioremediacin
La degradacin ambiental es una de las
peores amenazas a la que debe hacer
frente la humanidad.
Muchos problemas ambientales se pueden
curar por los microbios.

Las bacterias ms estudiadas han sido las
patgenas (particularmente para los
humanos y animales domsticos).
Sin embargo, muchas otras bacterias no

patgenas son del mayor inters
tecnolgico, por ejemplo aquellas que
participan en:
Depuracin de aguas servidas o industriales
Depuracin natural en ros, esteros o lagos
Descomposicin de orgnicos en el suelo y en
rellenos sanitarios (metanognesis)

Los microbios se utilizan para limpiar:
Bioremediacin de residuos txicos:

Uso de microbios para la limpieza de
residuos txicos.

Bioremediacin de Residuos
industriales y domsticos: las algas
para el tratamiento de aguas servidas en
lagunas (o pozos), permiten mantener
condiciones de oxgeno disuelto sobre el
valor de saturacin en agua en la fraccin
superior (menos profunda), donde
penetra la luz solar.

Bioremediacin derramamientos de
petrleo
Bioremediation Pesticidas

Indicadores de calidad ambiental:
La calidad y la productividad de las

aguas naturales estn relacionadas, en
gran medida, con su poblacin
microbiana
El aire limpio, sin polvo, tiene
relativamente pocos microorganismos

Los microorganimos
pueden utilizarse
como indicadores
La seguridad de la
de calidad ambiental
calidad ambiental
est ntimamente Indicador de calidad
relacionada con la microbiolgica de
flora bacteriana aguas es
presente. Escherichia coli, que
se relaciona con
contaminacin fecal

Microbiologa de la
alimentacin
Fertilidad de los suelos
Microbiologa de la
digestin
Conservacin de alimentos
y cosehas

Fertilidad de los suelos
Dependemos de los
cultivos para el sustento

y estas cosechas
dependen de suelos
sanos con su vida
microbiana equilibrada.
Mucha de la
protena que
comemos es el
resultado de la
fijacin bacteriana
del nitrgeno del
aire por microbios
tales como
Rhizobium.
Microbiologa de la digestin:
Los microbios se utilizan como probiticos,
un suplemento de la digestin que coloniza
los intestinos, previniendo la colonizacin
microbios causantes de enfermedad.
No son alimento.

Una enorme cantidad de
alimentos se pierde por:
El mal manejo de
Conservacin de alimentos procesados
alimentos y
El mal trato y la conta
cosehas
minacin de los
productos agrcolas y
pecuarios durante la
cosecha, el transporte el
almacenamiento y la
distribucin

Biotecnologa
Los microbios se utilizan como obreros
en la produccin de muchos
compuestos como:
Combustible Biochips del
ordenador
Minera
Productos
Biocontrol qumicos
Productos Ingeniera
farmacuticos gentica
Produccin del Combustible :
produccin del etanol para ser
usado como combustible para
automviles

Explotacin minera
Lixiviacin de metales de rocas
ricas en hierro por los
microbios.
El 5% del mineral de cobre del
mundo es producido bio-
lixiviando
El uranio se mina con la ayuda
de bacterias

Biocontrol : uso de microbios para
combatir parsitos y plagas.
Uso del Bacilo thuriengensis, una
bacteria que produce una toxina que
mata 40 parsitos del plantas

Biochips para Ordenadores
Los microorganismos se utilizarn en el
futuro para producir los
microprocesadores a base de protenas
con ms interruptores que los
microchips convencionales.

Ingeniera Gentica
Algunos microorganismos se utilizan
para llevar genes de unos organismos
a otros
Agrobacterium utilizada en la
ingeniera gentica de plantas.

Ingeniera gentica:
Microorganismos genticamente modificados
En los ltimos aos: El dominio de estos

Experimentos de campo
procesos permitir
con bacterianas reducir los riesgos
modificadas que conlleva la
genticamente liberacin de
Investigaciones sobre la microorganismos
transferencia de genes genticamente
entre bacterias en su modificados al
medio natural
entorno.
Hasta ahora, se ha demostrado que:
Las bacterias modificadas
genticamente suelen ser frgiles y
mueren con relativa rapidez.
No es probable, que sus genes gocen
de muchas posibilidades para
propasarse.

Productos Productos
farmacuticos qumicos
La bioingeniera de productos tiles

tales como antibiticos, suplementos
del alimento, y productos qumicos.
Producidos industrialmente a
gran escala por
microorganismos
seleccionados o modificados
genticamente
Estudios bsicos en
ciencias biolgicas
Como los microbios Fueron los primeros
son simples, seres vivos en la
proporcionan un tierra, hace 3700
modelo para millones de aos,
entender cmo ha mucho antes de que
evolucionado la plantas y animales
vida. multicelulares, que
se desarrollaron
hace 600 millones
de aos.
Los microbios se usan para estudiar la
ecologa, porque:
1. Las bacterias son pequeas

poblaciones grandes pueden ser estudiadas y
reproducidas rpidamente
2. Tienen realciones complejas:

Prooporcionan pistas de cmo funcionan los
ecosistemas complejos
En los ltimos tiempos,
la preocupacin por la calidad
ambiental ha tenido como efecto
un mayor inters por la
ecologa microbiana

El estudio de la ecologa microbiana
puede ayudarnos a mejorar nuestras
vidas va el uso de microbios en:
La restauracin ambiental
La produccin del alimento

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Mara Cecilia Arango Jaramillo

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Capacidad de los microorganismos para

rea grande en contacto con el sustrato

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Ciliados vida libre

Fitoflagelados Ciliados fijos

Predominio relativo de microorganismos de un lote de

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Estos cambios se producen por:

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Hay oportunidades El mutante es un

Los cambios genotpicos en

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Se produce entre bacterias que viven en el

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Transformacin en una bacteria gram-positiva

Esta adaptacin o ajuste

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La adaptacin en este Microorganismos

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Es una adaptacin evolutiva

Un tipo de microorganismos prospera en

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Los microbios nos rodean por todas

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Las transformaciones qumicas realizadas

Los microorganismos de un ecosistema

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Dos organismos tan diferentes que no

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Simbiosis en que Cuando la relacin

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Produccin de metabolitos diferentes.

Bacterias fijadoras de N2 Bacterias fijadoras de CO2,

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Un organismo vive a El parsito depende

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Ciclos Geoqumicos Globales

Las algas y cianobacterias