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Modelos cinticos de

formacin de producto
qumicamente
estructurado
El organismo debe sintetizar todos los productos qumicos
necesarios para operar, mantener y reproducir la clula.

Se investigaron la cintica, la energtica, y el control de las


vas bioqumicas principales para tales sntesis.

Un requisito previo necesario para este tipo de estudios es la


familiaridad con los reactivos, productos, catalizadores y
controladores qumicos que participan en la red de
reacciones de la clula.

Las reacciones qumicas que implican tales compuestos son


catalizadas por catalizadores biolgicos.

Al controlar tanto el nmero y el tipo de enzimas que


contiene la clula, la clula regula tanto el tipo como la
velocidad de las reacciones qumicas que ocurren dentro de
ella.
Cultivo en lote de Claviceps purpurea para la produccin de alcaloides

Peso seco
(g/L)

o Produccin
total de
alcaloides
(mg/L)
Modelo cintico para el crecimiento
y formacin de producto en lote
Crecimiento

Teissier lisis celular

Fosfato
extracelular

Fosfato
intracelular

Formacin de producto
Valores de los parmetros para el modelo cintico estructurado de
produccin de alcaloides por C. purpurea
MODELO GENTICAMENTE
ESTRUCTURADO
Balance de materia del ARNm [moles/unidad de volumen
celular] obtenido por transcripcin del gene G

kp es la constante global de la velocidad de transcripcin,


kd es la constante de la velocidad de desactivacin y/o destruccin del ARNm,
h es la eficiencia de la utilizacin del promotor

Balance de materia para la concentracin intracelular


del producto de la traduccin (la protena de inters)

x es la eficiencia de utilizacin del ARNm en los ribosomas


Para el crecimiento balanceado, las derivadas en el
tiempo de [ARNm] y [P] son cero.

Las dos ecuaciones algebraicas resultantes puedes ser


usadas para obtener:

Esta ecuacin expresa la concentracin del producto


intracelular directamente en trminos de parmetros
que caracterizan la expresin gnica y el ARNm y la
estabilidad del producto en la clula.
Valores de los parmetros para la cintica de expresin gnica en
E. coli
En muchos casos las velocidades de expresin gnica en
E. coli son limitadas a nivel de transcripcin.

La velocidad de expresin de un gen regulado por un


operador depende de la eficiencia de la transcripcin de
ese gen que a su vez est determinada por las
interacciones de las especies moduladoras en los sitios
del operador y la unin de la ARN polimerasa.

Consideremos el promotor-operador lac de E. coli, y nos


centraremos en la influencia del represor lac, el
inductor, y las interacciones del ADN sobre la expresin
gnica, y por lo tanto la actividad de la b-galactosidasa.
La cantidad de enzima producida es proporcional a la
eficiencia h de utilizacin del promotor que a su vez es
proporcional a la probabilidad de que el sitio O del
operador no est unido a la protena represora R.

[O]0 es la concentracin total de sitios del operador en


la clula de E. coli.
Se tienen en cuenta las siguientes interacciones entre R,
O, otros sitios de unin no especficos sobre ADN
designados D, y el inductor I, todos los cuales se
presume que estn en el equilibrio.
|Las especies de O pueden existir entres formas diferentes as que se
tiene un balance general

Similarmente, un balance general en R

La concentracin de sitios de unin no especficos D sobre el ADN


es mucho mayor que la concentracin total de R, podemos asumir
que
Encontramos que:

La Informacin experimental a partir de la literatura nos


provee los valores de los parmetros:

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