ESTRUCTURA DE GENOMAS VIRALES

La composicin y estructura de genomas virales son ms

variados que aquellos vistos en los tres reinos Archaea ,
Bacteria y Eucarya

Existen solo siete estrategias de replicacin de los genomas

virales para miles de virus conocidos, esto implica unidad en la
diversidad viral.

Todos los virus con genomas RNA deben codificar ya sa, una
RNA Polimerasa Dependiente de RNA, para sintetizar RNA de
un templado de RNA, o una Transcriptasa Reversa para
convertir el RNA viral en DNA.
Que informacin es codificada en un genoma viral?

Productos gnicos y seales reguladoras requeridas para:

Replicacin del genoma
Eficiente expresin del genoma
Ensamble y empaquetamiento del genoma
Regulacin del ciclo de reproduccin
Modulacin de las defensas del huesped
Diseminacin a otras clulas
Informacin no contenida en genomas virales:
Genes que codifican para la maquinaria de sintesis de
protenas (excepto virus gigantes)
Genes que codifican proteinas del metabolismo
energtico o biosntesis de membranas
Telomeros (para mantener genomas) o centromeros
(para asegurar segregacin de genomas)
Estructura y expresin de genomas de DNAdc: (A) Sntesis (B a E)
Configuraciones de los Genomas.
Ori, origen de replicacin; ITR, repeticin terminal invertida;
TP, protena terminal; L, regin larga; S, regin corta;
UL, US, regiones nicas larga and corta;
IRL, larga regin de secuencia repetida interna;
IRS, corta regin de secuencia repetida interna;
TRL, larga regin de secuencia repetida terminal;
TRS, corta regin de secuencia repetida terminal;
OriL, origen de replicacin de la regin larga;
OriS, origen de replicacin de la regin corta.
Los virus de DNA del VII grupo de Baltimore. Dado que su genoma de DNA con gap est
parcialmente de doble hebra, los vacos deben ser llenados para producir dplex perfecto. este
proceso de reparacin debe preceder a la sntesis de mRNA debido a que la RNA polimerasa del
husped puede transcribir slo si la doble cadena de DNA est complerta. El genoma de DNA con
gap (inusual) se produce a partir de una plantilla de RNA por una enzima codificada por el virus,
la transcriptasa inversa.

Estructura y expresin de genomas virales de DNA de doble cadena con gap. (A)
Sntesis (B) Configuracin de el genoma de hepadnavirus
.
 Se conocen siete familias de virus contienen genomas de DNA de cadena:
Anelloviridae , Circoviridae y Parvoviridae incluyen virus que infectan
vertebrados.

Estructura y expresin de genomas virales de DNA de cadena sencilla. (A)

Sntesis. (B, C) Configuraciones de los genomas.
Genomas RNA
Las clulas no tienen RNA polimerasas-RNA
dependientes. Unos virus con genomas RNA
codifican RNA polimerasas-RNA dependientes que
producen RNA de templados de. Otros (retrovirus)
transcriben el genoma de RNA a DNA de doble
cadena con una transcriptasa inversa viral, los
RNA mensajeros se transcriben a partir de este
con una RNA polimerasa del husped
Aunque el RNAdc contiene una cadena +, esta forma parte del duplex y no puede
traducirse. La cadena negativa es el templado para la sintesis de RNA
mensajeros. Los RNA sintetizados son encapsidados y son templado para la
sintesis de la doble cadena.

Estructura y expresin de genomas virales de RNA de doble cadena. (A) Sntesis

de genomas, RNAm y protenas. (B) Configuracin de los Genomas.
 RNA cadena positiva
Los virus de RNA con cadena positiva son los ms abundantes del planeta. La
genoma de RNA cadena positiva puede ser traducido directamente en los
ribosomas del huesped.

Estructura y expresin de genomas virales de RNA de cadena. Sencilla de polaridad

positiva. (A) Sntesis de genomas, RNAm y protenas. (B) Configuracin de los
Genomas. UTR, regin no traducida.
Cadena RNA de polaridad positiva con DNA intermediario
En contraste con los otros virus con RNA de cadena sencilla de polaridad positiva, el genoma de
RNA de los retroviruses es convertido a DNA de doble cadena intermediario por la DNA
polimerasa RNA dependiente viral (transcriptasa reversa). Este DNA servir como el templado para
la sntesis de RNAm y el genoma de los nuevos viriones por la RNA pol celular.

Estructura y expresin de genomas virales de RNA de cadena sencilla de polaridad

positiva con intermediario de DNA. (A) Sntesis de genomas, RNAm y protenas. (B)
Configuracin de los Genomas.
Virus con genoma RNA cadena negativa
El RNA de cadena negativa no puede ser traducido directamente en los ribosomas del huesped, debe ser
primero copiado para sintetizar la cadena positiva. No hay enzimas en la clula que puedan sinttizar
RNAm a partir del genoma RNA viral. Estos viriones contienen una RNA polimeras-RNA dependiente. El
genoma tambien es templado para la sintesis de cadenas positivas de todo lo del genoma el cual a su
vez es templado para la sintesis de genomas (RNA-). Los genomas de ciertos virus RNA de cadena
negativa (miembros de los Arenaviridae y Bunyaviridae ) son ambisentido:

Estructura y expresin de genomas virales de RNA de cadena sencilla de polaridad negativa. (A)
Sntesis de genomas, RNAm y protenas. (B) Configuracin de los Genomas.
Los genomas virales tienen el potencial de adoptar increbles estructuras
secundarias y terciarias en el que los nucletidos pueden participar en interacciones
de larga distancia.

(A) Representacin lineal de un genoma de RNA de picornavirus. UTR, regin no traducida. (B) interacciones
RNA-RNA a larga distancia en un genoma de virus RNA de plantas. El genoma viral de 4252 nucletidos se
muestra con estructuras secundarias de RNA en el extremo 5 y 3 terminal. Las secuencias de pares de bases que
se muestran en azul (necesario para frameshifting de RNA) y en rojo (necesario para traer los ribosomas del
extremo 3 al extremo 5).
 Las secuencias y estructuras cerca de los extremos de los genomas virales
son a menudo indispensable para la replicacin viral. Por ejemplo,
las secuencias de DNA en los extremos de los genomas de parvovirus forman
estructuras en forma de T que se requieren para el cebado durante DNA
Sntesis.
Las protenas unidas covalentemente a extremos 5, secuencias invertidas y Repetidas en
tndem, y tRNAs tambin puede participar en la replicacin de genomas RNA y DNA. ITR,
repeticin terminal invertidaTP, protena terminal; PBS, sitio de unin al primer
Estructuras de RNA secundarias puede facilitar la traduccin (el sitio de entrada al
ribosoma interno [IRES] de los genomas de picornavirus) y empaquetamiento del genoma
(la seal de empaquetamiento estructurado de genomas retrovirales). IRES, sitio de
entrada interno del ribosoma; TAR, elemento de respuesta de activacin en trans;
DIS, sitio de iniciacin de dimerizacin; DLS, estructura de ligamiento al dmero.
El genoma compacto de la mayora de los virus hace
incorrecto el dogma "un gen, un mRNA ". Tcticas
extraordinarias para recuperar informacin, tales como la
produccin de mltiples RNAm subgenmicos, splicing de
RNAm, edicin de RNA, y unidades de transcripcin anidadas,
permiten la produccin de mltiples protenas a partir de un
genoma viral simple.

Una mayor expansin de la capacidad de codificacin del

genoma viral se consigue mediante mecanismos
postranscripcionales, tales como la sntesis de poliprotena,
scanning de fallas, supresin de la terminacin, y
frameshifting ribosomal.

En general, cuanto menor el genoma, mayor es la compresin

de la informacin gentica.
Adenovirus Multiples RNA mensajeros subgenmicos

Hepadnavirus
 Paramixoviridae

Rabdoviridae
 Splicing alternativos

Orthomixoviridae

Polyomaviridae
Retroviridae
 Sntesis de poliprotena

Flaviviridae

Picornaviridae
 Sntesis de poliprotena

Togaviridae

Retroviridae
 Informacin en ambas cadenas

Polyomaviridae

Adenoviridae
 RNAm anidados

Coronavirus
Parvovirus