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Y ENZIMAS
Tema 12
Introduccin
Reaccin metablica
Cualquier reaccin que tenga lugar entre las
biomolculas presentes en un organismo
Metabolismo
Conjunto de procesos qumicos que se
producen en la clula catalizados por enzimas y que
tienen como objetivo la obtencin de materiales y
energa para sustentar las diferentes funciones vitales.
Metabolismo
Es el conjunto de reacciones
qumicas que se realizan en el
interior de las clulas.
Las reacciones metablicas
estn encadenadas, de forma que
el producto de una reaccin es el
sustrato o metabolito de la
siguiente.
Cada uno de los conjuntos de
reacciones encadenadas que
constituyen el metabolismo se
denomina va o ruta metablica.
Las rutas metablicas pueden ser:
lineales, ramificadas y cclicas.
Introduccin
El metabolismo puede ser de dos tipos:
o Anabolismo
Tiene como finalidad obtener sustancias orgnicas
complejas a partir de sustancias ms simples con y un gasto
de energa. Son reacciones de sntesis.
o Catabolismo
Conjunto de procesos por los que las molculas
complejas son degradas a molculas ms simples. Son
reacciones degenerativas y generan energa.
Introduccin
Anabolismo y catabolismo
Las rutas metablicas que consumen energa para llevar a cabo la sntesis de
biomolculas orgnicas complejas a partir de molculas ms simples reciben el nombre
de anabolismo o vas de biosntesis.
Las rutas metablicas que rompen y degradan biomolculas orgnicas para la obtencin
de energa til para las actividades celulares, constituyen el catabolismo o vas de
degradacin.
Introduccin
Por la forma de obtener los materiales
o Auttrofos
Utilizan como fuente de materia sustancias inorgnicas para sintetizar
sus compuestos orgnicos, Vegetales verdes y muchas bacterias,
o Hetertrofos
Utilizan como fuente de materia sustancias orgnicas para fabricar
molculas orgnicas. Animales, hongos y muchas bacterias.
13/12/2017
Vitamina A
Accin fisiolgica (funcin):
-Es antioxidante, ya que elimina radicales libres y protege al
ADN de su accin mutgena y frena el envejecimiento
celular.
-Protege y mantiene los tejidos epiteliales (piel, mucosas,..)
Vitaminas liposolubles
Vitamina D
Calciferol o Antirraqutica
oSirve para la absorcin de nutrientes como el calcio y las
protenas.
Vitamina D
Calciferol o antirraqutica.
Es un esteroide con cuatro
formas moleculares, las ms
importantes D2 y D3
Fuentes: Provitaminas vegetales:
ergosterol o por el colesterol y los
baos de sol. Tambin en
alimentos: leche, huevos,
pescados azules
Vitamina D
Accin fisiolgica (funcin):
-Regula la absorcin intestinal de calcio (Ca) y fsforo (P); la concentracin de stos
bioelementos en la sangre, y por tanto, la estabilidad y formacin sea.
Exceso:
-Trastornos digestivos (vmitos, diarreas,..) y calcificaciones en el rin, hgado,
corazn, etc
Vitaminas liposolubles
Vitamina E
Tocoferol o restauradora de la fertilidad
oEsta vitamina participa en la formacin de glbulos rojos, msculos y
otros tejidos. Se necesita para la formacin de las clulas sexuales
masculinas y en la antiesterilizacin.
oTiene como funcin principal participar como antioxidante,
Enzimas
estrictamente
proteicos
Cofactor orgnico
Cofactor inorgnico (COENZIMA): ATP,
(Mg 2+, Zn 2+) NADP+, FAD, CoA,
vitaminas
Propiedades de las
enzimas
Mismas que las protenas
Desnaturalizan (pH, T, concentraciones salinas)
Alto grado de especificidad. Sustrato y Reaccin
Sobre un determinado tipo de sustrato. Especificidad
absoluta
Con respecto a un grupo funcional. Esterasas
Especificidad de reaccin
Para cada tipo de reaccin qumica existe una enzima diferente
Catalizadores
No se consumen
Necesidades bajas
Cantidades mnimas pueden transformar grandes cantidades de
sustrato
Reaccin NO acoplada
Reaccin acoplada
Transferencia de energa
Hay dos formas bsicas de transferencia de energa en los procesos metablicos.
1. Mediante la transferencia de electrones, en las reacciones redox. A veces hay tambin
transferencia de tomos de hidrgeno, ya que esto supone tambin transferencia de
electrones.
Estado de transicin
Estado inicial
Variacin global
de energa libre
en la reaccin
Avance de la reaccin
Grfica de la energa de activacin
QU LES CARACTERIZA?
1. Disminuyen la EA, acelerando la velocidad de la reaccin
2. No modifican el estado de equilibrio de una reaccin.
3. Se recuperan al final de la reaccin.
4. Actan en cantidades muy pequeas.
5. Presentan elevado peso molecular
6. Son protenas globulares (solubles en agua), excepto ribozimas
(tipo de ARN con capacidad cataltica)
7. Son especficas para cada sustrato
8. Sufren desnaturalizacin
Enzima - Catalizador
Tanto la enzima como el catalizador
aceleran la velocidad de una reaccin
qumica.
Una enzima puede transformar 1000
molculas de sustrato/ segundo
Las enzimas tienen 3 propiedades que los
catalizadores NO tienen
o Especificidad por el sustrato
o Se inactivan por desnaturacin
o Pueden ser reguladas
Las etapas de reaccin
enzimtica
La accin catalizadora de las enzimas consiste en rebajar la energa de
activacin para llegar fcilmente al estado de transicin y permitir que
la reaccin se lleve a cabo. La reaccin catalizada se lleva a cabo en
tres etapas:
1. El sustrato se une a la apoenzima, en el centro activo, formando el
complejo enzima-sustrato. Esta unin se explica segn la teora del
ajuste inducido. Es una etapa reversible y la ms lenta.
2. Formado el complejo enzima-sustrato, la coenzima lleva a cabo la
reaccin y se obtiene el producto final. Esta etapa es rpida e
irreversible.
3. El producto se libera del centro activo y la apoenzima queda libre
para volver a unirse a nuevas molculas de sustrato. La coenzima
puede liberarse intacta o liberarse quedando modificada
Es en el centro activo donde se
produce la reaccin catalizada
La unin E y S se
produce a travs del
centro activo o Los enzimas inducen modificaciones a los
cataltico sustratos a los que se unen, ya sea por
ruptura, formacin o redistribucin de sus
enlaces o introduccin o prdida de algn
grupo funcional
Se conocen ms de 2.000 enzimas diferentes,
capaces de realizar una reaccin qumica
especfica. Pero no hay ninguna clula que
contenga todas las enzimas conocidas, sino que
diferentes de clulas contienen diferentes tipos
de enzimas.
Las etapas de reaccin
enzimtica
1. Se forma un complejo: Enzima-coenzima-substrato
2. Los restos de los aa que configuran el centro activo
catalizan el proceso. Para ello debilitan los enlaces
necesarios para que la reaccin qumica se lleva a
cabo a baja temperatura y no se necesite una
elevada energa de activacin.
3. Los productos de la reaccin de separan del centro
activo y la enzima se recupera intacta para nuevas
catlisis.
4. Las coenzimas colaboran en el proceso; bien
aportando energa (ATP), electrones (NADH/NADPH) o
en otras funciones relacionadas con la catlisis
enzimtica.
Mecanismo de reaccin
Centro activo
enzimtica
Las enzimas tienen una concavidad llamada centro activo o centro cataltico.
Est formado por unos determinados segmentos de la cadena de aminocidos de la
enzima (E) que determinan una superficie tridimensional complementaria a la
molcula del reactivo o sustrato (S).
El centro activo se une al sustrato mediante interacciones dbiles: inicas,
hidrofbicas o por puentes de hidrgeno, formndose as el complejo enzima-
sustrato (ES).
E + S ES E + P
Esta unin cambia el sustrato y el complejo enzima-sustrato (ES) se transforma en el
complejo enzima-producto (EP). A continuacin se separan la enzima y el producto
(P). El sustrato se uneal centro activo de la enzima mediante
enlaces dbiles: puentes de hidrgeno e interacciones
electrostticas, hidrofbicas y de van de Waals.
Sustrato
+
O HO
O HN
Enzima
Mecanismo de reaccin
enzimtica
Centro activo
Entre el centro activo y el sustrato debe existir una complementaridad estrica,
es decir, que si el sustrato es voluminoso, el centro activo suele ser una cavidad
con suficiente capacidad.
En un principio se pens que el sustrato encajara en el centro activo como
una llave encaja en la cerradura, pero en la actualidad se prefiere admitir la
hiptesis de Koshland, segn la cual el centro activo, que posee de antemano
una cierta complementariedad con el sustrato, se adapta totalmente a l
despus de un primer contacto.
La hiptesis de Koshland, se conoce como ajuste inducido, y tiene en cuenta
la flexibilidad conformacional de las protenas.
glucosa
fructosa
Complejo enzima-s us trato Complejo enzima-produc to
Sustrato Enz ima Produc to Enz ima
(s ac arosa) (s ac arasa)
Mecanismo de reaccin
enzimtica
Centro activo
En las holoenzimas, el cofactor interviene algunas veces en la unin del
sustrato, pero fundamentalmente lo hace en la fase cataltica.
Cintica enzimtica
Al aumentar la concentracin de sustrato, tambin aumenta
la velocidad de la reaccin. Sucede mientras quedan
enzimas libres.
Llega un momento en que, aunque la concentracin de
sustrato sigue aumentando, la velocidad no vara. Se alcanza
una velocidad mxima que no es posible superar. Ocurre
cuando no quedan enzimas libres.
La constante denominada de Michaelis-Menten o KM se
define como la concentracin de sustrato para la cual la
reaccin alcanza la velocidad semimxima (mitad de la
velocidad mxima). es caracterstica de cada enzima y
cuanto menor sea su valor, mayor afinidad tendr la enzima
por el sustrato, ya que se alcanza antes la velocidad
semimxima.
Cintica enzimtica
Cintica enzimtica
Las enzimas no se consumen durante las
reacciones metablicas. Este hecho permite que
dichas reacciones sean eficaces y sus velocidades
altas aunque la concentracin de la enzima sea
mucho menor que la del sustrato.
A diferencia de lo que ocurre con los catalizadores
no biolgicos las enzimas presentan saturacin por
el sustrato: la velocidad de una reaccin
enzimtica no crece linealmente con la
concentracin de sustrato sino que tiende
asintticamente a un lmite denominado velocidad
mxima.
La velocidad mxima se alcanza cuando
prcticamente toda enzima est en forma ES.
A la [S] que corresponde a una velocidad =
Vmax/2 se le llama Km.
La Km es una medida de la afinidad de la enzima
por el sustrato:
una Km baja indica gran afinidad.
una Km alta, supone poca afinidad.
Cintica enzimtica
Vmx
Velocidad de reaccin
ALTA
concentracin de
sustrato
SATURACION
Relacin entre Km y Vmax
Vmax
Michaelis y Menten
Velocidad de la reaccin (v)
Vmax/2
Vmax/2
v
100
Vmax
80
60
Vmx s
v
40 Km s
20
s
0
0 20 40 60 80 100
Km
Factores que influyen en
la velocidad de reaccin
Efecto de la concentracin de substrato
. . . .
v
.
.
.
.
[s]
Factores que influyen en la
velocidad de reaccin
Temperatura
La actividad enzimtica depende de la temperatura. En general, todas las
constantes cinticas aumentan con la temperatura, por lo que las reacciones
qumicas suelen acelerarse al aumentar sta.
En las reacciones enzimticas se da tambin este efecto, pero con una
particularidad: puesto que la estabilidad trmica de las protenas es limitada, si la
temperatura aumenta por encima de un determinado valor, la velocidad comienza a
disminuir. Esto se debe a la desnaturalizacin trmica de la enzima.
Las enzimas tienen una temperatura ptima, aqulla en que se da el mximo de
actividad.
Factores que influyen en la
velocidad de reaccin
pH
La actividad enzimtica tambin depende del pH. Normalmente, aunque hay
excepciones, la actividad vara siguiendo una curva acampanada, lo que se
traduce tambin en que la enzima tenga un pH ptimo de actuacin.
Aunque ese pH ptimo suele estar entre 5 y 8, en algunos casos se aparta bastante
de esos valores.
Factores que influyen en la
velocidad de reaccin
Efecto de la
temperatura
Cada enzima
Aumento de la Desnaturacin tiene una
temperatura
Velocidad de reaccin
Efecto del pH
Temperatura
ptima
El inhibidor se une
irreversiblemente a
determinados grupos del
centro activo y anulan su
capacidad cataltica. Ejemplo
los insecticidas
organofosforados son
inhibidores de la
enzimaacetilcolinesterasa
Inhibicin enzimtica.
Inhibidores reversibles
(a) El inhibidor se fija al centro activo de la enzima libre,
impidiendo la fijacin del substrato: Inhibicin
Competitiva
Con inhibidor
Km Km
Sin con
inhibidor inhibidor
Inhibicin no competitiva
Se une a un lugar diferente del sitio activo de la
enzima
La unin modifica la estructura de la enzima
Se une a la enzima libre y tambin al complejo
enzima-sustrato
Por accin del inhibidor disminuye la Vm pero el
valor de Km no se altera
Inhibicin no competitiva
Inhibicin no competitiva
Inhibicin no competitiva
El inhibidor NO competitivo se une a la enzima en un sitio diferente del sitio
activo
Inhibicin competitiva Inhibicin no competitiva
Lineweaver-Burk
Alosterismo
Constituye un sistema de regulacin enzimtica
sumamente preciso.
Las enzimas alostricas:
Estn formadas por varias subunidades y poseen varios
centros de regulacin. Estructura cuaternaria.
Adoptan dos conformaciones distintas, llamadas estado
R (en la que la afinidad por el sustrato es alta) y estado T
(en la que dicha afinidad es baja).
Existe un efecto cooperativo entre las subunidades, de
modo que la activacin o la inhibicin de una de ellas
provoca el mismo efecto en todas las dems
Su cintica es diferente a la del resto de las enzimas.
Alosterismo
Alosterismo
En las rutas metablicas hay una enzima,
generalmente la que cataliza la primera
reaccin, que controla la velocidad de
toda la ruta.
Estas enzimas reguladoras son capaces de
aumentar o disminuir su actividad
cataltica en respuesta a determinadas
sustancias moduladoras. Gracias a esto,
las necesidades de las clulas se atienden
continuamente. En este grupo se incluyen
las enzimas alostricas.
Las enzimas alostricas (alos = otros, stereo
= sitio, espacio) adems del centro activo
(o de los centros activos) poseen uno o
ms sitios alostricos, que son especficos,
a los que se unen las molculas de los
moduladores.
Enzimas alostricas
Estos moduladores pueden ser activadores
o inhibidores de la actividad enzimtica.
Alosterismo
Con frecuencia, los activadores de las enzimas alostricas son molculas del sustrato
de la enzima y los inhibidores molculas del producto final de la ruta bioqumica. Por
supuesto hay tambin otras molculas moduladoras.
Hay enzimas alostricas que slo pueden ser activadas, otras que slo admiten la
inhibicin y otras que son susceptibles de ambos tipos de modulacin.
S + E ES E + P A + E AE C + E// B + E D + E
Producto C Producto D
A + B + E ABE CDE C + D + E
Nomenclatura
Hay enzimas que conservan la denominacin inicial, como las enzimas
digestivas tripsina y pepsina.
En numerosos casos de nombre de las enzimas consta del sufijo -asa
precedido del nombre del reactivo o sustrato de la reaccin, como, por
ejemplo, ureasa o sacarasa,
En otros casos se nombran en funcin del tipo de reaccin, como las
hidrolasas que llevan a cabo reacciones de hidrlisis.
Actualmente se nombran con el nombre del sustrato (o sustratos) al que se le
aade el de la accin qumica realizada, como por ej. lactato
deshidrogenasa.
Nomenclatura
Nombre sistemtico:
Grupo transferido
Grupos qumicos
Nmero Enzyme Commission:
Enzyme
Comission
EC 2.7.1.1 Enzimas
Grupo Subgrupo
EC 1.x Oxidorreductasas
EC 2.x Transferasas
EC 3.x Hidrolasas
EC 4.x Liasas
EC 5.x Isomerasas
EC 6.x Ligasas
Nomenclatura
Grupo 1: Oxidorreductasas
Catalizan reacciones de oxidorreduccin, en que tomos de oxigeno hidrogeno son
trasladados entre molculas:
AH2 + B A + BH2
En las reacciones redox, siempre tienen que estar presentes a la vez el aceptor y
el dador electrnico.
Nomenclatura
Grupo 2: Transferasas
Catalizan reacciones de transferencia de tomos grupo de tomos
entre molculas:
A-X + B A + B-X
A=B + X-Y AX + BY
Nomenclatura
Grupo 5: Isomerasas
Catalizan reacciones de isomerizacin moleculares
A B
Ejemplo:
Glucosa isomerasa (EC 5.3.1.5)
Nomenclatura
Grupo 6: Ligasas
Catalizan la unin de dos grupos qumicos a expensas
de la hidrlisis de un nucletido trifosfato (ATP, GTP, etc.).