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UNIVERSIDAD NACIONAL DE TRUJILLO

FACULTAD DE CIENCIAS BIOLÓGICAS


DEPARTAMENTO ACADÉMICO DE QUÍMICA BIOLÓGICA Y
FISIOLOGÍA ANIMAL

BIOQUÍMICA

T1. Biosíntesis de nucleótidos. Importancia de los nucleótidos. Síntesis


de purinas: IMP, AMP, GMP. Reacciones enzimáticas. Biosíntesis de
pirimidinas: OMP, UMP, CTP. Reacciones enzimáticas. Biosíntesis de
desoxirribonucleótidos.
T2. Inhibidores de la síntesis de desoxirribonucleótidos. Nucleótidos
precursores de NAD, FAD y CoA. Degradación de purinas y pirimidinas.

Ms.C. Patricia Elizabeth Torres Plasencia


Biosíntesis de Nucleótidos

Los nucleótidos son los precursores activados de los ácidos nucleicos.


Un nucleótido de adenina: ATP, es la divisa energética universal.
Derivados de nucleótidos como UDP-glucosa participan en procesos biosintéticos como
la síntesis de glucógeno.
Los nucleótidos son componentes esenciales de las vías de transducción de señales
(vías catabólicas). Ejm. AMP cíclico, GMP cíclico.
¿Cuál es la estructura de un nucleótido?

Un nucleósido es una unidad consistente en una base nitrogenada (purina ó pirimidina),


unida a un azúcar, si el azúcar es una ribosa: ribonucleósido; si el azúcar es una
desoxirribosa: desoxirribonucleósido.
Un nucleótido es un nucleósido unido a uno ó más grupos fosfato por un enlace éster
Bases nitrogenadas:
Azúcar:

ARN ADN
Los nucleótidos se pueden sintetizar mediante vías de novo o mediante vías
de recuperación

En las vías de novo (de cero), las bases de los nucleótidos se construyen a partir de
compuestos más sencillos. Una vez ensamblado una base pirimidínica, se une a la
ribosa, mientras que una base púrica se sintetiza sobre una ribosa.

En las vías de recuperación, se captan bases que se han formado con anterioridad y se
vuelven a conectar a una unidad de ribosa.

Tanto las vías de novo como de recuperación, dan lugar a la síntesis de


ribonucleótidos y todos los desoxirribonucleótidos se sintetizan a partir de éstos
(mediante la reducción de la ribosa perteneciente a un nucleótido completamente
formado). Por lo que se sugiere que el RNA precedió al DNA.
En la síntesis de novo, el anillo de pirimidina se construye a partir de
bicarbonato, aspartato y glutamina

En la síntesis de novo de las pirimidinas, primero se


sintetiza el anillo y posteriormente se le añade la
ribosa fosfato para formar un nucleótido de
pirimidina.

Los anillos de pirimidina se construyen a partir


de bicarbonato, aspartato y NH3 (éste último
presente en disolución u obtenido
principalmente de la hidrólisis de la cadena
lateral de la glutamina).
1° paso para la biosíntesis de novo de pirimidinas, es la síntesis de carbamilfosfato, a
partir de bicarbonato y NH3 mediante un proceso con múltiples etapas que requiere la
escisión de 2 moléculas de ATP. Reacción catalizada por la carbamilfosfato sintetasa (CPS).
Carbamilfosfato sintetasa:

El enzima está formado por dos cadenas


polipeptídicas y presenta tres centros activos:
Uno para la hidrólisis de la glutamina
(generación de NH3).
Otro, sitio de sujección del ATP, donde el
bicarbonato se fosforila (carboxifosfato) y
reacciona con el NH3 para formar ác.
carbámico.
Otro, sitio de sujección del ATP, donde se
fosforila el ác. carbámico (carbamilfosfato).

Los centros activos están conectados


mediante un conducto por el que se
desplazan los intermediarios (canalización
del sustrato).
El carbamilfosfato da lugar al orotato y éste incorpora un anillo de ribosa del PRPP
para formar un nucleótido de pirimidina, que se convierte en uridilato

Aspartato transcarbamilasa
El orotato se acopla a la ribosa, que en forma activada se
encuentra como 5-fosforribosil-1-pirofosfato (PRPP),
para formar orotidilato, un nucleótido de pirimidina
(reacción catalizada por la fosforribosiltransferasa de
pirimidinas).

Orotidilato descarboxilasa

UMP

Ribonucleótido
Interconversión de los nucleótidos mono, di y trifosfato

¿Cómo se forma la citidina el otro ribonucleótido de pirimidina?

Se sintetiza a partir de la base uracilo del UMP (antes debe convertirse en UTP, ya que di
y trifosfatos son las formas activas de nucleótidos).

1° Los nucleósido monofosfato


UMP + ATP UDP + ADP se convierten en difosfato por
nucleósido monofosfato
quinasas (Ejm: UMP quinasa).

XDP + YTP XTP + YDP Nucleósido difosfato quinasa


La CTP se forma mediante aminación de UTP

Reemplazo de un grupo carbonilo por un grupo amino. Requiere de ATP y de la glutamina


como donador del grupo amino.
Las bases púricas se pueden sintetizar de novo o se pueden reciclar mediante vías
de recuperación

Los nucleótidos se pueden sintetizar mediante


dos vías distintas: de novo, partiendo de
materiales sencillos como aminoácidos y
bicarbonato; y por recuperación o reciclado,
durante la degradación hidrolítica de ác.
nucleicos y nucleótidos.
A diferencia de las pirimidinas, las purinas se
sintetizan estando ya unidas a la ribosa.

Síntesis de novo
Las vías de recuperación disminuyen el gasto de energía intracelular

Las bases de purina libres procedentes de la degradación de los nucleótidos o de la dieta


se pueden unir al PRPP para formar nucleósidos de purina monofosfato.

Las bases de purina se recuperan mediante dos enzimas de recuperación, con especificidades
distintas. La adenina fosforribosiltransferasa que cataliza la formación de adenilato (AMP):

Adenina + PRPP adenilato + PPi

y la hipoxantina-guanina fosforribosiltransferasa (HGPRT), que cataliza la formación


tanto de guanilato (GMP) como de inosinato (IMP), éste último precursor del guanilato
y adenilato.

Guanina + PRPP Guanilato + PPi

Hipoxantina + PRPP Inosinato + PPi

También existen vías de recuperación para las pirimidinas, la pirimidina fosforribosiltransferasa


incorporará uracilo pero no citosina al PRPP.
Biosíntesis de novo de bases púricas

Tanto en la biosíntesis de purinas como de


pirimidinas se requiere de PRPP.
El paso crucial consiste en la sustitución de
pirofosfato del PRPP por amoniaco en lugar
de una base, para producir 5-fosforribosil-1-
amina, reacción catalizada por la glutamina
fosforribosilamidotransferasa.
El anillo de purina se ensambla mediante etapas sucesivas en las que la activación
por fosforilación va seguida de una sustitución
Formación del inosinato
El AMP y el GMP se forman a partir de IMP

Adenilsuccinato
sintasa.

GMP sintasa

La síntesis de Adenilato requiere GTP mientras que la síntesis de guanilato requiere ATP.
Los desoxirribonucleótidos se sintetizan por reducción de ribonucleótidos mediante
un mecanismo en el que intervienen radicales

Se forman mediante la reducción de


ribonucleótidos, concretamente, el
grupo hidroxilo en posición 2’ del
componente ribosa se sustituye por
un átomo de hidrógeno. Reacción
catalizada por la ribonucleótido
reductasa.

Los sustratos de este enzima son


ribonucleótidos difosfato y el
reductor final es el NADPH.
Ribonucleótido reductasa
El timidilato se forma por metilación del desoxiuridilato

Timidilato sintasa

La metilación de este nucleótido señala los lugares del DNA que han sufrido daño
para promover su reparac, contribuyendo a la integridad de la inf. genética .
El donador de grupos CH2 es el tetrahidrofolato
La dihidrofolato reductasa cataliza la regeneración del tetrahidrofolato, un
transportador de fragmentos monocarbonados

El tetrahidrofolato se regenera a partir del dihidrofolato que se produce durante la síntesis


del timidilato.
Inhibidores de la síntesis de desoxirribonucleótidos
El NAD, FAD y CoA derivan del ATP
Las etapas clave de la biosíntesis de nucleótidos se regulan mediante retroinhibición

La biosíntesis de la pirimidina se regula mediante la aspartato transcarbamilasa

La síntesis de los nucleótidos de purina se controla por retroinhibición en varios lugares


La síntesis de los desoxirribonucleótidos se controla mediante la regulación de la
ribonucleótido reductasa
Degradación de purinas y pirimidinas

Los nucleótido de una célula se están renovando continuamente.


Los nucleótidos se degradan por hidrólisis a nucleósidos, por medio de las nucleotidasas.
La ruptura fosforolítica de los nucleósidos para originar bases libres y ribosa 1-fosfato (ó
desoxirribosa 1-fosfato) está catalizada por las nucleósido fosforilasas.
La ribosa 1-fosfato se isomeriza por medio de la fosforribomutasa a ribosa 5-fosfato, un
sustrato para la síntesis de PRPP.
Algunas de las bases son reutilizadas para formar nucleótidos mediante las vías de
recuperación.

Catabolismo de las purinas

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