Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
Vaccine technology
-Application
• functional studies
• structural studies
• vaccine/antigen/antibodies
• therapeutic drug
• industrial enzymes for reaction
Application: therapeutic proteins
• Epogen to treat anemia caused by
• Actimmune (If g) Chronic chemotherapy or chronic kidney disease, or anemia
Granulomatous Disease (an interferon gamma) caused by taking zidovudine to treat HIV (human
immunodeficiency virus)
• Activase (TPA) treat blood clots, heart
attack. • Regranex (PDGF) to treat diabetic
foot ulcers
• BeneFix (F IX) helps the blood to clot
• Novoseven (F VIIa)
• Betaseron (If b) (interferon beta-1b) is
made from human proteins. Interferons help the body fight • Intron-A Interferons help your body's immune
viral infections system respond to bacteria, viruses, cancer, or other
invading substances.
• Humulin (insulin isophane) improve blood sugar
control in adults and children with diabetes mellitus • Neupogen treat neutropenia, a lack of
certain white blood cells caused by cancer, bone marrow
• Novolin transplant, receiving chemotherapy
Master cell
bank
Innoculum
Chất cấy truyền Fermentation
Collection
Lyophilized
đông khô Collection Purification Concentration
Kỹ thuật đông khô
(lyophilization)
• Trong tổng hợp các vaccine hay các polymer,v.v. hòa tan được trong nước, sau khi phản ứng hoàn tất thì các tạp
chất được loại bỏ bằng kỹ thuật (dialysis http://en.wikipedia.org/wiki/Dialysis)với nước siêu tinh khiết (đã qua
chưng cất và màng siêu lọc để loại bỏ hoàn toàn các ion tạp chất). Những hợp chất có kích thước phân tử lớn sẽ
không lọt qua được màng bán thẩm nên bên trong màn bán thẩm chỉ còn chứa dung dịch sản phẩm vacinne hay
polymer khá tinh khiết.
• Vấn đề đặt ra là làm sao loại bỏ được nước mà không làm hỏng sản phẩm tổng hợp. Ví dụ nếu dùng máy cô quay
(rotavapor hay chưng cất thì các vaccine hay polymer có hoạt tính dược học sẽ bị phá hủy hay biến dạng). Vấn
đề này có thể giải quyết một cách dễ dàng bằng kỹ thuật đông khô. Để thực hiện kỹ thuất này cần phải có máy
đông khô (Lyophilizer, có thể mua hoặc chế tạo trong điều kiện Việt Nam) và tiến hành qua các bước sau:
• Bước 1: Cho dung dịch phản ứng sau dialysis vào bình chứa thích hợp bằng thủy tinh hay nhựa.
• Bước 2: Làm đông hoàn toàn dung dịch trên bằng hổn hợp nước đá khô (dry ice) với acetone hay methanol hay
isopropanol. Nếu dung dịch không được đông hóa một cách cẩn thận sẽ bị bắn văng khỏi bình chứa khi cho mẫu
lên máy đông khô.
• Bước 3: Cho mẫu lên máy, nước đá sẽ thăng hoa (sublime) trực tiếp ở thể rắn và thoát ra khỏi bình chứa mẫu ở
nhiệt độ phòng một cách dễ dàng. Với lượng nước khoảng 0.5L, thời gian thăng hoa sẽ khoảng 24 h với bình
chứa lớn.
• Bước 4: Kiểm tra mẫu xem đã khô một cách tuyệt đối chưa và lấy mẫu ra khỏi máy.
• Nói chung, nước được loại bỏ khỏi dung dịch một cách nhẹ nhàng để cho ra sản phẩm khô mà không cần phải
đun nóng gì cả nên mẫu thu được không bị biến tính và vẫn còn hoạt tính dược học.
Flow chart of protein production
Service
Requested
Parallel Cloning
additional charge
standard
Insoluble / posttranslational modification required
Soluble
Yeast system
Baculovirus system
in vitro expression systems
Protein Purification
Protease cleavage to
remove tag
Sources of biopharmaceuticals
Sources of biopharmaceuticals
Bacterial Systems
Advantages Disadvantages
• Grow quickly (8 hrs to • Difficulty expressing large
produce protein) proteins (>50 kD)
• High yields (50-500 mg/L) • No glycosylation or signal
• Low cost of media peptide removal
(simple media • Eukaryotic proteins are
constituents) sometimes toxic
• Low fermentor costs • Can’t handle S-S rich
proteins
Sources of biopharmaceuticals
Expression
1. Strong promoter
Fusion 2. Thioredoxin gene
protein 3. Nucleotide sequence coding for the
peptide sequence which serves as
cleavage site for the protease
Enterokinase (enterokinase)
4. Gene/cDNA for the protein of
interest
The denaturant is then removed by techniques such as dialysis or diafiltration. This facilitates refolding of
the protein, a high percentage of which will generally fold into its native, biologically active, conformation.
• Không có khả năng sinh con như E. coli để thực hiện các sửa đổi sau khi chuyển đổi
(đặc biệt là glycosylation) có thể giới hạn tính hữu ích của chúng như là hệ thống sản
xuất đối với một số protein hữu ích về mặt điều trị. Nhiều protein như vậy, khi được
sản xuất tự nhiên trong cơ thể, được glycosyl hoá.
• Tuy nhiên, thiếu thành phần carbohydrate của một số glycoprotein ít có, nếu có, ảnh
hưởng tiêu cực đến hoạt động sinh học của chúng.
• Ví dụ, dạng ung thư oxy hoá của IL-2 thể hiện hoạt tính sinh học giống hệt với hoạt
tính của phân tử glikozlated tự nhiên. Trong những trường hợp như vậy, E. coli có
thể phục vụ như là một hệ thống sản xuất thỏa đáng.
Sources of biopharmaceuticals
The pyrogenic nature of LPS renders essential its removal from the product stream.
-improvement
• growth condition (e.g. temperature)
• codon usage
• host strain
• fusion to carrier protein
Sources of biopharmaceuticals
Sticky-end PCR
E. coli
Gene of Interest
+
Expression Vector Recombinant
Vector
• Nguồn gốc nhân bản (ORI) - Dãy DNA cho DNA polymerase sao chép plasmid
• Marker chọn lọc (Amp hoặc Tet) - một gen, khi biểu hiện trên plasmid sẽ cho phép các tế bào chủ tồn tại
• Promoter hấp dẫn - Chuỗi ADN ngắn tăng cường biểu hiện gen liền kề
• Site đa nhân bản (MCS) - Chuỗi ADN ngắn chứa nhiều vị trí enzyme hạn chế
Which Vector?
• Must be compatible with host cell system
(prokaryotic vectors for prokaryotic cells,
eukaryotic vectors for eukaryotic cells)
• Needs a good combination of
– strong promoters
– ribosome binding sites
– termination sequences
– affinity tag or solubilization sequences
– multi-enzyme restriction site
Which Vector?
• Promoters
– arabinose systems (pBAD), phage T7 (pET),
Trc/Tac promoters, phage lambda PL or PR
• Tags
– His6 for metal affinity chromatography (Ni)
– FLAG epitope tage DYKDDDDK
– CBP-calmodulin binding peptide (26 residues)
– E-coil/K-coil tags (poly E35 or poly K35)
– c-myc epitope tag EQKLISEEDL
– Glutathione-S-transferase (GST) tags
– Celluluose binding domain (CBD) tags
Bacterial Transformation
• Moves the plasmid into bacterial host
• Essential to making the gene “actively” express the
protein inside the cell
• 2 routes of transformation
– CaCl2 + cold shock
– Electroporation
• Typical transformation rate is 1 in 10,000 cells (not very
efficient) for CaCl2, but 1 in 100 for electroporation
Electroporator
25 microfarads = 2500 V
@ 200 ohms for 5 ms
Electroporation
• Seems to cause disruption in
cell membrane
• Reconstitution of membrane
leads to large pores which
allow DNA molecules to
enter
• Works for bacteria, yeast and
animal cells
Cloning & Transforming in
Yeast Cells
Pichia pastoris
Pichia Pastoris
• Yeast are single celled eukaryotes
• Behave like bacteria, but have key advantages of
eukaryotes
• P. pastoris is a methylotrophic yeast that can use
methanol as its sole carbon source (using alcohol
oxidase)
• Has a very strong promoter for the alcohol oxidase
(AOX) gene (~30% of protein produced when induced)
Pichia Cloning
Pichia Pastoris Cloning
• Uses a special plasmid that works both in E. coli and
Yeast
• Once gene of interest is inserted into this plasmid, it
must be linearized (cut open so it isn’t circular)
• Double cross-over recombination event occurs to cause
the gene of interest to insert directly into P. pastoris
chromosome where the old AOX gene used to be
• Now gene of interest is under control of the powerful
AOX promoter
Pichia Systems
Advantages More advantages
• Grow quickly (8 hrs to • Can express large proteins
produce protein) (>50 kD)
• Very high yields (50-5000 • Glycosylation & signal
mg/L) peptide removal
• Low cost of media • Has chaperonins to help fold
(simple media “tough” prtns
constituents) • Can handle S-S rich proteins
• Low fermentor costs
Baculovirus Expression
~12 days
Baculovirus (AcMNPV) Cloning Process
Transfer vector
Cloned gene
5’ 3’
x x Cloned gene
5’ 3’
Polyhedrin gene
Transfect
dfhr- cells
Foreign gene
expressed in
high level in
CHO cells
Mammalian Systems
Disadvantages Advantages
• Selection takes time (weeks • Can express large proteins
for set-up) (>50 kD)
• Cell culture is only • Correct glycosylation &
sustainable for limited period signal peptide removal,
of time generates authentic proteins
• Set-up is very time • Has chaperonins to help fold
consuming, costly, modest “tough” prtns
yields
Conclusion
• Isolation of gene of interest
• Introduction of gene to expression vector
• Transformation into host cells
• Growth of cells through fermentation
• Isolation & purification of protein
Expression systems
• E. coli
• Baculovirus
• Yeast
• Cell-free
• Mammalian cell
( not open for service)
Upstream processing
The content of all the ampoules is identical, and the cells are effectively
preserved for indefinite periods when stored under liquid nitrogen. This batch
of cryopreserved ampoules forms a ‘cell bank’ system, whereby one ampoule
is thawed and the cell therein cultured in order to seed, for example, a single
production run. This concept is applied to both prokaryotic and eukaryotic
biopharmaceutical-producing cells.
Upstream processing
The master cell bank is constructed first, directly from a culture of the
newly constructed production cell line. It can consist of several hundred
individually stored ampoules.
Upstream processing
Figure 6 The master cell bank/working cell bank system. For simplicity, each
bank shown above contains only five ampoules. In reality, each bank would
likely consist of several hundred ampoules. Working cell bank number 2 will be
generated from master cell bank vial number 2 only when working cell bank
number 1 is exhausted and so on
Upstream processing
The ampoules are not used directly to seed a production batch. Instead, they
are used, as required, to generate a working cell bank.
The ampoules are then cryopreserved and form the working cell bank.
When a single batch of new product is required, one ampoule from the
working cell bank is thawed and used to seed that batch.
When all the vials that compose the first working cell bank are
exhausted, a second vial of the master cell bank is used to generate a
second working cell bank, and so on.
Upstream processing
The rationale behind this master cell bank/working cell bank system is to
ensure an essentially indefinite supply of the originally developed
production cells for manufacturing purposes.
Upstream processing
Heat-stable nutrients required for producer cell growth are then added
and the resultant medium is sterilized in situ heat, and many
fermenters have in built heating elements or, alternatively, outer jackets
through which steam can be passed in order to heat the vessel contents.
Heat-labile ingredients can be sterilized by filtration and added to the
fermenter after the heat step.
Downstream processing application
for pharmaceutical biotechnology
Introduction
Cellular disruption
(homogenization)
Removal of
cellular debris
(centrifugation
or filtration)
Concentration of product-containing
extracellular media (ultrafiltration or
Initial purification/concentration precipitation)
(ultrafiltration/ion exchange or
precipitation)
Chromatographic
purification; usually
2-4 chromatographic
steps
Adjustment of
potency and addition
of excipients
Sterile filtration
and aseptic filling
Freeze drying
.
Treatment with nucleases.
Concentration
Ultrafiltration
Diafiltration